特异性靶基因

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  • SupelMIP SPE NNAL 4-(甲基亚硝胺)-1-(3-吡啶基)-1-丁醇（特异性亚硝胺）
    SupelMIP SPE NNAL 4-(甲基亚硝胺)-1-(3-吡啶基)-1-丁醇（特异性亚硝胺） 25mg/3ml,50支/盒 高选择性 MIP 相，用于生物液体中烟草特异性亚硝胺 NNAL 的选择性萃取。 与复杂耗时的常规萃取方法不同，SupelMIP 固相萃取 &mdash NNAL 为定量 NNAL（4-(甲基亚硝胺)-1-(3-吡啶基)-1-丁醇）提供了简单有效的萃取方法。无论是否存在尼古丁，该方法都能为游离和总 NNAL 提供一致出众的选择性和回收率。该产品包括详细的萃取方案。 SupelMIP 固相萃取相由 MIP Technologies AB 所开发，它是分子印迹聚合物的的领导者和商业先锋之一。此固定相可用于大规模分离、分析色谱和样品制备。 SupelMIP 固相萃取产品线是由高度交联聚合物组成。该类特殊的固定相对提取单个目标分析物或结构相似的分析物具有极高的选择性。 在 MIP 合成过程中模仿目标分析物设计模板分子，该模板分子形成的洞穴或印记正好与目标分析物的立体和化学结构相匹配，这使得在 MIP 合成中引入选择性成为可能。 精心设计的印迹点是通过分子模拟、实验设计或筛选方法形成的，该印记点或洞穴能够提供多种与目标分析物的相互作用点。这可实现固相和分析物之间更强的相互作用。从而，在固相萃取方法中可允许更苛刻的冲洗条件，最终得到更干净的萃取物。由于萃取选择性得到显著提高，观察到的背景更低，使得分析物的检测限更低。
    供应商： 上海楚定分析仪器有限公司
    品牌： Supelco
    价格： 面议
  • SupelMIP SPE NNAL 4-(甲基亚硝胺)-1-(3-吡啶基)-1-丁醇（特异性亚硝胺） 25mg/10ml,50支/盒
    SupelMIP SPE NNAL 4-(甲基亚硝胺)-1-(3-吡啶基)-1-丁醇（特异性亚硝胺） 25mg/10ml,50支/盒 高选择性 MIP 相，用于生物液体中烟草特异性亚硝胺 NNAL 的选择性萃取。 与复杂耗时的常规萃取方法不同，SupelMIP 固相萃取 &mdash NNAL 为定量 NNAL（4-(甲基亚硝胺)-1-(3-吡啶基)-1-丁醇）提供了简单有效的萃取方法。无论是否存在尼古丁，该方法都能为游离和总 NNAL 提供一致出众的选择性和回收率。该产品包括详细的萃取方案。 SupelMIP 固相萃取相由 MIP Technologies AB 所开发，它是分子印迹聚合物的的领导者和商业先锋之一。此固定相可用于大规模分离、分析色谱和样品制备。 SupelMIP 固相萃取产品线是由高度交联聚合物组成。该类特殊的固定相对提取单个目标分析物或结构相似的分析物具有极高的选择性。 在 MIP 合成过程中模仿目标分析物设计模板分子，该模板分子形成的洞穴或印记正好与目标分析物的立体和化学结构相匹配，这使得在 MIP 合成中引入选择性成为可能。 精心设计的印迹点是通过分子模拟、实验设计或筛选方法形成的，该印记点或洞穴能够提供多种与目标分析物的相互作用点。这可实现固相和分析物之间更强的相互作用。从而，在固相萃取方法中可允许更苛刻的冲洗条件，最终得到更干净的萃取物。由于萃取选择性得到显著提高，观察到的背景更低，使得分析物的检测限更低。
    供应商： 上海楚定分析仪器有限公司
    品牌： Supelco
    价格： 面议
  • 人类基因组芯片配件
    人类基因组芯片配件是全球第一个完全基于人类基因组顺序的基因芯片微阵列，这种基因芯片的设计和制造使用了完整注解的25 509组人类基因。 这种新一代人类基因组芯片配件相对于其它产品有重要优势，其它产品往往从来源源注释不清的基因数据库组成ESTs序列。 这 种ArrayIt人类基因组芯片H25K/BT是一种多用途微阵列，含有26304长的寡核苷酸，设计用来优化在一个单一的生化反应中的对整个人类基因组 的研究。用户可以利用从基因组DNA，mRNA和蛋白质中的样品。可以研究许多问题，从核型分析和基因表达分析，到以染色质结构和蛋白质-DNA相互作用 的问题都可以研究。基因表达的革命性的学说是，一个位点上基因的单个杂交反应中可以定量测量超过300 000个基因转录。研究人员可能在H25K/ BT芯片买到一个或多个寡核苷酸。 关于生物信息学，寡核苷酸生产的最先进的技术，芯片印刷和表面化学带来前所未有的特异性和敏感性，从而优化结果的分析和利用。 编号 名称 H25K:BT 人类整个基因组(25 509 基因 - 26 304 长寡核苷酸)
