糖基化修饰

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糖基化修饰相关的耗材

  • MassPREP糖蛋白分析包
    MassPREP糖蛋白分析包1、使用RapiGest SF表面活性剂优化蛋白质的去糖基化反应2、使样品操作最少化3、有效的脱盐/样品净化方法4、与MALDI质谱分析和其它糖苷分析技术兼容5、有助于分离2-AB标记糖苷糖基化(Glycosylation)是真核蛋白质最重要的翻译后修饰(PTM:post-translational modification)类型之一。执行有效的样品去糖基化和样品制备是成功进行高灵敏的糖苷分析的关键点。此外,对糖蛋白释放的2-AB标记糖苷进行制备和纯化也是成功分析的一个重要步骤。MassPREP糖蛋白分析包,提供简单而耐用的样品制备方法,且并不牺牲样品回收率。如下图所示,在使用了MassPREP糖蛋白分析包之后,未标记的糖苷或2-AB标记糖苷能够用MALDI-MS或配备荧光检测器的LC进行成功分析。对来自糖蛋白的组分进行样品制备获得纯化的2-AB标记糖苷对天然和2-AB标记IgG糖苷进行MALDI质谱分析所得的质量轮廓图MassPREP糖蛋白分析包及配件产品描述 规格/数量 部件号MassPREP糖蛋白分析包(包括:MassPREP HILIC uElution样品处理板、RapiGest SF,以及MassPREP MALDI Matrix DHB) — 186002817MassPREP HILIC μElution样品处理板 96孔板 186002780RapiGest SF 1mg样品瓶 186001860
  • MassPREP糖蛋白分析包
    产品特点: 糖基化是真核蛋白后转译修饰(P TM)最常见的形式之一,由于Glycan的高度非均质性,对其进行表征非常具有挑战性。而蛋白的脱糖基化是影响Glycan分析的重要步骤,随着质谱技术的发展,Glycan分析变得更加快速和灵敏。 *MassPREP糖蛋白分析包具有如下特点 ■ 用RapiGestTM SF表面活性剂优化去糖基化反应 ■ 最小的样品处理量 ■ 高效的脱盐/样品清洗方法 ■ 与MADLI MS及其它的Glycan分析技术兼容 *MassPREP糖蛋白分析包的组成 ■ RapiGest SF试剂:用于糖蛋白变性,改善酶水解蛋白质释放Glycan的过程 ■ MassPREP HILIC &mu Elution提取板;用于去除蛋白质并对Glycan脱盐 ■ MassPREP MALDI基质(DHB);用于MALDI 分析 订货信息: 产品描述 规格 /数量 部件号 MassPREP糖蛋白分析包(包括 MassPREP HILIC &mu Elution提取板, RapiGest SF试刘及 MassPREP MALDI基质( DHB)) 186002817 MassPREP HILIC &mu Elution提取板 96-孔 186002780 RapiGest SF试剂   186001860 MassPREP MALEI基质( DHB) 10mg小瓶 5包 186002333
  • SHIMSEN Ankylo系列WCX柱 SCX柱
    生物药在制造过程中经历各种翻译后修饰,包括唾液酸化,脱酰胺,C-末端赖氨酸裂解,糖基化,琥珀酰亚胺形成,氧化等。这些修饰可导致电荷分布的变化,影响产品的生物活性和稳定性。因此,生物仿制药的电荷异质体表征和监测也是确保药物研发稳定性和过程一致性的关键质量属性。SHIMSEN Ankylo WCX系列填料采用亲水性无孔聚合物,减小样品的横向扩散和向填料内部扩散,可提供更快的分析速度和更高的分辨率。填料粒径的更均一,带来更好的分离效果。

