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ArrayJet生物芯片点样仪助力复苏植物耐旱机制研究

复苏植物Craterostigma plantagineum 、Lindernia brevidens和 Lindernia subracemosa的细胞壁成分组成分析研究目的:不同干燥条件下,比较复苏植物的细胞壁组成和结构特性作者单位:南非斯泰伦博什大学--葡萄与葡萄酒研究所期刊:Plants发表年份:2024年8月样本:复苏植物叶片芯片类型:植物糖芯片芯片点样仪:英国ArrayJet公司的生物芯片点样仪复苏植物是一类特殊的植物,能够在极端干旱的条件下生存下来。这类植物在失去大部分水分后,可通过一种类似休眠的状态维持细胞活力,当环境变得湿润时,它们则迅速恢复正常生长状态。复苏植物的研究,不仅有助于了解植物如何适应极端环境,还为植物耐旱及应激能力的基因改良以及开发新型细胞壁生物材料提供宝贵资源。本研究中,作者选取了三种复苏植物Craterostigma plantagineum、Lindernia brevidens以及L. subracemosa,比较其细胞壁组成和结构特性。收集这些植物的不同水化阶段叶片:完全水化、半干(约45%相对水含量)、完全干燥。继而在液氮下将冻干叶片研磨成粉末,悬浮在80% (v/v)的乙醇水溶液中15分钟使内源性酶失活,随后用有机溶剂萃取去除细胞壁中低分子量代谢物。提取的多糖使用ArrayJet生物芯片点样仪点印在硝化纤维素膜上制备聚合物微阵列,随后孵育27种特异性单克隆抗体,最后使用芯片扫描仪进行信号检测和分析,结果以热图的形式进行呈现,如图1。图1.植物叶片细胞壁的聚合物微阵列分析(CoMPP):CDTA提取物(a)和NaOH提取物(b)的结果检测图谱(三种水化阶段:完全水化H,部分水化PD或干燥D );热图显示了植物多糖含量的相对丰度,数值是三次实验的平均斑点信号;最高信号在整个数据集中设置为100,其他数据与其进行对比。综上所述,在这三种复苏植物的干旱研究中,其细胞壁成分没有发生明显变化,表明细胞壁的大规模重组并不是其干燥环境生存的必要条件。因此,需要更多的手段来评估脱水过程中壁膜信号的变化,以阐明干旱对被子植物脱水耐受的影响机制。原文链接:https://doi.org/10.3390/plants13162235Arrayjet位于英国爱丁堡,专注于提供生物芯片应用领域的解决方案及服务。自2000年公司成立即致力于开发新型生物样品喷点方案–喷墨式液体处理平台,该系统于2006年上市,目前用户遍布全球27个国家。Mercury系列产品采用独特的飞行喷墨点样技术实现行业第一的快速、非接触式微量液体处理。同时上万种不同样品可以进行快速点样,专利的上样模块配合高通量的点样喷头保障您的点样操作快速、无污染,更低的上样体积可有效减少样品损失,使您的珍贵样品物尽其用。▼更多 ArrayJet 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.08.22

Cas9辅助靶向测序检测林奇综合征相关基因PMS2的大片段倒位现象

SageHLS+Illumina:Cas9辅助靶向测序检测林奇综合征相关基因PMS2的大片段倒位现象背景知识:林奇综合征(Lynch Syndrome,LS)是一种常染色体显性遗传疾病,会导致直肠癌或其他部位罹患恶性肿瘤,约3%结直肠癌由LS引起,是最常见的遗传性结直肠癌综合征。林奇综合症是因为错配修复基因(MLH1、MSH2、MSH6、PMS2、EPCAM等)的胚系突变所诱发的。已有研究表明7号染色体上错配修复基因PMS2(band p22.1,如图1)的破坏性突变与两种遗传性癌症综合征有关:体质性错配修复缺陷(CMMRD)和林奇综合征(LS)。7号染色体上存在有15个PMS2假基因和覆盖PMS2基因3'部分(外显子9-15区域)的100kb低拷贝数重复序列(LCR,又称节段重复)。同时,反向LCR序列的第二个拷贝位于离着丝粒700kb的位置,与端粒拷贝(包含PMS2CL假基因)具有95%以上的同源性。虽然LCR间的倒位现象会导致PMS2基因活化突变,但因LCR之间相隔很远且序列同源性高,已有NGS测序方法无法对这种复杂的情况实现检测,亟需新的技术或方法对相关基因的大结构变异进行精准研究。图1.hg38参考基因组中PMS2基因位置图HLS-Cas9辅助靶向测序实验方法:利用来自the Ashkenazi trio(HG002、HG003、HG004)的Coriell细胞系样本,研究人员在体外用Cas9核酸内切酶靶向选择切割200kb的基因组DNA片段,并通过HLS-CATCH技术平台进行超长DNA片段回收。回收得到的200kb DNA片段,既横跨整个端粒LCR加上LCR两侧约50kb的独特侧翼序列,又包含整个未重排的PMS2基因,因此能够完成PMS2基因座的短读长测序,同时不会引起着丝粒LCR或PMS2假基因的并发问题。为了测试涉及LCR区域的倒位现象,使用不同的Cas9切割端粒LCR外的相同端粒近端位点,以及在着丝粒LCR内部约50kb的独特序列中的第二切割位点。第二次Cas9切割也将从倒位等位基因中释放出200kb长片段,测序reads与未重排等位基因不同的模式进行拼接,其中第二切割位点和着丝粒LCR边界之间的区域覆盖率很高,该区域距离未重排的PMS2基因的位置约650kb。HLS-CATCH技术平台,是Sage Science 公司开发的SageHLS超长DNA片段回收仪结合CATCH(Cas9-assisted targeting of chromosome segments,Cas9辅助靶向染色体片段)技术构成。首先,将核酸装载到Sage HLS预制胶样品孔中进行电泳,完整的染色体DNA被截留在样品孔中;关闭电泳并加入用于切除大部分PMS2区域的Cas9复合物(如图2所示);最后,消化产物通过仪器自带的脉冲场电泳实现纯化回收。继而qPCR定性定量检测回收产物,随后在Illumina测序仪上进行测序分析,测序分析结果见图3。图2. HLS-CATCH技术平台图3.目标片段测序覆盖情况在基因组分析中,检测长片段的倒位仍然是一个难题,其他方法如Strand-seq(Falconer等人,2012)、超长纳米孔测序(Zhou等人,2020)和荧光标测技术(Lam等人,2012年),都需要专门的DNA提取和处理步骤。本应用中基于HLS-CATCH技术(SageHLS超长DNA片段回收仪结合CATCH(Cas9-assisted targeting of chromosome segments,Cas9辅助靶向染色体片段)),从细胞核(或细胞)中提取HMW DNA到Cas9酶切步骤全程自动化完成。酶切产物的片段大小直接从HLS-CATCH洗脱回收。鉴于短读长Illumina测序成功获取检测目标片段的详细情况,该方法也适用于其他由染色体重排、倒位、易位现象导致的疾病研究等。定制化基因组切割、片段大小筛选和短读长Illumina测序的高覆盖率分析运用,使其成为一种相对简单且具有成本效益的大片段倒位分析方法。NOTE:Detection of large inversions involving the Lynch syndrome genePMS2 using Cas9-assisted targeted sequencing. Chris Boles,Tina Huang, Feng Chen, Sage Science, Inc., Beverly, MA.,Illumina, Inc., Foster City, CA.美国Sage Science是全球领先的全自动DNA脉冲场电泳回收仪的生产厂家,拥有美国技术专利,各个型号产品可以高效完成不同长度范围的DNA片段的精准回收,广泛用于二代测序、三代测序以及多种分子生物学相关领域。环亚生物科技有限公司作为美国Sage Science公司在中国区的独家代理商,自2011年以来将Sage Science的产品线引入国内,一直为国内用户提供专业的全自动核酸片段回收仪的安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。环亚生物科技有限公司将一如既往的支持越来越多的Sage Science用户。▼更多 SageHLS 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.08.14

Regemat 3D生物打印机助力皮肤相关的生物墨水开发

近些年,生物3D打印技术广泛应用于皮肤组织修复工程,即利用如胶原蛋白、明胶、纤维蛋白、果胶、透明质酸和细胞外基质(extracellular matrix ,ECM)等各种不同的生物墨水,开发和人体皮肤具有类似甚至相同机械特性、组织结构和细胞活性的人造皮肤,将其用于创伤修复、药物开发和基础研究等。然而,现有生物墨水所构建的人造皮肤无法满足实际应用要求。葡萄牙波尔图大学卫生和创新研究所的科研团队于2024年在《Biomimetics》杂志发表了文章《Bioinspired and Photo-Clickable Thiol-Ene Bioinks for the Extrusion Bioprinting of Mechanically Tunable 3D Skin Models》。在该文中,作者利用果胶、多肽、甲基丙烯酸、CaCl2、人成纤维细胞作为生物墨水材料,构建了一种新型皮肤细胞模型,并测试机械性能、组织相容性等指标,为开发更理想的人造皮肤提供了新的研究依据。实验流程1.以果胶作为主要成分构建生物墨水果胶是一种具有优异组织相容性的天然多糖,添加不同比例的甲基丙烯酸酯后形成甲基丙烯酸果胶(pectin methacrylate,PECMA)。PECMA可以与特定肽序列中的半胱氨酸残基在光照的情况下发生硫醇-烯反应光交联;另一方面和CaCl2中的钙离子结合,实现离子交联,对墨水流变性能进行调节,达到与天然真皮类似的机械性能。(图1 a和b)2.将制备好的PECMA和人的真皮成纤维细胞混合为待打印的生物墨水,通过西班牙Regemat 3D公司的Bio V1 3D生物打印机,按预先设定程序打印成特定结构,并在紫外光下交联40秒,形成稳定的共价结合网络,实现与皮肤类似的机械性能与生物活性。培养7天后,将人角质形成细胞(HaCaT细胞)接种在该皮肤模型上,建立双层皮肤结构(图1 c) 。图 1.生物墨水设计和3D皮肤模型打印流程示意图。(a) 使用甲基丙烯酸酯对果胶进行化学改性,产生甲基丙烯酸果胶(PECMA),甲基丙烯酸酯用于光交联,羧基用于与钙结合(b) 通过聚合物主链中的甲基丙烯酸酯和肽序列中的半胱氨酸(突出显示为绿色)之间的硫醇-烯反应,实现水凝胶生物功能化(c) 第一步,由PECMA聚合物和定制的肽序列制备一种光交联生物墨水,并通过添加氯化钙进行离子交联来调节其流变性,然后混合和均质化以获得物理交联的生物墨水;第二步,在生物墨水中加入真皮成纤维细胞并用Regemat 3D生物打印机打印成预设的真皮模型,并进行体外培养7天;第三步,将HaCaT细胞接种到真皮模型上,体外培养7天;第四步,体外培养7天,待后续检测实验结果1.用紫外光照射40秒(光交联)后,添加了肽交联剂的墨水具有814.0±129.1Pa的弹性模量;而未添加肽交联剂的墨水没有建立足够密度的共价键,导致培养基中水凝胶结构的完整性迅速丧失。然而,如果将光照时间延长到60秒,即使没有肽交联剂,也可以形成稳定的水凝胶结构。该结果说明,在肽交联剂存在的情况下,二级水凝胶交联主要通过阶梯生长机制进行,反应速率和形成水凝胶结构的效率更快。2.在不同硬度的水凝胶中,成纤维细胞的生长状态有显著差异。在低硬度水凝胶中,细胞扩散和细胞间接触的能力明显高于中等硬度和高硬度的水凝胶。说明水凝胶的硬度,影响成纤维细胞在模拟真皮模型中生长以及形成类似真皮结构的过程。3.将HaCaT细胞接种在真皮模型并培养28天后,评估关键标记物的位点特异性表达,免疫组化结果显示:该皮肤模型呈现出预想的双层结构,上层为表皮(角质形成细胞),下层为真皮(真皮成纤维细胞)。这种结构与天然皮肤类似,未来可以考虑用于替代天然皮肤(图2)。图2 生物打印 3D 皮肤模型(a) 具有圆形和方形形状的双层皮肤模型图示,以及培养28天后它们的结构完整性(比例尺顶部:2.5毫米;比例尺下:5毫米)。(b) 皮肤模型的免疫染色图示(Epidermis表皮层:细胞角蛋白(绿色)和细胞核(蓝色);真皮层Dermis:波形蛋白(红色)和细胞核(蓝色);比例尺:100μm))。结论利用果胶、肽交联剂、甲基丙烯酸酯和成纤维细胞,可以构建出理想的真皮模型,其理化性能和细胞性能可以通过调节水凝胶的硬度、紫外光照时间等方式实现;在接种HaCaT细胞后,更可以构建出理想的双层皮肤细胞结构。这为未来人造皮肤的开发提供了新的依据。更多资讯请查阅原文:https://doi.org/10.3390/biomimetics9040228环亚生物科技有限公司作为西班牙REGEMAT 3D公司生物3D打印系列产品在中国区的独家代理商,一直为国内用户提供专业的生物3D打印系统的安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。环亚生物科技有限公司将一如既往地支持越来越多的REGEMAT 3D用户。▼更多 Regemat 3D 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.08.14

