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应用代谢组学批量数据分析工作流程表征细菌中的差异代谢物

2016/07/14 14:00

阅读:321

分享:
应用领域:
生物产业
发布时间:
2016/07/14
检测样品:
其他
检测项目:
差异代谢物
浏览次数:
321
下载次数:
参考标准:
-

方案摘要:

本文应用发现代谢组学的精确质量Q-TOF LC/MS 工作流程,研究了处于早稳定期和晚稳定期的细菌。所采用的软件可批量处理数据,使得数据分析更高效且实现了自动化。应用Agilent MassHunter Profinder(批量特征提取软件)总共从正离子数据中获得了488 个特征,从负离子数据中获得了623 个特征。采用Mass Profiler Professional (MPP) 进行的统计学分析揭示了细菌在早稳定期和晚稳定期丰度具有显著差异的特征。在正离子数据中,有57 个特征在早稳定期中的丰度要高于晚稳定期。而在负离子数据中,有52 个特征在早稳定期中的丰度要明显高于晚稳定期。为了理解这些代谢组学数据的生物学和生物化学背景,我们通过数据库搜索、精确质量MS/MS 谱库匹配,以及MS/MS 分子结构关联对超过100 个差异特征进行了标注和鉴定。

产品配置单:

分析仪器

安捷伦6200系列精确质量数TOF LC/MS

型号: 6200

产地: 德国

品牌: 安捷伦

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