固碳突变体代谢物

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  • 呋喃它酮代谢物残留化学发光检测试剂盒
    呋喃它酮代谢物（AMOZ）检测试剂 盒（化学发光免疫分析法）使用说明书【产品名称】 呋喃它酮代谢物检测试剂盒（化学发光免疫分析法） 【包装规格】 100T/盒 【概述】 硝基呋喃类药物因有非常好的抗菌作用和药动力学的特性， 曾被广泛应用，作为禽类、水产和猪促生长的添加剂。但在长时 间的实验研究过程中发现，硝基呋喃类药物和代谢物均可以使实 验动物发生癌变和基因突变，正因为如此才导致此类药物禁止在 治疗和饲料中使用。 由于硝基呋喃类药物在体内很快就能被代谢，而在组织中结 合的代谢产物则能存留较长的一段时间，所以在分析此类药物的 残留时经常要分析其代谢后的产物，管理部门就以检测代谢产物 为手段达到检测硝基呋喃类残留的目的。呋喃唑酮代谢产物 AOZ； 呋喃它酮代谢产物 AMOZ；呋喃妥因代谢产物 AHD；硝基糠腙 （呋喃西林）代谢产物 SEM。【检测原理】 试剂盒采用竞争法进行检测，温育结束后，加磁场沉淀，去 掉上清液，用清洗液清洗沉淀复合物，并吸干废液，除去未与磁 性微粒结合的物质，再将反应杯送入测量室中。仪器自动泵入两 种激发液，使复合物产生化学发光信号，通过光电倍增器测量发 光强度。仪器自动通过工作曲线计算得出检测结果。【适用范围】 可定性、定量检测组织样品中呋喃它酮代谢物的残留量。【检测方法】 1.试剂盒为即用型，不能分开使用。 2.使用本试剂盒前请仔细阅读试剂说明书以及全自动化学发光 免疫分析仪的使用说明书，按照相关要求进行测定操作。试剂使 用时，测定仪会自动搅拌磁性微粒，使其处于悬浮状态，如果想 快速进行检测，上机前请手动摇匀磁性微粒。试剂的相关信息可 以自动读取，一次读取相关信息即存入测定仪器，不需反复读取。 3.定标：通过测定高、低值校准品，将预先定义的主曲线上的每 个定标点调整（重新定标）为一个新的、仪器特异的测量水平， 即工作曲线。 4.定标频率：每天进行一次定标，更换不同批号试剂或者激发液 需要重新定标。 【注意事项】 1.使用前请详细阅读说明书，并将试剂水平摇匀。 2.请按照储存方法保存试剂，避免冷冻，冷冻后的试剂质量会发 生变化，请勿使用。 3.避免试剂接触皮肤、眼睛和粘膜，一旦接触，应立即用清水冲 洗接触部位。 4.不同试剂盒中各组分不能互换。 【储存条件及有效期】 1.试剂盒于 2~8℃避光未拆封状态下竖直保存，禁止冷冻。 2.有效期为 12 个月，在 2~8℃环境下保存时，稳定性可持续至所 标示的日期；开瓶后低温避光（2~8℃）可保存 1 个月。
    供应商： 北京勤邦生物技术有限公司
    品牌： 勤邦生物
    价格： ￥4000
  • Astec CHIRALDEX G-TA气相色谱柱分离母体药物对映体及其代谢物73033AST Supelco
    Astec CHIRALDEX G-TA气相色谱柱分离母体药物对映体及其代谢物73033AST Supelco73033ASTSupelcoAstec® CHIRALDEX® G-TA 毛细管气相色谱柱Astec® CHIRALDEX® G-TA Capillary GC ColumnL × I.D. 30m × 0.25mm, df0.12μm◆产品描述：美国色谱科Supelco Astec CHIRALDEX G-TA 毛细管气相色谱柱是第 1 组 CSP（表面相互作用，复合衍生物）的首选。该阶段已被证明是制药行业最广泛选择的阶段，特别是在临床试验的各个阶段中手性中间体和药物研究的分析。在没有包含机制的情况下发生分离，并且通常比大多数手性固定相更快且更有效。G-TA 也被用于分离母体药物对映体及其代谢物。G-TA 对含氧分析物的选择性最高，如醇、二醇和多元醇，作为游离醇和酰基衍生物；胺类作为酰基衍生物；氨基醇、卤素（Cl Br F）、氨基酸、羟基酸、内酯、呋喃和吡喃。它对卤化物也具有高选择性。Chem/Phys Resistance温度限制：-10 °C 至 180 °C 等温和程序的Other Notes辅助产品：SyringesVials气体净化和气体管理吸入管路、玻璃棉和专用手动工具、手套和专用手动工具柱套圈、螺母和专用手动工具◆北京康林科技科技有限责任公司是美国Supelco公司一级代理商，供货美国色谱科Supelco Astec CHIRALDEX G-TA 毛细管气相色谱柱。