碎裂性质

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碎裂性质相关的耗材

  • 探头应用-唇膏破裂装置
    唇膏是透过多种技术条件的固体脂肪模型产品,包含一些不溶物和悬浮着色剂。产品需要具备一个重要性质就是一定不能在使用过程中弯曲、弄碎、破裂或者折断。正确配方的选择,例如:特种熔点的蜡状物,将利于形成具有弹性的模型产品,提供足够的坚硬度以承受使用者涂抹唇膏时的力度。 该探头装置可提供模拟和经验法则的测试结果。半圆形刀具的测试即模拟使用过程中的弯曲行为。
  • Alumaseal 压环 | 21473
    产品特点:Alumaseal压环 Alumaseal Ferrules● 铝结构 - 不会破裂或碎裂。● 温度循环后无需重新紧固 - 适用于GC-MS。●排气并使其密封,以减少检测器噪音。 ●在熔融石英管上永久锁定,不会造成破损。 ●与Vespel或石墨压环不同,不会固定在配件上。 ● 温度 550°C。● 用于1/16" 压缩式接头一起使用。Alumaseal压环结合了石墨和Vespel /石墨密封垫圈的优点,消除了缺点,可在任何应用中提高性能。 独特的前后密封垫圈设计可以轻松,可靠地密封,套圈不会碎裂或废气,并且可以稳定在550°C。 Alumaseal压环不允许氧气渗透到系统中,并且在温度循环后不需要重新拧紧,使其成为GC-MS应用的理想选择。 它们可与任何标准1/16“压缩型接头一起使用,带熔融石英柱。订货信息:Alumaseal FerrulesCatalog #Ferrule IdFits Column IdUnits214720.4 mm0.25 mm10-pk.214730.5 mm0.32 mm10-pk.214740.8 mm0.53 mm10-pk.
  • 进口衬管拆卸工具 | 20181
    产品特点:进口衬管拆卸工具Inlet Liner Removal Tool订货号:20181● 轻松从进样器中取出衬管 - 不再烧伤手指。● 由高温硅胶制成。● 不会碎裂或破裂衬管。

