涅氏小短杆菌

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  • 【金秋计划】“芽孢杆菌”鉴别小技巧

    [size=12px][b][b]一、形态学特征[/b][/b] 形态学鉴别菌种是最直接的方法,也是最简单的方法。[b][color=#000000][b][color=#000000][b]1.菌落特征[/b][/color][/b][/color][/b]不同的菌种在不同培养基上菌落形态不同,这是鉴别所有菌种的特征之一。不同的芽孢杆菌,菌落的大小、颜色、凸起、边缘形状等也不同。因此,根据菌落形态可以区分不同的芽孢菌种。有的边缘整齐,有的边缘呈锯齿状,特征非常明显。拿到菌种,记住菌落形态或拍照记录很重要。[b][color=#000000][b]2.芽孢位置[/b][/color][/b]芽孢杆菌,属于革兰氏染色阳性菌,最大的特点就是能够产生芽孢,不同的芽孢杆菌芽孢出现的位置不同,这是鉴别芽孢杆菌的重要特征之一。有的芽孢在菌体的中部、有的在菌体一侧或顶端。可以按照芽孢的位置区分是否属于自己的菌种。观察芽孢可以采用简单染色法也可以采用芽孢染色法。 [b][b]二、生化生化特征[/b][/b] 相比形态学特征,生化特性比较繁琐,但是鉴别芽孢杆菌的重要方法。通过分析芽孢杆菌分泌的代谢产物,比如说酶活、条带的位置、抑菌圈、有机酸等,鉴别是否是目标产物,进而鉴别是否是自己的菌种。 [b][b]三、分子生物学手段[/b][/b] 如果形态学方法和生理生化方法不能鉴别,只能采用分子生物学手段。每个菌种的遗传物质都不同,常采用16S rDNA测序,跟已知序列进行比对后,可以准确地定位芽孢杆菌的种属,这是鉴别菌种最重要的方法。 [/size]

  • 革兰氏阳性芽孢杆菌和球菌

    革兰氏阳性芽孢杆菌和球菌,该类群中与食品关系密切的菌属如下。1.芽孢杆菌属(Bacillus)该属可形成芽孢,对不良环境条件有很强的抵抗力。需氧或兼性厌氧,绝大多数菌种产生过氧化氢酶。该菌广泛分布于土壤、植物、腐殖质及食品上。其中包括人和动物的病原性细菌炭疽芽孢杆菌(B.anthracis)、食物中毒性细菌蜡样芽孢杆菌(B.cereus)、昆虫的病原菌苏云金芽孢杆菌(B.thuringiensis)、可用于食品工业生产的枯草芽孢杆菌(B.subtilis)。此外,也包括一些可引起食品腐败变质和食物中毒的菌种。(1)蜡样芽孢杆菌(B.ccrcl2S):该菌广泛分布于土壤、水、调味料、乳及咸肉中,污染牛乳后可产生卵磷脂酶,破坏脂肪球膜,使得脂肪不能很好地乳化,还可以产生类似凝乳酶的酶,使乳在酸度不高时即可发生凝固。蜡样芽孢杆菌的生长温度为10~48℃,pH值为4·9~9·3,发芽温度范围为1~59℃。该菌污染食品后,可以引起食品腐败变质,并且产生下痢性毒素、肠毒素、溶血素、呕吐毒素及肠管坏死毒素等,引起人食物中毒。(2)枯草芽孢杆菌(B.subtilis):该菌菌落呈圆形或不规则形状,表面粗糙或有皱纹,呈奶油色或褐色,菌落形态与培养基成分有关。枯草芽孢杆菌污染面粉后,可以使发酵面团产生液化黏丝状现象,使烤制的面包**头出现斑点或斑纹,并且伴有异味。在肉类表面可产生黏液并有异味。在肉类罐头及其他肉制品上经常可以分离到该菌,但在密封的罐头中较少引起变质。在牛乳中生长,可以使牛乳变稠,有时在不变酸时使牛乳凝固,即产生所谓的甜凝乳现象。(3)巨大芽孢杆菌(B.megaterium):该菌可以在含氨的环境中生长,不需要生长因子,无卵磷脂酶活性。在厌氧条件下,于葡萄糖肉汤中不生长,多数菌株可在培养基中产生黄、粉红、褐或黑色色素。适宜生长温度为28~37℃。该菌可以从鲜乳、消毒乳、于酪、肉类等食品中分离到,可使浓缩乳凝固并产生干酪味和气体,使肉类罐头变质胀罐。(4)嗜热脂肪芽孢杆菌(B.stearothermophilus):该菌菌落为圆形或不规则圆形小菌落,表面光滑或粗糙,能在49~65℃范围内生长,对热的抵抗力很强。该菌在pH值5.0以下的培养基上不生长。该菌主要可引起罐藏食品和淀粉类食品的腐败。(5)凝结芽孢杆菌(B.coagulans):该菌菌落为不透明的小菌落,生长温度范围为18~60℃,可在酸性条件下生长。在有氧条件下于葡萄糖肉汤中生长,产生醋酸、乳酸和CO2。在厌氧条件下主要产生乳酸,不产气。该菌能在pH值3.5~**5的食品中生长,引起食品变质,罐头食品变质后外观不膨胀。在炼乳罐头中,通常使乳形成坚实凝结,偶尔呈碎片状凝结,并有乳清析出。此种变质亦常发生于含有蔗糖的乳制品中。2.梭菌属(Clostridium)该属的绝大多数种为厌氧菌,只有少数种可在大气条件下生长,但在大气中不形成芽孢。该属菌形成的芽孢多呈球形,位于菌体中央,使菌体呈梭状。对不良环境条件具有极强的抵抗力。该属菌对营养的需要因菌种不同而异。可耐受2.5%~6.5%NaCl浓度的渗透压,对亚硝酸钠和氯敏感。梭菌广泛分布于土壤、下水污泥、海水沉淀物、腐败植物、食品、人和其他哺乳动物的肠道内。该属中的一些菌种如丁酸梭菌(C.butyricum)可分解碳水化合物产生各种有机酸(乙酸、丙酸、丁酸)和醇类(乙醇、异丙醇、丁醇),在食品加工上可用于生产某些酸、醇和酮类。一些菌种如腐化梭菌(C.putrefaciENs)分解蛋白质和氨基酸,产生H2S、硫醇、甲基吲哚(粪臭素)等具有恶臭味的腐败产物,在乳中生长时可使乳中酪蛋白完全胨化,在熟肉上生长使肉变黑,在罐头中生长时,因产气使罐头发生膨胀。肉毒梭菌(c.botulinum)在食品中增殖时可产生肉毒毒素,当人们食入含有该毒素的食品时,可发生毒素型食物中毒,早期症状为全身无力、头痛、头晕,继而出现眼睑下垂、视力模糊、瞳孔散大、吞咽困难等症状直至死亡。此外某些梭菌如破伤风梭菌(C.terni)是人和动物的破伤风病病原菌。

