您好,欢迎访问仪器信息网
注册
日立诊断产品(上海)有限公司

关注

已关注

已认证

粉丝量 0

当前位置: 日立诊断 > 公司动态
公司动态

DS3000应用|微卫星不稳定性(MSI)分析在一胰腺癌切除术临床案例术后长期肿瘤基因型追踪分析中的应用

背景胰腺导管腺癌(PDA)是一种致死率极高的疾病,即使在根治性切除术后也会复发。虽然建议进行辅助化疗,但中位无复发生存期KRAS基因中一种普遍存在的突变在胰腺癌的发生过程中起着起始基因的作用,随后肿瘤抑制基因如TP53,CDKN2A,SMAD4导致侵袭性和转移性疾病前体的进展。一项研究表明,这些突变的数量与PDA患者的术后生存率显著相关。最近的遗传学研究也发现PDA之间的突变谱存在相当大的差异,这可能广泛对应于不同的分子亚型。即使存在转移,阐明PDA遗传背景的临床意义对于预测有效的长期生存和对患者进行选择性手术治疗也是必要的。#案例一位42岁的女性因上腹部疼痛伴胰腺肿块转诊到本院,患者有胰腺分支导管型导管内乳头状粘液性肿瘤家族史。患者因胰管受累,诊断为胰腺导管腺癌(PDA)并发胰腺炎。病人接受了远端胰腺切除术,病理检查显示为管状腺癌。首次出现后6个月和43个月分别发现孤立性肝转移瘤和肺转移瘤,随后进行转移性切除术。本例胰腺癌患者在原发肿瘤切除和异时转移瘤切除术后存活8年以上。PDA可能与调节其生物学行为的遗传特征有关。检测其肝和肺切除标本、原发性动脉导管未闭和复发性肿瘤的基因图谱,发现在密码子12处具有相同的KRAS突变,而主要肿瘤抑制基因如TP53、CDKN2A和SMAD4没有突变。#实验方法为了评估原发性动脉导管未闭切除术后长期过程中发生的遗传学事件,我们利用从福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本中提取的基因组DNA,通过基于PCR扩增子的靶向测序,对原发性肿瘤和肝肺转移的特征进行了描述。1)DNA提取:使用GeneRead-DNA-FFPE试剂盒(Q公司)从非肿瘤组织(脾脏)、原发性PDA和肝/肺转移瘤的FFPE切片中提取基因组DNA,并进行定量。2)基因PCR扩增子的靶向测序:原发性和肝/肺转移性肿瘤的突变谱通过基于前面描述的PCR扩增子的靶向测序来确定。使用Ion AmpliSeq Cancer Hotspot Panel v2和定制Panel(T公司)扩增10到60ng的基因组DNA。Ion Ampliseq Cancer Hotspot Panel v2用于扩增207个覆盖50个癌基因主要热点的扩增子。定制Panel的扩增子包括18个在PDA中频繁突变的基因(ARID1A,BRAF,CDKN2A,CTNNB1,GNAS,IDH1,KDM6A,KRAS,MAP2K4,PIK3CA,RBM10,SF3B1,SMAD4,STK11,TGFBR1,TGFBR2,TP53和RNF43)。通过Ion Personal Genome Machine System and the Ion Personal Genome Machine Sequencing 200 Kit(T公司)进行测序并分析。3)微卫星不稳定性分析:微卫星不稳定性(MSI)试剂盒(P公司)利用5个单核苷酸标记物(BAT-25、BAT-26、NR-21、NR-24和MONO-27)和2个五核苷酸标记物(Penta C和Penta D)鉴定肿瘤和正常组织DNA标本中的MSI是否来自同一患者。DS3000基因分析仪被用于分离荧光标记了的PCR产物,结果通过GeneMaker 3.0软件(SoftGenetics)进行分析。如果肿瘤在至少2个单核苷酸标记物中表现为不稳定,则将其归类为MSI-H;如果在5个标记物中有1个标记物观察到MSI不稳定,则将其归类为MSI-L;如果在5个标记物中未检测到不稳定,则将其归类为微卫星稳定(MSS)。#结果所有3个肿瘤病灶样本在密码子12处都有相同的KRAS突变(p.G12V,COSM520),肝和肺肿瘤与原发性PDA基因相同。有趣的是,在胰腺肿瘤发生的主要抑癌基因(如TP53、SMAD4和CDKN2A)和其他在PDA中常见突变的基因中没有发现突变。此外,研究表明新的突变并没有在肝和肺转移瘤中累积。原发性和复发性肿瘤在基于多重PCR的MSI分析中都为MSS。#结论通过手术成功控制的PDA可能属于在分子水平上更有利生存的的一个亚型。因此,我们采用了遗传学方法来确定突变谱。在3个病灶中均发现相同的KRAS突变,提示转移可能起源于原发性PDA。一般认为肿瘤细胞会在进展过程中获得额外的突变,然而,在PDA中常见的其他突变如TP53、CDKN2A和SMAD4在原发性PDA和转移瘤中均未发现。另外,MSI的发生率及其与胰腺癌预后的关系可能因所用方法而异。在这里,我们描述了一例PDA患者,在原发性肿瘤切除术后,肝和肺孤立性复发性肿瘤的后续手术治疗中存活了8年以上。我们进一步描述了肝脏和肺部原发性和复发性肿瘤的连续切除是如何获得长期生存的,这些肿瘤显示出相同的KRAS突变,而在主要肿瘤抑制基因中没有发现其他突变。PDA的结果可能与调节其生物学行为的基因图谱有关。孤立性转移瘤的手术治疗可作为胰腺癌患者的一种治疗选择。(Hiroki Sato,MD   旭川医科大学医学系)Source:Sato H, Sasajima J, Okada T, Hayashi A, Kawabata H, Goto T, Koizumi K, Tamamura N, Tanabe H, Fujiya M, Chiba Si, Tanino M, Ono Y, Mizukami Y, Okumura T. Resection for pancreatic cancer metastases contributes to survival: A case report with sequential tumor genotype profiling during the longterm postoperative course. Medicine 2020;99:25(e20564).(仅供科研使用 For Research Use Only) 

