质谱细胞代谢组分析

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质谱细胞代谢组分析相关的厂商

  • 北京百泰派克生物科技有限公司
    北京百泰派克生物科技有限公司（Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP）成立于2015年，是国家级高新技术企业，业务范围主要围绕蛋白和小分子代谢物检测两大板块，从事蛋白质和小分子代谢物的理化性质分析及结构解析等相关技术服务，为客户提供高性价比、高效率的技术服务。深耕蛋白鉴定、定量蛋白组（iTRAQ/TMT、label free、DIA/SWATCH）、PRM靶蛋白定量、蛋白和抗体测序、蛋白修饰（二硫键、糖基化、磷酸化、乙酰化、泛素化等）、靶向和非靶向代谢物检测。百泰派克生物科技检测平台包括：检测分析平台、蛋白质组学分析平台、代谢组学分析平台、蛋白质从头测序平台、生物制药分析平台和流式细胞多因子检测平台。公司拥有独立的质谱实验室、色谱实验室、细胞培养室和免疫学实验室，以及高分辨率质谱仪和高效液相色谱。目前已与国内外多家药物研发企业，以及哈佛大学、北京大学在内的国内外高校建立了合作关系，协助客户发表了多篇中英文文章，包括Cell等多家高水平期刊。公司自主检测平台发展至今，已覆盖蛋白质组学、代谢组学、生物制药、生信分析等多组学检测平台，积累了丰富的实践经验，凭借专业的技术和优质的服务水平，客户覆盖北京大学、清华大学、中科院等多所知名院校，也与国内外多家药物研发企业建立合作关系。公司始终致力于为各科研院校、企业和机构提供高效、准确、高性价比的蛋白质（组）研究技术包裹，助力客户在基础研究、分子诊断及其他生命科学研究领域取得突破，为生命科学的发展做出贡献。百泰派克技术平台检测分析平台：多台高分辨率质谱仪、高效液相色谱、气相色谱，NMR。蛋白质组分析平台：Label-free、iTRAQ、SILAC、SWATH、MRM；蛋白质定性定量鉴定、蛋白质差异分析、发现疾病标记物、发现药物靶标。代谢组分析平台：靶向代谢组学、非靶向代谢组学、脂质组学分析；通量达1000种代谢分子、代谢通路分析、代谢靶标鉴定。流式细胞多因子检测平台：CBA、FlowCytomix；微量样品需求，分析多种细胞因子。蛋白质从头测序平台：Obitrap Fusion Lumos质谱仪、PEAKS软件分析；100%序列测定，精准蛋白、抗体测序。生物制药分析平台：生物药物鉴定、变异性分析、纯度分析。流式细胞多因子检测平台：CBA、FlowCytomix；微量样品需求，分析多种细胞因子。
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  • 长沙质谱佳科技有限公司 银牌1年
    400-860-5168转6112
    质谱佳科技是国内专业从事分析仪器维修等技术服务、进口二手分析仪器销售和租赁的领先企业，原厂工程师团队为客户在色谱、光谱、质谱仪的维护保养、维修、仪器认证、技术升级、仪器搬迁，软硬件操作培训等多方面提供完善的技术支持和整体解决方案。 质谱佳科技在美国、欧洲、日本有着良好的合作伙伴，凭借优质的进货渠道和专业的选品团队为客户提供优质的二手仪器。主营品牌有：Thermo（赛默飞）、AB Sciex（爱博才思） 、Agilent (安捷伦)、Waters（沃特世）、Shimadzu（岛津）等，另外质谱佳科技还提供分析仪器配件、耗材的销售。 质谱佳科技总部位于长沙，通过设在上海、海口等地的分公司，形成服务全国的网络。为制药、食品、环保、三方检测、新能源等多个行业以及高校、科研院所、政府实验室等客户提供方便快捷的本地化服务。
    主营产品： 二手分析仪器   维修保养   真空泵   液质联用仪  
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  • 广东联捷生物科技有限公司
    广东联捷生物科技有限公司是美国生物化学分析有限公司HT Laboratories在中国开办的分支机构，总公司自2000 年创办于美国圣地亚哥至今，已有超过15年的历史，长期从事分析化学研究和外包服务，在有机和无机物质鉴定，生化分析，药物代谢动力学，结构分析等领域积累了极为丰富的实践经验，15年的历程使我们的合作伙伴遍布世界各地，在顾客中建立了牢靠的信誉和技术权威。 由留美博士带领的联捷生物科技团队具有高素质，高效率，技术力量国际领先的优势。在分析技术服务方面，可为客户提供药物分析、代谢动力学研究服务、材料成分剖析、不明物质解析、食品和农产品检测、土壤检测、环境检测、产品指纹建立、同位素跟踪检测等高端专业分析技术服务。在分析化学领域我公司拥有多项独家技术，具备多快好省解决客户难题的独特能力。我们在仪器设备的维护与开发方面的经验也积累颇丰，能向各个行业提供多种翻修的检测设备并承担售后服务和技术支持。我公司的专家学者还将定期与不定期的开设各类分析技术与设备维护的培训。 我公司现已装备了几十套先进分析仪器设备，包括气质联用仪、液质联用仪、毛细管电泳与质谱联用仪、电感耦合等离子体质谱仪、高分辨质谱仪、同位素比例质谱仪、傅里叶变换吸光光度计、紫外-可见分光光度计、元素分析仪、高效液相色谱仪、制备型高效液相色谱仪、顶空进样气相色谱仪等高尖设备。利用这些一流的仪器设备，我们能定性定量分析任何样品，从化学组分分类，样品可以是有机物、无机物、离子化合物、金属元素、非金属元素、高分子化合物、蛋白质、DNA、糖类化合物等等，从样品来源分类，我们可以分析生物组织、血样、药物食品、酒水饮料、各种材料及合金、矿产农产水产、环境气体和水质等等。用我们的技术和仪器设备能分析世界上所有物质，并将以此发展成配方产品的开发平台。
