质谱矫正液分子量

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质谱矫正液分子量相关的厂商

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    质谱佳科技是国内专业从事分析仪器维修等技术服务、进口二手分析仪器销售和租赁的领先企业,原厂工程师团队为客户在色谱、光谱、质谱仪的维护保养、维修、仪器认证、技术升级、仪器搬迁,软硬件操作培训等多方面提供完善的技术支持和整体解决方案。 质谱佳科技在美国、欧洲、日本有着良好的合作伙伴,凭借优质的进货渠道和专业的选品团队为客户提供优质的二手仪器。主营品牌有:Thermo(赛默飞)、AB Sciex(爱博才思) 、Agilent (安捷伦)、Waters(沃特世)、Shimadzu(岛津)等,另外质谱佳科技还提供分析仪器配件、耗材的销售。 质谱佳科技总部位于长沙,通过设在上海、海口等地的分公司,形成服务全国的网络。为制药、食品、环保、三方检测、新能源等多个行业以及高校、科研院所、政府实验室等客户提供方便快捷的本地化服务。
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    衡昇质谱专注无机质谱等分析仪器的研发和制造。公司业务聚焦在质谱领域的自主研发,既定战略是:只专注发展有自主知识产权的质谱仪器。 以“衡昇”命名,是将“张衡”“毕昇”两位我国古代科技创新的杰出代表作为榜样,希望继承先贤之创新精神,立足科学研究,促进创新发明,为我国科学仪器事业做贡献。
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    服务科学,世界领先--赛默飞世尔科技赛默飞世尔科技(纽约证交所代码:TMO)是科学服务领域的世界领导者。公司年销售额170亿美元,在50个国家拥有约50,000名员工。我们的使命是帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。我们的产品和服务帮助客户加速生命科学领域的研究、解决在分析领域所遇到的复杂问题与挑战,促进医疗诊断发展、提高实验室生产力。借助于首要品牌Thermo Scientific、Applied Biosystems、Invitrogen、Fisher Scientific和Unity Lab Services,我们将创新技术、便捷采购方案和实验室运营管理的整体解决方案相结合,为客户、股东和员工创造价值。欲了解更多信息,请浏览公司网站:https://www.thermofisher.cn/cn/zh/home.html。 赛默飞世尔科技中国赛默飞世尔科技进入中国发展已有30多年,在中国的总部设于上海,并在北京、广州、香港、台湾、成都、沈阳、西安、南京、武汉、昆明等地设立了分公司,员工人数约3700名。我们的产品主要包括分析仪器、实验室设备、试剂、耗材和软件等,提供实验室综合解决方案,为各行各业的客户服务。为了满足中国市场的需求,现有8家工厂分别在上海、北京和苏州运营。我们在全国共设立了6个应用开发中心,将世界级的前沿技术和产品带给国内客户,并提供应用开发与培训等多项服务;位于上海的中国创新中心结合国内市场的需求和国外先进技术,研发适合中国的技术和产品;我们拥有遍布全国的维修服务网点和特别成立的中国技术培训团队,在全国有超过2000名专业人员直接为客户提供服务。我们致力于帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。欲了解更多信息,请登录网站https://www.thermofisher.cn/cn/zh/home.html。 联系方式:电话:400-611-9236售前咨询电子邮箱:yang.chen4@thermofisher.com售后服务电子邮箱:cru.cn@thermofisher.cn扫一扫,关注 “赛默飞色谱与质谱中国”官方微信
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质谱矫正液分子量相关的仪器

  • LC-MS 2000是天瑞仪器自主研发生产的新一代液相色谱-单四级杆质谱联用仪。LC-MS 2000具有体积更小,灵敏度更高,维护更方便,性价比更优的特点。可应用于生物医药(生物大分子、蛋白、多肽)、化工、食品安全(农残、兽残、食品添加剂)、环境保护(环境中VOCS检测) 、公检刑侦( 兴奋剂) 、工业检测(RoHS2.0指令、REACH指令)等领域。LC-MS 2000产品各项性能指标均达到国家检定规程要求。其采用更大抽速的进口真空泵、有效降低了本底真空的化学干扰。结构更加紧凑,大大缩减了仪器的体积,为实验室节约更多空间。产品性能升级离子源独特的涡旋加热气体设计,离子源温度控制精度高,均匀。多通道采集功能,快速地提高了分析速度及工作效率。可快速切换正、负电离模式,灵活测试;高压电源最快切换时间-10KV到+10KV可达20ms。专利的六级杆聚焦设计,可大幅提高离子的通过率,特别是高质量数离子信号。可获得丰富的质谱信息(包含分子量和多个结构信息)。ChemAnalyst软件功能强大、可一键切换的中英文用户界面,操作简便。可以选择多种离子源配置组合ESI(标配),APCI(选配),APPI(选配)。软件可操控自动进样器,有效提高样品通量,可完成无人值守的自动化序列检测。满足GMP,GLP要求,增加用户权限管理模块,数据完整性,审计追溯模块。测试质量范围10-2000AMU。大幅提升检测器的使用寿命,增强动态范围和灵敏度。应用领域生物医药:合成药物检测(CRO有机合成、生物多肽合成),原料药检测(合成原料药、中药药材)等。RoHS,REACH检测: PAEs,PAHs,双酚A,PBBs,PBDEs的超快速筛查。工业分析:生产质控(合成中间体及成品质量控制)。环境监测:环境污染物监测分析。食品安全:食品添加剂,食品残留物、污染物,非法添加物等。
