测序仪用水对结果的影响

测序环节中，从样品收集到上机测序，水贯穿了包括测序仪的日常清洗维护和试剂配制在内的每一个环节。作为一个基础试剂，水的品质对最终测序结果会产生显著影响。水中的杂质，如无机盐、有机物、核酸酶、颗粒物等，不仅会污染设备，缩短测序仪毛细管的使用寿命，而且还会降低DNA聚合酶的活性，干扰测序结果的准确性。基因测序经常遇到的问题很有可能是使用的水有问题，快来看看你有没有中招…测序仪用水对结果的影响 基因测序技术是一种基因检测技术，也被称为 DNA 测序技术，是进行分子生 物学研究和基因改造的基础。从第一台测序仪发明，人类开始获得探索生命遗传 本质的能力，而生命科学研究也因此步入了基因组学的时代。基因测序技术发展 40余年来，已在众多领域被广泛应用，包括生物的基因组图谱绘制、物种进化演 替过程、表观遗传学、疾病相关基因的确定和诊断等等。近年来，基因测序相关产 品和技术已由实验室研究演变到临床使用，说基因测序技术是下一个改变世界的 技术毫不为过。 在新冠疫情期间，这项技术更加得到了更多人的关注 。疫情爆发初期，在不 到 一个月的时间内，通过基因测序技术，新冠病毒(COVID-19)的基因组序列被公布，为研究分析武汉新型冠状病毒的进化来源、致病机制提供 了 第一手资料。不少国 家也发起了 COVID-19 患者基因测序计划，以 了 解个人基因对病毒感染反应的影 响，这项研究的数据将为患者护理及药物处方提供信息，未来还可以帮助疫苗设 计，从而拯救更多生命。 整个测序环节中，从测序仪的日常清洗维护到基因测序试剂的配制，都会用到 水，如果水中含有无机盐、有机物、核酸酶、颗粒等杂质，不仅会缩短测序仪毛细 管的使用寿命，而且会干扰测序结果。 下面这些基因测序经常遇到的问题很有可能是使用的水有问题，快来看看你有 没有中招... Q1： DNA 测序样品用什么溶液溶解比较好? 溶解 DNA 测序样品，使用超纯水溶解最好。 原因：DNA的测序反应也是 Taq酶的聚合反应，需要一个最佳的酶反应条件 。 如果溶解 DNA 样品的溶液含有大 量 的盐，会影响测序反应体系，造成 Taq 酶 的聚合 性 能下降，干扰测序反应甚至无法产生信号 。 纯水应用 Tips： 超纯水机采用基因测序专用超纯化柱，RephiLe 独创配方填料 的低镁型纯化柱，可以特异性去除水中的镁离子，降低空白本底对测序反应体系 的影响 。 Q2：测序结果怎么没有峰图呢? 原因：模板被降解，罪魁祸首可能是测序使用的水中含有核酸酶。 纯水应用 Tips：制备超纯水的超纯水机需要带有终端滤器，如乐枫生物的 RephiBio 终端滤器，可以去除 DNA酶和 RNA酶。 Q3：为什么测序峰图出现了“瀑布效应”? “瀑布效应”是基线突然从高处下降的现象。 原因：样品被有机物污染，有机物会被激发产生荧光，抬高基线 。 纯水应用 Tips：使用带有 TOC 检测系统的超纯水机，如乐枫 Genie 系列智能 超纯水系统，采用全 氧 化法设计的 TOC在线监测系统，有机物含 量 低于 5 ppb。 Q4： “钉子峰”女 如何避免? “钉子峰”是A、、T、C、G四个颜色的峰都被突然拔起，形成了尖锐的峰形。原因：溶液中可能存在气泡或者颗粒，气泡和颗粒对激光全反射，形成 “钉子峰”。纯水应用 Tips： 纯水机取水口配备 0.22um 的终端滤器。 乐枫生物 Genie 系列智能纯水系统以稳定的水质、智能的操作系统充分满足基 因测序用水需求，在诸多应用到测序仪的实验室常常会看到乐枫生物 Genie 系列 智能超纯水系统的身影。华大基因海外“火眼实验室”采用的超纯水机是 Genie A 无水箱智能超纯水系统。 关于乐枫生物 乐枫生物(Rephile Bioscience，Ltd.) 是一家专业从事高端水纯化和实验室分 离纯化产品研发、设计和制造的企业，为高科技生物技术和生命科学领域的用户 服务。乐枫公司着眼于全球发展，在中国、美国、法国、印度、南非等近20个 国家建立了销售机构，同时也为国际大型公司提供 OEM 和ODM，产品销往包括 欧美的近100个国家。成立十余年，乐枫持续投入研发，创立出了自己的产品品 牌 RephiLe(瑞枫)，推出了多个新概念产品-无线连接的 Genie 系列纯水系统 和智能型大流量纯水工作站 Super-Genie 等。目前乐枫纯化柱填料配方齐全，也 提供多款密理博纯水系统的兼容耗材。 关键词：纯水，超纯水，实验室， Genie 纯水机，核酸检测，电泳条带，乐枫 关注 RephiLe 企业微信：乐枫纯水，关注乐枫动态!