位置异构体

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位置异构体相关的耗材

  • YMC-光学异构体和结构异构体分离柱
    YMC-光学异构体和结构异构体分离柱在商业上有价值的环型多聚糖环糊精,由三种成分组成,包括:α-环糊精(六环)、β-环糊精(七环)和γ-环糊精(八环),如下图所示。这种圆锥状环糊精分子具有一个疏水的空穴和一个碳水化合物上的亲水边缘。在残存的葡萄糖上碳原子6上的一级羟基具有较小直径的边缘,葡萄糖上的2和3碳原子上的二级羟基则形成较大直径的边缘。空穴的直径如同一个单独的苯环,或取代基单个的苯环和多环系统的变化。YMC Chiral CD BR液相色谱柱提供了对镜像异构体分离的一个选择方法。环糊精上的溴代衍生物共价键合到YMC硅胶上形成一个新的手性固定相(CSP,Chiral Stationary Phases)。在溴代衍生物中第六个碳原子上的羟基被溴化物取代,从而提供了不同于环糊精的手性异构选择性。这种环糊精溴化衍生物被用于反相模式的液相色谱分离,其具有广范围的分离特性,适合于极性和水溶性化合物的分离,此外,其在相似的条件下也可用于分离芳香族化合物取代基的位置异构体分离。YMC Chiral CD BR色谱柱可在pH 3.5-6.5范围和通常使用的缓冲液色谱系统中使用。但是在保存该种色谱柱时,必须用水/甲醇溶液(80-100%水)将分析后柱内残留的盐分和缓冲液全部冲洗干净,色谱柱必须储存在无盐的水/甲醇(50%甲醇)的条件下。如果可能可用三氟醋酸(THF)清洗除去残留,以再生色谱柱。Chiral CD BR系列液相色谱柱的特点 环糊精结构的光学异构体分离柱,有α-、β-和γ-三种类型的柱填料 反相-液相色谱柱;粒径:5µ m;孔径:12nm (120Å );适用pH范围:3.5-6.5 用于光学异构体和结构异构体化合物的分析 用于反相、极性和水溶性药物或化合物的位置异构体分离
  • YMC-光学异构体和结构异构体分离柱--北京绿百草
    YMC-光学异构体和结构异构体分离柱在商业上有价值的环型多聚糖环糊精,由三种成分组成,包括:&alpha -环糊精(六环)、&beta -环糊精(七环)和&gamma -环糊精(八环),如下图所示。这种圆锥状环糊精分子具有一个疏水的空穴和一个碳水化合物上的亲水边缘。在残存的葡萄糖上碳原子6上的一级羟基具有较小直径的边缘,葡萄糖上的2和3碳原子上的二级羟基则形成较大直径的边缘。空穴的直径如同一个单独的苯环,或取代基单个的苯环和多环系统的变化。YMC Chiral CD BR液相色谱柱提供了对镜像异构体分离的一个选择方法。环糊精上的溴代衍生物共价键合到YMC硅胶上形成一个新的手性固定相(CSP,Chiral Stationary Phases)。在溴代衍生物中第六个碳原子上的羟基被溴化物取代,从而提供了不同于环糊精的手性异构选择性。这种环糊精溴化衍生物被用于反相模式的液相色谱分离,其具有广范围的分离特性,适合于极性和水溶性化合物的分离,此外,其在相似的条件下也可用于分离芳香族化合物取代基的位置异构体分离。YMC Chiral CD BR色谱柱可在pH 3.5-6.5范围和通常使用的缓冲液色谱系统中使用。但是在保存该种色谱柱时,必须用水/甲醇溶液(80-100%水)将分析后柱内残留的盐分和缓冲液全部冲洗干净,色谱柱必须储存在无盐的水/甲醇(50%甲醇)的条件下。如果可能可用三氟醋酸(THF)清洗除去残留,以再生色谱柱。Chiral CD BR系列液相色谱柱的特点环糊精结构的光学异构体分离柱,有&alpha -、&beta -和&gamma -三种类型的柱填料反相-液相色谱柱;粒径:5?m;孔径:12nm (120?);适用pH范围:3.5-6.5用于光学异构体和结构异构体化合物的分析用于反相、极性和水溶性药物或化合物的位置异构体分离Chiral CD BR系列液相色谱柱的规格和应用实例Chiral CD BR系列液相色谱柱的分析柱和保护柱分析柱     填 料粒径(?m)孔径(?)色谱柱规格(内径x长度)产品编号 &alpha -CD BR51204.6x150mm4.6x250mmDA12S05-1546WTDA12S05-2546WT &beta -CD BR51204.6x150mm4.6x250mmDB12S05-1546WTDB12S05-2546WT &gamma -CD BR51204.6x150mm4.6x250mmDG12S05-1546WTDG12S05-2546WT 保护柱(卡套柱)    填 料粒径(?m)孔径(?)色谱柱规格(内径x长度)产品编号 &alpha -CD BR51204.0x23mmDA12S05-G304CC* &beta -CD BR51204.0x23mmDB12S05-G304CC* &gamma -CD BR51204.0x23mmDG12S05-G304CC*    卡套保护柱柱套XPCHW *. 每包装3支,仅为柱芯;第一次使用时,需另定购柱套(XPCHW,每包装1个)YMC-光学异构体和结构异构体分离柱需要详细的信息请和绿百草科技联系:010-51659766登录网站获得更多产品信息:www.greenherbs.com.cn
