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固碳突变体代谢物

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  • 【分享】我国科学家从玉米中提取出抗艾蛋白酶突变体

    可选择性杀伤HIV感染细胞,为HIV药物生产提供新思路经过多年的科技攻关,近日,香港中文大学教授邵鹏柱学科组与中科院昆明动物研究所研究员郑永唐学科组合作,从玉米中获得了一种能够选择性地杀伤艾滋病病毒(HIV)感染细胞的蛋白酶突变体。该研究成果为研发特异性靶向HIV感染细胞的新型抗HIV药物提供了新思路和新策略。 据悉,HIV存在潜藏机制可以长期潜伏在细胞中而逃逸宿主免疫系统的攻击,目前已上市的抗HIV药物均不能选择性地杀伤感染细胞而根除病毒。郑永唐认为,新的研究思路对开发新型抗HIV药物显得非常重要,研究具有选择性地杀伤HIV感染细胞而保护正常细胞不受伤害的抗艾滋病药物是极有前景的方向。 核糖体失活蛋白(RIPs)具有RNA N-糖苷酶活性,可以阻遏延长因子EF-1或EF-2与核糖体的结合,抑制蛋白质的生物合成。因此,RIPs具有很高的细胞毒性,常常被开发成为免疫毒素、抗病毒或抗肿瘤药物。RIP分为3类:I型、II型和III型。其中,III型RIP以玉米RIP为代表,先合成无活性的含有一段25氨基酸的内部失活结构域的前体蛋白,前体蛋白被切除该结构域后才成为有活性的核糖体失活蛋白。 在香港研究资助局、科技部“973”项目、国家重大科技专项、中科院等项目的资助下,邵鹏柱、郑永唐等对玉米RIP的内部失活结构域进行一系列的结构修饰和改造,获得了对HIV-1蛋白酶特异识别并激活的玉米RIP突变体。细胞水平实验的研究表明,突变体对未感染细胞毒性低,但突变体进入HIV-1感染细胞后则可被细胞内的HIV-1蛋白酶识别并切割去除失活结构域转变成为活性蛋白,从而选择性地杀伤HIV-1感染细胞。同时,通过增加突变体进入细胞的效率,对HIV-1感染细胞的杀伤力更强。突变体也可以被HIV-1蛋白酶耐药株的蛋白酶识别并激活,因此突变体对HIV-1蛋白酶耐药株感染细胞也有很好的选择杀伤性。

  • 【转帖】我国科学家从玉米中提取出抗艾蛋白酶突变体

    可选择性杀伤HIV感染细胞,为HIV药物生产提供新思路  经过多年的科技攻关,近日,香港中文大学教授邵鹏柱学科组与中科院昆明动物研究所研究员郑永唐学科组合作,从玉米中获得了一种能够选择性地杀伤艾滋病病毒(HIV)感染细胞的蛋白酶突变体。该研究成果为研发特异性靶向HIV感染细胞的新型抗HIV药物提供了新思路和新策略。  据悉,HIV存在潜藏机制可以长期潜伏在细胞中而逃逸宿主免疫系统的攻击,目前已上市的抗HIV药物均不能选择性地杀伤感染细胞而根除病毒。郑永唐认为,新的研究思路对开发新型抗HIV药物显得非常重要,研究具有选择性地杀伤HIV感染细胞而保护正常细胞不受伤害的抗艾滋病药物是极有前景的方向。  核糖体失活蛋白(RIPs)具有RNA N-糖苷酶活性,可以阻遏延长因子EF-1或EF-2与核糖体的结合,抑制蛋白质的生物合成。因此,RIPs具有很高的细胞毒性,常常被开发成为免疫毒素、抗病毒或抗肿瘤药物。RIP分为3类:I型、II型和III型。其中,III型RIP以玉米RIP为代表,先合成无活性的含有一段25氨基酸的内部失活结构域的前体蛋白,前体蛋白被切除该结构域后才成为有活性的核糖体失活蛋白。  在香港研究资助局、科技部“973”项目、国家重大科技专项、中科院等项目的资助下,邵鹏柱、郑永唐等对玉米RIP的内部失活结构域进行一系列的结构修饰和改造,获得了对HIV-1蛋白酶特异识别并激活的玉米RIP突变体。细胞水平实验的研究表明,突变体对未感染细胞毒性低,但突变体进入HIV-1感染细胞后则可被细胞内的HIV-1蛋白酶识别并切割去除失活结构域转变成为活性蛋白,从而选择性地杀伤HIV-1感染细胞。同时,通过增加突变体进入细胞的效率,对HIV-1感染细胞的杀伤力更强。突变体也可以被HIV-1蛋白酶耐药株的蛋白酶识别并激活,因此突变体对HIV-1蛋白酶耐药株感染细胞也有很好的选择杀伤性。  该研究成果已在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上发表。

