高通量植物分蘖测量系统

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  • 上海泽泉科技股份有限公司 金牌13年
    400-860-5168转1218
    上海泽泉科技股份有限公司（Zealquest Scientific Technology Co., Ltd.）成立于2000年，是一家专注于高端科研设备研发、系统集成、技术推广、咨询、销售和科研服务的科技型技术企业。公司注册资金3500万元人民币，具有进出口贸易权。公司总部位于上海浦西，在北京设有分公司，在广州、成都、武汉分别设有代表处。公司全体员工均具有高等教育背景，其中80%的技术研发、技术支持和销售人员具有硕士和博士学位，参加过很多国家和省部级重大科研项目，具有丰富的科研工作经验。公司曾获得上海市高新技术企业、上海市普陀区科技小巨人企业、上海市科技型企业中华全国工商联合会/上海市工商联合会/上海市商会会员单位，曾是上海市专业技术服务平台——生理生态测量与分析平台的依托单位和上海市高新技术成果转化项目承担单位。2012年公司通过了ISO9001质量管理体系认证，获得AAA级信用资质等级认定，获得普陀区科技小巨人企业认定，成为上海市研发公共服务平台加盟单位和“上海市工商联合会”/“上海市商会”会员单位 。2015年获得“专精特新”中小企业认定。2016年成为“上海市生态学学会常务理事单位”和“上海种子行业协会”会员单位，2017年成为“上海市农业工程学会理事单位”。上海泽泉科技股份有限公司非常注重自主知识产权的申报和保护，截止2021年底已获得发明专利6项、实用新型53项及软件著作9项，国内外科研期刊发表科研论文20多篇。公司还参与承担了国家自然科学基金重点项目（41030529）和水利部948项目（200907）。公司秉承推进中国生态环境改善、农业兴国的理念，服务涉及植物表型组学和基因组学、植物生理生态、土壤、环境气象、水文水利、氢农业等领域的科研和技术支持，服务对象主要为各级科研单位、高校和政府机构。公司先后为科技部“973”项目和“863”项目、国家科技重大专项、国家科技支撑计划、国家“211”工程和“985”工程、中科院知识创新工程、农业部“948”项目、水利部“948”项目等提供技术咨询、仪器设备、系统解决方案和系统集成服务，为项目的顺利完成提供了有力支持。多年来，公司积极参与相关领域的学术会议，并定期举办相关仪器设备的技术讲座和培训班，在科研和监测领域产生了积极的反响，获得了良好的口碑。截止2021年底，泽泉科技举办公开技术讲座200多场，参会人员超过10000人次；同时在国内外应邀参加学术会议和展会200多次，与相关领域的客户有非常密切的交流合作。2014年2月，上海泽泉科技股份有限公司在上海浦东孙桥现代农业园区投资成立了上海乾菲诺农业科技有限公司，建设了AgriPhenoTM “高通量植物基因型-表型-育种服务平台”，为植物科研和育种单位提供全面的样品收集和栽培，实验设计和项目合作，以及表型数据与生物信息学分析综合服务。平台成功主持了上海张江国家自主创新示范区专项发展资金重点项目“泽泉科技高通量植物基因型-表型-育种服务平台”。作为主持单位或合作单位参与了上海市农委和科委的30多项政府科研服务项目以及商业服务项目，如科技兴农种业发展项目“农作物分子育种的技术创新研究”和“青菜高通量表型图谱标准的建立及主要性状分析”、科技兴农重点攻关项目“基于图像分析及三维建模技术的黄瓜长势快速评价方法研究”、 “兰科观赏花卉分子育种技术研究与产业化应用”等。为了紧追世界科技发展水平，开启院企合作建立研究型平台的创新尝试，上海泽泉科技股份有限公司与上海市农业科学院，结合双方各自的优势，于2021年5月在上海农业科学院庄行试验站联合成立“上海市农业科学院庄行综合试验站泽泉科技植物表型技术研究平台”，AgriPhenoTM平台从上海浦东孙桥现代农业园区整体迁出，并入新建的植物表型技术研究平台。目前平台除拥有无人机表型平台、温室型和实验室型高通量表型分析系统外，还拥有现代化温室、生物学实验室、植物生理生态测量设备、农业气象测量系统和专业的数据库平台，已经具备了对植物、动物基因测序与植物表型研究的各类条件。可以承担高通量DNA提取、基因测序服务、分子辅助育种、植物生理生态研究等科研实验任务。同时可以为植物功能基因组、农业育种家提供高通量植物基因型测试、高通量植物表型测试和植物基因型-表型生物信息学数据分析等开放式服务。公司积极响应上海市政府“崇明世界级生态岛建设”的发展方向，2016年12月泽泉科技在崇明城桥镇投资成立了子公司—上海金盏农业发展有限公司，扩展建设田间智能化育种服务平台，以及智能化农业物联网“农业云平台”，以生态乡村、能源乡村的发展模式，展示并实施公司自主研发的先进的农业楼宇基础设施、温室与田间的智能化“多因子”调控的栽培管理模式；拟建成拥有田间型高通量表型分析系统的“AgriPheno智能化育种服务平台”，提高上海种业商业化育种的进程，并服务于全国和国外相关育种科研单位。展望未来，上海泽泉科技股份有限公司希望在社会多方资源的支持和关怀下，不断提升自己，为社会提供更多、更优秀的产品和一流的服务！