碎裂性质相关的仪器

  • SYNAPT XS高分辨率质谱仪没有研究,就制定的决策,容易是盲目的在科研领域,研究进展缓慢和成本不断上升俨然已成为一项挑战。SYNAPT XS质谱仪具有极致灵活性,可提供更大的选择自由度,能够打破这些壁垒,支持任何应用的科学创新和技术成功。 • 创新技术作为基石,提供最优异的分析性能• SONAR和HDMSE提供一套独特的工具包,用于解析复杂混合物• 离子淌度功能大大增加了峰容量和分析选择性• CCS测量可提高化合物鉴定的准确性创新技术提供最优异的分析性能凭借沃特世高级质谱“SELECT SERIES”传承下来的技术基石,内置先进的创新技术,确保使用该平台的科学家处于质谱分析的最前沿,同时维持SYNAPT的易用性和成熟的客户端工作流程。StepWave XS重新设计的分段四极杆传输光学元件,提升棘手化合物的分析灵敏度,同时进一步提高分析稳定性。Extended ToF 针对最复杂的样品,提供兼容UPLC的质量分辨率、耐受各种基质的动态范围和定量分析结果,同时提供卓越的性能指标。更大的分析选择自由度为有效解决固有难题,分析人员对各种分析策略的需求不断增加,因此,SYNAPT XS将高性能与极致灵活性相结合。竞争对手的系统大多存在入口选项有限、扫描功能局限性或需要多个平台等问题。与之相比,只有沃特世能够提供全方位的高性能LC-MS解决方案,该方案经过专门设计,能够提供更大的分析选择自由度以支持科学研究。SONAR和HDMSE提供了一套独特的工具包,用于解析复杂混合物完整的分析策略需要结合适当的互补技术才能得到更全面的数据信息。借助SYNAPT XS上基于SONAR和IMS的非数据依赖型采集(DIA)操作模式,分析人员能够利用互补机制,以独一无二的方式解析复杂混合物。两种类型的采集均提高了分析峰容量,提供“清晰明了”的碎片数据,但它们基于不同的分子特性。这提供了一种真正独有的研究工具包,适用于深入解析复杂混合物。离子淌度和CCS测量传统质谱仪基于m/z分离组分。SYNAPT XS还支持在离子淌度实验中,使用分子大小、形状和电荷作为其碰撞截面(CCS)的函数,对分子进行分离。 除离子淌度能提供额外的分离维度、增加峰容量和分析选择性以外,CCS测量还可提供额外的分子标识。离子CCS的测量结果有助于确定离子名称或研究其结构。运用离子淌度技术,显著提高了科学家分析复杂混合物和复杂分子的范围和可信度。CID与ETD碎裂功能TriWave的双碰撞室结构可进行碰撞诱导解离(CID)和/或电子转移解离(ETD)碎裂,且分辨率高、质量测定准确,能够拓展MS/MS检测能力。 高解析度四极杆包括4 KDa、8 KDa或32 KDa质量数范围,适用于从小分子到大分子的MS/MS分析TAP碎裂时间校准平行(TAP)碎裂是T-Wave IMS设计所独有的采集模式。它使用户能够利用TriWave配置,允许将IMS前T-Wave和IMS后T-Wave作为两个单独的碰撞室运行。得到的CID-IMS-CID仪器操作有助于对组分进行超高可信度的结构表征。TAP碎裂与传统MSn或MS/MS技术相比,具备卓越的碎片离子覆盖率、灵敏度和准确性,在构建完整结构方面有着不容置疑的优势。
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  • SYNAPT所具备的无需妥协的定性与定量性能、精简的工作流程和无与伦比的平台通用性,为复杂混合物和分子的详尽表征开辟了新的途径。极佳的UPLC/MS/MS性能强大的数据独立型和数据依赖型解决方案CID与ETD碎裂功能多种实验类型选择升级至三维的数据分辨率极佳的UPLC/MS/MS性能将StepWave和UPLC分离与定量飞行时间(QuanTof)技术相结合,实现最高的峰容量和数据质量。StepWave是目前最灵敏和最可靠的离子源,具有&ldquo 主动&rdquo 选择离子和&ldquo 被动&rdquo 防止中性污染物的独特功能。与其他所有质谱分析器不同,QuanTof能够提供高质量数高分辨率、精确质量数和准确的同位素比例、宽的动态范围(谱图内和定量)和m/z范围,并且都可以在最快的采集速率实现,即便是对于高基质负荷的样品也是如此。强大的数据独立型和数据依赖型解决方案无与伦比的适用范围和效率,适用于复杂混合物的分析。通用型UPLC/MSE采集技术可以记录每个可检测的分子离子的碎片离子数据,与其它&ldquo 数据独立型分析&rdquo (DIA) 技术相比,具有卓越的占空比;同时我们的信息学技术可以为各种各样的应用提供精简的数据分析流程。要想获得更高效、更有效的靶向MS/MS,请选用最新的&ldquo 非数据独立型&rdquo 工作流程。使用高分辨率MRM工作流程,可获得更低的定量限;而使用FastDDA可实现更高的MS/MS灵敏度,扩大研发实验中的化合物覆盖范围。CID与ETD碎裂功能TriWave的双碰撞室结构可提供碰撞诱导解离(CID)和/或电子转移解离(ETD)碎裂,并且同时得到高分辨率和精确质量数,从而获得更好的MS/MS检测结果。ETD选件性价比高,可以实现最佳性能(碎裂效率)和灵活性,且易于和使用和维护。高解析度四极杆包括4KDa、8KDa或32KDa质量数范围,适用于从小分子到大分子的MS/MS测定。多种实验类型选择沃特世的离子源结构可与各种技术相结合:对于分离,可结合UPLC、nanoUPLC、HDX Automation、APGC和UPC2;对于电离,可结合ESI、APCI、APPI、ASAP、 DESI、DART和LDTD。它们可快速互换,在几分钟内即可使用。对于直接进样分析方法,可升级至HDMS功能和T-Wave 离子淌度技术,后者可提供最佳的电离后选择性与特异性。在与高性能可以与大气压离子源快速切换MALDI选件结合时,这一点具有非常明显的优势。升级至三维的数据分辨率!保留。迁移。质量。某些情况下,色谱和质量数分辨率还不能满足要求。可简单、快速、独特地升级至SYNAPT 高清晰质谱功能和高效T-Wave离子淌度技术,从而可在分子大小和形状的基础上获得另一个分离维度。利用分子碰撞截面特性这一项独特的功能,可以提供最高水平的选择性、特异性、灵敏度和结构分析。其优点还包括同分异构体分离、消除干扰、生成更干净的谱图,以及更准确地识别化合物ID。注意:本页面内容仅供参考,所有资料请以沃特世官方网站()为准。