  • 【分享】我国科学家从玉米中提取出抗艾蛋白酶突变体

    经过多年的科技攻关,近日,香港中文大学教授邵鹏柱学科组与中科院昆明动物研究所研究员郑永唐学科组合作,从玉米中获得了一种能够选择性地杀伤艾滋病病毒(HIV)感染细胞的蛋白酶突变体。该研究成果为研发特异性靶向HIV感染细胞的新型抗HIV药物提供了新思路和新策略。据悉,HIV存在潜藏机制可以长期潜伏在细胞中而逃逸宿主免疫系统的攻击,目前已上市的抗HIV药物均不能选择性地杀伤感染细胞而根除病毒。郑永唐认为,新的研究思路对开发新型抗HIV药物显得非常重要,研究具有选择性地杀伤HIV感染细胞而保护正常细胞不受伤害的抗艾滋病药物是极有前景的方向。核糖体失活蛋白(RIPs)具有RNA N-糖苷酶活性,可以阻遏延长因子EF-1或EF-2与核糖体的结合,抑制蛋白质的生物合成。因此,RIPs具有很高的细胞毒性,常常被开发成为免疫毒素、抗病毒或抗肿瘤药物。RIP分为3类:I型、II型和III型。其中,III型RIP以玉米RIP为代表,先合成无活性的含有一段25氨基酸的内部失活结构域的前体蛋白,前体蛋白被切除该结构域后才成为有活性的核糖体失活蛋白。在香港研究资助局、科技部“973”项目、国家重大科技专项、中科院等项目的资助下,邵鹏柱、郑永唐等对玉米RIP的内部失活结构域进行一系列的结构修饰和改造,获得了对HIV-1蛋白酶特异识别并激活的玉米RIP突变体。细胞水平实验的研究表明,突变体对未感染细胞毒性低,但突变体进入HIV-1感染细胞后则可被细胞内的HIV-1蛋白酶识别并切割去除失活结构域转变成为活性蛋白,从而选择性地杀伤HIV-1感染细胞。同时,通过增加突变体进入细胞的效率,对HIV-1感染细胞的杀伤力更强。突变体也可以被HIV-1蛋白酶耐药株的蛋白酶识别并激活,因此突变体对HIV-1蛋白酶耐药株感染细胞也有很好的选择杀伤性。该研究成果已在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上发表。(科学时报)

  • 固相萃取 - 反相高效液相色谱法检测水产品中孔雀石绿和结晶紫及其代谢物

    孔雀石绿(MG)和结晶紫(CV)具有高毒素、高残留和致癌、致畸、致突变等特点,当其进入生物体内,就会产生具有更强危害的隐性孔雀石绿(LMG)和隐性结晶紫(LCV)。鉴于孔雀石绿和结晶紫的危害性,包括我国在内的许多国家都将它们列为水产养殖中的禁用药物。是进出口水产品必检项目之一。 《GB/T 19857-2005 水产品中孔雀石绿和结晶紫残留量的测定》和《SN/T 1479-2004 进出口水产品中孔雀石绿残留量检验方法》中均采用有机溶剂提取后经固相萃取柱净化,然后采用高效液相色谱法或液相色谱-串联质谱法测定。 迪马科技在参考上述两个标准的基础上开发出中性氧化铝和阳离子交换固相萃取柱串联净化后,反相高效液相色谱柱检测。该方法准确可靠,重复性好,回收率高,可作为水产品中孔雀石绿和结晶紫及代谢物的检测方法。水产品中孔雀石绿和结晶紫及其代谢物的检测 (参考《SN/T 1479-2004进出口水产品中孔雀石绿残留量检验方法》和 《GB/T 19857-2005 水产品中孔雀石绿和结晶紫残留量的测定》)1 适用范围 本方法适用于水产品中孔雀石绿和结晶紫及其代谢物的检测。2 样品准备 / 提取 1、称取已粉碎(已均质)的样品1 g于15 mL离心管中,加入1 mL 0.05 mol/L苯磺酸溶液、1 mL0.25 g/mL盐酸羟铵溶液、0.4 mL0.1 mol/L乙酸铵溶液(pH4.5)和8 mL乙腈,涡旋混合2 min,4000 rpm离心1 min;2、将上清液转移至50 mL离心管中,残渣按照步骤1重复提取一次;3、合并两次提取液,并加入6 mL三氯甲烷和7 mL水,涡旋混合1 min,4000 rpm离心1 min;4、取下层清液于旋蒸瓶中,向上层清液加入6 mL三氯甲烷,重复提取一次;5、合并两次下层三氯甲烷溶液,40℃减压蒸至近干,加入5 mL乙腈待净化。3 SPE 柱净化—— ProElut Al-N ( 1 g /6 mL )( Cat.# : 65306 )上层ProElut SCX ( 500 mg/3 mL )( Cat.# : 63604 )下层(1)活 化:加入10 mL乙腈,流出液弃去;(2)上 样:将待净化液加入小柱,流出液弃去;(3)淋 洗:加入5 mL乙腈淋洗小柱,流出液弃去,并去掉上层Al-N小柱;(4)洗 脱:加入5 mL5%氨水乙腈,收集洗脱液;(5)重新溶解:将洗脱液在40 ℃下减压蒸干,1 mL定容液*溶解残渣,过微孔滤膜供HPLC分析。*定容液:乙酸铵缓冲液:盐酸羟铵溶液=2:1乙酸铵缓冲液:乙腈:0.05 mol/L乙酸铵溶液(pH4.5)=75:25;盐酸羟铵溶液:取1 mL0.25 g/mL盐酸羟铵溶液用水定容至100mL。4 分析条件 色谱柱:Platisil ODS , 250 x 4.6 mm , 5 μm ( Cat.# 99503 ) 流 速:1.0 mL/min 检测器:UV 591 nm和UV 266 nm柱 温:30 ℃进样量:20 μL 流动相:A:乙腈 B:0.05 mol/L乙酸铵溶液(pH4.5)梯度:时间/ min05.511.011.0120B%28882828

  • 大佬们血清的色谱图怎么鉴别代谢物啊

    大佬们!俺跑完血清以后提取后的色谱图,怎么去判断代谢物和那个峰对应啊!或者说通过色谱图鉴别代谢物!俺只会手动通过Xcalibur打开raw文件,然后手动在mass range一个一个输入m/z数!比如跑正极后,参照文章里给的表格,在原有的m/z基础上加1.0078,然后用得出值去在mass range里搜