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  • ultrafleXtremeTM MALDI-TOF/TOF充分体现了MALDI-TOF技术的巨大突破,开辟了其在科研和工业等领域的新应用。一系列新技术和专业软件的应用,使ultrafleXtreme的应用范围不仅超越了常规蛋白质组学研究,而且拓展到生物药品的深入解析、基于快速组织成像技术的生物标志物发现和糖蛋白质组学等多种研究领域。MALDI分子成像:来自技术引领者的完整分子组织学解决方案 从上至下(Top-Down)生物标志物发现全新的从下至上ImageID工作流程,即能对蛋白定位,又能鉴定蛋白,并且扩展到FFPE组织和大蛋白分析增强的数据采集速率和仪器稳定性,适合于大规模高通量研究分析。蛋白质组学和糖蛋白质组学:扩展研究领域的超强能力 一体化的液质联用和二维凝胶电泳工作流程标记和非标记的从上至下以及从下至上定量技术糖蛋白质组:GlycoQuestTM高通量自动分析蛋白糖链结构生物医药:MALDI-TOF技术直接确定完整蛋白分子量和蛋白序列 多价态分析,准确测定完整蛋白分子量信息量丰富的快速蛋白测序副产物及末端多样性分析聚乙二醇化蛋白的分析 糖蛋白分析 完全糖链分析解决方案确定混合样品中的N-糖肽通过糖肽在MALDI-TOF/TOF谱图中呈现的独具特征的MS/MS二级碎片离子谱峰,结合GlycoQuest自动化糖链数据库搜索,完美实现糖肽结构解析。
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  • Thermo Scientific Prima PRO和Sentinel PRO:开启质谱新时代依托超过 30年在线质谱仪的成功研发应用经验,新一代 Thermo Scientific Prima PRO和Sentinel PRO在线质谱仪可从容应对石油化工应用的众多挑战,其中包括: 天然气处理 烯烃生产 裂解炉优化 环氧乙烷 /乙二醇 聚烯烃生产 合成氨 有毒挥发性有机化合物(VOC)的泄漏 凭借着经实践证明的更快、更全面的在线气体成分分析能力,Prima PRO可以对多流路气体进行精确分析,进而提高产量。它维护量少、易于操作并且可提供可靠、实时的数据到 DCS系统,从而确保投资回报率。基于和Prima PRO相同的操作平台, Sentinel PRO环境质谱仪以其众多同样的优势,被设计用于满足微量泄漏环境监测的需要。半连续监测 60-120个取样点及高灵敏度的检测能力,确保可靠的泄漏检测,从而提高生产装置的安全性和生产制度的规范性。此外,单台 Sentinel PRO或 Prima PRO可以轻松取代多台气相色谱仪(GC),减少取样时间,简化维护程序,更重要的是降低整体投资成本。操作原理Prima PRO、Sentinel PRO进行稳定、快速气体分析首选技术的基础是扫描磁扇质谱技术。利用这种技术,气体可以通过一个多流路进样阀源源不断的从取样系统到达离子源,在这里,气体分子被离子化和碎片化。离子被高能电场加速后进入电磁质量分析器,目标离子进入检测器。分子碎片能够产生重复性极好的“指纹”谱图,这可以让具有相似分子量的气体被精确测量而不受干扰。内置控制器使用一系列的工业标准协议,将气体浓度数据和其他诸如热值和碳平衡的计算数据直接传送到过程控制系统。耐用性和容错性设计在显著降低维护要求的同时,可以保证 99.7%以上的投用率。新型号带来更高的投资回报率 快速在线气体分析(每个取样点 1至20秒),准确反映工艺 动态 全组分气体分析,提供更多的数据给先进过程控制系统(APC)高稳定性,90天的标定间隔(自动) 可靠,容错设计,确保投用率超过99.7% 占地面积小 最少的维护量需求,降低运营成本天然气加工原料气可能来源于附近的气田或其他加工过程(如炼油厂的尾气),以及油田收集的伴生气。因此,气体工厂来料的体积和成份会有很大的差别。通常天然气含有 85%的甲烷和数量不定的天然气凝液( NGL),包括液化乙烷(C2H6)、丙烷(C3H8)、正丁烷(n-C4H10)、异丁烷(i-C4H10)、戊烷和更重烃(C5+)、惰性气体(典型的是氮和氦),和硫化氢(H2S)、二氧化碳(CO2)等酸性气体。酸性气体通过采用膜分离技术或氨水溶液进行脱除。硫是通过硫装置(或 Claus装置),采用加热和催化两步法将硫化氢中的硫还原为单质硫。对于剩余气体(通常称之为尾气),要对其残留的硫化氢进行处理,随后焚烧。气体工厂在把原气分馏为残留气体、乙烷、丙烷、丁烷和天然汽油产品前要去除水蒸汽、微量的汞和氮气。分馏系统的各阶段依靠馏份的沸点差来分馏各个烷烃。Prima PRO:快速、精确的气体成分分析利用Prima PRO,可对加工气体的成分进行快速、高精度的在线分析。分析包括全面和精确的成分分析以及热值(粗热值和净热值)、密度、比重、华比指数、化学需气量和燃烧需气量指数(CARI)的计算。燃烧需气量用于加工厂燃烧气体时对燃烧的控制。