脱氧核苷酸钠

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脱氧核苷酸钠相关的耗材

  • 寡核苷酸分离技术
    寡核苷酸分离技术合成寡核苷酸和DNA片段被应用于迅速发展的应用领域，包括作为主体或杂交探针用于治疗性制剂。沃特世寡核苷酸分离技术(OST：Oligonucleotide Separation Technology)基于BEH杂化颗粒的反相色谱柱，以及Gen-Pak离子交换柱，应对各种高分辨分析与实验室规模分离挑战所需，包括涉及各种DNA和RNA品种。沃特世OST色谱柱装有键合了C 18 的第二代杂化技术BEH颗粒。对去三苯甲基(detritylated，或称脱保护)的合成寡核苷酸样品的分离，基于成熟的离子对反相色谱法。沃特世提供1.7 μm UPLC颗粒或2.5 μm HPLC颗粒，装填以各种不同色谱柱规格，从而灵活满足各种实验室规模分离或分析的不同需求，并能实现异乎寻常的样品分辨率和卓越的色谱柱使用寿命。此外，沃特世的制造和质控测试程序，有助于确保批次之间与柱之间的性能的一致性，而无论应用的难度有多高。1、分离效率相当于或优于PAGE、CGE、或离子交换HPLC方法2、可从去三苯甲基(脱保护)的全长产物中分辨出失败序列3、可放大的柱规格，满足实验室规模的分离需求4、超长的色谱柱使用寿命，降低单次分析或分离成本5、经MassPREP OST标准品质控测试，帮助确保性能稳定对寡核苷酸混合物具有异乎寻常的高分辨率ACQUITY UPLC OST C 18 ，1.7 μm色谱柱(设计专用于ACQUITY UPLC系统)和XBridge OST C 18 ，2.5 μm色谱柱，能完全适用于离子对反相色谱法分析和纯化去三苯甲基寡核苷酸的需求。如图所示(右图)，使用沃特世UPLC技术所进行的分离，具有与毛细管凝胶电泳(CGE)相媲美的组分分辨率，而且分析时间显著缩短。由于使用亚2 μm BEH技术颗粒提高了分辨力，因而有可能对大寡核苷酸序列进行分离(如将N与N-1分开)。此外，使用沃特世OST色谱柱配合质谱联用技术以及对质谱兼容的洗脱剂，有可能对与失败序列的色谱分离开的目标寡核苷酸产物的分子量特征进行定量分析。分离15-60mer去三苯甲基寡脱氧胸苷序列组(Detritylated Oligodeoxythymidine Ladder)分离去三苯甲基寡脱氧胸苷序列组，比较毛细管凝胶电泳(CGE)与离子对反相色谱方法的分离效果纯化单链RNA干扰RNA寡核苷酸的UPLC/MS分析RNA干扰(RNAi)机制的发现现在被广泛用于静默目标基因表达，这推动了对小分子干扰RNA(siRNA)分析的需求。为满足对20-25个核苷酸的小分子干扰RNA(siRNA)进行耐用的、快速的、灵敏的分析的需求，沃特世开发了一个UPLC/MS方法，运用了UPLC OST色谱柱和Synapt HDMS质谱仪。采集准确质量可对5’-截断寡聚体(寡核苷酸合成过程所产生的失败序列)以及其它一些杂质峰进行分配。质谱图中的质量的每个峰均使用MaxEnt 1软件进行去卷积化。图2给出了推测性的5’-端失败产物。对寡核苷酸母体的几乎完整序列均进行了解释。质谱分析还显示除了目标21-mer RNAi序列以外，还存在一个额外的尿苷单核苷酸。对一个21mer的RNA进行LC/MS分析不同离子对试剂对不同寡核苷酸序列分离的影响杰出的柱寿命在这些苛刻的分离条件下，填充以BEH技术颗粒的沃特世OST色谱柱显示出引人注目的柱寿命，同时还具有并保持卓越的分离性能。而在相同的苛刻分离条件下，传统硅胶基质色谱柱的使用寿命显著缩短。分离5-25mer去三甲苯基(脱保护)寡脱氧胸苷序列——进样1000针柱分辨率没有任何变化寡核苷酸分离技术(OST)柱产品一览表产品描述 粒径 孔径 柱规格 部件号ACQUITY UPLC OST C 18 * 1.7 μm 135 2.1 x 50 mm 186003949ACQUITY UPLC OST C 18 * 1.7 μm 135 2.1 x 100 mm 186003950ACQUITY UPLC OST C 18 * 1.7 μm 135 2.1 x 150 mm 186005516ACQUITY UPLC OST C 18 方法验证包** 1.7 μm 135 2.1x 100 mm 186004898ACQUITY UPLC OST C 18 定制柱* 1.7 μm 135 定制 186003951XBridge OST C 18 2.5 μm 135 2.1 x 50 mm 186003952XBridge OST C 18 2.5 μm 135 4.6 x 50 mm 186003953XBridge OST C 18 2.5 μm 135 10 x 50 mm 186003954XBridge OST C 18 方法验证包** 2.5 μm 135 4.6 x 50 mm 186004906XBridge OST C 18 定制柱 2.5 μm 135 定制 186003955* 用于配合沃特世UPLC系统使用**来自于不同批次填料所装填的三根色谱柱可放大的DNA与RNAi分离，良好的产品回收率研究基因静默、或用于基因敲除时，需要高纯度寡核苷酸。XBridge OST C 18 色谱柱，具有极高分辨率，其柱规格设计用于满足实验室规模的分离需求，是纯化去三苯甲基(脱保护)寡核苷酸的首选色谱柱。如下表所示，XBridge OST C 18 色谱柱规格和操作流速的选择，主要取决于合成反应混合物的规模大小。我们建议根据寡核苷酸样品的载量选择适当的色谱柱规格，这样可使组分分辨率最大化，使目标产物与不要的失败序列分离开得到最大回收率。