  • 【转帖】玉米为新型抗HIV药物提供了新策略

    玉米为新型抗HIV药物提供了新策略 中国科学家从玉米中获得一种能够选择性地杀伤HIV感染细胞的蛋白酶突变体,为研发新型抗HIV药物提供了新思路和新策略。这是今天从此间的中国科学院昆明动物研究所传出的消息。毗邻东南亚多国的云南省一度是中国毒品和艾滋病的重灾区。消息称,中国科学院昆明动物研究所郑永唐研究员学科组与香港中文大学邵鹏柱教授学科组合作完成了这一研究课题。郑永唐研究员从事免疫学、病毒学和抗HIV药物等研究20余年,尤其在抗HIV药物、AIDS灵长类动物模型、病毒限制因子等研究方面积累丰富的经验。他称,“HIV病毒存在潜藏机制,可以长期潜伏在细胞中而逃逸宿主免疫系统的攻击,目前已上市的抗HIV药物均不能选择性地杀伤感染细胞而根除病毒,研究具有选择性地杀伤HIV感染细胞而保护正常细胞不受伤害的抗HIV药物极为重要。”经过多年合作,内地与香港科学家对玉米核糖体失活蛋白的内部失活结构域进行一系列的结构修饰和改造,获得了能识别并激活HIV蛋白酶特异的玉米核糖体失活蛋白突变体。细胞水平实验的研究表明,此种突变体对未感染细胞毒性低,但突变体进入HIV感染细胞后,则可被细胞内的HIV蛋白酶识别并切割去除失活结构域转变成为活性蛋白,从而选择性地杀伤HIV感染细胞。研究结果还表明,因为此种突变体能够高效率地进入感染细胞,因此对HIV-1感染细胞的杀伤力更强;突变体也可以被HIV蛋白酶耐药株的蛋白酶识别并激活,因此突变体对HIV蛋白酶耐药株感染细胞也有很好的选择杀伤性。郑永唐表示,该研究成果为研发特异性靶向HIV感染细胞的新型抗HIV药物提供了新思路和新策略。“研究成果已经在国际著名学术期刊Nucleic Acids Research 发表并申请国家专利。”郑透露,此次研究获得了香港研究资助局、中国国家科技部973项目、国家重大科技专项、中国科学院等项目资助。