Astec 为以下机构的注册商标： Sigma-Aldrich Co. LLCCHIRALDEX 为以下机构的注册商标： Sigma-Aldrich Co. LLC◆订货信息：73035ASTAstec CHIRALDEX G-TA 毛细管气相色谱柱L × I.D. 50 m × 0.25 mm, df 0.12 μm (Supelco)73031ASTAstec CHIRALDEX G-TA 毛细管气相色谱柱L × I.D. 10 m × 0.25 mm, df 0.12 μm (Supelco)73032ASTAstec CHIRALDEX G-TA 毛细管气相色谱柱L × I.D. 20 m × 0.25 mm, df 0.12 μm (Supelco)73033ASTAstec CHIRALDEX G-TA 毛细管气相色谱柱L × I.D. 30 m × 0.25 mm, df 0.12 μm (Supelco)73034ASTAstec CHIRALDEX G-TA 毛细管气相色谱柱L × I.D. 40 m × 0.25 mm, df 0.12 μm (Supelco)◆北京康林科技科技有限责任公司是美国Supelco公司一级代理商，供货美国色谱科Supelco Astec CHIRALDEX G-TA 毛细管气相色谱柱。 ◆欢迎联系北京康林科技科技有限责任公司咨询相关业务。Astec CHIRALDEX G-TA气相色谱柱分离母体药物对映体及其代谢物73033AST Supelco
    供应商： 北京康林科技有限责任公司
    品牌： Supelco
    价格： 面议
  • Astec CHIRALDEX G-TA气相色谱柱分离母体药物对映体及其代谢物73035AST Supelco
    Astec CHIRALDEX G-TA气相色谱柱分离母体药物对映体及其代谢物73035AST Supelco73035ASTSupelcoAstec® CHIRALDEX® G-TA 毛细管气相色谱柱Astec® CHIRALDEX® G-TA Capillary GC ColumnL × I.D. 50m × 0.25mm, df0.12μm◆产品描述：美国色谱科Supelco Astec® CHIRALDEX G-TA 毛细管气相色谱柱是第 1 组 CSP（表面相互作用，复合衍生物）的首选。该阶段已被证明是制药行业最广泛选择的阶段，特别是在临床试验的各个阶段中手性中间体和药物研究的分析。在没有包含机制的情况下发生分离，并且通常比大多数手性固定相更快且更有效。G-TA 也被用于分离母体药物对映体及其代谢物。G-TA 对含氧分析物的选择性最高，如醇、二醇和多元醇，作为游离醇和酰基衍生物；胺类作为酰基衍生物；氨基醇、卤素（Cl Br F）、氨基酸、羟基酸、内酯、呋喃和吡喃。它对卤化物也具有高选择性。Chem/Phys Resistance温度限制：• -10 °C 至 180 °C 等温和程序的Other Notes辅助产品：SyringesVials气体净化和气体管理吸入管路、玻璃棉和专用手动工具、手套和专用手动工具柱套圈、螺母和专用手动工具◆北京康林科技科技有限责任公司是美国Supelco公司一级代理商，供货美国色谱科Supelco Astec® CHIRALDEX G-TA 毛细管气相色谱柱。Astec 为以下机构的注册商标： Sigma-Aldrich Co. LLCCHIRALDEX 为以下机构的注册商标： Sigma-Aldrich Co. LLCmaterial fused silicadescription GC capillary columnpackaging pkg of 1eaparameter -10-180 °C temperature (isothermal or programmed)Beta value 500df0.12μmapplication(s) gas chromatography (GC): suitableL × I.D. 50m × 0.25mmmatrix active group non-bonded 2,6-di-O-pentyl-3-trifluoroacetyl derivative of γ-cyclodextrin phaseFeatured Industry AgricultureChemicals and Industrial PolymersCleaning ProductsClinicalCosmeticsEnvironmentalFlavors and FragrancesFood and BeveragesForensics and ToxicologyLife Science and BiopharmaPersonal CarePharmaceutical (small molecule)column type capillary chiralseparation technique chiral◆订货信息：73035ASTAstec® CHIRALDEX® G-TA 毛细管气相色谱柱L × I.D. 50 m × 0.25 mm, df 0.12 μm (Supelco)73031ASTAstec® CHIRALDEX® G-TA 毛细管气相色谱柱L × I.D. 