柱规格 大概样品载量** mg*** 流速2.1 x 50 mm 0.04 μmoles 0.2 mg 0.2 mL/min4.6 x 50 mm 0.20 μmoles 1.0 mg 1.0 mL/min10 x 50 mm 1.00 μmoles 4.5 mg 4.5 mL/min19 x 50 mm* 4.00 μmoles 16.0 mg 16.0 mL/min30 x 50 mm* 9.00 μmoles 40.0 mg 40.0 mL/min50 x 50 mm* 25.00 μmoles 110.0 mg 110.0 mL/min* OST订制柱** 所列数值仅为约值，且取决于寡核苷酸的长度、碱基组成、以及所采用的“切取中心”的馏分收集方法。*** 按平均寡核苷酸分子量及合成产率估算将siRNA Duplex与其相关杂质分离开
    供应商： 百道亨仪器设备（北京）有限公司
    品牌： 沃特世
    价格： 面议
  • 分离脱氧核糖核苷核糖核苷色谱柱SUPELCOSIL LC-18-S液相柱57939
    分离脱氧核糖核苷核糖核苷色谱柱SUPELCOSIL LC-18-S液相柱5793957939SupelcoSUPELCOSIL™ LC-18-S HPLC 色谱柱SUPELCOSIL™ LC-18-S HPLC Column5μm particle size, L × I.D. 25cm × 2.1mm产品描述General description美国色谱科SUPELCOSIL LC-18-S色谱柱是为可靠地分离脱氧核糖核苷和核糖核苷而设计的。美国色谱科SUPELCOSIL LC-18-S液相色谱柱是Supelcosil系列液相色谱柱之一,Supelcosil系列液相色谱柱品种齐全，有超过40种键合相，从反相的C18、C8柱到正相的Si、NH2柱，再到SAX、SCX等离子色谱柱，齐备的产品线提供了完全的解决方案；并提供多款特殊用途的色谱柱。Recommended productsDiscover LiChropur reagents ideal for HPLC or LC-MS analysisSUPELCOSIL 为以下机构的商标： Sigma-Aldrich Co. LLCfeature endcappedmfr. no. SUPELCOSILextent of labeling 11.0% carbon loadingparameter ≤70 °C temp. range400 bar pressure (5801 psi)application(s) HPLC: suitableL × I.D. 25cm × 2.1mmsurface coverage surface coverage 3.1μmol/m2matrix silica gel, spherical particle platformmatrix active group C18 (octadecyl) phaseparticle size 5μmpore size 120?surface area 170m2/gsuitability suitable for L1 per USPFeatured Industry Food and Beveragesseparation technique reversed phase订货信息：货号：58931名称：SUPELCOSIL ™ LC-18-S HPLC液相色谱柱规格：5 μm particle size, L × I.D. 15 cm × 4.6 mm (Supelco)货号：58928-U名称：SUPELCOSIL ™ LC-18-S HPLC液相色谱柱规格：5 μm particle size, L × I.D. 25 cm × 4.6 mm (Supelco)货号：57920名称：SUPELCOSIL ™ LC-18-S HPLC液相色谱柱规格：5 μm particle size, L × I.D. 30 cm × 1 mm (Supelco)货号：57939名称：SUPELCOSIL ™ LC-18-S HPLC液相色谱柱规格：5 μm particle size, L × I.D. 25 cm × 2.1 mm (Supelco)分离脱氧核糖核苷核糖核苷色谱柱SUPELCOSIL LC-18-S液相柱57939
    供应商： 北京康林科技有限责任公司
    品牌： Supelco
    价格： 面议
  • SUPELCOSIL LC-18-S液相色谱柱分离脱氧核糖核苷核糖核苷58931
    SUPELCOSIL LC-18-S液相色谱柱分离脱氧核糖核苷核糖核苷5893158931SupelcoSUPELCOSIL™ LC-18-S HPLC 色谱柱SUPELCOSIL™ LC-18-S HPLC Column5μm particle size, L × I.D. 15cm × 4.6mmfeature endcappedmfr. no. SUPELCOSILextent of labeling 11.0% carbon loadingparameter ≤70 °C temp. range400 bar pressure (5801 psi)application(s) HPLC: suitableL × I.D. 15cm × 4.6mmsurface coverage surface coverage 3.1μmol/m2matrix silica gel, spherical particle platformmatrix active group C18 (octadecyl) phaseparticle size 5μmpore size 120?surface area 170m2/gsuitability suitable for L1 per USPFeatured Industry Food and Beveragesseparation technique reversed phase产品描述General description美国色谱科SUPELCOSIL LC-18-S色谱柱是为可靠地分离脱氧核糖核苷和核糖核苷而设计的。