  • 【分享】呋喃西林代谢物产生途径的研究

    【分享】呋喃西林代谢物产生途径的研究

    呋喃西林代谢物产生途径的研究(烟台杰科检测服务有限公司,山东 烟台 265231)摘要:呋喃西林代谢物(SEM)是检测呋喃西林的标记物,本身具有致癌和弱毒性。研究发现食品中SEM的来源途径多样,不仅限于呋喃西林原药在动物体内的代谢,还包括偶氮甲酰胺(ADC)高温热解、次氯酸钠与含氮物质反应等。关键词:呋喃西林代谢物(SEM);偶氮甲酰胺(ADC);次氯酸钠 ;标记物Nitrofurazone metabolites produced by a variety of ways 关键词:呋喃西林代谢物(SEM);偶氮甲酰胺(ADC);次氯酸钠 ;标记物呋喃西林(图一)是一种引入硝基的广谱抗菌类药物, 因其杀菌能力强、抗菌谱广、不易产生耐药性、价格低廉、疗效好等优点,得到广泛应用。呋喃西林在临床上表现为明显的三致作用(致癌、致畸、致突变),因此引起各国的高度重视,欧盟早在1995年就禁止呋喃西林用作兽药,澳大利亚、美国也相继在2001年和2002年出台了相关法律,将呋喃西林作为养殖禁用药物。 呋喃西林在动物体内极易降解,短短数小时内即可代谢为呋喃西林代谢物(SEM)(图二),SEM与蛋白质结合,性质较稳定不易分解,可在动物体内存留数周。SEM常被用作检测呋喃西林原药的标记物,世界上大多数国家都以监测SEM来达到对呋喃西林原药监控的目的。 研究者发现,食品中SEM的来源不仅限于呋喃西林在动物体内的生物代谢,偶氮甲酰胺的高温热解反应、次氯酸钠作为消毒剂在食品加工过程中与含氮物质接触等都有可能导致SEM的产生。根据近年来国内外的有关研究,现将呋喃西林代谢物产生的途径做以下概述: 1、呋喃西林原药在动物体内代谢 虽然世界上大多数国家都禁止将呋喃类药物用作兽药,但因其药效和价格上的优点(上述第一段),仍有养殖者私自使用。 呋喃西林在动物体内代谢后与细胞膜蛋白结合,可在数周内保持稳定,从而延缓药物在体内的消除速度。普通的食物加工方法(如烧烤、微波加热、烹调)难以使结合态的SEM降解,经验证在弱酸条件下可以使代谢物从蛋白质中释放出来,当人食用了含有SEM的食物后,在胃酸的作用下,SEM与蛋白质解离,被人体吸收,当富集到一定量时会产生致癌的危险。 2、偶氮甲酰胺(ADC)高温热解 偶氮甲酰胺(Azodicarbonamide)(图三),简称ADC,为黄色至橘红色结晶性粉末,具有漂白和氧化双重作用,常用作面粉改良剂,可改善面团的物理操作性质及面制品组织结构 。偶氮甲酰胺能将面粉蛋白质内氨基酸的硫氢根(-SH)氧化成二硫键(-S-S-),使蛋白质链相互连结而构成立体网状结构,改善面团的弹性、韧性及均匀性,使生产出的面制品具有较大的体积,较好的组织结构。偶氮甲酰胺也是一种生产聚氯乙烯材料的发泡剂,食品玻璃容器盖子上的密封圈就是用聚氯乙烯材料制成的。 2.1 ADC—聚氯乙烯材料的发泡剂 人们第一次将偶氮甲酰胺与SEM联系在一起,是在2003年欧盟发生的一次严重的食品安全事件后。2003年欧洲食品安全局通报了一批SEM超出限量的食品,这些食品包括:果汁、果酱、蜂蜜、泡菜和消毒蔬菜、蛋黄酱,芥末,酱汁和番茄酱以及一些瓶装婴儿食品。这些食品有一个共同的特点:都是带有密封圈的玻璃或金属罐包装。欧洲食品安全局发布的调查结果为:SEM残留可能是ADC引起的。ADC用作密封圈(聚氯乙烯材料)的发泡剂,高温发泡的同时产生SEM,食物在与密封圈接触的过程中,SEM发生了迁移。 ADC的分解产物主要有气体(34%),包括氮气、一氧化碳、二氧化碳和氨,以及一些非挥法性残留物,主要是联二脲(hydrazodicarbonamide,HDC)(34%)和脲唑(urazole )(27%)。ADC在180℃-220℃的高温下加热30分钟,即可生成SEM。ADC的分解产物HDC和脲唑经加热处理可缓慢生成SEM,而同样的热处理条件下,SEM也可以生成HDC和脲唑,尽管生成的量很少。欧盟在2003年10月9曰,发布了关于SEM有害人体健康的警告,SEM具有弱毒性和致癌性。2004年1月6日,发布了2004/1/EC指令,规定在2005年8月2日后禁止使用ADC作为发泡剂用于聚氯乙烯密封垫片生产中。 2.2 ADC—面粉改良剂 Pereira et al研究发现:向不含SEM的面粉样品中添加ADC,经一定条件处理后,检出SEM 2.2 μg/kg -5.2 μg/kg。这些研究似乎证明了偶氮甲酰胺是面粉中检出西林的“罪魁祸首”。 面粉中检出氨基脲的事例并不常见,更多的是经过加热或烘烤的面制品。Becalski等研究发现:将含有ADC的面粉在特定温度下烘烤,以及用含有ADC的面粉制作成面包(经高温烘烤),都能检测出较高浓度的SEM,而同样含有ADC的面粉,不经高温处理,几乎检测不到SEM。该研究同时还发现面包中心的检出浓度要比面包外壳的稍大,经分析可能是由于面包中心的温度稍高的原因。Becalski还研究了湿度对SEM产生的影响:加水后的面粉和面包在200℃条件下烘焙,与干燥的面粉和面包同条件处理后相比,前者SEM的检出浓度要略高。这与ADC的热解产物HDC水解生成SEM需要水的条件是相符的。 在欧盟国家ADC是不允许作为面粉改良剂来使用的。同比,美国、巴西以及中国允许ADC在小麦粉中的最大添加量为45mg/kg。Anton发现,ADC添加到小麦粉中约有0.1%转化成SEM。而45mg/kg的允许添加量,显然是不安全的。 http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/06/201106190944_300449_2177386_3.jpg http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/06/201106190946_300450_2177386_3.jpg 图1 图2http://n

  • 【原创大赛】生姜中涕灭威及其代谢物检测固相萃取方法

    【原创大赛】生姜中涕灭威及其代谢物检测固相萃取方法

    生姜中涕灭威及其代谢物检测固相萃取方法一、实验目的本研究利用固相萃取法作为生姜样品的前处理方法,LC-MS/MS法作为检测手段。该方法可简化样品的前处理过程,节省有机溶剂的使用,操作简便。二、实验目标物三种涕灭威及其代谢物标准品:涕灭威(CSA:116-06-03),涕灭威砜(CSA:1646-88-4),涕灭威亚砜(CSA:1646-87-3)。三、应用范围本方法适用于生姜、大米、花生等样品中涕灭威、涕灭威砜及涕灭威亚砜LC-MS/MS检测及确证。四、参考标准进出口行业标准《SN/T 2441-2010 进出口食品中涕灭威、涕灭威砜、涕灭威亚砜残留量检测方法液相色谱-质谱/质谱法》。五、实验材料Biocomma® NH2 固相萃取柱 3mL/500mg。六、实验方法1、样品提取称取5.0g试样(精确至0.01g)于50mL离心管中,加入20mL乙腈,均质2min,振荡提取20min,上清液过无水硫酸钠收集到分液漏斗中,残渣再加入20mL乙腈,重复上述操作一次,合并2次滤液,加入20mL用乙腈饱和的正己烷,振荡10min,静置分层,弃去正己烷层,乙腈层于40℃下旋转蒸发浓缩至干,用2mL甲醇-二氯甲烷(1:99,体积比)溶解,待净化。2、SPE柱净化(1)活化:加入5mL甲醇-二氯甲烷(1:99,体积比)活化,弃去流出液。(2)上样:加入待净化液,流速控制在1 mL/min内,收集流出液。(3)洗脱:用5mL甲醇-二氯甲烷(1:99,体积比)洗脱,接收流出液,并重复一次,合并步骤(2)、(3)流出液。(4)浓缩定容:40 ℃缓慢氮气流条件下吹至近干(约0.5 mL)后挥干,用1.0mL乙腈-0.1%甲酸水溶液(10:90,体积比)定容容至1 mL,过0.45μm微孔滤膜,上LC-MS/MS,待测定。3、LC-MS/MS条件色谱柱:Venusil ASB C18(2.1×150mm,5μm,100Å)质谱仪:API 4000A:乙腈溶液;B:0.05%甲酸的水溶液http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/07/201507160926_555754_3310_3.jpg进样量:5μL柱温:30℃流速:0.3 mL/min离子源:电喷雾(ESI),正离子模式检测方式:多反应监测(MRM)http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/07/201507160927_555755_3310_3.jpg七、实验结果1、生姜基质10μg/kg加标回收结果:三个平行测试样的平均回收率均大于80%,平行样间相对标准偏差均小于5%,符合标准要求。(见表4)http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/07/201507160928_555756_3310_3.jpg2、空白样品中添加涕灭威及其代谢物色谱图http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/07/201507160929_555757_3310_3.jpghttp://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/07/201507160929_555759_3310_3.jpg本研究是逗点生物利用固相萃取法作为生姜样品的前处理方法,以进出口行业标准《SN/T 2441-2010 进出口食品中涕灭威、涕灭威砜、涕灭威亚砜残留量检测方法液相色谱-质谱/质谱法》制定,适用于生姜、大米、花生等样品中涕灭威、涕灭威砜及涕灭威亚砜LC-MS/MS检测及确证。欢迎广大色谱分析者参考。

