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大肠杆菌蛋白裂解液中肽段检测方案(移液工作站)

液质联用鉴定肽段的样品制备,通常由多步骤工作流程组成,包括溶液内蛋白酶解、肽段纯化,以及肽段分馏。该过程通常需要根据样品特性及分析目的( 即定量或表征)定制为具体的应用方法。样品制备工作流程的自动化可提高样品处理能力、降低差异性,并且无需熟练操作人员执行重复工作。然而,自动化平台通常并不用于最初的分析开发,这是因为分析开发者很少具有开发复杂自动化方案的经验。相反,分析通常是采用湿式工作台相关技术进行开发,然后在自动化专家的帮助下移植到自动化平台。 采用 AssayMAP 肽段样品制备解决方案,无需掌握专门的技术也能实现自动化操作。开发者可通过一个简单的软件用户界面和灵活的实验方案对关键实验变量进行完全控制,从而能够专注于科学分析研究。如今,分析开发者、科学家或技术员无需具备自动化专业知识也能实现可扩展、精确的自动化操作。采用 AssayMAP 平台,整个工作流程可直接在相同的硬件上进行开发,如需实现高通量样品前处理,也易于对硬件进行扩展,从而可减少或避免已有实验方案实现自动化所需的额外时间和资源。本文将介绍发现(鸟枪法)蛋白组学研究的一种常规液质联用工作流程,包括溶液内酶解、反相肽段纯化,以及肽段的强阳离子交换分馏 (SCX),所有这些操作均由 AssayMap Bravo 液体处理器完成。采用 SCX 小柱通过增加 pH 或离子强度对大肠杆菌蛋白裂解液进行逐步洗脱,在六个 SCX 馏分中鉴定出 15000 多条特定肽段序列,其中 64-67% 的肽段可专属性地在其中一个馏分中得到鉴定。
检测样品: 其他
检测项: 肽段

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外源DNA片断中PCR扩增产物的克隆检测方案(离心机)

实验方法原理 TA克隆 系统由Invitrogen公司(San Diego,CA)发展而来的商业性试剂盒,它用于PCR 产物的克隆 和测序。其原理是利用Taq酶能够在PCR 产物的3'末端加上一个非模板依赖的A,而T载体是一种带有3'T突出端的载体,在连接酶作用下,可以快速地、一步到位地把PCR 产物直接插入到质粒载体的多克隆 位点(MCS)中。 外源DNA与载体分子的连接就是DNA重组,这样重新组合的DNA叫做重组体或重组子。重组的DNA分子是在DNA连接酶的作用下,有Mg2+、ATP存在的连接缓冲系统中,将分别经酶切的载体分子与外源DNA分子进行连接。DNA连接酶有两种:T4噬菌体DNA连接酶和大肠杆菌DNA连接酶。两种DNA连接酶都有将两个带有相同粘性末端的DNA分子连在一起的功能,而且T4噬菌体DNA连接酶还有一种大肠杆菌DNA连接酶没有的特性,即能使两个平末端的双链DNA分子连接起来。但这种连接的效率比粘性末端的连接率低,一般可通过提高T4噬菌体DNA连接酶浓度或增加DNA浓度来提高平末端的连接效率。 T4噬菌体DNA 连接酶催化DNA 连接反应分为3 步:首先,T4 DNA 连接酶与辅因子ATP形成酶-ATP复合物;然后,酶-ATP复合物再结合到具有5'磷酸基和3'羟基切口的DNA上,使DNA腺苷化;最hou产生一个新的磷酸二酯键,把切口封起来。连接反应通常将两个不同大小的片断相连。因为DNA片断有两个端点,所以切割时出现两种可能,一种是单酶切,另一种是双酶切,这两种酶切方法在基因工程操作中都经常用到。对于单酶切来说,载体与供体的末端都相同,连接可以在任何末端之间进行,这样就导致了大量的自连接产物。为了减少自环的高本底,可对载体进行5'除磷酸处理,原理是连接酶只能连接DNA片断的3'OH末端与5'端,所以除磷后载体不会自环。一旦有外源片断插入时,由外源片断提供5'端就能与载体进行连接。通过这种方法可大大减少由载体的自环造成的高本底。对于双酶切来说,无论载体与供体同一片段上都有不同的末端,这样就避免了载体与供体的自环,能使有效连接产物大大增加。双酶切的另一个特点是能将供体分子定向连接到载体上。 连接反应的温度在37℃时有利于连接酶的活性。但是在这个温度下粘末端的氢键结合是不稳定的。因此采取折中的温度,即12-16℃,连接12-16h(过夜),这样既可最da限度地发挥连接酶的活性,又兼顾到短暂配对结构的稳定。Taq DNA酶扩增的PCR产物,其DNA双链前后末端都有一个游离的A碱基,可以与pGEM-T Easy Vector 末端游离的T碱基互补形成环状重组T质粒。
检测样品: 其他
检测项: PCR扩增产物的克隆

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