    供应商： 孚光精仪（中国）有限公司
    品牌： 孚光精仪
    价格： 面议
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  • Qubit Flex八通道核酸/蛋白定量荧光计 400-807-5250
    Qubit Flex八通道核酸/蛋白定量荧光计 产品描述Qubit Flex荧光计可同时准确测量多达 8 个样品，为DNA、RNA和蛋白质定量提供更灵活的通量选择。与单样品微量体积荧光计相比，Qubit Flex荧光计可对多样品同时进行检测，大大节约时间。Qubit Flex荧光计继承了Qubit 4荧光计的卓越准确性和灵敏度，同样采用荧光染料法，可特异性区分定量检测dsDNA、ssDNA、RNA，适合样品珍贵、对准确性要求高的应用领域，如NGS, qPCR, RT-PCR, 基因芯片Microarrays, Northern blot, Southern blot, Sanger sequencing, 转录, 转染, 克隆等。 特点与优点准确且可靠：荧光染料法特可特异性定量dsDNA、ssDNA、RNA、蛋白质，具有更出色的可重复性和低误差率灵敏且特异：比紫外吸光法更灵敏，可区分游离核苷酸或盐离子等杂质，样品仅需低至1μl更节约珍贵样品高效且便捷：3秒即可完成检测，可同时测多达8孔样品，避免单次重复操作，大触摸屏直观易用，大大节约时间50%专门内置四款计算器，帮助简化实验，提高效率：试剂计算器：可帮助算出需要制备多少量的工作溶液以用于所检测的样品量检测范围计算器：基于样品体积及检测类型，呈现最准确的核心浓度范围和可扩展的高低范围摩尔浓度计算器：可根据核酸长度和测得的浓度，快速计算样品的摩尔浓度归一化计算器：可用于测序文库制备中标准均一计算，轻松获得所需的质量、浓度或摩尔质量数据处理更轻松：本地数据可储存10,000样本，轻松通过Wi-Fi, USB, 网线连接导出数据可提供Digital SmartStart™ 3D在线演示教程，可视化互动展示如何安装、操作和维护仪器，随时随地可学Qubit 荧光计及套装订购信息：产品包装货号Qubit Flex荧光计1台Q33327Qubit Flex NGS入门套装1套Q45893Qubit Flex定量入门套装1 套Q45894Qubit Flex 八联管条125 tube stripsQ33252Qubit Flex 储液槽100 reservoirsQ33253Qubit Flex 系统验证分析试剂盒50 assaysQ33254DNA Assay KitsQubit 1X dsDNA HS Assay Kit100 assaysQ33230500 assaysQ33231Qubit dsDNA HS Assay Kit100 assaysQ32851500 assaysQ32854Qubit dsDNA BR Assay Kit100 assaysQ32850500 assaysQ32853Qubit ssDNA Assay Kit100 assaysQ10212RNA Assay KitsQubit RNA IQ Assay Kit75 assaysQ33221275 assaysQ33222Qubit RNA HS Assay Kit100 assaysQ32852500 assaysQ32855Qubit RNA BR Assay Kit100 assaysQ10210500 assaysQ10211Qubit microRNA Assay Kit100 assaysQ32880500 assaysQ32881Protein Assay KitsQubit Protein Assay Kits100 assaysQ33211500 assaysQ33212官方渠道购买 — 品质保证，售后无忧 从现在起，通过赛默飞世尔科技官方渠道购买全新Qubit Flex 荧光计，即享三年免费退换。 如果您在使用过程中需要技术支持，或者您的仪器出现问题或故障，请致电/ 或发送电子邮件至 获取帮助。了解更多，请访问
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    厂商： 赛默飞世尔科技生命科学产品
    品牌： Invitrogen
    型号： Qubit Flex
    价格： 面议
  • 自动基因扩增仪 400-860-8560