Prima PRO还能为控制气体加工阶段的物料平衡方程提供精确的气体组成数据。Prima PRO还有下列优点: 减少能源消耗(燃气和电能) 提高液化产品的回收 精确测量产品的能值 减少向环境中的排放烯烃生产典型的烯烃厂有两个基本工段:裂解炉和分馏系统。烯烃裂解炉或热解炉将饱和烃裂解成较小的不饱和烃。生产较轻的烯烃,包括乙烯、丙烯和丁烯所用的主要工业方法是蒸汽裂解法。在这一过程中,用蒸汽稀释气态或液态的烃原料(即石脑油、液化石油气、氢裂粗柴油或简单乙烷和丙烷混合物),并在裂解炉内短时加热。典型的反应温度很高(约为 850℃),反应时间限制在一秒钟内。在现代的裂解炉中,驻留时间缩短到毫秒级,产生超音速气流,从而提高所需产品的产量。当达到裂解温度以后,气体在传输线热交换器中急速骤冷以停止反应。反应时的产量取决于进料的成份、烃与蒸汽的比例、裂解温度和炉内驻留时间。轻烃物料,包括乙烷、液化石油气或轻石脑油,产生的产品富含轻烯烃,包括乙烯、丙烯和丁二烯。石脑油和炼油厂液态原料不仅可生产出这些轻质烯烃的一部分,还能生产出富含芳香烃产品,适于高温热解汽油或燃油。较高的裂解度,有利于乙烯和苯的生成,而较低的裂解度则生产较多数量的丙烯、C4烃和液态产品。这一过程也会导致焦炭慢慢沉积在炉管或裂解盘管壁上。由于炭层会限制热传导和增加压降,因此反应器的效率会降低。设计反应条件时应使焦炭沉积的速率减小到最低。采用动力学模型预测焦炭层的厚度,以保证依赖炉温的裂解效果能被预测。蒸汽裂解炉通常只能运行几个月,就需从裂解线上分离出来除炭。蒸汽或蒸汽 /空气混合气通过裂解炉盘管,可以使硬质固体的炭层转化为一氧化碳和二氧化碳。当这一反应完成后,裂解炉就可重新使用。另一种方法是离线的低温机械式清除法,用低温碱性清洗剂去除盘管上的沉积炭是有效的。不管用何种方法,在除炭过程中每一台炉要至少停炉27小时。以下的内容介绍了如何利用Prima PRO使裂解炉的使用得以优化。裂解炉优化的基本原理在任何给定时刻,产量取决于许多因素,包括原料成份、稀释蒸汽流量、烃流量、盘管温度分布(即炉子燃烧率和燃料能量)、炉子抽力和盘管焦炭成份。模型预测控制(MPC)利用多种测量参数,如盘管出口温度和进料率等来预测上述因素。这样,温度和驻留时间可以优化,在使焦炭沉积率最小的同时,实现烯烃的最高产量。虽然众多过程变量的关系是复杂的,但如果裂解度太低,乙烯产量将会很低。如果裂解度太高,则积炭率也会高,产量的减少也将是不可接受的。裂解度技术比较当动力学模型没有成份反馈时,实际的裂解度如何随时间变化。在这种情况下,一台气体裂解装置通常有62%的乙烯产率。使用在线气相色谱仪(GC)测量实际裂解度指数的益处(如丙烯/乙烯比和丙烯/甲烷比)。采用这种六分钟间隔的定时测量,就能通过提高裂解度的设定值来强化对裂解度的控制。这种升级一般能使气体裂解装置的产量提高 5%。这就是为什么世界上多数乙烯装置将气相色谱仪用于过程控制的原因。图4c说明了在一个更现代化的装置上用 Prima PRO取代气相色谱仪所带来的更强的控制。由于Prima PRO快速分析,可以用一台在线质谱仪(MS)取代 5台气相色谱仪,并把取样间隔从6分钟缩减到2分钟,从而得到另外 2%的增产。应注意到,由于在这个动力特性很强的过程中速度是很重要的,气相色谱分析将限定在 C1到C3分析。它能满足对于实际裂解度指数的测量,但不能提供足够的数据使动力学模型能精确地预测由于重烃的凝结和聚合作用所产生的焦炭沉积率。因此,在一般的装置中,对于速度很低的 C1烃到C4烃的扩展分析要用附加的气相色谱仪,以提供动力学模型所需数据。对于液态物料裂解炉,这种分析还要进一步扩展到 C5烃,以计算动力裂解因子(KSF),这一因子用于根据市场条件优化特种烯烃的生产。通常会将附 加的扩展分析色谱仪多路配置,使每一台气相色谱仪能监测 4到5台炉。然而,使用一台Prima PRO就能监测炉内裂解产物而无需额外的装置。Prima PRO的扩展分析还能提供对重烃进行监测的附加功能,重烃通常被 Thermo Scientific PyGas自清洗取样器所去除。这一数据能预测当样品处理系统发生故障时的维护能力,从而保证更可靠的运行。裂解度控制成本/效益分析Prima PRO解决方案一台配置了60个取样口和24个标定口的Prima PRO 在线质谱仪。如图7所示,一对有类似配置的冗余质谱仪系统可以取代15个气相色谱仪,这能节省约33%的成本,并具有更先进的分析性能。另外,两台Prima PRO可安装在相对便宜的分析小屋中,大约是气相色谱仪的分析小屋成本的25%。维护成本也只有气相色谱仪方案成本的20%左右。虽然Prima PRO的标定气体消耗要高一些,但与气相色谱仪的购置成本和维护费用相比,其费用是极低的。另外,Prima PRO不需要助燃气或载气,这是一种更经济的解决方案。气相色谱仪解决方案气相色谱仪的典型配置,用10台气相色谱仪控制裂解度,5台气相色谱仪提供所需数据用于APC动力模型分析。此方案的成本约100万美元;另外,在所有季节中都要进行维护。有些气相色谱仪能够完全补偿气候的影响,装在室外无需庞大、昂贵的分析小屋,而大多数则不能。一个预制的分析小屋包括全套的样品预处理系统、通讯设施及其他必要的公用工程,分析小屋在为维护人员提供良好工作环境的同时,大的分析小屋也带来了更高的制造成本。如果有很多气相色谱仪需要维护,总拥有成本就会很高:每年每台气相色谱仪大约要7000美元的维护费,这还不包括载气、助燃气和标定气体的消耗等费用。