糖基化修饰相关的仪器

  • 新型 6545 Q-TOF 将软件与硬件的创新进行了有机结合,使仪器质量、仪器稳定性及其整体性能均得到了显著提高。无论从事药物研究、食品安全分析、法医/毒理学研究、环境分析,还是代谢组学或脂质组学研究,全新 6545 Q-TOF 的独特设计都可以让您的 MS 分析更快速、更简单及更高效。主要特点:- 使用快速启动方法快速启动和运行,该方法包括用于完整蛋白质和多肽分析工作流程的 Agilent AdvanceBio LC 色谱柱。- 通过采用 MassHunter BioConfirm 软件的自动化数据工作流程表征主要和次要完整蛋白变异。- 利用 SWARM 自动调谐功能,根据需要调整仪器,确保在无需手动调整的情况下获得高性能。全新大分子设置可为完整糖基化单克隆抗体提供低至亚纳克级的检测限。- 针对糖基化完整蛋白,确保您的结果质量数准确度不超出 10 ppm 范围。- 使用强大的新型迭代 MS / MS 功能深入分析您的消化样品。- 采用经过测试的系统,即使执行数千次蛋白质进样也不会引起性能降低,大大延长正常运行时间。- 无需放空即可清洁入口光学组件,大大缩短维护延迟时间。食品安全及环境:全离子 MS/MS 技术对于检测食品、血浆、尿液等复杂基质中的数百种分析物,靶向 MS/MS 或自动MS/MS 对这些基质的分析存在局限性,直观得分系统可以轻松地在 MassHunter 定性分析软件中查看每个化合物的碎片离子谱库匹配和母离子与子离子的色谱共流出情况。MassHunter 定量分析软件中简化 MassHunter定性/定量分析方法用于批量分析,用户只需输入校准浓度,即可在一个批次中分析数百种农药。此外,实验结果证明,系统能够对复杂基质中浓度低于或等于法规规定最大残留限量 (MRL) 的多数农药和农药代谢物进行检测。脂质组学:1500 多种脂质得以鉴定,包括鞘脂类、磷脂类、甘油酯类、固醇和固醇酯类、多聚异戊二烯醇和多聚异戊二烯醇酯类,以及脂肪酸类。还揭示了一些烟草特异性脂质的性质。代谢流分析:采用 Agilent MassHunter VistaFlux 工作流程,在肿瘤细胞中以 U-13C-Gln作为代谢示踪物进行定性代谢流分析,展示示踪物进入经典三羧酸循环通路中的结果。与手动数据挖掘相比,为稳定同位素示踪数据处理提供了全面、自动化且快捷的框架,其中包括同位素体提取和定性代谢流文件数据的通路可视化。常规肽谱分析:NIST mAb 中多肽的提取化合物色谱图(ECC)。在较短的梯度时间 (15 min) 下获得了出色的色谱分离度。NIST mAb轻链和重链上每个已识别的多肽用其相应的序列编号进行标记。例如下图中,天然多肽(母离子位于m/z = 631.6385 处,+3)和 Met 氧化多肽(母离子位于 m/z = 636.9698 处,+3)的 MS/MS 谱图对比结果。b4–b7 碎片离子(绿框)的主要差异 (+15.99 Da)明确区分了天然形式和修饰形式,并指出了轻链中 Met-4 是氧化的位。单克隆抗体分析:完整 NIST mAb 分析(进样量 0.5 _g)完整 NIST mAb 的质谱解卷积结果(进样量 0.5 _g)完整单抗分析(创新药与生物仿制药)(进样量 0.5 _g)