10 m × 0.25 mm, df 0.12 μm (Supelco)73032ASTAstec® CHIRALDEX® G-TA 毛细管气相色谱柱L × I.D. 20 m × 0.25 mm, df 0.12 μm (Supelco)73033ASTAstec® CHIRALDEX® G-TA 毛细管气相色谱柱L × I.D. 30 m × 0.25 mm, df 0.12 μm (Supelco)73034ASTAstec® CHIRALDEX® G-TA 毛细管气相色谱柱L × I.D. 40 m × 0.25 mm, df 0.12 μm (Supelco)◆北京康林科技科技有限责任公司是美国Supelco公司一级代理商，供货美国色谱科Supelco Astec® CHIRALDEX G-TA 毛细管气相色谱柱。 ◆欢迎联系北京康林科技科技有限责任公司咨询相关业务。Astec CHIRALDEX G-TA气相色谱柱分离母体药物对映体及其代谢物73035AST Supelco
    供应商： 北京康林科技有限责任公司
    品牌： Supelco
    价格： 面议
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  • 代谢物数据库 400-612-9980
    代谢组学指对某一生物、组织或细胞在一特定生理时期内形成的各种代谢产物进行全面定性和定量分析的一系列技术，主要研究的是各种代谢途径的底物和产物的小分子代谢物（通常MW＜1000），近年来在食品及医药领域都有广泛的应用，如可用于改善食品口味和品质、开发功能保健食品、判别食品真伪及对食品进行质量控制，对血液、细胞和尿液的代谢物进行分析可以阐明生理和病理机制、发现先天性代谢缺陷或癌症的标志物等。代谢组学样品尤其是生物样品通常含有大量的干扰物质，如何从大量检出组分中快速确定哪些化合物是目标分析的关键物质以及如何准确排除干扰组分检测到痕量代谢物是目前研究工作者所面临的挑战。岛津一直致力于为代谢组学研究工作开发配套解决方案，数年前就推出了针对性的专业数据库，并不断进行更新和升级，今年该数据库再一次进行了强有力的扩充和升级，与此同时岛津积极与国内客户开展合作进一步扩充数据库。代谢物数据库包含代谢物组分的各种信息，是代谢物分析的有力手段。Smart Metabolites Database Ver.2化合物数量扩增至600多种，新增植物次生代谢物，如功能性成分儿茶素和绿原酸等代谢物信息，同时提供氨基酸、脂肪酸和糖的专用分析方法，扩展了数据库的适用范围。&bull 自动创建代谢物检测高灵敏度MRM分析方法Scan方法是代谢物分析的传统方式，但是对于痕量组分尤其是代谢物有重叠或是有污染物干扰时灵敏度往往无法满足要求。代谢物数据库包含优化后的MRM分析条件，同时结合AART保留时间校准功能，无需标准品即可轻松创建高灵敏度和高选择性的MRM方法进行代谢物泛靶向分析，即使是痕量组分也能准确定性和定量。&bull 省时、省力代谢物数据库包含600多种化合物信息，适用于各种样品分析，但与此同时数据分析时间也随着可分析化合物种类的增多而延长。为了更好的满足用户需求，新版数据库增加过滤功能，根据不同的样品的类型（植物、动物、血液、尿液、细胞），允许用户只选择和分析给定样品中可能被检测到的代谢物，从而大大节省分析过程中的时间和劳动力。&bull 提供“即时可用”的糖定量分析方法代谢组学分析中常用甲氧肟-TMS衍生化法，但是还原糖会产生多种几何异构体，在色谱上难以实现分离。数据库增加新的糖衍生化方法实现糖的选择性检测，同时包含24种主要糖分析所需的化合物信息和校准曲线信息，无需标准品即可轻松获得糖的半定量结果。&bull 食品代谢组学分析完整解决方案基于新版代谢物数据提供GC/MS食品代谢组学分析从样本制备到多变量分析的完整支持。数据库包含的“代谢组学手册”全方位说明从样品制备到多变量分析的每个步骤，即使是初学者也可以根据手册轻松应对。应用实例——番茄品种间的多变量分析利用Smart Metabolites Database Ver.2 对4种不同番茄的代谢物进行分析，然后利用多组学方法包，观察不同品种之间的差异。从分析结果可以看出，与其它番茄品种相比，A品种含有大量的氨基酸，C品种则含有大量的糖。同时利用糖的专用分析方法对不同番茄品种的糖代谢物进行半定量分析，从而确证每个品种间存在差异。
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    厂商： 岛津企业管理（中国）有限公司
    品牌： 岛津/Shimadzu
    型号： Smart Metabolites Database Ver.2
    价格： 面议
  • 赛默飞Orbitrap Elite™ 组合式质谱仪 400-611-9236