环氧乙烷 /乙二醇环氧乙烷(EO)是通过氧化银催化剂直接氧化乙烯而成的。由于环氧乙烷分子活性极强,因此生产通常与容易运输的乙二醇生产结合在一起。先对乙烯、压缩氧气和循环气预热,然后将这些气体注入装有氧化银催化剂环管反应器中的一个。由于生产中的目标分子不是二氧化碳和水,所以可通过氯化合物添加剂来改进选择性。催化剂的活性随时间而降低,要求逐步提高反应温度。为了增强反应器的燃烧率,要加入甲烷。 Prima PRO:最佳气体分析解决方案 Prima PRO能利用精确测量选择性和测量碳氧分子平衡实现气体分析过程的最优化。采集的数据经常用于控制氯添加剂。Prima PRO也能用于催化剂的开发研究,其目的是在高活化率的条件下增加催化效率。聚烯烃生产聚乙烯(PE)主要按其密度和支链分为几种不同的类别。聚乙烯的物理性能主要取决于几个变量,包括支链的长度和类型,晶体结构和分子量。高密度聚乙烯(HDPE)的支链少,因此具有较强内部分子力和抗拉强度。选择适当的催化剂和反应条件可以减少支链。线性低密度聚乙烯(LLDPE)是一种有大量短支链的聚合物,通常由乙烯与短链α烯烃(如:1-丁烯、1-己烯和1-辛烯)发生共聚作用形成。可利用一个或两个流化床气相反应器的交换工艺来制造全范围聚合物。这些聚合反应器的进料为乙烯、氢气、共聚单体和循环气。聚合物的质量是通过气体组份来控制的,这就需要准确、快速在线分析Prima PRO:精确,快速和多流路监测实验期间生成的数据。其中将专为监测五个工艺流路而配置的Prima PRO与专为监测反应器进料气体组分而整理的GC数据进行比较。Prima PRO清楚追踪了氢气/乙烯比的变化,精度高于GC。此外,Prima PRO更新DCS的速度要比单流路GC快九倍,即便Prima PRO测量五个流路亦是如此。在前四十个PMS数据点中,DCS试图利用GC数据来控制这个比率。当控制切换至Prima PRO数据时,此比率变化的监测得到显著改进,包括: 产品质量更稳定 分子量分布更集中 不合格产品更少 稳态动力学有所改进合成氨从烃进料中除去硫,然后与蒸汽混合通过镍基催化剂,生成氢气和一氧化碳。通过将蒸汽 /碳比维持在 3:1以上,将单质碳的形成减至最低限度,从而保护催化剂。未反应的甲烷(称作“损耗”)亦需控制在较低水平,以便优化转化炉 /变换炉的性能。在次级重整 /裂化装置中,空气在流量控制条件下引入,使氢 /氮比为 3:1。空气中的氧气可将大部分 CO氧化成 CO2,同时加入蒸汽,以便将剩余的 CO转化为CO2和氢气。在吸收塔中除去大部分CO2,微量的碳在催化剂作用下转化成甲烷。转炉进料气与循环气混合,转炉入口处的氢 /氮比(H:N)再次受到严格控制,以实现NH3转化效率的最大化。进气中所包含的惰性气体(如:氩气和氦气)的聚集情况需要予以监测,因为这些气体如果不定期清除的话,会成为重要的稀释剂。Prima PRO:稳定,可靠的在线气体分析 进气组分和热值计算精度最高;因严格控制蒸气/碳比(±0.01%)而减少消耗掉的能量 精确控制氢 /氮比(±0.003%),使产量最大准确测量甲烷损耗,以降低生产成本与较慢的色谱或稳定性较差的质谱控制作用相比,高取样率(在不到两分钟内10至12流路)可使产量提高1%至2%总成本极低 快速收回成本 有毒挥发性有机物(VOC)的泄漏只要化学品生产装置存在,就存在有毒挥发性有机物泄漏的潜在危险,监管机构通常都会要求工厂监测环境气体成分,以避免工人受到长期接触的伤害。有各种形式的捕获装置包括真空罐(苏玛罐)、可挥发性有机物报警器或吹扫和捕获装置。收集到的样品需要送往环境实验室进行分析。另外,还可利用电化学传感器来即时显示是否存在浓度超过预定水平的目标分子。还有一种定量方法是使用开路式傅利叶变换红外光谱仪测定VOC是否在警戒线以内。利用这些不同技术获得的数据,通常都用来满足当地法规的要求。然而,这些技术都不能提供满足诉讼依据要求的时间和空间的分辩率。Sentinel PRO环境质谱仪:简单全面的数据采集Sentinel PRO环境质谱仪能够在15分钟以内监测100个以上的取样点,并在0.01至1ppm精度范围内检测特定物质。凭借其速度和精度,它可监测所有关键区域的短时泄漏,并提供准确的8小时、时间加权平均泄露数据。由于具有大量可用的取样点,许多取样点可位于靠近潜在泄漏点的地方,如:阀杆处等,以便在有毒危害发生之前进行泄漏检测和修复。尽管安装这种装置的主要目的是为了保护操作人员和符合环保法规,但其使用效果往往超越了对泄露防护的要求。
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  • 中国科学家发现新冠病毒mRNA合成、基因组复制矫正等分子机制
    新冠病毒肺炎疫情至今已造成全球1.4亿人感染和300余万人死亡。随着疫情进展,突变病毒株不断出现,对中和抗体和疫苗的防护效果提出了严重挑战,迫切需要针对各型突变株中高度保守的转录复制过程开展深入研究,阐明关键药物靶点的工作机制,发现能够有效应对各种突变株的抗病毒药物。 新冠病毒是目前已知RNA病毒中基因组最大的一种病毒(约30 kb),其基因组编码了一系列非结构蛋白,并按照一定的空间和时间顺序,形成复杂的超分子蛋白质机器“转录复制复合体”(RTC),负责病毒转录复制的核心过程,包含了众多保守的抗病毒药物设计的关键靶点。由于基因组极大,同时聚合酶复制保守性较差,新冠病毒进化出一种独特的“复制矫正”(proofreading)机制,利用转录复制复合体中关键的nsp14蛋白对复制过程进行矫正,一旦发现聚合酶合成了错误配对的碱基,立刻通过nsp14具有的外切核酸酶(ExoN)将错误碱基处理掉,保证复制的准确进行,这也是病毒逃逸核苷类抗病毒药物的关键途径。