Fragment Analyzer™ 高通量SSR分析系统

1. Fragment Analyzer^TM系统应用背景及优势
传统琼脂糖凝胶电泳由于其简单、重复性好、操作简单和易清洗，一直以来受到广大实验室的普遍青睐，但事实上传统凝胶方法无法分析长度小于50bp的DNA片段。由美国AATI公司生产推出的新一代Fragment Analyzer^TM全自动毛细管电泳系统，可以用于分析任意种类的dsDNA片段，包括普通PCR产物，多重PCR产物以及限制性酶切产物，微卫星序列SSR等。Fragment Analyzer^TM系统分离片段具有以下优势：分辨率更高（分辨率高达2bp）；精确度更高（片段长度分析误差≤5%）；分析通量高，可一次分析高达288个样品；分析时间减少，PCR产物可直接上样，无需进行预处理。
2.Fragment Analyzer^TM系统SSR分析优势
● 全自动  分离胶和样品自动上样，无需手动灌胶，避免交叉污染
● 高通量  可一次检测12或96个样品，最多为288个样品
● 高分辨  分辨率为2bp
● 高灵敏  检测最低浓度可达5pg/ul
● 运行快  15min内完成700bp片段分离
● 成本低  无需芯片，毛细管可反复利用
● 易操作 PROSize2.0软件直观显示分析结果
● 用途广  可分析片段范围为35-40000bp
● 更灵活  可提供12和96两种型号的毛细管列阵
3. Fragment Analyzer^TM系统应用示例
应用示例1：SSR片段分离更快速，分辨率更高

SSR样品来自不同的植物科学研究所；A、C为Fragment Analyzer^TM系统下数字凝胶成像图，B、D为与之相对应的传统凝胶电泳成像图；Fragment Analyzer^TM系统提供明显提高的分辨率和关于样品条带分析的更多细节。
应用示例2: SSR片段分离，分辨率更高达2bp

Fragment Analyzer^TM系统下，父代1，父代2以及杂合体SSR样品分离；113bp，115bp，122bp三个不同的DNA片段被精确分来，显示Fragment Analyzer^TM系统高达2bp的分辨率；片段大小由PROSize2.0软件计算，误差在预期片段的1%之内。
应用示例3：SSR片段分离更快速，15min内完成700bp片段分离

快速分离父代1，父代2和杂合SSR样品。DNA片段大小为313bp和423bp(与10%误差相一致)。外部的峰代表200bp/700bp的Marker，较高的700bp Marker的迁移时间为13min。                

Fragment Analyzer^TM 12或96的技术参数

1.主要用途：

1.1   用于高通量动植物基因组核酸扩增产物微卫星片段大小分析，即SSR分析。

1.2   用于农业育种反向遗传学辐射或化学诱变突变体筛查，即Tilling分析。

1.3   用于常规DNA/RNA或扩增产物片段大小定性定量分析。

1.4   用于二代测序（NGS）过程中基因组DNA及文库的质控（定性定量）。

1.5   RNA定性定量分析。

1.6   质粒DNA分析、CAPS/RAPD/AFLP分析。

1.7   同时具备定性和定量的功能。

2.工作条件

2.1   环境温度: 15到25°C

2.2   电源：100-240 VAC, 50-60Hz

2.3   湿度：小于80%

3.技术指标  

3.1   *自动进样系统标准要求：标准SBS格式96孔板装载样品，96个样品同时进样，同时检测。

3.2   *进样系统配置要求：3x 96样品进样托盘，可实现无人值守下288个样本连续进样定性分析或384个样本连续进样定量分析。

3.3   *毛细管电泳分离技术，96通道毛细管长度1375px或者2000px。片段大小分辨率2bp(小于300bp片段)

3.4   全自动仪器，每次标本分析都更换新的分离胶。

3.5   分析前全自动灌胶。

3.6   全自动进样。

3.7   全自动进Marker和Ladder。

3.8   分析结束后全自动清洗毛细管。

3.9   分析结束后全自动将毛细管置入毛细管保存液中。

3.10    标准分析时间：15分钟内完成96个样本的分析检测（小于3kbp样本）

3.11    *检出限：5 pg/μL，即2ul上述单组分标本稀释12倍后进样，可测出信噪比大于10：1的信号。

3.12    动态范围：从最小至最高优于3个数量级。

3.13    样品要求：PCR产物、基因组DNA、RNA等。样品无需纯化除盐等后处理，直接进样分析。

3.14    *可检测DNA范围：35～100000bp。最大可测到10万碱基对，可对gDNA基因组DNA进行质控检测。

3.15    *突变检测灵敏度：可检测1000bp大小的DNA片段中1个碱基突变的存在以及8个混合样本中1个突变样本的存在。

3.16    适用的试剂盒：基因组DNA，NGS，RNA及常规片段大小分离试剂盒。

3.17    片段大小计算精度：优于5%,

3.18    光源：长寿命LED光源（标准寿命超过10年）激发波长470nm。

3.19    *检测器：高灵敏度CCD检测器，检测样本的发射波长范围：500～600nm。

3.20    具备电压进样和真空进样2种进样方式。

3.21    可同时放入2种不同类型的分离胶，2种不同类型的应用可不需要人工干预连续进行，如可连续进行DNA和RNA定性定量分析。