美国色谱科SUPELCOSIL LC-18-S液相色谱柱是Supelcosil系列液相色谱柱之一,Supelcosil系列液相色谱柱品种齐全，有超过40种键合相，从反相的C18、C8柱到正相的Si、NH2柱，再到SAX、SCX等离子色谱柱，齐备的产品线提供了完全的解决方案；并提供多款特殊用途的色谱柱。Recommended productsDiscover LiChropur reagents ideal for HPLC or LC-MS analysisSUPELCOSIL 为以下机构的商标： Sigma-Aldrich Co. LLC订货信息：货号：58931名称：SUPELCOSIL ™ LC-18-S HPLC液相色谱柱规格：5 μm particle size, L × I.D. 15 cm × 4.6 mm (Supelco)货号：58928-U名称：SUPELCOSIL ™ LC-18-S HPLC液相色谱柱规格：5 μm particle size, L × I.D. 25 cm × 4.6 mm (Supelco)货号：57920名称：SUPELCOSIL ™ LC-18-S HPLC液相色谱柱规格：5 μm particle size, L × I.D. 30 cm × 1 mm (Supelco)货号：57939名称：SUPELCOSIL ™ LC-18-S HPLC液相色谱柱规格：5 μm particle size, L × I.D. 25 cm × 2.1 mm (Supelco)SUPELCOSIL LC-18-S液相色谱柱分离脱氧核糖核苷核糖核苷58931
    供应商： 北京康林科技有限责任公司
    品牌： Supelco
    价格： 面议
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脱氧核苷酸钠相关的仪器

  • Agilent OLIGO PRO II 全自动寡核苷酸分析仪 400-629-8889
    寡核苷酸的合成和纯化是一个复杂的多步骤过程。最终产品质量受到许多因素的影响，这些因素虽然经过仔细的监控，但并不总在控制之下。对于制造商和最终用户来说，了解寡核苷酸纯度是至关重要的，产品必需具备足够的纯度质量，以确保最佳性能，并尽可能消除不明确的质控结果。可靠的寡核苷酸质量控制分析确保了下游应用的最佳性能，包括从PCR到梯度分子量标记的装配。OLIGO PRO II 全自动寡核苷酸分析仪提供了对ssDNA和ssRNA样品的全面分析。OLIGO PRO II 全自动寡核苷酸分析仪的特点：- 无需内掺式染料或探针 - 直观的纯度分析，对1-60 mer寡核苷酸提供1 nt的分辨率 - 可变换的通量，实现对12，24和96个样本的分析 - 自动化的操作，可连续分析多达288个样本产品货号：M5340AA- 可选毛细管阵列：m5340aa##001，m5340aa##002，m5340aa##003配套试剂盒- DN-415-0250: OLIGEL ssDNA Gel- DN-465-1000: ssDNA OLIGEL buffer- DN-475-1000: Capillary Conditioning Solution- GP-400-0100: Capillary Storage Solution
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    厂商： 安捷伦科技(中国)有限公司
    品牌： 安捷伦/Agilent Technologies
    型号： OLIGO PRO II
    价格： 面议
  • Agilent 1290 Infinity II 生物液相色谱系统 400-629-8889
    1290 Infinity II 生物液相色谱系统是一种由生物兼容性材料组成的二元 UHPLC，适用于生物制药（如关键质量属性）及其他高盐和极端 pH 条件下的应用。生物兼容性可确保生物分子的完整性和系统的稳定性。 该系统基于久经验证的 1290 Infinity II 液相色谱技术，不仅可以轻松实现方法转移（包括从旧仪器进行转移），还可以节省培训时间和精力。在 1300 bar 高压下实现高分离度和极低的扩散。多种生物惰性流通池可用于高灵敏度紫外检测。特性：生物兼容性溶剂和样品流路可确保生物分子的完整性，尽可能减少不必要的表面相互作用各种生物附件，包括一系列生物热交换器、生物毛细管工具包、生物定量环和分析头，可实现仪器的多功能性和高效率，从而满足各种应用需求适合所有应用的出色灵活性 — 更宽的性能范围和温度范围、可自动扩展的进样范围以及梯度选件（二元和四元溶剂混合）整个系统延迟体积极小，可实现超高的色谱分离度和极低的扩散高耐盐性和宽 pH 范围可增强灵活性与耐用性，延长仪器正常运行时间基于久经验证的 1290 Infinity II 技术，可轻松实现方法转移（包括从旧仪器进行转移），减少培训工作浅微孔板抽屉最多可容纳 6144 个样品，具有出众的样品容量功能强大，高达 1300 bar 的超高压力和高达 5 mL/min 的高分析流速，可实现出色的 UHPLC 性能各种流通池可实现广泛、灵敏的光学检测能力，可用于 VWD、DAD、FLD、生物惰性 MDS 或 LC/MS 检测，从而实现超高的适应性卓越性能和可持续性：1290 Infinity II 液相色谱系统经过独立审计，确认其在整个产品生命周期对环境的影响后，获得了 My Green Lab ACT（归责性、一致性、透明度）标签。