高通量植物成像系统

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高通量植物成像系统相关的厂商

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    北京博普特科技有限公司成立于2008年,公司主要为植物、食品、生态、土壤、环境、气象、遥感行业提供科研仪器以及系统解决方案。涵盖田间表型成像系统、室内表型成像系统、种子表型成像系统、根系表型成像系统、显微表型成像系统等各个领域。公司主营产品有:WIWAM植物表型成像系统(RGB成像模块、多光谱激光雷达模块、叶绿素荧光成像模块、高光谱成像模块、近红外成像模块、计算机断层扫描模块、红外成像模块、3D激光雷达模块等);Videometer植物、种子多光谱表型成像系统、根系多光谱表型成像系统、VideometerLiq液体稳定多光谱成像系统、VideometerMic显微多光谱成像系统、Videometer Minilab 便携式多光谱成像系统、Videometer LabUV紫外光多光谱成像系统、VideometerLab XY高通量种子表型成像系统;Plant-Ditech公司的Plantarray高通量植物生理表型研究平台、植物逆境生物学生理研究平台、植物种质资源精准评价与鉴定平台以及SPAC分析系统;Fraunhofer研究院的便携式植物种子断层扫描系统、台式计算机断层扫描系统、全自动种子断层扫描系统、大型落地式根系表型成像系统;Hiphen 公司Airphen多光谱表型成像系统、Hiphen LITERAL手持植物表型冠层成像系统、Hiphen推车多光谱成像系统、Phenomobile全自动全植株智能表型成像车;HAIP 公司的BlackBird科研级高光谱成像系统、Blackbullet科研级高光谱成像系统、Blackbox科研级高光谱成像系统、BlackIndustry 工业级高光谱成像系统、Black mobile便携式高光谱成像系统;SeQso高通量种子表型与播种一体化系统、CF叶绿素种子成熟度测量仪、自动种子分拣系统(X光、多光谱、高光谱、叶绿素荧光);STEPS公司的植物生理生态监测系统、在线光合生理监测系统、土壤养分测量系统、植物养分测量系统、土壤5合1多参数测量仪、土壤直测PH计、盐度/活度检测仪;Pessl公司的植物生态环境智能传感器平台、植物物候远程监测系统;Inno-concept公司的植物活力胁迫测量系统、植物抗逆研究测量系统、气相离子迁移谱仪;Aquation水陆两用叶绿素荧光检测系统、经典和手持叶绿素荧光仪、Aquation公司的水下光合呼吸测量系统;EMS公司的便携式物联网乙烯气体分析仪、温室气体物联网监测系统;Cleangrow多参数离子测定仪、植物工厂自动8离子测定仪;Schaller全谷物湿度仪;EGC植物生长培养箱和生长室等等。
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    上海泽泉科技股份有限公司(Zealquest Scientific Technology Co., Ltd.)成立于2000年,是一家专注于高端科研设备研发、系统集成、技术推广、咨询、销售和科研服务的科技型技术企业。公司注册资金3500万元人民币,具有进出口贸易权。公司总部位于上海浦西,在北京设有分公司,在广州、成都、武汉分别设有代表处。公司全体员工均具有高等教育背景,其中80%的技术研发、技术支持和销售人员具有硕士和博士学位,参加过很多国家和省部级重大科研项目,具有丰富的科研工作经验。公司曾获得上海市高新技术企业、上海市普陀区科技小巨人企业、上海市科技型企业中华全国工商联合会/上海市工商联合会/上海市商会会员单位,曾是上海市专业技术服务平台——生理生态测量与分析平台的依托单位和上海市高新技术成果转化项目承担单位。2012年公司通过了ISO9001质量管理体系认证,获得AAA级信用资质等级认定,获得普陀区科技小巨人企业认定,成为上海市研发公共服务平台加盟单位和“上海市工商联合会”/“上海市商会”会员单位 。2015年获得“专精特新”中小企业认定。2016年成为“上海市生态学学会常务理事单位”和“上海种子行业协会”会员单位,2017年成为“上海市农业工程学会理事单位”。上海泽泉科技股份有限公司非常注重自主知识产权的申报和保护,截止2021年底已获得发明专利6项、实用新型53项及软件著作9项,国内外科研期刊发表科研论文20多篇。公司还参与承担了国家自然科学基金重点项目(41030529)和水利部948项目(200907)。公司秉承推进中国生态环境改善、农业兴国的理念,服务涉及植物表型组学和基因组学、植物生理生态、土壤、环境气象、水文水利、氢农业等领域的科研和技术支持,服务对象主要为各级科研单位、高校和政府机构。公司先后为科技部“973”项目和“863”项目、国家科技重大专项、国家科技支撑计划、国家“211”工程和“985”工程、中科院知识创新工程、农业部“948”项目、水利部“948”项目等提供技术咨询、仪器设备、系统解决方案和系统集成服务,为项目的顺利完成提供了有力支持。多年来,公司积极参与相关领域的学术会议,并定期举办相关仪器设备的技术讲座和培训班,在科研和监测领域产生了积极的反响,获得了良好的口碑。截止2021年底,泽泉科技举办公开技术讲座200多场,参会人员超过10000人次;同时在国内外应邀参加学术会议和展会200多次,与相关领域的客户有非常密切的交流合作。2014年2月,上海泽泉科技股份有限公司在上海浦东孙桥现代农业园区投资成立了上海乾菲诺农业科技有限公司,建设了AgriPhenoTM “高通量植物基因型-表型-育种服务平台”,为植物科研和育种单位提供全面的样品收集和栽培,实验设计和项目合作,以及表型数据与生物信息学分析综合服务。平台成功主持了上海张江国家自主创新示范区专项发展资金重点项目“泽泉科技高通量植物基因型-表型-育种服务平台”。作为主持单位或合作单位参与了上海市农委和科委的30多项政府科研服务项目以及商业服务项目,如科技兴农种业发展项目“农作物分子育种的技术创新研究”和“青菜高通量表型图谱标准的建立及主要性状分析”、科技兴农重点攻关项目“基于图像分析及三维建模技术的黄瓜长势快速评价方法研究”、 “兰科观赏花卉分子育种技术研究与产业化应用”等。为了紧追世界科技发展水平,开启院企合作建立研究型平台的创新尝试,上海泽泉科技股份有限公司与上海市农业科学院,结合双方各自的优势,于2021年5月在上海农业科学院庄行试验站联合成立“上海市农业科学院庄行综合试验站泽泉科技植物表型技术研究平台”,AgriPhenoTM平台从上海浦东孙桥现代农业园区整体迁出,并入新建的植物表型技术研究平台。目前平台除拥有无人机表型平台、温室型和实验室型高通量表型分析系统外,还拥有现代化温室、生物学实验室、植物生理生态测量设备、农业气象测量系统和专业的数据库平台,已经具备了对植物、动物基因测序与植物表型研究的各类条件。可以承担高通量DNA提取、基因测序服务、分子辅助育种、植物生理生态研究等科研实验任务。同时可以为植物功能基因组、农业育种家提供高通量植物基因型测试、高通量植物表型测试和植物基因型-表型生物信息学数据分析等开放式服务。公司积极响应上海市政府“崇明世界级生态岛建设”的发展方向,2016年12月泽泉科技在崇明城桥镇投资成立了子公司—上海金盏农业发展有限公司,扩展建设田间智能化育种服务平台,以及智能化农业物联网“农业云平台”,以生态乡村、能源乡村的发展模式,展示并实施公司自主研发的先进的农业楼宇基础设施、温室与田间的智能化“多因子”调控的栽培管理模式;拟建成拥有田间型高通量表型分析系统的“AgriPheno智能化育种服务平台”,提高上海种业商业化育种的进程,并服务于全国和国外相关育种科研单位。展望未来,上海泽泉科技股份有限公司希望在社会多方资源的支持和关怀下,不断提升自己,为社会提供更多、更优秀的产品和一流的服务!