Blotcycler助力缺血性中风脑神经功能恢复的药物靶点研究

中风,又称脑卒中,发病率、致残率和死亡率三高,在全球范围内都是成人致死和致残的主要原因之一。中风患者中,有超过75%为缺血性中风,其病理机制复杂,涉及血管阻塞的脑部供血不足,尽管静脉溶栓和动脉血栓切除是常用的治疗方法,但95%的中风患者由于时间的限制和禁忌症无法接受这类治疗。因此,寻找潜在的新药干预靶点对于减少中风相关脑损伤的治疗至关重要。近年来,一种广泛用于情感障碍治疗的药物氯化锂(LiCl)引起了研究者的关注,其在动物模型中对多种神经退行性疾病具有神经保护作用,可减少脑梗死体积和神经缺陷。然而,LiCl如何在脑缺血后促进神经恢复,以及作用机制,目前仍然不清楚。‍来自贵州医科大学的朱俊德教授团队,构建大鼠中动脉闭塞(the middle cerebral artery occlusion,MCAO)模型模拟人类缺血性中风,探讨LiCl是否通过激活Wnt信号通路(同神经元的分化、发展和迁移密切相关)来促进神经功能恢复。这项研究不仅有望为缺血性中风提供新的治疗策略,也可能为LiCl在神经保护中的作用机制提供新的理解视角。研究成果以“Lithium chloride promotes neural functional recovery after local cerebral ischaemia injury in rats through Wnt signalling pathway activation”为题,发表在《Folia Morphologica》上。为了阐明LiCl神经保护作用的分子机制,在大鼠脑缺血后的海马组织中,评估了与凋亡相关的两种蛋白(Bcl-2抗凋亡蛋白)、Bax促凋亡蛋白)的表达水平。MCAO共分为五组,S组为模拟处理的对照组;M组中动脉闭塞组模拟人类缺血性中风;M+L组为中动脉闭塞后皮下注射LiCl,评估LiCl对缺血性脑损伤的潜在神经保护作用;M+D组为中动脉闭塞手术前,侧脑室注射了Wnt信号通路的抑制剂DKK1,探究Wnt信号通路在脑缺血损伤中的作用;M+L+D组为中动脉闭塞手术前注射了DKK1,手术后皮下注射LiCl,评估DKK1对LiCl神经保护效果的可能影响。Western blot结果(图1)显示,M组Bcl-2表达明显低于S组,LiCl给药后显著抑制了这种表达水平的降低。此外,与S组相比,M组的Bax表达显著增加,LiCl可显著预防这种情况。然而,Wnt信号通路抑制剂DKK1仅逆转了对Bcl-2表达的影响。图1 大鼠脑缺血后海马组织中与凋亡相关的两种蛋白:抗凋亡蛋白Bcl-2和促凋亡蛋白Bax的表达水平,左图是蛋白条带图,右图是对应的光强度分析结果。随后,该团队使用免疫荧光染色、q-PCR和Western blot分别研究了LiCl 对Wnt信号通路的激活作用,评估了LiCl对Wnt信号通路中关键蛋白Wnt-3a、Dvl-1、GSK-3β、β-catenin、Axin-2的影响。与其他方法一致,Western blot的分析结果(图2)进一步证实了LiCl通过Wnt信号通路发挥神经保护作用,LiCl增加了GSK-3β和β-catenin的蛋白表达,而DKK1则逆转了这些变化。这些结果表明,LiCl通过激活Wnt信号通路,促进了大鼠脑缺血诱导损伤后的神经功能恢复,DKK1作为Wnt信号通路抑制剂,在调节LiCl神经保护效果中发挥作用。Wnt信号通路的激活可能有助于提高神经保护过程和神经发生,从而促进功能恢复。图2 Wnt信号通路中关键蛋白GSK-3β、β-catenin的表达水平,左图为蛋白条带图,右图为对应的光强度分析结果本研究提供了LiCl作为神经保护剂的有力证据,并强调了其通过Wnt信号通路发挥作用的重要性,为未来的研究和临床应用奠定了基础。文中所有的蛋白免疫印迹杂交(Western Blot)操作,均由美国Precision Biosystems公司提供的全自动蛋白质印迹杂交系统Blotcycler完成。来自美国Precision Biosystems公司的Blotcycler,是一款全自动的蛋白质印迹杂交系统,Western Blot洗液工作站,可自动化完成封闭、孵育、清洗和一抗回收的一系列工作,很好地解放您的双手。更为重要和有意义的是:专利的流体清洗可以减少二抗在膜上的附着,降低背景,提高信噪比和灵敏度;自动化的操作流程避免了手工操作带来的误差,保证了批次内和批次间实验的高度重复性;高通量操作和多条件的设定可以辅助您优化Western Blot 实验的条件,例如合适的抗体浓度等,开放的实验平台,无需其他额外投入。Blotcycler是从事Western Blot实验的科研工作者的最佳选择。环亚生物,生命科学产品全国性代理商,不断把国外顶级的创新产品引入中国。环亚生物具备完善的公司运营、产品管理、营销、售前技术支持和售后维修体系。环亚生物作为Precision Biosystems产品大中华区独家代理商,负责Blotcycler在大中华区的营销和售后支持。更多资讯请访问文献全文链接:https://doi.org/10.5603/FM.a2022.0068▼更多 Blotcycler 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.08.14

全自动DNA片段回收系统助力ddRAD-Seq测序进行大规模种群遗传多样性研究

Pippin系列全自动DNA片段回收系统助力ddRAD-Seq测序进行大规模种群遗传多样性研究RAD-Seq(Restriction-site Associated DNA Sequence),对全基因组中处于限制性内切酶酶切位点附近的片段进行测序。RAD-Seq是开发单核苷酸多态性(SNPs)的高效方法,可用于遗传连锁图谱的构建、QTL定位、群体遗传分析等。相比全基因组测序,RAD-Seq具有如下优势:(1)大幅降低基因组复杂度;(2)降低建库和测序成本;(3)不受参考基因组的限制,研究物种范围更广泛;(4)相同通量情况下,一次测序可检测更多样本,尤其适合群体遗传研究。ddRAD-Seq是在传统RAD-Seq基础上发展而来的双酶切简化基因组测序技术,与RAD-Seq的主要区别在于,基因组DNA通过一个稀有限制性内切酶与一个常见限制性内切酶相结合进行双酶切,免去打断的步骤直接进行片段筛选后测序。如图所示,对基因组进行双酶切并辅以酶切产物的片段大小筛选,得到的序列就是两端为不同酶切位点且长度接近的片段,如图中蓝色区域。a、b两处虽然也在不同的酶切位点之间,但因大小不符而被筛除。因此,ddRAD-Seq对DNA文库的筛选更为严格,在通量相同的情况下比单酶切法的测序深度更深,准确度更高,也能检测更多的样本,提高数据的利用率。因此,构建ddRAD-Seq文库需要对酶切后的基因组DNA进行高精确度的片段筛选,传统的手工切胶难以达到准确度的要求,Sage Science公司的Pippin系统在此方面表现出强大的优势。案例1:应用新方法的双酶切限制性位点DNA测序(ddRAD-Seq)进行更高效的SNP鉴定2023年美国密西西比州立大学基因组学和生物技术研究所的科学家发表了一篇“应用新方法的双酶切限制性位点DNA测序(ddRAD-Seq)进行更高效的SNP鉴定”的方法学文章。新的方案提高了实验效率并减少了ddRAD-Seq的时长,为了证明其实用性,作者比较了新方案的SNP与来自全基因组重测序数据的SNP。结果表明,相比现有方法,改进的ddRAD-Seq方法在识别系统发育和关联遗传研究的单核苷酸多态性分析方面是可靠的,同时降低了成本和时间。Fig 1. 改进的ddRAD-Seq实验方法流程图。(A)从基因组DNA提取到测序文库构建的过程。(B)构建的文库,经过Sage ELF片段筛选仪进行295—614 bp片段筛选,最后经Illumina Hiseq X Ten测序在ddRAD-Seq测序文库制备过程中,使用Sage Science公司的Sage ELF高精度DNA片段分选回收仪对295-614bp的DNA片段,进行准确、高效地回收,确保Illumina测序在最佳片段范围内。同时作者也提出嵌合体的存在会造成序列读取不匹配,为了尽可能减少嵌合体的存在,需要将文库大小控制在364-444 bp之间,推荐使用Sage Science公司的系列片段回收仪Sage ELF 或 Blue Pippin 作为DNA片段精准筛选回收方法。案例2:ddRAD-seq技术用于大规模植物种群遗传多样性分析研究文章是来自复旦大学的科研团队关于应用ddRAD-seq技术,用于大规模植物种群遗传多样性分析。作者开发了一个通用的计算工具,优化植物RAD-seq设计,并通过实验验证其有效性。优化的RAD-seq方法能够在文库构建过程中去除叶绿体DNA和rRNA基因,同时保持所需的覆盖均匀性和密度。  通过优化选择限制性酶切位点(REs),同时引入精确的DNA片段大小筛选回收技术,显著提高了RAD-seq的效率和准确性。整个建库过程中,在两个步骤上均使用Pippin Prep作为DNA片段大小筛选回收工具(上图左)。经过DNA片段筛选后,每一个测序文库超过90%的被测序片段都落在目标大小范围内(220—420 bp)(上图右)。案例3:Pippin prep全自动DNA片段分选回收仪联合3RAD-seq技术,用于哥伦比亚红足龟的物种保护研究  ‍期刊:Molecular Ecology(IF5.2)发表年份:2023年6月7号物种:龟科——哥伦比亚红足龟文库类型:基于3种限制性内切酶的简化基因组测序文库即3RAD-Seq文库文库富集和精准回收:使用 Sage Science公司的Pippin Prep全自动DNA片段分选回收仪对350至450 bp之间的片段大小进行选择,在Illumina NovaSeq SP平台进行了文库测序。案例4: Pippin prep全自动DNA片段分选回收仪联用ddRADseq技术,用于研究关键传粉媒介欧洲熊峰的基因渗入和适应特征  期刊:Molecular Ecology(IF 5.2 )发表年份:2023年物种:欧洲熊峰bumblebee specimens (Bombus terrestris)文库类型:ddRAD 文库,A single quaddRAD library文库富集和精准回收:利用Sage Science公司的Pippin Prep全自动DNA片段分选回收仪制备quaddRAD文库,片段大小从450-550 bp精确回收,然后使用Illumina HiSeq 2500平台进行测序。Sage Science公司的Pippin系列全自动DNA片段回收系统对于RAD-seq及ddRAD-seq方法在精确回收目标片段,提高测序效率、减少非目标序列的干扰上有重要帮助,是大规模种群遗传多样性分析、遗传连锁分析、关联映射、生态和进化研究领域的重要工具。可广泛用于生命科学、农、林、牧、渔等多方面研究。文献:1、Zenaida V. M et al. “Innovations in double digest restriction-site associated DNA sequencing (ddRAD-Seq) method for more efficient SNP identification” Analytical Biochemistry 662 (2023) 1150012、Ning Jiang et al. “A highly robust and optimized sequence based approach for genetic polymorphism discovery and genotyping in large plant populations” Theor Appl Genet (2016) 129:1739–17573、Natalia GG, Mario VR, H. Bradley Shaffer,et al. "The importance of cryptic diversity in the conservation of wide-ranging species: The red-footed tortoise Chelonoidis carbonarius in Colombia" Molecular Ecology, 2023;32:4531–4545.4、Paolo F, Carmelo F, Thomas J., et al. "Limited introgression from non-native commercial strains and signatures of adaptation in the key pollinator Bombus terrestris." Molecular Ecology, Volume32, Issue21 November 2023 Pages 5709-5723美国Sage Science是全球领先的全自动DNA脉冲场电泳回收仪的生产厂家,拥有美国技术专利,各个型号产品可以高效完成不同长度范围的DNA片段的精准回收,广泛用于二代测序、三代测序以及多种分子生物学相关领域。环亚生物科技有限公司作为美国Sage Science公司在中国区的独家代理商,自2011年以来将Sage Science的产品线引入国内,一直为国内用户提供专业的全自动核酸片段回收仪的安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。环亚生物科技有限公司将一如既往的支持越来越多的Sage Science用户。▼更多 Pippin系列 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.08.05

Innopsys激光共聚焦荧光芯片扫描仪助力能量代谢研究

【iScience】Charge Characteristics of Agouti-Related Protein Implicate Potent Involvement of Heparan Sulfate Proteoglycans in Metabolic Function刺鼠关联蛋白(AgRP)的电荷特性与硫酸乙酰肝素聚糖调节代谢功能相关研究目的:内源性肾上腺皮质肽刺鼠关联蛋白(AgRP)在觅食行为研究十分广泛,但其对能量代谢的调节尚不清楚。作者单位:美国-斯克利普斯研究所期刊:iScience发表年份:2019年样本:合成的多肽芯片类型:聚糖芯片芯片扫描仪:Innopsys公司的激光共聚焦荧光芯片扫描仪实验方法:第一步:进行AgRP相关的多肽合成和纯化。第二步:氨基(-NH2)修饰的的硫酸肝素聚糖化合物点印在NHS包被的玻片上,AgRP(WT)和两种AgRP电荷变体肽(4Q;4K)在TMS缓冲液中稀释至50 mg/mL,与玻片进行孵育,随后加入络合的Rb抗人AgRP 抗体(10 mg/mL,一抗)和抗Rb IgG-Alexa 488 (5 mg/mL,荧光二抗),最后使用法国Innopsys公司的生物芯片扫描仪进行荧光信号检测和定量分析。结果显示:AgRP和电荷修饰AgRP变体与硫酸肝素聚糖阵列相结合;AgRP的结合亲和力与巯基化状态和硫酸肝素寡糖的长度有关,6S和NS磺化对AgRP的结合有利,而3S磺化对AgRP的结合不利,AgRP-4K突变型的结合能力是野生型的50倍,如下图。‍第三步:自由摄食量与对食物的操作性反应监测。结果显示:AgRP-4K突变型小鼠对食物的摄取量和体重都有明显增加,如下图(A、E每日基本进食量;B、F未突变野生型;C、G、D、H突变型)。第四步:实验动物综合监测,(气体浓度--氧气、二氧化碳测量、血流,体温,活动,进食,饮水等),结果如下图。结论:1.AgRP可增加小鼠的自由摄食和对食物的操作性反应,降低氧气消耗,降低体温及活动,本体能量消耗较低。2.AgRP可增加呼吸交换率,减少脂肪氧化和碳水化合物转移3.AgRP作用的持续时间和强度取决于其带正电的氨基酸密度,表明代谢作用取决于其对硫酸肝素的亲和力。综上:通过验证AgRP与硫酸肝素之间的相互作用,表明其参与到中枢能量调节和脂肪代谢过程当中,这对临床研究代谢性疾病具有重要意义。原文:Chen et al.iScience 22, 557– 570 December 20, 2019 . https://doi.org/10.1016/ j.isci.2019.10.061Innopsys 成立于1999年。总部位于法国,一直致力于生物医学领域相关仪器和软件的自主研发和生产。Innoscan系列扫描仪,采用先进的共聚焦PMT检测器和多激光扫描光路,可以同时进行多通道荧光检测。不仅有效降低了荧光光漂白现象以及信号损失,还可以有效缩短扫描时间。在基因组和蛋白组表达,基因突变,SNP检测,CGH,细菌病毒检测,肿瘤特异性标志筛查,病理组织筛查等方面都有非常广泛的应用。 环亚生物,生命科学产品全国性代理商,具备完善的公司运营、产品管理、营销、售前技术支持和售后维修体系。环亚生物作为Innoscan大中华区代理商,负责Innoscan产品大中华区的营销和售后支持。▼更多 Innopsys 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