  • InertCap CHIRAMIX 对映异构体专用柱
    产品描述对光学异构体有优异的分离度涂布两种以上环糊精衍生剂尖锐峰型GL Sciences公司独创InertCap CHIRAMIX 是涂布了两种以上环糊精衍生剂混合物的固定相专门用于分离对映异构体的毛细管柱。与其他只涂布了一种环糊精固定相的色谱柱相比,InertCap CHIRAMIX 可以作为在很短的时间内分离分析较宽范围化合物的第一优先选择的色谱柱。InertCap CHIRAMIX 是与T. Hasegawa Co., Ltd.合作研发的色谱柱。CHIRAMIX 是T. Hasegawa Co., Ltd 品牌名称.应 用订货信息InertCap CHIRAMIX直径(mm)长度(m)膜厚(μm)最高使用温度(℃)货号0.25300.25iso.180-prog.2001010-69142

位置异构体相关的仪器

  • timsTOF MALDI PharmaPulse 创新timsTOF技术,开启非标记超高通量药物筛选新纪元重新定义非标记高通量筛选带来高通量筛选超高信息容量和通量引领非标记高通量筛选到达新高度快速稳健:timsTOF MALDI PharmaPulse能够实现真正的超高通量筛选,采样速度可高达3孔/秒,并且MALDI源经久耐用。TIMS加持:timsTOF MPP 创新地将离子淌度这一新的维度引入到药物高通量筛选中,捕集离子淌度在实现超快分离的同时,能提供精确的CCS值。高选择性:卓越HTS数据,源于TIMS对于同重素及异构体的分离能力,以及高分辨率、高准确度、高灵敏度的QTOF质谱。灵活多能:卓越性能满足广泛的高通量应用需求,跨越高通量定量到近实时化学合成高通量筛选。非标记质谱技术,实现无偏、深度高通量筛选作为布鲁克PharmaPulse产品线中的一员,timsTOF MPP具有 MALDI 的极快速度和久经考验的稳定性,并且在 HTS 中创新地利用了布鲁克新的捕集离子淌度质谱 (TIMS)技术。 TIMS 通过利用分子碰撞截面实现同重素甚至异构体的快速气相分离,与常规 50,000 质量分辨率(高采集速率下)的 QTOF-MS 检测相结合,可在 HTS 速度下实现分析专属性的质的性提升。timsTOF MPP 具有MALDI / ESI 双离子源和行业先进的 10 kHz smartbeam™ 3D 激光器,可实现与 uHTS 兼容的速度和通量,并提供独特的 MALDI-2 选项进而扩大化学物质检测范围。作为 timsTOF MPP 解决方案的一部分,新的 MALDI PharmaPulse 2023 软件支持广泛用于药物发现的 HTS 应用。 其自动化接口允许在高通量环境中集成 timsTOF MPP,并与来自不同供应商的通用调度软件协同工作。 此外,MPP 2023 可将数据和结果无缝传输到下游像 Genedata Screener之类的分析软件。卓越数据质量,HTS超快速度毫不妥协timsTOF MPP 对于大规模样本,能够在高采样速度下,获得高分辨率、高准确度的 QTOF 质谱数据,从而保证超高通量筛选的成功。1536 孔样品板在高分辨 MS 或 MS/MS 模式下,仅需不到 10 分钟即可完成采集,采样速度可高达 3 样品孔/秒。并且,在大规模样品分析时,timsTOF MPP 能够始终保证卓越数据质量,从而实现从小分子到大分子不同药物的准确定量,降低假阳性率(FDR)。TIMS离子淌度优势:快速分离同重素和异构体对于只通过质量无法区分的同重素甚至是异构体,TIMS 能够快速分离,并且与 SPE 等方法相比能大幅缩短时间( 每个分离周期通常≤ 1秒 ),从而对目标化合物实现无干扰的定量。例:在存在异构体果糖(C6H12O6)的情况下,采用MALDI-TIMS-MS对葡萄糖(C6H12O6)进行定量。高阶 timsTOF 运行模式,提升定量结果在涉及生化或细胞分析等的高通量筛选中,目标化合物的定量通常会受到复杂样品基质的影响。