性能指标宽度435 mm智能系统模拟技术可选泵类型二元泵全能泵流速范围使用 G7132A 和 G7131A 流速高达 5 mL/min深度468 mm温度区域的最大数量2溶剂最大数量2 (High-Speed Pump): 2 out of maximum 26 solvents4 (Flexible Pump): Internal 4-solvent gradient formation valve included.Internal 4-solvent selection valve included.External 2 x 12 solvent valve as option, fully integrated in the pump control interface.External 2 x 12 solvent valve as option, fully integrated in the pump control interface特殊功能BlendAssist缓冲液顾问软件生物兼容Yes电源电压100-240 VAC系统压力操作范围最高 1300 bar系统类型生物分析梯度色谱柱 ID 读取器选件可选色谱柱容量8进样量范围0.001–500 µ L0.1–1500 µ L，配备多次抽取工具包工作原理：通过灵敏的紫外检测分析核苷酸生物色谱分析（如 Agilent 1290 Infinity II 生物液相色谱）通常需要更灵敏的紫外检测，以降低检出限，但这也带来了一定的缺点。更高的灵敏度通常意味着分析物需要暴露在更强的光照下。对于易受入射紫外光能量影响的分析物而言，这可能会导致难以察觉的降解。阅读本应用简报，了解如何将 Agilent InfinityLab 最大光强卡套式流通池 LSS 用于光敏样品，同时保留紫外检测器的分析结果。ISET 助力色谱方法转移对不同类型的 HPLC 和 UHPLC 系统而言，生物分离运行也可能会有很大的差异。通过增加额外的体积或等度保持步骤可以克服这些系统体积和泵行为差异。安捷伦提供了一种基于先进的数据驱动型技术的解决方案，即智能系统模拟技术 (ISET)，它可以设置相同的时间偏移并模拟不同的梯度扩散，从而实现成功的方法转移。仪器安装后提供 30 天的免费试用。高分离度 Bio SEC 和聚集体监测为实现最佳体积排阻色谱 (SEC) 分离，选择专用的色谱柱和消耗品以及具有极低扩散性的合适 UHPLC 至关重要。Agilent 1290 Infinity II 生物液相色谱配备超低扩散毛细管，具有极小的系统死体积，与 Agilent AdvanceBio SEC 色谱柱联用，非常适用于分析单克隆抗体 (mAb) 和 mAb 衍生的治疗药物。此配置可确保蛋白质聚集体研究中关键质量属性 (CQA) 分析实现极高分离度性能。应用：Agilent 1290 Infinity II 生物液相色谱为您提供核苷酸分析所需的惰性1290 Infinity II 生物液相色谱系统主要由 MP35N 制成，流路中采用不含铁的不锈钢部件。该生物兼容性液相色谱系统专为生物色谱分析而设计。即使在高达 8 mol/L 尿素的高盐浓度以及高/低 pH 溶剂中也可以长期使用而不出现磨损，同时保持出色的重现性和稳定性。因此，1290 Infinity II 生物液相色谱在分析对铁敏感的磷酸化核苷酸（如 AMPcP 和腺苷）时表现出优异的性能。使用 IEX 和 Agilent 1290 Infinity II 生物液相色谱系统进行寡核苷酸分析寡核苷酸分析中常使用离子对反相色谱法，但离子交换色谱法更适用于某些特定的分析。随着对寡核苷酸需求的增加，各种寡核苷酸的大小也因用途而异，因此我们需要仔细选择合适的分离模式。通过选择阴离子交换色谱法，可以对杂质进行检测。本应用简报证明了 Agilent Bio SAX 色谱柱在寡核苷酸分析中的通用性，并提供了用于进一步方法开发的推荐起始条件。多聚糖分离的分离度和速度单克隆抗体 (mAbs) 属于免疫球蛋白 G (IgG)，是一类现代生物治疗化合物，通过分子中蛋白质部分的构象及其 N-糖基化模式定义。糖基化模式对于 mAbs 的疗效非常重要，因此糖基化模式的生物色谱分析是 QA/QC 过程的关键步骤，也是 mAbs 关键质量属性 (CQA) 的一部分。本应用简报展示了使用 1290 Infinity II 生物液相色谱系统对荧光标记多聚糖的分离。
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    厂商： 安捷伦科技(中国)有限公司
    品牌： 安捷伦/Agilent Technologies
    型号： 1290 Infinity II Bio LC
    价格： 面议
  • 梅特勒托利多E4 XLS+ 多道电动移液器 400-659-9826
