细胞代谢过程

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细胞代谢过程相关的耗材

  • BT/BAR双联试剂条
    BT/BAR双联试剂条详情BAR基因是抗除草剂基因,其编码表达的产物PAT蛋白,能使草丁磷对植物无毒作用。BT是苏云金芽孢杆菌在代谢过程中产生的一种杀虫蛋白,作为生物农药广泛使用在蔬菜、瓜果等作物上。通过根癌农杆菌介导等方法将Bt基因转入棉花植株的细胞中后,棉株体内也能合成Bt杀虫蛋白。特点 一根试条、一份样本,检测多种转基因成分 一次操作、一眼判断,提高 效率而节省时间 一次检测、多种转基因,规避潜在其他风险 灵敏度高、稳定性好、原装进口、简便快捷订购信息 产品名称货号描述规格BT/BARcomboA07-20-413BT/BAR快速检测100条/盒
  • Biolife CS10细胞冻存液
    Biolife CS10细胞冻存液美国Biolife品牌CryoStor临床级即用型冻存液产品都预先配制了USP级DMSO,这是一种渗透性冷冻保护剂,有助于减轻冰的形成造成的损害。在广泛的细胞类型中,CryoStor配方已被证明比商业和家庭酿造的等渗和细胞外配方更有效地减少保存后的凋亡和坏死。CryoStor产品符合 USP 无菌和 USP 内毒素检测标准,并按cGMP生产。CryoStor CS10预先配制了10%的DMSO,在冷冻、储存和解冻过程中为需要10% DMSO的细胞和组织提供了安全、保护的环境。通过调节对低温保存过程的分子生物学反应,CryoStor提供了增强的细胞活力和功能,同时消除了血清、蛋白质或高水平的细胞毒性制剂的需求。产品特点:&bull 单独的Biolife品牌标签&bull 预配置(10%DMSO)&bull 无血清&bull 无蛋白&bull USP级别/高质量组分&bull cGMP 制造&bull FDA 药物主文件备案&bull 无菌、内毒素,以及细胞放行测试产品规格:产品参数:Jurkat T细胞微球悬浮在指定的低温培养基中,然后放置在2 ml 冻存管中,并在2-8℃下孵育15分钟。然后将cryovials转移到无LN2-程序降温仪以-1℃/分钟的速度冷冻保存。在达到-70℃后,将样品转移到LN2储存至少24小时。样品在指定条件下解冻,用CGM(1:10稀释)重悬,在37℃和5% CO2下转移到培养箱。在NucleoCounter NC-3000成像细胞仪(ChemoMetec,丹麦)上使用Via-1盒,根据膜完整性评估立即和解冻后24小时内的细胞存活率和计数。图1-Jurkat T细胞的活力是基于在解冻后24小时内使用膜完整性测定进行评估。图2-使用膜完整性试验评估了解冻后Jurkat T细胞的可见复苏率和扩增性能。结论:1-解冻后立即对细胞活率和数量进行分析并不能反映冷冻保存过程成功与否。未优化的冷冻培养基的不良影响可能要到解冻后的24-48小时才能检测到,这归因于低温保存诱导的延迟性细胞死亡(DOCD)。另一方面,优化的低温保存介质的加入可以防止DOCD的发生 因此,减少了变异性,更准确地估计了解冻后的生存和增殖。2-低温贮藏前的补料时间和培养基的变化对低温贮藏过程的结果有重要影响。这可能是由于一些参数,包括在冷冻前活力试验中没有出现的压力积累,但与DOCS结合,导致解冻后活力和功能的显著损失。3-冰成核的随机性本质上导致了细胞在低温保存过程中所承受的低温保存诱导应力的变化。因此适当的成核对模型T细胞的生存能力和增殖能力有显著影响。4-在37°C介质中稀释(类似于患者给药情景)是解冻后的最佳稀释实践。强烈建议,为了分析目的,细胞也应在温暖介质中稀释,以尽量减少在洗涤过程中渗透细胞的肿胀和溶解。使用方法:1. 将待冷冻保存的细胞重悬置于悬浮液中(机械或酶法解离)2. 对细胞进行离心3. 去除上清液-注意:尽可能多地去除培养基,以减少冷冻液的稀释。4. 添加冷(2°-8°C) 的cryostor冻存液。细胞浓度按照常规细胞培养方案0.5-10*106细胞/mL(可能更高)。DMSO是预先混合在cryostor冻存液中且冻存液中不含添加剂。5-预冷冻:细胞悬液在2°-8°C下孵育约10分钟。6-冷冻成核:在-80°C冷冻样品(许多protocol推荐交替使用-70°C和-80°C环境来处理样本)。对大多数哺乳动物细胞系统推荐使用程序降温仪来控制速率冷冻(-1°C/min),如果使用冷冻装置或异丙醇容器则应提前容器预冷至2°-8°c,使用异丙醇容器的冷冻时间(-80°C)建议约为4小时,或不超过一夜。样品内的冰成核应在大约-5°C下开始,使用可控速率冷冻机上的液氮爆裂程序设置,或在大约15-20分钟后对冷冻液/样品容器进行机械搅拌(轻弹或轻敲)。7.储存:将样品放入储存室,在液氮温度下(低于-130°C)储存样品。样品储存在-80°C仅建议短期储存(数周至数月)。8.解冻:在37°C水浴或同类似的机械解冻装置中快速解冻样品,样品融化时应轻轻地旋转样品,直到所有可见的冰都融化。在冰冻箱中,1ml样品的大约解冻时间为2-3分钟。不允许样品在冷冻温度(0-10°C)以上加热。冷冻瓶从浴液中取出时,摸起来应该是凉的。不建议被动解冻。9.立即用培养基或等效等渗介质稀释细胞/冷冻液混合物。稀释程序可以在一个步骤中完成。稀释介质应在20°C至37°C之间。建议稀释比为1:10(样品与介质)或更大。10. 应用合适的配置下种细胞。11.将细胞放入培养条件或立即使用。12.解冻后进行24小时生存能力评估。注:为了获得低温保存后细胞活力的准确测量,应在解冻后24小时进行评估,并与非冷冻对照样本进行比较。*样品解冻后立即使用膜完整性指标(如台盼蓝)进行评估,以比较分析样品细胞产量和存活率,这往往导致对细胞存活率的测量不准确。建议采用活/死荧光分析或代谢分析(MTT或alamarBlue*)更准确地评估可行回收率。CryoStor产品在环境温度下运输。收到后,保存在2°-8°C,避光,直到准备使用Biolife CS5 细胞冻存液美国Biolife品牌CryoStor临床级即用型冻存液产品都预先配制了USP级DMSO,这是一种渗透性冷冻保护剂,有助于减轻冰的形成造成的损害。在广泛的细胞类型中,CryoStor配方已被证明比商业和家庭酿造的等渗和细胞外配方更有效地减少保存后的凋亡和坏死。CryoStor产品符合 USP 无菌和 USP 内毒素检测标准,并按cGMP生产。