固碳突变体代谢物检测方案_固碳突变体代谢物行业应用

采用 GC/Q-TOF 进行蓝藻固碳突变体代谢组学研究
使用非靶向代谢组学评估蓝藻细长聚球蓝细菌模型的突变体，从而对可实现蓝藻更高效生长的可能表型变化进行鉴定。采用Agilent 7200 系列GC/Q-TOF 分析突变体，通过 Mass Profiler Professional 中的安捷伦通路结构软件分析代谢物谱的变化。本方法鉴定了多个代谢途径以及能够解释突变体改良表型的可能目标物。

厂商：安捷伦科技(中国)有限公司

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油菜叶绿素缺失突变体的遗传定位及生理分析
叶色突变能够降低光合效率，对作物生长和经济产量造成严重的负面影响。已有拟南芥和作物的不同叶绿素突变体被应用于叶绿素生物合成、叶绿体发育和光合效率的遗传控制和分子机制的研究。油菜的叶绿素突变体也常被用于遗传作图和定位，但很少用于生理研究(Lin et al., 2022)。为此，西南大学农学与生物科技学院的研究人员对油菜叶绿素缺失突变体同步进行了遗传定位及生理分析，研究成果发表在今年的《BMC Plant Biology》杂志上。其中生理分析采用了由国际知名植物表型仪器制造商Photons Systems Instruments（PSI）研发、北京易科泰生态技术有限公司提供全程技术支持的PlantScreen植物表型系统。

厂商：北京易科泰生态技术有限公司

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FluorCam叶绿素荧光成像技术应用于突变体研究
叶绿素荧光是植物光合生理检测的重要探针，基于叶绿素荧光测量的FluorCam叶绿素荧光成像技术经过数十年的发展，在植物与藻类研究中应用广泛，已然成为光合生理、育种、环境控制研究、农业生产等众多研究方向公认的有效工具。本次摘选4篇易科泰FluorCam叶绿素荧光成像系统在不同植物基因突变体研究方面的文献分享。

厂商：北京易科泰生态技术有限公司

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采用GC/Q-TOF 进行蓝藻固碳突变体代谢组学研究
气相色谱条件色谱柱Agilent J&W DB-5MS 超高惰性色谱柱，30 m × 0.25 mm，0.25 μ m（部件号122-5532UI）进样量1 μ L分流比10:1分流/不分流进样口温度250 ° C柱温箱升温程序60 ° C 保持1 min，以10 ° C/min 的速率升至325 ° C，保持3.5 min载气氦气，1 mL/min，恒流传输线温度290 ° C质谱条件电离模式EI离子源温度230 ° C四极杆温度150 ° C质量数范围50 m/z 至800 m/z谱图采集速率5 Hz，以棒状图和轮廓图两种模式采集

厂商：上海希言科学仪器有限公司

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从分子互作水平解读，为何新冠突变体传染能力增强？
繁殖不息，突变不止，进化不断——这个是所有物种的共性，尤其是已经肆虐了一年多的新冠病毒。病毒的突变不一定会使得病毒自身毒性更强，但往往会导致传染能力更强。新冠病毒S蛋白与人受体ACE2的分子结合能力是决定病毒传染能力强弱重要的因素之一。一个新冠病毒突变株的氨基酸突变点非常多，但是最值得关注就是那些位于S蛋白与人受体ACE2的结合部分（RBD结构域）的突变，可以直接影响其与受体的结合亲和力，从而改变其感染能力。