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  • 安捷伦通过全新 6495B 三重四极杆液质联用系统,将可靠性提升至全新水平。6495B LC/TQ 以久经考验的 iFunnel 技术为基础,代表了稳定性、可靠性和准确性的前沿水平。这些改进可帮助科学家更快分析更多样品、显著缩短分析周期以及得到更多综合性数据,从而提高实验室效率与 ROI(投资回报率)。- 安捷伦最灵敏的 LC/ TQ— 采用 iFunnel 技术,检测限可达阿克-介摩级- 利用高效的离子采样和离子传输实现更出色的分析性能- 通过强大的离子透镜获得可靠稳定的性能- 利用高能量转换打拿极和低噪音特性实现高效离子检测和定量分析- 插板阀技术 — 无需放空仪器即可进行离子源维护- 筛查、确证和定量 — 触发式多反应监测 (tMRM) 结合了快速、灵敏的 MRM 定量分析与产物离子谱图,可用于谱库检索、化合物筛查和确证多肽鉴定和定量分析高 m/z 多肽离子极具描述性,可以提供有关糖基化等翻译后修饰 (PTM) 尺寸和位置的重要生物学信息。Agilent 6495B 三重四极杆液质联用系统的质量数范围拓展至 m/z 3000,非常适合于检测大的肽段。下文演示了使用6495B 检测多肽中的碎片离子信号,这些信号来自于代表每种目标蛋白质的多肽。该方法具有极高灵敏度、良好的重现性以及定量精度。真菌毒素辣椒粉提取物中赭曲霉毒素 A (A) 和 黄曲霉毒素 B1 (B) 的触发式 MRM 数据,图中从左至右为化合物色谱图、定性离子详细信息和参比谱库匹配结果食品动物源基质中硝基呋喃化合物浓度为 0.5 ng/mL 的硝基呋喃代谢物混合工作液的 MRM 色谱图
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  • Agilent ProteoAnalyzer 系统是一种平行毛细管电泳仪器,可自动进行还原型和非还原型蛋白质样品的毛细管电泳-十二烷基硫酸钠 (CE-SDS) 分析。 该系统能够在短短 30 min 内对 12 个样品进行分离,省去了 SDS-PAGE 凝胶制备、染色/脱色和分析的繁琐过程,让您专注于结果。ProteoAnalyzer 系统可分离 10 kDa 至 240 kDa 的蛋白质,能够在单次运行中分析宽分子量范围的蛋白质。 在每次分离之间可恢复各个毛细管的性能,因此可以分析不同的样品,包括单克隆抗体、生物仿制药、蛋白质纯化组分和粗裂解物。特性:分析时间短 — 只需 30 min 即可平行分析 12 个蛋白质样品支持各种样品类型 — 可靠地分离具有挑战性的蛋白质样品,如膜蛋白和粗裂解物高分离分辨率 — 分离糖基化和非糖基化亚型宽分子量范围 — 安捷伦宽范围蛋白质 P240 试剂盒可测量 10 至 240 kDa 的蛋白质高灵敏度 — 可检测 PBS 中浓度低至1 ng/µ L 的 BSA 蛋白更宽的样品浓度范围 — PBS 中 BSA 样品的线性动态范围为 2-2000 ng/µ L提高实验室效率 — 在当前正在进行分离的情况下,上样并设置下一次运行灵活的上样方式 — 可以在队列中上下移动样品以调整运行顺序仪器准备时间非常短 — 无需进行日常阵列处理,并使用室温下稳定的试剂性能指标:功耗150 VA宽度35 cm尺寸(宽 x 深 x 高)35 cm x 51 cm x 61 cm操作环境的相对湿度20 - 80 %每次运行的样品数12深度51 cm电源电压100 - 240 VAC电源频率47 - 63 Hz重量38.5 kg高度61 cm
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糖基化修饰相关的试剂

