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教你如何同时鉴别和定量耐甲氧西林金黄色葡萄球菌

2018-01-08 13:21

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还记得来自Nature的伦敦音吗?转成正宗曼德瑞,教你如何同时鉴别和定量耐甲氧西林金黄色葡萄球菌( MRSA) 北京时间10月24日来自英国伦敦LGC的丹尼斯·奥沙利文,在全球范围内分享了她所在的分子与细胞生物学团队通过Naica crystal 数字PCR仪的三色检测通道,成功地在一次反应中达到了鉴别MRSA和对其携带抗性基因进行定量的研究,从而区分了MRSA和与其形态学类似的表皮葡萄球菌。在2017年最后一个工作日,小编将实验的研究背景、实验思路以及结果和重复性进行简明阐述。
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多重PCR要求在同一反应体系内对多个位点进行特异性扩增。因而引物间的配对与竞争性扩增均会影响扩增效果。如果能选择合适的反应体系、反应条件以及更合适的PCR仪,则有望提高多重PCR的扩增效果。所以在进行多重PCR的时候,不应墨守成规,要根据自身实验情况对实验条件进行不断优化,达到最佳扩增效果。

qPCR实验的工作流程首先需要确定研究的目的,根据实验设计规划好实验分组、重复次数等细节。接下来分为样本准备和引物探针验证两个重要的步骤。样本准备主要是核酸提取逆转录等步骤,引物探针需要去测试特异性和效率。接下来需要使用qPCR仪来对样品中的目的核酸进行扩增qPCR结束后根据实验目的对目的核酸进行相对或者绝对定量。

荧光定量PCR技术是将常规的PCR和荧光检测技术相结合,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,以此实现对初始模板的定量分析。荧光定量PCR技术作为当今生物学研究的重要手段之一,在基础科学、生物技术、医学研究、法医学、诊断学等多方面具有广泛的应用前景。

本研究使用ECHO REVOLVE正倒置一体荧光显微镜(RVL-100-G,Discover ECHO,US)检测VS29蠕虫的GFP荧光。激发和检测波长分别为470–495 nm和510–550 nm。使用图像处理和分析软件对荧光图像进行分析,计算其平均荧光密度。

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