    Thermo ScientificTM Orbitrap EliteTM 组合式质谱仪具有高场Orbitrap以及先进的信号处理技术。该系统能提供极高的杰出的分辨能力，为客户探索和解决蛋白质组学、代谢组学、脂类组学和代谢领域最为复杂和挑战性的应用研究提供帮助。 Orbitrap Elite 体现了多种先进的技术，包括它的质量分析器几何学、独特的信号处理技术、改善离子束到Orbitrap 质量分析器传输效率的全新离子转移光学系统，以及新的镜像电流前置放大器。这些功能与新的Velos ProTM 离子阱技术（线性检测电子学、快速扫描和中性阻断前端离子光学）相结合能提高整个系统的定量性能，加快分析速度并增加运行时间。这些独特的创新相结合能提供： 最大化的分辨能力； 提高了定量结果的精度度和可信度，而且增强了与UHPLC的兼容能力； 高品质的更高能量碰撞诱导解离（HCD）质谱图和FTMSn谱图裂解树能得到可靠的结构鉴定结果； 超高的灵敏度能检测极低丰度的蛋白质、肽和代谢物。 为综合性蛋白质组学研究提供新的可能 对于Top-Down的蛋白质鉴定，Orbitrap Elite超高的分辨率和灵敏度能帮助实验室提高完整蛋白质分子量的测量水平。采用互补的碎裂技术，如碰撞诱导解离（CID）、电子转移解离（ETD）和高能碰撞诱导解离（HCD）时，该系统还可以获得更高的蛋白质序列覆盖率。这些特征还能为突变和翻译后修饰（PTMs）的准确定位提供帮助。裂解技术的多功能性实现了最复杂的PTMs（包括多糖）的检测。 对于Bottom-Up的蛋白质组学实验，Orbitrap Elite能通过改善蛋白质、PTM和肽的鉴定，为实验室提供更高的蛋白质组覆盖率，即使是低丰度蛋白质也能获得满意的结果。对于定量蛋白质组学，当采用诸如串联质谱标记（TMT）的同位素标记方法时，更高的系统速度和灵敏度能增加可定量的肽的数目。 为代谢组学和代谢研究提供新的可能 对于代谢组学、脂类组学和代谢的研究，Orbitrap Elite能提供超高质量的HCD和MSn谱图，为可靠的代谢物鉴定提供更丰富的结构信息。相较于以前的系统，其超高的灵敏度能检测到更多的代谢物和其它重要的样品组分。该系统的高分辨率特别适合于诸如脂类分析时所需的同位素物质的测定。 超高分辨率、准确的质量数、快速扫描和线性检测的特性能减少样品基质干扰、提高结果重现性并实现更高的准确度，从而增强定量结果的可信度。为了满足全面的代谢研究的需求，Orbitrap Elite在同一个高性能系统中提供定性和定量工作流程。
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    厂商： 赛默飞色谱与质谱
    品牌： 赛默飞/Thermo Fisher
    型号： Orbitrap Elite&#8482
    价格： 400万 - 500万元
  • 赛默飞LTQ XL线性离子阱质谱仪 400-611-9236
    Thermo Scientific LTQ XL质谱与Ultimate 3000高速液相色谱系统联用，是高通量分析的最佳工具。结合多种解离技术，包括脉冲碰撞解离(PQD）和电子转移解离(ETD），LTQ XL提供最丰富的结构信息。广泛应用于蛋白质组学、代谢物鉴定、药物研发定量分析、法医和临床分析等领域。LTQ XL功能简介：1.可升级的电子转移裂解（ETD)模块可以提供传统裂解方法无法得到的蛋白质翻译后修饰信息；2.脉冲碰撞能量诱导解离（PQD)功能可以提供低质量端碎片离子信息；3.高选择MS/MS分析给谱图在数据库和谱库检索更好的匹配，提高了结构确证的可靠性。另外快速极性切换，母离子相关MS3数据关联扫描，可以对翻译后修饰和代谢物组成的鉴定进行智能、快速分析，还可以和高端的回旋共振质谱组合成最先进的多级高分辨杂交质谱仪；4.自动数据依赖性多级质谱采集技术不仅为用户提供预测代谢物（母离子列表）结构信息，也能提供未预测到的代谢物结构信息。此外使用自动固定中性丢失数据依赖性(CNL)扫描触发三级质谱扫描能检测某一类的代谢物。使用MetworksTM 和Mass Frontier分析软件增强复杂基质中代谢物筛选和鉴别功能，使谱图解析更简便。离子化技术：* IonMax离子源：ESI(电喷雾电离），APCI(大气压化学电离）和APPI（大气压光电离）探头都是基于革新的Ion Max离子源而设计。它具有超高性能，结构简单以及无需工具就可进行ESI和APCI探头更换的特点，探头在x，y，z三个方向均可调节。无论对于低流速还是高流速，都可以优化最佳位置获得最好的灵敏度。* 满足各种需要的离子源配置：ESI(电喷雾电离源），APCI(大气压化学电离源），APPI（大气压光电离源），纳喷电离源（NSI)。主要应用：* 应对代谢物鉴定和确证，LTQ系列质谱可自动查找到所有可能的代谢物。* 基于离子/离子化学的电子转移解离(ETD)，LTQ XL离子阱是实现此技术的最完美仪器。