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高质量数据新标准,Cytek谱写45色全光谱流式方案二重奏(分析+分选)

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分享: 2024/06/13 10:43:03


亮点一览



2020年Cytek发表的OMIP-069全光谱流式40色文章1让超多色实验的梦想照进现实,4年之后,文章的同一作者再次分享了一个高质量的45色方案,全景式描绘了人外周血单个核细胞的免疫图谱,同时深入挖掘了记忆T细胞的免疫表型。该45色方案采用Cytek®全光谱流式分析平台进行优化,随后无缝衔接到Cytek®全光谱流式分选平台--方案不仅在分析平台上呈现出高质量的数据表现,在分选平台也以高度一致的数据分辨率实现结果的平移,并成功完成稀有细胞的分选且保持了细胞功能性。这一方案续写经典,再创突破,有望被普及应用于肿瘤免疫、自身免疫、药物研发、感染性疾病、神经退行性疾病等诸多领域。



研究方案



方案设计起点基于OMIP-069的40色文章,保留了原方案37个指标,新加入8个指标。考虑部分试剂的可用性及数据表现的可优化性,对原方案的部分荧光试剂进行了替换。借助Cytek® Cloud工具设计并审阅方案,绿色框表示与原40色方案不同的指标或荧光素。45色方案横向评估了T、B、NK、NKT、单核、嗜碱性粒、先天淋巴样(ILCs)、树突状(DCs)等细胞,纵向剖析了T细胞活化、抑制、归巢、组织驻留、记忆和效应分化等指标,勾勒出人外周血免疫表型的精细图谱。

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45色全光谱流式方案信息表



结果赏析



45色全光谱流式方案门控策略




在排除细胞黏连体和红细胞后,圈选活的CD45+细胞,基于FSC/SSC分成淋巴/DCs/NK单核细胞群。单核细胞以CD14/CD16的表达区分出非经典、中间与经典亚群。淋巴/DCs/NK细胞圈走CD14+之后,CD3-TCRγδ-CD19+CD20+识别B细胞,借助IgD/CD27/CD20区分出Naïve、浆母细胞与IgD-记忆B细胞。CD14-CD3-CD19-CD20-CD56-HLA-DR+表征为DCs,并细化了CD123+ pDCs和CD11c+ DCs的功能性表达。CD14-CD3-CD19-CD20-HLA-DR-定义为NK细胞,根据CD56/CD16的表达丰度可分为早期、成熟与终端NK细胞。CD14-CD3-CD19-CD20-HLA-DR-CD56-CD16-圈出CD123+的嗜碱性粒细胞与CD123-的ILCs。CD3+TCRγδ-CD56+表征为NKT样细胞。CD3+CD56-中区分CD4+、CD8+、CD4-CD8-三群,CD4+ T细胞进一步细分为Naïve、TSCM、TCM、早期类TEM、早期TEM、中期TEM、晚期TEM、TEMRA各类亚群,并平行对比各自功能性指标的表达。


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45色方案分析人PBMCs手动圈门策略

荧光试剂数据性能对比




由于OMIP-069文章发表于2020年,在此之后,试剂厂家陆续研发出新型染料,为高维方案的优化和拓展带来了更丰富的选择。40色方案的部分荧光试剂存在货期问题,亦或是出现了数据表现更优的平替试剂。图中呈现的6种试剂,均与原方案的荧光素相似度较高,替换时无需对方案做出额外调整。其中cFluor®系列试剂来源于Cytek公司,染色指数与原方案相当甚至更优。CD24 cFluor YG610优化了对于蓝激光激发的荧光素的spread,也改善了针对非B细胞的非特异性结合的问题(图1D)。CD57 cFluor B532替换FITC,染色指数显著提升,同时还可优化与BB515的spread(相似指数:BB515/FITC 0.98;BB515/cFluor B532 0.89)


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荧光试剂数据性能对比

分析分选双平台

实现方案一键式转移




Cytek® Aurora™分析系统和Aurora™ CS分选系统搭载专利的全光谱分析技术(Full Spectrum Profiling™, FSP™),实验方案可以在双平台间实现无缝衔接,高质量结果仅需“复制粘贴”,大大简化了分选实验的流程。文章使用5激光的Aurora™和Aurora™ CS平台,采用相同的增益条件、参考对照、数据采集与实验分析模版,同一样品在3台分析仪与1台分选仪上分别进行获取,从降维可视化结果来看,4台仪器呈现的结果高度重叠,这为实现多中心标准化打造了一体化的平台。


