在法医学DNA检测和其他如大型灾难或失踪人口等身份确认时,经常遇到高度腐败的生物学检材,材料细胞的核DNA降解严重,这对DNA检测分型工作来说,是很有挑战性的。科学家发现一种解决这个问题的新策略,即利用DNA的结构特性。
从DNA到染色体不论是形态还是长度都相差很大。人类最长的第一个染色体全长仅10nm,但其DNA却长达7.2cm;一个细胞核直径仅5nm,在这样一个小小的空间中却要纳下全长近200cm的DNA,人们不禁要问DNA如何形成染色体,纳入小小的核中?
DNA首先形成核小体(压缩前后长度比为6),核小体进一步压缩形成纤丝(压缩包装比为40),纤丝再压缩形成染色质(1000),染色质到染色体的压缩包装比高达8400,此时染色体的长度约为DNA伸展状态时的万分之一。
核小体是由DNA和组蛋白形成的染色质基本结构单位,是DNA的二级结构。每个核小体DNA约200bp,由146bp的核心序列DNA和60bp左右的连接序列组成。在这 200bp中,146 bp是直接盘绕在组蛋白八聚体核心外面,这些DNA不易被核酸酶消化,其余的60bp左右DNA是用于连接下一个核小体。
科学家对人类粒性白细胞(Leukocytes)中的核小体进行高通量全基因组测序时发现一些存在于核小体核心DNA序列上的STR标记。并设计实验比较了这些“核小体保护的STR”(Nucleosome Protected STRs,NPSTRs)与其他非non-NPSTRs应用于DNA分型的分辨力。结果表明,无论在人工制备的降解DNA样品还是法医检测的真实样品中,NPSTRs的分型能力更强。这些标记可以被纳入未来的法医学、古生物学和考古学等学科中,因为它们对降解样品具有较高的鉴别力。
推荐阅读 “Whole genome nucleosome sequencing identifies novel types of forensic markers in degraded DNA samples” Scientific RepoRts | 6:26101 | DOI: 10.1038/srep26101
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