    主营产品： 光合仪   冠层分析仪   植物荧光成像   数据采集器  
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  • 北京博普特科技有限公司 金牌4年
    400-860-5168转4713
    北京博普特科技有限公司成立于2008年，公司主要为植物、食品、生态、土壤、环境、气象、遥感行业提供科研仪器以及系统解决方案。涵盖田间表型成像系统、室内表型成像系统、种子表型成像系统、根系表型成像系统、显微表型成像系统等各个领域。公司主营产品有：WIWAM植物表型成像系统（RGB成像模块、多光谱激光雷达模块、叶绿素荧光成像模块、高光谱成像模块、近红外成像模块、计算机断层扫描模块、红外成像模块、3D激光雷达模块等）；Videometer植物、种子多光谱表型成像系统、根系多光谱表型成像系统、VideometerLiq液体稳定多光谱成像系统、VideometerMic显微多光谱成像系统、Videometer Minilab 便携式多光谱成像系统、Videometer LabUV紫外光多光谱成像系统、VideometerLab XY高通量种子表型成像系统；Plant-Ditech公司的Plantarray高通量植物生理表型研究平台、植物逆境生物学生理研究平台、植物种质资源精准评价与鉴定平台以及SPAC分析系统；Fraunhofer研究院的便携式植物种子断层扫描系统、台式计算机断层扫描系统、全自动种子断层扫描系统、大型落地式根系表型成像系统；Hiphen 公司Airphen多光谱表型成像系统、Hiphen LITERAL手持植物表型冠层成像系统、Hiphen推车多光谱成像系统、Phenomobile全自动全植株智能表型成像车；HAIP 公司的BlackBird科研级高光谱成像系统、Blackbullet科研级高光谱成像系统、Blackbox科研级高光谱成像系统、BlackIndustry 工业级高光谱成像系统、Black mobile便携式高光谱成像系统；SeQso高通量种子表型与播种一体化系统、CF叶绿素种子成熟度测量仪、自动种子分拣系统（X光、多光谱、高光谱、叶绿素荧光）；STEPS公司的植物生理生态监测系统、在线光合生理监测系统、土壤养分测量系统、植物养分测量系统、土壤5合1多参数测量仪、土壤直测PH计、盐度/活度检测仪；Pessl公司的植物生态环境智能传感器平台、植物物候远程监测系统；Inno-concept公司的植物活力胁迫测量系统、植物抗逆研究测量系统、气相离子迁移谱仪；Aquation水陆两用叶绿素荧光检测系统、经典和手持叶绿素荧光仪、Aquation公司的水下光合呼吸测量系统；EMS公司的便携式物联网乙烯气体分析仪、温室气体物联网监测系统；Cleangrow多参数离子测定仪、植物工厂自动8离子测定仪；Schaller全谷物湿度仪；EGC植物生长培养箱和生长室等等。
    主营产品： 植物表型测量   土壤测定仪   土壤酸度计   根系监测系统  
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  • 北京青元开物技术有限公司 金牌1年
    400-860-5168转6230
    北京青元开物技术有限公司专注于生命科学和生物医药行业上游，以宽体积精密移液和微反应精密操控等底层技术驱动，针对测序和质谱等高端检测应用中的高通量、多组学、自动化和智能化需求，合成生物学和CGT等前沿领域的研发和生产端的需求，开发细分领域的专用工具系列产品。目前，测序前处理系列产品已量产和销售。文库制备系统集成建库、质控及均一化三位一体，实现高度自动化；超声打断工作站无需专用耗材，且可直接处理PCR孔板；质谱前处理产品线已有产品交付。在某头部医院使用的血斑萃取工作站，已完成数万例新生儿血斑萃取用于新生儿遗传代谢筛查；独立开发的质粒大提工作站，和天根生化开展背靠背合作模式，已进入量产和推广阶段。公司于2021年底成立，申请自主知识产权50余项，已获得"国家高新技术企业”、"北京市专精特新中小企业"、"北京市创新型中小企业"、"中关村高新技术企业"等资质，已完成四轮融资的交割。