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质谱细胞代谢组分析相关的仪器

  • 安捷伦Seahorse XFp 细胞能量代谢分析仪 400-860-5168转4076
    安捷伦Seahorse XFp 细胞能量代谢分析仪简介：安捷伦Seahorse XFp 分析仪在 8 孔微孔板中检测活细胞的 OCR 和 ECAR。快速简化设置使得 XFp 分析仪成为进行体外和其它有限量样品中代谢表型常规测试的理想工具。相关资料下载请点击：http://www.instrument.com.cn/netshow/SH104076/download.htm安捷伦Seahorse XFp 细胞能量代谢分析仪特性：1、样品量需求少，适用于珍贵样品 - XFp 分析仪是适用于研究少量细胞数或每天只分析少量样品的研究人员的性价比最高的解决方案。2、实时结果 - 该整合系统可在几分钟内报告代谢率，而无需样品提取或标记。 该仪器可立即测定并计算速率，完成整个分析只需一、两个小时。数据可轻松传输至 3、Seahorse Wave 分析软件，或导出至常用电子表格和作图程序。3、快速周转时间 - 8 孔板式微孔板形式可简化分析设置。 自定义报告生成器帮助并标准化关键分析的输出，同时实现灵活支持不同的实验方案。4、活细胞响应 - 实时检测底物，抑制剂和其它化合物的响应，其通过 4 接口进样系统进样并具备自动混合功能。5、高灵敏度 - 可分析每孔仅 5000 个细胞或是每组 15000 个细胞。 细胞数目需求根据细胞类型所不同；请参考细胞参考数据库了解详细信息。6、拥有精密控温加热托盘，可维持 16-40℃（最低至室温上 8℃），因此兼容多种样品来源。7、采用Seahorse XF 细胞能量表型测试可在一小时内生成一种代谢表型8、采用 Seahorse XFp 细胞线粒体压力测试试剂盒和报告生成器测定线粒体功能。9、利用 Seahorse XF 糖酵解速率分析法分析活细胞内的糖酵解速率10、采用 Seahorse XF 线粒体燃料灵活性测试试剂盒和报告生成器快速检测细胞能量生成对葡萄糖、谷氨酰胺或脂肪酸的依赖性。仅限研究使用。不可用于诊断目的。
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    厂商： 安捷伦Seahorse
    品牌： 安捷伦/Agilent Technologies
    型号： Seahorse XFp
    价格： 面议
  • 安捷伦Seahorse XFp 细胞能量代谢分析仪 400-629-8889
    安捷伦Seahorse XFp 细胞能量代谢分析仪简介：安捷伦Seahorse XFp 分析仪在 8 孔微孔板中检测活细胞的 OCR 和 ECAR。快速简化设置使得 XFp 分析仪成为进行体外和其它有限量样品中代谢表型常规测试的理想工具。 安捷伦Seahorse XFp 细胞能量代谢分析仪特性：1、样品量需求少，适用于珍贵样品 - XFp 分析仪是适用于研究少量细胞数或每天只分析少量样品的研究人员的性价比最高的解决方案。2、实时结果 - 该整合系统可在几分钟内报告代谢率，而无需样品提取或标记。 该仪器可立即测定并计算速率，完成整个分析只需一、两个小时。数据可轻松传输至 3、Seahorse Wave 分析软件，或导出至常用电子表格和作图程序。3、快速周转时间 - 8 孔板式微孔板形式可简化分析设置。 自定义报告生成器帮助并标准化关键分析的输出，同时实现灵活支持不同的实验方案。4、活细胞响应 - 实时检测底物，抑制剂和其它化合物的响应，其通过 4 接口进样系统进样并具备自动混合功能。5、高灵敏度 - 可分析每孔仅 5000 个细胞或是每组 15000 个细胞。 细胞数目需求根据细胞类型所不同；请参考细胞参考数据库了解详细信息。6、拥有精密控温加热托盘，可维持 16-40℃（最低至室温上 8℃），因此兼容多种样品来源。7、采用Seahorse XF 细胞能量表型测试可在一小时内生成一种代谢表型8、采用 Seahorse XFp 细胞线粒体压力测试试剂盒和报告生成器测定线粒体功能。9、利用 Seahorse XF 糖酵解速率分析法分析活细胞内的糖酵解速率10、采用 Seahorse XF 线粒体燃料灵活性测试试剂盒和报告生成器快速检测细胞能量生成对葡萄糖、谷氨酰胺或脂肪酸的依赖性。仅限研究使用。不可用于诊断目的。
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    厂商： 安捷伦科技(中国)有限公司
    品牌： 安捷伦/ BioTek
    型号： Seahorse XFp
    价格： 面议
  • 安捷伦Seahorse XFe24 细胞能量代谢分析仪 400-860-5168转4076
