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PROTAC二元和三元复合物表征

2022/08/11 14:47

阅读:185

分享:
应用领域:
制药/生物制药
发布时间:
2022/08/11
检测样品:
治疗类生物药品
检测项目:
临床前研究
浏览次数:
185
下载次数:
参考标准:
未知

方案摘要:

如果您正在从事蛋白降解靶向嵌合体(PROTACs)开发,找到正确的方法来表征二元和三元复合物是极为关键的。SPR等需要固定的方法在检测三元结合时,二元复合物固定后无法确保其稳定性。如果采用基于显著分子量变化的方法检测PROTAC分子中的目的蛋白(POI)配体即warheads,或泛素连接酶配体等小分子,您可能要耗费大量精力进行方法开发。基于空间距离的生化检测方法如AlphaScreen或TR-FRET需要对多个孵化步骤进行细致优化。此外,此类方法还需要使用两种不同的荧光基团来标记POI(TR-FRET)或分别标记供体或受体微球(AlphaScreen)。

产品配置单:

分析仪器

NanoTemper Dianthus高通量亲和力筛选系统 片段化合物库解决方案

型号: Dianthus

产地: 德国

品牌: NanoTemper

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方案详情:


检测样品:蛋白降解靶向嵌合体PROTAC

检测项目:小分子warheads检测,PROTAC三元复合物协同因子检测

方案标题: PROTAC二元和三元复合物表征

应用领域: 制药


方案详情:

1. 使用不依赖分子量变化的检测方法将warheads开发为完整PROTAC分子

在小分子warheads的筛选过程中,您需要不依赖分子量变化的方法来准确检测它对POI的亲和力。接下来,您还可以借助同样的方法检测完整的PROTAC分子。Dianthus分别检测warhead分子JQ1(+),PROTAC分子dBET6(基于JQ1(+) )与BRD4(POI)的相互作用。光谱位移结果表明,dBET6的分子量是JQ1(+)的两倍,两者与BRD4的亲和力依然几乎完全相同,因此,dBET6是值得向下游推进的PROTAC候选分子。

Charnwood Molecular公司旗下Aurelia Bioscience团队的合作项目数据


2. 以高质量的数据表征二元复合物中的分子间相互作用

SD-36是一种在临床前模型中显示存在抗肿瘤活性的高效特异性PROTAC分子。采用光谱位移技术分别检测SD-36与STAT3和CRBN泛素连接酶的亲和力,并获得了高质量数据( 信噪比S/N值>30)


3. 检测由共价结合PROTAC形成的高亲和力三元复合物

当您需要检测由共价结合配体参与的分子间相互作用时,在溶液中直接检测的方法相比基于固定的方法要简单得多。光谱位移技术检测到共价结合PROTAC分子LC-2对泛素连接酶复合物VCB的亲和力在结合靶蛋白KRAS后(蓝色曲线, 三元结合)相比未结合KRAS(紫色曲线,二元结合)提高了80倍。更高的亲和力对应高协同效应(α值),从而表明LC-2是有巨大潜力的KRAS蛋白降解剂。


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