同时,nsp14是一个独特的双功能蛋白,除负责复制矫正的外切核酸酶外,还拥有一个N7甲基化酶(N7-MTase),负责mRNA加帽过程关键的第三步催化反应。复制矫正和加帽过程如何进行,特别是两个截然不同的生化过程如何在一个nsp14蛋白中协同作用,是20多年来冠状病毒研究领域中最关键的几个“未解之谜”之一。 2021年5月24日,清华大学饶子和院士、娄智勇教授团队与上科大高岩博士合作在Cell发表研究论文Cryo-EM Structure of an Extended SARS-CoV-2 Replication and Transcription Complex Reveals an Intermediate State in Cap Synthesis,解析了新冠病毒超分子蛋白质机器“转录复制复合体”关键状态的三维结构,揭示了病毒mRNA加帽、基因组复制矫正、逃逸核苷类抗病毒药物的分子机制。这是该团队在新冠病毒转录复制复合体研究中,继在Science、Cell等期刊上连续发表4项成果后的又一重要工作。 新冠疫情爆发后,清华大学饶子和院士、娄智勇教授团队针对新冠病毒转录复制机制开展的深入研究,先后阐明了“核心转录复制复合体”(C-RTC)[1]、“延伸转录复制复合体”(E-RTC)[2]和“加帽中间态转录复制复合体”[Cap(-1)’-RTC][3]的工作机制。在此基础上,研究团队成功解析了Cap(-1)’-RTC与nsp10/nsp14形成的超级复合体Cap(0)-RTC的三维结构(图1)。 图1 新冠病毒Cap(0)-RTC的工作机制 在该复合体中,nsp9蛋白发挥了“适配器”(adaptor)的作用,通过与nsp14蛋白相互作用,将nsp10/nsp14复合体招募到Cap(-1)’-RTC中,从而利用nsp14的N7甲基化酶结构域完成mRNA加帽过程的第三步关键反应。尤为重要的是,研究团队发现Cap(0)-RTC在溶液状态下会形成稳定的同源二聚体。在二聚体中,解旋酶nsp13通过其1B结构域的重大构象变化,引导模板核酸链反向移动,引发产物链backtracking机制,从而将产物链3’末端传输至另一Cap(0)-RTC的nsp14外切核酸酶结构域的反应中心,完成错配碱基的矫正过程(图2)。 图2新冠病毒复制矫正的in trans backtracking机制 这一发现所提出的in trans backtracking的复制矫正机制,与真核/原核细胞RNA聚合酶Pol II的复制矫正机制具有一定的类似性,表明作为基因组最复杂的RNA病毒,新冠病毒的转录复制过程已与高等生物具有一定的类似性,阐明了冠状病毒研究领域20多年来悬而未决的关键科学问题。同时,复制矫正机制是新冠病毒逃逸核苷类抗病毒药物(如瑞德西韦)的关键机制,一旦核苷类药物被加入RNA产物链中,即会被病毒的复制矫正过程去除,从而丧失抑制活性,目前仅有NHC及其衍生物可以逃逸该过程。该成果也将对未来进一步优化和发展新型核苷类抗病毒药物提供关键的结构基础。 该成果的获得得益于研究团队在冠状病毒转录复制领域中17年多的长期积累。自新冠疫情发生后,研究团队系统研究了新冠病毒转录复制过程,阐明了关键药物靶点蛋白主蛋白酶Mpro和转录复制复合体多个状态三维结构,为认识病毒的生命过程、发展高效抗病毒药物提供了关键信息,先后在Nature[4]、Science[1]、Cell上[3,5]和Nature Communications[2]上发表系列研究论文,是国际上抗新冠药物靶点研究中最为系统、引用最多的工作之一。 清华大学饶子和院士、娄智勇教授/ChangJiang学者特聘教授和上海科技大学的高岩博士为共同通讯作者,清华大学医学院和生命学院的闫利明博士、杨云翔博士,以及博士生李明宇、张盈、郑礼涛、葛基、黄雨岑、刘震宇为共同第一作者。 专家点评(一) 钟南山(中国工程院院士) 从“非典”到“新冠”,科学依靠坚守 基础研究是科技创新的源头,是人类认识自然、适应和改造自然的知识源泉,需要科学家长期的坚守和耕耘。 自2003年“非典”开始,在不到20年的时间里,全球已经出现了3次由冠状病毒导致的传染病。尤其是此次新冠疫情,在全球已经造成超过1亿多人感染,而且随着疫情发展,突变病毒不断出现,一些已有的中和抗体不能很好的中和突变病毒,部分疫苗针对突变病毒的保护效果也有一定程度下降。深入认识病毒的生命周期,开发能够有效应对各种突变病毒的广谱抗病毒药物,将成为今后一段时间抗疫工作的重点内容之一。 目前针对新冠病毒的抗病毒药物研究,主要针对的是病毒转录复制过程的关键靶点蛋白,如蛋白酶和聚合酶等。针对这两个靶点的抑制剂已有相当数量的进入临床实验,例如瑞德西韦(Remdesivir)等。以瑞德西韦为代表的核苷类抗病毒药物主要作用于病毒的聚合酶,在被掺入产物核酸链后,阻断病毒核酸的合成,进而抑制病毒的转录复制过程。然而,在此类抑制剂进入临床研究后,其抗病毒效果与预期有一定差距。除药物代谢等问题外,冠状病毒通过特有的“复制矫正”(proofreading)机制逃逸核苷类抗病毒药物的抑制,可能是此类抗病毒药物抑制效果不佳的一个重要原因,目前仅有NHC及其衍生物能够躲避病毒复制矫正机制的干扰。对这个机制开展深入研究,将为今后发展广谱、高效的抗冠状病毒药物提供关键的科学信息。 