CryoStor CS5预先配制了10%的DMSO,在冷冻、储存和解冻过程中为需要10% DMSO的细胞和组织提供了安全、保护的环境。通过调节对低温保存过程的分子生物学反应,CryoStor提供了增强的细胞活力和功能,同时消除了血清、蛋白质或高水平的细胞毒性制剂的需求。产品特点:&bull 单独的Biolife品牌标签&bull 预配置(5%DMSO)&bull 无血清&bull 无蛋白&bull USP级别/高质量组分&bull cGMP 制造&bull FDA 药物主文件备案&bull 无菌、内毒素,以及细胞放行测试产品规格:产品数据:Jurkat T细胞微球悬浮在指定的低温培养基中,然后放置在2 ml 冻存管中,并在2-8℃下孵育15分钟。然后将cryovials转移到无LN2-程序降温仪以-1℃/分钟的速度冷冻保存。在达到-70℃后,将样品转移到LN2储存至少24小时。样品在指定条件下解冻,用CGM(1:10稀释)重悬,在37℃和5% CO2下转移到培养箱。在NucleoCounter NC-3000成像细胞仪(ChemoMetec,丹麦)上使用Via-1盒,根据膜完整性评估立即和解冻后24小时内的细胞存活率和计数。图1-Jurkat T细胞的活力是基于在解冻后24小时内使用膜完整性测定进行评估。图2-使用膜完整性试验评估了解冻后Jurkat T细胞的可见复苏率和扩增性能。1-解冻后立即对细胞活率和数量进行分析并不能反映冷冻保存过程成功与否。未优化的冷冻培养基的不良影响可能要到解冻后的24-48小时才能检测到,这归因于低温保存诱导的延迟性细胞死亡(DOCD)。另一方面,优化的低温保存介质的加入可以防止DOCD的发生 因此,减少了变异性,更准确地估计了解冻后的生存和增殖。2-低温贮藏前的补料时间和培养基的变化对低温贮藏过程的结果有重要影响。这可能是由于一些参数,包括在冷冻前活力试验中没有出现的压力积累,但与DOCS结合,导致解冻后活力和功能的显著损失。3-冰成核的随机性本质上导致了细胞在低温保存过程中所承受的低温保存诱导应力的变化。因此适当的成核对模型T细胞的生存能力和增殖能力有显著影响。4-在37°C介质中稀释(类似于患者给药情景)是解冻后的最佳稀释实践。强烈建议,为了分析目的,细胞也应在温暖介质中稀释,以尽量减少在洗涤过程中渗透细胞的肿胀和溶解。1. 将待冷冻保存的细胞重悬置于悬浮液中(机械或酶法解离)2. 对细胞进行离心3. 去除上清液-注意:尽可能多地去除培养基,以减少冷冻液的稀释。4. 添加冷(2°-8°C) 的cryostor冻存液。细胞浓度按照常规细胞培养方案0.5-10*106细胞/mL(可能更高)。DMSO是预先混合在cryostor冻存液中且冻存液中不含添加剂。5-预冷冻:细胞悬液在2°-8°C下孵育约10分钟。6-冷冻成核:在-80°C冷冻样品(许多protocol推荐交替使用-70°C和-80°C环境来处理样本)。对大多数哺乳动物细胞系统推荐使用程序降温仪来控制速率冷冻(-1°C/min),如果使用冷冻装置或异丙醇容器则应提前容器预冷至2°-8°c,使用异丙醇容器的冷冻时间(-80°C)建议约为4小时,或不超过一夜。样品内的冰成核应在大约-5°C下开始,使用可控速率冷冻机上的液氮爆裂程序设置,或在大约15-20分钟后对冷冻液/样品容器进行机械搅拌(轻弹或轻敲)。7.储存:将样品放入储存室,在液氮温度下(低于-130°C)储存样品。样品储存在-80°C仅建议短期储存(数周至数月)。8.解冻:在37°C水浴或同类似的机械解冻装置中快速解冻样品,样品融化时应轻轻地旋转样品,直到所有可见的冰都融化。在冰冻箱中,1ml样品的大约解冻时间为2-3分钟。不允许样品在冷冻温度(0-10°C)以上加热。冷冻瓶从浴液中取出时,摸起来应该是凉的。不建议被动解冻。9.立即用培养基或等效等渗介质稀释细胞/冷冻液混合物。稀释程序可以在一个步骤中完成。稀释介质应在20°C至37°C之间。建议稀释比为1:10(样品与介质)或更大。10. 应用合适的配置下种细胞。11.将细胞放入培养条件或立即使用。12.解冻后进行24小时生存能力评估。注:为了获得低温保存后细胞活力的准确测量,应在解冻后24小时进行评估,并与非冷冻对照样本进行比较。*样品解冻后立即使用膜完整性指标(如台盼蓝)进行评估,以比较分析样品细胞产量和存活率,这往往导致对细胞存活率的测量不准确。建议采用活/死荧光分析或代谢分析(MTT或alamarBlue*)更准确地评估可行回收率。CryoStor产品在环境温度下运输。收到后,保存在2°-8°C,避光,直到准备使用Biolife CS2 细胞冻存液美国Biolife品牌CryoStor临床级即用型冻存液产品都预先配制了USP级DMSO,这是一种渗透性冷冻保护剂,有助于减轻冰的形成造成的损害。在广泛的细胞类型中,CryoStor配方已被证明比商业和家庭酿造的等渗和细胞外配方更有效地减少保存后的凋亡和坏死。CryoStor产品符合 USP 无菌和 USP 内毒素检测标准,并按cGMP生产。CryoStor CS5预先配制了2%的DMSO,在冷冻、储存和解冻过程中为需要2% DMSO的细胞和组织提供了安全、保护的环境。通过调节对低温保存过程的分子生物学反应,CryoStor提供了增强的细胞活力和功能,同时消除了血清、蛋白质或高水平的细胞毒性制剂的需求。产品特点:&bull 单独的Biolife品牌标签&bull 预配置(5%DMSO)&bull 无血清&bull 无蛋白&bull USP级别/高质量组分&bull cGMP 制造&bull FDA 药物主文件备案&bull 无菌、内毒素,以及细胞放行测试产品规格:使用方法:1. 将待冷冻保存的细胞重悬置于悬浮液中(机械或酶法解离)2. 对细胞进行离心3. 去除上清液-注意:尽可能多地去除培养基,以减少冷冻液的稀释。4. 添加冷(2°-8°C) 的cryostor冻存液。细胞浓度按照常规细胞培养方案0.5-10*106细胞/mL(可能更高)。DMSO是预先混合在cryostor冻存液中且冻存液中不含添加剂。5-预冷冻:细胞悬液在2°-8°C下孵育约10分钟。6-冷冻成核:在-80°C冷冻样品(许多protocol推荐交替使用-70°C和-80°C环境来处理样本)。对大多数哺乳动物细胞系统推荐使用程序降温仪来控制速率冷冻(-1°C/min),如果使用冷冻装置或异丙醇容器则应提前容器预冷至2°-8°c,使用异丙醇容器的冷冻时间(-80°C)建议约为4小时,或不超过一夜。