    E4 XLS+ 多道移液器是高通量处理的完美工具。 所有通道均可快速装载，易于操作，并具有绝对的精确度和一致性，这是 Rainin 产品的标志。 专为高性能运行而设计带缓冲垫层的操纵杆选择器方便配置及运行方案。 通过多通道分配多个样本时，可确保每一步的一致容量和相同速度。 自动回圈计数可让操作者集中精力于其他细节，而大拇指也可解放出来处理自动混合或自动分配。 可轻松存储配置，以便后续重复测定。准确且精确所有的活塞移动都由机载微处理器控制，所有用户都可按设定的速度和距离移动活塞。 高级步进马达有 4,000 步进量 — 提供高度精确的液体测量。 在每次移液操作结束时，E4 XLS+ 都会通过重新设置零点的方式进行重新校准。简化重复移液，处理速度更快特殊模式可简化连续分液、连续稀释操作和复杂的移液程序。通过计算从单一提取中分配的份数，通过多次分配避免繁琐的重复移液操作。 自动步进 (AutoPace) 可简化重复性分配 – 单击操纵杆重复孔板分配。高度配置E4 的管理模式可使您以任何方式设置移液器。 为了方便或安全，删除不需要的模式或在设置中锁定。 打造个性化的设置档案，以将移液器 重新设置为首选配置。将多个自定义程序保存于机载存储器中。 只需轻松移动操纵杆，便可同时查看并选择程序。 不再需要一次又一次地重新输入所选的程序！ 人体工程学移液器E4 XLS+ 设计可方便左右手操作，即使戴上手套同样舒适，提供出众的平衡移液。 精加工成型的指钩无需紧紧抓握。 吸头退出器操作力极轻并带有硅树脂减振器，使移液工作变得轻松愉快。E4 的彩色超大显示幕、旋转导航键和操纵杆使操作变得轻松且直观。GLP/GMP 安全降低合规风险！ 在线服务数据非常安全，易于访问。 通过密码保护发出服务警报，避免校准合规的错误。 通过锁定程序设置，尽量减少移液 SOP 偏差。兼容的移液器E4 支持可对移液设置、协议和服务警报进行密码保护，以符合 GLP/GMP 规定。 服务记录、循环和状态数据可完全防篡改。在线 PureSpeed利用 E4 XLS+ 间距可调移液器和瑞宁 PureSpeed™ 吸头，纯化蛋白质和寡核苷酸等的生物分子。 快速温和的多种样品处理，高浓度的洗脱，两者相结合形成无与伦比的组合！ 所有 E4 都预装有 PureSpeed 功能。
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    厂商： 梅特勒托利多
    品牌： 瑞宁/RAININ
    型号： E4 XLS+
    价格： 8000 - 2万元
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脱氧核苷酸钠相关的试剂

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脱氧核苷酸钠相关的方案

  • 离子色谱法-紫外检测注射液中脱氧核苷酸钠
    脱氧核苷酸钠是一种具有遗传特性的化学物质，其在个体的生长、繁殖、遗传、变异等生理生化功能方面起着非常重要的作用。目前常用注射用脱氧核苷酸是用脱氧核糖核酸（DNA）为原料，经生物酶催化水解反应生成脱氧腺苷酸（dAMP），脱氧鸟苷酸（dGMP）、脱氧胞苷酸（dCMP）和脱氧胸苷酸（TMP）等四种脱氧核苷酸，然后经层析分离获得高纯度四种单一脱氧核苷酸产品。医药常使用复方制剂，组分包含脱氧糖胞嘧啶核苷酸、脱氧核糖腺嘌呤核苷酸、脱氧核糖胸腺嘧啶核苷酸及脱氧核糖鸟嘌呤核苷酸钠盐。用于急、慢性肝炎，白细胞减少症，血小板减少症及再生障碍性贫血等的辅助治疗。
  • 离子色谱法-紫外检测注射液中脱氧核苷酸钠
    采用DNAPac PA100高效阴离子交换核酸分离柱，在梯度淋洗条件下可实现C、A、T、G四种脱氧核苷酸与常见4种主要杂质（怀疑为C、A、T、G四种核苷酸）的良好分离，分离度可达到1.5以上，峰形对称度在0.83-1.15之间，而理论塔板数均能高于5000。此外，方法还具有常规柱无法比拟的优势，能同时分离小分子碱基，单分子核苷酸还有聚核苷酸，参见谱图中3min以前的峰和16 min以后的出峰。离子色谱柱上得到的峰形相比传统液相柱得到的更为尖锐，因此灵敏度相对高，10 μ L进样时即可达到0.5 mg/L以下的检出限。
  • 在线脱盐高通量液质联用分析寡核苷酸
    寡核苷酸是一类短链核苷酸的总称（包括脱氧核糖核酸及核糖核酸），如用于基因扩增和基因诊断的 PCR 引物和反义核酸，介导基因沉默的小干扰 RNA（small interfering RNA，siRNA）等，努力研究开发基因靶向治疗药物用于治疗病毒、肿瘤和遗传疾病。
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  • 【分享】一起分享核苷酸

    【分享】一起分享核苷酸

    [img]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2009/10/200910241555_177765_1610969_3.jpg[/img][color=#DC143C]核苷酸　[/color]　　　一类由嘌呤碱或嘧啶碱、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物。又称核甙酸。戊糖与有机碱合成核苷，核苷与磷酸合成核苷酸，4种核苷酸组成核酸。核苷酸主要参与构成核酸，许多单核苷酸也具有多种重要的生物学功能，如与能量代谢有关的三磷酸腺苷（ATP）、脱氢辅酶等。某些核苷酸的类似物能干扰核苷酸代谢，可作为抗癌药物。根据糖的不同，核苷酸有核糖核苷酸及脱氧核苷酸两类。根据碱基的不同，又有腺嘌呤核苷酸(腺苷酸，AMP)、鸟嘌呤核苷酸(鸟苷酸，GMP)、胞嘧啶核苷酸(胞苷酸， CMP)、尿嘧啶核苷酸(尿苷酸,UMP)、胸腺嘧啶核苷酸（胸苷酸，TMP）及次黄嘌呤核苷酸(肌苷酸，IMP)等。