  • 革兰氏阳性芽孢杆菌和球菌

    革兰氏阳性芽孢杆菌和球菌,该类群中与食品关系密切的菌属如下。1.芽孢杆菌属(Bacillus)该属可形成芽孢,对不良环境条件有很强的抵抗力。需氧或兼性厌氧,绝大多数菌种产生过氧化氢酶。该菌广泛分布于土壤、植物、腐殖质及食品上。其中包括人和动物的病原性细菌炭疽芽孢杆菌(B.anthracis)、食物中毒性细菌蜡样芽孢杆菌(B.cereus)、昆虫的病原菌苏云金芽孢杆菌(B.thuringiensis)、可用于食品工业生产的枯草芽杆菌(B.subtilis)。此外,也包括一些可引起食品腐败变质和食物中毒的菌种。(1)蜡样芽孢杆菌(B.ccrcl2S):该菌广泛分布于土壤、水、调味料、乳及咸肉中,污染牛乳后可产生卵磷脂酶,破坏脂肪球膜,使得脂肪不能很好地乳化,还可以产生类似凝乳酶的酶,使乳在酸度不高时即可发生凝固。蜡样芽孢杆菌的生长温度为10~48℃,pH值为4·9~9·3,发芽温度范围为1~59℃。该菌污染食品后,可以引起食品腐败变质,并且产生下痢性毒素、肠毒素、溶血素、呕吐毒素及肠管坏死毒素等,引起人食物中毒。(2)枯草芽孢杆菌(B.subtilis):该菌菌落呈圆形或不规则形状,表面粗糙或有皱纹,呈奶油色或褐色,菌落形态与培养基成分有关。枯草芽孢杆菌**面粉后,可以使发酵面团产生液化黏丝状现象,使烤制的面包或馒头出现斑点或斑纹,并且伴有异味。在肉类表面可产生黏液并有异味。在肉类罐头及其他肉制品上经常可以分离到该菌,但在密封的罐头中较少引起变质。在牛乳中生长,可以使牛乳变稠,有时在不变酸时使牛乳凝固,即产生所谓的甜凝乳现象。(3)巨大芽孢杆菌(B.megaterium):该菌可以在含氨的环境中生长,不需要生长因子,无卵磷脂酶活性。在厌氧条件下,于葡萄糖肉汤中不生长,多数菌株可在培养基中产生黄、粉红、褐或黑色色素。适宜生长温度为28~37℃。该菌可以从鲜乳、消毒乳、于酪、肉类等食品中分离到,可使浓缩乳凝固并产生干酪味和气体,使肉类罐头变质胀罐。(4)嗜热脂肪芽孢杆菌(B.stearothermophilus):该菌菌落为圆形或不规则圆形小菌落,表面光滑或粗糙,能在49~65℃范围内生长,对热的抵抗力很强。该菌在pH值5.0以下的培养基上不生长。该菌主要可引起罐藏食品和淀粉类食品的腐败。(5)凝结芽孢杆菌(B.coagulans):该菌菌落为不透明的小菌落,生长温度范围为18~60℃,可在酸性条件下生长。在有氧条件下于葡萄糖肉汤中生长,产生醋酸、乳酸和CO2**厌氧条件下主要产生乳酸,不产气。该菌能在pH值3.5~4.5的食品中生长,引起食品变质,罐头食品变质后外观不膨胀。在炼乳罐头中,通常使乳形成坚实凝结,偶尔呈碎片状凝结,并有乳清析出。此种变质亦常发生于含有蔗糖的乳制品中。2.梭菌属(Clostridium)该属的绝大多数种为厌氧菌,只有少数种可在大气条件下生长,但在大气中不形成芽孢。该属菌形成的芽孢多呈球形,位于菌体中央,使菌体呈梭状。对不良环境条件具有极强的抵抗力。该属菌对营养的需要因菌种不同而异。可耐受2.5%~6.5%NaCl浓度的渗透压,对亚硝酸钠和氯敏感。梭菌广泛分布于土壤、下水污泥、海水沉淀物、腐败植物、食品、人和其他哺乳动物的肠道内。该属中的一些菌种如丁酸梭菌(C.butyricum)可分解碳水化合物产生各种有机酸(乙酸、丙酸、丁酸)和醇类(乙醇、异丙醇、丁醇),在食品加工上可用于生产某些酸、醇和酮类。一些菌种如腐化梭菌(C.putrefaciENs)分解蛋白质和氨基酸,产生H2S、硫醇、甲基吲哚(粪臭素)等具有恶臭味的腐败产物,在乳中生长时可使乳中酪蛋白完全胨化,在熟肉上生长使肉变黑,在罐头中生长时,因产气使罐头发生膨胀。肉毒梭菌(c.botulinum)在食品中增殖时可产生肉毒毒素,当人们食入含有该毒素的食品时,可发生毒素型食物中毒,早期症状为全身无力、头痛、头晕,继而出现眼睑下垂、视力模糊、瞳孔散大、吞咽困难等症状直至死亡。此外某些梭菌如破伤风梭菌(C.terni)是人和动物的破伤风病病原菌。**

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  • 使用超高效合相色谱分析短杆菌肽
    使用超高效合相色谱(UPC2)分析短杆菌肽 Sean M. McCarthy, Andrew J. Aubin, 和 Michael D. Jones 沃特世公司(美国马萨诸塞州米尔福德) 应用效益 ■ 快速分离短杆菌肽 ■ 载量线性响应 ■ 准确、高精度分析短杆菌肽的方法 ■ 有可能用于其它疏水性肽和蛋白质 沃特世解决方案 ACQUITY UPC2系统 ACQUITY® SQD ACQUITY UPC2 CSH氟苯基色谱柱 Empower&trade 3软件 关键词 超高效合相色谱、UPC2、疏水性肽、短杆菌肽 简介 用反相液相色谱(RPLC)分析疏水性肽和蛋白质难度很大,因为溶液中经常需要使用洗涤剂保持疏水性物质的稳定性,而这些洗涤剂容易发生聚集和/或沉淀,严重影响它们的回收,这些因素以及其它原因使得难以用RPLC分离疏水性肽和蛋白质。 在本应用纪要中,我们为您介绍一种在ACQUITY UPC2TM系统上使用沃特世(Waters® )超高效合相色谱技术分离典型跨膜肽-短杆菌肽的方法。 