样品内的冰成核应在大约-5°C下开始,使用可控速率冷冻机上的液氮爆裂程序设置,或在大约15-20分钟后对冷冻液/样品容器进行机械搅拌(轻弹或轻敲)。7.储存:将样品放入储存室,在液氮温度下(低于-130°C)储存样品。样品储存在-80°C仅建议短期储存(数周至数月)。8.解冻:在37°C水浴或同类似的机械解冻装置中快速解冻样品,样品融化时应轻轻地旋转样品,直到所有可见的冰都融化。在冰冻箱中,1ml样品的大约解冻时间为2-3分钟。不允许样品在冷冻温度(0-10°C)以上加热。冷冻瓶从浴液中取出时,摸起来应该是凉的。不建议被动解冻。9.立即用培养基或等效等渗介质稀释细胞/冷冻液混合物。稀释程序可以在一个步骤中完成。稀释介质应在20°C至37°C之间。建议稀释比为1:10(样品与介质)或更大。10. 应用合适的配置下种细胞。11.将细胞放入培养条件或立即使用。12.解冻后进行24小时生存能力评估。注:为了获得低温保存后细胞活力的准确测量,应在解冻后24小时进行评估,并与非冷冻对照样本进行比较。*样品解冻后立即使用膜完整性指标(如台盼蓝)进行评估,以比较分析样品细胞产量和存活率,这往往导致对细胞存活率的测量不准确。建议采用活/死荧光分析或代谢分析(MTT或alamarBlue*)更准确地评估可行回收率。CryoStor产品在环境温度下运输。收到后,保存在2°-8°C,避光,直到准备使用
  • 细胞小室培养板
    细胞小室运用选择指南应用细胞膜孔径ADME(化合物穿过肠上皮细胞屏障转运和渗透)Caco-2、MDCK0.4 μm共培养和细胞分化、细胞成像原代细胞、肿瘤干细胞0.4 μm、1.0 μm大分子或病毒转运、分泌1.0 μm、3.0 μm细胞迁移和侵袭(血管生成)、细胞趋化作用(迁移)或内皮迁移 轴突增生、共培养内皮细胞、白细胞 神经元3.0 μm细胞迁移和侵袭淋巴细胞、巨噬细胞3.0 μm、5.0 μm肿瘤细胞迁移和侵袭 血细胞趋化作用或经内皮细胞迁移、共培养肿瘤衍生细胞、白细胞 肿瘤干细胞、MSCs8.0 μm细胞小室参数规格配套小室数量(个/块板)小室直径(mm)每孔容积(ml)小室内体积(ml)小室膜生长面积(cm² )6孔板6242.61.54.6712孔板12121.50.51.1224孔板126.50.60.10.33100mm皿17513944膜孔径(um)膜密度(孔/cm² )0.41x1081.02x1073.02x1065.04x1058.01x105PET(聚酯)膜带盖产品编号 TC处理产品编号 未TC处理产品名称孔径(μm)膜透明度包装规格个/盒个/箱7231217231316孔细胞小室0.4不透明66072412172413112孔细胞小室0.4不透明1212072512172513124孔细胞小室0.4不透明121207234217234316孔细胞小室1全透明66072442172443112孔细胞小室1全透明1212072542172543124孔细胞小室1全透明121207230217230316孔细胞小室3半透明66072402172403112孔细胞小室3半透明1212072502172503124孔细胞小室3半透明121207233217233316孔细胞小室8全透明66072432172433112孔细胞小室8全透明1212072532172533124孔细胞小室8全透明12120PC(聚碳酸酯)膜带盖产品编号 TC处理产品编号 未TC处理产品名称孔径(μm)膜透明度包装规格个/盒个/箱7231017231116孔细胞小室0.4不透明660724101724111 12孔细胞小室0.4不透明1212072510172511124孔细胞小室0.4不透明121207230017230116孔细胞小室3半透明66072400172401112孔细胞小室3半透明1212072500172501124孔细胞小室3半透明1212072420172421112孔细胞小室5半透明1212072520172521124孔细胞小室5半透明121207233017233116孔细胞小室8半透明66072430172431112孔细胞小室8半透明1212072530172531124孔细胞小室8半透明12120PC(聚碳酸酯)膜(TC处理)产品编号产品名称孔径(μm)膜透明度包装规格个/盒个/箱726001100mm 细胞小室 PC(聚碳酸酯)膜 带盖 TC3半透明110细胞小室在细胞实验中很常用,如:共培养实验、趋化实验、细胞迁移实验、细胞侵袭以及药物转运。其中,通透性支持物可以有效改善极性细胞的培养,因为这些支持物允许细胞从其基底面和顶面分泌和吸收分子,从而以更为自然的方式进行代谢,最大程度的模拟体内环境以培养某些特殊的细胞系。聚碳酸酯(PC)膜孔密度较高,允许通过膜完成更多交换,而且具有极佳的细胞粘附特性,所以适用于转运研究和其他需要实现最佳细胞生长的应用。 另外PC膜也非常适用于屏障分析。 在较长时段内相比其他膜材料,具有更高、更持续且更稳定的跨上皮电阻 (TEER) 值。PC膜无需基质包被即可培养大多数类型细胞。 PET膜PET膜孔密度较低,具有更好的光学清晰度,有利于显微镜细胞观察以及细胞成像。创新的边缘设计,加样方便丰富的配套多孔板选择:6孔、12孔、24孔PC膜:低吸附率,减少小分子蛋白和其他化合物的损失PET膜透明度极佳,具有更好的光学清晰度透明的PET膜方便观察细胞状态PC膜不易撕破或卷曲,且取出小室时操作方便与大部分固定与染色时用的溶剂相容使用指南使用时先将培养液加入到多孔板的孔中,将嵌套放入,再将含有细胞的培养液加入嵌套内部;预先平衡:培养液加入到多孔板中,再加入嵌套,然后放入培养箱中培养至少一个小时,也可以过夜;定期检查培养液体积,并按需补加新鲜培养基。但细胞层可以用基本细胞学方法在嵌套中直接固定和染色。注避免使用可以溶解PC膜的溶剂。在嵌套中直接固定和染色细胞,可以用解剖刀将膜割下做长期保存。注意事项在通透性支持物(膜)上生长的细胞的贴附对于起始接种密度很敏感,所以初次使用应接种不同密度保证最佳生长;培养过程中通过上层和孔之间的空隙取液、加液时一定要小心、缓慢操作、避免膜的损坏; 在培养细胞之前将通透性支持物在培养基中孵育可以改善细胞的贴附和分布。 下层培养液和小室间常会有气泡产生,一旦产生气泡,下层培养液的趋化作用就减弱甚至消失,所以在接种细胞的时候要特别留心,若产生气泡,要将小室提起,去除气泡,在将小室放进培养板。