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  • 睿科 Vitae 100高通量自动核酸纯化系统 400-831-3689
    Vitae 100高通量自动核酸纯化系统是一款高通量、全自动化核酸纯化平台，采用磁珠分离技术，可连续从96个样本中快速、可靠的纯化高质量的核酸。该系统能降低用户在生物样本核酸提取中产生的操作误差，减少人工操作，提高效率。 产品特点■ 功能多样化即具备核酸提取的功能，又具备PCR体系构建功能■ 自动化 高通量以全自动液体处理工作站为基础，一次性可以处理96份样本■ 实验结果稳定均一化操作，减少实验过程中的误差，提高检测的准确性■ 安全防污染措施严谨的自动防污灭活处理，减少检测人员在核酸提取过程中直接接触病人样本，降低检测人员感染风险■ 灵活高效的盘面设计Vitae 100高通量自动核酸纯化系统提供多种功能模块与适配器部件，强大而灵活，允许用户根据实验方案需求调整配置，真正实现自动化流程。■ 界面简洁 一目了然1）界面人性化设计，拖拽式模式，操作方便，易于使用2）模块端口自动扫描，用户无需手动配置，使用更为省心3）拖拽式生成实验流程，每个动作可独立配置参数，满足用户不同的实验需求■ 高质量的纯化产物将8份血液样本6倍稀释，使用Vitae 100高通量自动核酸纯化系统提取gDNA，紫外分光光度计测量DNA质量和纯度。结果显示，提取的gDNA为高质量核酸。■ 高度重复性结果Vitae 100高通量自动核酸纯化系统单次运行提取96个样本，提取结果进行荧光定量。结果表明，Vitae 100高通量自动核酸纯化系统具有非常高的批内和批间重复性。应用领域■ 全血DNA/RNA 提取■ 动/植物组织DNA/RNA 提取■ 真菌、细菌、病毒等微生物样本DNA/RNA 提取■ 法医样本DNA/RNA 提取■ 生物体液DNA/RNA 提取■ 培养细胞DNA/RNA 提取■ FFPE基因组DNA提取
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    厂商： 睿科集团股份有限公司
    品牌： 睿科集团/Raykol
    型号： Vitae 100
    价格： 50万 - 100万元
  • 型高通量植物分蘖测量系统PhenoTiller V1.0 400-860-5168转3927
    产品简介高通量植物分蘖测量系统 PhenoTiller用于测量温室盆栽的禾本科植物的分蘖数。以工业CT为基础，结合农业应用实践重新设计，主要包括自动传送系统、X-射线发射器、X-射线检测器、自动旋转平台、伺服电机控制器和电脑工作站。测量时利用传送系统将被测植株传送至旋转平台，通过电脑工作站对伺服电机控制器进行调控，使之稳定匀速驱动旋转平台进行360°自动旋转，该过程中X-射线发射器和检测器则处于固定位置进行扫描测量，图像自动获取、存储和分析，整个测量过程大约20 s完成。 功能特性专为禾本科植物分蘖数测量而设计的CT系统特别适合水稻、小麦等作物的分蘖数量集成自动传送系统对植物分蘖位置进行360度旋转断层扫描(CT)扫描完成后自动完成分蘖计数 系统配置焦点到检测器的最大距离：850 mm焦点到被测物的距离：740 mm视野面积：20 x 20 cm焦点尺寸：约0.8 mm工作电压范围（kV）：40 – 80工作电流范围（mA）：0.2 – 1实际工作电压（kV）：50实际工作电流（mA）：1剂量当量率：0.06 μSv/h发射器焦点到旋转平台距离：1122 mm发射器焦点到检测器距离：1412 mm放大倍数：1.26横截面视野范围：244 mmX-射线检测器：线阵X-射线检测器X scan 0.4f3-205X-射线管电压范围（kV）：20 -160像素数目：768像素间距（mm）：0.4像素高度（mm）：0.6像素宽度（mm）：0.3最大扫描速度（cm/s）：80 系统图 （a）高通量植物分蘖测量系统（PhenoTillerV1.0）系统图（b）X-ray成像系统 公司简介谷丰光电（GREENPHENO）致力于植物表型，农业科研和机器视觉系统集成领域，具备核心图像处理、光机电控制、以及系统集成技术，掌握一批自主知识产权。主营业务包含：水稻数字化考种机；玉米籽粒数字化考种机；玉米果穗考种机；叶片表型快速分析仪；双目视觉植物表型分析系统；小型植物表型分析系统；高通量植物表型参数自动提取系统；高通量植物荧光表型检测平台；高光谱成像系统；水稻穗长测量系统；同时我们也提供作物考种服务，图像分析定制服务，表型仪器定制服务。
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    厂商： 武汉红星杨科技有限公司