短杆菌肽是由芽孢杆菌产生的一种常见和已被良好表征的跨膜肽物质,它被用作对抗革兰氏阳性和某些革兰氏阴性细菌的局部用抗生素,短杆菌肽包括通用组成为甲酰-L-缬氨酸-甘氨酸-L-丙氨酸-D-亮氨酸-L-丙氨酸-D-缬氨酸-L-缬氨酸-D-缬氨酸-L-色氨酸-D-亮氨酸-L-X-D-亮氨酸-L-色氨酸-D-亮氨酸-L-色氨酸-氨基乙醇的一族化合物,其中X取决于短杆菌肽分子,即分别占总短杆菌肽量约87.5%、7.1%和5.1%的革兰氏A(X=色氨酸)、革兰氏B(X=苯丙氨酸)和革兰氏C(X=酪氨酸),1需要交替的D和L氨基酸单元构成_-螺旋状。 我们研究了色谱柱化学品、流动相改性剂和梯度斜率对分离短杆菌肽的影响。采用优化方法分离市场上销售的非处方药物(OTC),将测定的短杆菌肽浓度与标示量进行对比。采用质谱仪测定短杆菌肽的浓度,采用选择离子谱表征每种物质。在ACQUITY UPC2系统上使用我们的方法,可得到线性和可重复的结果&mdash &mdash 测定的OTC制剂浓度为标示量的98.4%。 试验 测试条件 除非另有说明,以下是用于所有色谱最终方法的最佳条件。 UPC2测试条件 UPC2系统: ACQUITY UPC2 检测器: PDA、ACQUITY SQD PDA @ 280nm,分辨率为6 nm(补偿400至500 nm) 色谱柱: ACQUITY UPC2 CSH 氟苯基,3.0 x 100 mm, 1.7 &mu m 柱温: 50 ° C 样品温度: 15 ° C UPC2 ABPR: 1885 psi 进样量: 1 &mu L 流速: 2.0 mL/min 流动相A: CO2 流动相B: 含0.1%TFA的甲醇(除非另有标示) 梯度: 20%至30% B,1.5min SQD条件 离子源: ES+ 锥孔电压: 20 V 毛细管电压:3.7kV 源温度: 150 ° C 脱溶剂气温度: 500 ° C 脱溶剂气体流速: 400 L/hr 锥孔气体流速: 25 L/hr SIR: 922.6,930.3,941.9 数据管理 Empower 3软件 样品描述 用解硫胺素芽孢杆菌(短芽孢杆菌)制备的短杆菌肽从Sigma Aldrich公司购买,将样品溶解在甲醇中制成0.5mg/mL浓度的溶液,如需要,可用甲醇稀释。含有短杆菌肽的非处方软膏是从当地药店购买的。将0.2g软膏溶解在10mL正己烷中,然后用5mL甲醇萃取短杆菌肽,去除甲醇层,用0.2-&mu m的烧结玻璃盘过滤,然后直接进样ACQUITY UPC2系统。 结果与讨论 我们系统性地筛选了四种色谱柱,测定哪种分离效果最佳,结果如图1所示,色谱柱筛选过程可在1小时内非常快速地完成。在我们设定的筛选条件下,BEH 2-EP和BEH色谱柱未检测到谱峰,由于其它色谱柱表现出合适的色谱性能,因而未对这两者的非洗脱原因深入研究,其中ACQUITY UPC2 CSH氟苯基色谱柱检测的色谱峰形最佳,因此采用该色谱柱继续研究。 图1.通过短杆菌肽标准物的色谱峰形和保留时间筛选各种化学特性色谱柱。所有色谱柱规格为3.0x100mm,填装亚-2-微米填料;所有分离条件都采用流动相 A:CO2、流动相 B、含0.1% FA的MeOH、2 mL/min, 3%B至25% B,5min。 为了分离短杆菌肽物质,对酸性改性剂的影响进行了研究,结果表明:使用三氟乙酸(TFA)可得到稍好的峰形,提高了短杆菌肽A和短杆菌肽C之间的分离度,结果如图2所示。已知TFA会抑制质谱电离,但每种物质的信号都足以定量检测治疗制剂,后续将对此进行讨论。对于要求更高灵敏度的应用,可能需要降低TFA浓度或使用甲酸,以达到希望的检测限值。 图2.酸性改性剂对分离短杆菌肽的影响。 当设置好合适色谱条件后,通过减少梯度时间优化分离过程,结果如图3所示,我们能够在1.5分钟时间内使每种短杆菌肽组分的分离度达到1.4或更高,在相同流速下通过减少运行时间增加梯度斜率,不但实现有效分离,同时还将短杆菌肽A的信噪比从336提高至605。 图3.UV 280-nm痕量检测优化分离短杆菌肽A、B和C。 我们测试了最佳分离条件,能够使用单四极杆质谱(SQD)检测每种物质,图4显示:每种物质都被质谱良好分离和检测到,另外每种短杆菌肽物质都显示含有绝大多数的M+2H离子,后续的研究将使用这些参数进行选择离子监测。 图4:每种短杆菌肽物质的总离子图谱-A和加合离子图谱-B-D。选择强度最高的离子评估市场上销售的抗菌制剂中的短杆菌肽含量,对于多肽序列,红色残基是L型同分异构体,黑色残基是D型同分异构体。 为了评估我们的方法是否适用于定量分析市场上销售的非处方药中的短杆菌肽,我们在ACQUITY SQD上使用选择离子监测,结果如图5A所示。我们绘制浓度-峰面积曲线,得到每种物质的校正曲线。结果发现:如图5B-D所示,每种成分在测试范围内都呈线性响应。另外还使用校正曲线测定了非处方药物中的每种短杆菌肽物质浓度。 图5,图A-25.0、12.5、1.25和0.625mg/mL浓度的标准溶液中含有短杆菌肽物质的叠加选择离子谱。图B、C和D-每种短杆菌肽A、B和C各自的MS峰面积线性拟合图。 使用开发的方法评估非处方药物中的短杆菌肽物质的浓度和相对丰度。如图6所示,重复分析结果表明:每种短杆菌肽%RSD值小,计算浓度与标签上的标称值相吻合;我们还发现短杆菌肽物质的相对丰度与文献报道的丰度非常吻合1。 图6. 从抗菌软膏中萃取的短杆菌肽A、B和C的叠加选择离子谱重复进样分析的计算RSD值(N=3)在可接受限值以内,计算丰度与文献报道数值非常吻合1。 结论 正如本应用纪要所展示的,ACQUITY UPC2系统与ACQUITYUPC2色谱柱化学结合使用,可为短杆菌肽提供简单、准确和可重现的分析方法。