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单细胞的成像,能用DESI吗?

Waters

2024/07/26 13:00

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解吸电喷雾电离技术(DESI)现已成为市场上广泛应用的成像技术,可实现更小的像素尺寸和更高的图像分辨率。对单细胞的测定,是现今前沿科学研究的热门方向,使用DESI XS能否进行单细胞的测试呢?

今年美国质谱年会(ASMS)上,沃特世展示了如何借助DESI™ XS进行5 μm空间分辨率的成像,从而实现对单细胞层面上的成像。

     



       
结论      
  • 兼容性与简易性:使用商用DESI XS离子源,无需重大改动即可实现5 μm左右的空间分辨率。

  • 高通量:低流量DESI非常稳定,适用于大样本分析(大于20个组织切片)。
  • 稳定性强:使用商品化的部件,保证稳定性和数据质量的情况下,进行超过35小时的长时间连续采集。
  • 高效率与高质量:在最低300 psi的背压、250 nL/min的流量下,可显著提高图像分辨率。利用HDI(1.8)软件以更高效地进行成像。



       
方法      

使用市售的 DESI 离子源(DESI XS,Waters)分析猪肝、人肾上腺和大鼠脑组织。DESI XS离子源配有高性能喷雾器、加热传输管路(HTL)和μBinary溶剂管理器流体系统(ACQUITY UPLC M-Class BSM)

为进行高分辨率低流量DESI分析,对该系统进行了一些可逆的微小改动:为改善溶剂输送,在溶剂管路中加入了1.7 μm(300 μm x 150 mm)ACQUITY C18色谱柱。


       
DESI设置如下      

     

     
  • 溶剂:95:5 MeOH:水      
  • 溶剂流速:200-250 nL/min      
  • 雾化气体压力:1.35 bar      
  • 毛细管电压:0.79-0.85 kV      
  • 喷雾头到样品表面的距离:<1 mm      
  • 喷雾头到离子进口的距离:3-5 mm      
  • 喷雾器角度:70°      
  • HTL:450℃(负模式) 250℃(正模式)      
   



       
Xevo™ G3 QTof质谱仪采集      

     

     
负离子和正离子模式,离子源温度为150℃,锥孔电压为80 V,所有其他设置均为默认值。  

HDI软件方法设置:使用250 nL/min的低流量设置,先以100 μm像素大小获取初始图像,然后以50 - 5 μm像素大小重新获取选定区域的图像。



       
研究结果      



       
分辨率高      

     

     

将溶剂输送流速从典型的每分钟2 μL降低到250 nL,可将喷射束直径从约20-25 μm减小到<10 μm,从而提高DESI的图像分辨率,使其达到细胞水平。

 

图1.纳升流动DESI与传统流动DESI的对比示意图。

利用低流量DESI的非破坏性,开发的数据驱动显微方法如下图所示。  
 

图2.HDI 1.8数据驱动显微镜工作流程,A)在模式选项卡中定义并获取低分辨率图像的初始区域。B) 在HDI中处理和检视图像。C) 在分析选项卡中选定感兴趣的区域。D) 将选定区域导入模式选项卡,并以更高分辨率采集。E) 在原始低分辨率图像上处理并显示高分辨率子区域。



       
兼容性与稳定性强      

     

     
低流量DESI能在多天采集的多个组织中保持稳定。在标准分析后,可以选定感兴趣的区域进行高分辨率分析。  

图3.左图:以50 μm分辨率采集的人类肾上腺癌组织图像。右上图:以5 μm分辨率重新采集的4号组织子区域。右下:Umap/DBscan对所需的5 μm区域进行分割的结果。


低流量DESI在高分辨率(10 μm像素大小)下长时间(大于35小时)采集也很稳定。

 

图4.左图:以10 μm像素尺寸绘制的整个大鼠大脑矢状切面,其扩展部分显示了小脑内部的细节。右图:数据组中与组织最相关20个的单异构离子。



       
效率与质量兼备      

     

     

将5 μm像素大小的图像与显微图像中看到的特征进行比较,估计达到的分辨率小于10 μm。

 

图5.A:图4中数据组一小块区域的扩展;B:A的Umap/DBscan分割结果,紫色部分与C中显微图像中的细胞相对应;D:重新采集5 μm处的区域,C中可见的细胞的分辨率有所提高。



       
后记      

       
解吸电喷雾电离(DESI)质谱技术越来越成熟,应用方向愈加广泛。现阶段来说,已可以朝着挑战单细胞成像的方向发展,如您有希望进行单细胞测试的合作意向,或希望了解更多DESI的应用方向,下载DESI应用文集,可扫描下方二维码告诉我们。  
 
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