RAPA3G植物组织直扩PCR试剂盒
商品属性:
货号 | 规格 | 产品名称 |
P-PR1270-80T(50 μl 体系) | 80T(50 μl 体系) | RAPA3G植物组织直扩PCR试剂盒 |
产品介绍:
描 述 :
RAPA3G DNA 聚合酶为经电子重构架的第三代 Taq DNA 聚合酶,第三代 DNA 聚合酶具有高度的杂质耐受性、 长片段扩增能力、高扩增成功率、高产量,这些特点使得 RAPA3G 系列产品可用于粗制样品的直接扩增,无需核酸纯 化步骤。该 PCR Mix 具有 5’-3’的聚合酶活性、5’-3’的外切 酶活性、3’-5’的外切酶活性,产物部分带有”A“尾巴,部 分为平末端,因此产物可用于 TA 克隆或平端克隆。
特点和用途:
(1)高杂质耐受性:该 PCR Mix 可直接使用多糖多酚含量极高的叶片等材料进行 PCR 扩增,无需基因组提取。
(2)高效的快速 DNA 释放剂:尽管该 PCR Mix 可以直接使用叶片进行扩增,但我们仍然推荐采用 DNA 释放剂进行样本的快速前处理(约需要 5min,可高通量操作)。DNA 释放剂的前处理,使得制备的 DNA 模板可以进行多次、多基因扩增,并长期保存植物 DNA,经 DNA 释放剂处理的样本,在室温条件下放置 1 个月,无任何后续影响,-20 可长期保存。
(3) 快速 PCR:该酶具有 6kb/min 以上的扩增速度,可显著的缩短 PCR 的扩增时间,在常规测试条件下,10s 的延伸时间可完成 1kb 的基因组 DNA 扩增。
(4)粗制样品的扩增能力:扩增能力>1.7kb。
(5) 高保真性能:该制品包含一定比例的 RAPA HiFi 超保真 DNA 聚合酶,因此其具有一定的保真性能(经蓝白斑测试,其保真性能约为 Taq DNA 聚合酶的 56 倍)。
(6)热启动,防止非特异性扩增:RAPA3G 系列产品均采用 专有的热启动技术,确保 50 度以下完全无活性,仅有 95 度加热 5min 以后才能恢复其活性,因此可最大限度的提高扩增的特异性,减少非特异性产物的产生。
包装:
2×RAPA3G PCR Mix (with Dye) 1mlX2
快速 DNA 释放剂 A 20 ml
快速 DNA 释放剂 B 20 ml
储存:长期储存置于-20°C 以下,可保存 2 年;短期使用置于 4°C(3 个月)保存。
使用方法
1. DNA 释放
(1)采用加热法:取 2-3mm 直径叶片(白 Tip 头上沿大小)、1-10mg 果实等材料,放入到 0.2ml EP 管中,加入 50 μl 快速 DNA 释放剂 A,于 PCR 仪中 98°C 加热 5min,加热完毕后加入 50 μl 快速 DNA 释放剂 B,混合均匀,即可使用。
(2)采用钢珠研磨法:取 2-3mm 直径叶片、1-10mg 果实等材料,放入到 2ml EP 管中,加入 250 μl 快速 DNA 释放剂 A 和 2-3 粒钢珠,研磨 1-2min 成浆体装。研磨完毕后加入 250 μl 快速 DNA 释放剂 B,混合均匀,即可使用。
2. 按下表配制 PCR 反应体系并混合均匀:
2×RAPA3G PCR Mix (with Dye) 25 μl
上游引物(10 μM) 2 μl
下游引物(10 μM) 2 μl
步骤 1 制备的模板 DNA 2 μl
ddH2O 19 μl
注意:当扩增片段>5kb 时,引物用量调整为 0.25-0.5μl。
3. PCR 扩增循环参数
循环数 温度 时间
预变性 95°C 5min
25-40 Cycles
95°C 20s
50~60°C 20s
72°C 4-6kb/min
末延伸 72°C 2min
请注意:(1)该制品为热启动制品预变性步骤 5min 不可缩短,否则 DNA 聚合酶无法恢复活性。(2)当扩增片段<1kb时,延伸时间使用 15s;扩增片段 1-2kb 时,延伸时间使用45s,扩增片段 2-3kb 时,延伸时间使用 1min,当扩增片段>3kb 时,请按照 2kb/min 的延伸时间进行设置。(3)尽管该酶具有 6kb/min 的延伸速度,但按照 2kb/min 设置延伸时间的条件下,能获得最高的产量。
3. 注意事项:(1) 当模板 GC 含量>70%时,请添加5× Q-Solution(Cat. No.: A3002)。(2)当采用全血、血浆等蛋白含量极高的样本时,扩增完毕后可能会有变性的蛋白沉淀,请离心后再进行点样和电泳。
![1.png 1.png](https://img1.17img.cn/17img/images/202408/uepic/6c3845b4-40f6-4da9-9255-cd3d60482c38.jpg)
![5.jpg](https://img1.17img.cn/17img/images/202408/uepic/e61abc57-2a7c-4156-9260-f14e6ba63934.jpg)
![6.png](https://img1.17img.cn/17img/images/202408/uepic/62851bc5-3a8d-40e2-a984-d347a9c64d3e.jpg)
![7.png](https://img1.17img.cn/17img/images/202408/uepic/1321522b-6687-4131-a7b4-7a74974aa01c.jpg)
pcr相关试剂实验结果分析:
PCR实验结果的分析涉及多个方面,包括实验操作、试剂质量、实验条件等,这些因素都会影响PCR实验的成功率和结果的准确性。以下是对PCR实验结果分析的一些关键点:
循环次数过多:增加模板量减少循环次数,缩短退火时间及延伸时间,或改用两种温度的PCR循环,可以有效避免循环次数过多导致的问题。
退火温度过低:退火温度的适当调整对于PCR反应的成功至关重要,过低的退火温度可能导致非特异性扩增,影响结果的准确性1。
电泳体系问题:包括凝胶中缓冲液和电泳缓冲液浓度相差太大、凝胶没有凝固好、琼脂糖质量差等问题,这些都会影响DNA片段的分离效果。
试剂盒问题:运输储存不当可能引起试剂盒失效,试剂盒本身质量问题如引物选择、循环参数设置不当也可能导致实验失败1。
降解的陈旧模板:使用降解的陈旧模板进行扩增容易产生涂布,影响结果的解读1。
PCR假阴性结果:可能由引物长度不够、试剂浓度不标准、靶序列突变或缺失、循环参数设置错误、标本中有Taq酶抑制剂、PCR产物检测系统灵敏度不够等因素引起。
为了获得准确的PCR实验结果,需要注意以下几点:
确保PCR反应体系中各种试剂的配比和操作步骤的精准度。
在PCR反应过程中需要对PCR产物进行实时监测,以便及时对反应条件进行调整。
防止样本的污染和交叉感染,以免影响PCR反应的准确性和可靠性。
通过上述分析,可以更好地理解和控制PCR实验中的关键因素,从而提高实验结果的准确性和可靠性。
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