timsTOF MPP独特的性能可解决背景干扰难题:捕集离子淌度(TIMS)实现气相中的快速分离,高分辨MS及MS/MS提升专属性,高阶timsTOF MPP运行模式在HTS的高速下有效减少背景干扰,从而提升定量结果。 例:对类药分子(MW 543 Da)进行定量分析在MALDI-MS模式下由于背景干扰难以定量。采用MALDI-TIMS-MS/MS模式即可排除干扰,实现对目标分子定量。样本提供:Dr. Frank H. Büttner & Team, Drug Discovery Sciences, Boehringer Ingelheim Pharma GmbH & Co. KG, Biberach, GermanyMALDI PharmaPulse 2023:专为HTS工作流程而设计的软件作为 timsTOF MPP 解决方案的一部分,MALDI PharmaPulse 2023 软件能够满足药物早期发现 HTS 应用的广泛需求。软件界面简单易用,结合 TIMS 和 MS/MS 的灵活多样的 timsTOF MPP 操作模式,方法设置简单,易于执行。MPP 2023 提供的自动化界面能够使HTS与不同供应商的自动化调度软件协同工作。此外,MPP 2023 可将数据和结果直接传输到第三方下游分析软件,比如 Genedata Screener。全新一代基于质谱的非标记 HTS 及 uHTS 完整解决方案以布鲁克timsTOF质谱为核心的解决方案,同时配备:MALDI/ESI 双离子源MALDI 样品盘自动加载机械臂MALDI-2 离子源(可选)轻型的靶板适配器,能够让实验室机器人在全自动样品处理及后续数据采集时保证MADLI靶板安全。采用低成本高效益的一次性MALDI样品靶板,可与高效液体处理器配合,进行自动化样本制备,支持96孔到1536孔靶板,甚至更高通量的靶板。酶活性筛选,结果即时呈现timsTOF MALDI PharmaPulse 在HTS高速下,能够对酶活性进行超高性能非标记筛选。经实验验证,采用timsTOF MPP定量酶反应终产物葡萄糖浓度,并以13C6 标记葡萄糖作为内标,不同的生物工程酶变体活性测定结果稳健可靠,RSD在0.1-3.7%之间。带 CCS 值的多维筛选,实现近实时化学合成高通量筛选对于新药研发,高通量实验通过多变量高通量化学方法,产生大量新设计的化合物。这个过程中的关键瓶颈在于如何对这些化学反应产物进行快速分析确认。timsTOF MPP 能够与高通量化学合成同步,对合成产物实现近实时的确证,并且通过对化合物多维物理性质(如准确分子量、同位素分布、碰撞截面积 CCS 值、CID-MS/MS 碎片信息等)的测定,增加结果可信度,减少高通量实验反馈时间及化学品消耗。MALDI-2: 进一步扩展检测范围MALDI-2,作为基于激光后电离的创新型技术,可进一步拓展传统MALDI源可检测的化合物种类范围,从而进一步扩展分析应用范围。
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  • 沃特世公司的大规模超临界流体色谱(SFC)纯化系统套件针对需要纯化的样品量提供最佳系统。这些系统使您容易地纯化大量单一样品。如果更快、更高效的目标维系着企业经营命脉,那么SFC纯化技术是您勿庸置疑的选择。 制备规模SFC 80、200和350系统是具有助溶剂梯度、定量回收纯化产物(例如对映异构体、复杂合成化学品和天然产物)的高压分离器的自动系统。这些系统设计用于手性和非手性分离。 特征: 高压CO2泵高压助溶剂泵进料模组UV-Vis检测器馏份收集模组自动背压调节器(ABPR)SuperChrom软件
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  • timsTOF Pro 2由平行累积连续碎裂技术( PASEF )驱动,使得 4D-蛋白质组学和 4D-脂质组学为无偏向性细胞和血浆蛋白质组学、液体活检多组生物标志物发现,以及整合基因组学、蛋白质组学和表观蛋白质组学拓宽了道路。4D-组学时代 —— 解锁第四维度的价值4D-组学的重大突破速度:PASEF 技术实现了在不影响分辨率情况下达到超过 120 Hz 扫描速度。深度:额外一维离子淌度提高了数据完整性。高通量:超快数据采集速度使其可以使用短梯度实现生物样本的高通量分析。耐用性:独特的仪器设计使得其可以连续分析数千个样品,仪器保持稳定的性能而无需清洁。4D-Proteomics&trade 的新标准:更快速度实现蛋白质组全覆盖基于质谱( MS )的蛋白质组学一次可实现样本里成千上万蛋白的定性和定量。然而,受到目前质谱仪的扫描速度、灵敏度和分辨率的影响,实现蛋白质组的全覆盖仍然具有挑战性。