    品牌： 未知
    型号： PhenoTiller V1.0
    价格： 面议
  • 型高通量植物分蘖测量系统谷丰光电PhenoTiller V2.0 400-860-5168转3927
    产品简介高通量植物分蘖测量系统 PhenoTiller2.0用于测量温室盆栽的禾本科植物的分蘖数、分蘖角度、分蘖大小、分蘖形状等分蘖参数；以及株高、株型、颜色、生物量等植株性状参数。以微型CT和RGB成像为基础，结合农业应用实践重新设计，主要包括自动传送系统、X-射线发射器、X-射线检测器、自动旋转平台、伺服电机控制器和电脑工作站。测量时利用传送系统将被测植株传送至旋转平台，通过电脑工作站对伺服电机控制器进行调控，使之稳定匀速驱动旋转平台进行360°自动旋转，图像自动获取、存储和分析，整个测量过程大约3 分钟完成。系统配置参数Micro-CT成像单元主要技术参数:视野面积：25 x 20 cm最小焦点尺寸：约0.035 mm实际工作电压（kV）：40实际工作电流（mA）：1剂量当量率：0.06 μSv/h RGB成像单元主要技术参数:视野面积：1607 mm (height) x 1347 mm (width)分辨率：2452 (height) × 2056 (width)镜头焦距：8 mm每株水稻拍摄图像帧数：20物距：1520 mm 系统结构图 图(a)高通量植物分蘖测量系统(PhenoTriller V2.0)整体结构图，图(b)x-ray单元及RGB单元布局设计，图(C)不同角度的水稻样品，图(d)不同角度的x-ray投影图像采集，图(e)正弦图获取，图(f)重建投影图，图(g)图像分割处理，(h)分蘖数、分蘖大小、分蘖形形状提取，（i）分蘖角度计算，图(j)水稻植株表型和分蘖表型性状。
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    厂商： 武汉红星杨科技有限公司
    品牌： 未知
    型号： PhenoTiller V2.0
    价格： 面议
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  • 高精度高通量植物生长观测仪
    成果名称高精度高通量植物生长观测仪单位名称北京大学联系人马靖联系邮箱mj@labpku.com成果成熟度□研发阶段 &radic 原理样机 □通过小试 □通过中试 □可以量产成果简介：该项目设计搭建一个用于观测植物表型的实验仪器，其中包括多个组件：高分辨率CCD和可调镜头组用来拍摄图片；平面光源用来提供不同波段的单色光照；气瓶和阀门等装置用来控制气体（如乙烯）的浓度；电动平移台用来实现实时观测过程中植物位置和观察角度的连续变化。以上所有组件与电脑相连接，在电脑软件&ldquo MatLab&rdquo 中编写程序，控制各组件的开关和运行，并在&ldquo MatLab&rdquo 中对拍摄得到的图片进行加工和处理，从而实现对拟南芥早期生长发育过程的高精度、高通量、自动化的实时观察和测量分析。主要的研究环节包括：1）使用高分辨率CCD、可调镜头组和平面光源作为图像采集系统，使用台式电脑和MatLab软件编写程序作为控制系统，实现对单一植物样品的自动化连续图像采集；2）使用MatLab软件编写图像处理程序，实现对植物图像中胚轴和根长度、顶端弯钩角度、子叶颜色变化的自动化识别和测量；3）在图像采集系统中加载电动平移台，在自动化的基础上，实现同时对多个植物样品的高通量图像采集；4）在图像采集系统中加载气流控制系统，实现气体处理（如植物激素乙烯）的加入和去除；5）在MatLab软件中改进和完善图像处理程序，在自动化的基础上，进一步提高识别和测量结果的精确度和可重复性。目前，基于以上设计的高精度高通量植物生长观测仪按期研制完成。自主开发了两种全新的图像处理程序，使电脑对植物图像中幼苗的长度和角度实现了自动化智能化的识别和测量，并达到了很高的精确度和可重复性，为关键技术突破。应用前景：样机已经在拟南芥黄化苗对植物激素乙烯的动力学反应研究中投入应用，取得相应成果，并在SCI期刊上发表文章。
    时间： 2015-04-14
    作者： 秦丽娟
  • Resonon | WinRoots：用于土壤胁迫下植物表型研究的高通量栽培和表型分析系统
