2021年7月15日星期四(北京时间:11:00PM),德国莱布尼茨植物遗传与作物研究所(IPK)的Stefan Heckmann教授和Yun-Jae Ahn博士将在线分享:基于naica®六色微滴芯片数字PCR系统无需全基因组扩增 (WGA),高通量绝对定量检测大麦单花粉核减数分裂重组率”的研究。
本次网络研讨会将讨论关于开发单个花粉核基因分型,实现数字PCR高通量绝对定量检测四个特定染色体间隔内的减数分裂重组率。
主题:naica®六色微滴芯片数字PCR系统高通量绝对定量检测大麦单花粉中核减数分裂重组率
日期:2021年7月15日(周四)
时间:北京时间11:00PM
内容简介:
植物育种利用减数分裂重组产生的新等位基因组合。在受精前直接测量配子中的减数分裂重组率,从单个个体中筛选出大量的样本,无需隔离种群分子标记分析,无需费时的细胞学观察的交叉互换(Cross Over)检测。目前由于花粉核DNA含量有限(~5 pg/单倍体细胞核),大麦花粉单核基因分型方案需要先进行全基因组扩增(WGA),再进行PCR分型或单细胞测序,从而限制了分析样本的数量。
德国莱布尼茨植物遗传与作物研究所(IPK)科学家,基于Stilla® Technologies 公司的naica®六色微滴芯片数字PCR系统,开发了一种单花粉核基因分型检测方法,在不进行WGA的情况下,以高通量测定四个特定染色体间隔内(两个着丝粒和两个远端)的减数分裂重组率。通过对花粉核的热稳定性限制性酶消化提高了基因分型检测的效率,完成了42,000多个花粉核进行了基因分型。杂交花粉核中测得的减数分裂重组率与隔离种群测得的重组率一致。基于naica®六色微滴芯片数字PCR系统,通过多重分析可在两个染色体间隔同时检测,进一步提高了样本通量。
该系统同时兼容基于多种不同核大小和DNA数量的农作物细胞核,证明基于naica®六色微滴芯片数字PCR系统的单核基因分型检测方法具有广泛适用性。
该成果“High-throughput measuring of meiotic recombination rates in barley pollen nuclei using Crystal Digital PCR™”已发表于The Plant Journal ( IF 6.417 ) PubDate : 2021-05-05 ,DOI: 10.1111/tpj.15305
主讲人:Evi Lianidou博士(雅典大学分析化学和临床化学)
德国莱布尼茨植物遗传与作物研究所(IPK),隶属于德国莱布尼茨科学联合会,坐落于德国Gatersleben,研究定位以作物为主要对象,研究野生和栽培植物的遗传多样性,并利用这些材料,开展具有原创性的科学发现和技术创新,并实现农作物的分子改良。经过长达70多年的收集,保存了151,000多份不同作物的种质资源,是欧洲最大的种质资源收集与保藏中心,为IPK和世界相关研究人员研究作物基因和基因组演变、发展和表达规律提供了独一无二的研究材料。
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