应用实例

2021.06.04

日立DS3000基因分析仪顺利通过公安部刑事技术产品质量监督检验中心验证

重磅来袭!日立 DS3000 基因分析仪日立DS3000基因分析仪已顺利通过公安部刑事技术产品质量监督检验中心的验证。此次验证进行了包括基线漂移和噪声、定性定量准确性、碱基分辨率、灵敏度等检测实验以及高低温贮存、恒定湿热、抗电强度等环境实验。众所周知,目前广泛应用于公安司法机构的基因分析仪,其制造来自日立公司,此次日立推出日立品牌的DS3000基因分析仪,其优异的仪器性能得到了公安部物证鉴定中心的充分肯定,完全满足法医DNA检测需求,适用于各类法医物证鉴定,同时由于DS3000体积小巧,更具备灵活运用于小型实验室、移动式检测及随来随检的海关抽样检测等各类场景的能力。#Sanger测序Sanger测序技术作为基因检测的金标准,除了应用于遗传变异、微生物鉴定、病原体分型等临床、食药、疾控的领域外,法医学领域也是非常重要的应用方向。通过对DNA的序列和长度多态性的检测,可以实现个体识别及亲权鉴定,因此,Sanger测序技术是当前法医物证鉴定最主要的技术手段,该技术在侦查破案、搜索被拐卖儿童、死亡案件个体识别以及犯罪证实等方面发挥了显著作用,为打击违法犯罪提供了强有力的武器。#DNA多态性人类基因组DNA多态性源于基因组DNA中的碱基突变,突变后的基因遗传给子代,显示出DNA分子水平上的个体差异。这种差异包括:1)长度多态性:特定基因座上序列长度的个体差异。*长度多态性为多存在于基因组DNA中的一类短串联重复序列(STR),是目前法医鉴定中最常用的遗传标记。2)序列多态性:特定基因座上碱基序列的个体差异。法医DNA检测和分析的主要就是这两类差异。根据孟德尔遗传定律,子代从双亲处得来的DNA特定序列,即在同源染色体中位于同一位置的两个等位基因,可以相同也可以不同。这样具有个体差异的DNA多态性是进行个体识别及亲子鉴定的理论基础。#日立DS3000基因分析仪DNA检测是法医物证鉴定中十分重要的一环,日立致力于为法医领域用户提供系统智能、性能优异且简便易操作的检测分析。日立DS3000基因分析仪秉承日立高新多年来研究开发的毛细管技术与激光辐射技术,作为小型CE测序仪,不仅外形“紧凑”,还具备“高性能”及“高速处理”的能力,可轻松完成片段与测序分析。DS3000采用4通道毛细管,一次性可处理32个样本,可同时进行6色荧光检测。支持短串联重复序列分析、突变分析和测序分析等用途。作为一款小型的集成化台式DNA分析仪,“紧凑”而“高效”,可以帮助各种规模的法医学DNA实验室进行Sanger测序和片段分析工作。欢迎关注“日立诊断”我们期待您的意见和建议