    土壤是重要的自然资源，地球上95%的食物来源于土壤，土壤保存了至少四分之一的全球生物多样性，不仅是粮食安全、水安全和更广泛的生态系统安全的基础，更是为人类提供多种服务、帮助抵御和适应气候变化的重要因素。由土壤组成造成的胁迫，例如盐、重金属和养分亏缺是作物减产的主要原因。作物土壤耐逆性是一种复杂性状，涉及植物形态、代谢和基因调控网络等多种遗传和非遗传因素的调控。传统的作物表型研究通常在田间进行，费事费力、劳动密集、低通量、且受研究人员无法控制的自然环境因素的影响。在此情形下，难以获得高精度的表型数据以满足表型组学的研究需求。在过去几十年，已经开发了几种HTP（高通量表型）平台在现场或可控条件下使用，但其运维成本极高。此外，作物表型相关研究通常只关注植物地上部分，而对根系形态数据的获取有限。然而，根系是植物吸收水分和养分的主要途径，也是碳水化合物的储存器官和土壤胁迫的直接感知器官。因此，根系表型是土壤胁迫条件下植物表型研究的重要组成部分。就通量、环境可控性和根系表型获取而言，现有的植物表型平台无法完全满足植物对土壤胁迫响应的表型组学研究的特定需求。基于此，在本文中，来自山东大学生命科学学院和潍坊农科院的一组研究团队描述了其最近开发的高通量植物栽培和表型系统—WinRoots平台。以大豆植物为研究对象，将其暴露在盐胁迫中，证明了土壤盐胁迫条件的一致性和可控性以及WinRoots系统的高通量。他们开发了优化的盐胁迫条件，以及适用于大豆耐盐性的高通量表型指数。此外，高通量多表型分析表明，子叶特征可作为大豆全苗耐盐性的非破坏性指标。在本研究中，Canon EOS 700D数码相机和Resonon Pika L高光谱成像仪分别用于获取RGB和高光谱图像。相机位于植物材料上方1.5 m的可滑动水平导轨上。每天收集大豆冠层和整株幼苗的图像。栽培第九天，获取离体叶片图像，每个品种重复3次。WinRoots系统：高通量根系和整株植物表型平台。系统使用示意图。【结果】盐胁迫相关性状之间的相关分析。（A）盐胁迫相关性状之间的相关矩阵。（B）预测值和观测值之间的回归曲线。大豆盐胁迫相关性状的合成聚类。（A）大豆盐胁迫相关性状的合成聚类剖面图。（B）聚类1和聚类2代表性栽培品种表型。（C）聚类1和聚类2指标比较。【结论】WinRoots系统为幼苗生长提供了均一可控的土壤胁迫条件，可用于土壤胁迫下高通量栽培和表型分析，有助于提供准确多样的土壤胁迫相关的表型数据。因此，WinRoots提供了一种分析诸如土壤胁迫之类的复杂性状的改进方法。HPPA(Hyperimager Plant Phenomics Analysis)高光谱植物表型成像系统由北京依锐思遥感技术有限公司与美国RESONON公司联合研制生产，整合了高光谱成像测量分析、RGB真彩色图像、无线自动化控制系统、线性均匀光源系统等多项先进技术；最优化方式实现大量植物样品的数据采集工作，可用于高通量植物表型成像分析测量、植物胁迫响应成像分析测量、植物生长分析测量、遗传组学与表型组学、遗传育种、生态毒理学研究、性状识别及植物生理生态分析研究等。请点击以下链接，阅读原文：https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MjM5NjE1ODg2NA==&mid=2650311205&idx=3&sn=ffe393bdf01d664cab05b92572691916&chksm=bee1a6da89962fccef8eae610681ac22d2239e59d016db96cd911d103186c3459c4061ca30bf&token=1489736406&lang=zh_CN#rd
    时间： 2022-06-10
    作者： 理加联合
  • PlantScreen高通量植物表型系统火热安装中”系列报道（一）
    癸卯春节 安装启动！ 2023年农历春节，各地沉浸在轻松欢快的节日氛围，而在中国农科院作科所的温室里，中国农科院的研究人员、PSI公司和北京易科泰公司的工程师投身于PlantScreen高通量植物表型系统——作物高光效高效筛查与鉴定表型平台的安装工作中，现场一片火热繁忙的景象。 从正月的初三到十四，短短的两周时间里，PlantScreen高通量植物表型系统平地而起。庞大的规模、现代感十足的外观、火热的安装场面，吸引假期期间仍在温室里辛苦劳作的研究人员纷纷驻足观看，询问安装进度，热切表达了希望未来能够使用这套系统开展实验的愿望。 PlantScreen高通量植物表型系统由国际知名的表型系统制造厂商PSI研发，整合了LED植物智能培养、自动化植物传送、多种光学成像传感器（FluorCam叶绿素荧光成像、多光谱荧光成像、可见光近红外及短波红外高光谱成像、植物热成像、RGB真彩3D成像、激光雷达3D成像、根系成像等）、自动条码识别管理、自动称重与浇灌、电脑自动控制及数据处理等多项先进技术，能够以最优化的方式对大量植物样品的生理状态、生化组分、形态结构的进行自动成像分析。 