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  • Thermo ScientificTM Orbitrap FusionTM 是赛默飞最高端的四极杆-静电场轨道阱-线性离子阱三合一组合式质谱。Fusion使用的Orbitrap为超高场Orbitrap质量分析器,相比于赛默飞其他Orbitrap系列产品,Fusion具有超高分辨、高灵敏度、多级质谱能力,并且配备多种裂解模式(CID、HCD及可升级的ETD),非常适合蛋白质组学中复杂体系的高通量蛋白检测。1) 离子源 Orbitrap Fusion配置的是赛默飞新一代的Easy Max NG离子源,具有加热型HESI源和APCI源一体化设计,只需要更换喷针即可实现ESI源和APCI源的切换。Easy Max NG源的另一个特点是集成式气路电路设计,安装Easy Max NG源时即可自动完成气路和电路的连接,不需要进行额外的操作。同时质谱系统还可自动识别源的类型,真正实现了智能化操作。对于蛋白质组学研究客户,除了标配的Easy Max NG离子源之外,有Nanospray Flex Ion Source NG和Easy-Spray nano-Electrospray Ion Source NG两种nanoESI源可供选择。 2) 离子传输部件 离子传输部件采用了S-lens设计,S-lens的离子传输效率是传统的tube lens的数倍,除了S-lens透镜组外,离子传输部件还采用了弯曲的方形离子传输四极杆,质谱离子化时会产生一些中性粒子,这些中性粒子很容易惯性飞行到检测器,被检测器检测到从而产生中心噪音。弯曲的离子传输四极杆可以有效阻挡样品离子中的中性粒子,降低噪音,提高灵敏度。 3) 四极杆质量分析器 主四极杆是Q Exactive上使用的赛默飞专利的同类双曲面四极杆,可以对离子进行过滤筛选,母离子选择窗口可调,可以根据自己实验的要求选择不同质荷比范围的离子通过四极杆进入到后方静电场轨道阱检测,既可进行数据依赖的二级或多级子离子扫描,也可进行非数据依赖的二级子离子扫描。 4) C-trap和离子传输多极杆 C-trap将离子冷却聚焦,传输到Orbitrap进行高分辨扫描。离子传输多极杆是Fusion的核心部件之一,离子进入到离子传输多极杆后可以做两个方向传输,第一就是传输到离子阱,进行快速的碎裂和子离子扫描,第二是经过C-trap进入Orbitrap,进行高分辨扫描。除此之外,离子传输多极杆同时又是一个高能裂解碰撞池,可对母离子进行HCD裂解。离子传输多极杆既可以将离子进行正向和反向传输,又可对离子进行HCD裂解,从而使得Fusion可以在任意阶段选择任意质量分析器进行任意裂解模式的碎裂和扫描。 5) Orbitrap超高静电场轨道阱 Orbitrap Fusion为新一代超高场Orbitrap技术,相比上一代Orbitrap产品,超高场Orbitrap阱的体积缩小,电压提高,从而使分辨率获得提高。同时超高场Orbitrap采用了独特的FT信号处理系统、新型离子传输透镜,从而改善进入Orbitrap质量分析器的离子光学传输。 (Orbitrap 原理:静电场轨道阱Orbitrap是1999年,由俄国科学家MAKAROV发明的一种新型的质谱仪,其质量分析器形状似纺锤体,由纺锤形的中心内电极和左右2个外纺锤半电极组成。Orbitrap对离子的操作步骤分为离子捕获,旋转运动,轴向振动和镜像电流检测。仪器工作时,在中心电极上逐渐加上直流高压,在Orbitrap内产生特殊几何结构的静电场。当离子进入到Orbitrap室内后,受到中心电场的引力,开始围绕中心电极做圆周轨道运动,m/z高的离子有较大的轨道半径。同时离子受到垂直方向的离心力和水平方向的推力,而沿中心内电极作水平和垂直方向的震荡。外电极除限制离子的运行轨道范围,同时检测由离子振荡产生的感应电势,其中水平振荡的频率和分子离子的m/z关系可有公式来描述,由方程可见轴向频率ω与离子的初始状态无关,这造就了Orbitrap的高分辨率和高质量精确度,频率由傅里叶转换成频域谱,再转换成质谱。此外和其他质谱仪不同,Orbitrap既是质量分析器又是检测器,是无损的不需要定期更换。) 6) 双压线性离子阱 Fusion的离子阱设计为高压阱和低压阱两个部分,离子阱技术采用氦气冷却打碎离子,高压氦气有利于离子的捕获、冷却和解离,低压氦气有利于离子的扫描。双压线性离子阱采用高压和低压两个离子阱,高压单元的离子捕获能力提高,离子碎裂时间缩短,低压单元扫描速度加快,质谱分辨率提高,这一双阱优化设计使得离子检测的各过程在最佳的氦气压力下进行,实现了最快的扫描速度,更多的扫描,更高的分辨率。CID裂解在离子阱中进行。 7) ETD(选配) ETD为电子转移裂解(Electron Transfer Dissociation)的简写。ETD裂解的原理是利用阴离子自由基向带正电荷的肽阳离子转移电子,在此过程中产生的化学能量将肽段碎裂。相较于传统的CID裂解和HCD裂解,ETD裂解能够使蛋白质或肽段离子在肽骨架上发生碎裂,即使不依赖蛋白质酶解技术都能够获得很好的肽段碎片信息,并且不会破坏蛋白质或肽段上带有的翻译后修饰基团,因此十分有利于翻译后修饰蛋白质组学和Top-down蛋白质组学研究。Fusion的ETD是不同于以往产品的全新设计,采用汤森德放点原理产生电子,用于和荧蒽反应产生ETD阴离子反应气,调谐更为简单,产生的阴离子反应气流十分稳定,使ETD操作更为简便。
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碎裂性质相关的方案