厂商：德国赛多利斯集团

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使用 LC/MS 和 GC/Q-TOF 技术强化土坛树树皮代谢物分析
传统草药被用作许多疾病的替代药物。土坛树就是这样一种传统药用植物。目前已有多项研究使用到这种植物的提取物，这也证明了其具有治疗价值。但是，极少有人尝试确定这种植物复杂的代谢物组成。在本应用简报中，我们用有机溶剂和水性溶剂对样品进行提取，对土坛树树皮上的代谢物进行分析和鉴定。通过 Agilent 1260 的分析型馏分收集系统对有机溶剂提取物和水提取物进行馏分收集。并利用 LC/MS 和 GC/Q-TOF 技术分析每种馏分。使用 HILIC 色谱和三个独立的正交反向色谱柱进行 LC/MS/MS 分析。使用 AJS 离子源在正离子和负离子模式下收集数据，然后在 METLIN 数据库或 MS/MS 谱库中进行搜索。那些未能获得数据库和谱库匹配的八角枫属化合物继而还可以使用安捷伦 MSC 软件在收录超过 3000 万个结构的ChemSpider 数据库中进行搜索。为了鉴定由 GC/Q-TOF 分析结果所产生的化合物，可以通过 AgilentFiehn GC/MS 代谢组学谱库和 Wiley/NIST 谱库对数据进行检索。借助多个 GC 谱库的搜索结果鉴定出 62 种化合物，匹配得分均大于 70。使用两种技术共检测出 1016 种化合物，其中有 511 种化合物被成功鉴定。文献检索显示，511 种化合物中有 81 种对癌症、微生物感染等传统疾病具有治疗效果。我们的研究表明，使用馏分收集法进行代谢物富集、用双相溶剂提取以及正交色谱柱固定相进行代谢物分离，并采用互补的 LC/MS 和 GC/MS 检测，可以提高药用植物的代谢物检测范围。

厂商：安捷伦科技(中国)有限公司

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植物荧光活体成像技术及其应用
植物活体成像技术能够在不破坏植物组织的前提下，利用一套非常灵敏的光学检测仪器，直接监控活体植物的细胞活动、光合作用和基因行为。其中应用最广泛的荧光活体成像技术，由于操作简单、结果直观、灵敏度高等特点，在植物光合机理、突变体筛选、抗逆基因与表型、生理节律与发育等研究中都有大量的应用。

厂商：北京易科泰生态技术有限公司

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FL6000应用案例: Slr0320对集胞藻强光驯化功能研究
光合生物在强光下会触发多种适应反应。2021年，中国农科院和中科院遗传所的科学家鉴定了对集胞藻（PCC 6803）高光驯化至关重要的基因--- Slr0320。研究发现，在正常光强下突变体的生长速率与野生型相似，但高光下突变体的生长速率严重下降。高光下突变体净光合速率较低，但在正常光照和高光下光系统II (PSII)活性较高。野生型和突变体的光系统II（PSII）积累和组装相似，通过FL3500双调制叶绿素荧光测量仪（现升级为FL6000）对叶绿素荧光测量发现，突变体在光下的稳态荧光比较高，QA到QB的电子传递较慢。结果表明，Slr0320蛋白是高光驯化过程中优化PSII活性和QA到QB电子传递的关键。

厂商：北京易科泰生态技术有限公司

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LCMS方法分析检测水产品鳗鱼中四种硝基呋喃代谢物
硝基呋喃类药物是人工合成的广谱抗生素，曾经被广泛应用，作为猪、禽类和水产促生长的添加剂。但在长时间的实验室研究过程中发现，硝基呋喃类的药物和代谢物均可使实验动物发生癌变和基因突变。硝基呋喃和氯霉素一样，已被欧盟确定为不得检出的抗生素之一。此文采用LC-APCI-MS对鳗鱼样品中硝基呋喃代谢物AOZ，AMOZ，SC，AH进行检测分析。

厂商：岛津

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实现中心碳代谢多方法分析并涵盖多种代谢物类别的创新解决方案
开发了一种结合多种方法的创新靶向代谢组学策略，通过考虑中心碳代谢、能量代谢、核酸代谢和氨基酸的峰形、分离以及代谢物覆盖度，以覆盖体液、组织或生物来源的培养细胞系中的数百种代谢物，从而提高分析性能。采用了全新的解决方案分析差异化生物样品，如本研究中展示的骨髓来源巨噬细胞 (BMDM) 或基因敲除肝癌细胞小鼠模型的结果

厂商：安捷伦科技(中国)有限公司

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菌种衰退原因+复壮方法
对菌种进行定期的分离纯化，可减少其中共存的自发突变菌或“突变不完全”产生的退休型菌株的增殖机会，保持原来的优良特性。诸如对营养缺陷型菌种在纯化过程中提供足够的营养物，以保持菌株的优势，避免回复突变体的竞争。同样在进行抗性突变的菌种纯化时在培养基中加入对应于抗性的药物，可保持菌株的抗性优势，避免产生无抗性的回复突变体。遗传性稳定的菌体作为菌种、采用合适的接种物传代等可减少和防止菌种的自身突变。