核苷酸中的磷酸又有一分子、两分子及三分子几种形式。此外，核苷酸分子内部还可脱水缩合成为环核苷酸。 　　核苷酸是核糖核酸及脱氧核糖核酸的基本组成单位，是体内合成核酸的前身物。核苷酸随着核酸分布于生物体内各器官、组织、细胞的核及胞质中，并作为核酸的组成成分参与生物的遗传、发育、生长等基本生命活动。生物体内还有相当数量以游离形式存在的核苷酸。三磷酸腺苷在细胞能量代谢中起着主要的作用。体内的能量释放及吸收主要是以产生及消耗三磷酸腺苷来体现的。此外，三磷酸尿苷、三磷酸胞苷及三磷酸鸟苷也是有些物质合成代谢中能量的来源。腺苷酸还是某些辅酶，如辅酶Ⅰ、Ⅱ及辅酶A等的组成成分。 　　在生物体内，核苷酸可由一些简单的化合物合成。这些合成原料有天门冬氨酸、甘氨酸、谷氨酰胺、一碳单位及 CO2等。嘌呤核苷酸在体内分解代谢可产生尿酸，嘧啶核苷酸分解生成CO2、β－丙氨酸及β-氨基异丁酸等。嘌呤核苷酸及嘧啶核苷酸的代谢紊乱可引起临床症状（见嘌呤代谢紊乱、嘧啶代谢紊乱）。 　　核苷酸类化合物也有作为药物用于临床治疗者，例如肿瘤化学治疗中常用的5-氟尿嘧啶及6-巯基嘌呤等。 　　有些核苷酸分子中只有一个磷酸基，所以可称为一磷酸核苷(NMP)。5''-核苷酸的磷酸基还可进一步磷酸化生成二磷酸核苷(NDP)及三磷酸核苷(NTP)，其中磷酸之间是以高能键相连。脱氧核苷酸的情况也是如此。 　　体内还有一类环化核苷酸，即单核苷酸中磷酸部分与核糖中第三位和第五位碳原子同时脱水缩合形成一个环状二酯、即3''，5''-环化核苷酸，重要的有3''，5''-环腺苷酸(cAMP)和3''，5''-环鸟苷酸(cGMP)。

  • 液质联用测脱氧核苷三磷酸响应值降低！特别低！

    [color=#444444]最近在建立液相质谱测细胞内脱氧核苷三磷酸，但是响应值特别低。最开始试的时候用的是500 ng/mL的标准品，MRM都有 10^3左右，结果后来氮气用完了新的一直没来，中间断气了三天之后就一直响应值特别低，autotune后，其他人用ESI positive都正常了，结果我这个用ESI negative的还是只有一百多，提高了十倍浓度照样只有两三百，最开始试的时候用连接柱不上色谱柱都有10^3的。已经试过不同pH的流动相，从sigma买了新的标准品，换过配样品的溶剂等等，一直没啥改善，求各位大侠指点迷津！谢谢！[/color][color=#444444]用的是Agilent 6410，ESI negative，Phenomenex Luna Aminopropyl做HILIC，流动相是20mM NH4Ac pH 9.45和乙腈，流速0.2 mL／min，Gas Temp 300 C，Gas Flow 10L/min，Nebulizer 25 psi，Capillary Negative 3000V。[/color]

  • 液质联用测脱氧核苷三磷酸响应值降低！特别低！

    [color=#444444]最近在建立液相质谱测细胞内脱氧核苷三磷酸，但是响应值特别低。最开始试的时候用的是500 ng/mL的标准品，MRM都有 10^3左右，结果后来氮气用完了新的一直没来，中间断气了三天之后就一直响应值特别低，autotune后，其他人用ESI positive都正常了，结果我这个用ESI negative的还是只有一百多，提高了十倍浓度照样只有两三百，最开始试的时候用连接柱不上色谱柱都有10^3的。已经试过不同pH的流动相，从sigma买了新的标准品，换过配样品的溶剂等等，一直没啥改善，求各位大侠指点迷津！谢谢！[/color][color=#444444]用的是Agilent 6410，ESI negative，Phenomenex Luna Aminopropyl做HILIC，流动相是20mM NH4Ac pH 9.45和乙腈，流速0.2 mL／min，Gas Temp 300 C，Gas Flow 10L/min，Nebulizer 25 psi，Capillary Negative 3000V。[/color]

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  • 生物惰性液相质谱联用系统提升寡核苷酸定量分析性能
    样品流路中分析物与金属表面相互作用引起的金属吸附是寡核苷酸分析中的主要问题之一。使用传统的 LC系统（基于不锈钢材质）通常会导致峰形不佳、灵敏度和定量性能受损。本文介绍了使用为解决金属吸附问题而开发的 Nexera XS inert系统分析寡核苷酸的示例。对灵敏度、定量性能和残留进行了评估，结果显示，与在流路中使用不锈钢的 HPLC 系统相比，该生物惰性系统在整体性能上明显改善。Nexera XS inert系统对金属配位化合物表现出优异的分析性能。通常用于 HPLC 流路的不锈钢 (SUS) 具有出色的耐压性，但含有磷酸基团的化合物可以通过金属配位作用与润湿不锈钢表面吸附。金属吸附会对峰形、检测灵敏度和重现性产生负面影响，并降低定量分析的性能。一般通过重复注入高浓度样品来抑制吸附，但这种方法既费时又昂贵。另一种方式是使用含有螯合剂的溶液来抑制吸附。但是此方法不适用于 LC/MS 分析，因为它可能导致污染和灵敏度降低。为了评估金属吸附抑制效果，采用常规HPLC系统（Nexera XR）和生物惰性UHPLC系统（Nexera XS inert）进行分析，并分别使用不锈钢色谱柱和无金属色谱柱。寡核苷酸的反相色谱分析中通常采用离子对试剂，本实验中使用HFIP（1, 1, 1, 3, 3, 3-六氟-2丙醇）和DIPEA（N, N-二异丙基乙胺）。