arrayjet advance生产服务为客户提高芯片产量的同时减少样品消耗 ultra marathon ii 在美国巴尔的摩安装后，客户对仪器非常满意。ultra marathon ii 加上jetmax 环境控制系统，实现在极低的温度下进行点样。 案例cdi实验室是一家美国蛋白质组学公司，之前采用低通量接触式的针式点样平台。他们经历了频繁的生产延误，产量降低，批间差异大，样品损失等问题。他们缺少生产高通量、高质量的蛋白芯片的技术平台。随着需求的不断增加，cdi面临有效商业化他们的产品，降低不断上升的设备维修费用的压力。 arrayjet adance 芯片点样服务arrayjet的 adance 芯片点样服务起始于2011年，非常有效的支持了cdi公司的项目。这种直接面向客户的芯片服务，客户可以直接得到arrayjet 总部75年的全面的生物芯片经验的支持，来实现他们的蛋白芯片的技术优化，转让和商业化。 实验优化人类蛋白库中的一部分人类蛋白通过arrayjet公司的ultra marathonii飞行喷墨式生物芯片点样平台点到环氧硅烷（图2）和硝酸纤维素膜上，整个点样环境通过jetmax环境控制系统控制在4°c。通过测试各种点样体积来优化最后的每个点的样品体积。14个微矩阵重复中，样品点圆形形态合格率大于99%。采用该微矩阵获得预期的表达图谱。 图2: 在环氧硅烷芯片上进行试验优化 批量点样更多来自cdi人类蛋白库的蛋白样品被点到200张环氧硅烷和硝酸纤维素玻片上，来进一步分析点样的重复性点样形态（图3）。arrayjet 的jetguard 确保在长时间点样过程中最少的样品蒸发。 图3：从人类蛋白库中纯化的一个小组的蛋白样品被点到200块相同的grace bio-lab path 硝酸纤维素膜上。 高密度点样通过功能学蛋白实验确认，我们成功的进行从针点到arrayje飞行喷墨式点样的方法学转移。我们进一步评估了ultra marathon ii飞行喷墨式点样平台进行高密度点样的能力。cdi 人类蛋白库的样品进行一个高密度的六边形矩阵喷点，来评估在不同点样基质上，芯片内和芯片间点样的重复性，以及背景信号。结果显示，芯片具有出非常好的矩阵，没有点的重叠。 全人类蛋白组芯片制备超过19000个gst融合蛋白从cdi 人类蛋白质库中纯化出来，并被重复的喷点到500张芯片上，每个点200pl 的样品 (图4)。实验成功的标准如下：?>97%的样品需要被点到芯片上?圆形点数量>90%?芯片内和芯片间的cv?具有阳性和正确的功能实验结果 图4： cdi 完整的人类蛋白库样本被喷点到grace bio-labs path® 蛋白芯片玻片上。 结论通过方法学的成功转移，cdi 公司目前能生产全球最大的人类蛋白组芯片，一个批次能生产100张3.1 版本的huprot 芯片。采购ultra marathon ii飞行喷墨式点样平台让cdi能够制备蛋白组芯片和其他客户定制的芯片。通过这些芯片，客户能使用最小量的临床样品进行上万种蛋白的分子相互作用检测。arrayjet advance芯片服务和非接触压电式点样技术显著的提高大规模、高质量的蛋白芯片生产效率。环境控制单元不仅仅保证了完美的样品点形态和矩阵，同时保护了蛋白的天然构象，最终证保实验结果的一致性。 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------“cdi 采购ultra marathon ii 飞行喷墨式点样平台用于研发和生产huprot 蛋白芯片和杂交瘤细胞筛选项目的特定芯片。cdi正在计划在不远的将来，采用该新技术平台制备单克隆抗体芯片和膜蛋白芯片。 我们选择arrayjet 是因为我们需要实现通量5倍的提升，而且最好是一台仪器来实现这个目标。arrayjet的高科技，精确和用户友好的设计是一个明显的优势。 另一个arrayjet 公司结构的优势在于，他还通过arrayjet advance 提供内部芯片服务。我们可以通过数个月，多个项目的测试，来再次加深我们对该平台的信任, 这个平台可以在多个方面提升我们目前运营。” dr. ignacio pino, ceo, cdi laboratories“ arrayjet 的jetspyder 样品进样装置有效的减少了蛋白样品间任何的交叉污染，我们的蛋白芯片的质量有了显著的提高。此前，我们一个批次仅仅能生产150片质量合格的芯片，这个通量不能满足规模生产和目前以及未来增长的需求。arrayjet的技术平台能够快速高效的制备1000张芯片的特点对我们有很大的吸引力。”dr. heng zhu, professor, johns hopkins school of medicine

