全血样品中自动分离、核酸提取、核酸质控和分析等检测方案(超声影像)

基因组 DNA 完整性检测 样品过程可追溯性 自动化分血工作站 ●·核酸提取解决方案 ·核酸定量与质量评价 ●·定制化整合系统 生物样本库的变革 面对日益增长的需求，生物样本库能够及时提供优质生物样本资源，为科技人员进行临床、药物和基础研究提供基础。从而增加我们对复杂疾病的了解。珀金埃尔默结合多项专利技术产品，为生物样本库工作流程提供系统解决方案，进而使生物样本库满足不同需求。珀金埃尔默生物样本库解决方案涵盖了全血样品的自动分离、核酸提取、核酸质控和分析等环节，同时可以将模块化的工作流程进行自动化整合，具有提取的核酸产量高、质量好、样品通量灵活、样品处理过程可追溯、仪器设备可升级整合等优点。 珀金埃尔默致力于生物样本库，为研究工作提供全血样品分离、高质量的核酸提取、质量控制和分析方案，模块化及可扩展的自动化，独特的资源整合，通过达到生物物本库的灵活性来满足不同需求。 ( 珀金埃尔默独特的定位使 得生物 样本库能够以自动化全血样品分离、 高 质 量的 核酸提取、质量控制和分析解决 方 案、 模 块 化和可扩展的 自动化以及单一来源的整合 来增 强研究能力，提供生物样本库所需的灵活 性， 以满足其不断变化的需求。 ) 集中式生物样本库设施在为生物标本的储存和处理设置高效、可扩展工作流程方面，面临着日益严苛的挑战。这些挑战包括：样本可追踪性、血液分离、质量控制以及进行基因分析的样本制备。新的 JANUS" G3 Blood iQTM 分血工作站作为分离血液中cfDNA、 cfRNA 以及基因组 DNA 进行基因分析的无缝、高效和可追踪工作流程中的首个步骤。 JANUS° G3 Blood iQTM 分血工作站为所有血液分离工作流程的无人自动化提供了优质的生物样本库解决方案。 JANUS小 G3Blood iQTM 分血工作站具备以下功能： ·基于深度学习的图像分析 三三三 高度可再现的移液技术 兼容下游应用的移板机械臂 ·较多工作台面 ·开箱即用的运行程序 JANUS° G3 Blood iQTM 工作站保证了能够对分离血液的白膜层和血浆层中gDNA、cfDNA 和 cfRNA 进行隔离进行所必需的可追踪、高效且可重复的血液分离。 血液层检测 采用专利的成像技术，使JANUS G3 Blood iQTM 分血工作站能够精确识别分离血液管中的血浆和白膜层。拍摄一个蓝色图像，根据像素周围的有界平方识别包含白细胞的白膜层高度。拍摄一个白色图像，通过血浆层半月板上的点及其相对于白膜层的位置，识别血浆层高度。该成像技术通过基于深度学习的图像分析模型进行驱动，该模型能够精确识别明显的血液组分。随后， JANUS G3 WinPrepTM软件根据层高度和管的几何尺寸，计算体积。每根管的高度计算是唯一的。这项重要技术会输出以下参数： 输入管条形码 血浆体积 白膜层体积 JANUSG3 VARISPANTM技术：精准移液，进行 cfDNA、cfRNA 和 gDNA 分析 JANUS G3 Blood iQTM 分血工作站配备有一个间距可调的独立8-通道移液模块，具有行业知名的移液准确度和精密度。如下所示，在该工作站中使用的四个主要移液吸头，能够在分离血液中进行复杂的血浆和白膜层分装。 基质 体积 准确度(标准误差) 精确度(随机误差) 血浆 5.0 mL +/-5% 5.0% CV 血浆 500 uL +/-10% 5.0% CV 白膜层 900 pL +/-5% 5.0% CV 白膜层 100 uL +/-10% 5.0% CV 这一重要的信息存储在 CSV文件中，该文件可与实验室信息管理系统无缝整合。JANUS G3 Blood iQTM 分血工作站在变量不满足用户指定的目标量时，会向用户发出通知，告知回收其样本。 上文图表显示了人工测量的血浆高度与通过 JANUS°G3 Blood iQTM 成像系统获得的测量值之间的差值。总体的百分比准确度显示，JANUS G3 Blood iQTM 分血工作站能够准确测量分离血液的血浆高度。 下游提取：整合移液臂和台面容量 JANUS°G3 Blood iQTM 分血工作站配备大台面和整合型移板机械臂，从而使基于磁球的核酸提取等下游工作流程完全自动化。该仪器还可为 chemagicTM 360 仪器等核酸提取平台分装制备洗液板和洗脱液板。 DOOO 888888 888888 1888888 88868c 588888 88888 血浆吸头 白膜层吸头 588888 88888 5 mL感应枪头 900 uL宽口枪头 带滤芯吸头 感应过滤吸头 各种起始样本的核酸提取 由于生物处理所收集的样本可能极为多样化，因此从广泛的样本类型和体积中分离核酸的能力至关重要。珀金埃尔默的 chemagicTM 能够实现从10微升到10毫升的起始样品中提取核酸，珀金埃尔默的 chemagicTM试剂和自动化方案可以实现对多种样本类型和多种起始样本体积进行核酸提取。 