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全光谱流式分析和分选平台无缝衔接


高维方案应用于Aurora™ CS分选平台,能够高精度地分辨细胞亚群,尤其是聚焦低比例细胞,并且一管样本可以实现6路同时分选,节省了时间和资源。从CD45+CD3+CD19-CD56-CD14-CD4+CD8-细胞群中,同时分选以下6群细胞:


A. TSCM: CCR7+CD45RA+CD27+CD28+CD127+CD95+

B. TEM early effector: CCR7-CD45RA-CD27+CD28+KLRG1+TIGIT-CCR6-DNAM-1+

C. TEM early effector: CCR7-CD45RA-CD27+CD28+KLRG1+TIGIT-CCR6+DNAM-1+

D. TEM early effector: CCR7-CD45RA-CD27+CD28+KLRG1-TIGIT-CCR6+DNAM-1+

E. TEM early effector: CCR7-CD45RA-CD27+CD28+KLRG1-TIGIT-CCR6-DNAM-1+

F. TEMRA: CCR7 -CD45RA+CD27+CD28+CD127+CD95+


随后,将分选收集到的细胞在37℃, 5% CO2培养箱中静置过夜,次日用PMA和离子霉素刺激,再用胞内标志物IFNγ、IL-2、TNF-α、IL-17进行染色,配色时选择分选的细胞上非共表达指标的荧光素。6种细胞呈现出截然不同的细胞因子表达趋势,阐明在免疫反应中各自可能扮演着不同的角色。


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6路分选细胞并进行功能性验证



总结展望



众所周知,OMIP-069是第一篇将40种荧光素合为一管的具有里程碑意义的文章。本文的45色方案不仅实现了“复刻经典”,并且进一步提升标准,开创性地在全光谱分析和分选流式双平台,平行展现了45色方案的高质量数据,也实现了6路分选高维方案中低比例细胞的技术突破。该方案基于健康人PBMCs优化,可以进一步拓展应用到病人血样或者组织样本,为免疫疗法、癌症监测、药物研发、靶标筛查等领域开拓更多元的思路。

参考文献

1Park, L. M., Lannigan, J. & Jaimes, M. C. OMIP-069: Forty-Color Full Spectrum Flow Cytometry Panel for Deep Immunophenotyping of Major Cell Subsets in Human Peripheral Blood. Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology 97, 1044-1051, doi:10.1002/cyto.a.24213 (2020).

2Bonilla, D. L., Park, L., Low, Q., Lannigan, J. & Jaimes, M. J. b. 45-Color Full Spectrum Flow Cytometry Panel for Deep Immunophenotyping of the Major Lineages Present in Human Peripheral Blood Mononuclear Cells with Emphasis on the T cell Memory Compartment. 2024.2004. 2027.591472 (2024).


关于Cytek

About Cytek /

Cytek Biosciences, Inc.(Nasdaq: CTKB)作为一家全球技术领先的生命科学技术公司,通过其受专利保护的全光谱分析(Full Spectrum Profiling™,FSP™)技术,提供高分辨率、高参数和高灵敏度的新一代细胞分析工具。Cytek的创新技术通过检测荧光信号的完整光谱信息,以实现更高水平更高灵敏度的多参数检测。Cytek的FSP™平台包括其核心仪器 ——Aurora和Northern Lights™分析系统、Aurora CS分选系统,Amnis®和Guava®品牌下的流式细胞仪和成像产品,以及试剂、软件和服务,为客户提供全面和完整的解决方案。Cytek总部位于美国加利福尼亚州Fremont,在全球设有分部和分销渠道。

更多的相关信息,请登录Cytek的官方网站:www.cytekbio.com和www.cytekbio.com.cn。

注:Cytek®, Tonbo Biosciences, cFluor®, Full Spectrum Profiling™, FSP™和Northern Lights™是Cytek Biosciences, Inc. 的商标或注册商标。Cytek®全光谱检测技术相关专利包括但不限于:US10739245B2,US11169076B2,US10788411B2。



[来源:Cytek Biosciences]

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