细胞代谢过程相关的仪器

  • 安捷伦 Seahorse XF Pro 分析仪以 96 孔规格测量并报告活细胞的耗氧率 (OCR)、质子释放率 (PER) 或细胞外酸化率 (ECAR) 以及 ATP 产生速率。该分析仪在低速率下具有出众的 OCR 精度,具备经验证的仪器性能、优化的温度控制,并且兼容自动化。OCR、PER 和 ATP 产生速率是能量代谢的关键测量,也是线粒体健康、毒性、糖酵解和总体细胞功能/功能障碍的重要指标。综合这些检测结果可在系统水平表征培养细胞和体外样品的细胞代谢功能。XF Pro 分析仪也配备先进的软件、标准化工作流程和安捷伦 Seahorse Analytics 软件提供的高级数据分析功能。这些功能极大地简化了从检测设计到数据 QC 和解读的整个 XF 检测过程。
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  • 安捷伦Seahorse XFp 细胞能量代谢分析仪简介:安捷伦Seahorse XFp 分析仪在 8 孔微孔板中检测活细胞的 OCR 和 ECAR。快速简化设置使得 XFp 分析仪成为进行体外和其它有限量样品中代谢表型常规测试的理想工具。相关资料下载请点击:http://www.instrument.com.cn/netshow/SH104076/download.htm安捷伦Seahorse XFp 细胞能量代谢分析仪特性:1、样品量需求少,适用于珍贵样品 - XFp 分析仪是适用于研究少量细胞数或每天只分析少量样品的研究人员的性价比最高的解决方案。2、实时结果 - 该整合系统可在几分钟内报告代谢率,而无需样品提取或标记。 该仪器可立即测定并计算速率,完成整个分析只需一、两个小时。数据可轻松传输至 3、Seahorse Wave 分析软件,或导出至常用电子表格和作图程序。3、快速周转时间 - 8 孔板式微孔板形式可简化分析设置。 自定义报告生成器帮助并标准化关键分析的输出,同时实现灵活支持不同的实验方案。4、活细胞响应 - 实时检测底物,抑制剂和其它化合物的响应,其通过 4 接口进样系统进样并具备自动混合功能。5、高灵敏度 - 可分析每孔仅 5000 个细胞或是每组 15000 个细胞。 细胞数目需求根据细胞类型所不同;请参考细胞参考数据库了解详细信息。6、拥有精密控温加热托盘,可维持 16-40℃(最低至室温上 8℃),因此兼容多种样品来源。7、采用Seahorse XF 细胞能量表型测试可在一小时内生成一种代谢表型8、采用 Seahorse XFp 细胞线粒体压力测试试剂盒和报告生成器测定线粒体功能。9、利用 Seahorse XF 糖酵解速率分析法分析活细胞内的糖酵解速率10、采用 Seahorse XF 线粒体燃料灵活性测试试剂盒和报告生成器快速检测细胞能量生成对葡萄糖、谷氨酰胺或脂肪酸的依赖性。仅限研究使用。不可用于诊断目的。
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细胞代谢过程相关的试剂