    安捷伦Seahorse XFe24 细胞能量代谢分析仪简介：安捷伦Seahorse XFe24 分析仪在 24 孔板中检测活细胞的 OCR 和 ECAR。这些数值是线粒体呼吸和糖酵解的关键指标，可在系统水平了解培养细胞，胰岛和体外样品的细胞代谢功能。相关资料下载请点击：http://www.instrument.com.cn/netshow/SH104076/download.htm安捷伦Seahorse XFe24 细胞能量代谢分析仪特性：1、实时结果 — 该整合系统可在几分钟内报告代谢率，而无需样品提取或标记。Wave 软件可控制仪器，并实时执行速率测定以当日内提供测试结果。2、活细胞响应 — 实时检测底物，抑制剂和其他化合物的响应，其通过 4 加药口系统实现加药并自动混合，同时保持生理温度 (37 oC)。3、高灵敏度 — 可分析自定义 24 孔板中每孔仅 10000 个细胞。细胞数目需求根据细胞类型所不同；请参考细胞参考数据库了解详细信息。相比 96 孔系统，24 孔微孔板和系统可容纳更大和/或更多的代谢活性样品。4、拥有精密控温加热托盘，可维持 16-42 oC（室温以上 12-20 oC），因此兼容多种样品。5、采用 Seahorse XF24 胰岛捕获板可分析胰岛功能或其它流动样品6、采用 Seahorse XF 细胞线粒体压力测试检测线粒体功能7、采用 Seahorse XF 细胞能量表型测试可在一小时内生成一种代谢表型8、利用 Seahorse XF 糖酵解速率测试分析活细胞内的糖酵解速率9、采用 Seahorse XF 线粒体底物分析测试，快速检测细胞能量生成对线粒体底物的依赖性10、使用 Seahorse Wave 软件可轻松创建分析实验方案和分析数据仅限研究使用。不可用于诊断目的。
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    厂商： 安捷伦Seahorse
    品牌： 安捷伦/Agilent Technologies
    型号： Seahorse XFe24
    价格： 面议
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质谱细胞代谢组分析相关的资讯

  • 清华大学张奇伟、张新荣团队合作开发单细胞空间代谢组分析新方法
    多细胞生物由复杂的层次性机制来维持稳态。在组织层面上，这种稳态通常由细胞内基因调控网络和细胞外环境中各种信号介导的相互作用共同维持。因此，具有空间分辨率的单细胞组学技术对理解组织微环境具有重要意义。现在国际上已有多种空间组学方法(如转录组、蛋白组)来测量单细胞级别的空间信号分布，但是仍然缺乏空间代谢组的分析方法。　　SEAM方法采用高空间分辨质谱成像结合机器学习算法，实现了组织原位代谢异质性可视化、单细胞核图像识别、代谢特征信息提取以及单细胞的聚类、差异化分析，从而能够让研究者系统的解析组织中单细胞的“代谢指纹图谱(metabolic fingerprint)”(图1)。由于器官或组织中的单个细胞的代谢物图谱存在明显的空间分布的异质性，因此，定位单个细胞在组织网络中的位置、区分相关代谢物的指纹图谱差异、确定重要代谢物的分子组成有重要意义。　　图1.SEAM在单核分辨率下捕捉到空间代谢异质性　　为了验证新方法，清华大学张奇伟、张新荣团队解析了野生型小鼠肝脏组织中的空间代谢异质性，发现了肝细胞代谢异质性亚群。这一发现和前人通过蛋白或者基因表达所验证的肝组织分区现象(Liverzonation)有着高度一致(图2)，有效证明了SEAM方法的可靠性和准确性。　　图2.SEAM在小鼠肝脏中通过代谢指纹图谱分析发现Liverzonation现象　　作者还对人肝纤维化中的代谢异质性进行了空间代谢组和空间转录组联合分析。发现在肝纤维化样本中存在有两种代谢差异的肝细胞亚群，它们和纤维化区域的距离在不同样本间存在有统计学差异(图3)。通过代谢组和转录组的共同分析，发现其中的存在有谷丙酰胺的上调以及其对应代谢相关的跨膜转运蛋白的基因表达上调。虽然单细胞转录组的研究已经取得长足进展，与转录组及其表型研究密切相关的代谢组研究在单细胞水平目前还缺少方法。本文提出的“SEAM”方法，系统解析了组织空间中的单细胞代谢组，对于整个单细胞技术领域的进步具有重要的推进作用。　　图3. SEAM在人类肝纤维化样本中发现代谢极性　　相关成果以“SEAM是一个研究组织微环境的单细胞核空间代谢组学方法”(SEAM is a spatial single nuclear metabolomics method for dissecting tissue microenvironment)为题于10月4日发表于《自然方法》(Nature Methods)。论文第一单位是清华大学自动化系。共同通讯作者是清华大学北京信息国家研究中心、医学院张奇伟教授，清华大学化学系张新荣教授，清华大学原副研究员陈阳(现中国医学科学院基础医学研究所研究员)。共同第一作者为清华大学自动化系博士生原致远、生命科学学院博士生周启明、化学系博士生蔡乐斯。中日友好医院潘林教授在本工作中参与了病理切片相关实验指导和细胞类型鉴定。北京协和医院郑永昌教授提供了临床样本。清华大学北京市中医药交叉研究所李梢教授为项目研究提出积极建议。项目由国家重点研发计划，国家自然科学基金以及北京信息国家研究中心基金等项目提供经费支持。　　论文链接：https://www.nature.com/articles/s41592-021-01276-3