timsTOF Pro 2 使用平行累积连续碎列( PASEF )的技术可实现极高的扫描速度和灵敏度,只需要少量样本就可以达到蛋白质组学鉴定新深度。双 TIMS 和 CCS 的分析捕集离子淌度谱( TIMS )首先是一项重要的气相分离技术,它是在高效液相色谱( HPLC )和质谱分离的基础上,带来额外一个维度的分离,可大大降低样品分析复杂度,极大提高峰容量和分析物鉴定可靠性。同样重要的是,TIMS 离子淌度管能对离子实现时间和空间上的聚焦,从而独特地提高灵敏度和扫描速度。双 TIMS 技术可以实现近乎 100% 的离子利用率,离子在前一根淌度管内累积,在后一根淌度管内根据离子淌度值分批释放。这种平行累积连续碎裂( PASEF )的过程能够实现碰撞横截面( CCS )的分析。CCS 额外一个维度信息能够提供很多进一步的分析可能性,可以从复杂数据库实现化合物的高可信度库匹配以及更低的错误发现率( FDRs )。4D-Proteomics&trade 的新标准:更快速度实现蛋白质组全覆盖基于质谱( MS )的蛋白质组学一次可实现样本里成千上万蛋白的定性和定量。然而,受到目前质谱仪的扫描速度、灵敏度和分辨率的影响,实现蛋白质组的全覆盖仍然具有挑战性。timsTOF Pro 2 使用平行累积连续碎列( PASEF )的技术可实现极高的扫描速度和灵敏度,只需要少量样本就可以达到蛋白质组学鉴定新深度。双 TIMS 和 CCS 的分析捕集离子淌度谱( TIMS )首先是一项重要的气相分离技术,它是在高效液相色谱( HPLC )和质谱分离的基础上,带来额外一个维度的分离,可大大降低样品分析复杂度,极大提高峰容量和分析物鉴定可靠性。同样重要的是,TIMS 离子淌度管能对离子实现时间和空间上的聚焦,从而独特地提高灵敏度和扫描速度。双 TIMS 技术可以实现近乎 100% 的离子利用率,离子在前一根淌度管内累积,在后一根淌度管内根据离子淌度值分批释放。这种平行累积连续碎裂( PASEF )的过程能够实现碰撞横截面( CCS )的分析。CCS 额外一个维度信息能够提供很多进一步的分析可能性,可以从复杂数据库实现化合物的高可信度库匹配以及更低的错误发现率( FDRs )。极高的稳定性和通量无需清洗许多用于蛋白质组学应用的 MS 仪器需要每月清洁一次,在大样本组中每天 24 小时运行。仪器性能下降即使在较短的时间段内也是显而易见的。timsTOF Pro 2 卓越稳定性意味着仪器可以全天运行很多周,而没有明显的信号和其它性能下降。PaSER Run & Done —— 加快4D-蛋白质组学的鉴定速度PaSER( 实时平行搜索引擎 )是一个结合硬件和软件的解决方案,能够实现基于样本序列管理的实时数据库搜索引擎。PaSER 以很快的速度就能提供结果,包括 PTM 搜索。通过使用基于 GPU 的搜索,PaSER 在实时或离线模式下可以提供相同的结果,而无需使用简化的算法或中间步骤。PaSER 极快的搜索速度使得在数据采集结束后数秒就能同步拿到搜库结果,真正实现运行并完成! PaSER 有效地打破了大队列样本数据分析通量壁垒。此外,实时蛋白组学的非标记定量也可以跨越 PaSER 获得的数据结果集,使其瞬间能过渡到定量蛋白质组学。通过 TIMS Viz 使得淌度偏移质量对齐( MOMA )变得可视化 ,从而用户可以鉴定和识别只有 4D-Omics 才能看到的共洗脱多肽。 dia-PASEF 增加鉴定可信度dia-PASEF比传统的 DIA 方法有更高灵敏度和选择性,是因为它将 PASEF 原理也应用进来,结合了 DIA 的优点和 PASEF 离子利用率高的优势。TIMS 分离提高了选择性,而且可以将单电荷母离子排除掉,从而降低本底噪音干扰。利用分子量和碰撞横截面 CCS 值的相关性,dia-PASEF 能够实现高可信度化合物鉴定。在 LC-MS/MS分析中, dia-PASEF 能够采集包含 m/z,离子淌度值( CCS ),保留时间和离子强度的 4D 数据。前所未有的蛋白质覆盖深度凭借强大的 SRIG( 不锈钢堆叠环形离子向导 )装置和新优化的 dda-PASEF 方法 ,timsTOF Pro 2 单针能够达到前所未有的蛋白组学覆盖深度。使用自制 HEK 酶切样本, 上样 200 ng,使用 Aurora - 25cm 色谱柱,在 60 分钟梯度下能够鉴定 超过 7,000个 蛋白和 60,000 条多肽。因此 timsTOF Pro 2 可以通过数据库搜索和运行之间的匹配,无需任何谱图库,在一些日常细胞系蛋白组定量实验中实现很高的蛋白覆盖深度。超高灵敏度的高通量靶向蛋白质组学和常规的靶向蛋白组学分析技术( SRM 和 PRM )相比,prm-PASEF 在单针中可极大提高监测多肽数目,同时不影响仪器选择性或灵敏度。