细胞代谢过程相关的方案

  • 3D ORM技术实时追踪细胞代谢过程
    文献发表于2013年3月的 Microbiol biotechnol,作者为比利时 CWBI/ university de liege教授 Frank Delwigne .采用DD ORM 技术,实时追踪生物反应器中细胞培养、代谢过程,以及相关影响因素。 Real-time monitoring of cell viability and cell density base on 3 D ORM technology , investigation of the effect of sub-lethal and lethal injuries
  • 用于癌症研究的安捷伦Seahorse XF活细胞代谢
    癌症是与影响正常细胞功能的遗传变化有关的多种不同疾病的集合,而代谢重编程正在成为癌症治疗性干预的一个关键靶标。癌细胞高度依赖代谢通路来产生多种致癌过程所需的能量(快速增殖、生存、入侵和转移),并对代谢进行重编程以支持这些过程。如今,研究人员正在使用多种基于细胞的分析方法,如基因和 RNA 表达、蛋白质定量、流式细胞术和质谱法,以进一步了解癌症生物学。利用实时细胞功能检测可以研究细胞代谢的动态特征,以及癌细胞如何重新编程其代谢过程来适应环境并存活,从而得以揭示癌细胞的代谢特性。这些代谢特性可以用于开发癌症靶向治疗。
  • 活细胞脂肪代谢过程新手段——光学红外显微成像!非接触式亚微米分辨红外拉曼同步测量
    近期,耶鲁大学成功安装了非接触亚微米分辨红外拉曼同步测量系统——mIRage,并在活细胞脂肪代谢研究中取得了新的进展!非接触亚微米分辨红外拉曼同步测量系统——mIRage在细胞成像中具有优异的潜力,可以提供脂质种类的信息,提供对低浓度物质如游离脂肪酸的定位,并允许对每个样品的脂质和蛋白质光谱特征进行全面位置光谱分析,并且能够应用长时间观测。这项技术未来将可以用于绘制细胞系和细胞内DNL的比率、疾病状态,进一步揭示DNL 导致代谢紊乱的原因。在评估针对调节DNL和治疗疾病的药物方面提供诸多帮助。