ETD与CID互为补充，提高蛋白序列覆盖率；保护不稳定PTM翻译后修饰基团，简化数据分析；单次进样自动启动CID和ETD。* 母离子智能选择：自动数据依赖多级质谱采集技术不仅能为用户提供预测代谢物（母离子列表）结构信息，也能提供提供未预测的代谢物结构信息。此外，使用自动固定中性丢失数据依赖性（CNL)扫描触发三级质谱扫描能检测某一类的代谢物。使用MetWorks和MassFrontier分析软件增强复杂基质钟代谢物筛选和鉴别功能，使谱图解析更加简便。* 应对蛋白质组学和生物标记问题，ETD解离技术使LTQ XL成为蛋白质组学研究更强大的分析工具。* LTQ和LTQ XL质谱均可配置ETD裂解源，ETD能够为线性离子阱提供类似ECD（电子捕获解离）的裂解碎片，在生成大量肽段碎片的同时，保护不稳定的PTM翻译后修饰集团，例如磷酸化翻译后修饰。ETD功能与赛默飞世尔线性离子阱的高离子储存量相结合，是蛋白质和肽类分析的新型有效工具。
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    厂商： 赛默飞色谱与质谱
    品牌： 赛默飞/Thermo Fisher
    型号： LTQ XL
    价格： 500万 - 750万元
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  • 【分享】我国科学家从玉米中提取出抗艾蛋白酶突变体

    可选择性杀伤HIV感染细胞,为HIV药物生产提供新思路经过多年的科技攻关，近日，香港中文大学教授邵鹏柱学科组与中科院昆明动物研究所研究员郑永唐学科组合作，从玉米中获得了一种能够选择性地杀伤艾滋病病毒（HIV）感染细胞的蛋白酶突变体。该研究成果为研发特异性靶向HIV感染细胞的新型抗HIV药物提供了新思路和新策略。 据悉，HIV存在潜藏机制可以长期潜伏在细胞中而逃逸宿主免疫系统的攻击，目前已上市的抗HIV药物均不能选择性地杀伤感染细胞而根除病毒。郑永唐认为，新的研究思路对开发新型抗HIV药物显得非常重要，研究具有选择性地杀伤HIV感染细胞而保护正常细胞不受伤害的抗艾滋病药物是极有前景的方向。 核糖体失活蛋白（RIPs）具有RNA N-糖苷酶活性，可以阻遏延长因子EF-1或EF-2与核糖体的结合，抑制蛋白质的生物合成。因此，RIPs具有很高的细胞毒性，常常被开发成为免疫毒素、抗病毒或抗肿瘤药物。RIP分为3类：I型、II型和III型。其中，III型RIP以玉米RIP为代表，先合成无活性的含有一段25氨基酸的内部失活结构域的前体蛋白，前体蛋白被切除该结构域后才成为有活性的核糖体失活蛋白。 在香港研究资助局、科技部“973”项目、国家重大科技专项、中科院等项目的资助下，邵鹏柱、郑永唐等对玉米RIP的内部失活结构域进行一系列的结构修饰和改造，获得了对HIV-1蛋白酶特异识别并激活的玉米RIP突变体。细胞水平实验的研究表明，突变体对未感染细胞毒性低，但突变体进入HIV-1感染细胞后则可被细胞内的HIV-1蛋白酶识别并切割去除失活结构域转变成为活性蛋白，从而选择性地杀伤HIV-1感染细胞。同时，通过增加突变体进入细胞的效率，对HIV-1感染细胞的杀伤力更强。突变体也可以被HIV-1蛋白酶耐药株的蛋白酶识别并激活，因此突变体对HIV-1蛋白酶耐药株感染细胞也有很好的选择杀伤性。

  • 【转帖】我国科学家从玉米中提取出抗艾蛋白酶突变体

    可选择性杀伤HIV感染细胞,为HIV药物生产提供新思路　　经过多年的科技攻关，近日，香港中文大学教授邵鹏柱学科组与中科院昆明动物研究所研究员郑永唐学科组合作，从玉米中获得了一种能够选择性地杀伤艾滋病病毒（HIV）感染细胞的蛋白酶突变体。该研究成果为研发特异性靶向HIV感染细胞的新型抗HIV药物提供了新思路和新策略。　　据悉，HIV存在潜藏机制可以长期潜伏在细胞中而逃逸宿主免疫系统的攻击，目前已上市的抗HIV药物均不能选择性地杀伤感染细胞而根除病毒。郑永唐认为，新的研究思路对开发新型抗HIV药物显得非常重要，研究具有选择性地杀伤HIV感染细胞而保护正常细胞不受伤害的抗艾滋病药物是极有前景的方向。　　核糖体失活蛋白（RIPs）具有RNA N-糖苷酶活性，可以阻遏延长因子EF-1或EF-2与核糖体的结合，抑制蛋白质的生物合成。因此，RIPs具有很高的细胞毒性，常常被开发成为免疫毒素、抗病毒或抗肿瘤药物。RIP分为3类：I型、II型和III型。其中，III型RIP以玉米RIP为代表，先合成无活性的含有一段25氨基酸的内部失活结构域的前体蛋白，前体蛋白被切除该结构域后才成为有活性的核糖体失活蛋白。　　在香港研究资助局、科技部“973”项目、国家重大科技专项、中科院等项目的资助下，邵鹏柱、郑永唐等对玉米RIP的内部失活结构域进行一系列的结构修饰和改造，获得了对HIV-1蛋白酶特异识别并激活的玉米RIP突变体。细胞水平实验的研究表明，突变体对未感染细胞毒性低，但突变体进入HIV-1感染细胞后则可被细胞内的HIV-1蛋白酶识别并切割去除失活结构域转变成为活性蛋白，从而选择性地杀伤HIV-1感染细胞。同时，通过增加突变体进入细胞的效率，对HIV-1感染细胞的杀伤力更强。突变体也可以被HIV-1蛋白酶耐药株的蛋白酶识别并激活，因此突变体对HIV-1蛋白酶耐药株感染细胞也有很好的选择杀伤性。　　该研究成果已在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上发表。