系统有效解决了传统植物表型分析技术中存在的精度低、费时费力、适用性差等问题，具备高效准确的特点，并可实现全生育期的无损动态监测；被广泛用于研究不同环境因子及基因型对植物生长、产量、质量的影响，揭示可控环境下基因组与环境等因素互作进而调控作物表型的分子机理。截止2020年底，PlantScreen在全球累积销售/装机量超过50台。主要用户有荷兰瓦格宁根大学、德国莱布尼茨植物遗传和作物研究所、芬兰赫尔辛基大学、澳大利亚国立大学等全球知名的农业学府和顶级研究机构（下图中的PlantScreen系统于2020年安装在都柏林大学），也不乏杜邦先锋、孟山都、巴斯夫等农业企业巨头。 作为PSI公司的合作伙伴和大中华区技术服务中心，成立20年来北京易科泰生态技术有限公司致力于精密、高端植物和藻类实验设备和技术的引进推广及自主研发，迄今为止已为中科院植物所、中国农科院、中科院水生所、中国农业大学、西北农林科技大学等国内知名农业院校和机构提供了大量仪器设备及技术支持。此次安装的PlantScreen高通量植物表型系统通量为4000株种苗/200株成体，配备FluorCam叶绿素荧光成像、RGB真彩3D成像、激光雷达3D成像、植物热成像和高光谱成像等传感器，具备自动称重与浇灌功能，将主要用于水稻等作物高光效高效筛查与鉴定、作物高光效机理研究及新材料创制。 立春已过，农耕将始。今年春天，除了位于北京的中国农科院生物技术研究所，中国水稻研究所（杭州）和东北地理与农业生态研究所（长春）也正在或者即将紧张有序地进行PlantScreen系统的安装。高通量作物表型监测被称为育种的加速器。毫无疑问，PlantScreen高通量植物表型系统的安装运行能够帮助中国作物遗传育种学家深入剖析与产量和胁迫耐受性相关的遗传学数量性状，必将为具有国家战略意义的分子设计育种和种质资源开发应用提供强有力的技术支撑。截止发稿前，农科院生物所PlantScreen系统的安装工作已基本完成，即将进入调试和试运行环节，并将合作举办培训研讨。
    时间： 2023-02-10
    作者： 易科泰
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  • 药物高通量筛选技术

    简单介绍一下关于药物高通量筛选技术的知识一.概念高通量筛选(High throughput screening，HTS)技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础，以微板形式作为实验工具载体，以自动化操作系统执行试验过程，以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据，以计算机对实验数据进行分析处理，同一时间对数以千万样品检测，并以相应的数据库支持整个体系运转的技术体系。二. 高通量筛选技术体系的组成1. 化合物样品库化合物样品主要有人工合成和从天然产物中分离纯化两个来源。其中,人工合成又可分为常规化学合成和组合化学合成两种方法。2.自动化的操作系统自动化操作系统利用计算机通过操作软件控制整个实验过程。操作软件采用实物图像代表实验用具，简洁明了的图示代表机器的动作。自动化操作系统的工作能力取决于系统的组分，根据需要可配置加样、冲洗、温解、离心等设备以进行相应的工作。3.高灵敏度的检测系统检测系统一般采用液闪计数器、化学发光检测计数器、宽谱带分光光度仪、荧光光度仪等。4.数据库管理系统数据库管理系统承担4个方面的功能: 样品库的管理功能;生物活性信息的管理功能; 对高通量药物筛选的服务功能; 药物设计与药物发现功能。三. 高通量筛选模型常用的筛选模型都在分子水平和细胞水平，观察的是药物与分子靶点的相互作用，能够直接认识药物的基本作用机制。1. 分子水平的药物筛选模型:受体筛选模型;酶筛选模型;离子通道筛选模型1.1受体筛选模型:指受体与放射性配体结合模型。以受体为作用靶的筛选方法,包括检测功能反应、第二信使生成和标记配体与受体相互作用等不同类型。1.2酶筛选模型:观察药物对酶活性的影响。根据酶的特点,酶的反应底物,产物都可以作为检测指标,并由此确定反应速度。典型的酶筛选包括1) 适当缓冲液中孵化;(2)控制反应速度,如:温度,缓冲液的pH值和酶的浓度等;(3)单时间点数器, 需测量产物的增加和底物的减少。1.3离子通道筛选模型: (1)贝类动物毒素的高通量筛选,其作用靶为Na+通道上的蛤蚌毒素结合位点，用放射性配体进行竞争性结合试验考察受试样品。(2)用酵母双杂交的方法高通量筛选干扰N型钙通道β3亚单位与α1β亚单位相互作用的小分子，寻找新型钙通道拮抗剂。2.细胞水平药物筛选模型观察被筛样品对细胞的作用,但不能反映药物作用的具体途径和靶标,仅反映药物对细胞生长等过程的综合作用。