应用实例

2024.08.05

Orflo快速流式细胞仪助力新型基因编码钙指示剂的研究

钙离子(Ca2+)是机体各项生理活动不可缺少的离子,是细胞内重要且广泛存在的第二信使。监测活细胞内钙水平,对探究生物活动相关的信号机制及规律至关重要。传统的合成钙指示剂,使用方便、可靠性高、动态范围广、光谱化学特性多样。经过优化的基因编码钙指示剂(GECIs),在许多应用中可与其效果相媲美,尤其是GECIs表达稳定,可有效降低试剂成本,简化分析过程,比合成钙指示剂更有优势。来自Janssen研发有限责任公司的Nyantsz Wu等人,构建了一个稳定表达GCaMP6s的克隆细胞系,并通过流式细胞仪(flow cytometry)和荧光成像(FLIPR)等技术,对荧光基因编码钙指示剂GCaMP6s与合成钙指示剂fluo-4进行了性能比较,相关研究以“High-throughput-compatible assays using a genetically-encoded calcium indicator”为题,发表在《Scientific Reports》上。实验中,采用美国Orflo公司的Moxi GO II流式细胞仪进行流式细胞实验,通过488nm激发激光和525/45nm发射滤光片,配合PMT检测荧光强度,采用Coulter法测定细胞大小,直径小于9微米的细胞被认为是碎片,排除在计数数据之外。首先,流式细胞实验对GCaMP6s与fluo-4的荧光光谱进行分析,比较fluo-4标记293-F细胞与用pGP-CMV-GCaMP6s转染 24小时的细胞的荧光强度(图1. a-c)图1. 流式细胞实验对数变换荧光强度直方图. (a)未标记细胞,(b)瞬时表达pGP-CMV-GCaMP6s,(c)标记fu -4的细胞(用缓冲液(红色)或10μM钙离子通道载体(蓝色)处理细胞)然后,基于共聚焦显微镜和流式细胞仪,对GCaMP6s与fluo-4分别处理的细胞内钙离子变化进行可视化分析(图2)。图2. 用GCaMP6s(a-c)和fluo -4(d-f)分别标记的稳定表达GluA 1o -γ4 293-F细胞共聚焦图像和流式细胞术检测结果(c,f)悬浮细胞流式细胞术荧光强度直方图:CP-465022(红色),谷氨酸+ LY-395153(橙色),钙离子通道载体(蓝色)最后,对流式细胞实验结果进行总结(表)。在每次实验中,测量所有直径大于9μm细胞的计数平均值(运行1,800-11,000个细胞)。数据以每次结果的平均值±标准差表示,实验次数用括号表示。细胞处理为CP-465022 (FCP);谷氨酸+LY-395153 (FPAM);钙离子通道载体 (Fiono)。ΔF为(FPAM -FCP)或(Fiono -FCP)。通过流式细胞实验可以直接比较两种荧光指示剂的荧光强度。FLIPR(高通量实时荧光检测)实验测量大约10,000至20,000个细胞的总荧光强度,可以通过流式细胞仪测量大约10,000个细胞的算术平均值来模拟。研究人员发现,GCaMP6s标记的细胞在总荧光输出上比fluo-4标记的细胞低,但足以在FLIPR实验中提供稳健的反应。作为一种新型的荧光基因编码的钙指示剂,GCaMP6s具有高亲和力、高表达量,不需要额外的染料加载,降低试剂成本,在细胞内Ca2+浓度变化的监测上显示出与fluo-4相当的动态范围和响应特性。此外,GCaMP6s还可以通过标准的分子生物学技术进行改造,以适应特定的实验需求。文章认为GCaMP6s是一个有前景的新型工具,作为合成钙指示剂的替代品,可以用于各种细胞生物学和药理学研究,尤其是在需要高通量筛选的现代药物发现领域。在这项研究中,Moxi GO II作为一个实验工具,即开即用,操作简便,对于实现快速、准确的细胞内钙离子水平检测至关重要,对评估GCaMP6s这一遗传编码钙指示剂的性能和应用潜力具有重要意义。美国Orflo Technologies公司将行业公认的细胞计数金标准——库尔特原理(Coulter Principle),与荧光流式检测技术相结合,推出的新一代快速流式细胞仪——Moxi GO II,提供超准确的细胞计数、细胞活率检测,以及超高分辨率的细胞粒径测量。库尔特原理对颗粒个体进行逐个三维测量,不但能准确测量颗粒的粒径分布,更能进行粒子绝对数目和浓度的测量。由于检测时不受激光衍射、散射因样本颜色或浓度变化的影响,库尔特原理所测粒径大小更接近真实。Moxi GO II快速流式细胞仪,采用库尔特原理进行细胞计数和粒径测量,同时采用488nm激光光源,结合两个PMT通道,525/45nm通道和561nm/LP(或者646nm/LP,可根据需要更换),进行细胞活率、细胞凋亡、转染效率、活性氧簇、线粒体膜电位等常规流式检测。仪器设计小巧轻便,无需预热,开机即用,预设程序,触屏操控,运行后10秒即可给出测试结果,使用后也无需清洁维护。无论是经验丰富的流式专家,还是初试身手的实验小白,Moxi Go II都可以助您轻松完成实验。美国Orflo Technologies公司是一家非常专业的细胞分析仪器研发和制造企业,拥有多项专利技术,产品以库尔特原理的高精细胞计数仪和超快流式细胞仪为主。环亚生物,生命科学产品全国性代理商,不断把国外顶级的创新产品引入中国。环亚生物具备完善的公司运营、产品管理、营销、售前技术支持和售后维修体系。作为Orflo Technologies中国地区独家代理,环亚生物科技有限公司全权负责Orflo Technologies产品在中国地区的推广、销售,为广大用户提供专业的技术咨询和产品服务。更多资讯请访问文献全文链接:https://doi.org/10.1038/s41598-019-49070-8▼更多 Orflo 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.08.05

Pippin Prep全自动DNA电泳回收仪助力细胞外miRNA测序,用于子痫前期的诊断和预后评估

文献速递:Pippin Prep全自动DNA电泳回收仪助力细胞外miRNA(ex-miRNA)测序,用于子痫前期的诊断和预后评估Discovery and verification of extracellular microRNA biomarkers for diagnostic and prognostic assessment of preeclampsia at triage子痫前期(Preeclampsia,PE)是妊娠期特有的一种多系统疾病,其特点是妊娠20周以后出现新发的高血压和蛋白尿,会增加胎儿早产和产妇死亡的风险。目前,临床对子痫前期无非常准确的早期诊断或预后评估方法。来自加州大学圣地亚哥分校的科研团队发现,在母体血液样本中的miRNA可以作为子痫前期诊断和后期干预效果评估的生物标志物。相关论文于2023年12月发表于《Science Advances》期刊,题为“Discovery and verification of extracellular microRNA biomarkers for diagnostic and prognostic assessment of preeclampsia at triage”。AbstractWe report on the identification of extracellular miRNA (ex-miRNA) biomarkers for early diagnosis and prognosis of preeclampsia (PE). Small RNA sequencing of maternal serum prospectively collected from participants undergoing evaluation for suspected PE revealed distinct patterns of ex-miRNA expression among different categories of hypertensive disorders in pregnancy. Applying an iterative machine learning method identified three bivariate miRNA biomarkers (miR-522-3p/miR-4732-5p, miR-516a-5p/miR-144-3p, and miR-27b-3p/let-7b-5p) that, when applied serially, distinguished between PE cases of different severity and differentiated cases from controls with a sensitivity of 93%, specificity of 79%, positive predictive value (PPV) of 55%, and negative predictive value (NPV) of 89%. In a small independent validation cohort, these ex-miRNA biomarkers had a sensitivity of 91% and specificity of 57%. Combining these ex-miRNA biomarkers with the established sFlt1:PlGF protein biomarker ratio performed better than either set of biomarkers alone (sensitivity of 89.4%, specificity of 91.3%, PPV of 95.5%, and NPV of 80.8%). 研究人员从子痫前期检查的参与者中收集母体血清,然后以血清为样本进行miRNA 测序。结合生物信息学分析,最终确定了三组双变量 miRNA 生物标志物(miR-522-3p/miR-4732-5p、miR-516a-5p/miR-144-3p 和 miR-27b-3p/let-7b-5p)。随后,通过检测miRNA生物标志物的差异,用于区分不同严重程度的子痫前期病例。结果显示检测灵敏性为93%,特异性为 79%,阳性预测值 (PPV) 为 55%,阴性预测值 (NPV) 为 89%,指示效果十分显著。同时小型独立验证实验的结果显示,再次验证了这几组生物标志物在不同类型的病例中确有显著差异。如果将发现的ex-miRNA生物标志物与已建立的 sFlt1:PlGF 蛋白生物标志物相结合,其效果更优(灵敏性为 89.4%,特异性为 91.3%,PPV 为 95.5%,NPV 为 80.8%)。期刊:SCIENCE ADVANCES(IF 15.4)发表年份:2023物种:人(Human)文库类型:120-135 非编码小RNA文库(Small non-coding RNA)文库富集和精准回收:Sage Science公司Pippin Prep全自动DNA电泳回收仪测序:Illumina HiSeq 4000二代测序仪细胞外miRNA(ex-miRNA)测序流程:1)Norgen的血浆/血清和外泌体 RNA 纯化试剂盒分离样品 ex-RNA;2)Agilent 的RNA 6000 Pico Kit对分离的ex-RNA 进行质量分析;3)NEB的Next Multiplex Small RNA Library Prep Set试剂盒构建miRNA-seq文库;4)Zymo Research的 DNA Clean & Concentrator-5试剂盒进行文库纯化,并对纯化的文库进行质量分析;5)Sage Science的Pippin Prep及配套3%琼脂糖凝胶试剂盒进行文库片段回收,回收范围设置为120-135bp,只保留miRNA-seq文库,彻底去除其他杂带;6)在Illumina的HiSeq 4000仪器上测序。原文Robert Morey et al. ,Discovery and verification of extracellular microRNA biomarkers for diagnostic and prognostic assessment of preeclampsia at triage.Sci. Adv.9,eadg7545(2023).美国Sage Science是全球领先的全自动DNA脉冲场电泳回收仪的生产厂家,拥有美国技术专利,各个型号产品可以高效完成不同长度范围的DNA片段的精准回收,广泛用于二代测序、三代测序以及多种分子生物学相关领域。环亚生物科技有限公司作为美国Sage Science公司在中国区的独家代理商,自2011年以来将Sage Science的产品线引入国内,一直为国内用户提供专业的全自动核酸片段回收仪的安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。环亚生物科技有限公司将一如既往的支持越来越多的Sage Science用户。▼更多 Pippin Prep 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.08.05

zenCELL owl活细胞动态成像及分析系统用于乳腺癌治疗的新靶点研究

乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,也是导致女性死亡率最高的癌症类型,发病率逐年上升。尽管已有多种治疗方法,但相关治疗和预后改善仍面临巨大挑战,如亚型三阴性乳腺癌(Triple-Negative Breast Cancer,TNBC),因缺乏明确的治疗靶点而较难治疗,且预后极差,被称为“乳腺癌之王”。乳腺癌具有分子异质性,即不同的亚型对治疗各不相同,因此,乳腺癌疗法需要寻求新的治疗策略和新的治疗靶点。已有研究表明,Flap核酸内切酶1(Flap Endonuclease 1,FEN1)参与DNA的损伤修复和复制,有效维持基因组稳定性。然而,FEN1的过表达会引起基因组突变,与多种癌症的发展和治疗耐受性相关,暗示了FEN1有可能成为新的治疗靶点。基于此,德国埃尔朗根大学的研究团队采用FEN1抑制剂(FEN1-IN-4)联合电离辐射(Ionizing Radiation,IR),对乳腺癌细胞给药实验,评估FEN1抑制剂(FEN1-IN-4)作为乳腺癌新型靶向治疗方法的有效性。研究成果以“FEN1 Inhibition as a Potential Novel Targeted Therapy against Breast Cancer and the Prognostic Relevance of FEN1”为题于2024年2月发表在《International Journal of Molecular Sciences》上。本研究采用德国innoME公司的zenCELL owl活细胞动态成像及分析系统,动态监测乳腺癌细胞系(T-47D、MCF7、BT-474、SK-BR-3、BT-20、MDA-MB-468、MDA-MB-231、BT-549,其中,MDA-MB-468、MDA-MB-231、BT-549为TNBC细胞系)、非恶性乳腺上皮细胞(MCF 10A)和健康皮肤成纤维细胞(SBLF-9)在FEN1-IN-4、IR单独或联合给药下的变化过程,获取相应的图片、生长曲线等数据结果,并据此计算倍增时间(图A)。图1 FEN1-IN-4、IR 单独和两者联合给药的zenCELL Owl监测结果(A)不同细胞系的生长曲线,并据此计算的倍增时间(B)MDA-MB-468的代表性图片:FEN1-IN-4、IR单独和联合给药后的后72 h、96 h、120 h和148 h 细胞生长图片zenCELL Owl的监测结果显示,不同处理后的细胞生长曲线明显不同,也反映在相应增加的倍增时间上。IR或FEN1-IN-4单独给药T-47D、MCF7、MDA-MB-468 和BT-20细胞系的生长曲线具有相似的延缓作用,联合给药下,这种延缓效果更为显著。类似的,相比于单独使用IR,联合给药下有4种细胞系的倍增时间显著增加, MCF 10A增加了56小时、BT-20增加了37小时、MCF7增加了33小时、T-47D增加了22小时。IR可减缓BT-474和MDA-MB-231的增殖速率。成纤维细胞显示出多样化的生长模式,所有给药条件下尤其是包含FEN1-IN-4时,倍增时间增加最为明显。此外,研究者还结合了免疫荧光显微镜、克隆形成实验、流式细胞术等技术综合评估FEN1-IN-4和IR对细胞的影响。结果表明,FEN1-IN-4和IR的单独或联合给药对癌细胞的生长曲线和倍增时间有显著影响。相对于单独给药,联合给药对癌细胞生长的抑制作用更为明显,引起倍增时间显著延长。这表明FEN1可能是乳腺癌治疗的一个新生物标志物,FEN1-IN-4则是一种具有潜力的新型靶向治疗药物,为乳腺癌的靶向治疗提供了新的策略。德国InnoME公司自主研发和生产的zenCELL owl活细胞动态成像及分析系统,基于非标记、非侵入方法,原位记录细胞实时生长和定量的分析数据。zenCELL owl体积小巧,耐温耐湿,可在细胞培养箱内长时间连续工作;通过24个显微成像镜头,对24个视野进行连续的动态监测和图像获取。zenCELL owl为用户提供高质量图像、视频、统计学曲线和定量数据,实现细胞增殖/增殖抑制、细胞培养质控/培养优化、迁移/侵袭等诸多活细胞动态过程的监测。环亚生物,生命科学产品全国性代理商,不断把国外顶级的创新产品引入中国。环亚生物具备完善的公司运营、产品管理、营销、售前技术支持和售后维修体系。环亚生物作为zenCELL owl大中华区独家代理商,负责zenCELL owl产品大中华区的营销和售后支持。更多资讯请访问文献全文链接:https://doi.org/10.3390/ijms25042110▼更多 zenCELL owl 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.08.02

Arrayjet生物芯片点样仪助力植物同土壤中盐度相关性研究

土壤盐碱化是一个日益严重的环境问题,过量的盐分损害土壤的养分吸收、破坏渗透平衡,对植物生长、发育和开花产生负面影响,导致作物产量下降。 为应对自身或外部刺激,植物会通过细胞壁修饰(包括木质素和木栓素沉积的增加,以及在较老的组织中形成次级细胞壁)和改变根的生长方向,以减少盐分的摄入。在此过程中还涉及到纤维素合成、纤维素微纤维定位、半乳聚糖积累以及合成阿拉伯糖等生物过程。已有研究表明,延伸蛋白(extensin)糖基化是这个过程中的关键因素,其中涉及到4种糖基化蛋白(HPAT1-3、RRA1-3、XEG113和ExAD),但具体的参与过程仍缺乏了解。荷兰瓦赫宁根大学植物生理学实验室的研究团队于2024年在《Plant》杂志发表了文章《Arabinosylation of cell wall extensin is required for the directional response to salinity in roots》。在该研究中,作者通过研究野生型和ExAD基因突变型拟南芥样本的果胶和半纤维素提取物,证实ExAD 基因是调节根定向生长所必需的,揭示了 ExAD 介导的阿拉伯糖基化在根对盐胁迫的反应中起着至关重要的作用。实验方法:1.盐诱导倾斜测定法(salt-induced tilting assay ,SITA):将拟南芥培育发芽,并在响应的时间点移植到不同类型的培养基(无NaCl 、100mM NaCl 、100mM KCl 和 200mM 山梨糖醇等)中,并将植株逆时针旋转90度,然后持续动态拍照,观察植物根部的生长弯曲过程(图1)。根尖角度(root tip direction,RTD)表示平行于根尖生长方向的矢量与垂直重力矢量之间的角度,表示根尖弯曲的量。图1 SITA的实验设置:将发芽的幼苗转移到含有不同处理的1/2 MS琼脂平板中,同时将平板逆时针旋转90度;在延时系统中追踪根系动态生长响应,成像频率为每块板每 20 分钟 1 张图像2.微阵列聚合物分析(Comprehensive Microarray Polymer Profiling,CoMPP):将样本拟南芥幼苗快速冻干。继而纯化,通过Arrayjet公司的Marathon(新型号Mecury)生物芯片点样仪点印在硝酸纤维素膜上,随后同特异性抗体杂交,生物芯片扫描仪扫描并进行结果分析。实验结果:1.野生型拟南芥在100mM NaCl 培养基中表现出明显的生长弯曲。与对照组、100mM KCl 和 200nM 山梨糖醇组相比,在100mM NaCl 培养基中生长的拟南芥的根尖RTD的变化量显著降低,说明高浓度NaCl 的确可以影响植物根尖生长方向(图2)。图2 在不同处理(对照组、100 mMNaCl、100mM KCl 和 200mM 山梨糖醇)下,在 4 日龄野生型幼苗根尖不同时间点延时拍照,y轴表示每 20 分钟根尖的RTD 值2.相对于野生型,ExAD突变型拟南芥在NaCl溶液中根尖RTD值的变化量显著降低,说明ExAD突变导致根尖回避高盐环境的能力减弱。3.相较于野生型,ExAD突变型样本在冻干后的提取物中NaCl含量显著升高,说明ExAD基因突变导致植株摄取了过量的NaCl。4.CoMPP实验结果显示,野生型植株的JIM11杂交信号显著高于ExAD突变型,而JIM11是延伸蛋白糖基化的重要指征,说明ExAD突变型植株的延伸蛋白缺乏糖基化,引起根尖遇到高盐溶液后弯曲能力降低。实验结论:ExAD引起延伸蛋白糖基化,参与盐胁迫条件下的根细胞壁修饰,该过程是调节根尖定向生长所必需的。综合以上结果说明 ExAD 介导的阿拉伯糖基化在根对盐胁迫的反应中起着至关重要的作用。原文链接:https://doi.org/10.1093/plcell/koae135Arrayjet位于英国爱丁堡,专注于提供生物芯片应用领域的解决方案及服务。自2000年公司成立即致力于开发新型生物样品喷点方案–喷墨式液体处理平台,该系统于2006年上市,目前用户遍布全球27个国家。Mercury系列产品采用独特的飞行喷墨点样技术实现行业第一的快速、非接触式微量液体处理。同时上万种不同样品可以进行快速点样,专利的上样模块配合高通量的点样喷头保障您的点样操作快速、无污染,更低的上样体积可有效减少样品损失,使您的珍贵样品物尽其用。▼更多 Arrayjet 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.08.02