    时间： 2021-10-08
    作者： ONE
  • Nature Methods | 张奇伟/张新荣团队合作开发出单细胞空间代谢组分析新方法
    2021年10月4日，清华大学北京信息国家研究中心/医学院张奇伟教授（美国德州大学达拉斯分校客座教授）与清华大学化学系张新荣教授团队合作在Nature Methods杂志上在线发表论文：SEAM is a spatial single nuclear metabolomics method for dissecting tissue microenvironment ，提出一种在单细胞分辨率下进行空间代谢异质性分析的新方法。SEAM方法采用高空间分辨质谱成像结合大数据算法，实现了组织原位代谢异质性可视化、单细胞核图像识别、代谢特征信息提取以及单细胞的聚类、差异化分析，从而能够让研究者系统的解析组织中单细胞的“代谢指纹图谱（metabolic fingerprint）”。由于器官或组织中的单个细胞的代谢物图谱存在明显的空间分布的异质性，因此，定位单个细胞在组织网络中的位置、区分相关代谢物的指纹图谱差异、确定重要代谢物的分子组成有重要意义。为了验证新方法，作者解析了野生型小鼠肝脏组织中的空间代谢异质性，发现了肝细胞代谢异质性亚群。这一发现和前人通过蛋白或者基因表达所验证的肝组织分区现象（Liver zonation）有着高度一致，有效证明了SEAM方法的可靠性和准确性。作者还对人肝纤维化中的代谢异质性进行了空间代谢组和空间转录组联合分析。发现在肝纤维化样本中存在有两种代谢差异的肝细胞亚群，它们和纤维化区域的距离在不同样本间存在有统计学差异。通过代谢组和转录组的共同分析，发现其中的存在有谷丙酰胺的上调以及其对应代谢相关的跨膜转运蛋白的基因表达上调。虽然单细胞转录组的研究已经取得长足进展，与转录组及其表型研究密切相关的代谢组研究在单细胞水平目前还缺少方法。本文提出的“SEAM”方法，系统解析了组织空间中的单细胞代谢组，对于整个单细胞技术领域的进步具有重要的推进作用。该论文的共同通讯作者是清华大学张奇伟教授、清华大学张新荣教授、原清华大学陈阳副研究员（现中国医学科学院基础医学研究所研究员）。共同第一作者为清华大学自动化系、北京信息国家研究中心博士生原致远、清华大学生命科学学院、生命科学联合中心博士生周启明、清华大学化学系博士生蔡乐斯。中日友好医院潘琳教授在本工作中参与了病理切片相关实验指导和细胞类型鉴定。北京协和医院郑永昌教授提供了临床样本。清华大学北京市中医药交叉研究所李梢教授为项目研究提出积极建议。
    时间： 2021-10-07
    作者： dahua1981
  • 一次性单细胞蛋白质组和代谢组同步分析策略
    细胞异质性作为细胞系统中一种普遍存在的现象，受到生物研究领域的日益关注。在传统的群体分析中，单个细胞的独特差异往往被整体的平均值所掩盖，而这些被忽略的细节恰恰构成了细胞分化过程中的关键线索。随着微阵列芯片、核酸测序、质谱等技术的进步，对单一细胞进行基因组、转录组、代谢组和蛋白组分析已不再遥不可及。特别是核酸扩增技术的进步极大地推动了基因组、转录组在单细胞层面的测序技术的应用。尽管取得了这些进步，但在单细胞层面对蛋白质和代谢物的分析仍然面临重大挑战，这主要是由于它们的量有限且缺少有效的扩增手段。本文提出了一种新的策略，通过一次性单细胞蛋白质组和代谢组分析（scPMA），可以在单次LC-MS/MS分析中同时获取单个细胞的蛋白质和代谢物信息。通过这种策略，研究人员能够整合单个细胞的多组学数据，以深入理解细胞内部相互作用的网络和调控细胞状态的复杂机制。scPMA策略共包括以下三个部分（图1）：单细胞捕获及分离、纳升级样品预处理、一次性LC注入和质谱检测。前两个环节都是基于课题组前期自制的机械装置操作完成的，最后一部分才是scPMA策略的亮点。在常规分析流程中，由于蛋白质组和代谢组在物理化学特性上的根本差异，它们通常需要匹配不同的质谱检测技术。因此，在传统的样本预处理阶段，蛋白质和代谢物会被分离，随后各自经历特定的处理流程，并最终分别进行LC-MS/MS检测。然而，这些额外的分离和处理步骤不仅增加了分析的复杂性，而且往往不可避免地会导致样本的损失，特别是在处理单细胞水平的微量样本时，这种损失尤为显著，可能对研究结果的准确性和可靠性造成影响。基于此，作者希望能够开发一种易于使用的方法来实现同一单细胞个体的蛋白质组和代谢组同步分析。图1 一次性单细胞蛋白质组和代谢组同步分析示意图实际上，代谢物和蛋白酶切后的肽段在C18反相色谱柱上的保留时间是存在差异的。如图2所示，在作者设置的45 min梯度下，大部分A549细胞酶切的肽段在9至17 min的范围内就已流出（图2a），而此时流动相中乙腈的最高含量仅为40%。而A549细胞产生的代谢物则主要分布在17 min之后，只有极少部分是在17 min以前流出（＜10）（图2b）。导致这些现象的根本原因是肽段与代谢物之间疏水性的差异，因此，该策略更适合蛋白组与有一定疏水性的代谢物分析。得益于C18的有效分离，可以在色谱梯度的不同时间段针对不同的样本成分（肽段/代谢物）设置不同的质谱检测参数（图2c）。有效的色谱分离加与之匹配的双区域质谱检测便可实现一次性单细胞蛋白质组和代谢组双重分析。