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  • 武汉宇鑫泽科技有限公司主要代理美国SDI的相关产品,BSS+水深及水底沉积物分析系统,Vibecore-mini和Vibecore-D型高频水底沉积物取样器,另外有高通量组织球磨仪、酶标分析仪、PCR仪和凝胶成像等其他实验设备。详情请关注我们的官方微信。
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高通量植物成像系统相关的仪器

  • 全自动、高通量对大量植株进行成像特别适合植物功能基因组学和植物表型组学遗传育种、突变株筛选、表型筛选的强大工具机器人技术、图像分析和大规模计算能力的完美结合 实验室高通量植物成像系统&mdash &mdash Scanalyzer HTS是一套可以全自动、高通量对大量小植株进行成像的系统,可以选择配置可见光(VIS)成像、近红外(NIR)成像、红外(IR)成像、荧光成像或激光扫描3D成像(只适合高度15 cm以下的小植株)中的一种或多种。成像系统带程控移动装置,可以在X轴和Y轴上进行移动,并配有射频或条形码读取器。Scanalyzer HTS系统通过软件控制摄像头移动到样品上方(多孔板或小盆)进行拍照,照片数据与该样品的电子标记(射频或条形码)一起存储。软件也可控制摄像头对多孔板上的每个孔进行单独成像,每个孔的数据分布存储(告诉软件多孔板类型,然后自动编码,如A01、A02&hellip &hellip )。(下载演示视频)软件可以控制系统每天自动对样品进行成像,获得样品成像的时间动力学变化。只要点击样品的编码,就可以获得样品的图像及分析数据的时间动力学变化,并可进行复杂的统计学分析和图表分析。系统提供顶部光源和底部光源,并可通过软件控制光强变化。根据测量样品数目的多少,可以选择配置4、24、48或72个多孔板的版本,不同版本的外观尺寸差别很大。如有特殊需要,可以定制更大版本。由于全自动、高通量测量获得的数据非常庞大,本系统必须配置服务器来存储数据。选购PHP远程数据库软件,还可以对系统进行远程原理、控制和分析。主要功能◆ 全自动、高通量对植物等小型样品进行可见光成像、近红外成像、红外成像、荧光成像(包括整株GFP成像)和/或激光扫描3D成像(每套系统可选择一种或多种)◆ 通过可见光成像可以测量植物的结构、宽度、密度、对称性、叶长、叶宽、叶面积、叶角度、叶颜色、叶病斑、种子颜色、种子颜色面积等等50多个参数◆ 通过近红外成像可以分析植物的水分分布状态、水力学研究、胁迫生理学研究等◆ 通过红外成像可以进行植物干旱胁迫研究、蒸腾研究等◆ 通过荧光成像可以分析植物的生理状态◆ 样品可以是培养在多孔板中(如12、24、48、96、384孔板),也可以是长在小花盆中。◆ 高通量测量大量样品,标准配置可选择装4、24、48或72个多孔板的版本◆ 花盆大小范围,直径3.64 ~ 20.51 cm,高2.79 ~ 15.44 cm◆ 可选择成像分辨率,特别适用于96孔板高精度测量◆ 进行动物/昆虫的游动/运动测试时,可自动获取图像应用领域植物功能基因组学、植物表型组学、遗传育种、突变株筛选、植物生理学、农业科学、植物病理学、植物形态建模、植物生物信息学、种子生理学、种子病理学、植物胁迫生理学、植物水力学等研究领域。HTS系统的成像扫描模式多孔板扫描模式整个多孔板像素每个孔的像素每个板扫描1次1 228 80012 800每个板扫描4次4 915 20051 200每个板扫描9次11 059 200115 200每个板扫描16次19 660 800204 800每个板扫描96次117 964 8001 228 800应用实例◆ 整盆拟南芥的GFP成像实验室型高通量植物成像系统Scanalyzer HTS特别适合于拟南芥植株的整株甚至是整盆的GFP成像。软件可以自动过滤掉盆和土壤引起的噪音,把有用的图像抽提出来进行进一步分析。对于不同的GFP,可以定制激发波长。下图是整盆拟南芥的eGFP成像。◆ 通过荧光成像进一步分析植物的生理状态植物的可见光成像更多的是反映植物的表观信息,对生理状态的反映有限。而荧光成像可以较深入的反映到植物的生理状态,如下图中,热水处理部分叶片后,可见光成像看不出有什么区别,而荧光成像则可以反映出受损伤的部位。热水处理部分叶片(红框区域)后的可见光成像原始照片和软件成像热水处理部分叶片(红框区域)后的荧光成像原始照片和软件成像◆ 植物的生长动力学变化高通量Scanalyzer HTS系统特别适合于研究植物的形态学指标和在生长过程中这些指标随时间的动力学变化,如下图就是利用Scanalyzer HTS系统研究的拟南芥植株面积随时间的动力学变化。利用Scanalyzer 3D系统可以研究玉米等大植株整个生活史的动力学曲线,各种形态学指标都可以测量。t = 0 dt = 4 dt = 7 dt = 11 d基于面积的植株生长动力学曲线◆ 利用表型参数的雷达图进行植株分类通过Scanalyzer HTS系统可以获得大量的植物表型参数,利用这些表型参数绘制的雷达图,可作为反映植株形态的&ldquo 指纹图谱&rdquo 。根据这种&ldquo 指纹图谱&rdquo 可以对植株根据表型进行分类,特别适合于数量性状基因座(QTL)研究。下面两个图根据拟南芥的表型雷达图进行的植物分类,对于其它大型的农作物用Scanalyzer 3D系统测量后,也可以获得类似的结果。利用表型参数的雷达图进行植株分类南芥表型参数的静态雷达图(&ldquo 指纹图谱&rdquo )利用5种参数做的雷达图,分类结果用颜色显示。数据为拟南芥生长到第13天时的结果。更多详细介绍,请点击链接:
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  • &ldquo 温室自动化 + 高通量成像&rdquo 技术机器人技术、图像分析和大规模计算能力的完美结合全自动、高通量对大量植株进行3D成像,从幼苗到成株皆可特别适合植物功能基因组学和植物表型组学植物表型和生理研究的强大助手遗传育种、突变株筛选、表型筛选的强大工具全自动高通量植物3D成像系统&mdash &mdash Scanalyzer 3D是一套可以全自动、高通量对大量植株(从幼苗到成熟植株即可)进行成像的系统,可以选择配置可见光(VIS)成像、近红外(NIR)成像、红外(IR)成像、荧光成像或根系近红外成像中的一种或多种,每个成像模块包括顶部和侧面两个摄像头,结合样品旋转装置,就可以对植株进行3D形态学分析。如果做小植株(15 cm以下),也可选配激光扫描3D成像。每一种成像模块都有单独的成像区域(&ldquo 暗房&rdquo ),依次进行成像分析。(下载演示视频) 小型版只能自动传送10盆植物,需手动更换花盆大型定制版(温室版)可自动传送1200盆植物的系统该系统通过可见光成像可以测量植物的结构、宽度、密度、对称性、叶长、叶宽、叶面积、叶角度、叶颜色、叶病斑、种子颜色、种子颜色面积等参数;通过近红外成像可以分析植物的水分分布状态、水力学研究、胁迫生理学研究等;通过根系近红外成像分析植物根系和土柱中的水分分布情况;通过红外成像可以进行植物干旱胁迫研究、蒸腾研究等;通过荧光成像可以分析植物的生理状态。由于所有植物都通过条形码或射频标记,其整个生活史的的不同阶段所有的表型数据都可定期进行测量。整套系统包括传送带、成像模块、&ldquo 暗房&rdquo 、运输车、浇水和称重装置、控制系统等。