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中国医学科学院JBC解析抑癌miRNA

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中国医学科学院JBC解析抑癌miRNA 来自中国医学科学院的研究人员在新研究中证实,miRNA-200b通过影响Pin1的表达控制了失巢凋亡(anoikis),且miRNA-200b的表达受到两个ETS家族成员PEA3和ELK-1的调控。这些研究发现在线发表在9月26日的《生物化学杂志》(JBC)上。 论文的通讯作者是中国医学科学院北京协和医学院的刘志华(Zhihua Liu)博士。其回国前曾在美国哈佛大学从事生物医学和计算生物学方面的研究工作,目前主要研究方向是计算生物学和系统生物学。 转移是恶性肿瘤最重要的一个特征。转移的基本步骤包括局部侵袭、进入血管(或淋巴管)、在循环中生存、渗出血管(淋巴管)、移植到新位点,及定植。在癌细胞离开原发肿瘤后,它们必须以一种“流离”(homeless)状态生存。这要求它们具备抗失巢凋亡的能力,而这种能力的调控涉及到多个信号机制。 MicroRNAs (miRNAs)是一类长度为19-23个核苷酸(nt)的非编码小RNA分子,可以通过与靶mRNA的3’非翻译区(3’UTR)相互作用来调控基因的转录后表达。近年来的研究已揭示了各种各样与癌症转移相关的miRNAs。 其中,miRNA-200s家族通过沉默E-cadherin的转录抑制子ZEB1/2来调节上皮间质转化(EMT)过程,由此影响了癌症转移。miRNA-200s下调减少了E-cadherin的表达,导致癌细胞容易脱离原发肿瘤,从而使癌细胞处于一种流离状态。这些癌细胞必须随后获得抗失巢凋亡的能力。

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外显子测序成诊断遗传病新希望

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外显子测序成诊断遗传病新希望 当一个婴儿迟迟不会爬或说话,或者出现其他症状表明其可能有遗传性疾病时,家长寻找答案的过程通常是漫长且令人沮丧的。医生可能会安排一系列的测试,但仍不能得出一个特定的诊断结果。 现在,价格便宜的DNA测序能有助于揭示这些神秘疾病的原因。该方法是对病人编码蛋白质的DNA中的1%(外显子组)进行测序,从而为找到疾病背后遗传基因上的罪魁祸首筛选数据。 在近日的《新英格兰医学杂志》上,研究人员报道使用外显子组测序技术成功查明了250名病人中的25%存在潜在的基因突变,这些孩子大多患有神经系统疾病。在他们中,有3人罹患有狄兰吉氏症候群,该病能引起认知延迟和与众不同的面部特征,诸如又长又粗的眉毛和向下翻的嘴唇。该成功率意味着外显子组测序技术能够常规应用于临床诊断一系列罕见的遗传疾病。

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我国首个抗病毒蛋白质生物农药问世

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我国首个抗病毒蛋白质生物农药问世 记者日前从中国农业科学院植物保护研究所获悉,由该所邱德文研究员领衔的科研团队成功研制出我国首个防治植物病毒病的蛋白质生物农药——“6%寡糖·链蛋白可湿性粉剂”,该药剂属蛋白质生物农药,对环境和植物本身安全、低毒、无污染,有利于农业的可持续发展。 据邱德文研究员介绍,科研人员大量筛选了弱致病性病原真菌,获得能高效提高植物免疫的极细链格孢菌株,分离纯化高活性热稳定蛋白,通过高效蛋白生产加工工艺,并添加增效因子氨基寡糖素,配制成“6%寡糖·链蛋白可湿性粉剂”,这种蛋白质生物农药通过诱导植物自身抗性,激发植物生长代谢和自身免疫系统而提高农作物抗性。

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Science探索癌症的未知世界

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Science探索癌症的未知世界 由耶鲁大学领导的一个研究小组,通过对人类自然遗传变异和癌肿瘤变异进行海量数据分析,揭示了数十个乳腺癌和前列腺癌形成过程中的突变。研究结果发表在10月4日的《科学》(Science)杂志上。 新发现的这些突变均位于不编码蛋白质但却能影响其他基因活性的DNA区域。科学家们认为,这些区域代表了一个未知的世界,研究人员和医生们可从中获得关于癌症病因和治疗的新认识。 论文的共同资深作者、生物医学信息学教授Mark Gerstein说:“这使得我们能够采用一种系统的研究方法来阐析癌症基因组。现在我们不必再将自身锁定在编码蛋白质的约1%的基因组区域上,而是能够探索我们其余的DNA区域。” 这一分析是将几个庞大的研究计划进行了统计学合并,其中的每项计划均提供了有关我们的基因组——生命遗传蓝图的一些突破性认识。 千人基因组计划(1000 Genomes Project)主要编译大量个体的个人基因组。这一数据有助于精确描绘出个体内变化较少,因而对于人类健康至关重要的DNA区域。DNA元件百科全书(ENCODE)计划则致力于编撰人类基因组中每个位点的功能目录。

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人类癌症的致癌全景图

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人类癌症的致癌全景图 用于新型癌症治疗方法的临床试验设计,一般来说都是集中在肿瘤起源所在的组织,然而近期由纪念斯隆-凯特琳癌症中心的研究人员完成的一项研究则发现了一种新的方法:基于基因组标记进行研究,而不是针对机体器官组织进行研究。 这一研究成果公布在9月26日的Nature Genetics杂志上,同时还有多篇文章将陆续发布于各大期刊杂志。这些成果利用了来自癌症基因组图集(Cancer Genome Atlas,TCGA)的数据。这一项目由美国国家卫生研究院(NIH)提供资金资助,旨在收集超过 20 种癌症,每种癌症多达 500 个肿瘤的基因组信息,其中包括所有编码蛋白质基因序列。 众所周知,癌症的出现是一个多步骤的复杂过程,由于此前癌症基因组图谱(TCGA)的努力,以及其他大规模癌症基因组研究成果,这一过程已经被解析成了精确分子事件细节,从中描绘了影响单个人体细胞20,000个基因的突变和其他分子事件。 现在,研究人员根据针对超过来自12个不同肿瘤类型的3000个样品基因组分析,提出了两个主要的假设: 有限数量的特殊遗传事件可能引发了大多数肿瘤亚型;无论肿瘤来自何种器官组织,可以通过肿瘤所具有的致癌标记来给肿瘤分类。这些致癌标记很大程度上独立于癌症所在的特定组织,这表明某些药物组合也许有助于筛选患有特殊类型肿瘤的病患。