糖基化修饰相关的方案

  • 应用 UHPLC/Q-TOF/MS 研究茶叶(Camellia Sinensis L.) 的糖基化次级代谢物
    糖基化广泛存在于植物的一系列生物过程中,并被认为对人体健康有益,但是有关这一生物过程的研究有限,其主要原因在于缺乏有效的分析方法鉴定植物中丰富多样的糖基化代谢物。本应用简报介绍了 Dai 等人最近报道的一种研究茶叶 (Camellia Sinensis L.) 中糖基化过程的非靶向特异性修饰代谢组学方法。将安捷伦超高效液相色谱 (UHPLC) 与高分辨率四极杆飞行时间质谱 (Q-TOF/MS) 结合使用,在全离子源内碎裂模式下对绿茶进行分析。利用实验室定制的工作流程对采集的数据进行处理,基于特定糖基化修饰的特征性中性丢失模式,选择性地提取与糖基化相关的化合物。直接在数据库中搜索糖基化代谢物或相应的底物,进一步鉴定这些化合物。借助这一策略,同时检测出 202 种糖基化代谢物,包括葡糖基化/半乳糖基化、鼠李糖基化、芦丁糖基化和樱草糖基化,其中在绿茶浸泡液中推断鉴定出 68 种糖基化代谢物。基于 MS/MS 谱图,初步解析出另外 44 种新型糖基化代谢物。此方法使用户能够分析、发现和鉴定植物样品中的新型糖基化代谢物。所述工作流程大大拓展了糖基化代谢物的鉴定范围,并提高了对未知代谢物进行结构解析的能力。该方法可以进一步扩展以分析植物中许多其他重要的修饰。
  • 单克隆抗体 N-糖基化的毛细管电泳和质谱分析
    糖基化是最重要的一种翻译后修饰,指的是将糖基部分连接到蛋白质上。糖基化模式的改变对免疫原性和整体生物活性有很大影响。因此,糖基化表征对基于生物医药的应用至关重要。虽然现在已有多种分析技术被应用于分析 N-糖基化,但低水平糖基化的精确测定仍面临着极大的挑战。本应用简报展示了利用毛细管电泳和质谱 (CEMS) 对重组单克隆抗体 (mAb) 糖基化进行分析。此方法包括利用 N-糖苷酶 F (PNGase F) 酶解 mAb 得到多糖,对多糖进行荧光标记( 8-氨基吡-1,3,6-三磺酸三钠盐,ATPS),并利用 Agilent 7100 CE 串联 Agilent 6520 精确质量 Q-TOF LC/MS 进行分析。从使用的重组 mAb 中,我们共鉴定出 7 种多糖,从每种多糖成分的相对百分比可知,主要及次要糖基化修饰均有存在。本应用简报证明了高分离速度的 CE 与高灵敏度检测限的 MS 相结合,使 CE-MS 成为一种替代 LC/MS 方法对 mAb 或其它糖蛋白进行糖基化表征的有效且最有前景的方法。
  • 采用新型 HILIC 色谱柱实现快速 N 连接糖基化分析
    重组单克隆抗体治疗药物(mAb) 是最大的一组治疗性蛋白药物。此类治疗性药物的有效性高度依赖于mAb 正确的糖基化模式,且迄今为止,所有批准的治疗性mAb 均为免疫球蛋白G (IgG) 。人类IgG 的每个重链上均含有一个保守的N 连接糖基化位点[2]。N 连接糖基化是一种极为重要且非常复杂的翻译后修饰,需要在糖蛋白药物开发、加工和生产的每个阶段对其进行控制、监测与了解。此外,治疗性蛋白的安全性、有效性和血清半衰期等特性也会因糖基化模式的不同而受到影响。因此,糖基化模式分析是表征治疗性糖蛋白(尤其是mAb)的一个重要部分。虽然已有多种不同的方法用于糖基化分析。但是,大部分的方法均基于酶解蛋白,从 mAb 中释放多糖,然后通过标记试剂(例如2-氨基苯甲酰胺,2-AB)进行进一步的衍生化。由于糖基缺少发色团,所以荧光检测前需先采用2-AB(中性)标签标记。而由于标记后的多糖结构极为亲水,因此将亲水相互作用色谱(通常称为HILIC)作为首选的分离技术。采用配合荧光检测的 HILIC 分离是一种非常稳健的糖基化分析方法,同时 HILIC/LC 还可与质谱联用,以获得重要的质量及结构信息。在本应用简报中,我们介绍了AdvanceBio 糖谱分析色谱柱,这是一种亚2 μ m HPLC 色谱柱,具有新型HILIC 酰胺化学技术,用于高通量糖基化分析。与现有的HPLC 色谱柱技术相比,该色谱柱及方法可增强多糖的分离,且减少了40% 的洗脱时间。为了阐释AdvanceBio 糖谱分析色谱柱的实用性,我们以2-AB 标记后的人类IgG N 连接糖链样品为例进行研究。

糖基化修饰相关的论坛

  • CE-SDS测高糖基化蛋白

    有没有同学用CE-SDS测高糖基化蛋白的?现有的方法多数是测单抗的,对我目前检测的蛋白不适用。想要改进方法又没有方向。希望有类似研究方向的同学交流一下,怎么能建立一个适用的方法。我用的仪器是贝克曼PA800plus

  • 抗体糖基化分析

    附件中是有关抗体IgG 的糖基化相关研究;希望对大家有用!祝新年好!