  • 【分享】我国科学家从玉米中提取出抗艾蛋白酶突变体

    经过多年的科技攻关，近日，香港中文大学教授邵鹏柱学科组与中科院昆明动物研究所研究员郑永唐学科组合作，从玉米中获得了一种能够选择性地杀伤艾滋病病毒（HIV）感染细胞的蛋白酶突变体。该研究成果为研发特异性靶向HIV感染细胞的新型抗HIV药物提供了新思路和新策略。据悉，HIV存在潜藏机制可以长期潜伏在细胞中而逃逸宿主免疫系统的攻击，目前已上市的抗HIV药物均不能选择性地杀伤感染细胞而根除病毒。郑永唐认为，新的研究思路对开发新型抗HIV药物显得非常重要，研究具有选择性地杀伤HIV感染细胞而保护正常细胞不受伤害的抗艾滋病药物是极有前景的方向。核糖体失活蛋白（RIPs）具有RNA N-糖苷酶活性，可以阻遏延长因子EF-1或EF-2与核糖体的结合，抑制蛋白质的生物合成。因此，RIPs具有很高的细胞毒性，常常被开发成为免疫毒素、抗病毒或抗肿瘤药物。RIP分为3类：I型、II型和III型。其中，III型RIP以玉米RIP为代表，先合成无活性的含有一段25氨基酸的内部失活结构域的前体蛋白，前体蛋白被切除该结构域后才成为有活性的核糖体失活蛋白。在香港研究资助局、科技部“973”项目、国家重大科技专项、中科院等项目的资助下，邵鹏柱、郑永唐等对玉米RIP的内部失活结构域进行一系列的结构修饰和改造，获得了对HIV-1蛋白酶特异识别并激活的玉米RIP突变体。细胞水平实验的研究表明，突变体对未感染细胞毒性低，但突变体进入HIV-1感染细胞后则可被细胞内的HIV-1蛋白酶识别并切割去除失活结构域转变成为活性蛋白，从而选择性地杀伤HIV-1感染细胞。同时，通过增加突变体进入细胞的效率，对HIV-1感染细胞的杀伤力更强。突变体也可以被HIV-1蛋白酶耐药株的蛋白酶识别并激活，因此突变体对HIV-1蛋白酶耐药株感染细胞也有很好的选择杀伤性。该研究成果已在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上发表。（科学时报）

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  • 生物大分子标记新突破：可基因编码的代谢糖质标记技术
    生物体中几乎所有的细胞都具有相同的基因组，而不同的细胞类型和功能则由不同的基因表达、表观遗传修饰和翻译后修饰等所决定。解析特定器官或组织中特定细胞的生物大分子图谱对探究发育、细胞间通讯以及疾病的发生发展等都具有重要意义。因此，开发细胞选择性的生物大分子标记方法，近年来受到了科学家们的广泛关注。通过基因编码的方法，人们在活体动物中实现了蛋白质的组织特异性和细胞选择性标记和分析。然而，糖质（glycan）作为另外一种主要的生物大分子，尚无法通过基因编码的方式，实现活体中的细胞选择性标记。糖质以寡糖、多糖、糖蛋白、糖脂等形式直接参与细胞的分化增殖、免疫调节、信号转导、细胞迁移等重要的生命活动，对其进行在体标记和分析一直是领域内的一个难点。其中，基于生物正交化学的代谢糖质标记（metabolic glycan labeling）技术已经成为了最主要的工具之一。经过20多年的发展，目前已有数十种非天然糖分子可用以在活细胞和活体中标记糖质。然而，非天然糖在活体中并不具备器官或细胞特异性，无法实现精准的细胞选择性标记，阐释特定细胞群体中糖质所发挥的生物学功能。北京大学化学与分子工程学院、北大-清华生命科学联合中心陈兴教授课题组一直致力于解决这个问题，此前开发了基于靶向性脂质体的非天然糖代谢标记技术，实现了肿瘤组织和脑部的糖质标记。同时，他们意识到，基因编码技术可以在活体中实现更加精准的细胞选择性。为了实现这一目标，继续推进代谢糖质标记技术的应用，2022年5月5日，该课题组在 Nature Chemical Biology 上发表了题为“Cell-type-specific labeling and profiling of glycans in living mice”的论文，报道了一种可基因编码的代谢糖质标记技术（GeMGL）。该技术将“凸凹互补（bump and hole）”的化学遗传学策略与代谢糖质标记方法相结合，利用非天然糖1,3-Pr2GlcNAl（Bump）及其匹配的焦磷酸酶突变体AGX2F383G（Hole）的正交组合，在活体动物上实现了细胞选择性糖质标记和分析。