Real-titer慢病毒滴度测定(Q-PCR)试剂盒
本试剂盒能够快速、简便、高效地对基于HIV-1构建的慢病毒进行有效滴度测定。通过对感染慢病毒的细胞基因组DNA中整合的慢病毒插入片段拷贝数进行Q-PCR测定,计算出初始病毒的有效滴度。产品特点►本产品采用感染病毒后靶细胞基因组作为模板,测得数据更真实►基于Taqman探针法开发本产品,结果更准确►适用于所有基于HIV-1病毒构建的慢病毒滴度测定产品成分试剂名称内容数量Solution 1标准品DNA模板(5x10^9 c/μl)100μlSolution 2Lenti-primer (10μM)40μlSolution 3Lenti-probe –FAM/TAMRA(2.5μM)80μlSolution 4Taq (probe qPCR) (2X)1mlSolution 5ROXI(50X)40μlSolution 6ROX II(50X)80μl其他所需材料细胞基因组DNA抽提试剂(离心柱法)超纯水Q-PCR用96孔板或8连管定量PCR仪1.5ml无酶离心管用于样品制备无酶枪尖操作步骤 1.取感染72h后的293T细胞,胰酶消化制备单细胞悬液,细胞计数,得细胞数为N 2.利用细胞基因组抽提试剂盒提取293T细胞基因组DNA,测定基因组DNA总量为G (μg),稀释至50ng/μl备用;注:此步骤推荐使用分离柱式基因组抽提试剂盒 3.根据下表稀释标准品及基因组DNA样品:标准品管样品管#稀释倍数Water标准品拷贝数/μl稀释倍数Water样品(50ng/μl)110^145μl5μl5.45x10^81045μl5μl210^245μl5μl of 1#5.45x10^75040μl10μl of #1310^345μl5μl of 2#5.45x10^6100455μl of #1410^445μl5μl of 3#5.45x10^5510^545μl5μl of 4#5.45x10^4610^645μl5μl of 5#5.45x10^3 梯度稀释取样前,需充分混匀; 4.根据下表配制反应液,每组配制3个复孔:试剂用量终浓度标准品或样本2μl*1Lenti-primer (10μM)0.4μl0.2μMLenti-probe (2.5μM)0.8μl0.1μMTaq (probe qPCR) (2X)10μl1XROX*2Water补至20μl *1:样本除步骤3中稀释的3种浓度外,另需一组未稀释样本,即总量为100ng/孔;另需设置阴性对照孔,即不添加任何DNA模板; *2:根据所使用仪器添加:适用仪器ROX I (终浓度1X)7300 Real-Time PCR System/ StepOnePlus Real-Time PCR SystemROX II (终浓度0.5X)7500 Real-Time PCR System/7500 Fast Real-Time PCR System无需ROXThermal Cycler Dice Real Time System series/ LightCycler 480 System/ CFX96 Real-Time PCR Detection System 5.上机,按照以下程序进行Q-PCR反应: 变性 (1 Cycle):95℃ 30s 扩增 (40 cycles):95℃ 5s + 60℃ 30s 注:可根据具体使用仪器自行调整程序。 6.计算标准曲线:计算每组标准品的平均Ct值,以平均Ct值为X,Loge(copy number)为Y,生成标准曲线Y=A*Ct+B。标准曲线R2需大于0.99; 7.计算样本平均Ct值,带入标准曲线计算出copy number=n。注:以Ct值在标准曲线范围内的数据为准,若样本Ct值超过或低于标准曲线Ct值,需对样本稀释倍数进行相应调整。 8.计算病毒滴度:举例 Titer(TU/ml)=[n*d*(G/0.1)/N]*Nori/V 其中:n=步骤7中计算所得拷贝数;d=所用Ct值对应的稀释倍数(1, 10, 50, 100);G=基因组提取所得DNA总量(μg);N=基因组提取所用细胞数;Nori=病毒感染时细胞数;V=病毒感染时病毒用量(ml)。 计算各个Ct值位于标准曲线范围内的不同稀释倍数组病毒滴度,取平均值为最终结果。