子和教授及其团队在新冠疫情爆发后,针对新冠病毒转录复制机制开展了系统研究,先后阐明了“核心转录复制复合体”(C-RTC)[1]、“延伸转录复制复合体”(E-RTC)[2]和“加帽中间态转录复制复合体”[Cap(-1)’-RTC][3]的工作机制。在这些工作的基础上,他们又在世界上第一次成功组装成含有形式复制矫正功能的nsp14蛋白的超分子机器Cap(0)-RTC。通过结构分析,他们发现在Cap(0)-RTC形成的同源二聚体中,解旋酶通过自身构象改变,引导模板核酸链反向移动,引发产物链“回溯”(backtracking)机制,进而将产物链3’末端传输至另一Cap(0)-RTC的nsp14外切核酸酶结构域的反应中心。复制矫正机制是新冠病毒逃逸核苷类抗病毒药物的关键机制,一旦核苷类药物被加入RNA产物链中,在其被聚合酶感知为“错配碱基”后,立刻会被病毒的复制矫正过程去除,从而丧失抑制活性。他们的研究工作,为我们生动展现了这一过程的可能机制。复制矫正的回溯机制,是从低等到高等生物细胞保证基因复制准确性的重要机制,但在病毒中以往还没有发现此类机制。这一研究成果不但发现病毒中的类似机制,是认识生命进化的重要成果,而且为进一步优化和发展新型核苷类抗病毒药物提供了关键的结构基础。 子和教授自2003年SARS爆发后,就一直在冠状病毒转录复制机制研究领域开展工作,至今已坚持了18年。2003年SARS疫情爆发期间,我当时即已了解子和教授在SARS病毒的一系列成果,智勇教授那时才刚刚开始博士阶段的学习。子和教授的研究组在国际上率先解析了SARS-CoV主蛋白酶的三维结构[6],并研发了一系列高效抑制剂[7],他们当时在转录复制复合体上的研究[8]至今仍被国际同行认为是冠状病毒转录复制复合体机制研究的“开篇之作”。这些积累,为新冠疫情爆发后他们在新冠病毒基础研究中取得的一系列重要成果奠定了坚实的基础,通过阐明新冠病毒主蛋白酶和转录复制复合体多个状态的三维结构,为认识该病毒的生命过程、发展高效抗病毒药物提供了关键信息,先后在Nature[4]、Science[1]、Cell[3,5]和Nature Communications[2]上发表系列研究论文,是国际上抗新冠药物靶点研究中最为系统、引用最多的工作之一。 2020年9月11日,习近平总书记在科学家座谈会上总结了新时代科学家精神,强调要有勇攀高峰、敢为人先的创新精神,追求真理、严谨治学的求实精神,淡泊名利、潜心研究的奉献精神,集智攻关、团结协作的协同精神,甘为人梯、奖掖后学的育人精神。18年来,子和教授的团队中有100多人先后参与冠状病毒研究,累计发表50余篇研究论文,引用超过6000余次,均篇引用超过100次,一批早期参与的俊彦陆续成长为国家科研骨干。科学依靠坚守,子和教授团队在冠状病毒的奋斗历程,对科学家精神做了一个很好的诠释。 专家点评(二) 康乐(中国科学院院士) 从结构生物学角度认识新冠病毒的转录复制机制 新冠病毒造成的疫情,是近一个世纪以来人类面对的最大的一次公共卫生事件,深入研究病毒生命周期的分子机制,是认识病毒特征、研发抗病毒手段的关键所在。新冠病毒非常特殊,它的基因组是目前已知RNA病毒中基因组最大的一种,其生命过程所涉及的分子机制也非常复杂。新冠病毒通过两个机制保证蛋白质翻译和相对准确的转录复制过程,一是要在病毒mRNA前端加上一个帽结构(cap),用于维持mRNA的稳定性和蛋白翻译的有效进行;二是通过一个独特的“复制矫正”(proofreading)机制,对病毒基因组的复制实施控制,一旦发现核酸中的错配碱基,随时进行修正。病毒转录复制复合体上的nsp14蛋白参与了这两个关键过程,可通过其C端的N7甲基化酶完成mRNA加帽过程的第三步催化反应,同时还可通过其N端的外切核酸酶完成复制矫正过程。这一现象在“非典”病毒(SARS-CoV)即已发现,但20年来一直无法回答两个截然不同的过程如何由一个蛋白来协同执行,是冠状病毒研究领域中多年来关注的核心基础生物学问题之一。 清华大学饶子和教授、娄智勇教授团队与上海科技大学合作在Cell发表的这一工作,解析了两种不同状态的“Cap(0)转录复制复合体”Cap(0)-RTC的三维结构,发现在转录复制复合体中,病毒编码的nsp9蛋白发挥了“适配器”(adaptor)的作用,将nsp10/nsp14形成的复合体招募到聚合酶上,与聚合酶上的NiRAN结构域共同形成一个“共转录加帽复合体”(Co-transcriptional Capping Complex, CCC),展示了mRNA加帽过程中,mRNA 5’端在多个关键酶分子之间的传输路径,第一次明确揭示了基因组超大的RNA病毒是如何将以聚合酶为中心的“延伸复合体”(Elongation Complex, EC)与“加帽复合体”连接起来。更加重要的是,他们在研究中发现Cap(0)转录复制复合体在溶液状态下会形成稳定的同源二聚体,通过深入研究该二聚体的结构,提出了冠状病毒复制矫正中称之为反式回溯(in trans backtracking)的机制。进一步的研究发现,在二聚体中,一个Cap(0)转录复制复合体的聚合酶催化中心与另一个Cap(0)转录复制复合体的nsp14外切核酸酶结构域催化中心相对,使合成的产物RNA 3’末端能够通过回溯的方式传输到nsp14外切核酸酶结构域进行加工。同时,他们还发现解旋酶nsp13的1B结构域发生了重大构象变化,并通过与模板核酸链的作用,引导模板核酸链反向移动,引发产物链回溯机制。值得指出的是,通过回溯的方式进行复制矫正,在真核/原核细胞中广泛存在,但是在病毒中还是第一次观察到此类机制。虽然该过程与真核/原核细胞Pol II转录过程的复制矫正机制具有一定类似性,但在Pol II的研究中,并未观测到蛋白具有巨大的构象变化,因而Pol II中回溯的驱动力也不是十分明确,而该工作表明解旋酶通过构象变化提供了回溯的驱动力,为深入理解这一基础生物学过程提供了重要的范例。