高质量的核酸 在进行分子分析时，核酸质量是非常重要的，因为导致降解的因素、杂质和酶抑制剂的存在以及长期的存储会对数据的质量产生重大影响。珀金埃尔默的chemagenTM 技术解决了提取难题，同时提供了适合长期储存的具有高回收率的纯净核酸，以及各种高难度的下游应用。 chemagenTM 技术避免了通常导致核酸变性和断裂的振荡和离心步骤。这种自动化磁珠分离过程使用 M-PVA磁珠来分离纯化人体样品中的核酸。这些微珠对核酸有很高的亲和力，对抑制剂的亲和力低，从而产生超纯的 DNA 和RNA。该技术的特点是具有可磁化的旋转棒，结合转移和悬浮磁珠提取 DNA，防止进一步碎片化。经过优化的流程也可用于优化分子量的高的 DNA 和细胞游离 DNA (cfDNA)。所分离的核酸可用于多种下游应用，包括 NGS、PCR和MLPA (1-10)。 样品类型 chemagicTM 核酸分离解决方案 等等 chemagic·TTM360NSTRI 4ENT 具备每天从96到1000个样本中分离出核酸的能力，并且能够从任何其他人体样本中分离 DNA 或 RNA 的灵活性，chemagicTM 360 设备能够满足实验室高通量核酸分离的需求。 图2.从干血点提取高质量DNA。用chemagicTM 360设备和chemagicTM DNA干血点试剂盒从干血点中提取DNA。使用LabChip GX Touch核酸分析仪的基因组DNA分析DNA。 灵活输出 chemagicTM 核酸分离解决方案 NI基因组 DNA NINcfDNA NII宏基因组 DNA NIMmRNA/miRNA NNHMW DNA 图3.高浓度 DNA。使用洗脱体积为500pL 的 chemagicTM 360仪器， 从133-4mL全血样本中提取DNA. 平均浓度为 314 ng/pL， 平均产量为157 pg. 使用该试剂盒分离盒 DNA 的 OD260/280>1.9，OD260/230>2， 平均 DNA 产量为20-50uL/ mL血液。 整合型全自动核酸提取、反应体系构建 全新的 chemagicM PrimeM工作站是一全自动化解决方案，用于原始样本的转移、DNA/RNA 提取、可选的浓度归一化处理和 PCR 反应体系构建，实现流线型的、无人值守全自动化操作。实现单一供应商提供的无交叉污染，用于科研、提取高浓度 DNA/RNA 的解决方案。 核酸提取是许多下游应用的前提。 chemagic Prime 工作站采用专利的聚乙烯醇磁珠技术(M-PVA磁珠)，整合全自动移液工作站，从各种类型样本中提取高品质和高产量的核酸，适用于 NGS、MLPA、基因分型和 PCR 应用。 chemagicPrime 工作站采用磁棒法替代磁力架法，从溶液中分离核酸。通过转移磁珠，而不是转移液体来进行核酸提取，减少交叉污染风险，可获得更高纯度、更好完整性的 DNA 和RNA。试剂盒兼容各种类型人源样品，可从全血、唾液、血清/血浆、组织、FFPE 和粪便等样品中分离 DNA 和 RNA。 工作流程 无人值守自动化，每批可进行2组提取，2*96个样本，2*24个样本，或2*12个样本力大幅度减少人工干预抓扳手和优化的吊篮载架设计，便于实验器具自动转移 文库制备洗脱产物分装浓度归一化处理 作为珀金埃尔默生物样本库的工作流程的组成部分，通过验证和测试的无缝式的分析解决方案消除您在核酸质量控制和定量方面的瓶颈。 在核酸定量方面， VICTOR NivoTM多模式平板阅读器可选择260nm 和260：280nm 比率下的紫外吸收，或可选择在96和384孔微板格式下测量染料与双链DNA结合的荧光强度。 0ptPlate-96 .abChip@CGX Touchi6TMDANALYZER 珀金埃尔默的 LabChip@ GX TouchTM 核酸分析仪使用的微流体技术在大约30秒内即可对核酸进行质量控制分析。具有自动化程度高、运行成本低、通量高且灵活等特点。 图7.RNA电泳图谱，其中展示18S和28S峰 图6.加入 Fragmentase (New England Biolabs， 1 uL酶/1 uggDNA)温育3至20分钟后降解的市售 gDNA 的电泳峰图和虚拟胶图。 GQS 评分随着降解程度的增加而降低，体现为样品的大小分布向较小方向迁移。 RNA 质控 利用专利的微流控芯片技术，对提取核酸的 RNA 完整性进行分析，并具备 RNA Quality Score (RQS) 质量评分0-10分，可以很好的评价 RNA 完整性以及18S、28S质量情况。RQS 是对样品的质量和完整性的量化评价，可预测下游基因表达实验(如NGS、芯片分析或实时 PCR 等)的成功几率。RQS 与其它商业指标的相关度极好。 图8.上图显示了 DNA NGS 3K 羊测样品的灵敏度。