百日咳是一种由百日咳杆菌传播，侵袭呼吸道并引发急性呼吸道感染的传染病。每年导致 35 万儿童和婴幼儿死亡，感染百日咳的病例数超过 4000 万。除了百日咳杆菌以外，副百日咳杆菌也导致百日咳。近年来副百日咳杆菌引起的百日咳一直在增加，部分原因可能是现在的百日咳疫苗对副百日咳杆菌的保护效力不佳。因此我们希望研究一种新的方法去筛选潜在的抗百日咳和副百日咳的疫苗候选抗原和药物靶点。本研究整合了生物信息学分析，比较基因组杂交芯片数据，基因表达谱和蛋白质相互作用网络数据。最终筛选了 191个交叉保护抗原。它们都在百日咳杆菌和副百日咳杆菌都高度表达，或者与百日咳的致病和毒力密切相关；都暴露在细菌的表面；不与宿主同源，不会对宿主产生危害；在 165 株百日咳杆菌和副百日咳杆菌中高度保守。在这 191 个疫苗候选抗原中，有 22 个在百日咳和副百日咳杆菌蛋白质相互作用网络中被鉴定为高度连接蛋白，能作为潜在的抗百日咳和副百日咳的药物靶点。对这 191 个疫苗候选抗原的进一步研究将会加速更有效的针对百日咳和副百日咳杆菌的新疫苗和药物的开发。