  • 1900万!东北大学300kV球差矫正透射电子显微镜采购项目
    项目编号:DDZK202202项目名称:300kV球差矫正透射电子显微镜(进口)预算金额:1900.0000000 万元(人民币)采购需求:300kV球差矫正透射电子显微镜,可实现原子级透射成像(TEM)和扫描透射成像(STEM), 通过球差矫正器,透射成像分辨率≤70pm,扫描透射成像分辨率≤60pm。球差矫正透射电子显微镜配备具有原子级分辨能力的电制冷能谱仪EDS,可进行原子级尺寸的点、线、面的定性定量分析。数量:1套合同履行期限:合同签订后360日内交货。本项目( 不接受 )联合体投标。
  • 基质升华重结晶法进行低分子量代谢产物质谱成像分析
    p style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "自质谱成像技术于二十世纪80年代前半期诞生以来,至今为止不断持续着技术改革,并被广泛运用于以新药研究和代谢产物研究领域为首的众多领域中。如今仍以提升灵敏度和空间分辨率、重现性等为目标,不断进行着技术改良。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "同时,也开发出多种离子化所需的基质,如何从这些基质中选出适用于检测目标化合物的基质成为重点。span style="text-indent: 2em "除基质选择外,其涂布方法也会对分析结果造成很大影响,因此,现有多个应用于检测目标化合物的基质涂布方法正在研究中。大致可分为喷雾法和升华法两种方法,两种涂布方法均有自己的优缺点,现阶段经常会同时使用两种方法。本公司开发了能控制基质膜厚的基质升华涂布装置iMLayer(图1),对涂布方法进行研究。/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "我们针对以往难以重结晶的基质9AA,开发了升华后重结晶的方法,并在此进行报告。此外,还将对小鼠肝脏中低分子量代谢产物的MS成像结果示例进行介绍。/pp style="text-align: right text-indent: 2em line-height: 1.75em "——R.Yamaguchi, E.Matsuo, T.Yamamoto/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong1、不同基质涂布方法对MS成像分析造成的影响/strong/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "基质涂布方法对基质的结晶形成和MS成像分析造成的影响如表1所示。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "与升华法相比,通过喷雾法生成的基质的结晶较粗,并可能因样本中所含成分的渗漏导致空间分辨率降低。均匀性较差,基质溶液干燥后结晶时会依赖湿度和温度等周围环境,因此重现性也会变差。另一方面,样本中所含化合物的提取效果较好,可能提高检测灵敏度。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "相比之下,升华法具有结晶较细、难以渗漏、均匀性好、重现性良好的特点,是高空间分辨率成像所不可或缺的方法。但相对的,其样本中成分的提取效果不佳,在灵敏度上可能存在不利的一面。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "实际的测量灵敏度依赖于检测化合物的结构。例如,在分析磷脂质等时,采用升华法便具有足够的灵敏度,诸如胺碘酮等药物可以足够的灵敏度完成MS成像(参考应用文集B61)。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "另一方面,在检测小鼠肝脏等器官中含有的ADP 和ATP 等低分子量代谢产物时,通过升华法进行基质涂布,由于没有任何提取效果,无法得到足够的灵敏度。因此,绝大多数例子都是通过喷雾法涂布9AA来实施MS成像,但其空间分辨率相对较低。于是,我们对将DHB和CHCA上使用的升华后重结晶法涂布9AA所需的条件进行了研究。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202006/uepic/0178e2f4-5edd-42fd-ab37-3b27f1e3173b.jpg" title="微信截图_20200619165723.png" alt="微信截图_20200619165723.png"//pp style="text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em "图1 基质升华装置iMLayer/pp style="text-align: center "表1 基质涂布方法对结晶形成和MS成像分析造成的影响/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202006/uepic/962223c2-c637-4894-9498-e953c6d6b688.jpg" title="2.png" alt="2.png"//pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong2、基质升华后重结晶法/strong/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="text-indent: 2em "对9AA进行升华后重结晶。