第二代测序仪

为加强第二代测序技术检测试剂的规范和指导，进一步保证和提高相关产品的质量，中国食品药品检定研究院(中检院)组织制定了《第二代测序技术检测试剂质量评价通用技术指导原则》，现予以发布。　　该文件是中检院发布的首个质量评价技术指导原则，旨在对产品设计、研发及验证的各关键环节进行规范，从而有效地保证产品质量。此次发布的通用技术指导原则对相关产品的质量控制提出指导性意见，广泛适用于各类第二代测序技术检测试剂，有利于行业发展。　　指导原则主要针对第二代测序(next generation sequencing，NGS)技术检测试剂(以下简称“NGS检测试剂”)产品质量提出指导性要求，涉及基本原则、主要原材料、检测流程及性能评价等方面。　　指导原则适用于基于NGS技术的检测试剂的质量评价。NGS检测试剂的预期用途包括但不限于以下内容：肿瘤相关基因异常、遗传疾病相关基因异常、胚胎植入前染色体非整倍体、胎儿染色体非整倍体及病原微生物等临床检测应用。此类检测试剂涉及的NGS技术包括靶向性测序和非靶向性测序：靶向性测序法是指对样本中的基因组进行部分测序，如靶基因测序、外显子(组)测序等 非靶向性测序是指对样本中潜在生物体的基因组进行测序。原则上不建议企业应用全基因组测序进行检测，如果企业应用全基因组测序技术，应进行充分的技术适用性验证并提交报告。　　待测样本可以是人源样本(如体液、组织、排泄物等)或病原微生物分离培养物(如血培养物、痰培养物等)，检测对象可以是脱氧核糖核酸(DNA)、核糖核酸(RNA)或两者的混合物。第二代测序技术检测试剂质量评价通用技术指导原则.doc

华大基因创始人汪建　　一石激起千层浪。　　7月初，华大基因第二代基因测序产品获得CFDA批准，引发市场上相关概念股票&ldquo 暴动&rdquo 。　　然而，这一好消息迅速引来质疑。7月15日，中科院北京基因组研究所DNA序列测定技术研究开发中心常务副主任任鲁风公开发文，质疑CFDA的超常规审评过程不透明，并向CFDA递交了政务公开申请。　　作为国内基因测序的龙头，华大基因虽然仍未上市，却早已名声在外。　　据了解，基因测序产业分为仪器、试剂和服务，其中仪器与试剂归属CFDA审批，开展技术服务需要通过国家卫生和计划生育委员会(以下简称&ldquo 卫计委&rdquo )审批。此次华大基因二代测序产品虽然获批，但基因测序服务是否能大规模推广，还需要等待卫计委进一步明确。这场质疑风波无疑也为华大基因旗下公司的华大科技近期香港上市计划增添了不确定因素。　　&ldquo 超常规&rdquo 审批　　基因测序(也称DNA测序)是一种破解基因密码(即碱基序列)的技术。通俗来说，就是利用仪器对基因进行测序，通过高科技的体检来预测患某种病的风险，从而提前采取措施：只需采集几毫升血液或者唾液，就可以预测其患癌症、白血病等疾病的风险，并提出相应对策，其因此被誉为防治遗传病最好的技术。　　我国作为全球人口最多的国家，在这一领域也表现出了巨大的市场潜力。单就产前诊断这一应用领域的市场，据估算就在150亿元左右。2013年华大基因、贝瑞合康在无创产前筛查领域分别测序10万人次和5万人次，占据了市场的大部分份额。　　CFDA发布的公告显示，批准了华大基因的BGISEQ-1000基因测序仪、BGISEQ-100基因测序仪和胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒(联合探针锚定连接测序法)、胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒(半导体测序法)医疗器械注册。这是自今年2月CFDA喊停所有未经批准的测序临床诊断服务后，CFDA首次批准注册的第二代基因测序诊断产品。　　任鲁风质疑称，此次华大基因获批的4个产品，就是华大基因去年3月收购美国Complete Genomics公司(以下简称CG)所获得的测序系统，以及Life Tech公司的IonProton系统，更名后摇身一变成了BGISEQ-1000和BGISEQ-100两款仪器，至于试剂盒，则是这两款机型的配套基础测序试剂。CFDA数据库信息显示，这两款仪器在武汉生产，试剂则在深圳生产。　　他为此向CFDA提出了政务公开申请，希望公开华大基因基因测序产品的注册材料，包括申请注册时间、申请注册提交的资料目录、出具产品检验报告的医疗器械检验机构名称，检验报告出具时间和报告结论等。