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仪器信息网 3i讲堂 基于宏基因组学技术的重症监护室环境菌群变化监测与追踪
1 2 投诉 分享 150 2022-07-12
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基于宏基因组学技术的重症监护室环境菌群变化监测与追踪

重症监护病房(Intensive care unit,ICU)是医院环境微生物研究的重要场所,由于ICU内病人抵抗力差以及使用抗生素等因素,ICU是医院获得性感染的高发区域。 为了探究宏基因组学技术在ICU环境微生物监控中的应用潜能,我们一年内按月为单位,共收集某医院ICU中214例环境样本,取样点包括被子、小推车、桌子、地面以及医护人员手等,通过16S rRNA测序结合宏基因组测序,分析了一年ICU环境微生物组成的变化以及不同取样点的物种组成,探讨ICU菌群分布的规律与特点。分析结果显示ICU环境中变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)的丰度最高,丰度较高的属随月份变化明显。追踪ICU环境微生物可能来源,发现除未知来源细菌外,占比最多的是来源于建筑物环境和人类皮肤的细菌。通过ICU内发生病人感染的病人样本mNGS样本分析,可推断出病人致病菌是否在相关环境中传播及传播的范围。此外,本研究对所有取样点平行进行细菌培养,比较发现基于宏基因组学技术的方法能检出更多ICU环境的微生物,可作为医院进行院感监控的一种新的手段。

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