细胞代谢过程相关的论坛

  • Science:活细胞代谢成像新方法

    http://www.bioon.com/biology/UploadFiles/201203/2012030911450761.jpg细胞S-腺苷甲硫氨酸成像图,随着每个时间点蛋氨酸(右下)的增加,荧光强度也增高通过基因工程技术使得细胞表达一种经修饰(改造)过的RNA,又称Spinach,研究人员能对活细胞中的小分子代谢物进行成像,并观察它们随时间变化是如何改变的。每个细胞新陈代谢都会产生代谢产物。假如能得知产物生成效率的话,就能辨识如癌症状态下细胞代谢的异常或确定药物能否将细胞的代谢状况恢复到正常状态。康奈尔大学威尔医学院的研究人员说发表在3月9日的《科学》杂志上的相关论文详细描述了这种先进的技术方法,这一技术将有可能彻底颠覆以往对代谢组学的认识,提供数千种细胞内代谢产物的动态变化的化学指纹图谱。威尔康乃尔医学院药理学副教授Samie R. Jaffrey博士说:“动态观察到代谢产物的变化将为我们提供新的和强大的武器,方便我们了解代谢在疾病状态下是如何改变的,并帮助我们找到可以将它们恢复到正常水平的方法”。Jaffrey博士领导威尔康乃尔的其他三名研究人员共同完成了这项研究。他说:“细胞的代谢水平调控着细胞诸多功能,也正因为如此,代谢水平的变化可以是细胞内在特定的时间内发生什么变化的写照”。例如生物学家都知道,肿瘤细胞存在代谢异常,这些细胞对葡萄糖能源的利用存在异常并产生独特的代谢产物如乳酸,从而有不一样的新陈代谢过程。Jaffrey博士说:“能够看到这些代谢异常的话,就可以了解癌症的发生发展。但是到现在为止,测量活细胞中代谢产物一直非常困难。Jaffrey博士和他的团队展开的科学研究表明:可以用特定的RNA序列来检测细胞中代谢产物的水平。这些RNAs是基于能在细胞发出绿色光的Spinach RNA设计的。Jaffrey博士研究小组修改Spinach的RNAs,使得它们一旦遇到它们专属绑定的代谢物时就关闭,造成Spinach荧光开启。他们设计出了RNA序列以追踪细胞中五个不同代谢产物包括二磷酸腺苷、细胞能量分子ATP和参与调节基因活性的甲基化过程的SAM(S-腺苷蛋氨酸)水平的变化。他说:“在此之前,一直没有人能够实时观察到细胞中代谢产物水平是如何变化的”。Jaffrey博士说:“在活细胞中运用RNA传感器,研究人员能够测量单个细胞中的目标代谢产物水平随着时间的变化而发生的改变,你可以看到这些代谢物如何响应信号刺激或遗传变化进而发生动态变化的。你可以筛选出能使得这些基因异常发生正常化的药物,我们的一个主要目标是确定药物是否能使细胞的新陈代谢正常化。新技术克服了现行的用绿色荧光蛋白(GFP)标记活细胞以充当传感器的缺点。如果将绿色荧光蛋白和其他发光蛋白质融合到能结合某种代谢物产物的自然存在的蛋白质中的话,绿色荧光蛋白和其他发光蛋白质就可以用来充当代谢感应器。但在某些情况下,代谢产物与自然存在的蛋白质结合方式会扭转蛋白质结构,进而影响已经融入到这些蛋白质中的荧光蛋白。另外,对于大多数的代谢产物,并没有可用来融合绿色荧光蛋白以制造传感器的蛋白质。通过使用RNA作为代谢物传感器,这个问题引刃而解了。Jaffrey博士说:“关于RNA令人惊奇的是,你可以得到基本上你想要结合任何一种小分子代谢物的RNA序列。他们可以在几个星期就能生产出来”。然后,这些人造序列融合到Spinach中,并在细胞中以单链RNA的形式表达。Jaffrey博士说:“这种做法能让你得到任何你想研究的小分子代谢物,以及这些小分子代谢物在细胞内的情况”,他和他的同事们将这一技术的运用范围扩大到能检测活细胞内的蛋白质和其他分子。他补充说道:该技术可应用于多种疾病研究中。Jaffrey博士说:“我们非常有兴趣研究导致发育障碍如自闭症的大脑神经细胞内的代谢如何是变化的,有很多的机会能让这一新的工具发挥用处”。这篇研究论文的合著者包括威尔康乃尔医学院药理系Jeremy S. Paige博士、Thinh Nguyen Duc博士、Wenjiao Song博士。这项研究由美国国立卫生研究院的生物医学成像和生物研究所以及McKnight基金会资助。康奈尔科技企业和商业中心(CCTEC)已经代表康奈尔大学提出了这项技术的专利保护申请。Samie Jaffrey博士是Lucerna技术的创始人和科学顾问,并持有该公司股权。此外,Lucerna技术拥有上述描述技术的相关许可证。

  • 分享一篇2013年Science上单细胞代谢的研究

    该文该文汇总了单细胞代谢的研究方法,包括质谱 (MS),质谱成像( MS imaging), 毛细管电泳(CE)(其中主要是chip ce), 光谱学(optical spectroscopy),和荧光生物传感器等多种技术手段分析了几百个单细胞,对单细胞进行大分子层面上的表征,以此阐述细胞代谢的表型异质性(phenotypic heteroge-neity)。大概就这个意思吧,大牛的东西,读起来反正就是半懂不懂。

  • 倒置荧光显微镜与活细胞的培养

    倒置荧光显微镜与活细胞的培养

    细胞活体的培养,是现代生物医学界一重要科研项目,细胞的繁殖,复制,新陈代谢过程,这些都是科学家们都想观察到的现象,借助于荧光显微镜,我们可以很清楚的观察到细胞的所有繁殖过程,那么什么样的倒置荧光显微镜比较好呢? 我们需要注意一下几点:倒置荧光显微镜一般由落射荧光显微系统与倒置生物显微系统组成,采用优良的无限远色差独立校正光学系统,配置长工作距离平场消色差物镜与大视野目镜。紧凑稳定的高刚性主体,充分体现了显微操作的防振要求。落射荧光显微系统采用模块化设计理念,可以安全、快揵地调整照明系统,切换荧光滤色片组件。产品可应用于细胞组织,透明液态组织的显微观察,也可用于生物制药,医学检测、疾病预防等领域内的荧光显微术观察。 我们来看看倒置荧光显微镜到底是怎么样的!http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2016/06/201606131012_596689_1783654_3.jpg倒置荧光显微镜成像效果http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2016/06/201606131014_596690_1783654_3.jpghttp://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2016/06/201606131014_596691_1783654_3.jpghttp://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2016/06/201606131014_596692_1783654_3.jpg