包括: 内皮细胞激活; 细胞凋亡; 抗肿瘤活性; 转录调控检测; 信号转导通路; 细菌蛋白分泌; 细菌生长。四.问题及展望高通量筛选技术与传统的药物筛选方法相比有以下几个优点:反应体积小；自动化；灵敏快速检测；高度特异性。但是，高通量筛选作为药物筛选的一种方法,并不是一种万能的手段，特别是在中药研究方面，其局限性也是十分明显的。首先，高通量筛选所采用的主要是分子、细胞水平的体外实验模型，因此任何模型都不可能充分反映药物的全面药理作用；其次，用于高通量筛选的模型是有限的和不断发展的，要建立反映机体全部生理机能或药物对整个机体作用的理想模型，也是不现实的。但我们应该相信，随着对高通量筛选研究的不断深入，随着对筛选模型的评价标准、新的药物作用靶点的发现以及筛选模型的新颖性和实用性的统一，高通量筛选技术必将在未来的药物研究中发挥越来越重要的作用。

  • 如何高通量高效破碎动植物组织和微生物

    如何高通量高效破碎动植物组织和微生物

    破碎大量样品、低温破碎大量样品、破碎坚硬或韧性较强的样品时，人工手动研磨就成了实验猿的噩梦。当然，也有很多实验猿已经尝试过市面一些研磨机/超声波粉碎机，发现自己那顽固的样品依然无法被完全破碎/破碎过程损坏了目标成分而十分心塞。 分享个高通量高效破碎动植物组织和微生物的方法，别逗，当然不是靠徒手研磨能做到的，必须入手个神器——tissuelyser系列和JXFSTPRP系列多样品组织研磨机。对于动植物组织和微生物，包括一些难以破碎的组织样品，都可以使用这个研磨机对其进行完全粉碎。 特别地，一些尤其坚硬/韧性比较强的样品，或要求维持低温条件进行破碎提取的样品，需要结合液氮进行研磨，如：皮肤、硬骨骼、软骨、血管、结缔组织、种子等；使用普通机械研磨方法，很难既保证研磨破碎效果又保证样品一直处于低温状态，尤其是提取RNA、酶等对温度敏感的物质时，低温状态的控制显得尤为关键。入手一台上海净信的多样品组织研磨机，这些都不再是问题了。看招：注：由于样品的具体差异及实验要求的不同，下文数据部分请咨询厂家。第一部分 破碎动物组织1）样品：猪肌肉组织2）仪器：Tissuelyser多样品组织研磨机（品牌：上海净信）；耗材：***毫升离心管和直径***毫米的研磨钢珠3）步骤：a.取***克左右肌肉组织样品，均匀地剪切成少量样品块，分别放入若干***毫升的研磨离心管中。b.每个试管中放入***颗直径***毫米的研磨钢珠和800μLPBS裂解液，分别盖紧管盖后，置入24孔研磨适配器中，再将适配器固定在研磨机中。c.将Tissuelyser多样品组织研磨机的参数设置为***赫兹，研磨***秒，启动研磨器。d.研磨完全停止后，拿出研磨离心管，旋开管盖，取出研磨好的肌肉组织样品。4）结果：研磨后的效果如图1，猪肌肉组织成很细腻的泥浆状，说明Tissuelyser多样品组织研磨机对猪肉组织的研磨效果良好。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/05/201505150947_546190_3397_3.jpg图1 猪肌肉研磨对比第二部分 破碎植物组织1）样品：水稻叶片2）仪器： Tissuelyser多样品组织研磨机（品牌：上海净信）；耗材：***毫升离心管和直径***毫米的研磨钢珠3）步骤：a.取***克左右叶片组织样品，均匀地剪切成少量样品块，分别放入若干***毫升的研磨离心管中。b.每个试管中放入***颗直径***毫米的研磨钢珠，分别盖紧管盖后，置入24孔研磨适配器中，再将适配器固定在研磨机中。c.将Tissuelyser多样品组织研磨机的参数设置为***赫兹，研磨***秒，启动研磨器。d.研磨完全停止后，拿出研磨离心管，旋开管盖，取出研磨好的叶片组织样品。4）结果：研磨后的效果如图2，叶片组织成很细腻的泥浆状，说明Tissuelyser多样品组织研磨机对叶片组织的研磨效果良好。顺带附上研磨黄豆（坚硬的植物种子）的研磨对比图。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/05/201505150948_546191_3397_3.jpg图2 水稻叶片研磨对比http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/05/201505150948_546192_3397_3.jpg图3 黄豆研磨对比第三部分 结合液氮使用tissuelyser研磨机 当样品死活无法破碎完全/样品傲娇要低温环境时，Tissuelyser多样品组织研磨机+液氮=问题轻松解决。以血管和植物叶片为例，具体操作方法如下： 血管： 取0.1克新鲜血管，用剪刀剪成若干小块，然后放入2毫升离心管中，加入1颗6mm研磨钢珠，盖上管盖。