靶向质谱( MS )技术是蛋白质组学实验中一种强大的技术,用来验证大队列样本中的候选生物标志物。与数据依赖采集( DDA )和数据非依赖采集( DIA )相比,这可以增加检测灵敏度。可是该技术受到在单针中监测离子数目和液相分离出峰时长以及整体灵敏度间的折中限制。只有通过更长的色谱分离时长或降低质谱的灵敏度和选择性,才能获得大量目标肽的完整数据。prm-PASEF 可以极大地提高单针中靶向监测的多肽数目,这得益于布鲁克 timsTOF Pro 2 的第四维分离可以极大提高选择性和灵敏度, PASEF 技术带来的速度可以增加靶向分析离子数量。超高灵敏度应对最困难的分析挑战随着某些特定细胞、少量细胞群或生物穿刺样本的生物研究越来越重要,低样本量蛋白组定量变得至关重要。而如此低的样本量对于质谱灵敏度提出了很高要求。使用高灵敏度的质谱仪对如此低的样本量进行原型定量至关重要。timsTOF Pro 2 上样 200 ng HeLa 样本,使用 Aurora - 25cm 色谱柱,在 30 分钟梯度下使用 PaSER 能够鉴定超过 74,200 个蛋白和接近 30,000 条多肽。dia-PASEF —— 高通量定量蛋白质组学中实现无与伦比的数据完整性和分析深度使用标准 dia-PASEF 方法多针测试结果有着很高重复性。三种不同的 dia-PASEF 窗口设置下使用 Aurora-25cm 柱在 60 分钟梯度下可实现接近 8,000 个蛋白定量和超过 70,000 条多肽,而且有极高的定量准确性。高灵敏度磷酸化蛋白组学分析和同分异构体分离支持 CCS 的近邻位磷酸化位点定量dia-PASEF 在 timsTOF Pro 2 上的高灵敏度、扫描速度和重现性甚至可以实现低样本量的磷酸化蛋白质组学分析。例如可以实现小鼠脑样本起始总蛋白仅为 25 μg 的磷酸化蛋白质组的非标记定量。使用 Evosep 每天 30 个样本的分析方法,三次重复可鉴定出多达 4,473 个 unique 磷酸化多肽。这些结果为针刺活检的应用带来了希望,可以用信号转导的信息补充癌症蛋白质基因组学数据。这些结果为针刺活检的应用带来了希望。此研究结果由 Stefan Tenzer 教授提供。分析样本量有限时的细胞信号传导当肽段在色谱上发生共洗脱时,由于等重性和信号重合,不能测量 CCS 值的传统蛋白质组学是不能实现磷酸化肽异构体的定量的。PASEF 技术使得基于 TiO2 富集时,使用 150 ug 蛋白富集起始量就能够鉴定 27,768 个磷酸化肽,展现了淌度偏离质量对齐( MOMA )的优点。1,946 条鉴定的共洗脱异构体中,20% 的异构体可以被TIMS 完全分离,这可以使得我们可以更好地理解邻位蛋白磷酸化位点信息。
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  • 【讨论】头孢哌酮S异构体的结构问题。。。

    【讨论】头孢哌酮S异构体的结构问题。。。

    哪位老师知道头孢哌酮的s异构体是哪个C原子的手型导致的啊?就是药典中所述头孢哌酮s异构体是指哪个C原子? 另外有文献指出如下:“头孢哌酮钠在C3位可形成同分异构体,即日抗基所称副产物II,质量标准中控制限度1.5%。需要注意的是,头孢哌酮常有一未知杂质容易被误为认为是S-异构体,但是其UV吸收与S-异构体不同,可采用二极管阵列检测器进行鉴别或者控制。”这里所说的一未知杂质具体是哪个有老师知道吗?另外一篇文献显示头孢哌酮手性碳如图,该碳引起的异构体是否是药典中的S异构体呢?file:///C:/Users/ADMINI~1/AppData/Local/Temp/PQL651~GYQV‚3)CJ$JHK2.jpghttp://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/01/201101102123_273270_1352078_3.jpg这EP中有关物质F的手性碳不同。有没有可能该图即为上一文献中的未知杂质呢???谢谢指导。。

  • 求助烯烃异构体的分离

    各位老师大家好,我现在遇到一个很棘手的问题,就是一对烯烃的异构体没有办法分离,大家有没有什么烯烃异构体分析的经验啊,请指点迷津啊! 这对烯烃的碳原子在20个左右,就是烯烃的双建的位置不一样,很难分离,液相气相能想到的方法差不多都试过了,还是没有分开。

  • 多溴异构体怎么做?

    多溴那么多异构体!标准品也不可能都买。现在就买了些常规的,大概二十几个。做的时候先SCAN一下,在已有标准品的出峰位置看一下,然后定性定量。但是其他的怎么弄呢,而且异构体的出峰时间相差也比较大?