  • [推荐]:核磁共振技术与新药安全性评价(药物代谢组学与代谢物组学)

    1.前言 随着科学与技术的发展,新药研发的速度正在日益加快,使得新药安全性评价工作的压力也变得越来越大。在新药研究开发过程中,因为安全性问题而被淘汰的候选药物占相当大的比例。一旦潜在的药物分子通过了初步的生物学筛选过程,就应该尽量减少这些候选药物分子在产品研发过程中的流失,以免造成巨大的资金和时间的浪费。因此,人们努力寻找新的分析方法,以便从功效和安全性两方面使得先导化合物的筛选更有效,从而尽可能地减少这种浪费。目前的生物分析手段主要利用基因组和蛋白质组方法,分别从基因水平和细胞蛋白质表达水平上测量生物体系对药物的反应。这两种方法都较昂贵,且劳动强度较大,然而却可能是研究在不同水平上对生物异源物质的生物应答的有力工具。但是,基因组学和蛋白质组学都不能提供可以了解生物体中整体细胞功能的信息,因为两者都忽略了整体器官中动态的代谢状态。因此,Nicholson等人提出了一种基于核磁共振的新方法,叫做metabonomics,我们暂且称之为代谢组学,以便与由代谢物组(metabolome)衍生而来的metabolomics相区别。Metabolomics研究的是一个细胞或细胞类型中所有的小分子成分,而metabonomics则是通过分析生物体液和组织来对完整的生物体(而不是单个细胞)中随时间改变的代谢物进行检测、确定、定量和分类;然后将这些***代谢轨迹与病生理过程中的生物学事件关联起。从药物研究和毒理学评价的角度来看,基因组学方法是观察给药后基因表达的改变,主要采用基因芯片技术。然而,基因调节/表达与系统的整体功能之间的关系在目前还很不清楚,主要是因为决大部分DNA是非编码的,而编码蛋白质的基因不能孤立地发挥作用,而是需要与其邻近的基因和非编码DNA一起才能发挥其功能。正式由于这个原因,人们才发展了蛋白质组学。蛋白质组学方法可以对由给药或其它病生理过程引起的细胞蛋白质组成变化进行半定量的测量。蛋白质组方法所采用的技术主要包括双向凝胶电泳和质谱技术。与基因组方法相比,蛋白质组方法较慢,且劳动强度较大。需要强调的是,虽然这些方法能够在很大程度上揭示毒理学机理,并且给出与疾病相关的新的生物标记物,却很难将这些发现与经典的毒理学指标相关联。原因很简单,因为目前的技术和方法不能对给药后反应的整个进程进行测量,也不能对生物整体的应答进行测量。因此需要发展一种新的方法来实时给出多器官生物整体的在体信息。基于NMR的代谢组学(metabonomics)方法可以满足这样的要求。2.Metabonomics在药物毒理学研究中的应用 代谢组学的目的是要扩展和补充由基因组学和蛋白质组学方法得到的对生物异源物质应答的信息。其任务是定量测量生物体对病生理刺激或基因改变的动态多参数代谢反应,是研究药物毒性和基因功能的技术平台。这个概念是根据Nicholson小组近二十年来利用1H NMR技术研究生物体液、细胞和组织中多组分代谢组成的工作而提出的。在这些研究中,还利用了模式识别,专家系统和相关的生物信息学工具。在许多情况下,药物通过与遗传物质直接作用而产生毒性,或通过诱导系统合成与药物代谢有关的酶,从而产生有毒的产物。在这种情况下,用基因组和蛋白质组学方法来评价毒性是有用的。然而,在生物异源物质有可能只在药理学水平上产生作用,因而可能不会影响基因的调节和表达。再者,显著的毒理学效应可能与基因的改变和蛋白质的合成完全不相关。因此,在许多情况下,从基因组和蛋白质组角度考虑到的反应可能不能预测药物毒性。但是,所有的由药物引起的病生理紊乱都会由于直接的化学反应,或通过与控制代谢的酶或核酸相结合而引起内源生化物质在比例、浓度、代谢通量等方面的失调。如果这种变化足够大的话,就会影响整个生物体的功能。生物体液中的代谢物是与细胞和组织中的代谢物处于动态平衡,因此,生物体中由于中毒或代谢损害而引起的细胞功能异常一定会反映在生物体液成分的变化中。要检测血浆、尿液、胆汁等生物基质中的一些具有特殊意义的微量物质,选择合适的分析方法致关重要。高分辨1H NMR波谱就非常适合用来检测生物体液中的成分异常,因为该方法可以同时对所有的代谢物进行定量分析,而且不需要样品前期准备,对任何成分一样灵敏。虽然也可以采用如质谱等其它方法,但对不同成分离子化程度的差别会影响定量和检测的可靠性。NMR方法还可以有效地用来从组织萃取物或细胞悬液中找出异常的代谢物。还可以利用高分辨魔角旋转(HR-MAS)探头来检测完整组织中的代谢物组成。由1H NMR谱检测到的生物体液中的内源性代谢物模式完全依赖于动物体内的毒素的类型。每一种类型的毒物都会在生物体液中产生特征的内源代谢物浓度和模式变化,这种特征给我们提供了毒性作用的机理和毒性位置的信息。右图所示为一系列尿样的1H NMR谱图,是大鼠经不同的毒物处理后得到的。每一张谱图只需几分钟的时间,是非常有效的。可以看出,不同毒素引起的代谢物变化是有特征性的。因为几乎所有的代谢物都有其特征的NMR谱,因而可以作为毒物引起的代谢变化的指纹图谱。利用NMR方法,人们已经成功地发现了许多新的器官特异相关毒性的代谢标记物。作为分析生物化学技术,NMR正是在这种探索性的工作上具有优势。