  • O-GlcNAc糖基化及其糖蛋白规模化的鉴定

    [align=center][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]基[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]化[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]及其[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖蛋白规模化的鉴定[/color][/size][/align]O- [size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖基化是一种发生在蛋白质丝氨酸或苏氨酸上的具有一个糖单元结构的翻译后修饰,广泛分布在细胞核和细胞质中,是一种重要的胞内修饰调控方式。它参与细胞的多种应激响应和细胞进程,如信号转导、转录、翻译、蛋白降解、基因调控与细胞周期调控等。目前,已发现的[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]1000[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]多种[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖蛋白中,主要有细胞骨架蛋白、核孔蛋白、转录因子、激素受体、磷酸酶、激酶等。[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖基化异常与一些疾病,如糖尿病、帕金森病、阿尔兹海默症等有紧密联系。因此,系统地对[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖基化蛋白质进行鉴定与分析[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d],[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]对于研究其生物学功能和在疾病发生发展中的作用都具有重要意义。[/color][/size][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#0d0d0d][1][/color][/size][/sup][/font][size=16px][color=#0d0d0d]与目前磷酸化蛋白的鉴定规模相比,[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]蛋白的鉴定尚处于初级水平。[/color][/size][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#0d0d0d][2-4][/color][/size][/sup][/font][size=16px][color=#0d0d0d]导致[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]难以鉴定的原因主要有:[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]1[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d])[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]修饰在胞内是动态变化的,并且在细胞裂解时糖苷键容易被破坏;[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]2[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d])[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]修饰蛋白表达丰度较低,[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]且糖基[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]化水平不一;[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]3[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d])[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]修饰蛋白在进行质谱检测时容易发生中性丢失,难以被完全检测。[/color][/size][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#0d0d0d][5][/color][/size][/sup][/font][size=16px][color=#0d0d0d]由于[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]修饰具有表达丰度低、高度动态变化、容易分解等特点,常规质谱鉴定手段难以对其实现高灵敏度、规模化的分析鉴定,因此对[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]的鉴定往往需要先对糖蛋白[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]/[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽进行分离富集后方能成功进行。[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]在近年来发展了多种针对[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖基化修饰蛋白质和[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]肽段[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]的分离与富集新策略,已有的[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽富集方法包括凝集素富集法、抗体富集法、代谢标签富集法、化学酶促反应标签富集法以及酰肼富集法等。[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]基于亲和作用的直接捕捉方法操作简便,但由于亲和力较弱,难以避免非特异性吸附,导致特异性差;而通过非天然糖基的代谢标记法或化学酶促标记法将生物兼容性的反应基团([/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]炔[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]基、叠氮基等)引入[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽,再由点击化学反应进行捕捉可以显著提高糖肽的富集特异性,但点击化学等反应不可逆,容易造成糖肽修饰基团的质量标签过大,影响糖肽的鉴定效率,而且操作复杂。[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]因此,应该开发特异性高、覆盖高度、操作简便,并且不会影响质谱鉴定的新方法实现[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖蛋白规模化的鉴定。[/color][/size]