  • 使用精确质量四极杆-飞行时间液质联用系统和分子结构关联软件对三氯蔗糖进行鉴定和碎裂研究
    本文将评价精确质量四极杆-飞行时间液质联用系统(Q-TOF LC/MS) 和MS/MS 系统在正负电喷雾离子化(ESI) 模式下对水中三氯蔗糖的鉴定。研究其响应和碎裂途径。Q-TOFLC/MS 系统在ESI 正离子或负离子模式下对三氯蔗糖具有良好的响应。正离子模式下获得的整体信号强度大约是负离子模式下的两倍。在正离子模式下,三氯蔗糖以其钠加合物[M+Na]+ 的形式在m/z 419.0038 处检出。通过精确质量MS/MS 测量提供所获得的钠加合碎片离子(m/z 221.0187 和m/z 238.9848)的结构信息。在负离子模式下观察到去质子化分子(m/z 395.0073 处的[M− H]− )。通过MS/MS 碎裂产生一个特征碎片离子(m/z 359.0306)。使用Agilent MassHunter 分子结构关联(MSC) 软件绘制和研究正负离子MS/MS 分析的碎裂途径。MSC 软件已证实在辅助碎片离子结构的表征上是一个有效工具。
  • 碎片离子检索功能在士的宁代谢物鉴定中的应用
    马钱子主要有效成分士的宁(strychnine)又名番木鳖碱,属于中枢神经兴奋剂,临床用于偏瘫、瘫痪及因注射链霉素引起的骨骼肌松弛、弱视症等和巴比妥类中毒等。此外,添加士的宁的饲料诱饵可用来消灭老鼠等啮齿类有害动物,然而这些动物体内残留士的宁会通过食物链传递, 对整个生态圈造成影响,故有必要对其代谢产物进行深入研究,为临床用药、环保、司法等部门提供可靠的分析手段和数据。LTQ Orbitrap XL结合了线性离子阱和Orbitrap高分辨质量分析器,具有高灵敏度的多级高分辨能力。Mass Frontier为Thermo专业的结构解析软件,利用其丰富的碎裂数据库,可快速的对士的宁多级碎裂规律进行准确推测和归属,碎片离子检索功能将母药与代谢物相关性与可能的代谢途径有机的结合起来,从繁杂的基质样品质谱信号中准确的筛选到未知代谢物信息,进一步对代谢位点进行推测,最终获得全面的代谢物信息。
  • Mass Frontier碎片离子检索功能(FISh)在士的宁代谢物鉴定中的应用
    马钱子主要有效成分士的宁(strychnine)又名番木鳖碱,属于中枢神经兴奋剂,临床用于偏瘫、瘫痪及因注射链霉素引起的骨骼肌松弛、弱视症和巴比妥类中毒等。此外,添加士的宁的饲料诱饵可用来消灭老鼠等啮齿类有害动物,然而这些动物体内残留士的宁会通过食物链传递, 对整个生态圈造成影响,故有必要对其代谢产物进行深入研究,为临床用药、环保、司法等部门提供可靠的分析手段和数据。LTQ Orbitrap XL结合了线性离子阱和Orbitrap高分辨质量分析器,具有高灵敏度的多级高分辨能力。Mass Frontier为赛默飞专业的结构解析软件,利用其丰富的碎裂数据库,可快速对士的宁多级碎裂规律进行准确推测和归属,碎片离子检索功能将母药与代谢物相关性与可能的代谢途径有机的结合起来,从繁杂的基质样品质谱信号中准确的筛选到未知代谢物信息,进一步对代谢位点进行推测,最终获得全面的代谢物信息。