&ldquo 华大若走加速审评道路，必须要先在CFDA创新医疗器械网站上公示，但是它没有公示&rdquo 。　　华大基因公共传播与政府事务首席代表徐萍在接受媒体采访时对此回应称：&ldquo 华大的无创技术研发从2008年开始，为期五六年。从2013年3月全资收购CG获得全部知识产权后，开始进行技术转移、零部件到位、临床前试制，并按照医疗器械相关法规程序要求及流程准备至最终获证历时14个月。&rdquo 　　据了解，为了整顿国内基因测序的临床应用市场，今年2月，CFDA和卫计委联合发布通知，宣布包括产前基因检测在内的所有医疗技术需要应用的检测仪器、诊断试剂和相关医用软件等产品，如用于疾病的预防、诊断、监护、治疗监测、健康状态评价和遗传性疾病的预测，需经食品药品监管部门审批注册，并经卫生计生行政部门批准技术准入方可应用，已经应用的，必须立即停止。　　医药行业研究员符浩表示，2014年1月14日，CFDA办公厅发布关于基因分析仪等3类产品分类界定的通知。5月30日即批准了相关的4项产品，CFDA在基因测序产品审批上，确有轻率冒进之嫌。　　&ldquo 试验是做过的，临床数据也有，华大完全用的是Life Tech在国外已成熟的技术，基因检测本身技术通路可靠，对仪器的改装和试剂的小小改动并不会增加假阴性几率 美国食品药品监督管理局(FDA)没有批准同类产品，但Life Tech无创检测项目已通过CLIA认证，相关测序服务已经在做 对仪器和试剂的FDA认证同时在进行中，FDA审批周期很长，正在走流程。&rdquo 符浩说。　　亦有公开资料显示，质疑者任鲁风所在的研究所正在与紫鑫药业合作，开发国产新一代基因测序仪产品，这与华大属竞争关系。　　绕路&ldquo 国产化&rdquo 　　这次被批准的两款仪器，BGISEQ-1000是基于华大基因在2013年收购美国测序仪生产商CG的原有测序仪 BGISEQ-100则是基于Life Tech公司的Ion Proton测序平台。　　按照现行的医疗器械监管法规，进口医疗器械的注册需要满足已经在原产国上市这一条件。　　据了解，国内检测机构目前所用的检测仪在原产国还未获批准上市，其中包括应用最广泛的Illumina公司Hiseq基因测序仪，其至今也并未通过FDA审批。　　今年2月，Illumina中国分公司负责人透露，其二代测序平台MiSeqDx正在积极申请CFDA的认证。　　&ldquo 国产化&rdquo 无疑能帮助国外仪器绕过其先在原产国上市的门槛。　　华大医学首席执行官尹烨曾公开表示：&ldquo 根据《医疗器械监督管理条例》规定，进口的第三类医疗器械在中国获得CFDA认证的前提是获得生产国的认证，而现有基因测序仪只有MiSeq通过了美国FDA的认证，因此其他进口仪器只能通过与国内公司合作、贴牌生产才可以推广，或者在卫计委批准的试点机构使用。&rdquo 　　任鲁风表示，华大上述这两种系统均未通过美国FDA认证。华大基因测序仪如果使用外国合作方芯片是不合规的。&ldquo 芯片是测序系统进行测序生化反应的载体，因此应作为测序试剂盒中不可缺少的组成部分。如果国产诊断试剂产品通过批准的话，芯片由于不属于组成仪器设备的零部件，而是测序反应中关系实验数据产出的关键性耗材，应该在国内生产，直接采购国外产品，不符合医疗器械监管条例。&rdquo 　　任鲁风还认为，华大基因测序产品是否获批，背后或承载着巨大的经济利益。国际测序巨头Life Tech与达安基因和华大基因或明或暗的合作，Illumina和贝瑞和康的技术&ldquo 国产化&rdquo 转移，都将实行对中国市场的围剿。&ldquo 只赚服务费用，而来源于核心技术资金的最大收入却流向国外。&rdquo 他说。　　任鲁风直言，华大基因经CFDA获批的Ion Proton系统则远低于国外在唐筛测序技术方面需要测到的3000万条序列的水平，这一获批在国际上看来都是个&ldquo 笑话&rdquo 。　　医药行业研究员符浩则认为，华大基因两个仪器一个芯片是CG的，一个芯片是Life Tech的，用合作方芯片是合规的，只要不存在专利纠纷。华大申请注册二代测序仪是和Life Tech有合作框架的，应该有许可。建库、测序试剂、测序仪，华大并不需要保证完全自主生产，部分测序芯片是进口的，部分测序试剂可能也是，但并不妨碍申报注册。　　公开资料显示，在目前核心的基因测序仪器部分，外资的Illumina和Life Tech两家公司已经占到了国内市场整体份额的90%以上。　　