与之前的单组学的结果相比，scPMA策略在定量深度上并无明显差异（图2d-f）。图2 单蛋白质组和代谢组分析与scPMA的性能比较 通过scPMA策略，研究者们能够对单个肿瘤细胞（包括A549、HeLa和HepG2细胞）进行双重组学分析，平均定量了816、578和293个蛋白质以及72、91和148个代谢物。并利用UMAP聚类和随机森林机器学习模型，基于单细胞的蛋白质组、代谢组和双重组学信息，实现了对细胞类型的初步分类（图3、4）。根据结果可得知，细胞在代谢组中的异质性要大于蛋白组。图3 scPMA策略分析单个肿瘤细胞（包括A549、HeLa和HepG2细胞）图4 基于单细胞的蛋白质组、代谢组和双重组学信息对细胞进行分类随后，作者还利用scPMA方法在单细胞水平上研究了多柔比星对肿瘤细胞的诱导作用（图5）。对比药物处理组的各个单细胞样本发现给药后不同的单细胞在蛋白质表达上存在着异质性，这也是在群体分析中无法观察到的现象。与未给药的细胞相比，给药组共鉴定出255个差异蛋白(图5b、c)，一些肺癌细胞中过表达的蛋白显著降低。大部分的差异蛋白涉及的通路与DNA、染色质、核小体的合成有关（图5g）。同样，给药组和未给药组中鉴定出的代谢物也被用于UMAP聚类(图5d)和差异分析。差异分析结果(图5e、f)显示，93种代谢物有差异表达。其中，多柔比星仅在给药组检测到。值得注意的是，在给药组的各个细胞中，多柔比星丰度有明显的离散分布，甚至有10倍的丰度差异。这一结果表明不同的细胞个体具有不同的药物吸收水平，从而表现出明显的细胞异质性，这可能为进一步深入探索提供启发。基于差异蛋白质组和代谢组信息，利用MetaboAnalyst 5.0进行联合通路分析，分别富集出62条和234条相关通路。其中有37条显著相关的通路涉及的差异蛋白和代谢物与核糖体、DNA复制等药物作用机制有关（图5i）。图7.氘代差异分析流程示意图这些结果展示了scPMA策略在单细胞分析中的潜力，尤其是在药物干预研究中的应用前景。同时，这项工作也证明了一次性获取单细胞蛋白质组和代谢组信息的可行性，为未来在细胞分化、衰老和肿瘤免疫等领域的研究提供了新的工具。本文2024年发表在Analytical Chemistry上，One-Shot Single-Cell Proteome and Metabolome Analysis Strategy for the Same Single Cell。该文章的通讯作者是来自浙江大学化学系微分析系统研究所的方群教授。
    时间： 2024-07-12
    作者： lirui
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质谱细胞代谢组分析相关的方案

  • 一种细胞培养基、培养液组分分析方案
    随着我国生物医药企业的高速发展，培养基作为生物制药的重要原料也逐步被一些生物医药、生物制品企业所关注。培养基虽不是细胞培养中唯一重要因素， 但确实是最重要的一种，其作为抗体、重组蛋白类药物研发和生产中原材料之 一，直接影响产物的质和量，对细胞培养基中个组分的含量以及细胞培养过程中培养液组分含量的变化进行监测，对细胞高效培养过程的建立具有重要意义。为了快速全面分析细胞培养基、细胞培养液、胞内中的成分，开发了一种“细胞 培养基、培养液组分分析方法包”，该方法包中包含上百种化合物，分两个液相方法分析测定。方法1主要分析氨基酸类、维生素类、核苷嘧啶嘌呤类、有机酸 类，单磷酸核苷酸类、多胺类以及糖化合物，方法2主要分析核苷酸类化合物。 由于化合物种类繁多，化合物性质差异较大，传统的检测方法过于复杂，需要使用不同的仪器、不同的样品前处理方法进行测定，已不能满足工业化高通量、标准化要求。而采用超高效液相质谱联用系统，为细胞培养基、培养液以及胞内组分分析提供一个快速、专属性强的检测手段。
  • 干细胞研究Agilent Seahorse XF 活细胞代谢分析解决方案
    鉴定多能状态和分化状态的转换细胞代谢表型分析能测量细胞准备在未分化与分化状态之间转换时的能量需求和代谢通路偏好。在细胞从静止状态转变为多能状态和/或从多能状态转变为分化状态时，代谢转换迅速发生。
  • 干细胞研究-安捷伦Seahorse XF活细胞代谢分析解决方案
    除了供体差异外，细胞的年龄及来源、实验方法的差异、生长速率以及培养基的选择，都会导致细胞的重编程和/或分化效率不一致。在细胞命运发生变化前后，了解细胞能量的利用，鉴定代谢表型的变化，使研究人员能够预测和确认细胞功能，揭示细胞重编程的可操作性和分化潜力。细胞代谢表型分析检测的是细胞准备在未分化与分化状态之间转换时的能量需求和路径偏好。随着细胞从静止到多能性的转换、和/或从多能性到分化的转换，代谢转换迅速发生。
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质谱细胞代谢组分析相关的论坛

  • 分享一篇2013年Science上单细胞代谢的研究

    该文该文汇总了单细胞代谢的研究方法，包括质谱 (MS)，质谱成像（ MS imaging）， 毛细管电泳（CE）（其中主要是chip ce）， 光谱学（optical spectroscopy），和荧光生物传感器等多种技术手段分析了几百个单细胞，对单细胞进行大分子层面上的表征，以此阐述细胞代谢的表型异质性（phenotypic heteroge-neity）。大概就这个意思吧，大牛的东西，读起来反正就是半懂不懂。