背景：microrna长度在18-30bp之间，illumina测序接头长度约为126bp，因此需要将构建的文库中144-156bp回收，并达到上机测序要求浓度200pg/ul。 实验内容：使用total rna样本构建的micro rna文库在pippin ht仪器上进行测试。 目的：将回收范围控制在140-160bp，去除空接头126bp，以及较大片段188 bp。 结果如下：上样量20ul，回收纯化后体积为10ul。  图1. total rna构建的microrna文库（回收前）图2. total rna回收后文库  总结：使用pippin ht target 145的模式能够回收到的主峰大小在151bp左右，这是microrna文库比较理想的主峰，相应回收得率高于50%。相比繁琐的手工page切胶，pippin ht 只需要38分钟即可完成microrna文库的精确回收，整个过程仪器全自动操作，避免了人为经验的误差和不稳定性。 nebsmall rna 建库试剂盒中有推荐使用sage science 的仪器nebnext multiplex small rna library prep setfor illumina    关于环亚生物科技美国sage science公司是一家创新研发制造企业，一直致力于改善生命科学应用中样品制备过程碰到的各种问题。环亚生物科技有限公司是美国sage公司中国区总代理商，一直关注测序相关设备在国内的引进和开发，致力于协助国内客户更好、更快完成测序样本的制备工作，实现更高效率、更轻松的工作流程。 更多详细信息请联系    环亚生物科技有限公司地址：上海市闵行区沪闵路7580弄南方城21号301室电话：+86 21 5484 7570网址：www.apgbio.cominfo@apgbio.com

美国Sage Science公司是一家创新研发制造企业，一直致力于改善生命科学应用中样品制备过程碰到的各种问题。公司于2017年2月13号宣布推出一种新的应用平台SageHLS，可以直接从细菌、组织培养物、血液样品或其它细胞源中提取和纯化极大的DNA片段。SageHLS平台（图1）近期正在美国佛罗里达州Hollywood举办的的基因组生物学和技术进展（AGBT）会议上展出。高分子量（High molecular weight, HMW）DNA或者大片段DNA是很多基因组应用匹配的最佳材料。但是，传统的样品准备过程无法将DNA片段长度处理到这些范围，因而削弱了科学家通过长读长和长范围测序、光学图谱、微滴式数字PCR以及单分子工具等技术获取最佳信息的能力。SageHLS平台（HLS为高分子量文库系统的缩写）可以将DNA纯化至50kb-2Mb的长度，为单倍型、结构变异和其它大的或连锁的基因组元件的研究提供了高质量的长片段DNA。Sage Science的首席执行官 Todd Barbera说:“我们相信数百Kb或者Mb级别DNA片段获取技术的突破，能够促进科学家充分利用先进的基因组技术，揭示大型基因组元件影响疾病和其它表型的机制。”他表示，“SageHLS 平台纯化出的DNA长度是其它工具所无法实现的。”工作原理如下图图2. SageHLS工作原理图（简要流程：1. 将收集好的细胞（红色圆点）加入到反应室，溶液室中加SDS。2. 通过电泳，SDS进入到反应室，裂解细胞并把蛋白电泳洗脱。从细胞中释放的DNA由于分子量很大，被困在反应室中，无法进入电泳通道。3.  将酶切反应液加入到反应室，与超高分子量基因组DNA反应，使其片段化。4. 加入SDS到溶液室, 纯化酶切后的DNA大片段。5. DNA大片段进入电泳通道，根据分子量大小被回收进右边回收孔。黄色表示SDS，红色（条带）表示细胞内蛋白，绿色表示核酸酶）在测试中，医学研究机构的科学家们已经利用SageHLS设备提取到2Mb大小的DNA片段（如图3）。并用CRISPR / Cas9基因编辑系统进行了基因组片段的靶向纯化，产生的198 kb的目标片段由SageHLS洗脱回收得到（如图4）。目标片段接下来可通过美国BioNano光学图谱测序技术或者英国Oxford公司的Nanopore测序系统进一步分析，也可以用传统的脉冲场电泳进行长度和带型检测。图3. 白细胞中提纯的高分子量DNA片段图4. 从大肠杆菌E.Coli原生质体中提取的198kb DNA片段(使用CRISPR/cas9核酸酶处理）对于大多数样品的纯化，SageHLS至少可以回收1μg的DNA，满足常规基因组应用需求。该设备的其它应用正在进一步开发中。环亚生物科技有限公司是美国Sage公司中国区总代理商，一直关注测序相关设备在国内的引进和开发，致力于协助国内客户更好、更快完成测序样本的制备工作，实现更高效率、更轻松的工作流程。