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  • 使用共价标记质谱区分组氨酸互变异构体
    大家好,本周为大家分享一篇发表在Anal Chem.上的文章,Distinguishing Histidine Tautomers in Proteins Using Covalent Labeling-Mass Spectrometry [1]。该文章的通讯作者是来自马萨诸塞大学阿默斯特分校的Richard W. Vachet教授。组氨酸是人体蛋白质结构中的重要组成氨基酸,研究发现,组氨酸具有Nδ-H和Nε-H两种互变异构体,通过两种互变异构体的转换,可以在蛋白质中介导质子转移。目前常使用2D NMR技术进行区分,但操作相对繁复。共价标记质谱是一种研究蛋白质结构的有力方法,具有操作简单,灵敏度高,结构分辨率高等优点。在本文中,作者尝试以焦碳酸二乙酯(DEPC)为标记试剂,采用共价标记质谱区分组氨酸互变异构体。组氨酸侧链的咪唑上具有两个氮原子,其中一个氮上的孤电子对参与芳香环π键的组成,而另一个氮原子仍保留孤对电子,更容易与DEPC等亲电子试剂反应。而组氨酸的两个互变异构体中都只有一个保留孤对电子的氮原子,且该氮原子位置不同,Nδ-H互变异构体中的Nε2与DEPC反应,而Nε-H互变异构体中的为Nδ1。因此以DEPC标记组氨酸以区分两个互变异构体的方法是可行的(图1)。图1. DEPC 结构及其与两种不同组氨酸互变异构体的反应 为了测试DEPC 标记区分两种互变异构体的能力,作者以几种含组氨酸的肽,在确保DEPC仅标记组氨酸条件下进行实验。以Fmoc-DGHGG-NH2为例子,该肽在N端包括一个Fmoc基团以确保仅标记组氨酸。采用等度洗脱来最大限度地利用LC分离两种异构体,并确保流动相组成不影响肽段电离效率,从而可以更好地量化每个互变异构体的比率。结果发现,在11.4和13.6分钟洗脱的峰具有相同的m/z值(图2)。根据串联MS数据,发现这两个峰代表着组氨酸上成功标记DEPC的单一物质(图3)。并且,这些同量异位离子的串联质谱不同,表明这两种物质为带有不同组氨酸互变异构体的物质。作者将先洗脱出的物质命名为修饰物质1,后洗脱出的为修饰物质2。根据MS/MS数据,两者的主要区别为修饰物质2具有更加丰富的羧基化a3离子(a3*)。图2. 未标记(蓝色迹线)和 DEPC 标记(红色迹线)肽 Fmoc-DGHGG-NH 2的提取离子色谱图。DEPC浓度比肽浓度高10倍,反应1分钟图3. 两种修饰的His异构体的串联质谱。(a)来自图2中的色谱图的修饰物质 1 的串联质谱。(b)来自图2中的色谱图的修饰物质2的串联质谱。标有星号 (*) 的产物离子包含羧基化产物此外,在重复实验中,作者发现物质2与物质1的丰度比为3.9± 0.2。而研究发现,在中性pH条件下,游离氨基酸Nε-H 互变异构体与 Nδ-H 互变异构体的比接近于4:1。因此,两物质的峰面积比表明物质1可能为 Nδ-H 互变异构体,而物质2可能为 Nε-H 互变异构体。结合以上发现,并考虑肽解离途径等因素,作者对两物质质谱图谱差异做出推测。当物质2为Nε-H互变异构体侧链时,DEPC 标记在Nδ1上,有利于肽通过bx-yz途径解离,随后通过bx-ax途径损失CO,因此物质2富含a3*离子。当物质1为Nδ-H 互变异构体时,DEPC 标记在Nε2上,肽通过组氨酸途径解离,并形成了稳定五元环,因此优先形成更稳定的b3*离子(图4)。以上发现进一步证明了Fmoc-DGHGG-NH2中物质1为 Nδ-H 互变异构体,物质2为 Nε-H 互变异构体。根据丰度比以及肽解离途径不同,作者在其他模型肽标记实验中也成功区分两互变异构体。由于组氨酸的pKa在一定程度上会影响互变异构体的比例,因此两互变异构体的丰度比可能会略有变化。总之,以上结果表明,DEPC共价标记质谱可以识别两个组氨酸互变异构体。图4. DEPC 标记的含组氨酸肽 CID 过程中两种异构体的肽片段化途径。左侧通路为物质1(Nδ-H互变异构体),右侧通路为物质2(Nε-H互变异构体)之后,作者还进一步研究了不同DEPC浓度对实验的影响。结果发现,在 DEPC 浓度范围超过一个数量级时,Fmoc-DGHGG-NH2的两种修饰形式的比率基本在4左右保持恒定,其他模型肽的比率略有不同(图5),但随着 DEPC 浓度的增加,给定肽的标记比率保持不变。在质谱可以确认互变异构体结构的肽中,Nε-H互变异构体总是丰度相对更高,洗脱相对较晚。此外,作者发现当组氨酸不是位于N末端残基时,Nε-H 互变异构体的an */bn *比率总是比Nδ -H 互变异构体的更高。但是,若组氨酸残基位于肽的N末端时,在质谱中观察不到b1和a1离子,将对结果造成影响。图 5. 在 DEPC 浓度增加时选择肽的两种修饰形式的标记比率。(a) Fmoc-DGHGG-NH2;(b) Ac-IQVYSRHPAENGK(Ac);(c) Ac-VEADIAGHGQEVLIR;(d) Ac-LFTGHPETLEK(Ac)。MS/MS 用于通过测量an /bn离子的比率来确认每个互变异构体总而言之,作者成功使用DEPC共价标记质谱区分肽与蛋白质中的组氨酸互变异构体,利用丰度比与洗脱时间,以及CID期间的肽解离模式,区分两种互变异构体。利用该方法,作者团队已经确定了几种蛋白质组氨酸互变异构体比率,并且相对于2D NMR方法,该方法更简单、更快、更精确,有利于探索蛋白质中组氨酸残基周围的局部结构,提供高分辨率的结构信息。[1]Pan X, Kirsch ZJ, Vachet RW. Distinguishing Histidine Tautomers in Proteins Using Covalent Labeling-Mass Spectrometry. Anal Chem. 2022 Jan 18 94(2):1003-1010.