碎裂性质相关的论坛

  • 【求助】玻璃的碎裂温度

    在做实验过程中,作为实验衬底的ITO玻璃忽然碎裂,由于是在一个未知的高温下进行的实验,没有测出碎裂时温度。想请问有没有朋友有没有这方面的专业资料或其他建设性的意见也可以,特此感谢。

  • 【求助】ICP 矩管碎裂问题

    我们实验室经常需要测试高盐基体类的样品,盐份含量大概在1.2%左右,盐分含量为硼酸锂介质,现在碰到的问题是炬管头部很容易烧结碎裂,从现象上看管壁上结了一层比较厚的盐,这个应该是造成碎裂的主要原因,想请教一下各位如何来改善这种情况?

  • 请教官能团极性与化合物在质谱碎裂的关系?

    请教分子上的官能团极性与分子在质谱碎裂的关系?极性是值整个分子的电荷分离的程度,带有吸电子基团则极性会偏大,且极性也与官能团对称的结构有关。我们在质谱施加碎裂电压时,经常容易断裂的基团是在分子上的官能团极性顺序进行断裂的吗?之前的理解是键能越小越容易被打碎,那么键能与电子云的偏向有关吗?各类化合物的极性俺下列次序增加:—CH3,—CH2—,—CH=,—CH三,—O—R,—S—R,—NO2,—N(R)2,—OCOR,—CHO,—COR,—NH2, —OH,—COOH,—SO3H