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北大解决克隆技术伦理难题

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北京大学近日公布一科研成果称,一只叫做“贝贝”的黑白相嵌小鼠在其生命科学学院干细胞和再生生物学实验室的诞生,不仅验证了2012年的诺贝尔生理学或医学奖获奖理论,还意味着未来白血病、糖尿病等疾病的治疗可能迈进一大步——细胞移植和器官移植所需的细胞来源有望得到解决。 7月18日,国际学术权威杂志《科学》(Science)刊登了北京大学生命科学学院教授邓宏魁和博士后赵扬带领的研究团队的一项革命性研究成果——用小分子化合物诱导体细胞“重编程”为多潜能干细胞。该成果开辟了一条全新的实现成体细胞“发育时钟”逆转、体细胞“重编程”的途径,给未来应用再生医学治疗重大疾病提供了新的可能。 2012年,由于发现可以重新编程的成熟细胞以及诱导多潜能干细胞,日本科学家山中伸弥与英国科学家约翰·格登获得诺贝尔生理学或医学奖。 由于哺乳动物细胞只有在胚胎的早期发育阶段才具有分化为各种类型组织和器官的多潜能性,而随着生长发育成为成体细胞之后,会逐渐丧失这一特性,因此,人类一直在寻找方法让已分化的成体细胞逆转,使之重新获得类似胚胎发育早期的多潜能性。1997年,用细胞核移植的方法诞生的克隆羊多利亮相,但这项技术在用于人体时,需要使用人体的卵细胞,并要破坏一个正常的人类胚胎,这项被指为“破坏生命”的技术一直存在伦理上的争议。 邓宏魁研究组则另辟蹊径,采用化学方法解决了这一难题:使用4个化学小分子化合物的组合对体细胞进行处理后,成功将已经分化的小鼠成体细胞,诱导成为可以重新分化发育为各种组织器官类型的多潜能性干细胞。这种采用化学诱导进行体细胞重编程的方法,是有别于以往体细胞重编程方法的全新途径,避免了伦理争议和基因突变。小鼠“贝贝”就是用化学方法将成体细胞重编程得到多潜能干细胞的成果。

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科学家制成“微型大脑”

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英国《自然》杂志日前刊登一项新成果,英、德等国研究人员用人类多功能干细胞在试管中培育出一个模拟人脑的组织,希望借助这种“微型大脑”促进神经科学和人脑早期发育等方面的研究。 研究人员先用干细胞培育出脑细胞,并让这些脑细胞逐渐形成脑组织,与真实大脑一样成层状分布,其结构、功能都与人类大脑早期发育时的形态十分类似。 虽然这种“微型大脑”直径仅有4毫米左右,但研究人员认为它有很高的科研价值,比如探寻精神分裂症、孤独症等神经系统疾病在大脑早期发育时的致病根源,以及进行相关药物开发和测试等。 参与研究的奥地利分子生物技术研究所的于尔根·克诺布利希说,这项研究并不是为了培育可替代人脑的人造器官,目前这种“微型大脑”的发育能力和复杂程度仍然有限,但它有望发挥巨大科研作用。

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表观遗传与免疫

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表观遗传与免疫 来自浙江大学医学院、第二军医大学和复旦大学等处的研究人员发现,组蛋白甲基转移酶Ash1l通过诱导泛素编辑酶A20,抑制了IL-6生成及炎症性自身免疫疾病。这一研究在线发表在9月5日的《免疫》(Immunity)杂志上。 文章的通讯作者是现任职浙江大学医学院和第二军医大学的曹雪涛(Xuetao Cao)院士,曹雪涛院士是我国著名的免疫学家,主要从事肿瘤免疫治疗和分子免疫学方面的研究,曾在树突状细胞的免疫学和肿瘤的免疫与基因治疗研究方面获得重要成果,以通讯作者的身份在Nature Immunology、Immunity、Blood、J Immunol等国内外知名杂志发表论文200多篇。 组蛋白是染色体的结构蛋白,它与DNA组成的核小体是染色体的基本结构单元。组蛋白氨基末端伸出核心之外,可以发生各种各样的修饰,包括组蛋白末端的乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化、ADP核糖基化等等。组蛋白修饰参与异染色质形成、基因印记、X染色体失活和转录调控等多种生理过程,在基因表达调控及肿瘤发生发展中起着重要的作用。已有一系列研究表明DNA甲基化与自身免疫性疾病如系统性红斑狼疮及类风湿关节炎等的发病相关。而组蛋白修饰和DNA甲基化在分子机制上密切相关。组蛋白修饰对于免疫系统和炎症反应中所起的作用也开始成为研究的热点。 在这篇文章中,研究人员报告称证实H3K4甲基转移酶Ash1l在Toll样受体(TLR)触发的巨噬细胞中抑制了IL-6和TNF生成,保护小鼠免于败血症。他们发现,Ash1l沉默小鼠由于IL-6生成增加更易患自身免疫疾病。Ash1l通过SET结构域的H3K4甲基转移酶活性,诱导Tnfaip3启动子H3K4修饰,从而促进了A20表达。Ash1l通过促进A20介导的NF-κB信号调节分子NEMO和转导分子TRAF6的去泛素化,抑制了NF-κB、MAPK信号通路和随后的IL-6生成。 这些结果表明,Ash1l介导Tnfaip3启动子H3K4甲基化是控制天然IL-6生成,抑制炎症性自身免疫疾病的必要条件,从而提供了表观遗传调控免疫反应和炎症机制的新认识

