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给微生物组热潮降降温

上海沪峰

2014/08/26 08:11

阅读:114

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人体肠道内生活着多达1000多种共生微生物,这些微生物遗传信息的总和就称为“微生物组”。近年来,微生物组研究受到了人们的极大重视,甚至被称为是人体的“第二基因组”。

现在,越来越多的研究将人体肠道菌群与疾病关联起来,例如自闭症、癌症和糖尿病等。研究界的这种热情也感染了公众,纽约时报曾以头条宣告“We Are Our Bacteria”。

有研究者认为,抗生素的使用会严重破坏微生物组,进而对人体健康产生可怕的影响。也有公司开始为个人提供微生物组的分析和解读。此外,粪便移植也被提出用于治疗糖尿病、阿尔茨海默症等疾病。

回顾之前的种种“组学”热我们可以看到,技术进步赋予了人们分析基因组、蛋白质组、代谢组的能力,于是便有大量研究将这些分子的状态与人体健康联系起来。然而,这些研究的后续工作往往后继无力,情况反而越来越复杂。因此,在微生物组红得发紫的今天,多一点怀疑和批判精神是很有必要的。(延伸阅读:Science重要发现:癌症与微生物组)

对微生物组热潮进行了反思。文章指出,在接受一项新结论之前,我们应该首先提出五个问题:

研究有没有检测到有意义的差异?微生物组图谱主要依赖16S rRNA分析,能提供门、属、种的信息,但这种分类还不够细。举例来说,有研究鉴定了与糖尿病有关的微生物组,是细菌不同门之间呈特定比例,这未免太过于宽泛。这相当于是认为100只鸟和25只蜗牛组成的鸟舍等同于有8条鱼和2只乌贼的水箱,只因为鸟舍和水箱里的脊椎动物和软体动物之比都是4:1。另外,就算是同一个属的微生物,所含基因也往往大相径庭。

如今的技术其实可以做到更细致的分类,我们可以通过破译“代谢网络”来理解微生物组进行的生化反应,并在此基础上鉴定对健康有影响的基因组合。不过这就要求研究者对整个网络有一个透彻的了解。

研究是否明确了因果关系?在鉴定疾病相关微生物组时,我们需要确定这种关系到底是不是因果关系,因为这种特别的微生物组有时可能只是个副产物。

一项研究发现,住在养老院里的老人微生物组与住在社区里的老人不同,而且这种差异与体质强弱。作者在考虑了多种因素后指出,饮食能够改变微生物组进而影响健康状况。这种结论的确与数据相符,但研究者却没能反向证明这样的因果关系。因为可能影响微生物组的因素很多,比如免疫系统比较不活跃,消化能力较弱等等。

 

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