蓄势待发
风光流转等闲过,又是一年春事休。不知不觉,2021也已经步入了尾声。如果用几个关键词来描述生物医药行业过去这一年,最先映入你脑海的是什么?mRNA疫苗,单抗,新药出海,CAR-T,胰岛素集采还是其他?在小编看来,PROTAC等蛋白降解技术也必定要占据一席之地。
2021年7月,PROTAC疗法领域的明星公司Arvinas宣布与辉瑞达成逾20亿美元的协议,推进潜在“first-in-class”疗法ARV-471的研发;
8月,拜耳宣布拟以20亿美元收购蛋白降解疗法新锐Vividion Therapeutics,礼来也与开发创新蛋白降解技术的Lycia Therapeutics达成可达16亿美元的合作;
11月,诺华与Dunad Therapeutics达成逾13亿美元的研发合作协议,开发新一代口服靶向蛋白降解疗法。
国际药企巨头为何纷纷花重金布局这一赛道?PROTAC技术又有什么革命性的创新?带着这些问题,今天我们跟大家分享PROTAC等蛋白降解技术的前世今生。
新一代小分子成药技术
目前已知的人类蛋白质组包含大约20,000种蛋白质, 但是约80%被认为是“undruggable”的不可成药靶点,究其原因,主要有以下几点:
1)传统占位驱动药理学难以靶向非酶蛋白,例如转录因子;
2)结合“口袋”平滑,小分子难以稳定结合,例如KRAS;
3)通过蛋白-蛋白相互作用(PPI)发挥活性的蛋白结合位点通常较大或无规则;
4)已成药靶点易产生耐药突变。
PROTAC(Proteolysis-targeting chimeras)是通过泛素-蛋白酶体系统(UPS)诱导靶向蛋白降解的一种全新技术。PROTAC由三种特殊元素组成:E3泛素连接酶配体、靶蛋白配体和连接子(Linker)。E3泛素连接酶配体负责特异性招募E3泛素连接酶,靶蛋白配体用于靶向和捕获目标蛋白,Linker用于结合这两个配体,形成稳定的三元复合物。
PROTAC分子能够将E3泛素连接酶募集到靶点蛋白附近,为靶点蛋白打上泛素“标签”。在细胞中,打上泛素“标签”的蛋白将被送入蛋白酶体进行降解。这样,PROTAC分子就能够特异性地促进致病蛋白的降解,降解后的产物,则能被细胞重新利用。据Arvinas公司估计,目前的“不可成药”靶点中有80%的靶点可以被PROTAC分子靶向。
PROTAC介导目标蛋白降解的机制
PROTAC技术优势
PROTAC发挥作用不同于传统小分子药物需与靶蛋白紧密结合(占位驱动),而是主要取决于E3连接酶和靶蛋白的相互靠近(事件驱动)。传统抑制剂的“占位驱动”:通常靶蛋白需要有合适的“活性口袋”,适合容纳小分子的明确活性位点。小分子抑制剂需持续占据蛋白的活性位点以阻断其功能,属于“占位驱动”。而在已被解析的疾病相关蛋白中,有高达80%的蛋白无法用现有药物去靶向,它们表面相对平滑,没有明显“口袋”——小分子抓不牢。
PROTAC只是提供结合活性,触发靶蛋白与E3连接酶结合从而引发降解这一事件,属于“事件驱动”。药物无需直接抑制目标蛋白的功能活性,也不需要与目标蛋白长时间和高强度的结合。利用PROTAC技术,理论上只要靶蛋白上有裂缝、缺口等可以提供短暂“着力点”。并且,PROTAC引发靶蛋白降解后即可从复合物中解离,并进入下一个催化循环,药物作用效率高。
PROTAC作用机制 小分子药物作用机制
PROTAC技术优势全面:
(1)相较于传统小分子抑制剂,PROTAC可对非酶蛋白、Undruggable蛋白等进行降解,活性和选择性有望更高,并且具有催化效应,有望实现低剂量、低频次用药。
(2)相较于单抗,PROTAC可靶向大量细胞内靶标,组织渗透性更强,可实现口服用药。
(3)相较于siRNA,siRNA和PROTAC均可实现蛋白降解,但siRNA半衰期短、易降解,药物递送仍然是限制其(siRNA)应用的重要因素。
PROTAC技术面临的挑战
PROTAC技术优势明确但是仍存在诸多限制因素:
(1)分子量偏大:PROTAC分子由三部分组成,不可避免地导致相对分子质量过大,目前报道的PROTAC的分子量大都在700以上,这打破了Lipinski“类药五规则”中“小分子药物分子量小于500”的条件。以Arvinas的两款PROTAC分子为例,其分子质量均超过700,而相对应的传统小分子抑制剂分子量都低于500。
(2)水溶性和细胞渗透性问题:PROTAC药物实现胞内蛋白的降解必须穿过细胞膜进入胞内,但相比于传统小分子抑制剂,PROTAC更大的分子量往往伴随有限的水溶性和细胞渗透性。
(3)E3连接酶的选择:迄今为止,在600多个E3泛素连接酶中,只有不到10个被开发用于靶向蛋白质降解,在报道的PROTAC分子中,以靶向CRBN E3泛素化连接酶为主,E3连接酶的种类尚待丰富。
(4)靶点局限:当前研究的PROTAC分子集中于靶向BET、AR、BTK等成熟靶点,仍有大量病理机制明确的蛋白未被探索。
正如所有的新兴技术一样,PROTAC技术目前面临的困难与挑战也是在所难免的。新药研发人员也熟知目前存在的技术难题,也在尝试寻找不同的解决方案。如果将来能不断突破这些瓶颈,相信PROTAC会释放出更大的潜力,造福病患。
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