其中传送带、运输车和植物在温室中运转,所有的植物可以由软件控制在传送带上进行动态分布,以避免由于温室中的光、温、湿分布不均匀造成的影响;成像模块、&ldquo 暗房&rdquo 、浇水和称重装置安装在独立的空调房中,并通过传送带与温室相连。分析模式有两种:一种是软件控制温室中的植物定期传送到&ldquo 暗房&rdquo 进行成像分析;另一种是人工携带生长在其他温室中的植物放到&ldquo 暗房&rdquo 前的传送带上,进行成像分析。软件通过成像分析的结果,根据表型数据可以对植株进行高通量筛选。通过对成像结果的分析,可以进行表型组学研究。目前我国对于作物的研究主要是利用传统的遗传育种方法以及基因组学的方法进行研究, 然而仅停留在基因组学研究水平上显然是不够的,并不能全面、彻底地阐明作物的生理功能,特别是作物表型与其产量、生理状态之间的相互关系,以及不同的环境条件对作物生长状况、产量、种质质量等的影响。这就需要对作物进行表型组学的研究,通过研究不同的表型性状来确定作物的遗传性状,并且寻找不同环境因子对作物各种指标影响的阈值,从而能够更加科学地阐明作物生长机理,指导作物生产。 ◆ 3D成像可选VIS、NIR、IR、根系NIR成像、荧光成像中的一种或多种,每种成像有独立的摄像区域(&ldquo 暗房&rdquo ),每个&ldquo 暗房&rdquo 的顶部和侧面各安装一个摄像头(拍摄顶部和侧面成像)。花盆底座有旋转装置,可以360度旋转,这样可以获得植株4个侧面的成像信息。结合顶部成像,可以获得完整的植株3D成像信息。针对15 cm以下的小植株,可以选择配置激光扫描3D成像,获得详细的三维形态学信息。◆ 自动传送系统带自动传送装置,所有花盆上都有电子标签,所有拍摄数据根据电子标签归档。可选传送50、100、150、250、375、500、800、1400盆或更多盆的传送装置,花盆和植株的重量可以为1、4、10或25 kg,更重需要定制。◆ 自动浇水和称重装置在温室系统中,可增加自动浇水和称重装置,软件控制对不同编号的花盆采用不同的浇水量,并每日对花盆进行称重。◆ 自动加营养盐装置在温室系统中,与自动浇水装置结合,可以在浇水的同时补充营养盐。◆ 自动喷淋装置在温室系统中,根据电子标签由软件控制是否喷洒农药,可用于检测农作物对农药的抗性或敏感性。◆ 自动分选在温室系统中,只要在传送装置上增加多级T-Junction(丁字路口),就可根据成像结果对大批量的植株进行分选,分选用的阈值参数可以由用户设定,分选级数取决于T-Junction的数目。◆ 服务器存储由于数据量非常大,本系统必须用服务器存储数据。◆ 软件分析软件分析功能非常强大,可以通过植株的编号(电子标签)调出整个生活史的数据,进行时间动力学分析,对拍摄的照片进行动画演示,对同一植株的时间动力学数据进行图表统计分析,对不同植株的数据进行复杂的统计学分析和图表分析。◆ 远程管理通过专用远程服务器管理软件,可以在异地对本系统的运转状况进行监测、改变测量程序或分析测量数据。◆ 系统大小最简单的只能传送10盆植物的系统可以安装在室内,高度(Y轴)是4 m,宽度(Z轴)是2 m。如果只配置一个成像模块,则系统长度(X轴)是4.5 m,每增加一个成像模块,系统长度(X轴)增加1.5 m。传送上百甚至上千盆植物的系统,多安装在温室内。实际大小可根据现场情况进行定制。主要功能◆ 全自动、高通量对植物等小型样品进行可见光成像、近红外成像、红外成像、荧光成像(包括整株GFP成像)和/或激光扫描3D成像(每套系统可选择一种或多种)◆ 通过可见光成像可以测量植物的结构、宽度、密度、对称性、叶长、叶宽、叶面积、叶角度、叶颜色、叶病斑、种子颜色、种子颜色面积等等50多个参数◆ 通过近红外成像可以分析植物的水分分布状态、水力学研究、胁迫生理学研究等◆ 通过根系近红外成像分析植物根系和土柱中的水分分布情况◆ 通过红外成像可以进行植物干旱胁迫研究、蒸腾研究等◆ 通过荧光成像可以分析植物的生理状态测量参数* 植株高度、宽度和密度* 植株结构分析、骨架分析、紧密性分析、对称性分析* 叶片长度、宽度、叶角度、叶面积* 植株紧凑性(叶角度和紧密性)* 植株体积* 植株和叶片的颜色分析,包含发育状态、病理学等信息* 植株鲜重* 植株和叶片含水量、玉米水分利用效率* 植株生长速率* 种子颜色、种子数目* 开花时间、花穗颜色、大小、性状等应用领域植物功能基因组学、植物表型组学、遗传育种、突变株筛选、植物生理学、农业科学、植物病理学、植物形态建模、植物生物信息学、种子生理学、种子病理学、植物胁迫生理学、植物水力学等研究领域。技术优势和先进性请联系我们获取电子版资料。 可以自动传送10盆植物的小型系统T-Junction分选自动灌溉装置侧面、侧面旋转90度和顶部成像应用实例◆ 植物颜色分类植物的颜色是反映植物健康状态的关键指标之一,而人肉眼对颜色的敏感度较低,存在较大的视觉误差。利用Scanalyzer系统可以在拍摄植物可见光照片的基础上,通过软件对获得的颜色信息进行锐化处理,从而使原本肉眼不易区分的颜色差别,显著的区分开来。 可见光成像 软件锐化处理后的图像◆ 植物骨架/结构分析植物骨架和架构信息,是非常典型的植物表观信息,是农业信息学的重要研究内容。对于杂交育种而言,Scanalyzer系统有助于快速进行表型筛选,也可用于了解整个生活史以及受到胁迫后的骨架/结构变化。 植物骨架分析植物结构分析◆ 植物形态学分析成像后,通过Lemna Tec公司专业的软件工程师团队开发的软件,可以对植物进行详细的三维形态学分析。对于所拍摄的每一张图片,都可获得50多个形态学参数。 对于本图而言,可以获得单个叶的长度、单个叶的面积、平均叶宽、茎长、茎宽、茎体积、弯曲度(Bent index)、叶卷曲指数(Leaf curling index)、叶朝向(Leaf orientation)、单个叶的颜色分类等等指标。本图用于详细的植物朝向、角度分析。 通过顶部成像和多个侧面成像,可以获得植物X、Y、Z三个轴的信息,根据各个方向的叶面积、茎长、茎宽、叶长、颜色等来估算植物的生物量。实验证明这种估算的生物量与实际生物量有非常好的线性关系。 X轴为实际鲜重,Y轴为通过成像参数估算的鲜重二者有非常好的线性关系由于转基因植物有很高的形态变异性,因此对叶片和茎杆进行定量非常重要◆ 利用近红外(NIR)成像分析植株和土壤的水分利用情况近红外成像可以直观的反映植物不同部位的含水量,通过软件处理加上代表不同含水量的颜色后,可以非常直观的看出不同处理下植株不同部位的含水量变化。如果植物是生长在专用土柱中,还可以对植物根系和土壤的含水量变化进行定量分析。 玉米停止浇水8 h后(轻度干旱处理),植株含水量的变化可以通过近红外成像明显从看出来,特别是老叶片失水严重。不同叶片的失水情况还可以通过软件获得数据,并可做图表分析。 土柱和玉米整株的近红外成像(原始图像)干旱过程中土柱的含水量变化干旱0 h和8 h时土柱中不同层的含水量分布注:LemnaTec公司设计的土柱筒,是透明聚丙烯塑料材质,内装自然土壤,高50 cm,直径5、8或10 cm,装土1.5 3.0 5.0 kg,底部有排水孔。培养时土柱外部套上不透明PVC管遮荫,放置苔藓和土壤藻类滋生,测量时将遮光管取下即可。◆ 利用近红外(NIR)成像分析NIR成像分析小麦干燥过程中含水量的变化本例是小麦在高温处理下,植株含水量的时间动力学变化可以通过NIR成像直观的反映处来,并进行定量分析。 高温处理16 h,小麦的NIR成像变化小麦植株含水量变化的定量分析,可以看出,随着高温处理时间的延长,小麦含水量逐渐降低◆ 利用红外(IR)成像检测植物温度差异红外成像,也叫热成像,用于检测植株的温度变化。由于植株温度与植物的蒸腾作用和含水量密切相关,因此红外成像常用于干旱胁迫研究、群体蒸腾等领域。 