InnoScan生物芯片扫描仪助力缺血性中风的神经功能研究

缺血性中风即缺血性脑卒中,是导致老年人残疾和死亡的主要原因,其发病率逐年上升。尽管静脉溶栓和动脉血栓切除是常用的治疗方法,但仅限于一小部分患者,高达95%的中风患者由于时间的限制和禁忌症无法接受这类治疗。因此,中风后的神经功能恢复及改善预后变得至关重要。缺血后神经功能的恢复与多种因素密切相关,如血管生成、神经发生和突触可塑性改变等。当脑供血受阻时,机体为了防止其受到损伤,会增强受损部位的氧气和营养供应。研究表明,中风患者梗死部位周围新生血管的密度越大,存活率越高,血管生成是修复大脑受损的关键因素。文章于2024年1月发表在《Chinese Medicine》杂志,作者来自首都医科大学北京脑疾病研究所脑卒中研究中心。中医理论认为治疗缺血性中风应该从改善血瘀、气虚和郁结入手,核心症候包括瘀血证、痰证、阴虚、气虚、肝亢等。 当代中医研究确定了几种具有神经保护作用的有效提取物,包括活性AMK成分白术内酯 I (Atr I)和白术内酯 III (Atr III)以及芍药甙(Pae),已经显示出比较好的药理学作用,包括神经保护,抗炎,抗氧化,抗过敏和抗癌特性。本研究旨在探索Atr I,Atr III和Pae联合使用是否可以促进中风后大脑血管的形成,从而改善缺血性中风神经功能的恢复。在文中,作者使用雄性C57BL/6小鼠的大脑动脉闭塞模型 (MCAO)造模,每天灌胃给药(Atr I,Atr III和Pae),评估药物对脑保护和血管生成的影响。细胞免疫荧光实验发现中药化合物可以促进细胞增殖,细胞划痕实验表明Atr I、Atr III和Pae联合使用可促进细胞增殖和细胞迁移,并刺激延迟管形成。同时,活体体内实验发现化合物可明显减小小鼠脑部的梗死面积,并降低神经功能障碍。 随后为了研究化合物促进血管生成的分子机制,通过血管生成抗体阵列并联合法国Innopsys公司的生物芯片扫描仪InnoScan 300(现新型号InnoScan 710),比较MCAO模型组和MCAO模型组+化合物治疗组的血管生成相关蛋白的表达水平,在23个靶蛋白中,发现有7个蛋白存在显著的表达差异,具体见图1。图1.Sham组、MCAO组与MCAO+化合物组蛋白表达水平的差异。综合以上结果,作者发现活性AMK成分白术内酯 I (Atr I)和白术内酯 III (Atr III)以及芍药甙(Pae)的联合应用,可对长期缺血性中风有显著的改善作用,这可能是通过增加IGF-2通路的激活来促进血管在缺血性脑组织中的生成。原文链接:https://doi.org/10.1186/s13020-023-00872-zInnopsys 成立于1999年。总部位于法国,一直致力于生物医学领域相关仪器和软件的自主研发和生产。Innoscan系列扫描仪,采用先进的共聚焦PMT检测器和多激光扫描光路,可以同时进行多通道荧光检测。不仅有效降低了荧光光漂白现象以及信号损失,还可以有效缩短扫描时间。在基因组和蛋白组表达,基因突变,SNP检测,CGH,细菌病毒检测,肿瘤特异性标志筛查,病理组织筛查等方面都有非常广泛的应用。环亚生物,生命科学产品全国性代理商,具备完善的公司运营、产品管理、营销、售前技术支持和售后维修体系。环亚生物作为Innoscan大中华区代理商,负责Innoscan产品大中华区的营销和售后支持。▼更多 InnoScan 系列 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.07.17

Moxi系统助力CAR T细胞在实体瘤微环境中的功能障碍研究

CAR T细胞治疗(Chimeric Antigen Receptor T-Cell Immunotherapy),即嵌合抗原受体T细胞免疫疗法,是一种有效治疗肿瘤的靶向疗法。该疗法采用基因工程技术,将来自人体的T细胞激活,装上定位导航装置CAR,将其改造为专门识别体内肿瘤细胞的靶向药物,通过免疫作用释放大量效应因子以杀灭肿瘤细胞,达到治疗恶性肿瘤的目的。CAR T细胞治疗对血液恶性肿瘤成效显著,但对实体瘤效果不佳,主要原因是CAR T细胞在实体瘤微环境中极易耗竭。目前,对介导CAR T细胞功能丧失的机制知之甚少。来自宾夕法尼亚大学的Carl H. June、Regina M. Young和Shelley L. Berger等研究人员,对此进行了深入研究,并为改善CAR T细胞治疗实体瘤提供了新策略。相关成果以“An NK-like CAR T cell transition in CAR T cell dysfunction”为题,发表在顶级期刊《cell》杂志上。研究者构建了一种体外模型模拟T细胞耗竭的特征。在该模型中,抗间皮素CAR(M5CAR)T细胞由于长期暴露于肿瘤抗原(CAE,continuous antigen exposure)而被驱动到功能失调,继而通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)、ATAC测序、质谱、流式细胞术、细胞分选、细胞毒性测定等多种技术手段,研究CAE对CAR T细胞的功效、表面表达和表型的影响,确定了CAR T功能障碍的多种机制。研究发现CAR T细胞功能障碍与CAR T细胞向自然杀伤样(NK-like)CAR T细胞的转变有关。这种转变涉及到CD8+ T细胞的转变,并且与CAR表达的失调有关。同时本研究还确定了一些CAR T细胞耗竭的关键调控因子,包括SOX4和ID3。通过基因编辑技术下调这些转录因子的表达,可以预防或延迟CAR T细胞功能障碍,从而提高CAR T细胞治疗实体瘤的疗效。总之,文章构建的泛癌症功能障碍这一强大体外模型提供了一个深入的研究视角,不仅揭示了CAR T细胞在治疗实体瘤中的可塑性,还为改善CAR T细胞治疗提供了可能的解决方案。本研究中,作者采用Orflo Technologies公司提供的Moxi Flow 系统(升级后新型号为Moxi V),在进行高通量细胞毒性测定之前,对经CAE后的CD8+ M5CAR T细胞进行计数,并评估其活性和细胞存活率。Moxi Flow系统提供了细胞数量和活性的重要数据,确保了实验中使用的T细胞具有高度活性和存活率,对于后续实验,包括评估CAR T细胞的细胞毒性和其他效应功能至关重要。Moxi 系列产品采用库尔特原理进行细胞计数和粒径测量,其中高端型号配备流式荧光检测通道,可进行细胞活率、细胞凋亡、转染效率、活性氧簇、线粒体膜电位等常规流式检测。仪器设计小巧轻便,无需预热,开机即用,预设程序,触屏操控,运行后10秒即可给出测试结果,使用后也无需清洁维护。无论是经验丰富的实验高手,还是初试身手的实验小白,Moxi系统都可以助您轻松完成实验。环亚生物,生命科学产品全国性代理商,不断把国外顶级的创新产品引入中国。环亚生物具备完善的公司运营、产品管理、营销、售前技术支持和售后维修体系。环亚生物作为Orflo Technologies大中华区独家代理商,负责Orflo Technologies产品大中华区的营销和售后支持。更多资讯请访问文献全文链接:https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.11.016▼更多 Moxi系列 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.07.17

OCUS切片扫描仪助力慢性酒精暴露对小鼠空间记忆及海马区信号通路影响的研究

酒精作为一种广泛使用的精神活性物质,其严重滥用已成为全球共同面临的重大公共卫生难题。诸多研究表明,长期饮酒与认知功能下降,特别是学习和记忆能力的损害密切相关。这些认知障碍与大脑中海马区的结构和功能变化有着直接联系。海马区是与学习和记忆密切相关的大脑区域,而脑源性神经营养因子(Brain-derived neurotrophic factor,BDNF)及其信号通路在调节海马区的突触可塑性、神经元存活和记忆形成扮演着关键角色。来自徐州医科大学法医学系蔡红星教授团队于2023年5月在《Heliyon》上发表了题为“The effect of chronic alcohol exposure on spatial memory and BDNF–TrkB- PLCγ1 signaling in the hippocampus of male and female mice”,文章根据BDNF在神经可塑性和记忆形成的重要性,以及酒精滥用对这些过程可能产生的负面影响,着重探讨了慢性酒精暴露对雄性和雌性小鼠空间记忆能力的影响,以及在这一过程中海马区内BDNF、其受体原肌球蛋白相关激酶B(Tropomyosin-related kinase B,TrkB)和下游信号分子磷脂酶Cγ1(Phospholipase Cγ1,PL Cγ1),即BDNF- TrkB- PL Cγ1信号通路的表达变化。本研究中,酒精暴露后两性小鼠的肝组织H&E石蜡切片和海马区IHC石蜡切片,均由芬兰Grundium公司的Ocus便携式数字病理切片显微扫描成像系统完成。图1 间歇性20%酒精摄入的小鼠肝组织中H&E染色图片(左雄性小鼠,右雌性小鼠)研究人员发现,与水系对照组相比,间歇性20%酒精摄入后雄性和雌性小鼠的肝脏组织均未发生明显改变(如图1所示)。图2 长期饮酒后雄性小鼠海马区IHC染色图片(BDNF、TrkB、p-PLCγ1、PLCγ1)图3 长期饮酒后雌性小鼠海马区IHC染色图片(BDNF、TrkB、p-PLCγ1、PLCγ1)结合Western blot和两性小鼠海马区IHC(图2、3)的实验结果,与水系对照组相比,可以发现长期饮酒后,酒精组雄性小鼠海马区BDNF表达明显上升,而雌性小鼠BDNF的表达则有所下降,TrkB和PLCγ1的表达在两性小鼠中没有显著变化。进一步研究表明,慢性酒精暴露会引起小鼠空间记忆损害,并在海马区BDNF-TrkB-PLCγ1信号通路的表达上存在性别差异。对酒精如何影响两性小鼠空间记忆和相关神经生物学机制,研究结果提出了更深入的见解,为未来酒精引起记忆损害的预防和治疗策略提供了科学依据。芬兰Grundium公司自主研发和生产了全球领先的便携式数字病理扫描显微成像系统--Ocus。设备具有双层可移动载物台,根据自动圈选的区域,结合专利的软件算法采取螺旋路径等非直线扫描模式,快速完成扫描。Ocus每个视野独立自动对焦,可有效避免切片厚薄不均导致的图像问题,且采集的图片自动无缝拼接生成超高清图片,不遗漏任何有价值的信息。Ocus的访问和操作均采用浏览器模式,通过有线、无线或自带热点的链接,无需安装额外的软件或app,通过手机、Pad或电脑即可实现仪器的访问和操控。环亚生物,生命科学产品全国性代理商,不断把国外顶级的创新产品引入国内。APG BIO具备完善的公司运营、产品管理、营销、售前技术支持和售后维修体系。APG BIO作为Grundium大中华区独家代理商,负责Grundium产品大中华区的营销和售后支持。更多资讯请访问文献全文链接:https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2023.e16660▼更多 OCUS 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.07.16

文献速递|Blue Pippin全自动DNA脉冲场电泳回收仪用于单分子蛋白组学识别技术开发

【Nature Nanotechnology】Single-molecule mechanical fingerprinting with DNA nanoswitch calipers借助DNA纳米开关卡尺绘制单分子蛋白组学的机制“指纹”从微量或痕量样本中鉴定生物分子是生物技术领域的一个长期目标。近些年,测序技术的迅速发展大大促进了DNA分析对基础研究和临床实践的推动。在蛋白质层面,其结构、功能相对复杂及无法实现体外扩增,尽管质谱法和质谱流式细胞技术等方法取得了一定进展,但是单分子蛋白质鉴定仍然面临挑战 。为此,来自哈佛大学威斯研究所(Wyss Institute at Harvard University)、哈佛医学院布拉瓦特尼克研究所(Blavatnik Institute at Harvard Medical School)和波士顿儿童医院(Boston Children 's Hospital)的科研人员,将DNA纳米技术与单分子力谱相结合,构建了一种DNA纳米开关卡尺(DNA Nanoswitch Caliper ,DNC),能够以原子分辨率测量单分子蛋白上的多个坐标。基于光镊技术,可以进行DNA和肽的绝对距离测量,精度可达埃米级。同时使用多重磁镊子,进行混合蛋白样本中相对丰度的量化检测。研究小组通过测量DNA标记残基之间的距离,对合成肽和天然肽进行了单分子指纹分析,并在异质群体中发现了不同蛋白修饰之间的区别。DNA纳米开关卡尺是一种功能强大且易于使用的工具,将在单分子蛋白质组学等领域实现新的应用。期刊:Nature Nanotechnology发表年份:2021年样本:pET-26b (+) 质粒应用:PCR产物纯化图1. DNA纳米开关卡尺(DNC)绘制单分子指纹图谱示意图DNA纳米开关卡尺(DNC)衍生于DNA纳米开关技术,其本质是一条DNA单链。在DNA单链上存在多个分子 “手柄”。当这些手柄中的两个相互结合时,会在DNA单链中形成闭环,且链的总长度缩短。当施加力量将手柄拉开时,DNA单链就会延伸恢复其原来的长度。链在开环和闭环状态下的长度差异反映了环的大小,进而反映了手柄之间的距离(图1)。在此基础上,通过将手柄设计成可以与生物大分子结合的单链,进而将该技术推进至生物大分子检测。手柄可以有效地将分子“夹在”中间,类似游标卡尺,通过测量DNA纳米开关在开环和闭环状态下的总长度差异,有效地测量生物大分子的大小,形成独特的分子指纹。其中,DNA纳米开关卡尺是通过连接两个修饰的DNA构建体而产生的(图2)。一种DNA构建体由pET-26b(+)质粒的2820bp区域PCR扩增制备,另一种由环状寡核苷酸、5’-地高辛修饰的寡核苷酸(DNC1)和其他链(DNC2和DNC3),进行退火制备。在构建完成后,使用Blue Pippin全自动DNA电泳回收仪进行目标片段(约3kb)的精准回收,获得单一目标DNA纳米开关卡尺(DNC),无杂带,确保后续DNC指纹功能的正常发挥。图2. DNA纳米开关卡尺(DNC)构建流程图文中首先在单链DNA(ssDNA)分子上测试了DNC技术,证实DNC的开环和闭环状态之间的距离变化与目标分子的长度直接相关。这些长度变化可以用埃米级精度(比DNA双螺旋的宽度小10倍)来测量,从而能够识别小到一个核苷酸的长度变化。继而将研究重点转移到蛋白质上,通过已知序列的合成肽,发现手柄之间的距离都与肽中氨基酸长度的预期距离相匹配。同时检测一种名称为NOXA BH3的天然线性化肽时,也得到了类似的结果。更进一步研究表明,通过用一个磁镊子系统取代光学珠,能够对多个不同的肽进行平行测量,并确定不同分子的相对浓度。DNC提供了一种强大的方法用于表征纳米级复合物中的距离和几何形状,对蛋白质组学、纳米技术、结构生物学和药物发现等多个领域有很大的应用潜力。原文Shrestha, Prakash, et al. "Single-molecule mechanical fingerprinting with DNA nanoswitch calipers." Nature nanotechnology 16.12 (2021): 1362-1370.美国Sage Science是全球领先的全自动DNA脉冲场电泳回收仪的生产厂家,拥有美国技术专利,各个型号产品可以高效完成不同长度范围的DNA片段的精准回收,广泛用于二代测序、三代测序以及多种分子生物学相关领域。环亚生物科技有限公司作为美国Sage Science公司在中国区的独家代理商,自2011年以来将Sage Science的产品线引入国内,一直为国内用户提供专业的全自动核酸片段回收仪的安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。环亚生物科技有限公司将一如既往的支持越来越多的Sage Science用户。▼更多 Blue Pippin 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.07.16