  • 【转帖】采用UPLC/Xevo G2 QTof对1μM维拉帕米进行快速而灵敏的体外代谢物鉴定

    目的使用ACQUITY UPLC®/Xevo™ G2 QTof质谱系统及MetaboLynx™ XS应用管理软件,鉴定通过人肝微粒体体外孵育而获取的1 μM维拉帕米的代谢物。背景近年来,随着越来越多的一线药品因存在安全性顾虑而退出市场,人们对药品研发过程中的药物代谢和毒性研究给予了更多的关注。如今,在药物发现和研制阶段提早进行药物代谢研究的趋势已比较明显。普遍的做法是对母体药物进行体外代谢物研究,以便在药品开发早期迅速确定其弱点。在药物发现阶段进行代谢物鉴定的一项挑战是:需要提供快速而通用的方法,并且该方法应足够灵敏,以使体外孵育研究可在低μM浓度水平下进行,从而使其更接近于化合物的体内作用情况。一项典型的体外代谢研究还包括分析母体药物的代谢速率和途径。此类研究的理想分析方案需提供在模拟体内条件的底物浓度下对代谢物进行检测的分析速度和灵敏度。利用与UPLC/MSE联用的Xevo G2 QTof质谱系统,体外代谢物研究可在低μM水平下进行,同时具有较好的速度、灵敏度和选择性。http://www.bio-equip.com/imgatl/20115514946.jpg图1. 人肝微粒体维拉帕米(1μM)的孵育结果显示在MetaboLynx浏览器中。解决方案将浓度为1 μM的维拉帕米与人肝微粒体在37°C下进行孵育,并分别在 0、15、30、60、120和 240分钟时加入等体积的冷乙腈终止反应。对样品进行离心,并取上清液直接进样。采用沃特世ACQUITY UPLC®系统,ACQUITY UPLC HSS T3色谱柱(1.7 μm、2.1 x 100 mm),进行色谱分离。流动相由0.1%甲酸水溶液(A)和乙腈(B)组成,进样量为5.0 μL。在ESI正离子模式下,使用Xevo G2 QTof质谱仪采用UPLC/MSE技术进行数据采集,这样一次进样即可同时获取母离子和产物离子的数据。MetaboLynx XS应用管理软件用于进行数据挖掘,结果显示在MetaboLynx浏览器中(如图1所示)。产物离子信息同时进行处理,并显示在MetaboLynx浏览器中的碎片分析窗口内(图2)。通过对多个孵育时间点的样品进样分析,母体药物的清除曲线和代谢物的形成曲线可在同一次试验中同时获取(如图3所示)。http://www.bio-equip.com/imgatl/20115514643.jpg图2. 碎片分析窗口中所显示的MS/MS信息。http://www.bio-equip.com/imgatl/20115514816.jpg图3. 维拉帕米的清除曲线(3A)及其代谢物的形成曲线(3B)。通过采用UPLC/MSE 数据采集策略,再加上具有化学智能的MetaboLynx XS数据处理工作流程,只需进行一次液相色谱进样即可快速完成所有代谢物的鉴定工作。通过在多个时间点进样,可比较容易地获取低浓度(μM)孵育水平下目标药物的代谢速率和途径。因此,产能最大化的目标即可轻松实现。总结这个应用表明:通过使用配备UPLC/MSE 和MetaboLynx XS工作流程的Xevo G2 QTof质谱系统,体外代谢物研究可在低浓度(μM)水平下进行,同时具有较好的速度、灵敏度和选择性。

