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您是否需要探索单细胞中的遗传信息?我们为您提供解决方案!使用QIAGEN专用于单细胞或少量细胞样本的分析试剂盒,即可了解单细胞基因组和转录组序列信息。创新的多重置换扩增(MDA)技术能够可靠扩增单细胞或少量样本中的全基因组或全转录组。 REPLI-g Single Cell Kit可均一的扩增单个细胞(1至1000个细菌或肿瘤细胞)或纯化的基因组DNA,能够覆盖基因组所有位点。所有缓冲液和试剂生产都经过严格控制的流程,避免污染DNA,确保每次实验获得可靠的结果。该产品采用多重置换扩增(MDA)技术,对所有基因组位点进行无偏差的扩增。与基于PCR的全基因组扩增技术相比,该技术具有更好的扩增高保真度,避免出现假阳性或假阴性信号。 |
原 理 |
REPLI-g Single Cell Kit含有REPLI-g sc Polymerase,这是一种优化的新型高保真Phi 29聚合酶。该试剂盒采用多重置换扩增技术扩增复杂的基因组DNA,温和的碱孵育能够避免DNA片段化,促进对所有位点的无偏差扩增。该试剂盒十分适用于分离的肿瘤细胞或细菌细胞等单一细胞,能够扩增获得高产量DNA(参见表1)。此外,该试剂盒还配有专用于鲜血或干血、新鲜或冷冻组织的实验方案,可用于多种研究样本。常规DNA产量可达40 μg,对模板的起始量要求低,因此进行后续遗传分析时无需检测DNA浓度。REPLI-g Single Cell Kit的扩增产物平均长度超过10 kb,且覆盖所有位点,适合于多种应用,包括二代测序、基于芯片技术的比较基因组杂交、焦磷酸测序和real-time PCR分析(参见表2)。 |
表1. 样本类型和研究领域 |
样本类型(细胞/DNA) 研究领域 人类/动物 生物标记物研究(SNP、突变、CNV) 干细胞研究 循环胚胎细胞分析 嵌合体研究 遗传易感性研究 转基因动物基因分型 癌症 体细胞遗传变异分析 肿瘤恶化 肿瘤干细胞/进化 循环肿瘤细胞分析 细菌 宏观基因组学研究 病原体分析 微生物基因分型 Plants* 植物气孔研究 花粉分析 * 没有细胞壁的细胞或纯化的基因组DNA。 |
表2. 下游应用和仪器 |
应用 仪器 全基因组测序 二代测序平台? 外显子组测序 SNP基因分型芯片 芯片平台? Array CGH qPCR/PCR技术 Real-time PCR/PCR仪? Sanger测序 毛细管测序仪? 焦磷酸测序 PyroMark (QIAGEN) ? 多家供应商均有销售 |
表3. REPLI-g Single Cell Kit的成 |
试剂盒成分 优势 REPLI-g sc Polymerase 最长可达70 kb的长片段 保真性是Taq聚合酶的1000倍 覆盖所有位点 均一扩增所有位点 REPLI-g sc Reaction Buffer? 对所有位点进行无偏差的扩增 Buffer DLB (裂解和变性) 高效扩增 不损伤DNA 紫外线照射去除污染 减少可检测到的残留DNA污染 ? 含有盐、引物和dNTP |
表 4. 多种REPLI-g Kits的规格 |
产品名称 REPLI-g Single Cell REPLI-g Mini REPLI-g UltraFast Mini REPLI-g Midi REPLI-g Screening REPLI-g FFPE REPLI-g Mitochondrial DNA 产品货号 150343/ 150345 150023/ 150025 150033/ 150035 150043/ 150045 150126 150243/ 150245 151023 起始材料 单一细胞、gDNA 纯化的基因组DNA、血液、细胞 纯化的基因组DNA、血液、细胞 FFPE组织、FFPE组织中纯化的基因组DNA 纯化的基因组DNA 另外提供其他起始材料的实验方案 起始量 单一细胞、2–1000各细胞、组织、纯化的gDNA (1–10 ng) >10 ng gDNA、0.5 μl血液或细胞(>600个细胞/μl) >10 ng gDNA、0.5 μl血液或细胞(>600个细胞/μl) 组织切片(直径1 cm,厚度10–40 μm);>100 ng gDNA >1 ng纯化的gDNA 产量(μg/反应) 40 10 7–10 40 8 标准产量:≤10; 高产量:≤40 3–5 反应时间 8–16小时 10–16 小时 1.5小时 8–16小时 12–16小时 标准产量:4小时;高产量:10小时 8小时 手动操作时间 15分钟 15分钟 15分钟 15分钟 15分钟 40分钟 15分钟 规格 反应管 反应管 反应管 反应管 孔板 |
以上信息来源QIAGEN |
阅读原文:http://www.liankebio.com/ProductCenterShow/articleID/2014100002.html
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