同一NGS文库样品进行6次3倍系列稀释，实验结果展示了 LabChip DNA NGS 3K检测样品浓度下限。数据结果在 LabChip GX Touch 仪器上展示。 模块化和可扩展的自动化 珀金埃尔默的自动化解决方案使生物数据库能够标准化程序并实施优化实践操作，以确保样品的完整性和安全性，增加了产量的同时降低了成本。珀金埃尔默提供的灵活的仪器模块在产量、容量和动态容量范围方面提供了灵活性，同时具有高质量的制造标准，杰出的客户服务和支持。 提高通量和样本安全 根据灵活的进样量，快速、经济有效地提取核酸 珀金埃尔默提供了模块化、可扩展的解决方案，解决了样本安全需求和灵活的通量和工作流程需求，实现整个生物样本库工作流程的自动化。 珀金埃尔默的 chemagicTM 具有灵活的通量、性能和样品类型，高质量的制造标准，并有着优质的客户支持。其核酸提取的自动化解决方案处理的样品体积从 10uL 到10mL， 经济高效且快速。 同一来源整合 珀金埃尔默的 explorerTM G3 工作站无缝集成了许多跨平台的关键生物库处理过程。通过集成核酸分离、样本评估和提高通量的模块化方法，可以设计出任何符合客户需求的定制化 explorerTM G3 工作站。 CUSTOM explorerTM G3 样本扫描 改善的再现性和准确性 自动化减少了大多数人工处理步骤，这些步骤是试验批次误差的主要来源。珀金埃尔默的自动化解决方案通过消除错误((如标签错误或样品错位等)，提高了再现性和准确性。 登记管架ID 和单个2D 洗脱管条形码 样本跟踪 样品和试剂转移至提取板 珀金埃尔默的生物样本库解决方案通过将自动条码扫描纳入样品处理的每一个步骤来实现样品跟踪。样本由数据库接收并放入珀金埃尔默自动化解决方案中，由条形码阅读器进行扫描，条形码阅读器与实验室信息管理系统(LIMS)相通，并根据预定义的工作指令进行处理。 核酸提取 LIMS集成 洗脱液转移到2D管(可选) 实验室信息管理系统(LIMS) 对于生物样本库来说是必需的，因生物样本库需要管理各种各样的样品，与电子医疗和健康记录集成，并符合相关的环境管理条例，如 HTA、GCLP、MHRA、FDA 21 CFR Part 11。珀金埃尔默的自动化解决方案与所有主要的 LIMS 兼容，使生物样本库能够轻松地将数据导入管理系统。 在样品登记时分配 2D 管ID(可选) 打印与管架和洗脱管ID 相对应的样品 ID 珀金埃尔默的生物样本库工作流程 ( ·提高效率 ) 凭自动化全血分离、核酸提取、自动化、系统集成以及定性和定量分析方面的专业知识技术，珀金埃尔默的自动化团队通过提供灵活、模块化的解决方案来提高其效率，用更少的成本做更多的事，帮助生物样本库取得成功。 ·标准化程序以确保样本完整性和安全性 ( ·提高通量 ) ·降低成本 ( 欢迎 联系当地销 售代表，了解更多适合您实验室特定 需 求 的 生 物样本库整合方案。 ) ( 参考文献 ) 1.Beisani， M.， Pappa， S.， Moreno， P.， Martinez， E.， Tarasco， J.， Granada，M. 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N.， Liaw， Y.， Lin， C.， Chu， H.， ※仅供研究使用，不适用于临床诊断。 珀金埃尔默企业管理(上海)有限公司 地址：上海张江高科技园区张衡路1670号电话：021-60645888传真：021-60645999 邮编：201203 PerkinElmer 中文网址： www.perkinelmer.com.cn 客户服务电话：8008205046 4008205046 版权@2019，珀金埃尔默公司。版权所有。 Perkinelmer是珀金埃尔默公司的注册商标。所有其他商标属于相应所有者的财产。 欲了解更多信息，请扫描二维码关注我们的微信公众账号2020年3月 PerkinElmerFor the Better 欲获悉全球办事处的完整清单，请登录visit www.perkinelmer.com/ContactUsAGCHN_BR PKI 面对日益增长的需求，生物样本库能够及时提供优质生物样本资源，为科技人员进行临床、药物和基础研究提供基础。从而增加我们对复杂疾病的了解。珀金埃尔默结合多项专利技术产品，为生物样本库工作流程提供系统解决方案，进而使生物样本库满足不同需求。珀金埃尔默生物样本库解决方案涵盖了全血样品的自动分离、核酸提取、核酸质控和分析等环节，同时可以将模块化的工作流程进行自动化整合，具有提取的核酸产量高、质量好、样品通量灵活、样品处理过程可追溯、仪器设备可升级整合等优点。珀金埃尔默致力于生物样本库，为研究工作提供全血样品分离、高质量的核酸提取、质量控制和分析方案，模块化及可扩展的自动化，独特的资源整合，通过达到生物样本库的灵活性来满足不同需求。