PCR
近日,CFDA评审委员会批准天津诺禾致源生物信息科技有限公司(下文简称“诺禾致源”)配套的“人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒(半导体测序法)”分析软件上市,这也是国内首个基于肿瘤NGS数据分析软件的III类医疗器械注册证。
“人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒(半导体测序法)”于2018年8月13日获批上市,是基于多重PCR目标区域富集建库与半导体测序的技术体系开发,用于检测非小细胞肺癌患者肿瘤组织中与靶向治疗密切相关的六个基因的突变状态,全面提示患者治疗相关的敏感、潜在耐药及基因共突变信息,筛选适合接受靶向药物治疗的患者。
分析软件主要是配合该已获批的“人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒(半导体测序法)”在DA8600测序仪上使用,临床上用于对来源于人体的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本经半导体测序法测序产出的基因测序数据(包括DNA数据和RNA数据)进行读取和分析,给出非小细胞肺癌相关基因EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1的单核苷酸突变(SNV)、短序列插入或缺失(InDel)突变以及基因的融合(Fusion)信息,并出具检测报告。为临床对非小细胞肺癌选择肿瘤靶向药物治疗阶段提供参考。该分析软件适用于医院、第三方临床检测机构、科研院所和高校对需要进行FFPE样本中的DNA和RNA进行基因突变检测的人,样本分析流程图如下:
软件的特点和优势主要体现在三个方面:(1)分析流程自动化。DA8600产生的数据可自动导入分析软件,搜集DNA的SNV和InDel的检测结果,对RNA数据进行融合(Fusion)基因检测,整合结果生成报告,从而实现测序数据的分析自动化。(2)系统实时监控。对计算机的CPU、内存和SWAP以及磁盘使用量实时检测,避免使用量过大而影响数据分析。(3)效率高。在确保与测序仪的连接速度>10MB/s情况下时,完成一个run的测序数据(文件大小10GB )分析需要的时间<2小时。
性能验证结果显示,对EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA的检测灵敏度可达100%,特异性均在99.24%以上;对于ALK、ROS1融合基因的检测灵敏度可达100%,特异性均在99.74%以上。
诺禾致源的“人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒(半导体测序法)”分析软件的获批将提高检测数据分析的效率和准确度,简化报告出具过程,配合试剂盒使用,将使更多的NSCLC患者接受更全面、精准、快速的靶向治疗相关基因检测。同时,此次多基因检测试剂盒及配套的分析软件系统的获批,更是诺禾致源布局肿瘤NGS分子诊断领域的重要起点。此前,诺禾致源围绕该检测试剂盒进行了一系列的DNA提取备案等,结合此次多基因检测试剂盒和“癌症基因数据处理软件”的获批,诺禾致源实现了从核酸提取试剂盒、建库测序试剂盒、数据分析软件全流程的产品备案及注册,力图为医院提供一站式肿瘤NGS分子病理诊断整体解决方案。
[来源:转化医学网]
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