该工作表明ACQUITY UPC2系统可用于分析疏水性肽,还可能用于分析疏水性蛋白质,例如膜蛋白。 参考文献 1. The Merck Index and Encyclopedia of Chemicals, Drugs, and Biologicals.13th ed. Whitehouse Station, NJ : Merck Research Laboratories 2001. 关于沃特世公司 (www.waters.com) 50多年来,沃特世公司(NYSE:WAT)通过提供实用和可持续的创新,使医疗服务、环境管理、食品安全和全球水质监测领域有了显著进步,从而为实验室相关机构创造了业务优势。 作为一系列分离科学、实验室信息管理、质谱分析和热分析技术的开创者,沃特世技术的重大突破和实验室解决方案为客户的成功创造了持久的平台。 2010年沃特世拥有16.4亿美元的收入和5,400名员工,它将继续带领全世界的客户探索科学并取得卓越成就。 联系人: 叶晓晨 沃特世科技(上海)有限公司 市场服务部 xiao_chen_ye@waters.com 周瑞琳(GraceChow) 泰信策略(PMC) 020-83569288 13602845427 grace.chow@pmc.com.cn
  • “嗜血”的质谱——关于流感嗜血杆菌和溶血嗜血杆菌的鉴定问题
    p   卫生部临检中心组织的2018年第一次临床微生物室间质评已经结束,但关于流感嗜血杆菌和溶血嗜血杆菌的鉴定问题,在微信朋友圈里谈得正热烈 (见文《溶血 or 流感?傻傻分不清?》)[1]。主要是因为在这次质评中,生化鉴定仪和有些品牌的质谱仪的鉴定结果出错了。令小布自豪的是,布鲁克MALDI Biotyper质谱的鉴定结果与标准答案完全相符!所以小布在这里来一段点评。 /p p   流感嗜血杆菌和溶血嗜血杆菌虽然同属,但属于两个不同的种,致病性和临床意义也大不相同,前者是上呼吸道感染的常见致病菌,而后者是上呼吸道的正常定植菌。小布认为要认真、仔细地把它们区分开,千万不要混淆! /p p   可是这两种菌的亲缘关系很近,用传统的形态学和生化方法难以区分。虽然产荚膜的流感嗜血杆菌可以通过荚膜肿胀实验区别于溶血嗜血杆菌,但有些流感嗜血杆菌是不产荚膜的,通常被认为是无法分型的。同样,虽然有的溶血嗜血杆菌能够通过卫星试验观察到溶血环,但不是所有的溶血嗜血杆菌都能观察到明显的溶血环。 /p p   难道就没有好办法了吗?当然不是! /p p    span style=" color: rgb(31, 73, 125) " strong 质谱是区分流感嗜血杆菌和溶血嗜血杆菌的好方法 /strong /span /p p   早在2013年中国CDC的研究人员就通过质谱图的聚类分析,发现质谱可以把流感嗜血杆菌和溶血嗜血杆菌清楚地分成两类,甚至可以把不同地区来源的菌株进一步细分(见图1)[2]。 /p p style=" text-align: center" strong img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201805/insimg/dfbc448c-6829-4363-bbc8-eb80e5161d6e.jpg" title=" 1.jpg" width=" 450" height=" 409" border=" 0" hspace=" 0" vspace=" 0" style=" width: 450px height: 409px " / /strong /p p strong   ▲图1. 流感嗜血杆菌和溶血嗜血杆菌的聚类分析树状图(MALDI Biotyper结果) /strong /p p   2014年荷兰公共卫生区域实验室、荷兰医学中心与布鲁克微生物研发中心共同发表了MALDI Biotyper能够正确鉴定流感嗜血杆菌和溶血嗜血杆菌的文章 [2],专家们通过分析不同来源的277个菌株,发现质谱法与测序法鉴定流感嗜血杆菌和溶血嗜血杆菌的结果几乎完全一致(见表1)。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201805/insimg/5e7cf664-5cee-4464-b1b3-ac63e6d76a51.jpg" title=" 2.jpg" / /p p    strong ▼表1.流感嗜血杆菌和溶血嗜血杆菌的MALDI Biotyper质谱法与测序法鉴定结果比较 /strong /p p   另外,布鲁克公司在美国FDA注册进行临床试验的结果显示:通过对74个流感嗜血杆菌和31个溶血嗜血杆菌的检测MALDI Biotyper质谱法鉴定100%正确!(结果摘自布鲁克公司提交美国FDA的报告) /p p   可见,质谱是区分流感嗜血杆菌和溶血嗜血杆菌可以信赖的方法!有些老师不免心生疑问:既然布鲁克质谱的鉴定结果都是正确的,那为什么其它品牌的质谱鉴定错了呢? /p p    strong span style=" color: rgb(31, 73, 125) " 质谱法的数据库和鉴定结果的算法非常重要 /span /strong /p p   原来呀,质谱鉴定微生物时,需要通过软件拿采集到的样品“蛋白指纹图”到数据库里进行逐个比对,因此,数据库建立与比对时所采用的理念与算法,以及数据库的容量,是影响鉴定结果非常重要的因素。 /p p   布鲁克MALDI Biotyper的建库理念是以菌株为单位,数据库中每个条目都是一个独立的菌株。