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新技术准确定量罕见的mtDNA缺失

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新技术准确定量罕见的mtDNA缺失 Fred Hutchinson癌症研究中心的研究人员近日发现了一种新工具,能够准确分析与多种疾病和衰老相关的极罕见线粒体DNA缺失。这项成果在线发表于《Aging Cell》杂志上。 mtDNA突变的积累与衰老、神经肌肉疾病和癌症有着密切的关联。然而,目前的方法无法准确定量和鉴定新的缺失事件,因其发生频率非常低,正常组织中每1亿个线粒体基因组约有一个缺失事件。为了解决这些限制,研究人员开发出一种基于ddPCR的分析方法,来高分辨率地分析这些罕见缺失。他们将这种方法称为“数字缺失检测(Digital Deletion Detection)”,简称3D。 文章的通讯作者Jason Bielas博士谈道:“研究mtDNA突变是极其困难的,更不用说缺失。我们的3D检测在特异性、灵敏度和准确性上与传统方法相比有了明显的改善。微滴式数字PCR所带来的通量增加让分析时间从数月缩短至数天。若没有这一技术,我们无法获得这一发现。” Bielas博士指的是Bio-Rad的QX100™ ddPCR系统。利用这一系统,研究小组分析了80亿个人类脑mtDNA基因组,并鉴定出超过10万个带有缺失的基因组。他们发现,与流行的看法相反,大多数mtDNA缺失的增加并不是由新的缺失引起的,而是之前缺失的扩增。他们推测,现有突变的扩增应当是造成mtDNA缺失积累的主要因素。 3D是一个新颖的三步法过程,包括富集带有缺失的分子;基因组被分成单分子液滴,并通过ddPCR定量;利用新一代测序确定断裂点。 富集完成后,通过QX100系统调整液滴中的分子浓度,让大多数液滴不含有突变基因组,而少数只有一个。这一过程允许每个缺失被无偏向地放大,而不会像qPCR那样引入误差。 在扩增后,Bielas及他的小组利用ddPCR确定突变分子的绝对浓度。根据液滴荧光和扩增子大小之间的关系,他们能够鉴定大脑样品中罕见缺失的大小和复杂性(到底是几个克隆的扩增,还是大量随机缺失)。 研究人员认为,3D检测作为一种重要的新工具,将有助于更好地研究缺失形成和扩增的机制,以及它们在衰老中的作用。而微滴式数字PCR的高通量和高灵敏度也让Bielas博士的实验室能够靶定骨骼肌、脑组织和血液中其他低水平的致病mtDNA缺失。

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PNAS文章:分割人类基因组

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PNAS文章:分割人类基因组 准确阐明特定生物体内的突变率对于研究人员而言是一件极其困难的事情。在近期发表于《美国科学院院刊》(PNAS)杂志上的一项研究中,宾夕法尼亚州立大学的Kateryna Makova和同事们阐明了出现这种情况的原因。 以往的研究都是将焦点集中在突变率的区域性差异上,而Makova和研究小组则同时检测了4种不同的突变类型,以前从未有人在单次分析中完成过这样的工作。他们利用一种叫做秘密Markov模型(HMMs)的统计学技术侧重分析了小插入和缺失、核苷酸置换和单核苷酸微卫星重复变异,搜索了具有相似突变率的邻近基因组片段,将它们归为一类,由此揭示了6个不同的遗传差异区域:分别命名为“hot”、“del/sub-warm”、“ins-warm”、“cold auto”、“cold X”和 “microsatellite”。 论文的共同作者Francesca Chiaromonte 说:“HMMs鉴别的6个区域可以揭示整个基因组大部分的突变率差异。我们看到在接近染色体顶端端粒处有很多的hot和warm区域,而在染色体中段和X染色体上有一些cold区域。看起来唯一随机的状态就是microsatellite状态。 这意味着在靠近染色体的两端处突变发生更为迅速,而在中部突变率降低。更重要的是,研究人员发现一些突变事件相比于另一些变化更为迅速。研究小组还将这些突变类型与基因组特征中一长串的参数联系起来。

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Cell封面文章:解析“长寿”蛋白质组

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Cell封面文章:解析“长寿”蛋白质组 蛋白质是细胞中的主角,它们负责执行编码在我们基因中的信息指定的职责。大多数的蛋白质只能存在两天或是更短的时间,以确保新的功能副本能够取代不可避免的化学修饰损伤的那些蛋白。 由Salk生物研究所和斯克里普斯研究所(TSRI)的研究人员领导的一个研究小组,现在发现大脑中的一个小蛋白质亚群能够存在更长的时间,有的甚至可以存在超过一年而不被取代。这些长寿的蛋白质寿命比标准蛋白质明显要长,鉴别它们有可能对于了解衰老的分子基础具有重要意义。这项新研究发布在8月29日的《细胞》(Cell)杂志上。 研究的资深作者、Salk生物研究所分子与细胞生物学实验室Martin Hetzer教授说:“蛋白质的寿命可能是影响细胞衰老的一个重要因素。鉴别出所有的长寿蛋白质,使得我们将研究的焦点放在了这些特异的蛋白质上,它们有可能是老化蛋白质组中最薄弱的环节。”本研究是第一次全面无偏倚鉴别这一长寿蛋白质组。 在去年发表于《科学》(Science)杂志上的一项研究中,Hetzer和他的同事们在细胞核中发现了一些长寿的蛋白质。新研究在Science论文研究发现上再往前迈进一步,广泛系统地鉴别了大鼠大脑中的长寿蛋白质。科学家们发现这些长寿蛋白质中有一些与基因表达、神经细胞通讯和酶催化过程有关,此外还包括核孔复合体(NPC)的一些组分,NPC负责所有的细胞核交通进出。 此外,他们发现NPC通过交换更小的亚复合物,而非整体NPCs,经历了缓慢而有限的转换(turnover),这可能帮助清除了不可避免累积的受损元件。

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中科院Cell Res解析Hippo信号调控机制

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中科院Cell Res解析Hippo信号调控机制 来自中科院上海生命科学研究院的研究人员发现了转录因子Scalloped(Sd)的一个新型结合蛋白,证实它通过对抗Scalloped-Yorkie活性调控了Hippo信号,这一研究发现发表在9月3日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 上海生命科学研究院的张雷(Lei Zhang)研究员和赵允(Yun Zhao)研究员是这篇论文的共同通讯作者。前者的研究方向是发育过程的组织分化与生长调控;后者的主要研究方向是细胞内信号传导通路的异常与疾病发生的分子基础。 器官大小控制是发育过程中的关键步骤之一。器官适当大小控制失常会导致肿瘤等疾病发生。在过去的10年里,Hippo (Hpo)信号通路被确定为是控制器官生长的一条重要信号通路。这一信号通路最先在果蝇中发现,在哺乳动物中高度保守。丝氨酸/苏氨酸Ste20-like kinase Hpo和NDR家族激酶Warts (Wts)与两个支架蛋白Salvador (Sav)和Mob as tumor suppressor (Mats)结合可诱导一系列的磷酸化事件,被认为是Hpo信号通路的核心。这一激酶级联反应导致了转录辅激活因子Yorkie(Yki, 哺乳动物中的YAP )失活及驻留在细胞质中。在Hpo信号缺失时,Yki会易位到细胞核中与Sd等转录因子结合,通过调控Hpo信号通路靶基因diap1、cyclin E和bantam来促进增殖及抑制凋亡。