  • 生物质谱技术在细胞生物学中的应用

    生物质谱技术在细胞生物学中的应用桑志红 王红霞 综述　概 论 蛋白分离与显色 蛋白质鉴定 数据库查寻 灵敏度 具体示例 展望未来（相关文献）摘 要 基因组计划的飞速发展使我们提早进入"后基因组时代"，而质谱技术的重要进展使得通过酶解、质量分析、序列分析及其数据库检索对蛋白质进行高通量快速鉴定的技术方法应运而生，并成为"后基因组时代"的关键核心技术。这种技术的应用范围已经从细胞,组织以及整个有机体中蛋白质的表达到蛋白质翻译后修饰等等方面。本文简要综述生物质谱技术在细胞生物学等学科中的应用。　 过去的十年经历并见证了生命科学革命性的变化. 大规模基因组测序技术的问世使人类基因组计划最终目标的实现比预期一再提前。与此同时，近几年间已有10余种模式生物的基因组序列测定告罄，3年内还将有40种左右生物的基因组全序列问世。因此大多数人同意我们现在已经提早进入"后基因组时代"（post-genome era）, 目前我们所面临的挑战是如何破解基因组计划已获得的大量序列信息并加以应用。这个问题的关键是基因的生物学功能不能只通过对核酸一级结构(序列)的检测来确定。研判一个未知基因的功能、与其他基因产物及其亚细胞结构之间的功能联系, 最终都必须通过在蛋白水平对基因产物的研究才能确定。蛋白质组这个名词是近几年才提出来的，它用来描述一个细胞的全部蛋白质,而在蛋白水平上进行大规模的研究引出了新的术语蛋白质组学。蛋白质表达图谱是依靠蛋白质显示技术和精确定量技术对细胞或组织中蛋白质表达总况进行比较（2）, 这个领域最近已有综述（11）。细胞图谱蛋白质组学是指应用生物质谱技术鉴定蛋白质及其相互作用并确定在亚细胞中的定位。本文的目的是 简要综述生物质谱技术在细胞生物学领域中越来越多的应用，并为该领域正考虑应用这种技术的研究者提供一些的有用的信息。 作为一个新的研究领域，蛋白质组学发展的关键是近年来质谱技术的革新。这种革新极大地促进了质谱技术在生命科学研究中的应用。质谱现在可以作为将各种蛋白质与序列数据库联系起来的桥梁。生物质谱根据质量数和所载电荷数不同的多肽片断在磁场中产生不同轨道而以质荷比（m/z）方式来分离它们。80年代末，随着两种崭新的尤其适合蛋白质研究的软电离方式ESI（电喷雾电离）和MALDI（基质辅助激光解吸附电离）的出现，质谱成为现代蛋白质科学中最重要和不可缺少的组成部分。 生物质谱最强大的应用功能之一是能够鉴定蛋白质复合物的组成成分（19）。细胞中一些最重要的生命过程都是通过多蛋白质复合体来执行和调节的，但由于蛋白质鉴定的困难，大多数上述蛋白复合体都是未知的。生物质谱灵敏度的不断提高显著地促进了对具有生物学功能和治疗潜力的蛋白复合体的鉴定，例如，NF-k B信号通路，CD95（FAS/APO-1）介导的细胞死亡途径，和核受体介导的转录信号传导过程中形成的蛋白复合体。在某些情况下，复合物可通过常规蛋白纯化的方法进行纯化，如剪接体复合（25），酵母纺锤体复合物（29）及VHL肿瘤抑制复合物（18）。然而，更常见的是，复合物中的组成成分通过一步免疫沉淀或免疫亲和步骤后就可纯化，这种方法甚至可以用于鉴定那些用常规蛋白纯化和鉴定技术所不及的一些过渡态或不稳定的复合物。因为生物质谱技术的介入，现在已经不再需要通过抗体进行免疫印迹实验，而是通过生物质谱技术对免疫沉淀获得的蛋白复合体组分直接进行蛋白序列分析。以酵母P24复合物鉴定为例，应用上游表位标签策略有可能不需制备抗目标蛋白的抗体就能对蛋白质复合物进行鉴定（13）。这种方法（36）对于基因组序列已完全清楚和遗传稳定的生物（如芽殖酵母,啤酒酵母）尤为简便, 例如对RENT复合物和促有丝分裂后期复合物（49）。因为这种方法的成功应用，使人们对上游表位标签策略－蛋白纯化－生物质谱分析的方法兴趣倍增。值得一提的是，将能被特殊蛋白酶切除的连接子（接头）掺入表位标签是尤为有利的（如下所述）。 上述方法是通过识别蛋白复合物中相互作用和配对的各组分而达到对蛋白鉴定的目的，另一种策略则是通过对分离纯化的细胞器蛋白组成进行鉴定而在亚细胞水平对蛋白质定位.　用这种方法确定蛋白质位置,　对评价蛋白质潜在的功能将是大有帮助的.　应用这种方法，我们称为细胞器蛋白质组学,　已经发现正常工作状态下的细胞器含有比我们以前所知道的数量多得多的蛋白种类。然而实际上，由于质谱极高的分辨率和灵敏度，纯化后的细胞器组分即使只有微量的混杂，也能被质谱分辨并误认为是细胞器的组成部分。因此，如何充分的纯化以保证至少绝大多数被鉴定的蛋白质都来自同一种细胞器，成为制约上述工作的瓶颈。 蛋白质翻译后修饰也是蛋白鉴定工作中的一个重要方面。根据DNA序列信息并不能可靠预测或推导出蛋白质翻译后的修饰。而质谱技术已经被证明对研究蛋白质翻译后的修饰（例如磷酸化和糖基化）是极为有用的，特别是对序列已知的蛋白的鉴定。例如:Betts等人（1a）用这种方法成功地鉴定了从小鼠大脑中分离的神经纤维蛋白体内磷酸化位点。同样方法, Wong等人（45）确定了钙联蛋白质（calnexin)C未端的磷酸化位点。在糖基化的例子中, Carr等人（5）采用液相色谱与质谱联用技术选择性地鉴定了糖蛋白中N- 和O-联接的寡糖. 稍后, 本文将会通过对E-选择素中糖基化位点的鉴定来进一步说明这种方法.

