文献速递｜湖南省疾控两篇连发Naica™数字PCR系统检测精子/全血/尿液/粪便中的新冠病毒SARS-CoV-2

Paper -1：

全球新型冠状病毒肺炎疫情日益严峻，除了齐心协力对抗病毒外，科研人员也在对新冠病毒进行更深入的研究，比如疫苗研发，感染后患者生理机能是否会受影响等。其中，关于新冠对生殖方面的影响一直备受关注，迄今为止，已在精液和精子中检测到27种病毒。那么在新冠大流行的背景下，SARS-CoV-2（covid-19）是否存在于精液中呢？如果精液样本中存在极低病毒载量的SARS-CoV-2（covid-19），一旦被使用，那么必定会有传染风险。

湖南省疾病预防控制中心以湖南省人类精子库在大流行期间和之后收集的冷冻精液为研究对象，开展了一项回顾性研究，并发表在《Reproductive BioMedicine Online》杂志上。  研究包括来自100个供体的100对精液和血液样本，考虑到两种标本的病毒载量均较低，所以研究人员使用了自主改良的一步法-单管巢式定量PCR（OSN-qRT-PCR）进行SARS-CoV-2（covid-19）检测。此外，为了避免出现“假阴性结果”，使用Naica™数字PCR（cd-PCR）对来自阴性精液样品的RNA进行了第二轮群体检测。

结果：对于单个血液和精液样本，分别检测了核衣壳蛋白（N）和开放阅读框（ORF-1ab）基因，在100对样本中均呈阴性。此外，根据cd-PCR结果，群体检测的RNA样本中，每孔均> 20,000个微滴，并且均不存在阳性液滴。

结论：冠状病毒大流行期间和之后，湖南省人类精子库冷冻保存的精液均不含SARS-CoV-2（covid-19），可以安全使用。

Paper -2：

本研究对已经确诊的3例新型冠状病毒肺炎患者按照不同时间的全血、尿液、粪便标本同时进行qPCR和Naica™数字PCR（cd-PCR）的核酸检测，并比较了两种方法检测各类样本中2019-nCoV的差异性，提出改进2019-nCoV核酸检测的综合策略，为核酸检测阴性患者提供更多诊断支持。

本实验中数字PCR在病例发病早、中、晚期标本中均能检测到阳性微滴，而qPCR漏检了发病小于5天的标本，检测到的阳性核酸均以中晚期为主。（表2）这也解释了受检测方法灵敏度的局限性，目前大部分假阴性患者都处于疾病发展的早期。此外，在本次实验中数字PCR在重症病例的三种标本中均测到阳性微滴，但因为血、尿和可疑粪便的标本病毒载量偏低，qPCR检测均为阴性。（表3）

总之，数字PCR技术可以有效克服qPCR灵敏度不足的难题，精准捕捉到病毒载量较低的血液、尿液和可疑的粪便或肛拭子标本，是qPCR的有益补充，为帮助临床医生准确判断早期感染及患者是否真正痊愈起到了积极的作用，对2019-nCoV的长期监控有重要的意义。

两篇Paper均采用了--Naica™数字PCR平台

法国Stilla Technologies公司的Naica™数字PCR技术在进行核酸检测时具有独特的优势。系统利用cutting-edge微流体创新型芯片—Sapphire芯片作为数字PCR过程的耗材。样品通过毛细通道网格以30,000个微滴的形式进入2D芯片中。3色荧光检测仪器，整个流程只需要2.5小时，并可进行数据的质控和结果追溯分析，获得的数据真实可靠。

操作流程：

原文链接：

Paper1：doi.org/10.1016/j.rbmo.2020.11.015

Paper2：doi:10.3969/j.issn.1006-3110.2020.11.009