  • 清华大学脂质同分异构体及小型质谱研究成果登Nature子刊
    p  最新一期的Nautre Methods杂志对清华大学瑕瑜课题组和欧阳证课题组在脂类同分异构体及小型质谱技术研究中取得的进展进行了报道。长期以来,质谱小型化技术被国外研究机构所垄断,欧阳证课题组的研究为我国在质谱仪的研发与产业化领域争取到了“原创话语权”。脂类同分异构体中C=C双键位置的确定在全世界一直是难点,瑕瑜课题组利用Paternò –Bü chi反应找到了定位C=C双键的方法,为脂质组学开辟了一个全新的研究维度。/pp style="text-align: center "img title="5.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201801/insimg/256c243d-6a9f-40d6-a0d8-13f84fb196f5.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体,楷体_GB2312, SimKai "Nautre Methods杂志是Nature子刊,影响因子25.06,主要提供生命科学领域的新方法和基础研究技术重大进展的相关报道/span/pp  span style="color: rgb(79, 129, 189) "strong根据C=C做脂质组学定性、定量分析/strong/span/pp style="text-align: center "img title="1.jpg" style="width: 230px height: 295px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201801/insimg/ac5de0cd-a2ab-4b34-a39f-a9f38337697c.jpg" height="295" hspace="0" border="0" vspace="0" width="230"//pp style="text-align: center "strong清华大学教授 瑕瑜/strong/pp  瑕瑜长期从事生物质谱为基础的气相化学自由基研究,一个偶然的机会,瑕瑜课题组的马潇潇博士(现为清华大学精密仪器系助理教授)在进行光化学自由基反应时发现受激发的丙酮与脂质C=C反应的结果并没有形成断裂加成峰,而是整个丙酮加到脂质分子上去。查阅资料之后,发现这是一个已知反应Paternò -Bü chi(PB反应)。根据PB反应的机理就能够清晰地解析离子碎裂谱图从而确定C=C位置。“这个发现对确定脂质同分异构体C=C位置,以及进行脂质定量分析非常有帮助。”瑕瑜说。/pp style="text-indent: 2em "从2014年发表第一篇文章起,他们将这一理论应用在了脂质组学研究中。 PB反应在鸟枪法策略中进行脂质同分异构体的定性与定量分析的研究已经取得了成功。目前,PB反应在液质联用策略中的脂质组学分析研究工作也已经完成。瑕瑜表示:“液质联用分析脂质组学能够得到更多的分子信息,应用面会更加广泛。将PB反应用在这个技术中,能够给脂质组学的发展提供更多机会。”/pp  strongspan style="color: rgb(79, 129, 189) "小型质谱技术简化脂质分析工作流程/span/strong/pp style="text-align: center "img title="2.jpg" style="width: 230px height: 295px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201801/insimg/e3ddfcc2-869d-4a4b-a052-469cdb80b27a.jpg" height="295" hspace="0" border="0" vspace="0" width="230"//pp style="text-align: center "strong清华大学教授 欧阳证/strong/pp  不同双键位置揭示的是不同的代谢通路,不同的发病机理,通过脂质同分异构体的定性与定量分析,可应用于临床诊断。现有的商业脂质解析数据库并不包括脂质C=C位置信息,并不能进行脂质同分异构体的定性与定量分析。目前,欧阳证与瑕瑜的研究团队正在进行基于小型质谱的包含C=C位置信息的脂质组学分析工作。“我们希望让更多做脂质组学研究的人知道这个技术,并通过建立数据库帮助到需要了解脂质C=C信息的研究。”欧阳证在谈到该数据库的建立时说,“事实上,我们将要建立的不止是一个数据库,而是包括前端液相方法、PB反应、质谱方法、数据库与软件分析在内的整体工作流程。”/pp style="text-indent: 2em "该工作已取得了一系列产业化成果,由欧阳证创立的清谱科技在10月份召开的BCEIA2017上推出了Mini β小型质谱仪、脂质组学双键定位系统Ω反应器以及MS Mate快速检测方案,结合了PB光化学反应的特异性、高效性以及质谱检测的特异性和灵敏度,可实现脂质中双键的快速定位、精准定量、全方位读取。此外,搭载的庞大的数据库可以实现数据检索、数据读取、报告生成一体化工作流程。/pp style="text-align: center "img title="3.jpg" style="width: 400px height: 290px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201801/insimg/9b657d8e-0702-4f7b-a363-4b1a7a569ed6.jpg" height="290" hspace="0" border="0" vspace="0" width="400"//pp style="text-align: center "strongMini β小型质谱仪/strong/pp  Mini β小型质谱仪与液质联用分析脂质组学的方法相比,突破了实验室环境的束缚,其简化的工作流程,大大降低了对操作人员专业性及检测环境的要求,可在现场检测,更利于质谱脂质分析走向临床、基层。