    无人值守 您的PCR实验自动完成 自动基因扩增仪 Biometra TRobot II 可与自动化平台整合来实现无人值守的全自动工作流程， 适用于96孔和384孔的样品通量，运行快速、温控精准、运行稳定，三面的开盖方式可匹配各种机械臂实现样品板的轻松取放，加密的数据传输能确保数据的完整性，提供多级用户权限管理，具有断电自动重启、自检等功能，在高通量NGS、大规模群体研究、疾病的全基因组关联研究、高通量分子标记筛选、药物筛选等方面都有很好的应用。 精准温控 温控精准：秉承耶拿公司三十多年的 PCR 研发制造经验，采用先进的Peltier 帕尔贴半导体温控技术，具有超高的温度准确性和均一性，提供快速高效、可靠稳定的 PCR 扩增速度快：运行速度快，不仅节省实验时间，还可提高扩增产物的特异性 型号齐全：有常规通量 96 孔和高通量 384 孔样品槽可选，有快速镀金银槽和常规铝合金槽可选 平整易清洁：样品槽四周平整光滑，无沟槽，极易清洁，不易积灰智能热盖 由于自动化 PCR 仪需要与机械臂配合来实现自动取放样品板，而与人相比，机械臂的灵活性会稍逊一筹，因此与普通 PCR 仪相比，如何保证机械臂能方便安全地取放样品板，是考察自动化 PCR 仪好坏的很重要的方面。 自动开盖：设计合理巧妙的弧形向上开盖方式，可轻松且安全地自动打开和关闭 PCR 热盖 三面开放：热盖打开后，形成完全敞开的空间，显露出完整的样品槽，既可以从仪器正面取放样品板，也可以从仪器左右两个侧面取放样品板，实现和市面上各类自动机械臂的完美兼容使用，方便整合进整个自动化平台 防止蒸发：热盖温度达到设定温度后，模块才会升温，确保样品管上方温度始终高于样品温度。热盖垂直向下施压，整板受力均匀，根据 PCR 板的高低不同可精细调节热盖接触压力，不仅有效防止样品蒸发，还为用户选择 PCR 板提供很大的开放性和灵活性，对耗材没有限制 安全制动：热盖带有安全感应框，碰到阻力会自行中断关盖程序，防止意外发生 经久耐用：无磨损的开关盖方式延长仪器使用寿命，并有助于整个自动化系统的稳定运行兼容多种自动化系统 耶拿公司不仅具有三十多年的 PCR 开发生产历史，还拥有三十多年的自动化工作站研制经验，在自动化系统设计和整合方面提供专业的产品和服务。 安全取板：经过数十轮的 PCR 循环和热盖高压后，样品板往往会紧密贴合在样品槽中，如果机械臂直接去取板，很难轻易取出。耶拿的自动 PCR 仪，设计了专利性的样品板自动抬离装置，取板前可自动将 PCR 板轻缓平稳地抬离样品槽，方便机械臂抓取 PCR 板并将其移出PCR 仪，避免卡板等意外的发生 兼容性好：基于合理的三面开放的开盖方式，智能安全的取板设计，以及低矮的仪器高度，占地面积小，能很好地与各种自动化机器臂配合使用，搭建成全自动 PCR 平台 适用性强：可通过耶拿公司提供的标配软件 TSuite 来独立控制 PCR 仪的自动运行，也可通过预置的驱动来兼容其他的自动化平台TSuite 软件提供自动 PCR 仪的全面功能，如创建程序、控制仪器运行、生成仪器运行状态和操作步骤的详细文档等。加密的数据传输能确保数据的完整性，提供三级用户权限管理功能，符合 GMP 规范各种运行和维修日志文件符合 GMP的法规要求，在发生故障时，日志文件还有助于快速排查故障原因仪器可独立运行，因此可通过 TSuite 软件预先优化好 PCR 程序，再整合入自动化系统，简化实验优化过程PCR 仪上带有仪器运行指示灯，可通过灯的颜色和状态来直观便捷地了解仪器的状态，无需再去查看软件界面，非常方便 耗材开放：可使用全裙边或半裙边的 PCR 板，可使用高缘板或低缘板，可使用封膜、硅胶垫或者塑料盖
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    厂商： 耶拿分析仪器（北京）有限公司
    品牌： 耶拿/JENA
    型号： Biometra TRobot II
    价格： 面议
  • SpeedCycler2 高速基因扩增仪（PCR） 400-860-8560