它的比对算法是采用指纹识别中的“模式识别”算法,就是把样品的“蛋白指纹图”与数据库中所有菌株的“蛋白指纹图”快速自动地进行逐个图逐个峰的比较,看看每对比对的“蛋白指纹图”之间有哪些峰是匹配的,哪些峰是不匹配的,以及匹配的谱峰之间相对强度的相关性,从而得到一个综合的匹配分数,并根据分数值告诉我们鉴定的可信程度。 /p p   MALDI Biotyper的算法看上去通俗、简单,正可谓“大道至简”吧,不仅非常实用!而且最大程度上避免了误判!就像警察通过指纹比对来识别罪犯一样,只要数据库里有罪犯的指纹,它就能正确地识别出罪犯 即使数据库里没有罪犯的指纹,它也不会找错,只是告诉我们当前数据库里没有匹配的指纹,只要扩大搜索数据库的范围,定会让罪犯无以循形,不会造成冤假错案! /p p   有些老师可能会问:我们是做菌种鉴定,MALDI Biotyper的数据库为什么不以菌种为单位,而是以菌株为单位建立的呢?难道它能鉴定到菌株吗? /p p   大家知道,微生物种类繁多,每种微生物又包含丰富多样的不同菌株,而同一菌种内不同菌株之间的差异是天然存在的,并和微生物的种类有关,有的种内差异大,有的种内差异小。所以,布鲁克决定在菌株水平上建库,并在选择每个菌种的建库菌株时,尽可能包含差异大的菌株,而剔除差异小的菌株。MALDI Biotyper在菌株水平建库,具有以下优势: /p p    span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 给代表性菌株预留了充分的覆盖范围 /span /p p span style=" color: rgb(255, 0, 0) "   避免了数据库不必要的冗余 /span /p p span style=" color: rgb(255, 0, 0) "   容易实现数据库的扩充和更新 /span /p p span style=" color: rgb(255, 0, 0) "   能快速适应分类学的改变 /span /p p   充分发挥了质谱技术分辨能力远远高于传统方法(如生 span style=" color: rgb(255, 0, 0) " /span 化方法)的特点,不丢失种水平之内菌株之间的差异。 /p p   正是由于上述优势,美国CDC、加拿大国家微生物实验室和美国NIH等多家机构也在采用布鲁克的仪器和理念建立数据库并对外开放。 /p p   通过以上对布鲁克MALDI Biotyper质谱的数据库与软件算法的简单介绍,相信各位老师就能理解为什么这次卫生部的质评中,布鲁克质谱的鉴定结果是正确的,也就很好理解为什么美国FDA批准Bruker MALDI Biotyper CA系统作为首个鉴定新型致病菌耳念珠菌(C. auris) 的新方法了[4-6]。 /p p   参考文献 /p p   1. 溶血 or 流感?傻傻分不清? /p p   2. B. Q. Zhu, D Xiao et al. MALDI-TOF MS Distinctly Differentiates Nontypable Haemophilus influenzae from Haemophilus haemolyticus.PLoS One. 2013 8(2): e56139 /p p   3. J. P. Bruin, M. Kostrzewa et al. Identification of Haemophilus influenzae and Haemophilus haemolyticus by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2014, 33:279–284 /p p   4. https://www.fda.gov/NewsEvents/Newsroom/PressAnnouncements/ucm605336.htm /p p   5. FDA首次批准质谱方法鉴定新型致病菌耳念珠菌 (Candida auris) /p p   6. “布”下天罗地网,防止“耳念”侵袭 /p
  • 肉毒杆菌标准缺失 并非必检项目
    一场肉毒杆菌风波,卷入数家企业。肉毒杆菌为何物?国际以及国内是否有相关标准?   中国农业大学食品科学与营养工程学院副教授朱毅在接受记者采访时表示,不管国内国外,奶粉生产中,肉毒杆菌都不作为必检项目,但是不少企业都有一定的相关自检。&ldquo 根据乳品和奶粉的相关工艺和食用人群,相对来讲本次涉及的乳品应该是安全的,但是给6~12月份婴幼儿食用的奶粉需要警惕。&rdquo   肉毒杆菌尚无相关标准   资料显示,肉毒杆菌是一种生长在常温、低酸和缺氧环境中的革兰氏阳性细菌。食入和吸收这种毒素后,神经系统将遭到破坏,出现恶心、呕吐、头晕、呼吸困难和肌肉乏力等症状。   &ldquo 由于肉毒杆菌并不是全部有毒,并且企业都有一定的内控标准,而含乳饮料、奶粉等生产又有一定的高温生产工艺,基本上肉毒杆菌芽孢都给消灭掉了。&rdquo 朱毅表示,在临床上,这种感染非常罕见,因此也就没有制定相关的标准。   乳业专家王丁棉也表示,肉毒梭状杆菌其致病性在于它所产生的肉毒毒素,肉毒毒素系蛋白质类毒素,对热敏感,不耐高温不耐高酸。酸度pH4.5以下或者温度在45℃就可以抑制它,100℃的高温几分钟可以杀死。   &ldquo 但对奶粉还需要一定的警惕,虽然基本毒素不存在,就怕如果奶粉中有芽孢,因为芽孢耐热能力比较强,在加工工艺中没有消灭的话可能有一定的风险。