  • 【分享】细胞代谢呼吸动态分析仪同步侦测OCR、CDPR、ECAR

    北京华威中仪科技代理的由美国Seahorse Bioscience 公司最新研发的XF生物能量测定仪(细胞代谢呼吸动态分析仪)XF extracellular analyzer是世界首创使用24孔及96孔微孔盘为平台，采用无损伤专利固态探针侦测技术即时同步侦测有氧呼吸O2(OCR)以及糖酵解作H+(OCAR)、 CO2产率(CDPR)的动态分析仪，透过此系统的协助，研究者得以更快的速度、更简易的设计了解细胞以及线粒体如何运用不同的受质作为能量的来源、评估疾病与氧代谢及线粒体运作状态之交互作用、分析代谢调节药物对于生理的效应、建立细胞品管系统、快速筛选出具开发潜力之药物及药物毒性评估等多种不同应用。此系统现已被广泛应用于免疫学、药物筛选、肝脏及外源性毒理、糖尿病及肥胖症、老化、干细胞、细胞生理、药物转化等各个领域，哈佛大学等名校已借助该系统在nature、cell上发表文章几十篇，其他SCI高影响因子文章200多篇，现在就拥有Seahorse Bioscience 公司的细胞代谢呼吸动态分析仪，领先下一个细胞与线粒体研究的黄金十年。

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  • 安捷伦 AdvanceBioMSSpentMedia 氨基酸和细胞培养基分析
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    供应商： 安捷伦科技（中国）有限公司
    品牌： 安捷伦
    价格： 面议
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  • Biolife CS10细胞冻存液
    Biolife CS10细胞冻存液美国Biolife品牌CryoStor临床级即用型冻存液产品都预先配制了USP级DMSO，这是一种渗透性冷冻保护剂，有助于减轻冰的形成造成的损害。在广泛的细胞类型中，CryoStor配方已被证明比商业和家庭酿造的等渗和细胞外配方更有效地减少保存后的凋亡和坏死。CryoStor产品符合 USP 无菌和 USP 内毒素检测标准，并按cGMP生产。CryoStor CS10预先配制了10%的DMSO，在冷冻、储存和解冻过程中为需要10% DMSO的细胞和组织提供了安全、保护的环境。通过调节对低温保存过程的分子生物学反应，CryoStor提供了增强的细胞活力和功能，同时消除了血清、蛋白质或高水平的细胞毒性制剂的需求。产品特点:&bull 单独的Biolife品牌标签&bull 预配置（10%DMSO）&bull 无血清&bull 无蛋白&bull USP级别/高质量组分&bull cGMP 制造&bull FDA 药物主文件备案&bull 无菌、内毒素,以及细胞放行测试产品规格:产品参数：Jurkat T细胞微球悬浮在指定的低温培养基中，然后放置在2 ml 冻存管中，并在2-8℃下孵育15分钟。然后将cryovials转移到无LN2-程序降温仪以-1℃/分钟的速度冷冻保存。在达到-70℃后，将样品转移到LN2储存至少24小时。样品在指定条件下解冻，用CGM(1:10稀释)重悬，在37℃和5% CO2下转移到培养箱。在NucleoCounter NC-3000成像细胞仪(ChemoMetec，丹麦)上使用Via-1盒，根据膜完整性评估立即和解冻后24小时内的细胞存活率和计数。图1-Jurkat T细胞的活力是基于在解冻后24小时内使用膜完整性测定进行评估。图2-使用膜完整性试验评估了解冻后Jurkat T细胞的可见复苏率和扩增性能。结论：1-解冻后立即对细胞活率和数量进行分析并不能反映冷冻保存过程成功与否。未优化的冷冻培养基的不良影响可能要到解冻后的24-48小时才能检测到，这归因于低温保存诱导的延迟性细胞死亡(DOCD)。另一方面，优化的低温保存介质的加入可以防止DOCD的发生 因此，减少了变异性，更准确地估计了解冻后的生存和增殖。2-低温贮藏前的补料时间和培养基的变化对低温贮藏过程的结果有重要影响。这可能是由于一些参数，包括在冷冻前活力试验中没有出现的压力积累，但与DOCS结合，导致解冻后活力和功能的显著损失。3-冰成核的随机性本质上导致了细胞在低温保存过程中所承受的低温保存诱导应力的变化。因此适当的成核对模型T细胞的生存能力和增殖能力有显著影响。4-在37°C介质中稀释(类似于患者给药情景)是解冻后的最佳稀释实践。强烈建议，为了分析目的，细胞也应在温暖介质中稀释，以尽量减少在洗涤过程中渗透细胞的肿胀和溶解。使用方法：1. 将待冷冻保存的细胞重悬置于悬浮液中(机械或酶法解离)2. 对细胞进行离心3. 去除上清液-注意:尽可能多地去除培养基，以减少冷冻液的稀释。4. 添加冷(2°-8°C) 的cryostor冻存液。细胞浓度按照常规细胞培养方案0.5-10*106细胞/mL(可能更高)。DMSO是预先混合在cryostor冻存液中且冻存液中不含添加剂。5-预冷冻:细胞悬液在2°-8°C下孵育约10分钟。6-冷冻成核:在-80°C冷冻样品(许多protocol推荐交替使用-70°C和-80°C环境来处理样本)。对大多数哺乳动物细胞系统推荐使用程序降温仪来控制速率冷冻(-1°C/min)，如果使用冷冻装置或异丙醇容器则应提前容器预冷至2°-8°c，使用异丙醇容器的冷冻时间(-80°C)建议约为4小时，或不超过一夜。样品内的冰成核应在大约-5°C下开始，使用可控速率冷冻机上的液氮爆裂程序设置，或在大约15-20分钟后对冷冻液/样品容器进行机械搅拌(轻弹或轻敲)。7.储存:将样品放入储存室，在液氮温度下(低于-130°C)储存样品。样品储存在-80°C仅建议短期储存(数周至数月)。8.解冻:在37°C水浴或同类似的机械解冻装置中快速解冻样品，样品融化时应轻轻地旋转样品，直到所有可见的冰都融化。在冰冻箱中，1ml样品的大约解冻时间为2-3分钟。不允许样品在冷冻温度(0-10°C)以上加热。冷冻瓶从浴液中取出时，摸起来应该是凉的。不建议被动解冻。9.