INDEC荧光小动物活体成像系统助力小鼠前列腺癌模型中激动性EphA2配体研究

前列腺癌因其耐药性成为男性癌症死亡的主要诱因,在2020年美国有大约19万新病例和3万死亡病例。前列腺癌最初依赖雄激素信号轴抑制剂和化疗等治疗方法,但仍会发展为去势抵抗性前列腺癌(CRPC)。EphA2是一种酪氨酸激酶受体,高度表达于多种实体肿瘤中。在前列腺癌转移中,EphA2的表达与恶性程度相关,并且与肿瘤细胞的迁移和转移有关。因此,EphA2在前列腺癌转移中起着重要作用,针对EphA2的治疗可能成为创新的抗转移治疗策略之一。2020年来自美国加州大学研究团队在《Cancers》上发表文章“Prostate Cancer Metastases Are Strongly Inhibited by Agonistic Epha2 Ligands in an Orthotopic Mouse Model”,表明,EphA2激动剂可以有效抑制前列腺癌细胞的迁移和转移。该团队利用GFP标记的肿瘤细胞系构建小鼠前列腺癌动物模型,激活EphA2受体的配体,可以强烈抑制前列腺癌的转移。实验方法中,基于小鼠前列腺癌模型,研究EphA2激动剂(包括合成配体135H12和天然配体ephrinA1-Fc)对前列腺癌细胞迁移和肿瘤转移的影响。通过Western blot、细胞迁移实验、荧光小动物活体成像实验(美国INDEC Biosystems公司FluorVivo荧光小动物活体成像系统)和免疫组化等方法评估激动剂的效果。将GFP荧光蛋白标记的前列腺癌细胞(PC-3-GFP)以2.0 × 106个细胞的浓度(150uL)注射到裸鼠侧腹,构建小鼠前列腺癌原位移植动物模型。随后切取皮下肿瘤,检查并去除严重坏死或疑似非绿色荧光蛋白肿瘤组织,并处理为1 mm3的PC-3-GFP肿瘤小块。采用外科原位植入术(SOI),在20只裸鼠的前列腺上每只植入2片1 mm3的肿瘤小块。通过FluorVivo荧光小动物活体成像系统进行示踪成像,观察体内肿瘤在ephrinA1-Fc、135H12分别处理的实验组、无处理的对照组生长情况。在监测的第7天,FluorVivo荧光小动物活体成像系统获取图像中,实验组存在显著差异(图4c,d)。尸检后,对胸部和腹部进行各器官转移的影像学检查。图像显示,在用ephrinA1-Fc或135H12治疗的实验组中,转移灶明显减少(图4c),并从每组代表性小鼠的代表性图像中看出(图4d)。Fig4. 用ephrinA1-Fc或135H12治疗PC-3-GFP细胞原位前列腺癌小鼠模型(每个治疗组n = 5只)。图(a-c)分别为体重、肿瘤体积和与转移相关的平均荧光强度;图(d)各组小鼠第7天的代表性图像:对照组(使用溶剂处理),实验组ephrinA1-Fc处理,实验组135H12处理研究发现,在前列腺癌小鼠模型中,EphA2激动剂ephrinA1-Fc或135H12的处理显著减少了肿瘤的转移。EphA2是一个重要的治疗靶点,其激动剂能够抑制前列腺癌的转移,进一步开发和优化EphA2激动剂,可作为治疗EphA2驱动的侵袭性转移肿瘤(包括前列腺癌、胰腺癌和乳腺癌)的潜在治疗策略。INDEC BioSystems荧光小动物活体成像系统美国INDEC BioSystems公司FluorVivo系列是专注于荧光检测的小动物活体成像系统,其产品线提供了一套从个体水平到细胞水平的体内成像的解决方案。产品特点:1.全波长范围内用户定制通道,通道数量1或3可选。2.同时成像GFP和RFP。3.毫秒级快速成像,实时动态监测,可生成Video。4.实时光谱分离,去除背景荧光,有效提升信噪比。5.配备脚踏板成像装置,方便易用,可开门操作。6.标配FluorVivo成像与分析软件。环亚生物,生命科学产品全国性代理商,不断把国外顶级的创新产品引入中国。环亚生物具备完善的公司运营、产品管理、营销、售前技术支持和售后维修体系。作为INDEC BioSystems中国地区独家代理,环亚生物科技有限公司全权负责INDEC BioSystems产品在中国地区的推广、销售,为广大用户提供专业的技术咨询和产品服务。文献全文网页链接:https://www.mdpi.com/2072-6694/12/10/2854▼更多 INDEC 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.07.16

文献速递|Origins高分辨率潜水电泳仪助力罕见肿瘤患者诊疗 -------微卫星分析

文献速递|Origins高分辨率潜水电泳仪助力罕见肿瘤患者诊疗-------微卫星分析(microsatellite analysis)【SN Comprehensive Clinical Medicine】Intracranial Intracerebral Schwannoma: a Case Report and Review of the Literature案例报告:颅内脑神经鞘瘤颅内神经鞘瘤相对罕见,约占所有颅内肿瘤的8%,而脑实质内神经鞘瘤则是一种更为罕见的实体瘤,约占全部颅内神经鞘癌的1%。在回顾相关文献后,本文讨论了一名74岁女性的诊疗过程。患者有3周的头晕和恶心病史,且磁共振成像显示右侧颞部肿块伴局灶性水肿,结合组织病理学检查和免疫组织化学等辅助诊断,最终确诊为胶质母细胞瘤或转移瘤,对其进行整体全切,且患者术后恢复顺利。此外,研究人员有必要进一步分析该案例,以增强罕对见肿瘤的了解,用以改善患者的预后。期刊:SN Comprehensive Clinical Medicine发表年份:2023年样本:脑实质内神经鞘瘤患者应用:微卫星分析(microsatellite analysis)文中使用Origins高分辨率潜水电泳仪结合Spreadex gel EL800预制胶,进行22号染色体上4个微卫星位点检测,结果显示4个微卫星标记中至少有3个(D22S445、D22S684、D22S268)在肿瘤组织中存在杂合等位基因缺失(见下图)。基于PCR的微卫星分析结果图起源于Schwann细胞的神经鞘瘤通常会形成外周神经的髓鞘,见于颅神经和外周神经。然而,脑实质内神经鞘瘤是罕见的,故而引起了人们对其起源的猜测。已有各种理论对其进行解释,分为发育理论和非发育理论。发育理论认为,扭曲的胚胎发生是脑实质中Schwann细胞异常灶的来源,这可能涉及到发育的间充质基底细胞转化为Schwann细胞,多电位间充质因子分化,神经嵴细胞异位迁移,或有髓神经纤维错位等多方因素。相反,非发育理论认为,脑内Schwann细胞起源于实质小动脉的血管周围神经丛。神经鞘瘤患者常携带编码肿瘤抑制蛋白merlin的NF2基因常染色体显性突变。该蛋白的基因位于染色体22q.12.2上,靠近微卫星标记D22S268。通过微卫星分析和FISH,证明案例患者的肿瘤中存在22号染色体的体细胞杂合缺失,可能导致肿瘤的发展。总之,脑实质内神经鞘瘤是神经鞘瘤的一种罕见变体,以其脑内位置和非典型表现为特征。这些肿瘤的起源仍处于研究阶段,精准诊断需结合组织病理学特征和其他辅助诊断技术。虽然手术切除瘤体是首选的治疗方法,通常也会带来良好预后。然而,临床科研人员更需要进一步阐明这种罕见实体瘤的潜在机制,并寻找最佳治疗策略。原文:Henia, Mohamed, et al. "Intracranial Intracerebral Schwannoma: a Case Report and Review of the Literature." SN Comprehensive Clinical Medicine 5.1 (2023): 289.Origins高分辨率潜水电泳来自瑞士Elchrom Scientific公司,集成了整体的温度控制系统,即通过半导体元件和自动温度控制系统,精准控制电泳过程中的温度。同时整合循环泵系统,确保整个电泳区域温度和pH值恒定,形成均匀的、线性电场,这使得该设备具有高分辨率和高重复性,可广泛用于植物、微生物物种的分群和鉴定,以及疾病相关基因的研究等。环亚生物科技有限公司为该产品在中国区的独家代理商,自2011年成立以来,诚挚为国内用户提供专业安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,期待您的来电垂询。▼更多 Origins 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.07.03

Biofluidix 压电式纳升分液装置Pipejet用于透皮给药系统

近十年来,溶解微针阵列 (Dissolving microneedle arrays,dMNAs)用于透皮接种疫苗已取得极大发展。与传统的肌肉注射和皮下注射相比,dMNAs可诱导相似或更高水平的免疫反应,同时溶解在微针中的抗原疫苗更稳定,无需冷链运输,可自行完成接种,减少医疗系统压力。目前,dMNAs主要通过抗原和构成微针的聚合物混合,浇筑模型后离心的方式制备。然而,该制备过程中的微针阵列背板中,存在大量的抗原残留,成本的增加限制了dMNAs技术的应用。荷兰莱顿大学莱顿药物研究中心的一个研究团队于2021年在《International Journal of Pharmaceutics》杂志发表了一篇名为《Engineering of an automated nano-droplet dispensing system for fabrication of antigen-loaded dissolving microneedle arrays》的文章。在该研究中,研究团队使用自动纳升分液技术开发了一种新的dMNA制备工艺,不但保留了原有dMNA的优势,而且极大提升了抗原使用效率,大大降低了透皮接种疫苗成本。实验流程与结果1. 微针聚合物材料筛选以聚乙烯吡咯烷酮/聚乙二醇(PVP/PEG)、聚乙烯醇(PVA)、透明质酸 (HA)、羧甲基纤维素 (CMC)和明胶作为微针聚合物的候选材料,利用传统离心法制备dMNA,根据制备dMNA的热稳定性、脆性、粘度等因素筛选最为合适的聚合物候选材料。测试结果表明,除部分配方不适合制备微针(如 3.25% (w/v)的 PVP/PEG会导致微针过脆而断裂,50% (w/v) PVA的粘度太高无法浇筑在模具上)外,其余均进入后续实验。2. 离体人体皮肤的渗透实验和溶解实验利用离体人体皮肤,测试上述不同配方制备的dMNAs穿透效果和溶解效果。渗透实验结果表明,所有选定的dMNAs在人体腹部皮肤中都显示出优异的渗透效率,即使穿透效果最低的40% (w/v) 明胶 dMNAs,其穿透效果也达到了91.7,%,表明一个9微针的阵列中至少有8个针可以穿透皮肤。溶解实验结果表明,在透皮5分钟后,不同材质的dMNAs溶解效率有较大差别,其中溶解效果最好的是6.5% (w/v) PVP/PEG。溶解的越充分,疫苗利用率越高,因此选用该材料作为后续微针制备的标准配方。3. 利用纳升分液技术制备微针在选定聚合物候选材料后,研究团队搭建了一套全自动纳米分液装置,其核心部件——德国Biofluidix公司的Pipejet全自动纳升分液器。Pipejet可以转移小至2nL的液滴,将其加入14nl的微针腔体内。该系统以Pipejet为核心,配套质控相机、真空室、XYZ移动平台等设备搭建完成。(图1)图1 用于 dMNAs 制备的自动系统示意图(a)Pipejet纳升分液器,(b)点样器支架,(c)数码显微镜相机,(d)铝棒,(e)线性平台,(f)真空室,(g)真空泵,(h) 将PDMS模具放置在真空室的顶部(分配器和载物台均由软件Python操作)微针制备过程:1)将聚合物溶液浇筑在构建好的微针模具中,制成具有空腔的微针;2)将代替抗原的荧光标记卵清蛋白通过Pipejet加入微针空腔;3)利用离心和负压排除空气,制成微针。4. 效果测试离体人体的皮肤测试效果表明,新方法制备的微针在穿透率和溶解效率上,与已有方法即全程离心法制备的微针相似(图2)。但是,新方法的抗原只存在在微针处,且2nl抗原就可制备一个dMNAs,对比全程离心法需要90ul抗原,大大节省了抗原成本。图2.荧光标记的卵清蛋白负载微针的显微镜图像(a) 在皮肤穿透前含有 AF647 标记卵清蛋白的微针,(b) 100% 的皮肤穿透效率 (n = 4), 表明微针具有足够的锋利度和机械强度,卵清蛋白的成功递送可从(c)穿透皮肤的荧光中显示,(d) 5 分钟和 (e) 15 分钟溶解后剩余微针的明场显微镜图像,f)溶解15分钟后剩余微针的荧光显微镜图像综上所述,纳升分液自动化制备的微针,其效果与传统离心法相似,但大大降低了抗原损耗和成本,可进入更大范围的工业推广。更多资讯请访问文献全文链接:https://doi.org/10.1016/j.ijpharm.2021.120473Biofluidix是全球领先的研发制造高精度生物芯片点样和分液系统的生产厂家,不仅有体系化的点样分液平台,也提供模块化的皮升、纳升和微升分液装置,能够兼容第三方设备,实现精准点样和分液。广泛应用与生物、材料、航空、航天等多个领域。环亚生物科技有限公司作为德国Biofluidix公司在中国区的独家代理商,一直为国内用户提供专业的安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。环亚生物科技有限公司将一如既往的支持越来越多的Biofluidix用户。▼更多 Biofluidix 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.07.02