厂商：上海远慕生物科技有限公司

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使用 LC MS 和 GC Q-TOF 技术强化土坛树树皮代谢物分析 (PDF)
传统草药被用作许多疾病的替代药物。土坛树就是这样一种传统药用植物。目前已有多项研究使用到这种植物的提取物，这也证明了其具有治疗价值。但是，极少有人尝试确定这种植物复杂的代谢物组成。在本应用简报中，我们用有机溶剂和水性溶剂对样品进行提取，对土坛树树皮上的代谢物进行分析和鉴定。通过 Agilent 1260 的分析型馏分收集系统对有机溶剂提取物和水提取物进行馏分收集。并利用 LC/MS 和 GC/Q-TOF 技术分析每种馏分。使用 HILIC 色谱和三个独立的正交反向色谱柱进行 LC/MS/MS 分析。使用 AJS 离子源在正离子和负离子模式下收集数据，然后在 METLIN 数据库或 MS/MS 谱库中进行搜索。那些未能获得数据库和谱库匹配的八角枫属化合物继而还可以使用安捷伦 MSC 软件在收录超过 3000 万个结构的 ChemSpider (http://www.chemspider.com/) 数据库中进行搜索。为了鉴定由 GC/Q-TOF 分析结果所产生的化合物，可以通过 AgilentFiehn GC/MS 代谢组学谱库和 Wiley/NIST 谱库对数据进行检索。借助多个 GC 谱库的搜索结果鉴定出 62 种化合物，匹配得分均大于 70。

厂商：天津市普伦科技开发有限公司

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固相萃取-LC-MS/MS测定污水中若干种du品及其代谢物
du品问题一直是社会高度关注的焦点，污水中du品及其代谢物的检测不仅能够反映当地的du品滥用情况，更能反映某个特定区域禁毒工作效果，警方能通过污水du品检测客观分析，构建毒情形势监测体系，有利于把控du品发展态势，全面科学分析du品滥用情况、确定毒情泛滥区域，进而强有力地推进禁毒工作。本文参考《污水中13种du品及其代谢物的固相萃取方法研究》，使用莱伯泰科SPE1000全自动固相萃取系统进行污水中的du品及其代谢物的萃取处理，经M64高通量平行浓缩仪浓缩后用液相色谱-串联质谱检测，从而测定污水中du品及其代谢物的含量，该方法能够快速、高效、稳定地达到实验的要求。

厂商：北京莱伯泰科仪器股份有限公司

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碎片离子检索功能在士的宁代谢物鉴定中的应用
马钱子主要有效成分士的宁（strychnine）又名番木鳖碱，属于中枢神经兴奋剂，临床用于偏瘫、瘫痪及因注射链霉素引起的骨骼肌松弛、弱视症等和巴比妥类中毒等。此外，添加士的宁的饲料诱饵可用来消灭老鼠等啮齿类有害动物，然而这些动物体内残留士的宁会通过食物链传递, 对整个生态圈造成影响，故有必要对其代谢产物进行深入研究，为临床用药、环保、司法等部门提供可靠的分析手段和数据。LTQ Orbitrap XL结合了线性离子阱和Orbitrap高分辨质量分析器，具有高灵敏度的多级高分辨能力。Mass Frontier为Thermo专业的结构解析软件，利用其丰富的碎裂数据库，可快速的对士的宁多级碎裂规律进行准确推测和归属，碎片离子检索功能将母药与代谢物相关性与可能的代谢途径有机的结合起来，从繁杂的基质样品质谱信号中准确的筛选到未知代谢物信息，进一步对代谢位点进行推测，最终获得全面的代谢物信息。

厂商：赛默飞质谱

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非监督的MS/MS二级谱图的相似性代谢轮廓图分析显示与防御有关的土豆代谢物
非监督的MS/MS二级谱图的相似性代谢轮廓图分析快速找出了17种以前未曾分析出的代谢物，并发现了羟基肉桂酰胺在AtACT-AtdTX18超表达路径中的合成机制。