/pp  更多详细内容:/pp style="text-align: left text-indent: 2em "a title="" href="http://www.instrument.com.cn/news/20170616/222209.shtml" target="_blank"span style="color: rgb(79, 129, 189) "C=C位置探索思路或将发现脂质生物标志物——访清华大学瑕瑜教授、欧阳证教授/span/a/pp style="text-align: left text-indent: 2em "a title="" href="http://www.instrument.com.cn/news/20171013/230960.shtml" target="_blank"span style="color: rgb(79, 129, 189) "十年一剑 欧阳证带领清谱科技推出Mini β小型质谱分析系统/span/a/p
  • 清华精仪系团队实现高分辨生物分子异构体分析研究
    研究背景与成果生物分子的结构解析与相关生物学功能的关联研究已成为现今生命科学的前沿。生物分子存在多级结构,而其结构复杂度的一个重要因素为分子异构。不同的异构分子(Isomers and isoforms)具有相同的化学式和分子量,但化学结构不同。例如,单糖存在多种异构体,包括葡萄糖、果糖、半乳糖等;多糖由单糖两两通过糖苷键相互连接组成,导致出现更为复杂的构造异构(分子中原子或原子团互相连接次序不同,Structural or constitutional isomers)和立体异构现象(连 接 次 序 相 同 但 空 间 排 列 不 同,Spatial isomers or stereoisomers)。离子迁移(Ion mobility, IM)与质谱(Mass spectrometry, MS)联用(IM-MS)分析已经发展为生物分子特别是生物大分子结构解析的一种主要手段,并成为质谱仪器发展的主要方向。IM可以区分MS不能区分的异构体或同重素(Isobars),这一独到的特性对生物分子的结构解析研究十分关键,近年来被广泛用于糖结构、脂质结构、蛋白质结构和活性、蛋白质-分子相互作用等研究中。近年来,多种IM 分析方法被纷纷提出,例如迁移时间 DTIMS (Drift time ion mobility spectrometry)、囚禁式 TIMS(Trapped ion mobility spectrometry)、行波 TWIMS(Travelling wave ion mobility spectrometry) 以及非对称场 FAIMS(Field asymmetric ion mobility spectrometry)等。然而,这些技术均基于低E/N场原理(E/N 30 Td,E代表电场场强,N代表中性气体数密度,Td是Townsend数),分离分辨率一般在40-200,不足以解决目前生物分子异构体解析研究的迫切需求。图1. 离子云扫描分析技术的仪器设置、原理和性能表征。(a)Mini β质谱仪器系统。(b)实验装置示意图。(c)离子云扫描技术原理。强迫振动下的两种异构体离子(紫色和蓝色)的离子轨迹。(d)获得的离子云扫描谱图。针对以上难题,清华大学精密仪器系生物医学仪器与应用研究团队向高E/N场寻求突破离子迁移分析低分辨率的局限,提出一种超高场离子云扫描技术,并在Mini β质谱仪器系统(PURSPEC科技(北京)有限公司)上实现迁移分辨率超过10,000的高分辨IM分析,提升较现有技术水平一个数量级以上(图1)。超高场离子云扫描技术采用强迫振荡的物理原理,在超高场(约1×105 Td)条件下实现异构体离子的离子云分离,通过扫描激发振荡电压可以获得异构体离子的高分辨IM谱图。成果优势利用高场离子云扫描分析技术,对四种二糖异构体 (海藻糖、麦芽糖、纤维二糖和乳糖,图2a)开展了结构分析(图2b),并对乳糖和纤维二糖的混合物进行了离子云扫描分析(图2c),并与传统串联质谱分析(图2d)结果对比。从图2d可见,乳糖和纤维二糖具有到相同的碎裂模式,无法通过串联质谱技术加以区分。但这两种异构体可以通过离子云扫描实现完全分离(图2c)。此外,离子云扫描分析技术也展现出优异的定量分析特性(图2e和2f)。图2. 二糖异构体分析。(a)四种二糖异构体及其(b)离子云扫描谱图。乳糖和纤维二糖混合物的(c)离子云扫描谱图和(d)串级质谱分析谱图。(e)两种二糖标准品及(f)混合物的定量分析结果。离子云扫描技术对各类生物分子异构体具有普遍适用性。如图3所示,该技术同样可分辨脂质和多肽分子异构体。研究工作中,离子云扫描方法展现出多种优点,如分析部件结构简单、操作方便、具有强大的时间/空间串级质谱能力等,可以方便地与多类质量分析器联用,用于设计混合型串联分析质谱仪器,在生物分子复杂结构解析上展现出较好的应用前景。图3. 脂质与多肽异构体分析。(a)脂质异构方式示意图。各种脂质异构体的离子云扫描谱图:(b)sn异构、(c)碳碳双键位置异构和(d)双键顺反异构。(e)多肽的不同翻译后修饰类型及其异构方式示意图。不同翻译后修饰类型的多肽异构体离子云扫描谱图:(f)甲基化、(g)乙酰化和(h)磷酸化。本研究由国家自然科学基金项目和清华大学精准医学科研项目资助。论文第一作者为清华大学精仪系周晓煜副教授,通讯作者为欧阳证教授,其他作者还包括精仪系博士生王卓凡和范菁津,第一完成单位为清华大学精密仪器系精密测试技术与仪器国家重点实验室。这项研究也得到了清华大学化学系瑕瑜教授、精仪系马潇潇副教授与张文鹏助理教授的大力帮助。
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