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  • 耶鲁大学新进展!探索活细胞脂肪代谢过程:光学红外显微成像技术揭开DNL的奥秘
    从头脂肪生成(DNL)是脂肪和肝脏组织产生脂质代谢的关键过程。该途径的失调与肥胖、非酒精性脂肪性肝病和II型糖尿病密切相关。但是DNL在细胞内的研究非常困难,常规的脂质染料缺乏特异性,抗体和小分子染料很难特异性标记这些脂质体。虽然目前可以使用葡萄糖基代谢探针等同位素来标记这些物质,但是很难具备亚微米级别的空间分辨率,同时无法对细胞内部进行成像,也不能提供脂质的特性和其他环境生物分子的组成信息。这些都极大的限制了脂质体的相关研究,尤其是活细胞内脂质代谢的研究。美国PSC公司研发的全新非接触亚微米分辨红外拉曼同步测量系统——mIRage的出现为上述问题提供了新的解决方案。mIRage采用新型光学光热诱导共振(O-PTIR)技术,不仅具备传统FTIR的特性,可以对物质的分子结构进行解析,还克服了传统红外空间分辨率不足,无法精细表征细胞内部结构的问题,其分辨高达500 nm,可在亚微米尺度上实现对细胞结构的观测,与光学显微镜基本相同,有助于理解亚细胞器结构。设备光热膨胀技术能够在不接触样品的情况下进行检测,大幅度简化了样品制备过程,全程对样品无污染,并且没有米氏散射问题,可在不平整的表面上取得良好的谱线。而其特有的探测机制使得mIRage能够很大限度上避免水的干扰,真正实现活细胞的探测。 近期,耶鲁大学成功安装了非接触亚微米分辨红外拉曼同步测量系统——mIRage,并在活细胞脂肪代谢研究中取得了新的进展!在该研究中,Sydney O. Shuster等人使用非接触亚微米分辨红外拉曼同步测量系统——mIRage观测DNL在活细胞和固定脂肪细胞中的分布。作者认为在DNL、葡萄糖或其他碳水化合物代谢形成游离脂肪酸(FFA) 和甘油三酯的途径中,首先形成糖酵解丙酮酸,后被带进线粒体,通过TCA循环转化为柠檬酸盐。柠檬酸盐再转化为酰基辅酶a和丙二酰辅酶a用于脂肪酸合成并产生甘油三酯,然后储存在脂滴中作为能量储备。通过mIRage对固定的3T3-L1细胞的成像分析,作者通过脂肪代表性的酯羰基振动1747cm-1成功定位到细胞中的大部分脂质、甘油三酯的分布,并通过1655和1541cm-1处的酰胺-I和酰胺-II带定位蛋白质。DNL的代谢途径与固定细胞的明场与红外脂质体与蛋白的热图成像 为了跟踪葡萄糖代谢和DNL,作者给细胞喂入13C葡萄糖来代替12C葡萄糖。因为它的分子振动模式与所涉及的原子质量增加导致红外波数的红移,通过检测发现羰基的拉伸震动红移了44 cm-1。有趣的是1239 cm-1的波段本身不能明确地区分给C-O-C或PO2 ,而未标记细胞中的不对称拉伸在13C标记后时消失,这可能是红移到相邻的峰中导致的。这表明该峰值的主要来源是C-O-C 甘油三酯和/或胆固醇酯的不对称拉伸震动,并且磷脂不会显著地干扰3T3-L1脂肪细胞中的信号。而蛋白信号在这一过程中没有变化,表明蛋白质不会随着13C葡萄糖的供给而偏移。与之相对,CH3和CH2相关的1450cm-1波段蛋白质和脂类的变形和伸展震动的出峰不变。这可能是由于形成的甘油三酯来自游离脂肪酸和甘油的酯化。虽然两者都是 FFA和甘油由葡萄糖通过糖酵解产生,但它们以不同的速度产生和回收,影响着这些波段的移动速率。进一步对加入13C葡萄糖24、48和72小时后的细胞进行检测,结果显示平均单细胞13C/12C比率在测试期间(72小时)持续增加,最终比率为0.54±0.14。其中大部分的13C转化成甘油三酯,并且DNL在空间上也是异质的。对不同时间点固定的细胞进行观测和对比其中的DNL含量 在活细胞实验中,也取得了和固定细胞类似的结果,并且活细胞的光谱图像比固定的更清晰,细胞和与蛋白质酰胺-I信号重叠较少证明了这项技术甚至可以检测到活细胞中甘油三酯到12C甘油三酯13C比率的微小差异。活细胞的DNL含量观测综上所述,非接触亚微米分辨红外拉曼同步测量系统——mIRage在细胞成像中具有优异的潜力,可以提供脂质种类的信息,提供对低浓度物质如游离脂肪酸的定位,并允许对每个样品的脂质和蛋白质光谱特征进行全面位置光谱分析,并且能够应用长时间观测。这项技术未来将可以用于绘制细胞系和细胞内DNL的比率、疾病状态,进一步揭示DNL 导致代谢紊乱的原因。在评估针对调节DNL和治疗疾病的药物方面提供诸多帮助。 参考文献:Spatiotemporal Heterogeneity of De Novo Lipogenesis in Fixed and Living Single Cells. J. Phys. Chem. B 2023, 127, 2918&minus 2926为满足国内日益增长的生物红外表征需求,更好的为国内科研工作者提供专业技术支持和服务,Quantum Design中国北京样机实验室引进了非接触亚微米分辨红外拉曼同步测量系统——mIRage,为您提供样品测试、样机体验等机会,期待与您的合作!
  • 氢氘交换结合单细胞纳喷雾高分辨质谱提高细胞代谢物鉴定效率
    大家好,本周为大家分享一篇发表在Anal. Chem.上的文章,Hydrogen/Deuterium Exchange Aiding Metabolite Identification in Single-Cell Nanospray High-Resolution Mass Spectrometry Analysis1。该文章的作者是中国地质大学(武汉)的彭月娥老师。在生物医药研究中,从单细胞水平进行代谢物的分析可以揭示细胞异质性。但由于样本量较小、代谢转化率快、浓度范围广以及分子结构多样,单细胞中代谢物的准确识别和定量具有挑战性。毛细管微采样电喷雾电离质谱(Capillary microsampling ESI-MS)以及单细胞质谱(single-cell MS)技术的使得单细胞代谢物分析得以发展。但目前其常规实验方案是没有与色谱(LC)耦联的,单靠一级谱图精确质量、二级碎裂谱图以及目前已知代谢物谱图数据库对于鉴定的准确性仍是有局限的。氢氘交换(HDX)技术可以用于氘代小分子中含氢的官能团(-OH、 -COOH、 -NH和-SH)从而起到区分作用。