立即用培养基或等效等渗介质稀释细胞/冷冻液混合物。稀释程序可以在一个步骤中完成。稀释介质应在20°C至37°C之间。建议稀释比为1:10(样品与介质)或更大。10. 应用合适的配置下种细胞。11.将细胞放入培养条件或立即使用。12.解冻后进行24小时生存能力评估。注:为了获得低温保存后细胞活力的准确测量，应在解冻后24小时进行评估，并与非冷冻对照样本进行比较。*样品解冻后立即使用膜完整性指标(如台盼蓝)进行评估，以比较分析样品细胞产量和存活率，这往往导致对细胞存活率的测量不准确。建议采用活/死荧光分析或代谢分析(MTT或alamarBlue*)更准确地评估可行回收率。CryoStor产品在环境温度下运输。收到后，保存在2°-8°C，避光，直到准备使用Biolife CS5 细胞冻存液美国Biolife品牌CryoStor临床级即用型冻存液产品都预先配制了USP级DMSO，这是一种渗透性冷冻保护剂，有助于减轻冰的形成造成的损害。在广泛的细胞类型中，CryoStor配方已被证明比商业和家庭酿造的等渗和细胞外配方更有效地减少保存后的凋亡和坏死。CryoStor产品符合 USP 无菌和 USP 内毒素检测标准，并按cGMP生产。CryoStor CS5预先配制了10%的DMSO，在冷冻、储存和解冻过程中为需要10% DMSO的细胞和组织提供了安全、保护的环境。通过调节对低温保存过程的分子生物学反应，CryoStor提供了增强的细胞活力和功能，同时消除了血清、蛋白质或高水平的细胞毒性制剂的需求。产品特点:&bull 单独的Biolife品牌标签&bull 预配置（5%DMSO）&bull 无血清&bull 无蛋白&bull USP级别/高质量组分&bull cGMP 制造&bull FDA 药物主文件备案&bull 无菌、内毒素,以及细胞放行测试产品规格:产品数据：Jurkat T细胞微球悬浮在指定的低温培养基中，然后放置在2 ml 冻存管中，并在2-8℃下孵育15分钟。然后将cryovials转移到无LN2-程序降温仪以-1℃/分钟的速度冷冻保存。在达到-70℃后，将样品转移到LN2储存至少24小时。样品在指定条件下解冻，用CGM(1:10稀释)重悬，在37℃和5% CO2下转移到培养箱。在NucleoCounter NC-3000成像细胞仪(ChemoMetec，丹麦)上使用Via-1盒，根据膜完整性评估立即和解冻后24小时内的细胞存活率和计数。图1-Jurkat T细胞的活力是基于在解冻后24小时内使用膜完整性测定进行评估。图2-使用膜完整性试验评估了解冻后Jurkat T细胞的可见复苏率和扩增性能。1-解冻后立即对细胞活率和数量进行分析并不能反映冷冻保存过程成功与否。未优化的冷冻培养基的不良影响可能要到解冻后的24-48小时才能检测到，这归因于低温保存诱导的延迟性细胞死亡(DOCD)。另一方面，优化的低温保存介质的加入可以防止DOCD的发生 因此，减少了变异性，更准确地估计了解冻后的生存和增殖。2-低温贮藏前的补料时间和培养基的变化对低温贮藏过程的结果有重要影响。这可能是由于一些参数，包括在冷冻前活力试验中没有出现的压力积累，但与DOCS结合，导致解冻后活力和功能的显著损失。3-冰成核的随机性本质上导致了细胞在低温保存过程中所承受的低温保存诱导应力的变化。因此适当的成核对模型T细胞的生存能力和增殖能力有显著影响。4-在37°C介质中稀释(类似于患者给药情景)是解冻后的最佳稀释实践。强烈建议，为了分析目的，细胞也应在温暖介质中稀释，以尽量减少在洗涤过程中渗透细胞的肿胀和溶解。1. 将待冷冻保存的细胞重悬置于悬浮液中(机械或酶法解离)2. 对细胞进行离心3. 去除上清液-注意:尽可能多地去除培养基，以减少冷冻液的稀释。4. 添加冷(2°-8°C) 的cryostor冻存液。细胞浓度按照常规细胞培养方案0.5-10*106细胞/mL(可能更高)。DMSO是预先混合在cryostor冻存液中且冻存液中不含添加剂。5-预冷冻:细胞悬液在2°-8°C下孵育约10分钟。6-冷冻成核:在-80°C冷冻样品(许多protocol推荐交替使用-70°C和-80°C环境来处理样本)。对大多数哺乳动物细胞系统推荐使用程序降温仪来控制速率冷冻(-1°C/min)，如果使用冷冻装置或异丙醇容器则应提前容器预冷至2°-8°c，使用异丙醇容器的冷冻时间(-80°C)建议约为4小时，或不超过一夜。样品内的冰成核应在大约-5°C下开始，使用可控速率冷冻机上的液氮爆裂程序设置，或在大约15-20分钟后对冷冻液/样品容器进行机械搅拌(轻弹或轻敲)。7.储存:将样品放入储存室，在液氮温度下(低于-130°C)储存样品。样品储存在-80°C仅建议短期储存(数周至数月)。8.解冻:在37°C水浴或同类似的机械解冻装置中快速解冻样品，样品融化时应轻轻地旋转样品，直到所有可见的冰都融化。在冰冻箱中，1ml样品的大约解冻时间为2-3分钟。不允许样品在冷冻温度(0-10°C)以上加热。冷冻瓶从浴液中取出时，摸起来应该是凉的。不建议被动解冻。9.立即用培养基或等效等渗介质稀释细胞/冷冻液混合物。稀释程序可以在一个步骤中完成。稀释介质应在20°C至37°C之间。建议稀释比为1:10(样品与介质)或更大。10. 应用合适的配置下种细胞。11.将细胞放入培养条件或立即使用。12.解冻后进行24小时生存能力评估。注:为了获得低温保存后细胞活力的准确测量，应在解冻后24小时进行评估，并与非冷冻对照样本进行比较。*样品解冻后立即使用膜完整性指标(如台盼蓝)进行评估，以比较分析样品细胞产量和存活率，这往往导致对细胞存活率的测量不准确。建议采用活/死荧光分析或代谢分析(MTT或alamarBlue*)更准确地评估可行回收率。CryoStor产品在环境温度下运输。收到后，保存在2°-8°C，避光，直到准备使用Biolife CS2 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    供应商： 普迈精医科技（北京）有限公司
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