PerkinElmer NGS整体解决方案助力新冠病毒的测序研究

PerkinElmer NGS全流程解决方案

1、病毒RNA提取：Chemagen自动化核酸提取方案

新冠病毒检测之Chemagen自动化核酸提取方案

2、病毒RNA质控及NGS文库质控：Labchip GX Touch

病毒RNA质控：由于不同样品之间病毒含量差异较大，不少样品病毒量稀少，在NGS文库构建需要进行RNA质控，了解RNA的提取质量情况对下游实验及数据分析等都有非常重要的意义。

我们创新的LabChip® GX Touch微流体技术提供了无与伦比的电泳分离效果。LabChip® RNA分析为大小介于100 至6000个核苷酸之间的RNA样品提供了一种快速简易的定量方法。利用RNA检测实验分析RNA样品，通过自动化步骤来进行样品定量和完整性分析，可以节省时间和金钱。LabChip的RNA分析能够为用户提供RNA浓度，以及核糖体RNA比值作为完整性检测的指标。RQS为一个介于0和10之间的质量评分，其中“10”表示样品完好无损。RQS与其它商业指标的相关度极好。

图示：RNA样品的降解过程，强制性的对完整的RNA通过加热一系列指定时间使之降解，以展示样品的降解过程。

NGS文库质控：构建好的NGS文库，可以利用NGS 3K试剂盒进行NGS文库的质控。LabChip DNA NGS 3K实验能够提供最灵敏的浓度检测范围(起始样品浓度5-500pg/μL)，已远远超过其他的DNA荧光标记技术。无论是何种应用，LabChip DNA NGS 3K检测都只需要很低的样本量。这个实验尤其适合有稀缺文库样本的质控。

图示：DNA NGS 3K实验可达成的灵敏度。同一NGS文库样本进行6次3倍系列稀释，实验结果展示了LabChip DNA NGS 3K的灵敏度及检测下限。数据结果由LabChip GX Touch仪器生成。

除了以上RNA质控及高灵敏度的NGS 3k芯片试剂，Labchip可以在同一个平台上完成高灵敏度DNA/RNA样品分析、弥散性DNA样本分析， 以及RNA和基因组DNA样本的完整性分析，且每个样品耗时可低至28秒。本系统既有最大批处理能力为24个样品、帮助节约时间和试剂用量的型号LabChip GX Touch 24，又有适用于高通量实验室的型号LabChip GX Touch HT，可达成384的处理能力。您可根据具体的应用选择适合的数据输出：电泳峰图、虚拟胶图或数据表格。

3、NGS建库自动化方案：自动化文库构建工作站

NGS建库流程复杂，对液体处理精准度要求高，利用自动化工作站进行NGS文库构建，具有流程标准化、样品之间重复性好，精准度好，通量高等特点。根据通量大小、自动化程度的不同，珀金埃尔默提供了多款自动化NGS文库工作站供选择。

Sciclone G3 NGSx iQ高通量自动化建库工作站，通过整合协同工作， 自动化程度获得极大提高： 一个Twister III五维机器人手臂、可存放27盒枪头的储板栈、高通量精准移液的Sciclone G3 NGSx文库制备工作站、内嵌桌面式Inheco ODTC热循环仪、直观图示化的用户界面、经PKI 专业开发验证、兼容不同品牌供应商建库试剂盒的NGS自动化建库程序，确保高质量的DNA或RNA的NGS文库构建。大量已经 验证的NGS建库程序，确保NGS文库的快速制备。使用这套无人值守自动化建库系统，您可以空出更多时间去做更具智力挑战性的工作，分析实验数据、设计您的下一个实验方案等。

Sciclone G3 NGSx iQ HT 高通量自动化建库工作站，基于Sciclone G3 NGSx iQ工作站做进一步升级，配备384通道移液头，内置抓扳手及外置Twister III五维机器人手臂、内嵌桌面式Inheco ODTC热循环仪。是目前市场上唯一 一款提供从核酸到文库的微型化、标准化、测试应用的仪器。反应的微型化节约了宝贵的试剂，并允许研究人员以相同的成本运行更多的样品。

Sciclone® G3 NGSx工作站是我们的高通量解决方案，适用于文库制备、序列捕获及样品归一化。该系统每周可制备多达480个文库或192个外显子组捕获文库，且灵活性极强，每轮能处理8到96个样品。此外，Sciclone® G3 NGSx工作站的全封闭平台设计，可使交叉污染降至更低水平。该系统在针对前PCR工作流程设计优化之余，同样适用于后PCR工作流程。

Zephyr® G3 NGS工作站是一个简单易用的文库制备系统，经过专门的设计和预编程，可应对新一代测序样品制备工作流程中的后PCR步骤――磁珠纯化、qPCR体系构建、样品归一化、样品混合（多重）实验。同时也是追求性价比的中通量实验室的前PCR建库系统的好选择。

JANUS G3 NGS Express(PLUS)工作站配备直观的文库制备应用界面，可实现片段化文库、扩增子、靶向捕获等文库制备及样品归一化。它是中低通量台式测序系统的完美补充。

4、NGS建库试剂：NextFlex 文库构建试剂盒

新型冠状病毒是具外套膜的正链单股RNA病毒，利用NextFlex Directional RNA-seq kit 2.0 可以构建链特异性RNA文库，通过对病毒的测序来进行病毒变异、宿主溯源等深入研究。

珀金埃尔默提供了行业领先的二代测序文库构建试剂产品组合，包含DNA、RNA、Small建库试剂，扩增子/探针杂交捕获试剂以及建库流程中使用到的接头和纯化磁珠。同时珀金埃尔默提供相应的自动化试剂盒包装，可以直接应用于珀金埃尔默的NGS自动化文库构建工作站。