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对于多细胞生物来说,细胞与细胞之间是存在差异的。受精卵从一个细胞开始分裂到最终发育成成熟的个体,各种功能细胞之间的差异会越来越大,表达各自不同的基因,决定不同的生理功能。疾病的发生过程中,伴随多种细胞的参与,不同细胞也会受到不同影响,如肿瘤的异质性、原发灶、转移灶、肿瘤微环境细胞等其基因表达有很大的差异,这些差异决定了肿瘤细胞对治疗的反应。传统的研究方法由于技术限制,是在多细胞水平进行的,获得的基因表达信息是细胞群体的平均信号,丢失了细胞个体特异的基因表达信息。为了更加精细地研究基因表达于细胞功能的关系,单细胞水平进行检测是更加准确的方法,获得的基因表达信息也更加直观。单细胞测序的发展将基因表达于细胞功能的研究带入了一个新的时代。单细胞测序解决了单个细胞RNA量少的问题:
在单细胞测序出现之前,主要是Bulk RNA-seq,即测量一个大的细胞群体中每一个基因的平均表达水平,但对于基因表达的本质研究不够深入,很多基因表达的时空信息被掩盖。scRNA-seq直到2014年后才降测序费用降低到可接受的水平,逐渐进入大家的视野。它测定的是细胞种群中每个细胞中的基因的表达量分布,对于研究特定细胞基因表达的变化意义重大。能同时测定的细胞数量从最初的几十上百个到现在的成千上万个,向着高通量的方向快速发展。将研究推升到一个更加精准的方向。
单细胞测序可以解决的科学问题1.研究对象中细胞一共分多少群?2.每个群对应哪种细胞?3.如何定义新的细胞类群?4.已知的某类细胞是否可分成几个亚群?5.每个细胞群/亚群的marker基因?6.不同样本(病人)间的细胞构成有何差异?7.细胞构成和基因表达差异与表型的关系?
样本的要求1. 总量> 10*目标细胞个数(最少10,000个细胞);2. 浓度500-1,000个/uL;3. 细胞间无粘连(成团率<5%);4. 无大于40um的细胞碎片或其他颗粒物;5. 细胞成活率应大于80%(台盼蓝染色检测);6. 不存在逆转录抑制剂和非细胞的核酸分子。
45-50个工作日
分析内容
(来自文献nature, A human liver cell atlas reveals heterogeneity and epithelial progenitors. 2019)
BDFIA-8000 全自动流动注射分析仪
海能 T860 全自动电位滴定仪
X波段脉冲式电子顺磁共振谱仪EPR100
赛默飞戴安ICS-4000毛细管离子色谱系统
企业名称
斑马鱼(北京)科技有限公司
企业信息已认证
企业类型
信用代码
911103025636697284
成立日期
2010-10-19
注册资本
200
经营范围
技术开发、技术转让、技术咨询、技术服务;销售仪器仪表、Ⅰ、Ⅱ医疗器械、机械设备、电子产品、化工产品、文具用品;会议服务;货物进出口;技术进出口;代理进出口;Ⅲ类医疗器械。
公司地址
北京市朝阳区中安盛业大厦1707室
客服电话
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全自动双向电泳仪
微流控活细胞芯片分析仪
实时单细胞多模态分析仪
活细胞成像系统
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一体化全电动荧光显微成像系统
超微量高灵敏靶向蛋白组分析仪
差示扫描微量热仪 NANO DSC
等温滴定微量热仪 Affinity ITC
等温滴定微量热仪 NANO ITC
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10x Chromium Controller单细胞测序
新一代高通量单细胞测序系统
全自动单细胞测序建库解码系统
10x Genomics单细胞转录组测序
Olink蛋白多因子检测
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公司名称: 斑马鱼(北京)科技有限公司
公司地址: 北京市朝阳区中安盛业大厦1707室 联系人: 李先生 邮编: 100101
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