厂商：布鲁克道尔顿(Bruker Daltonics)
Mass Frontier碎片离子检索功能（FISh）在士的宁代谢物鉴定中的应用
马钱子主要有效成分士的宁（strychnine）又名番木鳖碱，属于中枢神经兴奋剂，临床用于偏瘫、瘫痪及因注射链霉素引起的骨骼肌松弛、弱视症和巴比妥类中毒等。此外，添加士的宁的饲料诱饵可用来消灭老鼠等啮齿类有害动物，然而这些动物体内残留士的宁会通过食物链传递, 对整个生态圈造成影响，故有必要对其代谢产物进行深入研究，为临床用药、环保、司法等部门提供可靠的分析手段和数据。LTQ Orbitrap XL结合了线性离子阱和Orbitrap高分辨质量分析器，具有高灵敏度的多级高分辨能力。Mass Frontier为赛默飞专业的结构解析软件，利用其丰富的碎裂数据库，可快速对士的宁多级碎裂规律进行准确推测和归属，碎片离子检索功能将母药与代谢物相关性与可能的代谢途径有机的结合起来，从繁杂的基质样品质谱信号中准确的筛选到未知代谢物信息，进一步对代谢位点进行推测，最终获得全面的代谢物信息。

厂商：赛默飞质谱分析

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模块式植物表型分析技术方案 ——拟南芥UV胁迫的响应机制
植物面对各种生物和非生物胁迫时，会调整它们的响应机制来优化发育和适应程序。UV辐射作为一种环境因子，会影响植物的光合过程并触发细胞死亡。华沙生命科学大学的Anna Rusaczonek评估了红/远红光感受器光敏色素A和光敏色素B在拟南芥UV胁迫响应中的作用。通过测量相关突变株的CO2同化、叶绿素荧光（包括荧光淬灭动力学曲线和OJIP快速荧光动力学曲线）、活性氧积累等，他发现UV胁迫干扰了光系统II，并增加了相关突变体的死亡率。

厂商：北京易科泰生态技术有限公司

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采用 MassHunter 代谢物鉴定软件根据 RRLC – QTOF MS 数据鉴定代谢物（2）
本应用简报介绍了：? 利用 Agilent 1200 快速分离液相色谱（RRLC）系统高分离度分离体外代谢实验中得到的代谢物? 利用 Agilent 6520 QTOF 质谱仪采集用于计算机辅助代谢物鉴定的数据? 利用 Agilent MassHunter 代谢物鉴定软件高效鉴定非预期代谢物? 奈法唑酮药物非预期代谢物的代谢物鉴定数据分析结果

厂商：天津市普伦科技开发有限公司

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基于Orbitrap ID-X Tribrid MS技术的中药柴胡体外肠内菌代谢物分析
本实验采用Orbitrap ID-X Tribrid MS高分辨液质联用技术，结合Compound Discoverer软件中的代谢物分析工作流程，对中药柴胡体外肠内菌代谢物进行了快速准确的分析。Compound Discoverer内置I相+II相代谢途径，针对已知和未知代谢物开采用质量亏损过滤（MDF），碎片离子搜索策略（FISh），特征同位素，共有碎片检索等方式，寻找代谢物；同时软件提供多种统计学工具，通过不同给药时间点或不同处理方式统计学差异，确证代谢物。选择柴胡中鉴定到的代表性物质柴胡皂苷A和绿原酸为母药，在孵育基质样品中柴胡皂苷A正离子模式共鉴定出14种可能的代谢物，负离子模式鉴定出11种可能的代谢物；绿原酸共鉴定出5种可能的代谢物。

厂商：赛默飞色谱与质谱

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使用无标记TSA方法评估CRISPR-Cas9 RNP复合物形成的最佳条件
Thermal shift assay（TSA），也被称为差示扫描荧光法（DSF）是表征蛋白热稳定性的常用方法之一，广泛应用于蛋白配体互作表征，突变体、缓冲液、去垢剂筛选等领域。但DSF的实验操作较繁琐，需要根据蛋白的特性及去垢剂兼容性选择合适的染料，优化蛋白和染料的比例，在配制样品时还要考虑染料自带的有机溶剂对蛋白的影响。时下被行业深度认可的无标记的TSA验证方法-也称nanoDSF技术，可解决DSF技术的局限性，样品无需加染料就可以直接上机检测了。下面我们一起通过用户的文献案例来进一步了解。