    新品详情 &bull 高速：镀金纯银槽，防腐蚀抗氧化，高品质Peltier控温，升温速率最高可达15℃/s &bull 高效：SAC自适应技术实现90%以上的热能利用率，能使常规的30s-30s-60s的PCR程序缩短为2s-2s-10s甚至更短，最快8min即可完成一个常规PCR实验 &bull 高质量产物：样品温度在非常短的时间内达到设定温度，大大缩短退火时间，有效防止引物错配，提高扩增产物的特异性 &bull 配置灵活：有多种型号可选，有能使高速效果达到极致的96孔LPR模块，也有耗材开放的96孔SPR模块 &bull SPS样品保护技术：热盖温度先升高，其温度达到设定温度前，不与样品管接触，当达到设定温度时，热盖自动下压，与样品管接触，此时模块才开始升温，这样可以确保样品无蒸发，即使5µ l的反应体系也能得到很好的结果 &bull 硬件热启动功能：升温速度快，在PCR起始阶段迅速达到变性步骤，有效防止PCR初期的非特异性扩增，达到类似热启动PCR的效果 &bull 功能齐全：除常规的PCR外，还可设置Touchdown PCR实验，以提高PCR扩增产物特异性 &bull 控制灵活：可通过5.7英寸的彩色触摸控制器HID-Pro 320单机操作，也可连接电脑操作&bull 操作方便：基于Windows CE的软件，界面友好，操作简便&bull 断电保护功能：断电后再次来电时仪器会自动重启，从断电前最后一个循环的变性步骤开始，以减少非特异性扩增产物 技术参数 热反应模块材质：高品质的镀金纯银Peltier模块，防腐蚀抗氧化模块种类：96孔LPR 模块：96 x 20µ l 96孔SPR 模块：96 x 0.2ml 96孔SP 模块：96 x 0.2ml模块温度控制紧凑快速型（96孔LPR模块）：升温速率：最大15℃/s降温速率：最大10℃/s标准快速型（96孔SPR模块）：升温速率：最大8℃/s降温速率：最大6℃/s标准普通型（96孔SP模块）：升温速率：最大5.5℃/s降温速率：最大4℃/s温度控制模式：模块控制、仿真的样品管控制模块温度范围：4-105℃温控准确性： ± 0.2℃ at 72℃温度均一性： ± 0.3℃ at 72℃温度递增调节：± 0.1℃-1℃/循环时间递增调节± 0.1s -1s/循环热盖温度：最高可达120℃接触压力：自动调节用户操作界面通过PC，带操作软件；或通过彩色触摸控制器HID-Pro 320存储能力HID-Pro 320可存储500个程序，通过USB外接存储器则无限量仪器重量12kg仪器尺寸280 x 290 x 250mm（W x H x D）
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    厂商： 耶拿分析仪器（北京）有限公司
    品牌： 耶拿/JENA
    型号： SpeedCycler2
    价格： 面议
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  • 增加RT-PCR特异性的办法

    第一链cDNA合成的起始可以使用三种不同的方法，各种方法的相对特异性影响了所合成cDNA的量和种类。随机引物法是三种方法中特异性最低的。引物在整个转录本的多个位点退火，产生短的，部分长度的cDNA。这种方法经常用于获取5‘末端序列及从带有二级结构区域或带有逆转录酶不能复制的终止位点的RNA模板获得cDNA。为了获得最长的cDNA，需要按经验确定每个RNA样品中引物与RNA的比例。随机引物的起始浓度范围为50到250ng每20μl反应体系。因为使用随机引物从总RNA合成的cDNA主要是核糖体RNA，所以模板一般选用poly（A）+RNA。Oligo（dT）起始比随机引物特异性高。它同大多数真核细胞mRNA 3’端所发现的poly（A）尾杂交。因为poly（A）+RNA大概占总RNA的1%到2%，所以与使用随机引物相比，cDNA的数量和复杂度要少得多。因为其较高的特异性，oligo（dT）一般不需要对RNA和引物的比例及poly（A）+选择进行优化。建议每20μl反应体系使用0.5μg oligo（dT）。oligo（dT）12-18适用于多数RT-PCR。ThermoScript RT-PCR System提供了oligo（dT）20，因为其热稳定性较好，适用于较高的保温温度。基因特异性引物（GSP）对于逆转录步骤是特异性最好的引物。GSP是反义寡聚核苷，可以特异性地同RNA目的序列杂交，而不象随机引物或oligo（dT）那样同所有RNA退火。用于设计PCR引物的规则同样适用于逆转录反应GSP的设计。GSP可以同与mRNA3‘最末端退火的扩增引物序列相同，或GSP可以设计为与反向扩增引物的下游退火。对于部分扩增对象，为了成功进行RT-PCR，需要设计多于一个反义引物，因为目的RNA的二级结构可能会阻止引物结合。建议在20μl的第一链合成反应体系中使用1pmol反义GSP。提高逆转录保温温度为了充分利用GSP特异性的全部优点，应该使用有较高热稳定性的逆转录酶。热稳定逆转录酶可以在较高温度保温以增加反应严谨性。比如，如果一个GSP退火温度为55℃，那么如果使用AMV或M-MLV在低严谨性的37℃进行逆转录，GSP所带有的特异性就没有完全利用。