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科学家发现30种常见癌症DNA秘密 助开发新疗法

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科学家发现30种常见癌症DNA秘密 助开发新疗法 英国科学家在抗癌的道路上有了一项意义深远的突破,他们已解开30种最常见癌症的DNA的秘密,这可能有助于开发出新的疗法,甚至对预防癌症也将具有重要作用,使我们离了解癌症的起因更近一步。 虽然医学已经取得重大进步,但科学家对引发癌症的原因还知之甚少。这种杀伤力巨大的疾病每年使32.5万个确诊患上癌症的英国人的一半死亡。在这项此类研究中规模最大的研究中,研究人员比较了世界各地7000多名癌症患者的DNA。这些病例包括最常见的癌症,例如乳腺癌、直肠癌、肺癌和前列腺癌等。它们占到在英国诊断出的癌症比例的一半多。 癌症是由DNA突变造成的。在肺癌或咽喉癌病例中,这些突变是由烟草等成分造成的。而过多的紫外线照射造成皮肤癌。研究人员分析了由这些突变造成的肿瘤的遗传密码模式。7000个DNA样本的分析结果显示出21个造成30种癌症的遗传密码模式。有些癌症是由烟草、日光或衰老等明显因素造成的,但许多癌症原因依然是未知数。 弄清楚食物、饮料、习惯或其他外部因素对DNA造成的各种变化可能有助于科学家研发预防癌症的新方法。例如,如果人们吃的某些东西造成突变,就会被告知避免吃它们。同样,戒烟降低患上肺癌的几率,而涂防晒霜可帮助人们抵抗皮肤癌。了解更多有关癌症遗传学的信息还可加快研发新疗法的进程。有些现有药物可能对一些特别遗传密码模式造成的肿瘤有更好疗效。

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Nature新闻:治疗健忘的妙方

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Nature新闻:治疗健忘的妙方 像人类一样,随着年龄的增长果蝇也会变得健忘。而根据在线发表在9月1日《自然神经科学》(Nature Neuroscience)杂志上的一项新研究,吃富含多胺(polyamines)的食物至少可以逆转它们的记忆缺失。 斯克里普斯研究所学习和记忆专家Ronald Davis(未参与该研究)说:“迫切需要研发出一些认知增强药物来维持我们在老年时的健康,现在多胺为我们提供了一种新方法。我们有充分的理由乐观地认为,这一果蝇研究将可以转化到人类身上。” 最普遍且具有重要生理功能的多胺包括有腐胺、尸胺、亚精胺等,这些小分子对于细胞生存和生长至关重要。但它们的细胞水平会随着年龄的增长而下降。 一些含有高水平多胺的食物,例如麦芽精和发酵大豆被普遍认为有益健康。日本的科学家们证实,一种发酵大豆加工制品:纳豆(natto)可提高人类血液中的多胺水平。 该研究的课题领头人之一、柏林自由大学的Stephan Sigrist谨慎地表示,在断言多胺能够帮助延缓老年人记忆衰退之前还有很长的一段路要走。“不过,这一多胺系统为那些对开发治疗感兴趣的研究人员提供了一个新靶点。” 其他一些科学家们曾证实,喂给果蝇、线虫或酵母多胺可以延长生物的寿命。看起来它是通过逆转年龄相关的自噬衰退而发挥这一效应的。自噬是细胞清除自身残骸的一种方式。通过遗传技术或热量摄取限制促进自噬也可以延长果蝇的寿命。但两种方法都还未明确证实可有效对抗年龄相关的记忆衰退。 因此,本研究的科学家们在开展这项为期2年的多胺研究之初,并不确定会发生什么。Sigrist说:“不过,我们认为亚精胺是一种天然的、有效的自噬诱导子,它通过一种新型的机制发挥作用,因此有可能影响了记忆衰退。” 恢复青春 研究小组训练他们的果蝇将一种特殊的气味与轻微的电击联系到一起。年轻的果蝇会很快学会避免这种气味,并很多个小时都记住避开它。老年果蝇学习则较缓慢。但当研究人员喂给老年果蝇一种富含多胺的食物时,果蝇的多胺水平恢复到了年轻水平,学习和记忆的年龄差异几乎完全消除。 Sigrist说:“我们对于这一强大的效应印象深刻。但这也让我们感觉有些紧张。” 为了确定这一效应是真实的,Sigrist要求他实验室的其他研究人员各自以双盲方式重复了这些实验。除了喂给多胺,研究小组还采用了第二种方法,他们上调了在细胞中生成这些分子的一种酶的活性。两种情况下他们得到了相同的结果。 在其他的实验中,科学家们证实其对于记忆的影响是特异性的,并非是由于饮食使果蝇变得更为健康的一个普遍结果。他们还证实这一机制与促进生命延长无关。 研究人员现正开始研究,一种富含多样的饮食是否能在小鼠和人类中产生相似的影响。