食用2段奶粉的婴幼儿都是6~12月的婴幼儿,婴幼儿的肠道不是很强,如果繁殖分泌毒素,就会有肉毒毒素中毒。&rdquo 朱毅说。   监管须打通全产业链   有人士指出,洋奶粉问题频出,暴露出我国相关国家标准缺失的问题,有关部门应尽快完善相关标准,才能提升监管力度。   但一名国家食品安全标准制定专家曾对《每日经济新闻》记者表示,在现有多项标准已经出台的情况下,新标准的制定须经过严格论证,而且需要一定的成本,增加的成本会转嫁到消费者身上。目前可行的办法并不是倒逼更多的标准出台,而是在贯彻好既有标准的前提下,打通全产业链的有力监管,这一点在乳制品产业链中显得尤为重要。   食药监总局相关负责人对记者表示,针对经营企业的标准规范仍在制定过程中,为实现全程追溯,卫计委正在就规范的制定紧密协商,未来将出台的新规将就批批检验以及流通环节检验等多方面提出要求。   上述国家食品安全标准制定专家认为,乳制品产业链在饲料、加工、存储、包装、运输等环节都可能造成质量问题。从原料采购,到生产企业生产,再到经营企业销售等,监管部门的监管须建立起全程质量追溯体系,拓展到产业链的每一个环节中。

涅氏小短杆菌相关的仪器

  • 英国DelAgua大肠螺杆菌生物分析仪要实现了饮用水的八个基本检测,包括微生物、浊度、余氯、总氯、电导率、总溶解固体(TDS),pH值和温度。英国DelAgua大肠螺杆菌生物分析仪产品简介:DelAgua大肠螺杆菌生物分析仪要实现了饮用水的八个基本检测,包括微生物、浊度、余氯、总氯、电导率、总溶解固体(TDS),pH值和温度。该套件是专门用在在该领域,但也可用于实验室或其他固定的地方,而且该套件提供了一系列的配件,很大程度的增加了水质监测范围。英国DelAgua大肠螺杆菌生物分析仪产品特点:. 测试需要品 医院里的压力锅或便携式消毒器或反应釜。.甲醇(约1毫升/测试)蒸馏水1升的量筒或量杯清洁布. 耐热大肠菌群(粪便):该工具箱包括一个由电池供电的便携式培养器,它能够在没有电,发电机或车载电源的情况下完成5个循环的培养。耐热性(粪便)可在14到18小时之间采样,这样可以在不需要运输或实验室设施的情况下减小卫生风险。. 浊度试验:一种水供应量的悬浮物量。悬浮物可消耗氯消毒剂,并需在消毒前进行处理。浊度测量有2种方法,一个是用简单的杰克逊管来测量(测量到2000 NTU),另外一个是用精度范围为0-1000NTU的便携式数字浊度仪来测量。. 氯和pH值测试:很多急救水供应都使用含氯消毒剂来确保饮用水。这些测试可以快速评估氯的水平,并有助于有效地控制剂量,从而确保有足够的氯来保障供应。. 电导率和TDS:电导率仪配备有这种试剂盒。电导率可以显示污染指标,如盐水入侵或污水污染。此外,该电导率仪也可以作为污染指标来测量TDS。测试:耐热(粪便)大肠菌,浊度,游离氯和总氯,pH,温度,电导率和总溶解固体(TDS).额外的水测试设备以扩大监控范围.内置电池,可通过市电或汽车电池进行充电.16-测试能力英国DelAgua大肠螺杆菌生物分析仪产品参数:. 可以另外选配的部件:. 派力肯箱,其中带有基本的培养皿. EC、pH和TDS(LR)测试仪防水袋. delagua手册. delagua培训光盘. 铝垫片. 青铜盘. 样品杯. 外置电池电源引线与两脚插头. 保险丝. 挂绳. 无孔的培养皿盖. 甲醇机. O形圈. 3套可重复使用16次的铝皿. 聚丙烯瓶60×10ml. 过滤漏斗. 硅胶环. 酒精温度计. 微调工具. 浊度管. 镊. 真空杯及泵. 手持放大镜. 巴斯德吸管x10. 比较仪. 小瓶润滑油. 电子定时器. 供200次检测的耗材. 膜过滤器和垫×200. 附加信息. 尺寸:37×14×26厘米. 重量(约):10kg. 培养温度:44°C. 电源:12V(由内部电池充电器提供)
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  • GNST-WECT-8000水质大肠杆菌(菌群)在线分析仪 仪器简介在线大肠杆菌(菌群)分析仪采用国际标准的方法,酶与细菌培养反应后光信号变化成正比这一原理,反映出样品中细菌总量或大肠菌群的多少。系统广泛用于饮用水水源、应急评估及多细菌的测定,能对水污染事件进行预警,同时可预警一般性水体污染事件以及食物中毒事件。 应用领域可广泛应用于水环境自动监测站、污水处理厂、自来水厂、排污监控点、地区水界点、水质分析室以及各级环境监管机构对水环境的监测。 测定原理大肠杆菌(菌群)测试技术是一种基于生物传感技术的大肠杆菌(菌群)检测系统,它提供一种有效应对供水污染的检测手段。测量原理采用国际标准ISO9308中规定的标准方法,能确保适应各种不同水质对大肠杆菌(菌群)的在线自动监测。水样大肠杆菌(菌群)的数量可以通过溶液光强变弱的程度与无毒对照空白实验的比较来表示。 产品特点1、操作简单,集成报表生成,实时反应全过程监测,并动态显示测试项目的反应曲线2、检测灵活,测量周期短,响应速度快,检测过程可自由设定3、自动进行质控和校准,保证测试结果的一致性和可靠性4、全自动控制,用户可编程检测参数,适应不同应用场合对可疑样本自动启动循环检测模式,同时启动控制模块警报机器断电后重新来电时,自动恢复工作状态5、运行可靠,使用和维护成本低,自动完成样本和试剂的分注、混匀和清洗,避免交叉污染维护简便,运行成本低,试剂消耗量小,每周维护一次,只需要更换试剂,一次性耗材成本低 技术参数 型号GNST-WECT-8000水质大肠杆菌(菌群)在线分析仪测量方法酶底物法检测参数总大肠菌群或耐热大肠杆菌(菌群)测量范围测量范围: 1个/100ml—1×109个/ 100 ml重复性5%分辨率1%测量时间小于12小时清洗维护测量前后自动进行清洗消毒测量间隔连续或者任意选择,可设置校准周期三个月人机操作超大屏幕彩色液晶触摸屏数据存储1年以上输出RS232,RS485,4-20mA正常工作条件环境温度:0~40℃电源要求220V AC±10%,50Hz±5%功率不大于200W外界环境无显著震动及电磁干扰,避免阳光直射尺寸500mm×1650mm×310mm(W×H×D)