样品信息：序列：5'-dG-dC*-dC*-dT-dC*-dA-dG-dT-dC*-dT-dG-dC*-dT-dT-dC*-dG-dC*-dA-dC* -dC*-3'，(*) 表示 5-C 或 5-U 甲基化 (d) 2'-脱氧核苷分子量：6431.72色谱及质谱条件：略。图 1 显示了使用 Nexera XR 和不锈钢色谱柱以及 Nexera XS inert和无金属色谱柱分析的 10 ng/mL 标准寡核苷酸溶液的色谱图。与 Nexera XR 相比，Nexera XS inert 的峰强度增加了约 1.7 倍。图1 寡核苷酸标准溶液(10 ng/mL)的MRM色谱图图2 (a) Nexera XR，(b)Nexera XS inert 交叉污染比较分析浓度为1000 ng/mL的寡核苷酸溶液后，立即将样品溶剂水作为空白进样以评估残留情况。图2（a）显示了Nexera XR空白分析的色谱图，图2（b）显示了Nexera XS inert空白分析的色谱图，可以看到两者的残留水平分别为0.0790%和0.0033%。这些结果表明，Nexera XS inert系统显著抑制了金属吸附并最大限度地减少了交叉污染。样品流路中分析物与金属表面相互作用引起的金属吸附是寡核苷酸以及其他金属敏感化合物分析中的主要问题之一。Nexera XS inert在样品接触流路中使用生物惰性材料，对易被吸附的化合物具有出色的峰形、分离度、灵敏度、重现性和定量性能。而且，该系统耐压超过100MPa，适用于超快速分析，显著提高实验室分析通量。Nexera XS inert系统与MS的结合是分析金属敏感化合物的理想解决方案。本应用中使用的仪器（Nexera XS inert+LCMS-8060）参考文献：1、LCAV-0001-0274，Improvement of Quantitative Performance in LC/MS Analysis of Oligonucleotides using Nexera XS inert本文内容非商业广告，仅供专业人士参考。
    时间： 2023-05-08
    作者： 岛津
  • 上海首个核酸产业园7月正式开工，一起来聊聊寡核苷酸药物解链温度
    导 读近年来，以核酸药物为首的功能性核酸备受关注，2021年底治疗罕见病脊髓性肌肉萎缩的反义寡核苷酸药物诺西那生钠进入中国医保，几乎同一时间，诺华降血脂的小干扰RNA药物Leqvio获FDA批准上市，据悉一年只需用药两次。寡核苷酸药物已经从罕见病过渡到了常见慢性病，并可大大降低患者用药频率。随着寡核苷酸类药物的陆续上市，核酸药物已成为当前生命科学和药物研究的热点之一。为了更好促进核酸药物的快速发展，上海首个核酸产业园于7月中旬在上海杭州湾经济技术开发区正式开工，该产业园是以生物医药产业为发展方向，基于核酸开发各种疫苗及药物。今天，我们就一起来聊聊核酸药物以及解链温度等话题。01核酸药物小科普核酸类药物核酸类药物是各种具有不同功能的寡聚核糖核苷酸(RNA)或寡聚脱氧核糖核苷酸(DNA)，能够直接作用于致病靶基因或者靶mRNA，在基因水平上发挥治疗疾病的作用。常见的寡核苷酸药物主要包括反义寡核苷酸（ASO）、小干扰RNA（siRNA）、微小RNA（microRNA）、小激活RNA（saRNA）、适配体（Aptamaer）、信使RNA（mRNA）。解链温度在这些核酸药物中，对于具有双链结构的药物，需要对其解链温度进行分析。解链温度是衡量双链结构核酸类物质热稳定性的重要指标，它是控制结构和功能的关键因素。例如小干扰RNA（siRNA）药物等具有双链结构，当温度升高时，氢键断裂，双链逐渐解体，形成单链结构。这种现象称为核酸的“溶解”，将双链和单链所占比例相等的温度定义为解链温度(Tm）。因为核酸类物质在260 nm附近有一个紫外吸收峰，吸收值在解链过程中增加，通过测试该吸光度变化，以确定Tm值。因此在进行核酸药物Tm值分析时，可以利用紫外分光光度计加上控温附件和对应的数据分析软件来完成。02分析利器对于核酸解链温度Tm测试，岛津拥有成熟的方法和分析设备，该设备一般为UV-1900i配Tm分析系统(TMSPC-8)。Tm分析系统由8列控温支架、专用8列微量比色池、温度控制器和Tm分析软件构成，最多可同时测定8个样品。UV-1900i和Tm分析系统专用8列微量比色池（光程10 mm）03案例分享接着小编带您看看具体的寡核苷酸分析案例，操作步骤简单快捷，结果直观。测试样品为M13-25mer核酸，测试前先进行样品溶液脱气的预处理，通过UV-1900i和Tm分析系统可以轻松获得Tm 曲线（绘制260nm处的吸光度对温度曲线，如下图所示），该曲线可以显示升温时和降温时的结果。样品的Tm曲线测试完成后，可以通过中线法和微分法两种方法计算Tm值，最终得到的Tm值结果基本一致。Tm计算结果结 语核酸分子的解链温度对核酸药物的稳定性、有效性等研究有重大意义，在核酸药物研发生产过程是一个重要的参数指标。岛津紫外配合Tm分析系统，可以满足轻松获取Tm曲线，通过中线法或者微分法均可计算Tm温度，满足测试要求，为核酸药物质量控制提供了可靠数据。更多寡核苷酸药物分析，敬请持续关注。撰稿人：王娟娟本文内容非商业广告，仅供专业人士参考。
    时间： 2022-09-02
    作者： 岛津
  • 【飞诺美色谱】罕见遗传性疾病的救星——寡核苷酸药物