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钙调蛋白激酶家族在抑郁症中起关键作用

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钙调蛋白激酶家族在抑郁症中起关键作用 中科院神经科学研究所胡海岚研究组近期研究表明,通过蛋白定量质谱分析,脑区定点基因表达,电生理以及行为学等手段发现并证明了钙调蛋白激酶家族成员 βCaMKII 在抑郁核心症状的形成中起关键作用。相关文章发表在2013年8月30日的《science》上。 现代社会中,抑郁症的发病率越来越普遍,并且成为影响人类生活最严重的精神疾病之一,但人们对于抑郁症的成因一直没有明确的认识。最新的观点认为抑郁症的成因主要是大脑在响应外界刺激比如压力时因为某些分子及细胞水平的可塑性变化,最终导致特定大脑环路的神经活动发生了病理性的改变。 近年来,外侧缰核(LHb),作为从前脑边缘系统向众多中脑单胺能中心传递信息的核心脑区,被认为是研究抑郁症病理以及治疗的关键区域。神经影像学以及抑郁动物模型中的研究表明,在抑郁状态下缰核的代谢过度兴奋,并且缰核神经元的突触传递效率与动作电位输出均出现增强。对于这些现象背后分子机制的研究将对进一步认识以及治疗抑郁症有着非常重要的意义。 在这项研究中,胡海岚研究组的博士生李坤,周涛首先与美国 Scripps 研究所 John Yates 实验室的廖鲁剑及 Catherine Wong 合作,使用蛋白定量质谱在天生抑郁大鼠模型(由美国 Fritz Henn 教授提供)的缰核中筛选出了一系列表达异常的分子,并经过western免疫印记技术确认了 βCaMKII 在抑郁动物模型的外侧缰核中表达显著上调。 为了进一步明确 βCaMKII 表达变化与抑郁表型的关系,李坤与周涛构建了高效的病毒载体并在老鼠的外侧缰核进行定点注射,结果表明在外侧缰核过表达 βCaMKII 可以诱导正常老鼠在糖水偏好实验与强迫游泳实验中表现出快感缺失与行为绝望等抑郁症的核心症状。这一诱导作用具有亚型特异性,因为过表达 CaMKII 家族的另一亚型分子a CaMKII 并不会引起抑郁症状。

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致癌基因Notch 1在非小细胞肺癌中的关键作用

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致癌基因Notch 1在非小细胞肺癌中的关键作用 最近,佛罗里达州斯克里普斯研究所( TSRI )科学家已经表明,一个众所周知的致癌基因在非小细胞肺癌中也起着更为关键的作用。 这些发现确立了调节肺癌肿瘤生长的一个关键基因。发表在Cancer Research杂志的新研究中,科学家们发现,致癌基因Notch 1对癌细胞的生存是必需的。 在细胞和动物模型研究中,抑制Notch 1能导致肿瘤细胞死亡的增加。虽然Notch信号通路在许多类型的癌症中是重要治疗靶标,但当前的方法影响Notch家族中的所有成员,这会一直伴随着毒性。 新的研究结果表明,Notch1对非小细胞肺癌是必需的,因为它抑制p53(一个著名的肿瘤抑制蛋白,被称为基因组的监护人,因为它的作用是防止突变)。p53蛋白可以修复受损细胞,或迫使细胞发生程序性细胞死亡导致肿瘤细胞死亡。 利用动物模型,研究表明抑制Notch1信号导致最初肿瘤生长减少。此外,中断 Notch 1能通过诱导p53的稳定性大大增加细胞的凋亡。 这些发现为Notch1和p53基因携带的非突变形式非小细胞肺癌患者预后较差相关性提供了重要的临床见解。

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一个古老抗癌药物可用于防止组织移植的排斥反应

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一个古老抗癌药物可用于防止组织移植的排斥反应 近日,隆德大学研究人员意外地发现,一个古老的抗癌药物可用于防止组织移植的排斥反应。 现在,研究人员寄予厚望,他们的发现可能对移植患者和自身免疫性疾病患者出现新的治疗方法。 研究结果已发表在科学PLOS ONE杂志上。研究小组分析在20世纪60年代美国开发的肿瘤药物Zebularine对免疫系统的影响,结果发现它对免疫系统有完全意想不到的效果。 原来,Zebularine有能力“制服”人体免疫系统的反应。在组织或器官移植的情况下,这可能是重要的。同时,研究者认为它可以用来抑制自身免疫性疾病攻击人体自身组织,例如1型糖尿病或类风湿性关节炎。 在动物研究中,研究人员将健康大鼠胰岛移植到患有糖尿病大鼠中。 糖尿病大鼠分为两组,一组用Zebularine治疗,另一对照组未接受任何治疗。 Zebularine治疗的糖尿病大鼠比未经处理的大鼠存活较长的时间。这是非常有趣的,虽然Zebularine只治疗两星期,但可以在整个90天的随访期都观察到治疗效果。 调查结果是非常令人兴奋的,因为这意味着Zebularine不只是一般抑制性的免疫系统,而是更有针对性的治疗,另外研究中还没有看到任何迹象副作用。

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阻断炎症分子通路逆转大鼠肺动脉高压

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阻断炎症分子通路逆转大鼠肺动脉高压 根据斯坦福大学医学院研究人员的一项新研究证实:阻断导致炎症的分子途径可以在大鼠中扭转致命疾病--肺性高血压。 Mark Nicolls和他的同事发现,肺动脉高压(一种发生在肺部的致命高血压-),可能由炎症分子途径引起。结果发表在8月28日的Science Translational Medicine杂志上。 新的研究也有可能导致更好地了解涉及血管炎症的其他疾病如冠状动脉疾病。研究认为,针对炎症是一个令人兴奋的治疗方法,来增强肺动脉高压疾病的治疗,因为它可能扭转疾病的根本原因。 肺动脉高压,虽然罕见,但通常影响年轻和中年妇女,让他们呼吸短促,而且往往无法完成简单的日常任务。 这种疾病可以是致命的,某些自身免疫性疾病(如硬皮病和狼疮)、艾滋病毒,先天性心脏疾病或肝脏疾病患者风险较高。使用药物如安非他明和可卡因,或减肥药fenphen的人风险也是高的。 在美国和欧洲约10万人已经被诊断出患有肺动脉高压,但许多其他许多人都未被确诊,因为主要症状--呼吸急促并不是是疾病非特异性的。直到20世纪90年代,除了肺移植外,还没有有效的治疗方法。

