曲吡那敏

p style=" text-indent: 2em " 本月5日，Illumina宣布它计划以12亿美元的现金收购Pacific Biosciences。消息宣布后，这两家公司的CEO–Illumina的Francis deSouza和PacBio的Mike Hunkapiller–在电话会议上介绍了一些细节并回答了一些问题。 /p p style=" text-align: center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/325ed835-958f-47a6-b273-1be9304babfa.jpg" title=" ceo.jpg" alt=" ceo.jpg" / /p p style=" text-align: center " Illumina公司的CEO Francis deSouza /p p 　　deSouza在他的开场白中说：“从以往来说，长读长技术面临的挑战是准确性和成本。然而，PacBio最近的技术突破已经证明了长读长有着无以伦比的准确性，再加上即将发布的8M Smart Cell，这将大大提高该技术的实用性和经济性。” /p p 　　在回答“为什么是现在”的问题时，deSouza强调Illumina一直在关注长读长市场，而PacBio最近的试剂和软件更新提供了时机。“坦率地说，PacBio在过去几个月有了激动人心的创新，他们能够大大提高其产品的准确性，以及测序仪的总产量，”deSouza说。他表示，Illumina迅速采取行动，而这个过程并不存在竞争。 /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 组合优势 /strong /span /p p 　　两位高管都盛赞了对方的团队和文化。“作为此次收购的一部分，我们感到特别兴奋的一件事情就是拥有一支很有才华的技术团队。这支技术团队拥有大量的单分子专业知识，包括纳米孔知识，”deSouza谈道。 /p p style=" text-align: center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/e71645bc-cd4b-4474-9f5a-3f973239e954.jpg" title=" ceo2.jpg" alt=" ceo2.jpg" / /p p style=" text-align: center " PacBio公司的CEO Mike Hunkapiller /p p 　　Hunkapiller则认为两家公司能够轻松整合。“我们有着相似的文化，这将使我们能够快速整合，并继续实现我们的技术路线图，从而大大拓宽我们互补长读长平台的机会，”他说。 /p p 　　关键词是 strong 互补 /strong 。 /p p 　　这项交易预计在2019年年中完成，具体时间取决于全球监管部门的审批。Illumina在今年早些时候收购了Edico Genome，如今是测序市场上最大的参与者 而PacBio则是第二大的参与者，但两位高管都反复强调，两家公司拥有互补技术，并非竞争。 /p p 　　deSouza表示：“我们是最大的参与者，我们服务于短读长测序市场。这个细分市场与长读长参与者所服务的细分市场是互补的。坦率地说，我们并没有真正参与长读长测序市场。以de novo测序为例，那真的非常适合长读长的参与者。”他再次强调：“PacBio不会参与短读长市场的竞争 我们也不会参与长读长市场的竞争。” /p p 　　Illumina认为，短读长和长读长技术都是市场所需要的。“我们相信有一些临床应用，需要用到长读长技术。例如，有些疾病是由结构变异引起的，这只能通过长读长技术来诊断，”deSouza说。他还提到了组织分型和药物基因组学。 /p p 　　“我们认为，利用SBS短读长技术和PacBio长读长技术完成全基因组测序的成本差距将继续存在，”deSouza谈道。“从市场的角度来看，我认为这样很好。考虑到利用长读长技术所获得的东西，市场可以接受。” /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 首要任务 /strong /span /p p 　　在被问及整合平台时，也就是在同一台仪器上对短读长和长读长进行测序，deSouza将话题转到了数据。他认为数据整合是首先要做的事。 /p p 　　“我们感到兴奋的事情之一是有望整合两种仪器的数据，为客户带来独特的基因组视图。如今，客户必须手动将它们拼接在一起，以获得他们想要的见解。我认为，如果他们能够自动获得，那无疑将有很大帮助。通过这种组合，我们将能够做到这一点，”deSouza说。 /p p 　　Hunkapiller也表示同意。他说：“对于那些未必有丰富信息学知识的人来说，这真的很有吸引力，因为它让数据集的整合变得更容易。这无疑是将我们组合在一起的关键因素。” /p