糖基化修饰相关的资料

糖基化修饰相关的资讯

  • 上海有机所等揭示糖基化修饰调控阿尔茨海默病beta淀粉样蛋白病理性聚集机制
    在阿尔茨海默病(AD)进展中,存在beta淀粉样蛋白(β-Amyloid,Aβ)的积累。Aβ在受影响的脑组织区域形成病理性聚集,被认为与AD的发生、进展和表型密切相关。多种翻译后修饰(如磷酸化、硝基化、糖基化等)对Aβ的病理性聚集及体内生物活性具有重要且不同的调控作用。在AD患者脑内,多种病理相关蛋白的糖基化位点、数量和水平都发生了显著性改变,表明了糖基化修饰在AD发生和发展中的重要意义。2011年,科学家对AD病人脑脊液中的Aβ片段进行鉴定,检测到之前未在哺乳动物中发现的酪氨酸O-糖基化修饰,然而由于天然来源的翻译后修饰蛋白丰度低、微观不均一等困难,Aβ糖基化修饰的生物学功能及在疾病中的作用尚未能得以阐释。  近日,中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心刘聪课题组与北京大学药学院董甦伟课题组合作,在J. Am. Chem. Soc.上发表题为O-Glycosylation Induces Amyloid-β to Form New Fibril Polymorphs Vulnerable for Degradation的研究论文,利用化学合成策略构建了一系列含不同O-糖基化修饰的均一结构Aβ,并系统研究了糖基化修饰对Aβ病理性聚集的调控作用及其构效关系。  该研究中,研究人员首先合成了三种O-糖修饰的酪氨酸砌块,糖基分别是α-GalNAc, Galβ1-3GalNAc和Neuα2,3Galβ1-3GalNAc。然后,通过固相多肽合成策略将上述三种酪氨酸砌块制备相应的Aβ糖肽。然而,Aβ含有较多大位阻氨基酸,且自身疏水性强、容易聚集,再加上糖基的引入,给Aβ糖肽的合成带来了不少困难。为了克服这些合成难题,研究人员利用微波辅助的合成策略以及多赖氨酸亲水标签等方法,以较高效率获得了结构均一、含有不同O-糖修饰的Aβ糖肽。他们进一步对三种Aβ糖肽和不含糖链的Aβ多肽进行性质表征,发现糖基化修饰能够显著抑制Aβ的聚集,并且抑制效果与糖链结构相关。通过对Aβ聚集/解聚动力学的进一步研究,表明糖基修饰可以降低纤维结构的稳定性。在酶解实验中,糖基修饰的Aβ纤维表现出了更差的酶解稳定性。  为进一步阐述糖基化修饰降低Aβ纤维稳定性的分子机理,研究人员通过冷冻电镜技术(Cryo-EM),获得了Galβ1-3GalNAc糖型Aβ纤维的3.1埃近原子级分辨率结构。糖基修饰的Aβ组装形成了一种全新的淀粉样纤维结构,其纤维核心由6-42位氨基酸残基组成,并且在Tyr10残基侧链附近可以观察到修饰糖基的电子密度。通过与未修饰的Aβ纤维核心结构进行比较,研究发现Tyr10的糖基化会增大其与相邻氨基酸残基的空间位阻,从而导致整个Aβ纤维核心结构的重排。相较而言,糖基化Aβ纤维的结构具有更小的原纤维间交互界面,且仅由两对盐桥(Asp23和相邻原纤维的Lys28)所维持。这为糖基化修饰降低Aβ纤维稳定性提供了分子层面的解释。  该工作首次发现糖基化修饰在动态调控Aβ病理性聚集方面的重要功能,为后续研究不同糖基修饰对神经退行性疾病病理蛋白聚集的生物活性及病理毒性的调控作用,提供了有利的研究工具及新的研究思路。该工作得到了国家自然科学基金委、北京市自然科学基金委和中科院稳定支持基础研究领域青年团队计划的资助。  论文链接
  • 黄超兰与高福团队描绘新冠刺突蛋白糖基化图谱, 揭示“O-Follow-N”糖基化新规律
    CellRes. | 突破!黄超兰与高福团队描绘新冠刺突蛋白糖基化图谱,揭示“O-Follow-N”糖基化新规律  蛋白质糖基化修饰是生物体内最重要的翻译后修饰之一,发生在细胞50%-70%的蛋白上。病毒囊膜蛋白的糖基化修饰具有广泛的功能,包括调控蛋白质稳定性、病毒的趋向性、和保护潜在的抗原表位免受免疫监视等。深入了解新型冠状病毒(SARS-CoV-2)刺突蛋白(Spike, S)的糖基化修饰对于新型冠状病毒肺炎(COVID-19)发病机制的探索,疫苗和治疗药物的设计开发,以及检测试剂盒的生产具有重要意义。此前研究者在体外纯化表达的S蛋白胞外域和从病毒颗粒中提取的S蛋白中共鉴定到了22个N-糖基化修饰位点1,2。