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发现癌细胞新的弱点使其对化疗药物更敏感

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发现癌细胞新的弱点使其对化疗药物更敏感 近日,科学家发现癌细胞的一个新的“弱点”,靶向这一“弱点”可能使肿瘤细胞更容易受到化疗或其他治疗的影响。 在FASEB Journal杂志上发表的这份研究报告中,科学家确定HDAC5蛋白对端粒结构的维护是必不可少的。在肿瘤细胞内,端粒促进癌细胞的“长寿”。 端粒较长的癌症细胞往往更容易抵抗治疗,而端粒较短的癌症细胞往往更容易受到治疗的影响。 针对癌细胞维持端粒的机制--HDAC5 ,就可以根除癌症。通过抑制HDAC5,减少端粒长度,使得癌细胞对化疗药物更加敏感。 研究员Mottet和他同事们分析了几种端粒生物学(不同的端粒长度以及维持端粒长度分子机制不同)不同的肿瘤细胞株,他们发现HDAC5只在端粒长度很长的肿瘤细胞中存在。 然后,研究人员在端粒长度不同的肿瘤细胞中耗尽HDAC5蛋白,结果只在最初拥有更长端粒长度的癌细胞中观察到表型变化(端粒的缩短)。而端粒较短的肿瘤细胞HDAC5蛋白缺乏后似乎并没有什么影响。 他们还发现,一些端粒很长的癌细胞抗常见化疗药物诱导的死亡,但HDAC5在这些细胞中的蛋白表达水平降低后,随着端粒的缩短,细胞对这些药物的敏感程度增加,从而导致大量的细胞死亡。 端粒缩短也直接关系到细胞老化、早衰综合征的发展以及衰老性疾病,这项研究可能最终有广泛的临床影响。

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研究人员找出癌症发展过程中的关键蛋白

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研究人员找出癌症发展过程中的关键蛋白 近日,辛辛那提大学( UC )研究人员已经确定了雌激素受体的第一个双向功能的协同调控关键蛋白,为改善几种类型的癌症如乳腺癌,前列腺癌,肺癌和脑癌的治疗开辟了新的道路。 在Journal of Biological Chemistry杂志上的这项新研究中,团队专注于雌激素受体β(ER)和协同调节因子Tip60之间的相互作用。协同调控因子是与转录因子相互作用的蛋白质,即绑定到特定的DNA序列的蛋白质。 协同调控也可以共激活,激活基因的转录,或共抑制,抑制基因转录。不同于雌激素受体α(在乳腺癌的启动和发展起到了重要作用),雌激素受体β是一个强有力的肿瘤抑制基因。 协同激活雌激素受体β会损害细胞的生长,从而阻止或减缓癌症的发展。协同抑制雌激素受体β将促进细胞的生长,鼓励肿瘤发展。 使用体外模型,研究小组发现,Tip60担任雌激素受体β的协同激活剂和协同抑制剂,取决于所涉及的DNA位点。 具体而言,在结合位点激活蛋白-1(AP - 1)处作为协同活化剂,但在雌激素反应元件( ERE )位点是协同抑制剂。为了抑制肿瘤的生长,例如在癌症治疗中,Tip60和雌激素受体β相互作用后,成为包含AP - 1位点的任何基因的“合作伙伴”。 因此,研究人员希望设计新的药物或识别天然物质可以做到这一点。研究中发现常用于治疗乳腺癌的药物氟维司群,能在AP -1位点增强Tip60的共激活。大豆和豆腐中植物源性物质如亚麻籽,也在AP -1位点激活Tip60。 最重要的事情是要弄清楚如何运用抑制剂或活化剂作用雌激素受体β,使肿瘤细胞死亡可以增加或减少。

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Cell子刊揭示蛋白质降解新分子机制

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Cell子刊揭示蛋白质降解新分子机制 细胞通过一套复杂的系统来控制和清除有缺陷的、多余的蛋白,从而避免它们损伤机体。现在,来自德国和以色列的研究人员发现了参与这一至关重要过程的某个酶的新功能。利用酵母细胞作为模式生物,研究人员证实特殊因子Cue1,不仅是蛋白质降解装置中一个组件的受体和激活子,还确保了给缺陷蛋白标记上降解分子标签。 蛋白质是生物体细胞中的分子机器。不同类型的蛋白质执行着大量不同的功能:它们将物质输送到目的地,抵御病原体,确保细胞内的化学反应等等。许多的蛋白质是在称作为内质网(endoplasmic reticulum,ER)的细胞器中生成,随后折叠,然后再被运送至它们的目的地。 一些蛋白只是为某一特定的、有时间限制的效用所需,它们的目的一旦实现就必须将这些蛋白质降解。并且错误也常常会发生在蛋白质生成和折叠的过程中。缺陷蛋白质没有功能,甚至可能损害生物体。由此,也必须将它们降解。 因此,细胞通过一套复杂的系统来处理这些有缺陷、多余的蛋白质。在内质网中,存在有一个称之为内质网相关蛋白降解(ER-associated degradation,ERAD)的特殊蛋白质降解过程。这一系统包含有大量的酶,它们协同作用确保了给缺陷蛋白标记上泛素分子。这一过程就称之为泛素化(ubiquitylation)。4-6个一连串的分子充当了降解信号。标记着这样一条分子链的蛋白质被运送至蛋白酶体,在那里被分解。

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瑞士发现一种影响听觉的蛋白

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瑞士发现一种影响听觉的蛋白 瑞士洛桑联邦工学院科研人员日前宣布,他们发现一种能影响听觉的蛋白。 各个神经元之间有上千个触点——突触,突触负责保证神经元之间的信息交换。人类目前发现的大脑负责听觉区域中的最大突触形状酷似花萼,1893年由德国神经学家黑尔德发现。因为有这种花萼型突触,听觉信息可在几分之一毫秒内得到处理,信息处理速度远快于大多数其他神经回路。 研究人员利用实验鼠神经元开展的实验发现,如果让一种“骨形态发生蛋白”发挥作用,神经元上的这种花萼型突触就会膨胀变大,加快听觉信息处理速度。如果不让这种蛋白发挥作用,神经元上就会出现众多小突触,使听觉信息处理速度减慢。 参与研究的拉尔夫·施奈根布格尔指出,这种蛋白能促进这种花萼型突触的生长发育,有利于大脑处理听觉信息。

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英首个干细胞治疗中风初试见效 将申请临床试验

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英首个干细胞治疗中风初试见效 将申请临床试验 英国研究人员27日宣布,他们开展的首个干细胞治疗中风试验取得初步成果,部分接受治疗的患者病情有所缓解,目前正准备申请二期临床试验。 英国格拉斯哥大学的研究人员报告说,有9名缺血性中风患者参与了此次试验,他们接受干细胞治疗时已患中风半年至5年,而中风超过半年的患者通常被认为很难康复。研究人员在试验中将神经干细胞注射到患者脑损伤部位,希望这些干细胞能有助于健康组织的形成或启动人体自我修复机制。 结果显示,5名60至80岁患者的神经功能缺损症状持续缓解,其认知、平衡和运动能力有所恢复。此外,这9名患者均未出现细胞及免疫方面的不良反应。 这项小规模临床试验的目的主要是评估干细胞疗法的安全性,目前看来这一疗法未带来明显副作用,且超过一半的患者症状得到改善。研究人员计划今年6月向监管部门申请第二期临床试验,以确定患者病情的改善是否确实由干细胞疗法引发。 这一成果将于28日在伦敦举行的第22届欧洲中风会议上公布。