如图2所示,将含有5%甲醇的滤纸和升华处理后的样本放入相同容器中,于37℃的恒温环境下静置5分钟。此时,滤纸中的5%甲醇蒸发,渗入样本中,在提取样本中化合物的同时会使少许9AA结晶溶解。之后将其真空干燥器内干燥10分钟,使溶解的9AA进行重结晶。/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="text-indent: 2em "/span/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202006/uepic/b1b946ad-81b9-4670-bd42-0b2b1b03f739.jpg" title="33333333333333.png" alt="33333333333333.png"//pp style="text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="text-indent: 2em "图2 9AA升华后重结晶的方法/span/pp style="text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="text-indent: 2em "/span/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202006/uepic/8767d240-e8eb-44fc-8470-cff5822571a1.jpg" title="444444444.png" alt="444444444.png"//pp style="text-align: center "图3 成像质谱显微镜iMScopeTRIO/pp style="text-align: center "表2 iMScope iTRIO/i测量参数/pp style="text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="text-indent: 2em "/span/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202006/uepic/69636f83-0667-4f8a-a02b-4d1c757bc977.jpg" title="55555555555.png" alt="55555555555.png"//pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong3、使用升华后重结晶法提高MS成像灵敏度/strong/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "对9AA升华后重结晶的小鼠肝脏样本,使用成像质谱显微镜iMScope iTRIO/i(图3),根据表2的参数进行质谱成像分析。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "对比升华法进行基质涂布样本与升华后重结晶样本的分析结果、比较其分析区域的平均质谱图(图4)。仅采用升华法时、能强烈检测到基质9AA的峰(m/z 385.14)(图4▼),基本上检测不到低分子量代谢产物的峰,但通过实施升华后重结晶,使来自低分子量代谢产物的峰强度增加(图4▼等),确认其提升检测灵敏度的效果。此外,其他多个低分子量代谢产物的MS图像,通过升华后重结晶的处理,能够获得更为清晰的MS图像(图5)。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "针对难以重结晶的9AA开发的升华后重结晶方法,充分利用升华法的优势成功实现了无损且高灵敏度的MS成像分析。/ppspan style="text-indent: 2em "/span/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202006/uepic/0bbf3127-6052-4b6a-af7e-a0c6fc57f542.jpg" title="6.png" alt="6.png"//pp style="text-align: center "图4 质谱图(升华法和升华后重结晶法的比较)/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202006/uepic/de208828-8702-40d6-8202-037e64b3f190.jpg" title="7.png" alt="7.png"//pp style="text-align: center "图5 MS图像(升华法和升华后重结晶法的比较)/ppbr//p

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