环亚生物科技有限公司是Genomic Vision在国内的独家代理，全新引进Genomic Vision的分子梳技术及其专利的GMC(Genomic Morse Code，基因组摩斯码）检测技术，为基因组结构和功能研究，以及遗传性等相关疾病检测开启了全新的可视化的精准单分子成像方案。此技术联合了专利的分子梳技术，可以单分子DNA拉直并固定在玻片上；同时，结合独特的可视化单分子检测方法，GMC,可以对我们感兴趣的区域（2kbp-几个Mbp）的染色体结构变异和稳定性，DNA 复制叉位点，DNA 拷贝数变异， DNA 损伤修复等事件进行可视化，快速，高通量的监测。Genomic Vision为医学和基础研究提供了长片段变异和DNA动态变化的精准成像分析方案，首次解决了以前技术中不能够精确进行分析甚至无法分析的基因拷贝数变化，基因转座，倒位，微卫星重复序列等结构变化，以及DNA动态变化，这些变化实际和某些遗传疾病息息相关。我们的技术是现有遗传分析，DNA测序以及DNA动态分析技术的有益补充。从长片段DNA的提取纯化到最终数据报告，Genomic Vision的分子梳平台为我们在单分子水平研究DNA动态变化和基因组结构变异提供了一体化的，灵活的，全自动的解决方案，此平台包含DNA提取，DNA分子梳，DNA染色，图像捕获和处理，数据分析等部分，其中分子梳可以单独购买。Fig.1 Genomic Vision Molecular Combing Platform平台功能和优势一、对2kbp-几个Mbp 的DNA结构进行可视化研究· 直接检测单分子变化 · 可检测极低丰度的变异和嵌合体· 可检测异源样本· 可对相邻的大范围的染色体重组进行全景式观察· 精确计算等位基因拷贝数· 检测片段缺失，重复，复制，反向等，方法简单，易于掌握· 可以准确鉴定外源性整合的DNA（如病毒DNA整合到宿主DNA）拷贝数，整合方式(单独，串联，或者分散整合）Fig.2 Copy Number Variation close to BRCA1. Allelic characterization of the RNU2 macro satellites. High sensitivity for allelic copy number, even for highly poly-morphicloci.Fig.3 Precise characterization of exogenous DNA integration: number of integrated 二、强大的可视化的在单分子水平研究DNA复制，损伤和修复的工具· 可保留遗传信息的连续性· 可直接可视化和定量研究· 可持续观察DNA损伤，修复，切除等，即使小切口也能准确检测· 对单分子的外切修复位点进行作图· 同时对多个RCA（Replication Combing Assay）进行分析Fig.4 Accurate measurement of DNA replication parameters. Thousands of signals of high quality on equally and parrall stretched molecules三 基因编辑或者基因工程的的DNA进行准确可视化的效率和质量控制· 可监测目标基因的编辑方式：缺失或者插入· 检测非特异性编辑时间· 定量分析编辑效率Fig.5 Visualize the CRISP/CAS-9 gene edit by Molecular combing systemsGENOMIC VISION 是一家致力于开发早期癌症检测，以及遗传相关疾病诊断方法和提供基因组研究工具的公司。公司已经开发出诊断FSHD的产品。通过其专利性的分子梳及GMC技术， GENOMIC VISION公司为制药公司，遗传学研究，疾病研究，诊断公司及诊断试剂开发公司等提供先进的解决方案。公司已经开发出了检测乳腺癌，结肠癌，肌肉无力症，HPV病毒感染的一整套方案，同时也为DNA动态变化包括DNA复制，损伤和修复，基因编辑等提供成熟的解决方案。 APG Bio Ltd（环亚生物科技有限公司）是中国领先的代理商，我们致力成为生命科学行业的资深信息传播者。方法的更新是生物学研究进 展的基础。我 们以敏锐的眼光和专业的态度，发现具有技术特色的新产品，并及时将其引入中国市场。同时，我们具备完整的营销系统，包括优化的产品线结构、有效的推广活 动、全国性的分销渠道和专业的售后应用支持。因此，APG Bio Ltd不单单是一个渠道品牌，更是一个有价值的信息枢纽。