文献速递|全自动DNA片段回收仪Blue Pippin助力废水中病原微生物监测

文献速递|全自动DNA片段回收仪Blue Pippin助力废水中病原微生物监测【Frontiers in Public Health】Analysis of metatranscriptomic methods to enable wastewater-based biosurveillance of all infectious diseases宏转录组分析法实现废水中所有病原微生物监测新冠肺炎大流行期间,在不增加卫生保健系统负担下,通过检测废水中的病原微生物,可快速筛查大量人群,以监测病毒的变异和传播。目前的检测方法多是针对于一种或几种病原体的靶向检测,无法实现多种病原体的同时检测。因此,在废水监测传染病领域中亟需引入新技术,全面监测多种病原微生物的流行情况,在后疫情时代实现更有效的传染病监测和跟踪。期刊:Frontiers in Public Health发表年份:2023年样本:废水文库类型:宏转录组文库(200- 600 bp)宏转录组文库富集和精准回收:Sage Science公司Blue Pippin全自动DNA片段回收仪测序仪:Illumina NextSeq 500/550美国哥伦布巴特尔纪念研究所,依据俄亥俄州现有的冠状病毒废水监测网络(OCWMN),研究测试了多种靶向和非靶向的基因组测序分析方法,进行废水中病原微生物监测,以寻找最有效的方法,对传染病的发展趋势、已知病原体的爆发情况以及社区中正在上升的潜在新病原体或变种的检测和跟踪。文章建立了一套基于废水中微生物宏转录组的病原体监测分析方法。具体实施步骤:连续6周,OCWMN每周从10个位点获取RNA提取物,将其构建为相应宏转录组文库,之后在Illumina NextSeq和MinION测序仪上对总RNA进行测序,以鉴定存在的病原体种类。MinION长读长测序可以有效降低变异检测的复杂性。最后,测试了一种靶向杂交方法与废水RNA样品的兼容性。在宏转录组测序中,研究人员对比了磁珠法和Blue Pippin筛选和纯化目标DNA片段,实验结果表明使用磁珠法耗时长,效果差,并不能有效去除接头、引物等非目标片段。而使用Blue Pippin全自动DNA电泳回收仪,可自动化完成测序片段精准回收(200-600bp),完全去除杂带,使得测序结果聚焦目标区域,显著提升数据质量。基于废水的人类病原微生物监测,能够在疾病大流行之前对其进行监测和早期检测,从而能够快速做出反应,抑制致命细菌或病毒的传播。传统的宏基因组测序(如鸟枪宏基因组学或16S扩增子测序)无法检测样本中存在的RNA病毒,如SARS-CoV-2。现有的宏转录组分析方法能够检测真核生物、细菌和病毒病原体,可证明哪些基因正在表达。但现有的非靶向方法不能对具有小基因组的未知病原体以合理的成本进行大规模检测。因此,废水中病毒的监测仍然需要靶向测序,或在测序前进行病毒浓缩,去除所有细菌和真核细胞。此外,废水由完整细胞和细胞碎片组成。如果过滤和浓缩方法对病毒的富集程度不够,则无法通过非靶向测序进行一致的检测。本研究的数据提供了一个基线评估,证明废水是传染病流行病学的丰富资源,并确定了技术差距和潜在的解决方案,使公共卫生实验室能够使用这些资源来监测其地区的传染病流行情况。原文Spurbeck, Rachel R et al. “Analysis of metatranscriptomic methods to enable wastewater-based biosurveillance of all infectious diseases.” Frontiers in public health vol. 11 1145275. 22 Mar. 2023,美国Sage Science是全球领先的全自动DNA脉冲场电泳回收仪的生产厂家,拥有美国技术专利,各个型号产品可以高效完成不同长度范围的DNA片段的精准回收,广泛用于二代测序、三代测序以及多种分子生物学相关领域。环亚生物科技有限公司作为美国Sage Science公司在中国区的独家代理商,自2011年以来将Sage Science的产品线引入国内,一直为国内用户提供专业的全自动核酸片段回收仪的安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。环亚生物科技有限公司将一如既往的支持越来越多的Sage Science用户。▼更多 Blue Pippin 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.07.02

Regemat 3D生物打印神经组织工程材料的性能评估

神经组织工程(Neural tissue engineering ,NTE)是近些年新兴的一门学科,主要研究神经系统的修复和再生,其重要应用为构建具有良好组织相容性的仿生三维支架。这种支架能够提供细胞生长、粘附和分化环境,并促进神经组织功能的改善和修复。因此,研究人员需要开发并选择理想的、能够用于这类支架的神经组织工程材料。目前,天然或人工生物聚合材料,如聚乳酸(PLA)、聚己内酯(PCL),Filaflex(FF)、Flexdym(FD)和明胶甲基丙烯酸酯水凝胶(GelMA),凭借其优秀的生物组织相容性、机械性能,均有望应用于NTE中。西班牙格拉纳达大学组织工程系一个研究团队于今年在《 Polymers 》杂质发表了一篇名为《Comparison of Printable Biomaterials for Use in Neural Tissue Engineering: An In Vitro Characterization and In Vivo Biocompatibility Assessment》的文章。在该文章中,作者从打印性、机械性能、体外细胞与材料相互作用分析以及体内组织相容性四个角度,系统地比较了上述五种聚合物材料在NTE应用方面的优劣性,为将来相关生物材料开发提供了新的依据。实验流程:1. 生物材料制备采购即用型PLA、PCL, FF、FD长纤维,制备GelMA水凝胶溶液。2. 打印3D生物支架使用西班牙Regemat 3D公司的REG4Life生物3D打印机,将步骤1中的材料,打印成预先设计的4种不同类型的3D结构,用于后续测试(图1)。图1 待检测的3D支架和实验方案:使用REG4Life生物3D打印机制备4种不同结构的3D聚合物支架,分别用于印刷性测试、机械测试、体外细胞-生物材料相互作用分析和体内组织相容性实验3. 系统测试根据实验方案,从4个方面验证不同聚合物材料打印的3D生物支架性能(图1)。实验结果1. 打印性这五种生物材料都具有很好的打印效果,相比之下,PLA、FF和FD支架比PCL有更高的保真度和分辨率。而GelMA由于膨胀,导致打印的孔径比预先设定的值小(图2)。图2 a) PLA、(b) PCL、(c) FF、(d) FD 和 (e) GelMA 的打印效果图2. 机械性能拉伸实验结果表明,所有材料都满足NTE需求,不过在具体参数中各有优劣。在刚度方面,PLA较硬(325.89±30.33 MPa),而FD和GelMA较软(分别为0.41±0.02 MPa和0.09±0.02 MPa)。在形变能力方面,FD的材料更柔软,而PLA材料的形变能力最差。3. 体外细胞-生物材料相互作用分析通过比对生物材料和细胞体外共培养72h和7d后的细胞存活率等指标,作者发现在细胞培养72小时和7天后,接种PCL、FF和FD支架的细胞显代谢活性示出明显高于接种PLA和GelMA的细胞(p 4. 生物相容性实验生物材料皮下植入成年大鼠体内,10天后评估免疫原性反应。免疫组化结果证实了生物材料周围的局部宿主炎症反应,但没有核浸润或存在浆细胞介导的反应。 结论:受限于实验周期等因素,对于生物降解等指标还需进一步研究,但无论是机械性能还是细胞-生物材料组织相容性,REG4Life生物3D打印机所打印的4种生物材料都可以应用在NTE中,对NTE材料的开发具有很好的借鉴意义。更多资讯请访问文献全文链接:https:// doi.org/10.3390/polym16101426环亚生物科技有限公司作为西班牙REGEMAT 3D公司生物3D打印系列产品在中国区的独家代理商,一直为国内用户提供专业的生物3D打印系统的安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。环亚生物科技有限公司将一如既往地支持越来越多的REGEMAT 3D用户。▼更多 Regemat 3D 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.07.02

Innopsys激光共聚焦荧光芯片扫描仪助力灭活轮状病毒在恒河猴免疫原性及免疫机制的研究

轮状病毒,一种双链无包膜的RNA病毒,主要引起5岁以下儿童严重腹泻甚至死亡。目前,对该病毒感染尚无有效疗法,多采用疫苗接种以预防和控制感染、降低重症死亡率。活疫苗在防治方面取得进步,然而环境性肠病、营养不良、肠道微生物组等诸多因素的影响,疫苗效果仍存在较大差异。因此,需要不断探索和改进,开发一款效果更佳、毒副作用更小的灭活疫苗。北京大学协和医学院的一个研究团队于2023年在《Hum Vaccin Immunother》杂质发表了《Immunogenicity of inactivated rotavirus in rhesus monkey, and assessment of immunologic mechanisms》。在该文中,作者从云南省一例腹泻患儿的粪便中提取出轮状病毒并传代培养,连续培养16代后配制成1280、640和320 EU/mL三个浓度,通过离子交换层析、凝胶过滤等方法不断纯化浓缩,最后甲醛灭活为浓度98%的灭活轮状病毒,在此基础上制成灭活疫苗。将该疫苗接种在24只恒河猴中,分为2剂次免疫组和3剂次免疫组,每组内又分成四个亚组即对照组(0 EU)、160 EU、320 EU和640 EU。对免疫前和免疫后不同时间点,采集恒河猴的外周血进行抗体滴度检测、ELISpot实验和PBMC基因谱分析。同时, 利用法国Innopsys公司的Innoscan 300(现新型号InnoScan710)芯片扫描仪,检测灭活疫苗的免疫应答引起的细胞因子反应。对恒河猴血清不同时间点的检测,研究人员发现不同免疫方案(2剂次和3剂次)的体液免疫结果中:1剂次IRV免疫后血清中和抗体、IgG抗体和IgA抗体滴度均较低.第2次注射后,3种抗体测定值都升高。而3剂次都接种的免疫组的免疫效果优于2剂次免疫组。该结果说明,中和抗体、IgG和IgA水平与IRV免疫剂量相关,尤其是血清IgA抗体水平。Innoscan 300分析细胞因子微阵列芯片的实验结果表明,与免疫前的血液样本相比,血清中TNFα水平下调了0.67倍、IL-6上调了1.21倍、IL-5上调了1.25倍、IL-4下调了0.67倍、IL-1β上调了1.02倍、IL-16下调了0.69倍、IL-15下调了0.87倍、IL-12p70上调了5.22倍、IFN-γ上调了1.93倍、GM-CSF下调了0.82倍(见图1)。结合后续的GO分析和pathway分析,该结果说明,恒河猴首次免疫后5天,血清中IL-12p70和IFN-γ表达升高,IL-4和IL-16表达降低。IRV免疫可以刺激IL-12的表达和分泌,与轮状病毒感染的效果相似。此外,轮状病毒灭活疫苗免疫还能刺激活化T细胞增殖,激活CD4+ T细胞向Th0细胞分化,促进Th0细胞向Th1细胞分化,并分泌IFN-γ。分泌的细胞因子可直接对抗病毒,协助B细胞、CD8+ T淋巴细胞和巨噬细胞一起参与机体的免疫应答。图1 通过IFN-γ ELISPOT检测和细胞因子阵列对轮状病毒灭活疫苗接种后的细胞免疫分析(a)最后一次免疫接种后第2周猴IFN-γ应答情况;(b)血浆细胞因子(TNF-α、IL-6、IL-5、IL-4、IL-1β、IL-16、IL-15、IL-12p70、IFN-γ和GM-CSF)通过innoscan 300定量分析(*:p基于上述结果,作者得出结论——轮状病毒灭活疫苗免疫可诱导恒河猴产生体液和细胞免疫应答。中和抗体、IgG和IgA抗体水平与免疫剂量有关,尤其是血清IgA抗体。在恒河猴中进行的免疫原性评价结果为今后的临床试验提供了参考依据。更多资讯请访问文献全文链接:https://doi.org/10.1080/21645515.2023.2189598Innopsys 成立于1999年。总部位于法国,一直致力于生物医学领域相关仪器和软件的自主研发和生产。Innoscan系列扫描仪,采用先进的共聚焦PMT检测器和多激光扫描光路,可以同时进行多通道荧光检测。不仅有效降低了荧光光漂白现象以及信号损失,还可以有效缩短扫描时间。在基因组和蛋白组表达,基因突变,SNP检测,CGH,细菌病毒检测,肿瘤特异性标志筛查,病理组织筛查等方面都有非常广泛的应用。环亚生物,生命科学产品全国性代理商,具备完善的公司运营、产品管理、营销、售前技术支持和售后维修体系。环亚生物作为Innoscan大中华区代理商,负责Innoscan产品大中华区的营销和售后支持。▼更多 Innopsys 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.06.26

会议回顾丨纳米孔测序技术应用专题学术研讨会(南京站)-精彩回顾

由南京农业大学前沿交叉研究院主办,Oxford Nanopore Technologie、宝诚生物、环亚生物和墨卓生物联合承办的“纳米孔测序技术应用专题学术研讨会-南京站”,于2024年6月21日在南农翰苑宾馆顺利举行,吸引相关人士踊跃参与。本次研讨会到场一百多位嘉宾,众高校教授与公司技术大咖共同探讨三代纳米孔测序最新技术,以及上下游相关产品联合使用的解决方案。会上,环亚生物资深产品经理滕鹏为与会者作了《长片段文库制备助力三代测序应用》的专题报告,介绍了Sage Science全自动DNA片段回收仪助力ONT纳米孔测序中长片段分选回收的解决方案,引起众多专家学者的兴趣和探讨。《长片段文库制备助力三代测序应用》滕鹏 资深产品经理 Sage Science长片段分选产品应用专家纳米孔测序技术具有超长读长的技术优势,在基因组组装、RNA直接测序、病原菌监测以及疾病变异与致病机理方面,具有重要的应用价值。滕鹏经理为现场的各位专家学者带来了Sage Science全自动DNA片段回收仪,该设备能够实现特定长度片段的筛选与收集,更好地富集特定长片段或传统方法难以回收的长片段,以充分发挥纳米孔长读长测序的性能。滕经理详细介绍了该平台的回收原理、产品特点和最新技术动态等,并分享了与纳米孔测序联用的最新客户案例,重点内容包括长片段回收的重要性、HLS-CATCH应用、病原菌和疾病检测解决方案等。 专家学者了解Sage Science长片段分选设备前期回顾—厦门站:2024年5月24日,由厦门大学药学院主办,Oxford NanoporeTechnologie、宝诚生物、环亚生物和墨卓生物联合承办的“纳米孔测序技术应用专题学术研讨会-厦门站”。《长片段文库制备助力三代测序应用》滕鹏 资深产品经理 Sage Science长片段分选产品应用专家 专家学者了解Sage Science长片段分选设备美国Sage Science是全球领先的全自动DNA脉冲场电泳回收仪的生产厂家,拥有美国技术专利,各个型号产品可以高效完成不同长度范围的DNA片段的精准回收,广泛用于二代测序、三代测序以及多种分子生物学相关领域。环亚生物科技有限公司作为美国Sage Science公司在中国区的独家代理商,自2011年以来将Sage Science的产品线引入国内,一直为国内用户提供专业的全自动核酸片段回收仪的安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。环亚生物科技有限公司将一如既往的支持越来越多的Sage Science用户。▼更多产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市松江区莘砖公路518号9幢502室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.06.26

