环境变化会影响肠道微生物群落的稳定性！

             环境变化会影响肠道微生物群落的稳定性！

中国微生物菌种查询网：你的指纹一辈子都不会变。但是，在儿童双胞胎的肠道中共享的微生物菌株的“指纹”又如何呢？

研究人员利用阿拉巴马大学伯明翰分校(University of Alabama at Birmingham)开发的基因组学压力跟踪生物信息学工具，调查了在一起生活了几十年的成年双胞胎开始分开生活后，这些共享的菌株是否保持稳定，对饮食或环境的变化有弹性。

发表在《公共科学图书馆综合》(PLOS ONE)杂志上的UAB研究分析了两对双胞胎的宏基因组测序数据库，一组是仍住在一起的儿童，另一组是年龄在36岁至80岁之间的成年双胞胎，他们分开居住的时间从1年到59年不等。

这项研究使用了先前由UAB开发的一种称为基于窗口的相似单核苷酸变异(WSS)的生物信息学应变跟踪工具。UAB遗传与基因组学核心系的Hyunmin Koo博士领导了信息学分析。

这项研究产生了大约6tb的数据，在Cheaha UABgrid超级计算机和UAB信息技术研究计算小组的帮助下进行了分析。

研究人员已经在之前的几项应变跟踪研究中使用了这种微生物指纹工具。2017年，他们发现，用于医疗难辨梭状芽胞杆菌复发感染的粪便供体微生物在粪便移植后在受体体内存留了数月或数年。

2018年，他们发现通过肥胖术导致上消化道的变化导致了新菌株的出现，2019年，他们分析了抗生素医疗后新菌株在个体中的稳定性。

目前的研究使用了来自8个双胞胎儿童个体和50个双胞胎成人个体粪便样本的宏基因组测序数据库。

UAB的研究人员发现，与分开居住一段时间后的成年双胞胎相比，仍然住在一起的儿童双胞胎有更多共享的菌株对。

在成年双胞胎中，那些分开生活不到10年的双胞胎与那些分开生活较长时间(从10年到60年)的双胞胎相比，有更多的相关菌株对。

具体来说，在一起生活了79年，然后分开1年的80岁双胞胎显示出最多的相关菌株对。

其次是56岁的双胞胎，他们一起生活了51年，然后分开了5年，73岁的双胞胎一起生活了66年，然后分开了7年，36岁的双胞胎分开了19年。

在3对分开生活了22 - 54年的双胞胎中发现了单共享菌株，但这些零星的共享菌株与分开生活的时间长短没有相关性。

美国医疗团队和生元获悉，虽然某些肠道微生物菌株在人体内可以保持稳定，但在某些情况下可以保持几十年，随着时间的推移，宿主环境条件的变化可能会影响肠道微生物群落的稳定性。这可能导致新菌株的出现，可能会影响对人类健康至关重要的微生物相互作用。