然而SuperScripⅡ和ThermoScript可以在50℃或更高进行反应，这就会消除较低温度时产生的非特异性产物。为获得最大的特异性，可以将RNA/引物混合物直接从65℃变性温度转移到逆转录保温温度，并加入预热的2×反应混合液（cDNA合成热启动）。这有助于防止低温时分子间碱基配对。使用PCR仪可以简化RT-PCR所需的多种温度转换。http://www.biomart.cn/upload/asset/2009/03/27/1237778966.gif图 逆转录温度对RT-PCR特异性的影响使用ThermoScriptTM和设计用来同人DNA聚合酶ε mRNA退火的GSP，由1μg Hela RNA合成cDNA。ThermoscriptTM加入到预热的反应混合液中，使用Platinum Taq DNA聚合酶对1/10的cDNA进行35个循环的PCR。减少基因组DNA污染RT-PCR所遇到的一个潜在的困难是RNA中沾染的基因组DNA。使用较好的RNA分离方法，如Trizol Reagent，会减少RNA制备物中沾染的基因组DNA。为了避免产生于基因组DNA的产物，可以在逆转录之前使用扩增级的DNaseⅠ对RNA进行处理以除去沾染的DNA。将样品在2.0mM EDTA中65℃保温10分钟以终止DNaseⅠ消化。EDTA可以螯合镁离子，防止高温时所发生的依赖于镁离子的RNA水解。为了将扩增的cDNA同沾染的基因组DNA扩增产物分开，可以设计分别同分开的外显子退火的引物。来源于cDNA的PCR产物会比来源于沾染的基因组DNA的产物短。另外对每个RNA模板进行一个无逆转录的对照实验，以确定一个给定片段是来自基因组DNA还是cDNA。在无逆转录时所得到的PCR产物来源于基因组。

  • 双特异性抗体的优缺点介绍

    [font=宋体][font=宋体]双特异性抗体是含有两种抗原结合位点的抗体，可结合不同表位（通常在两个抗原上）。一般来说，一个抗原结合位点特异性结合靶细胞表面的抗原，而另一个则结合效应细胞表面上的触发分子，例如一种[/font][font=Calibri]Fc[/font][font=宋体]γ[/font][font=Calibri]R[/font][font=宋体]或[/font][font=Calibri]CD3/T[/font][font=宋体]细胞受体复合物。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]双特异性抗体可以改变效应细胞对其自然靶标的特异性，并使其重定向，杀死它原本会忽略的靶标。不同的细胞毒性细胞表达不同的触发分子（受体）。因此，通过改变靶标和效应结合域的特异性，可针对大多数类型的靶细胞产生多种效应应答。或者，通过特异性结合血清免疫球蛋白，可以实现全范围的效应功能（即[/font][font=Calibri]ADCC[/font][font=宋体]、吞噬作用、补体激活和延长血清半衰期）。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]近日，市面上出现了用于治疗用途的两种双特异性抗体。由于其独特的作用机制，双特异性抗体受到了广泛的关注，越来越多的双特异性抗体不仅用于癌症研究，也用于其他疾病的临床试验。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b]双特异性抗体的优缺点：[/b][/font][font=宋体]优势：[/font][font=宋体]①双特异性抗体将效应细胞直接靶向肿瘤细胞，增强其细胞毒性。[/font][font=宋体]②双特异性抗体可以同时识别两种分子，提高了抗体的选择性和功能性亲和力，改善了药物的安全性和有效性。[/font][font=宋体]③与两种单克隆抗体药物联合用药治疗相比，双特异性抗体药物减少了开发和临床试验成本。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体]与单克隆抗体药物相比，双抗药物也存在不足之处，主要表现在：[/font][font=宋体]①存在重链、轻链错配现象，制备工艺难度高[/font][font=宋体]②双抗并非天然结构，存在使用过程中产生抗药物抗体的可能。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b]双特异性抗体的制备方法：[/b][/font][font=宋体][font=宋体]制备[url=https://cn.sinobiological.com/resource/antibody-technical/bispecific-antibody][b]双特异性抗体[/b][/url]，科学界同仁已开发了诸多解决方案。