zenCELL owl活细胞动态成像系统用于软组织肉瘤RCC1-Skp2核质转运的调控研究

软组织肉瘤(soft-tissue sarcoma ,STS),是一种高发在结缔组织的恶性肿瘤,遗传异质性复杂、隐匿性强、局部复发率高、转移率高,多采用放化疗结合特定靶点和生物标志物的靶向治疗改善其预后和疗效。软组织肉瘤肿瘤生物学的关键特征之一是细胞周期S期的无序提前。S期激酶相关蛋白-2(Skp2)是S期提前的关键调节因子,其高表达与软组织肉瘤的预后较差有关。已有研究发现, Skp2蛋白的稳定性和活性与肿瘤的发展有关。Skp2在细胞内部的转运过程决定其亚细胞定位和功能开启,但目前负责Skp2核质转运的蛋白质尚未明确。染色体凝聚调节蛋白1(RCC1)在调控细胞有丝分裂和蛋白质核质转运方面扮演着关键角色,其高表达与肿瘤细胞周期进展的提前和增殖能力的提升正相关,但它是否参与调节Skp2的核质转运,以及这一过程如何影响软组织肉瘤的发展仍有待研究。福州大学的吕鹏、卢钟磊等人通过敲低(knockdown)RCC1的方法对RCC1与Skp2的关系,及其在软组织肉瘤细胞周期和进展中的功能进行研究,成果以“Targeting RCC1 to block the human soft-tissue sarcoma by disrupting nucleo-cytoplasmic trafficking of Skp2”为题,于2024年4月发表在《Cell Death and Disease》杂志上。研究发现, Skp2是RCC1在STS中的下游靶标,RCC1 可以直接与 Skp2 结合,并可能作为STS 细胞中Skp2 核胞质转运的货物蛋白。通过诱导Skp2的细胞质滞留和稳定,以促进STS细胞的细胞周期转变和增殖。RCC1的敲低显著抑制了STS细胞的周期进展、增殖和迁移,抑制体内STS的生长,从而在STS中发挥抑癌作用。同时,靶向抑制RCC1可以恢复对免疫疗法和化疗的敏感性。因此,RCC1可能是改善临床STS治疗的一个有希望的靶点,可能具有与一线抗癌药物联合治疗的潜力。本研究采用德国innoME公司的zenCELL owl活细胞动态成像及分析系统,动态监测SW872和 HTC75两种STS细胞系在RCC1敲低后的增殖变化过程(图1和图2)。图1 SW872细胞在RCC1敲低后的生长状态图2 HTC75细胞在RCC1敲低后的生长状态德国InnoME公司自主研发和生产的zenCELL owl活细胞动态成像及分析系统,基于非标记、非侵入方法,原位记录细胞实时生长和定量的分析数据。zenCELL owl体积小巧,耐温耐湿,可在细胞培养箱内长时间连续工作;通过24个显微成像镜头,对24个视野进行连续的动态监测和图像获取。zenCELL owl为用户提供高质量图像、视频、统计学曲线和定量数据,实现细胞增殖/增殖抑制、细胞培养质控/培养优化、迁移/侵袭等诸多活细胞动态过程的监测。环亚生物,生命科学产品全国性代理商,不断把国外顶级的创新产品引入中国。环亚生物具备完善的公司运营、产品管理、营销、售前技术支持和售后维修体系。环亚生物作为zenCELL owl大中华区独家代理商,负责zenCELL owl产品大中华区的营销和售后支持。更多资讯请访问文献全文链接:https://doi.org/10.1038/s41419-024-06629-2▼更多产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市闵行区友东路358号闵欣大厦1号楼701/703/705室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.06.12

文献速递|M2生物芯片点样仪助力抗体共价偶联过程及流动特性研究

文献速递|M2生物芯片点样仪助力抗体共价偶联过程及流动特性研究【Preparative Biochemistry & Biotechnology】Study on covalent coupling process and flow characteristics of antibody on the surface of immunoassay microfluidic chip抗体在免疫分析微流控芯片上偶联特性以及流动特性分析微流控芯片集成了样品反应、处理和分离整个过程,与传统检测方式相比,具有体积小、试剂消耗少、检测时间短、操作方便等诸多特点。因此,被广泛应用在分子诊断和即时检测(POCT)领域。微流控芯片的免疫检测反应是一个动态过程,需要将反应物持续运送到固相载体表面。目前,大多研究集中在免疫反应的底物上,而对反应物的流量以及流速等特性的研究十分有限。如何结合微流控芯片内部结构得到最佳流速的免疫检测,成为芯片表面修饰技术急需解决的问题之一。本文研究了几种聚苯乙烯亚基表面修饰的工艺,用于阐明抗体固定与流速对免疫反应效果的影响。抗体采用共价结合的方式进行固定,基于酶联免疫吸附原理进行荧光定量检测及免疫应答过程的评估。另外,以降钙素原为例,系统地研究了抗体共价偶联过程和流动特性对免疫检测结果的影响,为免疫检测微流控芯片的结构设计提供理论基础。作者单位:清华大学精密/超精密制造装备与控制重点实验室,清华大学天津先进装备研究院期刊:Preparative Biochemistry & Biotechnology 发表年份:2021年样本:蛋白抗体芯片类型:自制微流控芯片芯片点样仪:M2公司iTWO 200生物芯片点样仪芯片设计和免疫反应原理如图1所示:使用德国M2生物芯片点样仪将标记物(荧光微球)点印在反应区,特异性抗体点印在测试区(仅与感兴趣的抗原结合),非特异性抗体点印在对照区(只与标记物或抗原结合)。当含有抗原的血液流经反应区时,抗原在反应区与标记物结合,通过检测区后,标记抗原被特异性抗体捕获,形成“抗体-抗原-抗体免疫复合物”,从而产生荧光,当血液流入控制区域时非特异性抗体捕获未结合的标记抗体。最后使用荧光定量分析仪进行荧光信号分析。结果显示:对血液中降钙素原检测过程中,研究人员发现平均流速约为0.2 mm/s时免疫反应信号最强;与氨基和醛基修饰相比,环氧基修饰的芯片抗体免疫效率最高,对于小分子基团修饰的芯片,引入聚L -赖氨酸可以增加抗体的固定数量。原文链接:https://doi.org/10.1080/10826068.2021.1958344M2-Automation成立于2003年,总部位于德国柏林,是一家创新技术开发公司,专注于微量/超微量、非接触式自动化移液和生物芯片点样技术。仪器准确性、精确性高,重复性好,全程自动化点样,同时可根据客户需求进行定制。▼更多产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市闵行区友东路358号闵欣大厦1号楼701/703/705室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.06.12

全自动大片段DNA脉冲场电泳回收仪联合Pacbio和ONT,用于长读长测序优势研究

文献速递:Pippin HT全自动大片段DNA脉冲场电泳回收仪联合Pacbio和ONT,用于长读长测序优势研究Utility of long-read sequencing for All of Us【Nature Communications】长读长测序对AoU计划的效用期刊:Nature Communications(IF:16.6)发表年份:2024年1月物种:人文库类型:基因组测序文库文库富集和精准回收:Sage Science公司Pippin HT全自动大片段DNA脉冲场电泳回收仪基因组测序:Pacbio Sequel IIe / ONT PromethION三代测序仪“All of Us(AoU)”计划对超过一百万名来自不同种族背景的美国人,进行基因组测序,以改善个性化医疗服务。最近的一项技术试验即HapMap项目,研究人员对其一小部分样本和代表八个数据集的两个AoU对照样本,比较了传统短读长测序和长读长测序的性能差异。结果揭示,在复杂医学相关基因的测序准确率,尤其是基因覆盖度和致病变异体的鉴定方面,这两种技术具有显著差异。在大型群体分析项目中,如果利用低覆盖度测序的优势,需要一定程度增加样本数量。而长读长测序技术,特别是PacBio的HiFi测序技术,在检测小型和大型变异方面都产生了准确的结果。同时,研究者提出了一个基于云的流程,通过大规模优化单核苷酸变异(SNV)、插入/删除(indel)和结构变异(SV)的数据调用,优化长读长测序结果的分析。这些研究成果可极大优化并加快整个 AoU项目进程。文中在长读长测序实验流程中,使用Pippin HT全自动大片段DNA脉冲场电泳回收仪精准回收15-22kb的目标片段,然后按照Pacbio和ONT建库流程建库后上机测序。结论相比于短读长测序技术,长读长测序技术在识别单核苷酸变异(SNVs)和结构变异(SVs)方面展示出更高的准确性,尤其适用于分析那些复杂、重复的医学相关基因。原文Mahmoud, M., Huang, Y., Garimella, K. et al. Utility of long-read sequencing for All of Us. Nat Commun 15, 837 (2024). 美国Sage Science是全球领先的全自动DNA脉冲场电泳回收仪的生产厂家,拥有美国技术专利,各个型号产品可以高效完成不同长度范围的DNA片段的精准回收,广泛用于二代测序、三代测序以及多种分子生物学相关领域。环亚生物科技有限公司作为美国Sage Science公司在中国区的独家代理商,自2011年以来将Sage Science的产品线引入国内,一直为国内用户提供专业的全自动核酸片段回收仪的安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。环亚生物科技有限公司将一如既往的支持越来越多的Sage Science用户。▼更多Sage Science产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市闵行区友东路358号闵欣大厦1号楼701/703/705室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.06.12

zenCELL owl活细胞动态成像系统用于细胞追踪算法的开发

细胞迁移作为基本的生物学过程,在机体的生长发育、体内平衡和疾病发生发展中起着重要作用。异常的细胞迁移可导致相关功能意外中断,并与畸形、自身免疫性疾病和癌症转移等疾病关联。因此,长时间连续跟踪和观察细胞集体的迁移运动及各种细胞的形态变化,有效识别和分析异常的细胞行为,助力于疾病研究和治疗。然而单个细胞具有多样性和动态性形状,目前对细胞集体的连续追踪和识别仍然是巨大挑战。细胞追踪方法早期专为特定应用而设计,如对圆形细胞量身定制,或进行荧光标记,一定程度上限制了应用类型或影响活细胞的内在行为。随着计算机科学和生物图像信息学的不断发展,细胞追踪方法取得了很大进步。华东理工大学万永菁教授和南京大学龙亿涛教授联合开发了一种基于深度学习的细胞跟踪算法HFM-Tracker(Hybrid Feature Matching Tracker),准确捕获图像序列中的动态细胞行为。研究成果以“HFM-Tracker: a cell tracking algorithm based on hybrid feature matching”为题于2024年3月发表在英国皇家化学学会期刊《Analyst》上。该文入选“《Analyst》2024热门文章(Analyst HOT Articles 2024)”和“150 周年论文集:电化学和电分析方法(150th Anniversary Collection: Electrochemistry and Electroanalytical Approaches)”。本研究采用德国innoME公司的zenCELL owl活细胞动态成像及分析系统,对培养的MCF-7细胞(人类乳腺癌细胞系)进行实时动态的图像采集,每隔10分钟采集一次,每组图像采集144幅延时图像(2588×1942像素),总记录时间为24小时。从采集到的图像中选择70幅用于HFM-Tracker算法深度学习的训练、验证和测试等整个开发过程(图1和图2)。图1 HFM-Tracker算法流程示意图(zenCELL owl获取追踪细胞的图像)图2 HFM-Tracker算法追踪结果(zenCELL owl获取追踪细胞的延时图像)HFM-Tracker算法在细胞检测和追踪方面皆表现优越,实现了75%的多目标追踪准确性(Multiple Object Tracking Accuracy,已考虑轨迹丢失、假阳性检测、漏检 和轨迹错误四个方面的误差)和65%的IDF1评分(多目标跟踪对象的身份准确性指标,已考虑检测和关联准确性)。HFM-Tracker算法提供了细胞形态和迁移特征的定量分析,有助于理解复杂多样的细胞迁移过程。另外,在迁移相关的生物过程中,如何阐明异常细胞行为间的复杂相互作用,该算法也可以起到重要作用,进而在生化和临床领域发挥潜力。德国InnoME公司自主研发和生产的zenCELL owl活细胞动态成像及分析系统,基于非标记、非侵入方法,原位记录细胞实时生长和定量的分析数据。zenCELL owl体积小巧,耐温耐湿,可在细胞培养箱内长时间连续工作;通过24个显微成像镜头,对24个视野进行连续的动态监测和图像获取。zenCELL owl为用户提供高质量图像、视频、统计学曲线和定量数据,实现细胞增殖/增殖抑制、细胞培养质控/培养优化、迁移/侵袭等诸多活细胞动态过程的监测。环亚生物,生命科学产品全国性代理商,不断把国外顶级的创新产品引入中国。环亚生物具备完善的公司运营、产品管理、营销、售前技术支持和售后维修体系。环亚生物作为zenCELL owl大中华区独家代理商,负责zenCELL owl产品大中华区的营销和售后支持。更多资讯请访问文献全文链接:https://doi.org/10.1039/d4an00199k▼更zenCELL owl详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市闵行区友东路358号闵欣大厦1号楼701/703/705室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.06.05

利用Biofluidix喷墨打印技术构建双细胞肿瘤球模型

近年来,3D肿瘤模型已成为癌症生物学、药物开发和医学研究的新工具。常见的3D肿瘤模型包括肿瘤球、类器官、微流体装置等。肿瘤球和类器官是最常用的两种模型,基于不同的细胞来源和制备方案,模拟肿瘤微环境如结构组织、细胞分层、营养和氧气梯度等特征。然而,这些方法仍存在不足,比如构建初期的肿瘤模型,其细胞密度明显低于天然组织,无法真实模拟肿瘤细胞与基质细胞的相互作用;多需要等待几天甚至几周,后期模型的细胞密度才能与天然组织相当,增加了研究周期。美国印第安纳州的西拉斐特普渡大学机械工程学院于2023年在《Materials Today Advances》发表该文章,研究开发了一种新的3D肿瘤模型构建方法。利用该方法能够快速制备3D肿瘤模型,细胞密度和生理特性与自然组织类似,同时还可调整墨水成分及打印条件构建不同类型的肿瘤模型。实验方法:1.墨水制备将肿瘤细胞与一种含有I 型大鼠尾胶原蛋白和聚(N-异丙基丙烯酰胺-共甲基丙烯酸甲酯)的互渗透聚合物油墨混合,构成含有肿瘤细胞的墨水。再将肿瘤基质组织最主要成分的癌症相关成纤维细胞( cancer-associated fibroblasts ,CAFs)用同样方法制成含有CAFs的墨水。2.喷墨打印德国Biofluidix公司的纳升级压电式点样器Pipejet安装在载物台控制器上,将上述两种墨水用Pipejet点样器以线阵列的方式点印在玻璃孔板中并在37℃固化。固化完成后加入细胞培养基进行培养。(图1)图1 喷墨打印过程的示意图以及组织压缩应力假设机理3.组织学观察取不同时间点的肿瘤模型做免疫荧光染色,通过共聚焦显微镜观察不同时间点肿瘤模型的变化。实验结果常规肿瘤球形成验证已有研究表明,相比于肿瘤细胞,CAF细胞的收缩性更强,因此预期加入培养基后,CAF细胞将收缩得更为紧密,而肿瘤细胞包裹在其周围。最终形成基质细胞在内、肿瘤细胞在外侧的结构(图1)。在实际实验中,如预期所示,随着时间变化,逐渐形成CAF细胞为致密核心,肿瘤细胞将其完全包裹的肿瘤球(图2,A),且在接下来两个月内持续稳定存在(图2,D)。图2 喷墨打印快速形成肿瘤球(A)主动收缩,0–24 小时延时图像(红色通道:肿瘤细胞,绿色通道:CAF细胞);(B)量化体积应变;(C)细胞密度和胶原浓度的定量;(D)肿瘤球在1天-2个月不同时期的明场和荧光图像(比例尺:500μm)。通过分析延时图像中细胞占用的面积,可以计算出肿瘤球的体积以及响应的细胞密度(图2 ,B-C)。结果显示,在培养24小时后,3D 类肿瘤细胞密度已达到 108个细胞每平方厘米,接近天然组织中肿瘤的细胞密度。说明这种方法可以快速形成类似天然组织细胞密度的肿瘤球。其他类型肿瘤球形成验证在上述实验基础上,作者改变打印方式、调整打印温度等,又成功构建了具有3D腔体形状的肿瘤球,以及肿瘤细胞在内侧、CAF细胞在外侧的肿瘤球。实验结论利用Pipejet喷墨打印方法制备的肿瘤球,可在短时间内形成类似天然组织的细胞密度,大大提升实验效率,还可推广到其他不同类型的细胞和肿瘤球模型,有广泛的应用空间。更多资讯请访问文献全文链接:https://doi.org/10.1016/j.mtadv.2023.100408Biofluidix是全球领先的研发制造高精度生物芯片点样和分液系统的生产厂家,不仅有体系化的点样分液平台,也提供模块化的皮升、纳升和微升分液装置,能够兼容第三方设备,实现精准点样和分液。广泛应用与生物、材料、航空、航天等多个领域。环亚生物科技有限公司作为德国Biofluidix公司在中国区的独家代理商,一直为国内用户提供专业的安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。环亚生物科技有限公司将一如既往的支持越来越多的Biofluidix用户。▼更多 Biofluidix 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市闵行区友东路358号闵欣大厦1号楼701/703/705室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.06.05