胃癌是我国最常见的消化系统恶性肿瘤之一，患病率高，进展较快，严重影响人民健康。目前，由于胃癌的肿瘤异质性和化疗药物的耐药等问题，进展期胃癌综合治疗效果欠佳，因而开发新型胃癌治疗药物意义重大。曲妥珠单抗（trastuzumab）通过与HER2受体的细胞外区域结合， 抑制HER2同源二聚，从而阻止HER2 介导的信号转导，并且促进抗体依赖的细胞毒性作用，导致表达HER2 的细胞死亡，在胃癌中显示出生存获益。但是，许多接受曲妥珠单抗治疗的HER2阳性胃癌患者由于细胞敏感性不足和耐药性导致患者的用药反应差，对于临床治疗仍然具有巨大的挑战。2021兰州大学第二医院萃英生物医学研究中心焦作义团队在Nature Communications发表题为“Hyperactivation of HER2-SHCBP1-PLK1 axis promotes tumor cell mitosis and impairs trastuzumab sensitivity to gastric cancer”的研究论文，报道了HER2下游存在的一条新的信号通路HER2/Shc1/SHCBP1/PLK1，该信号通路的异常激活与曲妥珠单抗耐药密切相关。并据此筛选发现了新型的SHCBP1-PLK1复合体的抑制剂茶黄素-3, 3’-双没食子酸（TFBG），可显著增敏曲妥珠单抗治疗胃癌的疗效。如图1所示，HER2和其他表皮生长因子受体（ERBBs）始终使用Shc1（一种细胞内支架蛋白）募集细胞质靶标激活下游途径，包括促分裂原活化蛋白激酶（MAPK）和磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）途径，并通过增加细胞增殖，转移和侵袭来促进肿瘤发生。SHCBP1是一种Shc1结合蛋白，在HER2激活后与支架蛋白Shc1脱离。释放的SHCBP1在Ser273磷酸化后进入细胞核，从而对HER2级联反应，然后通过与PLK1结合促进有丝分裂相互作用因子MISP的磷酸化来调控细胞有丝分裂。同时，Shc1被募集到HER2进行MAPK或PI3K途径激活。HER2-SHCBP1-PLK1这一关键的信号通路驱动曲妥珠单抗敏感并在治疗上具有针对性。图1 胃癌治疗靶点HER2下游新的信号通路HER2/Shc1/SHCBP1/PLK1据此研究人员采用虚拟筛选和SPR的方法，寻找抑制SHCBP1–PLK1结合的天然产物。在用Biacore进行小分子筛选时，将PLK1偶联到CM5芯片上，40个小分子化合物以100uM的浓度进样，经过分子量校正后通过与阳参的对比可以得到候选的小分子抑制剂（图2）。图2 Biacore对40个小分子化合物进行亲和力筛选最终研究人员选择了亲和力最强的小分子TFBG，与PLK1的亲和力为4.67 ×10-7M（图3）。TFBG对SHCBP1–PLK1互作的抑制也通过后续的Co-IP和细胞FERT实验得到了验证。在动物实验中，TFBG治疗与曲妥珠单抗联合显示出显著的生长抑制和肿瘤消退，表明在HER2阳性胃癌治疗中的潜在临床应用。图3 Biacore检测TFBG与PLK1的亲和力回顾整篇文章，研究人员采用LC-MS/MS、免疫组化、FERT、原位杂交等多种方法明确了HER2下游新的信号通路HER2/Shc1/SHCBP1/PLK1，然后以抑制SHCBP1–PLK1互作为目标，找到了小分子抑制剂TFBG，最后在细胞实验和动物实验中，TFBG联合曲妥珠单抗的方案都显示了显著的抗肿瘤效果，为胃癌临床靶向治疗提供了新思路，也对天然药物研发产生了有力推动作用。图4 文章整体思路高灵敏度的Biacore在小分子抑制剂的筛选和表征中可以输出可靠的数据，无人值守的操作能够满足高通量筛选的需求，兼具了数据质量和筛选效率。智能的筛选分析模块可以自动对样品进行分子量校正，方便直接用响应值的高低进行比较，并且可以根据需求自动进行排序或者划分阈值线，直观地呈现筛选结果，极大地提高实验效率，保证在药物开发过程中的高效性。Biacore，for a better life参考文献：Shi, Wengui et al. “Hyperactivation of HER2-SHCBP1-PLK1 axis promotes tumor cell mitosis and impairs trastuzumab sensitivity to gastric cancer.” Nature communications vol. 12,1 2812. 14 May. 2021, doi:10.1038/s41467-021-23053-8关注德泉兴业，了解更多实验室仪器实验信息！

美国伊利诺伊大学芝加哥分校的科学家日前开发出一种能够分辨出单个气体分子的超高灵敏度&ldquo 电子鼻&rdquo 。这种新型气体传感器对气体分子的吸收能力比传统化学传感器强300倍。 　　让人不可思议的是，用来制造这种高灵敏度&ldquo 电子鼻&rdquo 的材料竟是此前被认为残次品的、存在缺陷的石墨烯。相关论文发表在《自然· 通信》杂志网站上。 　 　在制造石墨烯的过程中，石墨烯逐渐形成晶格或片状时，会随机出现一些单晶颗粒。这种多晶结构与单晶之间的边界被称为晶界。由于晶界会造成电子的散射，削 弱石墨烯晶格的性能，具有晶界的石墨烯通常都被认为是毫无价值的次品。但美国伊利诺伊大学芝加哥分校机械和工业工程教授阿明· 萨利希-空锦带领的研究小组 却发现，这些缺陷正好适合用来制造高灵敏度气体传感器。 　　物理学家组织网9月23日（北京时间）报道称，为了验证这一想法，测试石墨烯缺 陷的电气性能，研究人员用单个石墨烯晶界制造了一个微米尺寸的气体传感器。他们在测试中发现，石墨烯晶界能够将气体分子吸附到其表面并让它们聚集起来，石墨烯晶体上却没有这样的现象。这使具有这种缺陷的石墨烯成为观测气体分子的理想场所。 　　由切赫· 克拉尔带领伊利诺伊大学芝加哥分校的一个 理论化学小组，对该晶界所具备的这种独特吸引力和电子特性进行了解释：晶界的不规则特性使其具备了数百个不同灵敏度的电子传输间隙。这就像是许多平行的并 联开关，当气体分子在晶界上发生聚集，电荷发生转移时，这些开关会突然打开或者关闭。这一切都发生在一个非常短暂的时间当中。而这便是用其制成的气体传感 器能够具备超高灵敏度的原因所在。 　　萨利希-空锦说：&ldquo 数十年来科学家们一直试图制造出一种强大的、具有超高灵敏度的传感器。我们的研究 将其变成了现实，可以在微米级的尺寸上将这些晶界集成起来进行统一控制。使用这种技术能很容易制造出芯片级的传感器阵列。借助晶界对气体分子超强的吸附能 力和快速反应能力，用石墨烯晶界阵列制成的电子鼻甚至能够检测出单个气体分子。这种材料集精确和可靠于一身，是制造气体传感器的理想材料。&rdquo