他们从一个具有低标记效率的非天然糖—乙酰胺基葡萄糖的叠氮类似物GlcNAz出发，确认了其代谢通路中的焦磷酸酶AGX是限速酶，将其过表达可以增强代谢强度。他们随即想到，增大非天然基团并对AGX酶进行突变，可能可以开发出凹凸对。于是，他们采用了炔基修饰的乙酰胺基葡萄糖GlcNAl和焦磷酸酶突变体AGX2F383G，通过体外和细胞实验证明了GlcNAl的代谢完全依赖焦磷酸酶突变体AGX2F383G。接着，在多细胞共培养体系和小鼠移植瘤模型中，证明了GeMGL策略的可行性。基于此，他们将该策略拓展到了转基因小鼠中。他们首先利用心肌细胞特异的启动子α-MHC实现了AGX2F383G在小鼠心肌细胞中的特异性表达，然后腹腔注射非天然糖1,3-Pr2GlcNAl，实现了非天然糖分子在小鼠心肌细胞中的特异性代谢。从各组织标记结果来看，GeMGL策略展现出严格的心肌细胞选择性。结合定量蛋白质组学方法，在小鼠心肌细胞中鉴定到582个O-GlcNAc修饰蛋白。分析发现，心肌细胞中许多糖酵解、TCA循环和氧化磷酸化途径相关蛋白都具有O-GlcNAc糖基化修饰，表明O-GlcNAc糖基化修饰可能在心肌细胞的线粒体能量代谢过程中发挥重要功能。在转基因小鼠中进行的细胞类型特异性代谢糖质标记该工作提供了一种可基因编码的细胞特异性糖质标记技术GeMGL，为在活体层面研究糖质在特定细胞类型中的生物学功能提供了一种便利、有效的工具。该技术有望被推广到更为复杂的神经系统中，并在相关疾病模型中探究糖基化与神经发育、神经退行性疾病等的关系。陈兴 北京大学化学学院教授，生命科学联合中心高级研究员，合成与功能生物分子中心研究员。长期致力于糖化学和糖生物学研究，糖质标记和分析是其研究重点之一。综合运用化学方法、生物手段和纳米技术，研究糖基化的生物学功能及其在代谢疾病及其心血管并发症中的作用。原文连接：https://www.nature.com/articles/s41589-022-01016-4
    时间： 2022-05-23
    作者： Ev
  • Nature | 菌群代谢物激活自然杀伤性T细胞的机制
    机体与共生微生物相互作用，共同进化，在机体的免疫系统发育和稳态维持发挥关键作用。微生物代谢物多样性水平很高，宿主已经进化出复杂的机制来区分病原体和共生体衍生而来的分子。但是在一个物种中，微生物代谢物仍然会存在结构变异。以结构为基础探究化学异构体的生物学作用极具挑战性。在人肠道微生物中，脆弱拟杆菌经常用于研究共生菌衍生物活性的分子机制。目前已经鉴定出α-半乳糖神经酰胺（α-Galactosylceramide BfaGCs）是由脆弱拟杆菌产生的可用做免疫调节分子的衍生物。新生小鼠脆弱拟杆菌单菌定植或者新生小鼠口服BfaGCs可以调节肠道NKT细胞数量。而给与小鼠BfaGCs突变的脆弱拟杆菌，小鼠的表现类似于无菌小鼠。也有报道发现鞘氨醇单胞菌可以调控肠道NKT（natural killer T）细胞功能。但是菌群衍生物在调控宿主免疫系统中的分子机制尚不清楚。2021年11月10日，来自哈佛大学的Dennis L. Kasper 团队在Nature 上发表题为Host immunomodulatory lipids created by symbionts from dietary amino acids 的文章。本研究从结构水平上证实BfaGCs可以直接作用于NKT细胞，与CD1d和TCR结合激活NKT。作者首先利用LC-MS/MS技术分析脆弱拟杆菌鞘脂发现BfaGCs是同源酰基链的混合物。其中C34丰度最高。鉴于共生菌来源鞘脂的结构多样性，作者系统构建了16个BfaGCs类似物，7个异构体。支链BfaGCs在真核生物中相对少见，原核生物中更常见。于是作者评估了支链氨基酸对于BfaGCs生物合成的影响。分析后发现支链氨基酸可以直接渗入脂质决定BfaGCs的结构，而不含氨基酸时BfaGCs倾向于单支和非支化结构。进一步研究发现宿主饮食中补充或者去除支链氨基酸直接影响单支和分支型鞘脂的比例。这些结果在分子水平证实了宿主膳食对于肠道菌群衍生物合成的影响。接下来作者开始通过靶向脆弱杆菌支链氨基酸代谢途径来探究支链BfaGCs对于肠道NKT的调控作用。支链氨基酸转氨酶BCAT将支链氨基酸脱氨基为a-酮羧酸，进一步再转化为支链脂肪酸。作者构建了目标基因敲除菌株（BF9343-Δ3671）。对比发现野生菌株与敲除菌株在小鼠肠道定植水平相当，敲除菌株产生不含分支的BfaGCs水平更高。分析结果显示敲除菌株定植的小鼠成年后结肠NKT细胞数量较高。作者又利用BMDC（小鼠骨髓来源树突状细胞）和NKT共培养体系评估21种合成BfaGCs对NKT的作用。检测IL2的产生水平，作者把21中合成物分成了两组：强刺激物和弱刺激物。10个属于强刺激物都是分支结构，11个弱刺激物没有这些结构。作者又直接挑选了支链和不含支链的代表合成分子SB2222和SB2223，浓度梯度实验发现支链长度与刺激强度无关。