企业动态

2021.03.25

紧凑型毛细管电泳测序仪“日立DS3000”开始发售

2020年9月1日株式会社日立高新技术  株式会社日立高新技术(董事兼社长:宫崎正启、以下简称日立)将在日本、中国大陆、韩国、中国台湾,经由本公司代理商从9月1日开始依次发售与promega corporation(chairman and ceo:william a. linton/所在地:美国威斯康辛州麦迪逊市、以下简称promega)共同开发的紧凑型毛细管电泳(ce)*1测序仪“日立ds3000”。【紧凑型毛细管电泳测序仪“日立ds3000”】  DNA测序仪可自动读取并分析DNA核酸序列,广泛应用于所有生物基因信息的分析研究。制药,食品,科研等小规模研究机构均需要以更短的检测时间,较低的价格来进行基因样品的分析,为了满足该需求,紧凑型毛细管电泳测序仪“日立DS3000”全新上市。 日立DS3000采用日立高新多年来研究开发的毛细管技术与激光辐射技术,作为小型CE测序仪不仅外形“紧凑”,还实现了“高性能”及“高速处理”。此外,本产品还采用了环境友好型设计,通过减少在产品使用时排出的CO‍2排放量,为客户提供可降低环境负荷的产品。 此次发售的日立DS3000主要特点如下。1.节省空间并提高用户可操作性  产品配备有触屏式操作界面,仪器运行情况一目了然,同时简化操作流程,可轻松地进行基因分析。此外,与以往产品相比大幅缩小产品体积,实现了紧凑型设计,致力于节省空间并提高可操作性。另外,亦配置了 “远程监控系统”,可通过计算机导出报告并被二次分析软件解析,便于客户操作。2.降低维护频率  耗材采用了卡槽式设计。此外,无泵化注胶系统免除了以往的清洗步骤,有助于缩短维护时间并降低成本。新产品配置的激光二极管光源(ld光源)与以往光源相比,延长了实际亮灯时间,替换简单且降低了价格成本,延长了使用寿命。  日立DS3000可用于基因序列分析及片段分析*2,预期可用于各类需要进行基因分析的实验室。 通过本产品的开发,日立高新集团将在视为重点领域的生物医疗保健市场,进一步扩大DNA测序仪业务。今后,日立高新也将以“分析技术”为根基,在生物医疗及公共安全领域致力于第一时间掌握客户需求,创造出高附加价值的Focused Solutions。*1CE:Capillary Electrophoresis(毛细管电泳)*2片段分析:对于DNA片段长度的分析 

新品

2021.03.01

日立诊断产品(上海)有限公司

沟通底价

提交后,商家将派代表为您专人服务

获取验证码

{{maxedution}}s后重新发送

获取多家报价,选型效率提升30%
提交留言
点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》 且同意关注厂商展位
联系方式:

公司名称: 日立诊断产品(上海)有限公司

公司地址: 上海市浦东新区陆家嘴环路1000号恒生银行大厦21层 联系人: 总机 邮编: 200120

友情链接:

仪器信息网APP

展位手机站