而由于技术和样本来源的限制,已有研究仅在纯化的S蛋白上鉴定到了一些O-糖基化修饰位点,截止目前,尚未进行病毒颗粒上S蛋白的O-糖基化修饰的研究。近日,北大-清华生命科学联合中心黄超兰团队,和中国科学院院士高福团队,中国科学院天津工业生物技术研究所高峰团队等开展合作研究,采用基于质谱的糖基化鉴定技术,首次揭示了病毒颗粒上提取的S蛋白O-糖基化修饰图谱,并提出了“O-Follow-N”的O糖基化修饰规律。该研究以“O-glycosylation pattern of the SARS-CoV-2 spike proteinreveals an “O-Follow-N” rule”为题于2021年8月2日线上发表在Cell Research期刊上。为获得天然状态下S蛋白的N-和O-糖基化修饰完整图谱,研究者从SARS-CoV-2病毒颗粒上获得S蛋白,用多种蛋白酶酶解成肽段,采用纳升液相色谱以及具有超高分辨率的Orbitrap Eclipse Tribrid三合一质谱联用仪,利用阶梯能量HCD (stepped collisional energy SCE),HCD (Higher-energy collisional dissociation) 以及HCDpdEThcD三种碎裂方法进行质谱分析。本研究中,研究者不但成功鉴定到了此前已报道的22个N-糖基化修饰位点,还首次从SARS-CoV-2病毒颗粒中提取的S蛋白上鉴定到了17个O-糖基化修饰位点。值得注意的是,研究者发现在这17个位点中,有11个位点位于糖基化的天冬酰胺(Asn)附近。研究者将NxS/T共有基序内糖基化的Asn每一侧的3个氨基酸定义为“N±1-3”。分析结果显示,11个O-糖基化修饰位点分布在“N±1-3”的位置上,位点信息确定的位点数有10个,其中7个位点分布在“N+2”的位置上。研究者还通过开展定点突变实验进一步证实Asn糖基化修饰的存在是“N±1-3”的位置上出现O-糖基化修饰的先决条件。综上,研究者提出SARS-CoV-2病毒S蛋白的糖基化修饰存在O-糖基化修饰追随N-糖基化修饰发生的现象,并将这一现象命名为“O-Follow-N”规律。  图. SARS-CoV-2病毒S蛋白的糖基化修饰遵循“O-Follow-N”规律 本研究基于前沿的质谱鉴定技术,揭示了S蛋白的O糖基化修饰谱,提出了O糖基化修饰的“O-Follow-N”规律,这一规律可能适用于其它蛋白,提示O-糖基化修饰具有潜在的新机制,特别是N-和O-糖基化修饰之间可能存在的协同作用,未来有望在极大程度上推动糖生物学领域的研究。此前,黄超兰主任领衔的多组学中心团队还与高福院士领衔的多学科团队紧密合作,揭示早期的新冠感染患者存在显著的免疫抑制,并首次提出COVID-19的发病机制或存在“两阶段”模式3。多组学中心在黄超兰教授的带领下,将继续基于临床,前沿技术和基础学科的深度交叉融合,深耕前沿技术方法开发,为推动基础生物学和临床领域的创新研究提供最有质量保证的蛋白质组和质谱技术手段。中国科学院微生物研究所高福院士,北大-清华生命科学联合中心、北京大学医学部精准医疗多组学研究中心黄超兰教授,北京大学医学部精准医疗多组学研究中心陈扬副研究员,中国科学院天津工业生物技术研究所高峰教授为本文的共同通讯作者 北京大学医学部精准医疗多组学研究中心田文敏博士,中国科学院天津工业生物技术研究所李德林博士,北京大学医学部精准医疗多组学研究中心博士研究生张楠,中国科学院天津工业生物技术研究所博士研究生白桂杰、原恺博士为本文的共同一作。 原文链接:https://www.nature.com/articles/s41422-021-00545-2
  • 北京基因组所等揭示O-GlcNAc糖基化修饰维持基因组稳定性的分子机制