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PNAS:发现节能的新型分子开关

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PNAS:发现节能的新型分子开关 科学家们在鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella Typhimurium)中,首次发现了一种特殊的S-硫醇化分子开关,这种保护性开关可以帮助细菌适应感染过程中的环境改变,文章提前发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志的网站上。 在细胞经受压力时,S-硫醇化(S-thiolation)能够保护蛋白避免发生不可逆的化学改变。研究指出,新发现的S-硫醇化开关可以在调节蛋白活性的同时,为蛋白提供保护。这一发现增进了人们对沙门氏菌感染机制的理解。 鼠伤寒沙门氏菌会感染人类引发食物中毒,对于老年人和幼儿来说这种细菌非常危险。人们往往通过蛋白质组学方法,来分析细菌感染和致病的关键蛋白。这类方法大多需要对蛋白进行切割,来检测细胞中的全体蛋白。但研究人员希望对全长蛋白进行研究,因为全长蛋白能够反映更多的蛋白调控信息。 细胞通过多种途径调节蛋白的功能,最常见的是给蛋白添加分子进行修饰。以切割蛋白为基础的蛋白质组分析,可以鉴定蛋白是否存在,但并不能反映蛋白是否具有功能,也无法展现蛋白修饰的情况。 研究人员分别在营养丰富和营养匮乏环境下培养沙门氏菌,其中的营养匮乏环境是模拟细菌感染时所经受的环境压力。他们利用能分析全长蛋白的top-down蛋白组学方法,在沙门氏菌中鉴定了563个独特蛋白,这些蛋白共有1,665种不同的修饰形式。研究人员指出,top-down蛋白组学方法对于研究调控信息特别有用。

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Nature子刊:创新iPS细胞诱导技术

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Nature子刊:创新iPS细胞诱导技术 来自中国的研究人员近日报道称通过按严格的时间表达重编程因子,他们调控了干细胞的生成。在发表于《自然细胞生物学》(Nature Cell Biology)杂志上的新研究论文中,他们证实通过控制转化因子的导入顺序,可以优化细胞重编程的效率,以及干细胞的产量,并在理论上探索了这一情况背后的潜在机制。 2006年,日本的研究人员避开对卵母细胞或其他胚胎干细胞的需求,将皮肤细胞有效重编程为干细胞。通过表达4个转录因子:Oct4、Sox2、KLF4和c-Myc,他们生成了能够转化任何细胞类型的干细胞(至少在理论上)。然而不幸的是,不仅存活干细胞的总产率低,抽提的这些“恢复青春活力”的细胞也不适合用于随后的患者治疗。问题在于,即便获得的移植干细胞是来自于患者自身的皮肤,仍然存在免疫排斥或肿瘤形成。这种失衡是由于这些年轻细胞内蛋白亚型表达“不协调”引起免疫系统混乱所致。 通过在不同的时间诱导表达4个转化因子,中科院广州生物医药与健康研究院的裴端卿和郑辉课题组的研究人员最终找到了最佳的顺序。简而言之,研究人员最先导入了Oct4和Klf4组合,随后是c-Myc,最后为Sox2,从而获得了最高的产量。他们惊讶地发现,这种顺序性方案激活了一种上皮间质(EMT)转化,随后发生了延迟的间质上皮(MET)逆向转化。有一段时间,人所共知,小鼠成纤维细胞一开始必须通过间质上皮转化才能重编程为多能干细胞。因此,发现与EMT相关的蛋白SLUG和N-cadherin上调,让研究人员颇感到意外。

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布鲁菌单克隆抗体乳胶凝集试验方法的建立

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布鲁菌单克隆抗体乳胶凝集试验方法的建立 摘 要:建立了用纯化好的牛布鲁菌(B.abortus)单克隆抗体致敏乳胶的检测方法。通过试验确定了抗体致敏乳胶最佳偶联蛋白量为1.23 mg/mL,最佳致敏时间4 h,最佳的乳胶浓度为1%。水样模拟样本的制作,取含1.0×109cfu/mL灭活的B.abortus 544A生理盐水菌悬液各1 mL,加入9 mL自来水中,充分混合均匀,各取1 mL,土样、奶样模拟样本制作同上。最低检出率水样为3×104 cfu/ mL~1.0×105 cfu/ mL,土样、奶样为5×104 cfu/ mL~1.0×105 cfu/mL。 关键词:牛布鲁菌;单克隆抗体;乳胶凝集试验 布鲁菌(Brucella)是一种革兰氏阴性、胞内寄生菌。根据致病性的不同和宿主特异性,将布鲁菌分为6个种,即马尔他布鲁菌(B.melitensis),牛布鲁菌(B.abortus),猪布鲁菌(B.suis),绵羊布鲁菌(B.ovis),犬布鲁菌(B.canis)和沙林鼠布鲁菌(B.neotomae)[1]。布鲁菌能够感染人和多种动物,引起严重的人兽共患传染病。被感染的雌性动物主要表现流产,雄性动物主要表现不育,人类感染表现为发热,主要为波状热、肝脾肿大等症状,此病已经使世界各国遭受了巨大的经济损失,更重要的是布鲁菌能引起人的感染发病,威胁着公众健康,被一些西方国家列为生物战剂之一。早在1954年美国把猪布鲁菌研发成世界第一个生物武器,所以布鲁菌病的诊断和布鲁菌的检测一直受到世界各国的关注。 从近几年布鲁菌病的流行病学调查分析,在西方国家,人的布鲁菌病主要来源于感染的山羊;东方国家,人的布鲁菌病则主要来源于牛和猪;在城市,布鲁菌病主要来源是动物屠宰场。从发病的临床症状观察,布鲁菌病人不表现发热等明显的症状,呈现隐性感染,这种情况不仅为布鲁菌病的早期诊断带来了极大的困难,而且更有利于布鲁菌病的扩散。所以,急需建立快速、准确的检测方法,以达到早发现、早防治的目的[2]。本文报道一种快速检测牛布鲁菌(B.abortus)的乳胶凝集试验方法。