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  • 大肠螺杆菌生物分析仪 (微生物细菌)产品介绍:大肠螺杆菌生物分析仪 (微生物细菌)测试需要品 医院里的压力锅或便携式消毒器或反应釜。.甲醇(约1毫升/测试)蒸馏水1升的量筒或量杯清洁布. 耐热大肠菌群(粪便):该工具箱包括一个由电池供电的便携式培养器,它能够在没有电,发电机或车载电源的情况下完成5个循环的培养。耐热性(粪便)可在14到18小时之间采样,这样可以在不需要运输或实验室设施的情况下减小卫生风险。. 浊度试验:一种水供应量的悬浮物量。悬浮物可消耗氯消毒剂,并需在消毒前进行处理。浊度测量有2种方法,一个是用简单的杰克逊管来测量(测量到2000 NTU),另外一个是用精度范围为0-1000NTU的便携式数字浊度仪来测量。. 氯和pH值测试:很多急救水供应都使用含氯消毒剂来确保饮用水的。这些测试可以快速评估氯的水平,并有助于有效地控制剂量,从而确保有足够的氯来保障供应。. 电导率和TDS:电导率仪配备有这种试剂盒。电导率可以显示污染指标,如盐水入侵或污水污染。此外,该电导率仪也可以作为污染指标来测量TDS。测试:耐热(粪便)大肠菌,浊度,游离氯和总氯,pH,温度,电导率和总溶解固体(TDS).额外的水测试设备以扩大监控范围.内置电池,可通过市电或汽车电池进行充电.16-测试能力产品参数:. 可以另外选配的部件:. 派力肯箱,其中带有基本的培养皿. EC、pH和TDS(LR)测试仪防水袋. 手册. 培训光盘. 铝垫片. 青铜盘. 样品杯. 外置电池电源引线与两脚插头. 保险丝. 挂绳. 无孔的培养皿盖. 甲醇机. O形圈. 3套可重复使用16次的铝皿. 聚丙烯瓶60×10ml. 过滤漏斗. 硅胶环. 酒精温度计. 微调工具. 浊度管. 镊. 真空杯及泵. 手持放大镜. 巴斯德吸管x10. 比较仪. 小瓶润滑油. 电子定时器. 供200次检测的耗材. 膜过滤器和垫×200. 附加信息. 尺寸:37×14×26厘米. 重量(约):10kg. 培养温度:44°C. 电源:12V(由内部电池充电器提供)
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涅氏小短杆菌相关的耗材

  • 大肠杆菌/大肠菌群快速检测片
    Charm 食品微生物快速检测片由日水公司生产,使用专利技术生产的预制的无菌干式培养基,可室温下保存。与传统方法相比,缩短测试时间,操作简便易学,有益于提高微生物检测质量和效率。测试片扩散层的立体结构中含培养基成分和胶化剂,当样品匀液被滴入扩散层的中央后,样品会因扩散层纤维的毛细现象而迅速自动地均匀扩散后形成凝胶,简化了传统式的实验操作程序。 ●主要成分:XM-G琼脂培养基与MAGENTA-GAL,X-GLUC●大肠杆菌菌落显蓝?蓝紫色,其它大肠菌菌落显粉?红色●36 ℃ ± 1 ℃培养24 h ± 2 h后计数●检测片体积小,方便取拿存放,可防止操作中造成的不必要污染。●可叠列培养,恒温培养箱空间使用率高。●检测片密封时可室温保存一年半,稳定性好。●通过AOAC PTM MicroVal认证。订货信息检测项目产品名称产品编号规格大肠杆菌/大肠菌群Charm EC6742674340片240片
  • 嗜酸乳杆菌的用途及使用方法!
    嗜酸乳杆菌的用途及使用方法! 嗜酸乳杆菌属于乳杆菌属,革兰氏阳性杆菌,杆的末端呈圆形,主要存在小肠中,释放乳酸,乙酸和一些对有害菌起作用的抗菌素,但是抑菌作用比较弱。早在20世纪70年代,北卡罗来纳州立大学从人体粪便中最先分离出LactobacillusacidophilusNCFM,它是唯一一株进行了基因测序和注释的嗜酸Chemicalbook乳杆菌。嗜酸乳杆菌是目前乳酸菌家族中广泛研究与开发的益生菌之一,被视为第三代酸乳发酵剂菌种,也是人体中重要的微生物。嗜酸乳杆菌不仅在胃中,它还是人体小肠内的主要益生菌。 一、菌种简介平台编号:bio-67309提供形式:冻干物拉丁属名:Lactobacillus acidophilus中文名称:嗜酸乳杆菌拉丁名称:Lactobacillus acidophilus其它保藏中心编号:=AS 1.2686来源历史:←中科院微生物所收藏时间:2010/10/15原始编号:LA-14资源归类编码:15131319101模式菌株:非模式菌株用途:研究;生产;奶制品(美国菌种)。主要用途:研究;生产具体用途:奶制品(美国菌种)。生物危害程度:四类培养基编号:CM0006培养基名称:MRS培养基培养基成分:酪蛋白胨 10.0g,牛肉膏 10.0g,酵母粉 5.0g,葡萄糖 5.0g,乙酸钠 5.0g,柠檬酸二铵 2.0g,Tween 80 1.0g,K2HPO4 2.0g,MgSO4.7H2O 0.2g,MnSO4.H2O 0.05g,CaCO3 20.0g,琼脂 15.0g,蒸馏水 1.0L,pH6.8。*培养CICC 10774时pH需调至5.0.