作者用脆弱拟杆菌主要合成的SB2217 和SB2219进行体内实验。对比与KRN7000诱导的IFNr产生和CD1d配体OCH诱导的IL4，含支链的SB2217则只能较弱的产生IFNr和IL4，不含支链的SB2219则几乎不能产生IFNr和IL4。预防性给与小鼠SB2217可以保护小鼠免受炎症，减少小鼠体重减轻和组织损伤。为了细致分析SB2217的体内效应，作者分析了SB2217处理后脾脏NKT细胞的转录组特征。分析发现SB2217可以促进NKT相关细胞因子表达以及免疫信号的激活。这表明SB2217是CD1d的功能性配体和NKT细胞的激动剂。最后作者分析了BfaGC和CD1d、TCR相互作用的晶体结构，从结构水平上证明了BfaGC是由CD1d呈递的配体，并被NKT细胞受体以保守方式识别。亲和力比较支链BfaGC SB2217大于非支链 SB2219。本研究证实BfaGCs的分支结构是激活NKT细胞的关键决定因素，从而诱导特定的免疫调节基因表达特征，并从结构水平和亲和力分析证实了BfaGCs与CD1d和TCR相互作用方式。本文为菌群、饮食以及免疫系统相互作用提供了分子机制范式。原文链接：https://doi.org/10.1038/s41586-021-04083-0
    时间： 2021-11-21
    作者： dahua1981
  • 浅谈高效率突变方法ARTP
    一、育种领域有哪些？细菌、酵母、藻类、真菌、作物、鱼类...二、育种目标：希望提高有用成分的产出效率希望提高菌株的繁殖能力希望加快生长速度希望增加耐受性希望提高产量希望调整获取时间... ...三、针对育种目标，您可能会遇到以下情况：得不到想要的变异株使用的方法受到限制不愿使用危险品四、生物产业的关键技术问题和解决途径： ▲图丨：摘自陈坚院士报告五、细胞工厂构建，可以利用ARTP原理：ARTP（Atmospheric Room Temperature Plasma）是一种全新的射频放电技术，该技术使用惰性气体放电，能够在常压室温条件下产生大量高能量的活性粒子；研究表明，活性粒子可以有效的用于细胞的遗传物质并导致DNA结构损伤，进而利用细胞自身高容错率的修复机制，产生大量的突变位点，最终获得大容量的基因突变库。六、ARTP具有以下特点：突变性能更强、突变位点更丰富放电条件温和，活性粒子丰富，使用方便安全应用范围广泛，包括植物界、真菌界、动物界、藻类、原生动物、细菌等截止到2022年09月27日，使用ARTP发表的中文文献407篇，英文文献168篇，专利250篇，学位论文174篇，共计999篇与UV相比可以得到多样的变异体，设备具有易操作，机器故障率低，实验等待时间短，安全等特点七、ARTP诱变原理：高纯氦气激发的等离子体富含各种高能量的活性粒子。活性粒子可以透过细胞壁、细胞膜并有效地作用于蛋白质、DNA等。活性粒子对DNA物质产生作用，引起DNA结构的多样性损伤。细胞启动SOS修复机制，形成大量突变位点。诱变后菌株/植株经过筛选获得性状优良的细胞，最终大大地提高生产效率。八、ARTP安全高效：常压室温等离子体ARTP获得欧盟认证及美国UL认证。由于可以在常压室温下进行处理，照射的等离子体温度较低，被证实适用于各种物种。九、ARTP应用案例：Case1：细菌领域成果多、效果显著筛选到高产L-亮氨酸的突变株，产量达到18.55 mg/g，比出发菌株提高2.91倍。（Nature Communications，9（2018）） Case2：霉菌产色素能力大幅度提升突变菌株产橙、黄色素能力比出发菌株分别提高136%、43%。（核农学报，2016,30（4）：654-661）Case3：应用ARTP茂源链轮丝菌，提高所产谷氨酰胺酶的酶活▲图丨：ARTP诱变后的典型菌落特征（G1-G14为形态与出发菌株不同的典型菌落代表；G15为与出发菌株形态相同）采用ARTP技术对链霉菌孢子进行诱变，突变率42.8%，正突变率20.6%，高产突变株G2-1酶活达到2.73U/mL，比出发菌株提高了82%。（微生物学通报，2010，37(11)：1642-1649）Case4：优良植物品系的选育▲图丨玉米矮杆突变M2代 玉米矮杆突变M3代ARTP辐照玉米萌动种子，M1代中发现矮秆、分蘖和雄性不育的玉米突变。对M3矮秆突变株系与其亲本基因组DNA重测序表明，ARTP诱导玉米基因组突变率为0.083%，远高于化学诱变。Case5：ARTP诱变育种技术在水产育种中的应用ARTP处理牙鲆受精卵和精子，突变体出现明显的生长性状分离；在全基因组水平，ARTP诱导牙鲆的突变率高达0.064%，远高于ENU在其他鱼类上所获得的突变率。▲图丨常压室温等离子体诱变育种仪ARTP（来源：天木生物）
    时间： 2022-10-20
    作者： 天木生物
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