    style type="text/css".TRS_Editor P{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor DIV{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor TD{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor TH{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor SPAN{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor FONT{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor UL{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor LI{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor A{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }/stylep  DNA总是受到内源或外源环境中多种损伤因子的攻击,例如DNA复制错误、细胞代谢产物、电离辐射、紫外线照射和化疗试剂等,这些因素都会引起DNA损伤的产生。如果不能够及时有效修复DNA损伤,将导致基因组不稳定性,进而诱发多种人类疾病,如肿瘤、神经退行和出生缺陷。为维持基因组稳定性,生物体进化出一套保护机制来监控DNA损伤并及时修复,这一机制即为DNA损伤应答。/pp  中国科学院北京基因组研究所郭彩霞研究组与中科院动物研究所唐铁山研究组合作,通过质谱技术发现跨损伤合成DNA聚合酶Polη第457位苏氨酸能发生一种新的蛋白质翻译后修饰:氧连糖基化修饰(O-GlcNAcylation)。已知在紫外线辐射或顺铂等化疗试剂暴露条件下,跨损伤合成DNA聚合酶Polη被招募到复制叉处替换高保真性DNA复制酶,在相应的损伤DNA模板对侧整合正确的核苷酸,从而促进复制叉的继续前行。但与高保真的DNA复制酶相比,Polη复制未损伤DNA模板的错误率显著升高(10sup-2/sup~10sup-3/sup),极易导致遗传信息不能够正确地从亲代细胞传递到子代细胞中,因此它到复制叉的招募和移除必须受到严格调控,然而关于Polη在TLS完成后如何从复制叉解离尚不清楚。研究发现,干扰Polη的氧连糖基化修饰虽不影响其被招募到受阻复制叉处及其在损伤DNA模板对侧整合核苷酸的能力,但显著削弱Polη与CRL4supCDT2/sup E3泛素连接酶之间的相互作用,降低第462位赖氨酸的多泛素化修饰水平,进而抑制p97-UFD1-NPL4复合体所介导的Polη与复制叉分离的过程,导致细胞内突变率上升、细胞对紫外线和顺铂试剂敏感性增强、DNA复制叉移动速率变缓等。该项研究工作揭示了Polη 氧连糖基化修饰与泛素化修饰之间的互作关系,以及DNA复制过程中多种DNA聚合酶转换的分子机制。Polη在多种肿瘤细胞中表达显著升高,与顺铂等化疗药物的耐药性产生密切相关,也与非小细胞肺癌患者的生存期呈负相关。/pp  该发现首次报道氧连糖基化修饰参与调控细胞跨损伤合成过程并维持基因组稳定性,从DNA损伤应答角度揭示了对营养水平敏感的氧连糖基化修饰调控基因组稳定性和肿瘤耐药性的分子机制,为解决顺铂等化疗药物的耐药性提供新的思路和策略,有望改善部分肿瘤患者的生存状况。/pp  研究工作以emPolη O-GlcNAcylation governs genome integrity during translesion DNA synthesis/em为题,在线发表在emNature Communications/em上。研究工作获得了国家自然科学基金委、科技部等的资助。/pp style="text-align:center "img alt="" oldsrc="W020171212545298381499.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201712/uepic/afc0a60a-899a-40ca-87bc-2c12afb7ef13.jpg" uploadpic="W020171212545298381499.jpg"//pp style="text-align: center "O-GlcNAc糖基化修饰调控Polη与复制叉解离的分子机制示意图/p
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