培养温度:37℃需氧类型:厌氧保存方法:-80℃冰箱冻结法;真空冷冻干燥法共享方式:公益性共享;资源纯交易性共享;合作研究共享;资源交换性共享注意事项:仅用于科学研究或者工业应用等非医疗目的,不可用于人类或动物的临床诊断或治疗,非药用,非食用。 二、嗜酸乳杆菌的功效1、抑制病原菌、抗病害:嗜酸乳杆菌能有效调整动物肠道的菌群平衡,调节机体肠粘膜的免疫活性,增强免疫力,提高动物存活率。2、促进动物生长:能分泌乳酸,并产生蛋白酶、淀粉酶、脂肪酶等消化酶,有利于物质的分解;合成B族维生Chemicalbook素,氨基酸、未明促生长因子等营养物质,促进动物生长。3、净化养殖水体:明显降低养殖水体氨氮等有害物质的含量,分解鱼类残饵、粪便及水中有机质,改良水体环境,抑制水体中有害菌的繁殖生长,调节藻相平衡,控制有害菌藻,净化水质,促进鱼虾类健康生长。 三、嗜酸乳杆菌的用途嗜酸乳杆菌作为益生菌家族中的重要成员更是被广泛的应用于各种功能性食品当中,如瑞典研发的发酵燕麦粥,其产品中的益生菌能寄生于胃肠道壁上,有效地改善人体的免疫系统,增强免疫力。 四、嗜酸乳杆菌的使用方法嗜酸乳杆菌可与其它添加剂混合作预混料使用,经预混合后添加到粉料中或直接与其他饲料原料一起制粒;也可投于饮用水中饲喂。 五、嗜酸乳杆菌的获取方式嗜酸乳杆菌在胃中存活率一般能达到80%,但是若不经包埋处理,口服嗜酸乳杆菌后,它们的活力仍是会受到影响的;而如果将它们全部包埋,又无法发挥其在胃中的有益作用。因此我们首先选择由菌母直接繁育出的一代活菌,再将它们的一半应用双层包埋技术,不仅胃、肠同养,还保证了活菌在肠道中的活性。双包埋技术的优势还在于,外层的胶质在肠道内溶解后,内层的蛋白质还可帮助活菌定植在肠壁上,让它们代代繁殖,有效调节肠道微生态。根据卫生部公告2011年第25号,嗜酸乳杆菌是可用于婴幼儿食品的菌种。嗜酸乳杆菌的性状:冷冻干燥粉末,嗜酸乳杆菌活菌数:≥3.0×10cfu/g,水分:≤4.0%,如菌液,则水分80%。 六、嗜酸乳杆菌的增殖方式在营养丰富的MRS培养基巾,添加低聚糖对3株乳酸菌增殖的影响,如低聚异麦芽糖对嗜酸乳杆菌、乳酸乳杆菌、乳酸链球菌均有一定的增殖作用。低聚糖是由2~10个单糖单位通过糖苷键而连接的小聚合体,介于单体单糖与高度聚合的多糖之间。国外已有报道,低聚糖可以促进肠道双歧杆菌和乳酸菌的增殖,抑制大肠杆菌等的生长,还可以稳定肠道环境,提高肠黏膜免疫功能等。也有报道低聚果糖仅可提高粪便中微生物的数量,不能促进肠道中双歧杆菌的数量。通过本实验可以看出,低聚异麦芽糖和低糖均可一定程度的促进禽源嗜酸乳杆菌、乳酸乳杆菌和乳酸链球菌的增殖。低聚糖作为双歧因子,不能被消化道和病原菌利用,仅能被益生菌利用,从而可使益生菌大量繁殖,作为益生菌的增殖因子,增强益生菌的竞争优势。本实验进行了不同营养条件下异麦芽低聚糖对3株乳酸菌体外增殖的观察。本实验结果显示,在营养贫瘠的培养基中,低聚糖可以明显的促进乳酸菌的增殖,这对于临床上人和动物机体的肠道恢复具有积极的意义。乳酸杆菌和双歧杆菌等肠道有益菌群的生长增殖需要较高的营养水平,而大肠杆菌等条件致病菌对于营养的要求相对较低,在肠道内繁殖时,获得其生长的营养要求较容易。正常健康的机体肠道环境下,有益菌群获得足够的营养,生长增殖比较旺盛,对有害菌群亦起到了一定的抑制作用;而当机体肠道紊乱,有害菌群大量增殖消耗营养,有益菌群此时营养条件不够,生长增殖受到影响,从而更加加剧了肠道环境的恶化。而此时服用低聚糖,可有效的发挥其对于乳酸杆菌的增殖作用,加之其不被有害菌群所利用的特性,决定了它可以特异的促进双歧杆菌、乳酸杆菌生长,从而达到调节肠道菌群平衡的效果。北京百欧博伟生物技术有限公司的中国微生物菌种查询网提供微生物菌种保藏、测序、购买等服务,是中国微生物菌种保藏中心的服务平台,并且是集微生物菌种、菌种,ATCC菌种、细胞、培养基为一体的大型微生物查询类网站,自设设备及技术的微生物菌种保藏中心!欢迎广大客户来询!
  • 嗜热脂肪杆菌芽孢菌片
    嗜热脂肪杆菌芽孢菌片 ATCC7953 50片/包 菌株特点: 1、 该菌为需氧芽孢杆菌,细菌繁殖体G兰氏染色阴性呈紫色,细菌芽胞孔雀绿着色。其细菌繁殖体对培养基要求低,在溴甲酚紫葡萄糖蛋白胨琼脂上生长良好,表面粗糙呈米黄色。 2、 最适生长繁殖湿度为56-65℃,培养24h即可形成菌落,37℃下24h看不到菌落。 3、 本生物指示剂载体为高级滤纸片,染菌量为5× 105-5× 106cfu/片(6mm× 12mm/片),封装在小纸袋内,热死亡时间为121℃,3.9 min阳性,19 min阴性;D10值1.3-1.9 min,符合美国药典第十一版规定标准。 4、 该菌无毒,热抗稳定,在冰箱内4℃下保存一年抗力无明显下降,在常温(20℃左右)可保存1个月。 使用方法: 1、 该芽孢菌片使用时将装有菌片的小纸袋放在被灭菌的物品中心部位(每锅放置菌片数按卫生部规定)。 2、 灭菌后,再无菌操作下取出小纸袋中的菌片,放到溴甲酚紫培养液管中。同时将未经灭菌的菌片投入别一管培养基中作对照。 3、 56℃-60℃培养,48h观察结果,对照管为米黄色;若灭菌片培养液颜色不变仍为淡紫色,为阴性(-),表示灭菌彻底;如变黄为阳性(+),表示灭菌不彻底。 注意事项: 1、 防止指示剂中酒精挥发而使溴甲酚紫含量过高(溴甲酚紫含量过高后可抑菌生长); 2、 菌片灭菌后应及时取出培养; 3、 禁止菌片接触任何消毒剂及放射源以免影响抗力。 规格:50片/包

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