通过肉眼很难区分哪株玉米受到干旱胁迫 通过红外成像,明显看出右边的玉米温度更高,说明含水量低,受到干旱胁迫◆ 利用红外成像反映小麦气孔的关闭照光时气孔开放,叶片进行蒸腾作用。关光4 min后就检测到叶片温度的显著上升,说明气孔开始关闭。Scanalyzer 3D系统可以非常灵敏的检测气孔状态。 随着时间的延长,气温与叶片温度的差异越来越小,说明气孔逐渐关闭◆ 静态根密度分析析Scanalyzer 3D系统可以拍摄生长在土柱中的植物根系可见光照片,软件自动分析土柱表层的根系。由于土柱的运输车下自带程序控制的旋转台,就可以通过软件控制自动顺序旋转90度角来完成4个不同侧面的成像,获得更完善的根系信息。 不同植物根系的静态分析同一株植物4个侧面的根系成像◆ 根系动态生长分析析Scanalyzer 3D系统可以全自动、高通量的拍摄植物根系照片,结合电子标签,就可以对特定编号的植物根系数据进行时间动力学分析。从下图中的结果可以看出,从第35-100天,根生长最快,从表层有大量的根往下生长,从第35-60天,浇水过量,导致底部很多根死亡。 左图示出了一株植物根系随时间的生长发育过程,右图示出的是不同时间点的根系覆盖面积随深度分层的变化◆ 鉴定非转基因植物喷洒农药后,没有转入抗农药基因的植物,可以通过颜色鉴定出来。 ◆ 植物个体和群体的形态学应用举例Scanalyzer 3D成像系统可以获得大量的形态学参数,并且针对不同的材料,可以获得有针对性的参数。下面是几个例子: 水稻植株成像的部分参数:* 叶片长度(即使交叉也可测量)* 叶片面积* 叶片颜色* 植物高度* 植物宽度* 叶片密度* 叶片朝向 稻穗成像的部分参数:* 稻穗面积* 稻穗颜色* 稻穗长度* 稻穗最大长度* 稻穗结构* 稻穗骨架(skeleton) 群体表型成像的部分参数:* Criteria of plant growth* 高度* 紧密性(Compactness)* 叶朝向&ndash 弯曲指数* 密度* 对称性* 单位高度的平均植物宽度基于复杂的形态学指标的表型分析:* 结构朝向* momentum of inertia* 高度* 宽度* 圆度(roundness)* 紧密性◆ 植物开花过程的动态监测由于绝大多数植物的花的颜色与茎叶不同,利用Scanalyzer 3D成像系统的高通量、全自动、带电子标签的特性,就可以自动监测植物是否开花、开花时间、花朵数目、花朵发育阶段、花败时间等信息。 开花过程监测的部分参数:* 叶面积* 白化(Chlorosis)* 黑斑(Necrosis)* 衰老(Senecence)* 角果数目* 角果长度* Start flowering* End flowering* Stay green* Morphology* 生长速率Scanalyzer 3D系统与PL和HTS系统的比较 Scanalyzer PLScanalyzer HTSScanalyzer 3D高通量否是是小植株成像是是是96孔板成像是是否大植株成像否否是根系研究否否是可见光成像可以可以可以,3D荧光成像可以可以可以,3D红外成像可以可以可以,3D近红外成像可以可以可以,3D根系近红外成像否否可以,3D激光扫描3D成像否可以可以,只限高度15 cm以下的小植株部分用户* 澳大利亚植物功能基因组中心(Australian Centre for Plant Functional Genomics)位于阿德雷德(Adelaide)大学,建有澳大利亚植物表型组设施(Australia Plant Phenomics Facility)&mdash &mdash 植物加速器(Plant Accelarator)和高精度植物表型组中心(The High Resolution Plant Phenomics Centre)。2010年1月28日,造价超过3000万美金的&ldquo 植物加速器&rdquo (The Plant Accelerator)正式运行,并对全球科学家开放。&ldquo 植物加速器&rdquo 是一套国际上到目前为止进行植物表型组研究的最复杂、造价最昂贵的设备。它的核心由4个140平米的温室以及两套&ldquo 全自动高通量植物3D成像系统Scanalyzer 3D&rdquo 组成,所有进行植物表型研究的成像设备,包括传送带、成像模块、&ldquo 暗房&rdquo 、运输车、控制系统等都由德国LemnaTec公司提供。每套Scanalyzer 3D系统占有两个140平米的温室,带可见光成像、近红外成像、根系近红外成像、红外(热)成像和荧光成像模块,以及自动浇水和称重的设备,并配有可自动传送2400盆植物的传送带和运输车。两套Scanalyzer 3D系统的传送带长度加起来达1.2公里。如果两套系统24 h连续运转,每天可以获得4000-6000盆植物的表型成像数据,一年可以获得30-60T的数据量。根据实际实验情况,预计&ldquo 植物加速器&rdquo 一年可以进行16万盆植物的实验。高精度植物表型组中心有一套不带温室传送的基础型Scanalyzer 3D系统,已运转多年。* 法国农业科学研究院(I&rsquo institut National de la Recherche Agronomique,INRA,French National Institute for Agricultural Research)是世界上最有科研实力和竞争力的农业研究机构之一。INRA Montpelier(蒙彼利埃)正在建设一套传送1400盆植物的系统,2010年中完工;INRA Dijon(第戎)正在建设一套传送1482盆植物的系统,2010年底完工。* 德国莱布尼茨植物遗传和作物研究所(Leibniz-Institut fü r Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung,IPK,Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research)IPK是德国的著名公立研究所,在大麦杂交育种方面很有名。到2010年底有三套Scanalyzer系统运转:1) 目前正在运转一套能600盆植物的系统,专门做大麦研究2) 一套做拟南芥的S惨案了原则让 3D系统,能传送600盆拟南芥,2010年春天投入运转3) 目前正在建设一套大的能传送600盆玉米的系统,预计2010年底投入运转* 意大利麦塔庞特市植物生物技术研究所(Metapontum Agrobios Research Centre for Plant Biotechnology)归政府所有,但以企业化运作,特点在于小麦、西红柿等的基因改良。有一套能传送500盆植物的系统,2009年开始运转* 先锋(Pioneer)/杜邦(Dupont)先锋良种国际有限公司是杜邦集团的子公司,是国际玉米育种巨头!先锋从2005年开始运转一套能传送1500盆植物的系统。* 荷兰Keygene公司在瓦赫宁根,是几家农业公司合资建的一个做研究的公司,有一套小的系统在运转,正在建设一套能传送1100盆植物的系统。LemnaTec公司与Keygene公司合作,承担了一个EuroStar的PhenoCrop项目:Innovation in vegetable plant breeding by large scale deep phenotyping。