&ldquo 大家一直在说国产，结果叫来一群披着国产仪器外衣的狼。&rdquo 任鲁风说。　　基因测序设备和人们熟知的B超、核磁共振成像设备一样，是一种开放平台。任鲁风担心，市场一旦被国外品牌占领，整个围绕着设备应用的试剂、医疗流程设计、人员培训、科研等都将被捆绑在外国设备商之下。　　业内人士看来，华大二代产品还面临着商业推广难题，市场接受度存在疑问。　　&ldquo 此前CG的设备需要在独立的恒温恒湿及特定波长光源照明的实验室环境下进行，如果与CG相比没有改变，那对用户的实验室环境要求是个挑战。&rdquo 任鲁风说。　　医药行业研究员符浩则认为，BGISEQ-1000是基于CG的测序平台做的改进，以华大本身的技术实力，想在性能上做出较大程度的优化，相信是非常困难的，因此BGISEQ-1000在临床上的使用预计会遇到使用条件苛刻的短板。不出意外的话，华大在无创产检推广上，将偏重于更加适用于实验室环境的采用Life Tech技术的BGISEQ-100，而BGISEQ-1000只是华大仪器自产化的一个尝试。　　申银万国研究报告则称，CG只能测序人类基因组，并且无法做无创产前检测。　　美国HudsonAlpha研究院韩健研究员也撰文表示，美国有四家提供无创产前诊断测序服务的公司都是使用Illumina公司的测序仪器。华大获得报批的产品是两个不同的技术平台，Life Tech的仪器和Complete Genomic的仪器。如果华大提供产前诊断服务使用的是Life Tech的技术平台，那在通量上(一次得到的数据量)就吃亏很多。　　华大科技拟去香港上市，但上市时间未定，集资约4亿美元(约31.2亿港元)，上市保荐人为花旗及大摩，目前还无法得知这场正在发酵的质疑风波对其上市前景影响几何。　　面对种种质疑，华大基因方面对相关问题一直未能做出任何回应。

瑞士/苏黎世、2011年6月29日&ndash Tecan公司今天发布其扩展的第二代高通量测序样本制备解决方案。基于Freedom EVO自动化液体处理平台的该专用解决方案扩展了对Life Technologies公司的最新一代高通量测序仪SOLiD 4以及SOLiD 5500样本制备的支持，实现全自动断片化文库的制备工作。Life Technolgies公司协助Tecan公司开发了这一扩展方案，且在Freedom EVO 75平台上进行了完整的验证。按照用户通量的需求，Tecan公司能为用户提供基于Freedom EVO 75平台的紧凑型方案（一次性处理1-24个样本），或基于Freedom EVP 150大型平台的高通量方案（一次性处理1-96个样本）。Tecan公司同时在其网页上公布了有关方案的具体信息及相关文档：www.tecan.com\ngs。Tecan公司在高通量测序的发展初期即开展相关样本制备自动化的工作。基于灵活的Freedom EVO自动化液体处理平台，Tecan公司的高通量测序样本制备解决方案集成了包括类似Covaris自适应聚焦超声DNA剪切断片化设备在内的样本制备过程所需的各种模块，从而实现高度重现的全自动样本制备。全自动的样本制备不仅节约了研究人员用于高通量测序前的样本准备时间，也完全排除了因为手工操作而可能导致的人为错误或误差，在大幅度提高处理通量的同时，实现了高度可重复的样本制备过程，并确保了测序结果的再现性与可靠性。有关更多高通量测序样本制备的信息，请联系当地的Tecan员工或经销商。 有关Tecan集团瑞士Tecan集团(www.tecan.com)是全球领先的试验室设备与自动化方案供应商，服务于包括生物制药、法医以及临床诊断等实验室在内的多个领域。Tecan集团致力于研发、生产、以及销售包括生命科学领域在内实验室所需的广泛且全面的自动化解决方案。Tecan集团的客户包括制药及生物技术公司、大学以及研究所、法医实验室、以及诊断及检测实验室。Tecan集团同时也是全球领先的OEM设备供应商，能够提供全方位的OEM设备研发与生产，以及为伙伴公司提供关键性组件。Tecan集团公司于1980年成立于瑞士，在欧洲及北美拥有研发与生产基地，并在全球超过52个国家和地区拥有销售及服务网络。Tecan集团在2010年的销售额为3.71瑞郎（3.56亿美元或2.69亿欧元)。公司注册股票在瑞交所上市(TK: TECN/ Reuters: TECZn.S/ ISIN: 12100191)。