本文将HDX与nanospray 高分辨质谱(nanospray HRMS)结合起来提高Allium cepa L.细胞中的代谢物鉴定效率。图1. 实验装置。(a)微采样系统。(b)捕捉细胞时的电镜图。(c)HDX nanospray离子源。(d)源内HDX原理。图2. 鉴定流程实验装置如图1所示,用于提取细胞代谢物并在喷雾时进行HDX反应。鉴定流程如图2所示。作者首先用[(H3PO4)n-H]-评价了该体系的氘代能力,如图3,最终确定该体系能够使可氘代化合物发生80-83%的氘代。图3. [(H3PO4)n-H]-的氘代谱图如图4是该方法的应用实例。对于洋葱细胞样品中代谢物的谱图,作者首先用多个商业化软件进行了初次匹配。接着通过匹配其发生的氘代数从而进行进一步确证。例如一级谱图中观测到的m/z 178.0530一物质,软件给出该分子量对应元素组成只有C6H11O3NS这一选项。氘代后的谱图显示该物质含有3个不稳定H。562个备选化合物中只有65个符合该特点。通过碎裂模拟发现其中只有27个物质的二级谱图与该峰的二级谱图能够匹配。通过寻找碎片离子不稳定H将可能化合物数量又降至了25。只通过MS法几乎无法区分立体异构体,因此忽略备选化合物中的立体异构体,将备选数量降至11。通过调研文献,并利用标准物参考中确定,该物质极可能是isoalliin。图4. Isoalliin的鉴定流程基于该鉴定作者接下来分析了单细胞中isoalliin的分解途径。据报道isoalliin首先降解为sulfenic acid,然后降解为propanethial S-oxide。但sulfenic acid和propanethial S-oxide属于同分异构体(C3H6OS),且sulfenic acid是瞬时存在的,因而常规的LC-MS流程很难鉴定区分。通过HDX nanospray HRMS,作者发现细胞中C3H6OS的不稳定H在喷雾后10~15min间从2个变为了1个(图6)。Sulfenic acid中理论不稳定H为2,propanethial S-oxide中理论不稳定H为1。这表明sulfenic acid转化成了propanethial S-oxide,时间尺度是15min左右。图5. C3H6OS采样10min后(a)和采样15min后(b)的HDX分布。(c)C3H6OS 氘代数随时间变化。本研究整合HDX与单细胞HRMS法,提高了单细胞代谢物分析的准确度,并利用HDX特性分析了物质在单细胞水平的代谢过程,为细胞代谢过程中生化反应的监测提供了新方法。撰稿:罗宇翔编辑:李惠琳原文:Hydrogen/Deuterium Exchange Aiding Metabolite Identification in Single-Cell Nanospray High-Resolution Mass Spectrometry Analysis李惠琳课题组网址:https://www.x-mol.com/groups/li_huilin参考文献1.Osipenko, S. Zherebker, A. Rumiantseva, L. Kovaleva, O. Nikolaev, E. N. Kostyukevich, Y., Oxygen Isotope Exchange Reaction for Untargeted LC-MS Analysis. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2022, 33 (2), 390-398.
  • 分子细胞卓越中心揭示Hh信号通路通过Hilnc参与肝脏脂质代谢的新机制
    11月8日,Nature Metabolism在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)赵允研究组的最新成果(Loss of Hilnc prevents diet-induced hepatic steatosis through binding of IGF2BP2)。该研究揭示了Hedgehog(Hh)信号通路调控Hilnc(Hedgehog induced Long non-coding RNA)的表达,进而参与调控高脂诱导的肝脏脂质代谢过程的分子机理。  非酒精性脂肪肝(Non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)是常见的慢性肝病之一,其特征是肝细胞肿胀和/或小叶炎症,可导致肝纤维化,最终可能发展为肝硬化和原发性肝癌。研究表明,Hh信号通路在NAFLD的病人和小鼠的肝脏中均被激活,且Sonic Hedgehog的表达水平与NAFLD的严重程度密切相关。然而,肝细胞Hh信号在NAFLD或任何其他肝病中的功能及作用机制尚未确定。  赵允研究组发现,Hh信号通路可直接调控一个之前未定义的、在脂质代谢中起到重要作用的长链非编码RNA(Hilnc,Hedgehog信号诱导的长链非编码RNA),从而参与脂质代谢。突变Hilnc启动子区中的Gli结合位点在体内和体外均可显著降低Hilnc的表达。在高脂喂养下,HilncBM/BM(BM:Gli binding site mutation,Hilnc启动子区中的Gli结合位点突变小鼠)和Hilnc-/-(Hilnc基因敲除)小鼠可以抵抗饮食诱导的肥胖及脂肪肝的发生。研究还发现,Hilnc的缺失会明显减弱小鼠肝脏中PPAR信号通路相关基因的表达。Hilnc可以直接与mRNA结合蛋白IGF2BP2结合调节Pparγ的mRNA的稳定性,进而调控肝脏脂肪代谢。此外,科研人员还在人类基因组中发现了Hilnc的功能同源物——h-Hilnc。这一新发现的Hh-Hilnc-IGF2BP2-Pparγ信号轴,为进一步阐释Hh信号通路调控lncRNAs及lncRNAs如何参与系统性代谢过程提供了新证据,并为肥胖及脂肪肝相关疾病的新的潜在药物靶点的发现提供了理论依据。  研究工作获得分子细胞卓越中心动物实验技术平台、细胞分析技术平台和分子生物学技术平台的支持,并得到国家自然科学基金委、科技部、中科院、上海市等的资助。  论文链接
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