厂商：诺坦普科技（北京）有限公司

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差示扫描荧光法表征蛋白配体互作
差示扫描荧光法（DSF），也被称为thermal shift assay（TSA），是表征蛋白热稳定性的常用方法之一，广泛应用于蛋白配体互作表征，突变体、缓冲液、去垢剂筛选等领域。DSF可以通过荧光染料或蛋白内源荧光信号监测升温过程中蛋白构象的变化计算其熔解温度Tm（折叠蛋白与去折叠蛋白相等时的温度）。

厂商：诺坦普科技（北京）有限公司

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使用初级代谢物的相关性分析研究衰老的性别差异
根据日本总务省统计局的调查，截至2023年，在日本1.25亿的总人口中，65岁以上的老年人所占比例达到29.0%，每3个人中就有1个是老年人1)。1947年至1949年出生的“婴儿潮一代”在2022年开始迎来75岁，75岁以上（高龄老年人）的人口与其他年龄层相比呈显著增加的趋势，2023年占总人口的15.5%（上一年14.9%）1)。高龄老年人的疾病发病风险高，而且容易出现长期化趋势，因此，日本专为高龄老年人制定了不同于其他年龄段的医疗制度。有论文报告称，衰老导致的身体功能变化是患病率增加的原因之一，由于衰老导致的糖代谢异常造成糖耐量下降，餐后血糖容易升高，而且，脂肪代谢异常导致肝脏中贮存的脂肪酸容量减少2)。同样是高龄老年人，不同性别的人在与年龄相关的健康状况方面也存在差异：男性更容易罹患与生活方式相关的疾病，如心脏病和中风，需要护理的情况较多，而女性则因骨骼和肌肉力量的衰退存在运动功能和独立性下降的趋势3)。推测代谢物的数量变化也对这些差异造成了影响，因此，阐明老年人代谢物数量性别差异是一个紧迫的课题。在本应用中，使用气相色谱质谱联用仪（GC-MS）检测了70至84岁的健康者血清中所含的初级代谢物。为了从检测结果中发现性别之间的差异，我们使用“多组学分析软件包”进行了分析（图1）。多组学分析软件包是一种具有多变量分析（如主成分分析、聚类分析）和数据可视化功能（如火山图和代谢图）的分析软件。下面介绍将初级代谢物检测数据转换为代谢途径图，通过不同年龄段分析和相关性分析进行性别差异分析的案例。

厂商：岛津企业管理（中国）有限公司

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水产品中硝基呋喃类代谢物残留量检测方案(固相萃取仪)
标准规定了水产品中呋喃妥因代谢物1-氨基-2内酰脲(AHD)、呋喃唑酮代谢物3-氨基-2-唑烷基酮(AOZ)和呋喃西林代谢氨基脲（SEM）残留量的高效液相色谱测定方法(样品为龙利鱼)。

厂商：月旭科技（上海）股份有限公司
全新一代三重四极杆液质联用TSQ Quantis检测鸡蛋中氟虫腈及其代谢物残留
固相萃取 SPE 前处理方法结合三重四极杆液质联用仪（TSQ Quantis）分析鸡蛋中氟虫腈及其代谢物的快速检测方法。该方法前处理简单便捷可以有效去除基质干扰满足高通量分析要求，此外由实验结果可以看出，基于 TSQ Quantis 建立的检测方法具有优异的灵敏度，可用于鸡蛋中氟虫腈及其代谢物的日常分析检测。

厂商：赛默飞色谱与质谱

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应用代谢组学技术研究不同品质白茶的代谢物与风味特征
本应用通过基于 UHPLC-Q-TOF/MS 的非靶向代谢组学分析方法探讨了白茶中非挥发性化合物对茶叶风味特征的影响。使用 UHPLC-Q-TOF/MS 分析茶叶的提取物，然后进行特征化合物的提取和比对，得到 1915 种化合物。基于这些化合物的主成分分析 (PCA) 和有监督的偏最小二乘差异分析 (PLSDA) 表明，三种不同品质白茶样品可以很好地分离。通过与标准品和数据库进行匹配，鉴定出多达 99 种代谢物。经由显著性检验和相关性分析发现，有显著差异的代谢物中有 41 种与风味高度相关；其中，茶氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺和 AMP 与鲜味呈正相关，而黄烷-3-醇、聚酯型儿茶素、原花青素 B3 和可可碱与苦味和涩味呈正相关。结果表明，代谢组学技术是一种有效的发现茶叶中特征代谢物的手段，这些特征代谢物有望作为潜在标记物用来区分不同品质的白茶，以应对人为掺假和标签错贴的现象。