将整个试管放入液氮中冷冻1分钟左右或直到液氮不沸腾，然后放入机器处理30秒钟。取出样品管可见样品被破碎成乳白色粉末，然后加入提取缓冲液，可以进行接下来的后续提取，加入缓冲液之前能保证样品温度一直处于-20℃以下。 叶片： 取0.2克植物叶片，清洁叶片表面后放入离心管中，加入1颗直径5mm不锈钢研磨钢珠，盖上管盖。将整个试管和适配器放入液氮中冷冻1分钟左右或直到液氮不沸腾，然后取出放入研磨机器中机器处理30秒钟。取出样品管可见叶片被破碎成绿色粉末，然后加入提取缓冲液，进行接下来的后续提取即可，加入缓冲液之前能保证样品温度一直处于-20℃以下。后记 想入手这个神器，但又对研磨效果有所犹疑的小伙伴，现在上海净信部分研磨机产品可申请试用，是时候下手了。激动人心的还有，近期研磨机好价，试用爽了直接入手一台也是毫不含糊的。

  • 高通量组织研磨仪液氮冷冻研磨实验

    高通量组织研磨仪液氮冷冻研磨实验

    TJ2011高通量组织研磨仪对植物叶片的液氮冷冻研磨实验处理材料：植物叶片 （水稻、玉米、小麦、草、蔬菜叶等）1 装物料：将植物叶片截成所需的小段，用镊子夹住，放入1.5/2ml的离心管管底，对离心管进行编号。现以24空离心管适配器为例；2 装研磨珠：每个离心管内装上1个5mm碳化钨（或氧化锆）研磨珠，或3mm碳化钨（或氧化锆）研磨珠5个；3 冷冻保存：将铝合金夹具夹住24孔，固定好，放到专业液氮盒中，加液氮冷冻，3-5分钟，充分冷冻夹具及管内样品。4 溶剂加入：如有需要，在每个离心管中，小心加入裂解液或其他溶剂；4 主机运转：设定转速与时间例如1500转/分钟 3min，点击Start5 研磨过程：在典型研磨时间（2~3min）内，研磨结束。可同时得到2*24=48个通量的样品；6 取下夹具，进行下一步实验。注意事项：在上夹具时，要注意一是要带上厚一点的手套，防止被液氮冻伤；一是要迅速，且要保证螺栓拧紧，卡上保险扣。然后，启动研磨。TJ2011高通量组织研磨仪同时适用动物组织（骨骼、肌肉、内脏、毛发等）的研磨，高通量提取DNA/RNA。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/02/201202141110_349211_1812435_3.jpghttp://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/02/201202141110_349212_1812435_3.jpg

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    MagPure纯化技术介绍MagPure（磁珠法）纯化技术是专门为自动化核核酸提取设计的。该技术采用超顺磁性粒子为基质， 在其表面包被硅醇基或羧基基团，使得微粒与核酸发生特异性的吸附作用，从而达到纯化核酸的目的。 MagPure技术配合自动化核酸提取工作站，可将核酸分离纯化，从手工变成机械自动化操作，可大大 提高实验的准确度和通量，并减少操作人员接触危险样品的机会。MagPure Plant RNA Kit (自动化植物RNA纯化系统)从50mg植物样品中提取高纯度的总RNAMagPure Plant RNA Kit采用磁珠纯化技术，适用从50mg植物样品中提取高纯度的总RNA。得到的RNA可直接用于RT-PCR、荧光定 量RT-PCR、Nouthern杂交等实验。该产品可成功在VERSA 10，VERSA 1100，VERSA HT等设备上运用。不同的植物叶片样品(50mg)经MagPure Plant RNA Kit提取后，取5%纯化RNA上样于1%琼脂糖凝胶电泳结果)。取纯化的RNA测量结果结果表明，MagPure Plant RNA Kit可处理常规的植物样品，也可以处理多酚类和多糖类的植物样品。可兼容液体处理系统VERSA 10 PCR/NAP 自动化核酸提取-PCR建立工作站VERSA HT 高通量自动化液体处理工作站VERSA 1100 NGLP 下一代测序工作组VERSA 1100 4ch Independent 独立四通道液体处理工作站VERSA 1100 PCR/NAP 自动化核酸提取-PCR建立工作站Aurora在核酸分离纯化领域拥有完整和先进的技术，MagPure试 剂盒为不同样品提供不同粒径或不同官能基团的磁性粒子，以达到 最佳的纯化效果。在满足产品精确性及可重现性的要求，实现高通 量自动化核酸纯化的同时 保证产品绝对的兼容性。
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