项目目的:&ldquo The overall objective is to develop new deep phenotyping applications for the LemnaTec Scanalyzer for vegetable crops. Correlation of genotypic data and phenotyping results will lead to new molecular markers or gene clones that positively contribute to complex commercial traits in vegetable plants&rdquo 。项目总经费达142万欧元,预计2011年结题。* 巴斯夫(BASF)国际化工巨头,从1998年开始介入植物科学研究,兼并了比利时CropDesign公司,并与孟山都有密切合作,在玉米、土豆、甜菜、苜蓿等的遗传育种方面取得了丰硕成果。2006年,BASF USA和BASF Germany分别建立了一套能传送800盆和300盆植物的Scanalyzer 3D系统。* 英国草地与环境研究所(Institute of Grassland and Environmental Research,IGER)正在建设一套可以传送800盆植物的系统,预计2010年底或2011年初运转* 拜耳作物科学公司(Bayer CropScience)是拜耳集团三大业务子集团之一、全球领先的创新型作物科学公司。拜耳作物科学公司的销售额(2009年)为65.10亿欧元,约占拜耳集团销售额的20.8%。拜耳作物科学公司在水稻、油菜以及蔬菜育种方面占有很大市场份额。到2010年中,Bayer CropScience Belgium将建成一套可传输600盆植物的系统;到2010年底,Bayer CropScience Germany将建成可传输1200盆植物的系统。更多详细介绍,请点击链接:
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  • 用途:凭借数十年植物科学研究的经验而设计出的PlantScreen植物表型成像分析系统,可用于高通量植物表型监测、植物构架量化以及在自然环境、温室和野外条件下高精度控制测量。 PlantScreen植物表型成像分析系统整合了叶绿素荧光动力学成像、植物形态学和RGB真彩3D成像、植物热成像、植物高光谱成像、植物近红外成像、自动条形码识别管理、植物图像控制软件和植物表型数据分析等系统,通过外接传感器和软件系统可测量光合有效辐射、空气温湿度、CO2、风速等环境因子,用于植物高通量表型成像分析测量、植物胁迫响应分析测量、植物生长分析测量、植物生态毒理学研究、性状识别及植物生理生态分析研究等。 特点:专业定制,根据用户实验需求量身定制;测量参数多样,有热成像、RGB成像、叶绿素荧光成像、高光谱成像、近红外成像等全方位测量参数;适用于多种类型的研究对象,拟南芥、水稻、小麦、玉米等;成像面积大,单幅成像达40cm x40cm;成像分析平台尺寸大,宽10m,高度可调至2.5m,样带轨迹长度100m;可外接环境气象因子传感器,综合分析环境因素的影响;用户可编辑测量程序(protocols),满足特殊实验需求。 技术规格:系统主体成像分析平台宽10m,高度可调,最大2.5m,可沿10m宽样带移动成像,样带轨迹长度100m外接传感器外接传感器和软件可采集PAR、CO2、空气温湿度、风速GPS带GPS精准定位系统实验程序预设常用实验程序(Protocols),用户可自定义、编辑实验程序叶绿素荧光成像系统测量和计算的参数Fo, Fm, Fv, Fo’, Fm’, Fv’, Ft, Fv/Fm, Fv’/Fm’, Phi_PSII, NPQ, qN, qP, Rfd等几十个叶绿素荧光参数成像面积40cm x 40cm测量光橙色620nm光化学橙色和白色双色光饱和光白色或蓝色,最大光强3600μmol.m-2 .s-1镜头分辨率1024 x 768像素,7位滤波轮RGB成像测量参数叶面积、植物紧实度、叶片周长、偏心率、叶圆度、叶宽指数、叶片细长度SOL、植物圆直径、凸包面积、植物质心、节间距、生长高度、植物三维最大高度和宽度、相对生长速率、叶倾角、节叶片数量、其他用于植物适合度估算的颜色定量分级、绿度指数成像位置顶部及侧面全方位成像分辨率500万像素高光谱成像测量参数归一化指数、简单比值指数、改进的叶绿素吸收反射指数、最优化土壤调整植被指数、绿度指数、改进的叶绿素吸收反射指数、转换类胡萝卜素指数、三角植被指数、ZMI指数、简单比值色素指数、归一化脱镁作用指数、光化学植被反射指数、归一化叶绿素指数、Carter指数、Lichtenthaler指数、SIPI指数、Gitelson-Merzlyak指数光谱范围380-1000nm光源LED,光强50-1000μmol/m2s热成像分辨率640x480nm温度范围20-120°C灵敏度NETD0.05°C@30°C/50mK成像面积35x35cm近红外成像波长范围1450-1600nm RGB成像 叶绿素荧光成像 高光谱成像 近红外成像 热成像 控制软件 产地:捷克
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高通量植物成像系统相关的资讯

  • PlantScreen高通量植物表型系统火热安装中”系列报道(一)
    癸卯春节 安装启动! 2023年农历春节,各地沉浸在轻松欢快的节日氛围,而在中国农科院作科所的温室里,中国农科院的研究人员、PSI公司和北京易科泰公司的工程师投身于PlantScreen高通量植物表型系统——作物高光效高效筛查与鉴定表型平台的安装工作中,现场一片火热繁忙的景象。 从正月的初三到十四,短短的两周时间里,PlantScreen高通量植物表型系统平地而起。庞大的规模、现代感十足的外观、火热的安装场面,吸引假期期间仍在温室里辛苦劳作的研究人员纷纷驻足观看,询问安装进度,热切表达了希望未来能够使用这套系统开展实验的愿望。 PlantScreen高通量植物表型系统由国际知名的表型系统制造厂商PSI研发,整合了LED植物智能培养、自动化植物传送、多种光学成像传感器(FluorCam叶绿素荧光成像、多光谱荧光成像、可见光近红外及短波红外高光谱成像、植物热成像、RGB真彩3D成像、激光雷达3D成像、根系成像等)、自动条码识别管理、自动称重与浇灌、电脑自动控制及数据处理等多项先进技术,能够以最优化的方式对大量植物样品的生理状态、生化组分、形态结构的进行自动成像分析。 系统有效解决了传统植物表型分析技术中存在的精度低、费时费力、适用性差等问题,具备高效准确的特点,并可实现全生育期的无损动态监测;被广泛用于研究不同环境因子及基因型对植物生长、产量、质量的影响,揭示可控环境下基因组与环境等因素互作进而调控作物表型的分子机理。截止2020年底,PlantScreen在全球累积销售/装机量超过50台。主要用户有荷兰瓦格宁根大学、德国莱布尼茨植物遗传和作物研究所、芬兰赫尔辛基大学、澳大利亚国立大学等全球知名的农业学府和顶级研究机构(下图中的PlantScreen系统于2020年安装在都柏林大学),也不乏杜邦先锋、孟山都、巴斯夫等农业企业巨头。 作为PSI公司的合作伙伴和大中华区技术服务中心,成立20年来北京易科泰生态技术有限公司致力于精密、高端植物和藻类实验设备和技术的引进推广及自主研发,迄今为止已为中科院植物所、中国农科院、中科院水生所、中国农业大学、西北农林科技大学等国内知名农业院校和机构提供了大量仪器设备及技术支持。此次安装的PlantScreen高通量植物表型系统通量为4000株种苗/200株成体,配备FluorCam叶绿素荧光成像、RGB真彩3D成像、激光雷达3D成像、植物热成像和高光谱成像等传感器,具备自动称重与浇灌功能,将主要用于水稻等作物高光效高效筛查与鉴定、作物高光效机理研究及新材料创制。 立春已过,农耕将始。今年春天,除了位于北京的中国农科院生物技术研究所,中国水稻研究所(杭州)和东北地理与农业生态研究所(长春)也正在或者即将紧张有序地进行PlantScreen系统的安装。高通量作物表型监测被称为育种的加速器。毫无疑问,PlantScreen高通量植物表型系统的安装运行能够帮助中国作物遗传育种学家深入剖析与产量和胁迫耐受性相关的遗传学数量性状,必将为具有国家战略意义的分子设计育种和种质资源开发应用提供强有力的技术支撑。截止发稿前,农科院生物所PlantScreen系统的安装工作已基本完成,即将进入调试和试运行环节,并将合作举办培训研讨。