杂交[/font][font=Calibri]-[/font][font=宋体]杂交瘤法（也称为四源杂交瘤）是最早用于制备双特异性抗体的技术。基于两种不同杂交瘤细胞系的体细胞融合，表达所需特异性的鼠[/font][font=Calibri]IgG[/font][font=宋体]。然而，这种方法制备的功能性双特异性抗体占比低，为后续的抗体纯化和质控带来了巨大的挑战。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]通过使用分子克隆技术，双特异性[/font][font=Calibri]IgG[/font][font=宋体]抗体由同一细胞系表达的两条不同重链和轻链组成。双特异性抗体的制备需要至少两个用于异二聚化重链的质粒和一个用于公共轻链的质粒。如果使用两个不同的轻链，则需要两个轻链质粒。一般建议[/font][font=Calibri]2[/font][font=宋体]个单独的质粒上表达[/font][font=Calibri]HC[/font][font=宋体]和[/font][font=Calibri]LC[/font][font=宋体]，因为调整质粒比率是一种简单有效的方法。随后，通常要经历复杂的过程从异质稳定转染池中选择最理想的克隆细胞系，以用于大规模抗体生产。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]与稳定转染相比，瞬时转染无需将重组[/font][font=Calibri]DNA[/font][font=宋体]整合至宿主基因组中，可以在数天内快速得到结果。人胚肾细胞（[/font][font=Calibri]HEK293[/font][font=宋体]）可用于双抗的瞬时表达，适合应用于双抗药物开发的早期阶段。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]更多详情可以查看：[/font][font=Calibri]https://cn.sinobiological.com/resource/antibody-technical/bispecific-antibody[/font][/font]

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  • 科研快讯 | MGISEQ-200助力CRISPR基因编辑系统的特异性精准开发
    近日，北京大学神经科学研究所的科学家们在Science Advances 杂志发表了题为Development of a CRISPR-SaCas9 system for projection-and function-specific gene editing in the rat brain的研究论文。该研究基于CRISPR-SaCas9技术，结合腺相关病毒和细胞标记技术，以功能特异性模式实现基因编辑，在实验大鼠的脑中实现了特定记忆的精准删除。在研究中，研究人员对基因编辑靶点和潜在的脱靶位点进行扩增建库并使用基因测序仪MGISEQ-200对扩增产物进行深度测序。测序数据分析结果显示：潜在脱靶位点相对于基因编辑靶点在indel发生率方面至少低两个数量级（图1），同时在单细胞水平上对基因编辑后靶点区域的indel信息进行了验证（图2）。与以往的相关研究报道一致，SaCas9对DNA错配有较高的抗性，在体内能够保证高的靶点特异性。图1 基因编辑靶点和潜在脱靶位点序列及indel发生率图2 基因编辑靶点序列及基因编辑后测序结果展示作为一款小型化的桌面型基因测序仪，MGISEQ-200小巧、灵活，应用广泛，支持基于杂交捕获或多重PCR扩增的靶向测序、小型基因组测序、低深度全基因组测序等多种应用。目前，通过MGISEQ-200获得测序数据并由此展开深入探讨的相关研究已陆续见刊。其中，基于MGISEQ-200深度测序的新冠病毒转录组结构研究于4月份登上了Cell杂志，为全球科学家的后续研究提供参考和依据。小贴士MGISEQ-200已发表文章（精选）[1] 一例基孔肯雅病毒和寨卡病毒混合感染病例的发现.华南预防医学.DOI: 10.13217/j.scjpm.2019.0481[2] Devolopment of a CRISPR-SaCas9 system for projection and function-specific geneediting in the rat brain. Science Advances.DOI: 10.1126/sciadv.aay6687[3] Thearchitecture of SARS-CoV-2 transcriptome. Cell.DOI: 10.1016/j.cell.2020.04.011