碎裂性质相关的资料

碎裂性质相关的资讯

  • 大连化物所开发出基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂
    近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员张丽华团队,研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂,显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度,同时具有良好的两亲性和生物兼容性,实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。   作为生命活动的执行者,蛋白质通过相互作用形成复合物等形式行使其特定的生物学功能,其中,细胞内的限域效应、拥挤效应和细胞器微环境等对于维持蛋白质复合物结构和功能至关重要。化学交联技术(Chemical cross-linking mass spectrometry,CXMS),尤其是原位化学交联质谱技术(in-vivo CXMS)具有规模化分析蛋白复合物原位构象和相互作用界面的优势,已成为活细胞内蛋白质复合物解析的重要技术。然而,目前活细胞原位交联面临着细胞扰动大、交联肽段谱图复杂程度高等问题。因此,如何实现活细胞低扰动下的原位快速交联是蛋白质原位构象和相互作用精准解析的先决条件。   本工作基于糖分子的高生物兼容性和糖苷键的质谱可碎裂特征,将糖苷键引入到功能交联剂的骨架设计中,筛选并获得了高生物兼容性的海藻糖作为骨架分子,研制了质谱可碎裂型交联剂——海藻糖二琥珀酰亚胺酯(TDS)。该交联剂较目前已报道的可透膜型化学交联剂,展示了更优异的细胞活性维持能力,可在低扰动状态下实现细胞内蛋白质复合物的高效交联。在此基础上,低能量的糖苷键-高能量的肽键的质谱选择性碎裂模式,可将“工字形”的交联肽段数据分析降幂为常规交联剂片段修饰的线性肽段数据检索,降低了交联肽段谱图分析的复杂性,提高了交联肽段的鉴定效率与准确度。该团队从Hela细胞中鉴定到对应于3500对以上交联肽段的1453个蛋白质的构象以及843对蛋白质间的相互作用信息,实现了活细胞中蛋白质复合物的原位交联与规模化分析,为活细胞中蛋白质功能的调控提供了重要的技术支撑和关键的互作位点信息。   近年来,张丽华团队致力于原位化学交联质谱新技术研究,通过开发一系列新型多功能型化学交联剂,并系统建立深度覆盖的化学交联分析方法等,不断提升原位化学交联技术对于蛋白质复合物原位动态构象的深度捕获和精准分析能力。目前,该团队研制了多种类型的具有不同富集基团、正交反应活性基团的可透膜交联剂,并发展了相应的原位快速交联方法,低丰度交联位点的高效酶解和富集方法,以及基于化学交联距离约束的蛋白质原位构象和相互作用解析方法等,为蛋白质复合物功能状态下原位构象的规模化精准解析提供了关键技术支撑。   相关研究成果以A Glycosidic-Bond-Based Mass-Spectrometry-Cleavable Cross-linker Enables In vivo Cross-linking for Protein Complex Analysis为题,发表在《德国应用化学》上。研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金和中国科学院青年创新促进会等的支持。
  • Nat Genetics | 染色体碎裂驱动癌基因扩增
    2019年,BioArt曾解读Nature Reviews Cancer上的一篇观点文章(这篇观点文章是3月发表),讲述了染色体外DNA的(Extrachromosomal DNA,ecDNA)过去和未来(详见BioArt报道:特别推荐丨环状DNA的过去和未来),详细介绍了癌基因在ecDNA上扩增的重新发现的过程,强调ecDNA在肿瘤发病机制和加速癌症进化中的重要性。然而ecDNA的结构如何呢?同年11月21日,美国加州大学圣迭戈分校的Paul Mischel教授团队(注:Mischel正是Nature Reviews Cancer的通讯作者之一另外在2017年,Mischel团队曾发表一篇Nature文章揭示了染色体外癌基因扩增与肿瘤的关系)发表了Nature文章对ecDNA进行了详细解析,利用各种技术手段证明了ecDNA的存在形式是—环状,即ecDNA变成了eccDNA(详见BioArt报道:Nature亮点 | 吴思涵等首次解析肿瘤染色体外DNA的环状结构与功能)。