  • 375万!中国科学院武汉植物园高通量全波段光合成像仪等采购项目
    项目编号:OITC-G220321516、OITC-G220321517、OITC-G220321518项目名称:中国科学院武汉植物园高通量水分含量图谱检测仪等采购项目采购方式:竞争性磋商预算金额:375.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):375.0000000 万元(人民币)采购需求:1、采购项目的名称、数量:包号货物名称数量(台/套)是否允许采购进口产品采购预算(万元人民币)1高通量水分含量图谱检测仪1套是852高通量全波段光合成像仪1套是1603可见光高光谱分析检测仪2套是130供应商须以包为单位对该包中的全部内容进行响应,不得拆分,不完整的报价将被拒绝。竞争性磋商及评审、推荐成交供应商以包为单位。2、技术要求详见公告附件。合同履行期限:详见采购需求。本项目( 不接受 )联合体投标。
  • Resonon | WinRoots:用于土壤胁迫下植物表型研究的高通量栽培和表型分析系统
    土壤是重要的自然资源,地球上95%的食物来源于土壤,土壤保存了至少四分之一的全球生物多样性,不仅是粮食安全、水安全和更广泛的生态系统安全的基础,更是为人类提供多种服务、帮助抵御和适应气候变化的重要因素。由土壤组成造成的胁迫,例如盐、重金属和养分亏缺是作物减产的主要原因。作物土壤耐逆性是一种复杂性状,涉及植物形态、代谢和基因调控网络等多种遗传和非遗传因素的调控。传统的作物表型研究通常在田间进行,费事费力、劳动密集、低通量、且受研究人员无法控制的自然环境因素的影响。在此情形下,难以获得高精度的表型数据以满足表型组学的研究需求。在过去几十年,已经开发了几种HTP(高通量表型)平台在现场或可控条件下使用,但其运维成本极高。此外,作物表型相关研究通常只关注植物地上部分,而对根系形态数据的获取有限。然而,根系是植物吸收水分和养分的主要途径,也是碳水化合物的储存器官和土壤胁迫的直接感知器官。因此,根系表型是土壤胁迫条件下植物表型研究的重要组成部分。就通量、环境可控性和根系表型获取而言,现有的植物表型平台无法完全满足植物对土壤胁迫响应的表型组学研究的特定需求。基于此,在本文中,来自山东大学生命科学学院和潍坊农科院的一组研究团队描述了其最近开发的高通量植物栽培和表型系统—WinRoots平台。以大豆植物为研究对象,将其暴露在盐胁迫中,证明了土壤盐胁迫条件的一致性和可控性以及WinRoots系统的高通量。他们开发了优化的盐胁迫条件,以及适用于大豆耐盐性的高通量表型指数。此外,高通量多表型分析表明,子叶特征可作为大豆全苗耐盐性的非破坏性指标。在本研究中,Canon EOS 700D数码相机和Resonon Pika L高光谱成像仪分别用于获取RGB和高光谱图像。相机位于植物材料上方1.5 m的可滑动水平导轨上。每天收集大豆冠层和整株幼苗的图像。栽培第九天,获取离体叶片图像,每个品种重复3次。WinRoots系统:高通量根系和整株植物表型平台。系统使用示意图。【结果】盐胁迫相关性状之间的相关分析。(A)盐胁迫相关性状之间的相关矩阵。(B)预测值和观测值之间的回归曲线。大豆盐胁迫相关性状的合成聚类。(A)大豆盐胁迫相关性状的合成聚类剖面图。(B)聚类1和聚类2代表性栽培品种表型。(C)聚类1和聚类2指标比较。【结论】WinRoots系统为幼苗生长提供了均一可控的土壤胁迫条件,可用于土壤胁迫下高通量栽培和表型分析,有助于提供准确多样的土壤胁迫相关的表型数据。因此,WinRoots提供了一种分析诸如土壤胁迫之类的复杂性状的改进方法。HPPA(Hyperimager Plant Phenomics Analysis)高光谱植物表型成像系统由北京依锐思遥感技术有限公司与美国RESONON公司联合研制生产,整合了高光谱成像测量分析、RGB真彩色图像、无线自动化控制系统、线性均匀光源系统等多项先进技术;最优化方式实现大量植物样品的数据采集工作,可用于高通量植物表型成像分析测量、植物胁迫响应成像分析测量、植物生长分析测量、遗传组学与表型组学、遗传育种、生态毒理学研究、性状识别及植物生理生态分析研究等。请点击以下链接,阅读原文:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MjM5NjE1ODg2NA==&mid=2650311205&idx=3&sn=ffe393bdf01d664cab05b92572691916&chksm=bee1a6da89962fccef8eae610681ac22d2239e59d016db96cd911d103186c3459c4061ca30bf&token=1489736406&lang=zh_CN#rd

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  • 药物高通量筛选技术

    简单介绍一下关于药物高通量筛选技术的知识一.概念高通量筛选(High throughput screening,HTS)技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机对实验数据进行分析处理,同一时间对数以千万样品检测,并以相应的数据库支持整个体系运转的技术体系。二. 高通量筛选技术体系的组成1. 化合物样品库化合物样品主要有人工合成和从天然产物中分离纯化两个来源。其中,人工合成又可分为常规化学合成和组合化学合成两种方法。2.自动化的操作系统自动化操作系统利用计算机通过操作软件控制整个实验过程。操作软件采用实物图像代表实验用具,简洁明了的图示代表机器的动作。自动化操作系统的工作能力取决于系统的组分,根据需要可配置加样、冲洗、温解、离心等设备以进行相应的工作。3.高灵敏度的检测系统检测系统一般采用液闪计数器、化学发光检测计数器、宽谱带分光光度仪、荧光光度仪等。4.数据库管理系统数据库管理系统承担4个方面的功能: 样品库的管理功能;生物活性信息的管理功能; 对高通量药物筛选的服务功能; 药物设计与药物发现功能。三. 高通量筛选模型常用的筛选模型都在分子水平和细胞水平,观察的是药物与分子靶点的相互作用,能够直接认识药物的基本作用机制。1. 分子水平的药物筛选模型:受体筛选模型;酶筛选模型;离子通道筛选模型1.1受体筛选模型:指受体与放射性配体结合模型。以受体为作用靶的筛选方法,包括检测功能反应、第二信使生成和标记配体与受体相互作用等不同类型。1.2酶筛选模型:观察药物对酶活性的影响。根据酶的特点,酶的反应底物,产物都可以作为检测指标,并由此确定反应速度。典型的酶筛选包括1) 适当缓冲液中孵化;(2)控制反应速度,如:温度,缓冲液的pH值和酶的浓度等;(3)单时间点数器, 需测量产物的增加和底物的减少。