  • 用艾滋病病毒对抗癌症可提高治癌药物功效

    有望在癌症和其他疾病的治疗中发挥重要作用 中国科技网讯 艾滋病是威胁人类健康的一大杀手,让其“弃暗投明”帮助科学家对抗癌症,听起来似乎是件完全不可能的事情。据每日科学网8月29日报道,法国国家科学研究院(CNRS)的科学家日前就独辟蹊径,让其成为了现实。 利用艾滋病病毒(HIV)的复制机制,该机构的研究人员已经培育出了一种突变体蛋白。该物质能极大提高抗癌药物的功效,在与抗癌药物联合使用时,药物剂量减至先前的1/300即可达到同样的疗效。相关论文发表在8月23日出版的《公共科学图书馆·遗传学》上。该发现有望在癌症和其他疾病的治疗中发挥重要作用。 HIV通过大量复制病毒将自己的遗传物质插入宿主细胞的方式来进行繁殖。其显著特征是,HIV通过不断发生变异并产生多种不同突变蛋白(突变体)来进行繁殖,这种特性使其能够在复杂多变的环境中生存。迄今为止,还没有任何一种药物能够将其彻底杀灭。 法国国家科学研究院的科学家反其道而行之,提出了使用HIV的策略来治疗其他疾病,尤其是癌症的设想。 为了验证这一想法,他们首先通过向HIV基因中插入一种人类基因对其进行改造。这种基因能够促成脱氧胞苷激酶(dCK)的产生。脱氧胞苷激酶是催化抗病毒和抗肿瘤药物在人体内合成其单磷酸盐的关键酶,是激活抗肿瘤药物的关键所在。不少病毒或癌细胞对药物的抗药性都与人体细胞内脱氧胞苷激酶的失活相关。因此,近几年来全世界的科学家们一直试图通过增加脱氧胞苷激酶的活性、提高其效率的方式实现对肿瘤的抑制。 根据HIV的繁殖方式,该研究团队建立一个包括近80个艾滋病病毒突变的突变体库,并结合抗癌药物对其进行实验以确定其功效。结果发现,这些突变体在识别脱氧胞苷激酶方面比传统的未变异蛋白更有效。当抗癌药物与这些突变体蛋白联合使用时,在剂量上只需原先的1/300即可达到同样的疗效。 这种方法不但能够降低大剂量抗癌药物在使用时所有可能产生的副作用,还能极大地提高效率。下一步,研究人员还将在动物实验中对单独的突变体蛋白进行测试。研究人员称,除治疗癌症外,类似的疗法在抗病毒治疗中也具有一定潜力。(王小龙) 《科技日报》(2012-8-30 二版)

  • 【讨论】农药代谢物

    请教各位,在哪里可以查到关于农药代谢物的限量标准?看过NY1500和GB2763,在前者里看到有关于克百威等少数几种农药,其残留限量中提到了它们的代谢物,其他农药则没有以前看到一个帖子说有些农药在检测时也要求检它们的代谢物,请问有没有相关的标准规定了那些农药要检代谢物?另外,国外很多农药都有代谢物的限量标准,这个标准制定的依据是什么?哪里可以得到比较全的这样的标准?先谢谢了~

  • 呋喃西林代谢物

    我们做呋喃代谢物的时候,当样品为虾时呋喃西林代谢物总是有很高的浓度,哪位高手能给解答一下。

  • 求助硝基呋喃代谢物标准品衍生化

    我门最近刚刚开展肉中硝基呋喃代谢物的检测。仪器是agilent 6410的质谱。但是突然发现在优化质谱条件,寻找母离子和子离子时,需要将标准品进行衍生,请教各位大侠,有没有具体的衍生化条件?越具体越好!不胜感激!

  • 兽药残留检测和代谢物

    请问做代谢物在动物体内的代谢物,检测出好几种代谢物,那做在组织体内的残留检测时是不是需要也检测这几种代谢物,是不是只用检测它的原型啊?谢谢!!!

  • 气质用于代谢物分析

    各位老师,大神好,最近我有在做农作物的代谢组学检测,参考一篇论文的方法进行的,他把代谢物分为两大部分来做,然后当我在做极性物检测的时候,对氨基酸和有机酸的检测经常出现问题,除了一种苹果酸外,其他检测不到。希望有人做代谢物的进行一个交流,谢谢

  • 氟虫腈及其代谢物的检测

    请问各位老师,在GB/T 20769-2008中,有氟虫腈及其代谢物吗?GB23200.8里只有氟虫腈没有代谢物,虽说可以按这个方法或者NY/T761用ECD做,标准里没有心里没底。