功能上,eccDNA在癌症中扮演了重要的角色,尤其是原癌基因(详见BioArt报道:Nat Genet 丨ecDNA:在癌症基因组图谱上画出浓墨重彩的一笔);来源上,eccDNA不仅来自于染色体,甚至可以整回到染色体中(详见BioArt报道:再一篇!Nat Genetics报道染色体外环状DNA新功能:驱动神经母细胞瘤基因组重排),那么,还有一个问题,eccDNA是否有序列或位置特异性,表观遗传学领域大佬哈佛医学院张毅教授于今年10月20日在Nature上给出了否定的回答,并提到eccDNA可能是基因组DNA随机断裂产生片段的环化产物(详见BioArt报道:专家点评Nature | 突破!张毅团队揭秘染色体之外环状DNA的前世今生)。再回到癌症,基因扩增对于癌症的发展“功不可没”,其扩增可以分为染色体外扩增(如双微体,double minutes,DM)和染色体内扩增(如均匀染色区,homogeneously staining regions,HSR)。除了DM和HSR,还有一种是巨型标记染色体(giant marker chromosomes)或者新染色体(neochromosomes)。这些概念也说明了癌症基因扩增中演化的复杂性。尽管扩增演化中的部分形式的机制已经相对比较明确了,比如串联重复等,但大部分还是不甚清楚。2021年11月15日,德国科隆大学儿童医院Matthias Fischer在Nature Genetics上发表了文章Chromothripsis followed by circular recombination drives oncogene amplification in human cancer,利用小儿神经母细胞瘤的全基因组测序发现一种新型扩增,并命名为“地震扩增”(seismic amplification,注:这一术语原本属于地质学或者地震相关学科),这一扩增的特点为多重重排和不连续的拷贝数,并且在38种不同类型肿瘤的发生率为9.9%(在38种不同类型肿瘤共计2756例病人中,出现例数为274,占9.9%)。机制上,地震扩增起始于染色体碎裂,产生染色体外环状DNA,之后是环状重组,由此导致原癌基因拷贝数增加、表达升高,从而促进癌症的发生。首先,研究人员检测了79例神经母细胞瘤样本的全基因组数据,对其基因扩增进行了详细分析,并将经历过14次及以上内部重排的扩增子定义为“地震扩增”。根据这一定义,神经母细胞瘤中228个扩增子中有20个属于“地震扩增”,并且影响了79例样本中的19例。其热点区域主要有两个,2p24(内部有MYCN)和12q13/12q15(内部有CDK4和MDM2)。除了神经母细胞瘤,研究人员进一步分析了TCGA上37种不同类型癌症的2677个肿瘤样本,对其“地震扩增”进行了描述。由于染色体碎裂可产生大规模的基因重组,研究人员比对了染色体碎裂和“地震扩增”的区域,发现77.6%的地震扩增子与染色体碎裂区域至少部分重合,其中34.9%是完全重合。同时研究人员排除了断裂—愈合—染色体桥循环(breakage-fusion-bridge cycles)是地震扩增起始事件的可能性。之后,研究人员对重排和扩增事件进行了分析,描述了“地震扩增”的过程模型:1)一个或多个染色体区域发生染色体碎裂;2)将随机片段整合为环状DNA;3)发生环状重组事件(这些环状重组事件与肿瘤细胞高频突变有关);4)扩增区域或保留在双微体中、或以均匀染色区形式整合进染色体中、或形成新染色体。重要的是,“地震扩增”在肿瘤细胞中是稳定的,而非变化的。总之,该研究定义了一种复杂的基因扩增形式——“地震突变”,并描述了其扩增过程,为理解癌症基因组演化包括染色体外环状DNA提供了新的解读。原文链接:https://doi.org/10.1038/s41588-021-00951-7
  • 袁谷教授:ESI-MS方法鉴别环肽非对映异构体、碎裂机理及DNA识别的研究
    仪器信息网讯,2009年11月7日,由中国质谱学会有机质谱专业委员会与中国分析测试协会联合举办的“2009年中国有机质谱年会”在北京成功召开,会议为期三天,出席会议人数达300人。仪器信息网作为特邀媒体也应邀参加。  此次质谱年会为与会代表准备了丰富的报告内容,内容涉及生命科学、医学、药学、环境科学、食品安全、毒物分析中的质谱应用研究以及质谱仪器研发的新技术、新进展等。仪器信息网将进行系列报道。  北京大学化学学院的袁谷教授以手性物质为研究对象,创新地选用质谱作为分析手段进行研究。北京大学化学学院的袁谷教授 其主要做了以下几个方面工作:ESI质谱法鉴别环肽非对映异构体、环肽质谱碎裂机理研究、环肽识别乙肝病毒发卡型DNA研究、环肽识别HIV-1双链DNA研究。课题组利用ESI-MS测定了8个4对环肽非对映异构体特征离子的相对强度,成功区别了8个异构体,同时用MS鉴别了非对映异构体混合物并确定了相对含量,建立了鉴别环肽非对映异构体混合物的标准曲线和计算方法。  研究发现:MS/MS是鉴别异构体的有用方法 环肽分子对DNA具有识别功能 质谱是分析分子间相互作用力的好方法。
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