    时间： 2020-06-15
    作者： 华大智造
  • ​Nat Bio Eng封面文章 | 傅阳心团队开发新型双特异性抗体—通过靶向树突状细胞上的PD-L1来重新激活肿瘤特异性T细胞
    双特异性T细胞衔接器（bispecific T-cell engager，BiTE）是一种能够同时结合肿瘤相关抗原（tumor associate antigen， TAA）和 CD3 复合物的抗体类抗肿瘤药物。传统的技术是通过靶向TAA 来实现肿瘤内T细胞上CD3信号通路的再激活，从而达到杀伤肿瘤细胞的效果【1-3】。自上世纪90年代起，针对双特异性抗体疗法的设计和改进已经有了近30年的研究。然而，目前为止只有安进公司（Amgen）的Blinatumomab (针对CD19 的 BiTE) 被FDA 批准用于治疗复发或难治性急性淋巴细胞白血病 (acute lymphoblastic leukemia, ALL)【4,5】。以细胞因子风暴（cytokine storm）为主的副作用限制了其他针对实体瘤的BiTE所进行的临床测试。仅在2021年，安进公司就暂停了4种 BiTE的一期临床试验, 所涉及的抗原包括FLT3, BCMA, CD33和EGFRVIII。除了严重的副作用之外，半衰期短，TAA特异性低以及抑制性肿瘤微环境都是限制BiTE在体内发挥抗肿瘤效应的重要因素。因此，提升双特异性抗体的有效性并降低其副作用能够极大的促进该疗法在临床的广泛应用。图1 正在以单药形式进行临床测试的双特异性抗体2021年11月1日，美国德克萨斯大学西南医学中心傅阳心团队在Nature Biomedical Engineering杂志上发表了题为Rejuvenation of tumour-specific T cells through bispecific antibodies targeting PD-L1 on dendritic cells的文章。该研究构建了靶向免疫检验点PD-L1 和CD3ε的双特异性抗体 （PD-L1xCD3）。在多种小鼠肿瘤模型上，PD-L1xCD3比传统的TAA靶向性双特异性抗体（ErbxCD3）展现出了更强的抗肿瘤效果。利用多种条件性敲除小鼠表明，PD-L1xCD3在体内主要结合树突状细胞（dendritic cells， DCs）表达的PD-L1而并非肿瘤细胞或巨噬细胞表达的PD-L1，进而重新激活了肿瘤内部的抗原特异性CD8 T 细胞免疫反应来达到治疗肿瘤的效果。进一步的机制研究表明，PD-L1xCD3与DC上PD-L1的结合，促进了共刺激分子B7和CD28之间的相互作用，从而避免T细胞发生激活诱导的细胞死亡（activation-induced cell death），进而实现肿瘤内T 细胞长效激活的效果。研究团队首先在体外验证了制备的PD-L1xCD3能够同时结合PD-L1和CD3ε，并能够以PD-L1依赖的方式刺激T细胞活化并分泌IFNγ，杀伤肿瘤细胞。体内实验进一步表明PD-L1xCD3能够在MC38模型上产生良好的抗肿瘤效果并优于anti-PD-L1和anti-CD3的联合治疗，从而表明PD-L1xCD3具有其独特的作用机制。通过细胞过继转移和删除实验表明，PD-L1xCD3能够诱导抗原特异性CD8 T细胞反应并产生免疫记忆，而这一现象依赖于肿瘤内预存的CD8 T 细胞。为了研究PD-L1xCD3是否比传统的TAAxCD3具有更强的抗肿瘤效果，作者们制备了靶向TAA的ErbxCD3双特异性抗体，并通过体外实验证明其具有与PDL1xCD3相似的亲和力，激活T细胞能力和肿瘤细胞杀伤能力。然而体内实验却表明，在相同剂量下PD-L1xCD3比ErbxCD3展现出了更强的抗肿瘤效果，并且这一现象在TC1，B16F10，TuBo等多种模型上均得到了验证，提示靶向免疫检验点PD-L1的双特异性抗体比靶向TAA具有更好的激活T细胞能力。为了进一步探究产生这种区别的本质原因，作者们首先通过在不同的细胞上敲除了PD-L1来探寻哪种细胞表达的PD-L1对于PD-L1xCD3在体内的抗肿瘤效果是必须的。出乎意料的是，尽管肿瘤细胞本身是最主要的PD-L1阳性的细胞，但敲除肿瘤细胞上的PD-L1并没有影响PD-L1xCD3的治疗效果。