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新品速递|凯杰靶向测序方案,专为液体活检而生

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分享: 2023/06/26 09:57:54
导读: 液体活检技术的不断发展为癌症领域带来了重大突破,也为肿瘤的早期诊断、伴随诊断等带来了新的希望,近期凯杰推出了专为液体活检而生的靶向测序方案,使液体活检技术摆脱目前检测灵敏度及精确度的限制。

液体活检技术的不断发展为癌症领域带来了重大突破,这种非侵入性的检测方法凭借其样本可及性、可持续性、可消除异质性等特点,为肿瘤的早期诊断、伴随诊断等带来了新的希望,但其进一步广泛应用仍受制于目前检测灵敏度及精确度的限制。QIAGEN全新推出的QIAseq Targeted cfDNA Ultra靶向测序方案专为液体活检而生,在针对低至0.1%突变的检测上依然可实现99%的特异性


特殊的建库方案实现更低的检测限

基于杂交捕获的靶向方案由于步骤较为繁琐,实验过程中起始模板的损失较大降低了灵敏度,因此所需的样本量通常较高。传统多重PCR向方案因模板利用率高因此起始样本要求低,但是由于扩增产物的起始位置均相同,很难通过这些复制的分子进行等位基因突变频率的计算,也很难排除扩增的错误和偏差。QIAseq Panel基于特殊的单端特异性引物延伸(Single Primer Extension, SPE)技术,作为多重PCR的一种,与一般扩增子技术不同的是扩增产物起始位置并不完全相同,多样性的产物更有利于重复数据的消除,同时对杂交捕获与多重PCR两种技术进行了取长补短,而最低仅需5 ng起始cfDNA样本。


均一的覆盖度

由于cfDNA较短,传统多重PCR可能出现上下游引物无法同时结合在一个DNA模板上而无法扩增的情况,浪费了大量起始模板,而SPE技术仅需一条引物结合到靶向区域即可扩增,因此也能解决这一难题。同时我们也根据cfDNA片段较短的特点有针对性优化了引物设计,增加了引物密度,结合完善的扩增体系,在实现目标区域扩增特异性90%以上的同时也确保了整体扩增均性指标(Uniformity超过97%。特异分子条形码 (Unique Molecular Indices, UMI)的引入也可以有效解决PCR扩增所带来的偏倚,为检测的准确性、灵敏度及全面性提供了前所未有的保障。


HiFi Ultra高保真酶助力更高测序品质

NGS的理论检测极限受到扩增酶的影响,PCR扩增错误作为背景噪音会极大的影响低于0.3%突变检测的准确性。QIAGEN将原有扩增酶进一步升级为HiFi Ultra高保真酶同时搭配双端唯一标签(Unique Dual Index, UDI)接头,极大提高了低频突变的检测准确度和灵敏度,进一步提升了NGS分析结果。

QIAseq Targeted cfDNA Ultra目前已推出Breast Cancer、Colorectal Cancer、Lung Cancer等多款预制产品可供选择,后续也会推出定制服务。


[来源:凯杰生命科学]

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