    新冠疫情促使mRNA技术快速发展的同时也使人们开始高度关注核酸药物这一领域。核酸药物包括反义核酸（ASO）、小干扰RNA（siRNA）、微小RNA（miRNA）、小激活RNA（saRNA）、信使RNA（mRNA）、适配体（aptamer）、核酶(ribozyme)、抗体核酸偶联药物（ARC）等，是基因治疗的一种形式。除mRNA药物外，其他几种核酸药物，基本上都是由100个以内的核糖核苷酸或脱氧核糖核苷酸单链或双链组成，所以也称为寡核苷酸药物。与mRNA药物编码产生目的蛋白不同的是，寡核苷酸药物主要是通过碱基互补配对原则与DNA、mRNA或者pre-mRNA配对，通过基因沉默、非编码RNA抑制、基因激活等一系列机制来调节基因表达。已上市寡核苷酸药物化学结构（Nature reviews drug discovery）寡核苷酸药物对比于小分子药物及蛋白药物，具有多方面的优势，首先可根据目标靶点设计碱基序列，靶点明确、特异性强；其次寡核苷酸药物从转录后水平进行治疗，可选择的靶点丰富，特别是能覆盖蛋白质不可成药的靶点以及开发由基因缺陷导致的遗传性疾病的相关靶点；另外寡核苷酸药物由于序列短，可采用化学合成方法，完成目标序列的装配，并结合生物学测试筛选有效序列，能够避免盲目开发，节省研发时间。但是寡核苷酸药物在研发中也面临着诸多挑战。寡核苷酸在细胞外稳定性低，易被核酸酶降解，加上分子量及负电荷的因素，难以进入细胞，因此在研发过程中，使其保持稳定的结构以及能够有效递送的传递载体是主要考虑的两个因素。寡核苷酸核酸分子的改造主要包括磷酸骨架，碱基以及糖环的修饰，在改造中需要考虑多个因素，包括稳定性、药代动力学、碱基配对的亲和力等，最重要的是能够保留被功能酶及功能蛋白所识别的功能。因此，在前期研发过程中，需要对寡核苷酸进行精确的结构表征及定量。丹纳赫生命科学旗下SCIEX 的高分辨质谱ZenoTOF&trade 7600系统具有一系列对寡核苷酸进行分析的方案，可进行寡核苷酸的分子量分析并进行杂质检测，可对寡核苷酸进行碱基序列鉴定。由于Zeno TOF 7600具有EAD和CID两种互补的碰撞模式，不但能产生丰富的离子碎片信息，还会保留完整的核酸低丰度修饰信息。寡核苷酸分子量及碱基序列的检测高分辨质谱ZenoTOF&trade 7600系统另外，高分辨质谱ZenoTOF&trade 7600系统还能实现对寡核苷酸的定量分析，线性范围可达 5 ng/mL – 10000 ng/mL，可以完成寡核苷酸药物在研发阶段的药代及多种代谢产物同时鉴定及定量分析。在研发阶段，对于采用同一种仪器进行鉴定及定量，可避免定量方法转移时造成的方法优化时间浪费，可帮助用户加快研发进度。艾杰尔-飞诺美寡核苷酸定量分析前处理试剂盒高分辨质谱对寡核苷酸进行定量分析在寡核苷酸药物种类中，反义寡核苷酸由于是单链，分子量小，递送较其他寡核苷酸容易，且反义寡核苷酸功能多样，可上调或下调基因表达，成为研发罕见遗传性疾病药物中最关注的种类。为了帮助研究人员开发这类针对罕见遗传性疾病患者的ASO疗法，FDA还发布了指导这类ASO疗法非临床检测的指南。在已上市的寡核苷酸药物中，大部分都是用于治疗罕见遗传性疾病的反义寡核苷酸药物，特别是杜氏型肌营养不良，已经上市了针对不同基因位点的四款产品。药品名治疗疾病药物种类上市时间Fomivirsen巨细胞病毒视网膜炎反义寡核苷酸1998.8（已退市）Pegaptanib年龄相关性黄斑变性核酸适配子2004.12Mipomersen纯合性家族性高胆固醇血症(hoFH)反义寡核苷酸2013.1（已退市）Defibrotide肝静脉闭塞反义寡核苷酸2016.3Eteplirsen杜氏型肌营养不良（DMD基因外显子51）反义寡核苷酸2016.9Nusinersen脊髓性肌萎缩症 （SMN2基因外显子7）反义寡核苷酸2016.12Patisiran遗传性甲状旁腺素淀粉样变性小干扰RNA2018.8Inotersen遗传性甲状旁腺素淀粉样变性反义寡核苷酸2018.10Waylivra家族性乳糜微粒血症综合征反义寡核苷酸2019.5Givosiran急性肝卟啉症小干扰RNA2019.11Golodirsen杜氏型肌营养不良（DMD基因外显子53）反义寡核苷酸2019.12Viltolarsen杜氏型肌营养不良（DMD基因外显子53）反义寡核苷酸2020Lumasiran原发性高草酸尿症I型小干扰RNA2020Inclisiran成人高胆固醇血症及混合性血脂异常小干扰RNA2020Casimersen杜氏型肌营养不良（DMD基因外显子45）反义寡核苷酸2021.2.25已上市的寡核苷酸药物（根据网上资料整理）由此可见，对罕见病的诊断也非常重要，很多罕见遗传病是由几十甚至上百种突变引起的，而且不同区域的患者可能存在不同的基因变异位点，NGS是现在进行高通量基因检测的重要手段。丹纳赫生命科学旗下Integrated DNA Technologies（IDT）公司（中文名称：埃德特）是全球领先的NGS试剂供应商，其外显子捕获产品Exome Research Panel V2特别适合进行遗传性疾病的全外显子组测序，助力遗传性疾病的诊断。V2由 415,115 条单独合成且经过质控检验的 xGen Lockdown 探针组成。探针组跨越人基因组的 34 Mb 目标区域（19,433 个基因），并且覆盖 39 Mb 的探针空间（即由探针覆盖的基因组区域）。探针是使用全新的“捕获感知”(capture-aware) 算法进行设计的，并进行了专有的脱靶分析，确保实现完整的设计覆盖度。探针组中的所有探针均严格按照 ISO 13485 标准进行生产。每条探针均经过质谱法和双定量测量检验，确保探针的质量及在探针库中具有适当的代表性。IDT Exome Research Panel试剂盒
    时间： 2024-01-24
    作者： 艾杰尔飞诺美
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