Moxi Go II快速流式细胞仪应用于类风湿性关节炎疗法的研究

类风湿性关节炎(Rheumatoid arthritis,RA)是一种全身性的自身免疫性疾病,以炎症细胞浸润和滑膜细胞增生为特征。该疾病导致软骨和骨骼损伤、关节畸形甚至残疾,但现有治疗药物的毒性高、传递效率低,无法有效阻止其发展,因此仍以控制病情、减少致残率和改善患者的生活质量为主。铁死亡是一种铁依赖性的新型细胞程序性死亡方式。在肿瘤、RA等炎症微环境中,过氧化氢(H2O2)富集,可通过Fe2+介导的费托反应催化生成高毒性的•OH。•OH诱导细胞内脂质过氧化,继而损伤浸润的炎症细胞和增殖的成纤维细胞样滑膜细胞,因此在RA治疗中铁死亡具有很大的研究潜力。2023年12月来自江苏大学药学院及附属医院的研究团队在《Materials Today Bio》上发表一种治疗RA的新方法:用工程巨噬细胞作为载体,递送Fe3O4和柳氮磺胺吡啶(sulfasalazine,SSZ),用于RA的铁死亡和光热疗法。Fe3O4是一种磁性纳米材料,可以通过外加磁场实现对巨噬细胞的定向操控。SSZ是一种常用的抗风湿药物,具有抗炎和免疫调节作用。研究者利用巨噬细胞固有的炎症趋化性和对纳米颗粒的保护作用,将Fe3O4和SSZ有效运送到RA组织中,在近红外光(NIR)照射下产生热量,破坏巨噬细胞,释放Fe3O4纳米颗粒和SSZ,诱导细胞铁死亡。铁死亡和光热效应有效地破坏了驻留的炎症细胞和增殖的滑膜,对RA有明显的治疗作用(如Fig 1所示)。Fig 1.  巨噬细胞介导的RA铁死亡和光热治疗药物递送示意图文章中使用荧光染料FITC和DOX标记Fe3O4纳米颗粒(NPs)与巨噬细胞共孵育,使用Orflo Technologies公司的快速流式细胞仪Moxi Go II,定量分析巨噬细胞对FITC标记Fe3O4的摄取时间和浓度摸索(Fig 2),在4h和40μg/mL为最佳孵育时间和浓度;定量分析DOX标记Fe3O4 NPs的细胞摄取情况(Fig 3)。结果显示,DOX标记的Fe3O4 NPs在巨噬细胞中的摄取能力强于对游离DOX的摄取。Fig 2. (c) Fe3O4-FITC孵育不同时间(0.5、1、2、4 h)后巨噬细胞的流式分析(d) FITC浓度为10、20、40、80μg/mL时,Fe3O4-FITC孵育后巨噬细胞的流式分析Fig 3 (a)培养4小时后,巨噬细胞内化游离DOX或Fe3O4-DOX NPs的流式检测(b)流式细胞术定量分析游离DOX和Fe3O4-DOX的平均荧光强度综上所述,本文开发了一种新的基于巨噬细胞的靶向纳米颗粒递送平台,Fe3O4-SZZ能被巨噬细胞有效吸收,增加SZZ负载能力,为炎症药物递送提供了一种策略,也证明了铁死亡和光热治疗联合治疗在RA治疗方面的巨大潜力。Moxi GO II快速流式细胞仪Moxi GO II快速流式细胞仪,采用库尔特原理进行细胞计数和粒径测量,同时采用488nm激光光源,结合两个PMT通道,525/45nm通道和561nm/LP(或者646nm/LP,可根据需要更换),进行细胞活率、细胞凋亡、转染效率、活性氧簇、线粒体膜电位等常规流式检测。仪器设计小巧轻便,无需预热,开机即用,预设程序,触屏操控,运行后10秒即可给出测试结果,使用后也无需清洁维护。无论是经验丰富的流式专家,还是初试身手的实验小白,Moxi Go II都可以助您轻松完成实验。美国Orflo Technologies公司是一家非常专业的细胞分析仪器研发和制造企业,拥有多项专利技术,产品以库尔特原理的高精细胞计数仪和超快流式细胞仪为主。环亚生物,生命科学产品全国性代理商,不断把国外顶级的创新产品引入中国。环亚生物具备完善的公司运营、产品管理、营销、售前技术支持和售后维修体系。作为Orflo Technologies中国地区独家代理,环亚生物科技有限公司全权负责Orflo Technologies产品在中国地区的推广、销售,为广大用户提供专业的技术咨询和产品服务。文献全文网页链接:https://doi.org/10.1016/j.mtbio.2023.100925▼更多 Moxi Go II 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市闵行区友东路358号闵欣大厦1号楼701/703/705室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.06.05

ArrayJet高通量生物芯片点样平台助力筛选癌症潜在治疗靶点

Arrayjet是一家领先的喷墨式液体处理方案供应商,2016年Arrayjet公司开发了一种独特的治疗性抗体筛选方法,即ArrayPlexTM药物筛选平台,对功能性抗体进行高通量筛选,该过程基于Arrayjet独特的生物喷墨打印技术速度快和通量高的特点,每10天制备约200万个样品点,既不需要表征抗体,也不需要表征靶标,用以研究配体与靶标的相互作用、发现抗体-药物偶联物、制备抗体库等等。该平台除了在抗体和裂解物文库之间进行筛选,还可兼容其他的样品类型,例如小分子文库、蛋白文库、核酸文库等。目前,ArrayPlexTM药物筛选平台已被美国生物技术公司Immunome, Inc.选中,扩展其内部高通量筛选的工具,Immunome使用患者B细胞产生的大量杂交瘤抗体文库,对其进行筛选,以发现癌症靶向治疗的新方法。目前,针对数百种癌症组织裂解物,ArrayJet已经筛选到数十万种相关抗体,同时也在不断完善检测方法,来推进发现癌症潜在治疗靶点的进程。抗体筛选流程(具体如图1):步骤1点印捕获样本(例如:组织、细胞裂解物)--使用Arrayjet Mercury仪器点印到功能化玻璃载玻片上进行固定。步骤2点印待测样本(例如:抗体或杂交瘤抗体文库)--通过Arrayjet Mercury仪器进行微阵列点上点样,未结合的待测样品可通过清洗去除。步骤3信号检测--通过荧光标记的检测抗体对待测样本进行识别,同时和对照组相比消除假阳性结果,阳性抗体后续进一步表征。Arrayjet位于英国爱丁堡,专注于提供生物芯片应用领域的解决方案及服务。自2000年公司成立即致力于开发新型生物样品喷点方案–喷墨式液体处理平台,该系统于2006年上市,目前用户遍布全球27个国家。Mercury系列产品采用独特的飞行喷墨点样技术实现行业第一的快速、非接触式微量液体处理。同时上万种不同样品可以进行快速点样,专利的上样模块配合高通量的点样喷头保障您的点样操作快速、无污染,更低的上样体积可有效减少样品损失,使您的珍贵样品物尽其用。▼更多 ArrayJet 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市闵行区友东路358号闵欣大厦1号楼701/703/705室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.06.05

文献速递|Origins高分辨率潜水电泳仪助力病原微生物流行病学研究

【Microorganisms】Spatial and Temporal Variability in Prevalence Rates of Members of the Borrelia burgdorferi Species Complex in Ixodes ricinus Ticks in Urban, Agricultural and Sylvatic Habitats in Slovakia在斯洛伐克城市、农业和洞穴栖息地中,蓖麻硬蜱对伯氏疏螺旋体复合体感染率的时空特异性莱姆病(Lyme borreliosis ,LB)是欧洲最常见的蜱传人类感染性疾病,近几十年来发病率不断上升。该病以蜱为媒介,由伯氏疏螺旋体(Bbsl)所致的自然疫源性疾病。在欧洲全域,特别是斯洛伐克,已观察到大量的蓖麻硬蜱种群,成为病原体伯氏疏螺旋体(Bbsl)复合体的主要媒介。了解感染性疾病的传播途径对实施有效的控制措施至关重要。本研究聚焦于斯洛伐克,从代表城市/郊区、自然和农业栖息地的三个地点寻找感染伯氏疏螺旋体(Bbsl)的蓖麻硬蜱种群,调查Bbsl的感染率及其物种多样性的时空特异性。在布拉迪斯拉发镇(城市/郊区栖息地)、小喀尔巴阡山脉(自然栖息地)和斯洛伐克东部农业栖息地,通过拖拽植被采集蓖麻硬蜱若虫和成虫。用聚合酶链式反应检测蜱体内是否存在疏螺旋体,并用限制性片段长度多态性(RFLP)鉴定Bbsl种群。用反向线性印迹法(Reverse Line Blotting ,RLB)鉴定共感染蜱中的伯氏疏螺旋体类型,从而获得不同环境中蓖麻硬蜱携带伯氏疏螺旋体的真实情况。期刊:Microorganisms发表年份:2023年样本:蓖麻硬蜱(Ixodes ricinus Ticks)应用:限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism ,RFLP)文中使用限制性片段长度多态性(RFLP)分析鉴定Bbsl种群类型,具体通过Origins高分辨率潜水电泳仪结合Spreadex gel EL300 mini预制胶,以核酸片段分布图谱确定Bbsl种群及亚种。不同环境类型中,蓖麻硬蜱若虫和成虫对伯氏疏螺旋体的感染率在探索的栖息地中,蜱虫感染伯氏疏螺旋体在空间和时间上存在显著差异。总感染率最低的是城市/郊区栖息地,而自然和农业栖息地的感染率较高。RFLP在每个环境类型中检测到6种Bbsl,包括B. burgdorferi sensu stricto (s.s.), B. afzelii, B. garinii, B. valaisiana,B. lusitaniae 和 B. spielmanii。其中,共感染占总感染数量的3%。通过RLB和测序鉴定出B. kurtenbachii与B. burgdorferi s.s,B. garinii 和B. valaisiana存在共感染的情况。这是首次在斯洛伐克和欧洲的蓖麻硬蜱调研中发现B.kurtenbachii。同时在若虫和成虫之间、不同年份之间以及不同生物环境类型之间,发现了Bbsl物种比例的变化。在城市栖息地相对距离较短的地点之间,Bbsl物种的流行模式和比例也存在空间差异。伯氏疏螺旋体感染率和分布的时空特异性可能与当地环境条件和脊椎动物宿主谱有关。由于存在对人类致病的伯氏疏螺旋体类型,所有探索的地点都可以被列为具有高流行病学风险的地区。原文:Kazimírová, Mária, et al. "Spatial and Temporal Variability in Prevalence Rates of Members of the Borrelia burgdorferi Species Complex in Ixodes ricinus Ticks in Urban, Agricultural and Sylvatic Habitats in Slovakia." Microorganisms 11.7 (2023): 1666.Origins高分辨率潜水电泳来自奥地利AL-Labortechnik公司,集成了整体的温度控制系统,即通过半导体元件和自动温度控制系统,精准控制电泳过程中的温度。同时整合循环泵系统,确保整个电泳区域温度和pH值恒定,形成均匀的、线性电场,这使得该设备具有高分辨率和高重复性,可广泛用于植物、微生物物种的分群和鉴定,以及疾病相关基因的研究等。环亚生物科技有限公司为该产品在中国区的独家代理商,自2011年成立以来,诚挚为国内用户提供专业安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,期待您的来电垂询。▼更多 Origins 产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市闵行区友东路358号闵欣大厦1号楼701/703/705室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.06.05

CISILE 2024中国科仪展——环亚生物精彩速递

在这个科技日新月异的时代,生物医学领域正以前所未有的速度发展。2024年,我们有幸参加一年一度的CISILE中国科仪展,一个汇聚全球顶尖科技与创新的平台。CISILE 2024吸引了来自世界各地的科研机构、生物技术公司和医疗器械制造商,为您提供一个国际化的交流与合作机会。【环亚生物】作为全国性总代理商,以产品营销为核心,持续不断地引进国际上创新的科研仪器设备,配备专业的产品管理团队和全国渠道销售团队。【产品亮点】在2024年的CISILE中国科仪展上,我们公司代理的法国Innopsys激光共聚焦荧光定量组织切片正式亮相、这一突破性的产品将为生物医学研究带来里程碑性的改变。【功能用途】1.组织切片扫描:脑组织切片、肿瘤组织切片等组织切片多重荧光染色扫描2.生物芯片扫描:基因芯片、蛋白芯片、糖芯片、细胞芯片、组织芯片等生物芯片扫描【产品优势】1.4荧光通道同时扫描:四组独立的激光器(375nm、488nm、561nm、640nm)和PMT检测器,用于荧光玻片多重扫描2.激光共聚焦扫描:有效消除背景荧光,提高信噪比3.整片一次扫描,无需拼接:激光共聚焦逐点扫描技术,无区域分割、无后期拼接,整体一次成像,图片高度还原用于精准的分析定量4.逐点扫描,无需阴影校正:逐点扫描技术保证每一点的亮度保持一致,无需阴影校正5.扫描速度快:17分钟完成18*18mm面积的四色扫描6.扫描通量高:可选高通量型号(内置自动载片架),一次完成1-24张玻片扫描今后我们诚挚邀请您与我们一同探讨合作的可能性,共同开拓市场,实现共赢。 会议展出的仪器:Blue pippin 全自动DNA脉冲场回收仪DNA片段分选回收领域的标配设备和金标准脉冲场分选回收大片段DNA二代测序文库制备用于三代测序长片段文库制备,也可用于常规分子生物学PCR片段、酶切片段回收超万篇学术文献引用Ocus 便携式数字病理切片扫描仪目前全球最小巧的玻片扫描系统扫描速度快、成像清晰、色彩还原好系统极致优化,无线操控,安全稳定Innoquant激光共聚焦荧光定量组织切片扫描仪快速、高效:4组独立检测通道无需阴影校正:激光光源和PMT检测器图像高清:激光共聚焦,自动对焦和定焦无需拼接:激光逐点扫描,无区域分割精准定量分析:适配各种分析软件智能成像:人工操作少,软件简洁zenCELL owl 活细胞动态成像及分析系统在培养箱内,对细胞进行长时间非侵入式实时监测24组镜头和光源,同步监测、分组对比、平行分析呈现图片、视频、数据曲线用于细胞毒理、药化、划痕迁移、类器官、3D培养等的活细胞动态监测Blotcycler 全自动蛋白质印迹杂交系统自动化完成抗体孵育、洗膜的过程,下一步即可进行曝光检测清洗更干净,降低背景,提高了信噪比和相对灵敏度Orflo 快速流式细胞仪库尔特原理,配合荧光方法,对细胞进行快速、精准的计数和粒径测量多维度的数据结果:细胞计数+细胞粒径+细胞活性分析+流式分析支持高上样量,数据更有代表性,操作简单,10秒出结果▼更产品详情,请联系我们▼环亚生物科技有限公司地址:上海市闵行区友东路358号闵欣大厦1号楼701/703/705室电话:021-54583565邮箱:info@apgbio.com网址:www.apgbio.com ▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼

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2024.06.05

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