  • 关于咖啡那点事~咖啡因代谢物的测定

    关于咖啡那点事~咖啡因代谢物的测定

    咖啡的主要成分是咖啡因,可以作用于神经细胞中一种叫做腺嘌呤核苷的化学物质,是一种中枢神经兴奋剂,能够暂时的驱走睡意并恢复精力。 不过,咖啡对有些人是有好处的,但是对某些人却产生负面影响,这主要是与咖啡因的在不同人的代谢能力有关的。 咖啡因在肝脏中被分解产生三个初级代谢产物副黄嘌呤,可可碱,茶碱。咖啡因在摄取后45分钟内被胃和小肠完全吸收。吸收后它会分布于身体的所有器官之中,转化过程符合化学动力学一级反应,这些化合物进一步代谢,最终通过尿液排泄。 如果某些人的这个酶的代谢比较快,摄入的咖啡因很快就会被清除出体外,因此咖啡因起作用的效果就很有限,不能令人产生特别明显的兴奋感。而对于另一些人,他们这个酶代谢速度慢,咖啡因在体内的清除速度很慢,起作用时间也就较长,这样的人往往一杯咖啡就会令他们夜不能寐,有的还会影响食欲,呕吐和痉挛,也可能出现胃炎或心脏病等不良反应。 所以这也解释了一般人普遍担心的咖啡会影响睡眠问题,其实和你对咖啡因的代谢力有很大的关系。由于每个人对咖啡因代谢的能力不同,平均来说,咖啡因在体内的运作,大约能维持3~4个小时,所以即使在晚餐后饮用,也不至于造成太大的困扰。但有些人的代谢力较差,可能会持续作用8~12个小时;或者体质对咖啡因比较敏感,就得特别注意喝咖啡的时间,避免影响作息,因为不论是多喝开水或是增加运动,都无法有效的促使咖啡因快速代谢。*********************************** 以上对咖啡因的代谢方面做了简单的科普,可如何对咖啡因代谢物进行检测呢?由于咖啡因代谢物从化学结构上来看,这一类化合物具有相似的母体结构,不同之处在于甲基的位置,属于位置异构体。(见下图)http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2016/01/201601071109_581149_2452211_3.png 对于分离这些代谢物来说,对色谱柱的分离能力要求比较高,下面我们看看使用迪马Spursil色谱柱分离9种咖啡因代谢物的分离效果情况色谱柱:Spursil C18规格:150 x 4.6 mm, 5 μm流动相:甲醇/ 水+1% 乙酸=10/90流速:1.0 mL/min柱温:室温检测器:UV 254 nm样品:1. 尿酸2. 黄嘌呤3. 7- 甲基黄嘌呤4. 1- 甲基尿酸5. 3- 甲基黄嘌呤6. 1,3- 二甲基尿酸7. 可可碱8. 1,7- 二甲基黄嘌呤9. 茶碱http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2016/01/201601071110_581151_2452211_3.png总结:Spursil 色谱柱能够在13分钟之内将它们全部分开且达到基线分离~棒棒哒http://simg.instrument.com.cn/bbs/images/default/em09505.gif

  • 【求助】硝基呋喃代谢物的检测

    请教大家一个问题,我们做硝基呋喃代谢物的检测时,四种物质只有AMOZ的线性可以,回收也可以,其他的三个线性不好,回收也不好。但是仪器上质谱图出的都挺好的,都找到相应物质的峰了,而且峰型挺不错的。请问大家在硝基呋喃的前处理过程中要注意什么问题。

  • 【求助】关于呋喃西林代谢物空白污染的问题

    最近一段时间我们检测呋喃代谢物的时候,隔三差五的就出现SEM空白污染的问题,浓度大约都在检测限水平,有时候是一连好几天污染,有时候又突然没有了。不知道大家有没有遇到类似的问题?补充说明:1、我们检测呋喃代谢物有好几年了,在第一次出现污染,之前从没有过类似现象。2、最近只更换了一种试剂(磷酸钠),本来以为是试剂的问题,可是空白时有时无,也排除了。3、样品也全部检出,但扣除空白后,就微乎其微了。3、换不同的人员操作,污染依然存在。请大家帮忙想一想,是什么原因?谢谢!

  • 武汉大学分子遗传学 第六章

    第六章 突变 6.1 概述 一、定义突变是一种遗传状态,可以通过复制而遗传的DNA结构的任何永久改变,都叫突变mutation 。所有突变都是DNA结构中碱基所发生的改变。携带突变的生物个体或群体或株系,叫突变体mutant。突变位点发生在基因内,该基因称为突变基因mutant gene;而没有发生突变的基因称为野生型基因wild type gene。如arg+ 为Arg合成的野生型基因,而突变的基因型写成 arg-, 即精氨酸合成缺陷型,其表型为 Arg-表现型。野生型和突变体的表现型和基因型的表示方法见表5-1。P161所有基因表型名称均用3个小写的斜体字母或小写字母在底下画线,而有关的具体基因则在3 个小写字母后用大写的斜体字母表示,如lacZ, lacZ。所有的表现型名称均用3个正写的字母表示(其中第一个字母大写),如Lac+ , Lac-。还有一些其他的特殊意义的突变表示方法,如抗性,敏感性,温度敏感性,无意义等突变。-r, -s, Ts, 有兴趣的自己看。引起突变的物理化学因素称突变剂mutagen。由于突变剂的作用而产生突变的过程或作用称为突变生成作用mutagenesis。简称突变分类:自发突变生成spontaneous mutagenesis——自发突变spontaneous mutation——自然突变体spontaneous mutant. 诱发突变生成,3. 简称诱变induced mutation——诱发突变induced mutaion——诱发突变体induced mutant.`二 突变分类从DNA碱基序列改变多少来分:单点突变和多点突变从对阅读框架的影响来看:由于插入缺失一个或两个碱基会引起移码框架突变从对遗传信息的改变来说:点突变可引起同一突变,错意突变,无义突变或无声突变(含中性突变和同8. 一突变)从突变表型对外界环境的敏感性来区分,可分非条件型突变和条件型突变,如温度敏感突变为条件型突变。从突变的效应背离或返回到野生型这两种方向来分:正向突变和回复突变突变位点也可能存在于负责基因调控的DNA序列中:启动子上升突变和启动子下降突变。产生表达方式的操作子突变或调节基因的突变叫做组成型突变constitutive mutation.

  • 【求助】食品中呋喃妥因代谢物检测。

    大家好: 我在做食品中呋喃妥因代谢物时,不知道什么原因,所有的样品都检出,标准品也不成线性,回收率很高有时能达到好几百,请问呋喃妥因代谢物检测过程中有什么因素可以影响?谢谢指点。(我用的是Thermo的TSQ Quantum [url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]液质[/color][/url])

  • 利巴韦林代谢物和尿苷色谱峰分离

    测鸡蛋中利巴韦林及代谢物等几种抗病毒药,但是尿苷是鸡蛋中和利巴韦林有相同离子对的干扰物质,和利巴韦林代谢物重叠了,调流动相乙腈梯度也分不开,请懂的人出出主意

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