采用安捷伦 2200 TapeStation 系统进行 RNA 质量控制 – RINe 质量指标的评价

摘要

本应用简报描述了安捷伦 2200 TapeStation 系统与安捷伦 2100 生物分析仪间的性能比较及基准，后者是 RNA 质量控制的行业标准。2200 TapeStation 系统可对最多 96 个样品进行自动化分析，每个样品的分析时间约为 1 分钟。本应用简报展示了2200 TapeStation 系统生成的 RINe 与 2100 生物分析仪的 RIN 质量评估之间的高度相关性。此外还展示了 2200 TapeStation 系统在 RNA 质量评估中所得 RINe 的高度重现性。因此，2200 TapeStation 系统是可靠的 RNA 质量控制系统。

前言

RNA 的结构完整性是确保微阵列、cDNA 文库构建，RT-PCR 及 RT-qPCR1 之类实验成功的最重要因素。采用微阵列技术及 qPCR 进行基因表达研究越来越得到重视，这就需要可靠耐用的 RNA 完整性分析方法。安捷伦 2100 生物分析仪及其 RNA 完整值 (RIN) 是 RNA 质量评估的行业标准。最新推出的安捷伦 2200 TapeStation 系统建立在 2100 生物分析仪系统的成功之上，且分析时间更短，每个样品成本固定的情况下，通量灵活性提高，且具有分析 96 孔板的能力。

2200 TapeStation 系统的分析采用现成的消耗品 ScreenTape 预制胶条。安捷伦 R6K ScreenTape 及安捷伦高灵敏度 R6K ScreenTape 包括 16 个独立的泳道。由于 ScreenTape 消耗品中未使用的泳道可留待随后的分析，因此在每个样品成本固定的情况下，通量可为 2 到 96 个样品不等。2200 TapeStation 仪器可自动将制备的样品从 8 联管条中或 96 孔板中上样至 R6K ScreenTape。电泳及成像也是在该仪器中自动完成的。2200 TapeStation 软件可为每个样品提供胶图及电泳图谱结果，并可在短至 1 分钟内进行查看。采用 R6K ScreenTape 及高灵敏度 R6K ScreenTape 进行 RNA 质量分析可得到 RIN 对应值 (RINe)。RINe 的值可在 1 到 10 之间，其中 10 代表了最高质量的 RNA 样品。本文中，我们进行了一项对比研究，比较了 R6K ScreenTape 及高灵敏度 R6K ScreenTape 所得的 RINe 质量评分与 2100 生物分析仪所得的 RIN 质量指标。

结论

安捷伦 2200 TapeStation 系统为 RNA 样品的分析提供了一种简便易用的系统，人工干预可降至最低。R6K 及高灵敏度 R6K ScreenTape 经证实可精确可靠地进行 RNA 质量控制，可媲美安捷伦 2100 生物分析仪系统。2200 TapeStation 系统还在样品重现性方面展示出极高的精密度。

因此，在 RNA 质量评估方面，2200 TapeStation 系统可提供与行业标准 2100生物分析仪系统媲美的性能。高通量兼容性、简单易用、最少人工干预，以及不论通量大小，每个样品的成本固定，这些新增的优点结合起来，使 2200 TapeStation系统成为 RNA 质量评估的理想之选。