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Cell子刊突破:胰岛素的惊人效应

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Cell子刊突破:胰岛素的惊人效应 来自澳大利亚的科学家们以前所未有的细节,精确地绘制出了胰岛素在细胞中的作用路径图。从而为了解糖尿病中的异常提供了一张综合性蓝图。来自悉尼Garvan医学研究所的Sean Humphrey和David James教授将这一突破性的研究在线发表在著名的《细胞代谢》(Cell Metabolism)杂志上。 胰岛素于1921年被首次发现,由于它能够帮助我们降低餐后血糖,确保血糖进入细胞中,在机体内起着非常重要的作用。尽管科学家们已在广泛水平上了解了胰岛素的功能,然而直到现在他们都还在努力了解胰岛素完成自身任务的确切机制。 称作质谱仪的最新分析设备现在为我们提供了一直以来缺少的一种工具,利用它,人们可以观测存在于人体单个细胞中的极其复杂的分子迷宫。 这些强大的设备开启了一个称之为“蛋白质组学”的新领域,大规模地对蛋白质展开研究。蛋白质是细胞的工作部件,利用能量蛋白质参与完成如肌肉收缩、心跳甚至记忆等所有基本功能。 每个细胞中都包含有10,000-12,000个蛋白质类型,每种类型的蛋白质都有多个拷贝,它们利用各种方法彼此沟通,最常见的一种方法就是“磷酸化”作用。磷酸分子被特异地添加到蛋白质上以传递信息,或是改变蛋白质功能。 一个细胞中每种蛋白质类型都有多达20个潜在“磷酸化位点”,这使得一段时间内的细胞状态就有可能达到数十亿种。 作者们发现5,705种不同蛋白质上的37,248个磷酸化位点,其中15%响应胰岛素发生了改变。

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Nature子刊:维生素C的新功能

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Nature子刊:维生素C的新功能 根据发表在5月21日《自然通讯》(Nature Communications.)杂志上的一项新研究,高剂量的维生素C通过诱导一种化学反应,生成高水平DNA损伤性氧自由基,可以快速清除全部的结核病(tuberculosis,TB)耐药性菌株群。 这项研究是针对实验室培养物中的结核分枝杆菌开展,如果在体内也能获得一致的结果,人们有可能会将维生素C添加到现有结核药物中以改善治疗。此外,通过阐明维生素C杀死结核杆菌的机制,这项工作提供了一条有前景的途径,开发出新型的结核药物,对付这些难以杀死的细菌。 KwaZulu-Natal结核与HIV研究所主任William Bishai(未参与该研究)说:“这项研究表明,结核分枝杆菌或许并没有我们所以为的铁壳盔甲;并且它也许有着一些弱点以及软肋。” 但Bishai谨慎地表示,人体很难达到所需维生素C高浓度,在启动以这一机制为中心的、大规模的药物发现工作之间,还需要更多一点的原理论证。“我认为未来的问题在于,我们是否能找到一种更有效的还原剂,可以较低的浓度给药,但仍能刺激氧自由基?” 该研究的第一作者、叶史瓦大学艾伯特爱因斯坦医学院的Catherine Vilcheze说:“我们并没有说维生素C是结核病的一种治疗方法。但我们应该尝试寻找一些途径,模拟它在体外杀死结核杆菌的方式,因为它非常非常地有效。”

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Nature:最大规模人类疾病测序研究

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Nature:最大规模人类疾病测序研究 来自伦敦大学玛丽女王学院的研究人员领导完成了迄今为止最大规模的人类疾病测序研究,调查了6种自身免疫疾病的遗传基础。研究结果发表在5月22日的《自然》(Nature)杂志上。 这6种疾病分别是自身免疫性甲状腺病、乳糜泻、克罗恩病、银屑病、多发性硬化症和1型糖尿病,目前对于这些疾病的确切病因并不清楚,人们认为是遗传和环境因素的复杂组合作用所导致。已经鉴别的遗传变异只能解释每种疾病部分的异质性。到目前为止,所采用的技术通常鉴别出的都是只具微弱效应的群体常见变异。 在这项研究中,来自全球的科学家组成的一个研究小组利用高通量测序技术,力图在一个包括近42,000名个体(24,892名自身免疫性疾病患者和17,019名对照)的样本中,鉴别出从前确认的25个风险基因的新变异,其中包括罕见变异和潜在高风险变异。 在一项“罕见变异综合性全基因组关联假说”中,人们提出风险基因中少量的罕见变异有可能是这些疾病异质性的主要原因。 然而,Nature新研究表明,这些疾病的遗传风险更有可能,与在群体中数百个常见的微弱效应变异的复杂组合有关。 作者估计,对于可通过常见变异进行解释的疾病,这些风险基因中的罕见变异只大约导致了3%的异质性。

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PNAS:GPCR孤儿受体找到“亲人”

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PNAS:GPCR孤儿受体找到“亲人” 人类基因组中存在一些被称为“孤儿受体”(orphan receptors)的蛋白,从它们与其他蛋白的序列相似性来看,这些蛋白应该能结合并应答激素或化学物质,但人们至今还未发现其生理性配体。 Emory大学的研究人员为大脑中的一对GPCR孤儿受体找到了配体,这一发现有望帮助人们治疗相关的神经系统疾病。文章提前发表在美国国家科学院院刊PNAS的网站上。 GPCR涉及了视觉、嗅觉、以及脑细胞对激素和神经递质的应答,是许多药物的靶标。目前,与G蛋白偶联受体相似的GPCR孤儿受体大约有一百种,GPR37就是其中之一。 GPR37与遗传型帕金森病有关,因而吸引了不少研究者的注意。帕金森病患者体内产多巴胺的神经元会发生退化,而GPR37在这类细胞中含量丰富。不过,人们此前并不知道与GPR37相互作用的配体。“我们推测GPR37应该具有重要的功能,”文章的资深作者,Emory大学医学院的Randy Hall教授说。 Hall与研究生Rebecca Meyer开发了一个标记系统,以此展现产GPR37的细胞与配体的相互作用。“通常,当GPCR遇到配体时,细胞会将其从表面移除,”Meyer说。“我们通过标记,使位于细胞表面的GPR37呈红色,而进入细胞内的GPR37呈绿色。”

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