1.3离子通道筛选模型: (1)贝类动物毒素的高通量筛选,其作用靶为Na+通道上的蛤蚌毒素结合位点,用放射性配体进行竞争性结合试验考察受试样品。(2)用酵母双杂交的方法高通量筛选干扰N型钙通道β3亚单位与α1β亚单位相互作用的小分子,寻找新型钙通道拮抗剂。2.细胞水平药物筛选模型观察被筛样品对细胞的作用,但不能反映药物作用的具体途径和靶标,仅反映药物对细胞生长等过程的综合作用。包括: 内皮细胞激活; 细胞凋亡; 抗肿瘤活性; 转录调控检测; 信号转导通路; 细菌蛋白分泌; 细菌生长。四.问题及展望高通量筛选技术与传统的药物筛选方法相比有以下几个优点:反应体积小;自动化;灵敏快速检测;高度特异性。但是,高通量筛选作为药物筛选的一种方法,并不是一种万能的手段,特别是在中药研究方面,其局限性也是十分明显的。首先,高通量筛选所采用的主要是分子、细胞水平的体外实验模型,因此任何模型都不可能充分反映药物的全面药理作用;其次,用于高通量筛选的模型是有限的和不断发展的,要建立反映机体全部生理机能或药物对整个机体作用的理想模型,也是不现实的。但我们应该相信,随着对高通量筛选研究的不断深入,随着对筛选模型的评价标准、新的药物作用靶点的发现以及筛选模型的新颖性和实用性的统一,高通量筛选技术必将在未来的药物研究中发挥越来越重要的作用。

  • 3i流式重磅|清华尤政院士/斯坦福赵精晶博士等提出基于点阵光斑激发的高通量流式成像技术

    近日,清华大学精密仪器系尤政教授团队提出了基于点阵激光激发方法的高通量流式成像方法。该方法可实现低成本、高可扩展性的成像流式细胞仪,而且首次验证了全光谱成像流式技术。相关成果以“Imaging flow cytometry using linear array spot excitation”为题在期刊《Device》上发表,并被选为当期封面文章。[align=center][img=c26a7468c0a13da42a1780598874882f_640_wx_fmt=png&wxfrom=5&wx_lazy=1&wx_co=1.png]https://img1.17img.cn/17img/images/202401/uepic/c494041c-314c-47ad-9e5d-2f92c66f26b9.jpg[/img][/align][color=#c00000][b]研究背景与成果[/b][/color]流式和显微镜是细胞检测的两个基本工具。流式技术具有高通量和丰富的分子检测信息,但缺乏细胞形态信息;相反,荧光显微镜可以提供细胞影像信息,但检测通量低,难以获取足够的样本数据进行统计分析。自流式细胞仪问世以来,其发展趋势一直在于保持高检测通量的同时增加更多信息维度,例如空间形态信息或光谱信息,以实现更准确的细胞分析或分选。成像流式技术是一种整合了流式细胞仪高检测通量和荧光显微镜空间分辨能力的仪器。然而,由于成像通量、分辨率和检测灵敏度之间的基本矛盾,现有的成像流式技术通常采用复杂的光路系统、复杂的图像重构算法,同时成像可扩展性也很有限。这使得成像流式细胞仪难以达到像传统流式细胞仪那样的高检测通道数,并且其高昂的技术成本限制了应用范围。为解决这些问题,清华大学精仪系尤政教授课题组提出了一种基于点阵激光激发的成像方法,即Linear spot array excitation(LASE)。该方法的核心思想是使用点阵结构光斑替代传统流式细胞仪中的椭圆或条状光斑,从而赋予流式细胞仪成像能力。[align=center][img=图片]https://img1.17img.cn/17img/images/202401/uepic/2a51cd6f-84e6-460b-8bec-791da44f9167.jpg[/img][/align][align=center]图1:点阵激光激发成像原理示意图[/align]图1展示了该成像方法的工作原理。在检测区域中,激发光斑呈一串等间隔的点阵光斑,由衍射光学器件生成,光斑间隔大于细胞大小,并且其排列直线与细胞运动直线呈一定的小角度。当细胞依次通过照明光斑时,将产生一串荧光和散射光信号。在图像重构阶段,只需通过信号的分割和重组即可重建细胞图像。该方法具有实现简单、实时重建的优势,并且与现有流式细胞仪光路结构兼容,因此具有良好的可扩展性,能够在高检测通量的基础上,同时实现多激光、多荧光通道以及无标记成像。[color=#c00000][b]技术成果展示[/b][/color][align=center][img=图片]https://img1.17img.cn/17img/images/202401/uepic/f7c2ba0d-80b1-411e-8e3f-9420cb746c2c.jpg[/img][/align][align=center]图2. 双激光五通道成像流式系统[/align][align=center][img=图片]https://img1.17img.cn/17img/images/202401/uepic/965bb49f-6bb0-4cc3-95fc-0151b53c32e8.jpg[/img][/align][align=center]图3.细胞器进行成像与细胞周期研究[/align]本研究利用基于LASE成像方法构建了一个成像系统,具备2色激光(488nm/638nm)和5个成像通道(明场、FITC、PE、PI、APC),如图2A所示。该系统经验证在30×30μm的成像视场下,具有1.3μm的空间分辨率。当细胞样本以5m/s的流速经过探测区域后,系统能够进行无标记的明场成像和荧光成像,且不会出现运动模糊,成像通量最高可达每秒5000个细胞每秒。该系统不仅能够对细胞中的细胞器结构进行成像(见图3A),而且可以在多个荧光波段下,实现对不同细胞结构的同时成像(见图3B)。在生物学应用中,图像被广泛视为金标准,因为它能够为细胞分析提供更为丰富和准确的信息,从而更细致准确地进行细胞分型。举例来说,通过图像,可以在传统流式基础上更进一步区分细胞周期M期的细胞核形态,如图3C所示。[align=center][img=图片]https://img1.17img.cn/17img/images/202401/uepic/bb721d89-7acb-43ad-9181-552afeb94d76.jpg[/img][/align][align=center]图4. 32通道全光谱成像流式验证[/align]得益于LASE成像方法的高度可扩展性,本论文将成像荧光信号引入一个基于棱镜色散的32通道光谱仪中,初步验证了全光谱成像流式细胞仪的可行性。该系统在保持每秒5000个细胞的检测速度通量的同时,能够同时在32个光谱通道上对细胞进行成像。借助光谱分解算法,可以有效解决多染料检测实验中染料光谱混叠效应的问题,将成像流式细胞仪的理论可检测染料数扩展至30以上的量级。这将大大提高成像流式细胞仪给单细胞分析带来的信息量。[color=#c00000][b]成果优势[/b][/color]该研究提出的点阵激光激发的成像方法,具有以下优势:1、系统简单:采用衍射器件在传统流式细胞仪基础上进行光斑整形,即可实现高通量成像功能,相较于已有成像流式技术,具备显著的成本优势。2、图像重建复杂度低:可实现实时重建,进一步可用于基于图像的实时细胞分选。3、可扩展性强:该技术可搭配多个激光和更多的检测通道,也可结合光谱检测实现全光谱成像,使成像流式细胞仪达到与传统流式细胞仪和光谱流式细胞仪相当的可检测标记数量。该技术提供的高通量和信息量将有效为细胞病理学、多组学、药物筛选、液体活检、单细胞测序等研究领域提供高质量的数据。[b]该研究的第一完成单位为清华大学精密仪器系。中国工程院院士、清华大学精密仪器系教授尤政,斯坦福大学研究科学家赵精晶(原精仪系博士生)为该论文的共同通讯作者。[/b]精仪系博士毕业生韩勇、赵精晶为该文的共同第一作者。精仪系博士毕业生晁子翕、焦泽衡,精仪系博士生张驰、姜凌奇等为该论文共同作者。该研究得到了国家自然科学基金、生物医学检测技术及仪器北京实验室的资助。论文链接:[url]https://www.cell.com/device/fulltext/S2666-9986(23)00183-7#secsectitle0070[/url][align=right](文:清华大学精密仪器系)[/align][来源:仪器信息网] 未经授权不得转载[align=right][/align]