厂商：安捷伦科技(中国)有限公司

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GCMS-TQ8050结合岛津代谢物数据库分析冬虫夏草代谢物
本文利用GCMS-TQ8050结合岛津代谢物数据库自动创建467种代谢物的MRM分析方法。通过建立的MRM方法对冬虫夏草中的多种代谢物进行筛查，使用核糖醇作为替代物，确认筛查结果的可靠性判断，以2-异丙基苹果酸作为内标，对筛查出的代谢物进行了半定量。在无测定目标组分标准品的情况下，鉴定出代谢物143种。

厂商：岛津企业管理（中国）有限公司/岛津（香港）有限公司

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采用 MassHunter 代谢物鉴定软件根据 RRLC – QTOF MS 数据鉴定代谢产物（1）
摘要本应用简报介绍了：? 利用 Agilent 1200 快速分离液相色谱（RRLC）系统高分离度分离体外代谢实验中得到的代谢物? 利用 Agilent 6520 QTOF 质谱仪采集用于计算机辅助代谢物鉴定的数据? 利用 Agilent MassHunter 代谢物鉴定软件高效鉴定预期代谢物? 奈法唑酮药物预期代谢物的代谢物鉴定数据分析结果

厂商：天津市普伦科技开发有限公司

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优化用于极性代谢物的发现代谢组学液质联用方法
为了在分析中实现对多种常见内源性代谢物类别的全面覆盖，开发了高 pH 和低 pH亲水相互作用色谱 (HILIC) 法。这些方法适用于高分辨率的精确质量数 LC/Q-TOF 质谱仪 (MS)。靶向代谢物类别包括维生素、氨基酸、聚胺、糖、磷酸糖、有机酸、核苷酸和辅酶 A (CoA) 衍生物。对液相色谱梯度和离子源进行了系统优化，以获得良好的异构体色谱分离效果，并获得所研究的所有代谢物类别的最佳信号响应。为验证此方法的稳定性，使用 HILIC LC/Q-TOF MS 方法运行 25 小时对酵母提取物进行了评估。

厂商：安捷伦科技(中国)有限公司

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采用UPC2/MS/MS分离利培酮的活性对映体代谢物并用于检测代谢稳定性
许多候选药物及其代谢物都含有一个或多个手性中心。识别和监测可能存在的各种对映体是药物开发过程中至关重要的一步。众所周知，超临界流体色谱（SFC）是一种可进行手性分离的高效技术。在本技术简报中，我们展示了利用UPC2/MS/MS对利培酮的活性代谢物9-羟基利培酮进行对映体分离和检测。研究人员使用9-羟基利培酮标准品进行方法优化，然后将其应用于在人肝脏微粒体中温育的利培酮样品。实验监测了从母体化合物到羟基代谢物的转化过程。

厂商： Waters

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利用离子对 dMRM LC/QQQ 对源自肠道菌群的吲哚代谢物进行定量分析
摘要随着人体肠道菌群在健康和疾病研究中的作用受到越来越多的关注，对不同化学类别的菌群代谢物的定量分析需求也应运而生。安捷伦开发出一种高重现性、稳定的离子对反相 (IP-RP) 动态多反应监测 (dMRM) 方法，该方法可高效分离 200 多种中心碳代谢物。本应用简报重点介绍了将 IP-RP dMRM 方法扩展到与宿主代谢和免疫通路相关联的色氨酸和吲哚代谢物的测量。扩展的 IP-RP dMRM 方法能够在宽动态范围内灵敏地检测相关生物样品中的这些化合物。

厂商：安捷伦科技(中国)有限公司

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固碳突变体代谢物

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