与之相反，敲除宿主细胞上的PD-L1却彻底废除了PD-L1xCD3的治疗效果。通过条件性PD-L1敲除小鼠实验表明，树突状细胞而并非巨噬细胞表达的PD-L1起到了至关重要的作用。作者进一步利用Batf3敲除小鼠确认树突状细胞亚群（cDC1）对于PD-L1xCD3的治疗效果是不可或缺的。前期研究表明，anti-PD-(L)1 治疗能够通过增强B7-1(CD80) 与CD28的相互作用来达到激活T 细胞的效果6, 7。由此，研究人员提出了PD-L1xCD3治疗是通过增强共刺激信号来发挥作用的假设。结果也表明，用抗体阻断CD80/86后，PD-L1xCD3的治疗效果消失同时抗原特异性T细胞反应也大大减弱。通过体外共培养实验证明，PD-L1xCD3能够通过增强共刺激信号的方式促进IL-2的分泌，避免T细胞因过度激活导致的凋亡，从而实现肿瘤内T细胞的长效激活。传统BiTE的设计理念是通过单链抗体（ScFv）衔接T细胞与肿瘤细胞，促使T细胞活化并直接进行肿瘤细胞杀伤。然而，在肿瘤微环境里T细胞的数量和质量都非常有限。而肿瘤细胞不仅数量“占优”并且能够通过激活抑制性信号通路（如PD-L1/PD-1）来逃逸杀伤。与此同时，由于肿瘤细胞本身并不表达共刺激分子，其激活T细胞的效果非常有限。面对数倍于己的“敌军”，T细胞在反复杀伤的过程中很容易产生耗竭而败下阵来。与之相反，作为新型双特异性抗体，PD-L1xCD3能够将T细胞与树突状细胞衔接在一起，从而为其激活提供充足的条件（共刺激分子）。通过与树突状细胞的相互作用，T细胞不仅得到了有效的激活并且能够通过IL-2实现自我扩增。最终实现T细胞的持续性激活并获得持久的抗肿瘤免疫反应。图二：PD-L1xCD3的作用机理综上所述，该研究为新一代双特异性抗体设计提供了思路。证明了PD-L1xCD3 具有优于传统BiTE的如下特点：1）靶向肿瘤组织降低毒性；2）阻断PD-L1/PD-1相互作用，解除T细胞抑制；3）靶向DC细胞为T细胞激活提供共刺激信号，从而促进IL-2介导的T细胞存活。据悉，该论文已被选为Nature Biomedical Engineering 杂志11月份的封面故事。该研究的通讯作者是美国德克萨斯大学西南医学中心的乔健博士和傅阳心教授。刘龙超博士为论文的第一作者。原文链接：https://www.nature.com/articles/s41551-021-00800-2
    时间： 2021-11-02
    作者： dahua1981
  • 科学家开发出用于肝癌特异性筛查的全基因组cfDNA片段化特征检测方法
    肝癌的发病率和死亡率在癌症中位居前列，全世界每年新增病例超过90万，死亡病例超80万。在所有肝癌病例中，肝细胞癌 (HCC)占比约90%，对肝细胞癌高危人群进行有效、高灵敏度的筛查显得尤为重要。目前对肝癌高危人群早筛的方法是肝脏超声检查和血清甲胎蛋白（AFP）监测，其筛查灵敏度从47%-84%不等，特异性在67%-90%之间。因此，当前急需开发灵敏、高效的非侵入性肝细胞癌筛查方法。　　近期，来自美国约翰霍普金斯大学的研究团队在《Cancer Discovery》上发表题为“Detecting liver cancer using cell-free DNA fragmentomes”的文章。该研究开发出一种基于血液的全基因组cfDNA片段化检测方法（DELFI），为HCC检测提供了一种高性能、具有成本效益的新选择。　　研究人员检测了501名训练队列个体的血浆样本，对cfDNA片段进行低覆盖率基因组测序，分析HCC患者中cfDNA的分子来源，并确定了与片段化变化相关的基因组和染色质特征。通过机器学习方法构建DELFI模型。结果显示，在平均风险人群中，DELFI模型对HCC检测的敏感性为88%，特异性为98%；在高危人群中，DELFI模型对HCC检测的敏感性为85%，特异性为80%。此外，研究人员将来自223名香港患者的全基因组序列数据作为验证队列进行检测。在验证队列中，DELFI模型可将AUC为0.97的HCC患者与高危个体区分开来，有效证明了模型的可靠性。　　该研究开发的全基因组cfDNA片段化特征检测方法对HCC具有高灵敏度和特异性，弥补了血清甲胎蛋白监测敏感性低、准确率差的不足，有望为肝癌高危人群提供可靠且具有成本效益的筛查方式。　　注：此研究成果摘自《Cancer Discovery》杂志，文章内容并不代表本网站的观点和立场，仅供参考。
    时间： 2023-06-20
    作者： dahua1981
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