  • 如何高通量高效破碎动植物组织和微生物

    如何高通量高效破碎动植物组织和微生物

    破碎大量样品、低温破碎大量样品、破碎坚硬或韧性较强的样品时,人工手动研磨就成了实验猿的噩梦。当然,也有很多实验猿已经尝试过市面一些研磨机/超声波粉碎机,发现自己那顽固的样品依然无法被完全破碎/破碎过程损坏了目标成分而十分心塞。 分享个高通量高效破碎动植物组织和微生物的方法,别逗,当然不是靠徒手研磨能做到的,必须入手个神器——tissuelyser系列和JXFSTPRP系列多样品组织研磨机。对于动植物组织和微生物,包括一些难以破碎的组织样品,都可以使用这个研磨机对其进行完全粉碎。 特别地,一些尤其坚硬/韧性比较强的样品,或要求维持低温条件进行破碎提取的样品,需要结合液氮进行研磨,如:皮肤、硬骨骼、软骨、血管、结缔组织、种子等;使用普通机械研磨方法,很难既保证研磨破碎效果又保证样品一直处于低温状态,尤其是提取RNA、酶等对温度敏感的物质时,低温状态的控制显得尤为关键。入手一台上海净信的多样品组织研磨机,这些都不再是问题了。看招:注:由于样品的具体差异及实验要求的不同,下文数据部分请咨询厂家。第一部分 破碎动物组织1)样品:猪肌肉组织2)仪器:Tissuelyser多样品组织研磨机(品牌:上海净信);耗材:***毫升离心管和直径***毫米的研磨钢珠3)步骤:a.取***克左右肌肉组织样品,均匀地剪切成少量样品块,分别放入若干***毫升的研磨离心管中。b.每个试管中放入***颗直径***毫米的研磨钢珠和800μLPBS裂解液,分别盖紧管盖后,置入24孔研磨适配器中,再将适配器固定在研磨机中。c.将Tissuelyser多样品组织研磨机的参数设置为***赫兹,研磨***秒,启动研磨器。d.研磨完全停止后,拿出研磨离心管,旋开管盖,取出研磨好的肌肉组织样品。4)结果:研磨后的效果如图1,猪肌肉组织成很细腻的泥浆状,说明Tissuelyser多样品组织研磨机对猪肉组织的研磨效果良好。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/05/201505150947_546190_3397_3.jpg图1 猪肌肉研磨对比第二部分 破碎植物组织1)样品:水稻叶片2)仪器: Tissuelyser多样品组织研磨机(品牌:上海净信);耗材:***毫升离心管和直径***毫米的研磨钢珠3)步骤:a.取***克左右叶片组织样品,均匀地剪切成少量样品块,分别放入若干***毫升的研磨离心管中。b.每个试管中放入***颗直径***毫米的研磨钢珠,分别盖紧管盖后,置入24孔研磨适配器中,再将适配器固定在研磨机中。c.将Tissuelyser多样品组织研磨机的参数设置为***赫兹,研磨***秒,启动研磨器。d.研磨完全停止后,拿出研磨离心管,旋开管盖,取出研磨好的叶片组织样品。4)结果:研磨后的效果如图2,叶片组织成很细腻的泥浆状,说明Tissuelyser多样品组织研磨机对叶片组织的研磨效果良好。顺带附上研磨黄豆(坚硬的植物种子)的研磨对比图。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/05/201505150948_546191_3397_3.jpg图2 水稻叶片研磨对比http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/05/201505150948_546192_3397_3.jpg图3 黄豆研磨对比第三部分 结合液氮使用tissuelyser研磨机 当样品死活无法破碎完全/样品傲娇要低温环境时,Tissuelyser多样品组织研磨机+液氮=问题轻松解决。以血管和植物叶片为例,具体操作方法如下: 血管: 取0.1克新鲜血管,用剪刀剪成若干小块,然后放入2毫升离心管中,加入1颗6mm研磨钢珠,盖上管盖。将整个试管放入液氮中冷冻1分钟左右或直到液氮不沸腾,然后放入机器处理30秒钟。取出样品管可见样品被破碎成乳白色粉末,然后加入提取缓冲液,可以进行接下来的后续提取,加入缓冲液之前能保证样品温度一直处于-20℃以下。 叶片: 取0.2克植物叶片,清洁叶片表面后放入离心管中,加入1颗直径5mm不锈钢研磨钢珠,盖上管盖。将整个试管和适配器放入液氮中冷冻1分钟左右或直到液氮不沸腾,然后取出放入研磨机器中机器处理30秒钟。取出样品管可见叶片被破碎成绿色粉末,然后加入提取缓冲液,进行接下来的后续提取即可,加入缓冲液之前能保证样品温度一直处于-20℃以下。后记 想入手这个神器,但又对研磨效果有所犹疑的小伙伴,现在上海净信部分研磨机产品可申请试用,是时候下手了。激动人心的还有,近期研磨机好价,试用爽了直接入手一台也是毫不含糊的。

高通量植物成像系统相关的耗材

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    MagPure纯化技术介绍MagPure(磁珠法)纯化技术是专门为自动化核核酸提取设计的。该技术采用超顺磁性粒子为基质, 在其表面包被硅醇基或羧基基团,使得微粒与核酸发生特异性的吸附作用,从而达到纯化核酸的目的。 MagPure技术配合自动化核酸提取工作站,可将核酸分离纯化,从手工变成机械自动化操作,可大大 提高实验的准确度和通量,并减少操作人员接触危险样品的机会。MagPure Plant RNA Kit (自动化植物RNA纯化系统)从50mg植物样品中提取高纯度的总RNAMagPure Plant RNA Kit采用磁珠纯化技术,适用从50mg植物样品中提取高纯度的总RNA。得到的RNA可直接用于RT-PCR、荧光定 量RT-PCR、Nouthern杂交等实验。该产品可成功在VERSA 10,VERSA 1100,VERSA HT等设备上运用。不同的植物叶片样品(50mg)经MagPure Plant RNA Kit提取后,取5%纯化RNA上样于1%琼脂糖凝胶电泳结果)。取纯化的RNA测量结果结果表明,MagPure Plant RNA Kit可处理常规的植物样品,也可以处理多酚类和多糖类的植物样品。可兼容液体处理系统VERSA 10 PCR/NAP 自动化核酸提取-PCR建立工作站VERSA HT 高通量自动化液体处理工作站VERSA 1100 NGLP 下一代测序工作组VERSA 1100 4ch Independent 独立四通道液体处理工作站VERSA 1100 PCR/NAP 自动化核酸提取-PCR建立工作站Aurora在核酸分离纯化领域拥有完整和先进的技术,MagPure试 剂盒为不同样品提供不同粒径或不同官能基团的磁性粒子,以达到 最佳的纯化效果。在满足产品精确性及可重现性的要求,实现高通 量自动化核酸纯化的同时 保证产品绝对的兼容性。
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