蛋白质组学的发展离不开高分辨质谱仪的进步，包括灵敏度的提高和扫描速度的加快。但是目前即使使用最新的超高分辨质谱，单针data-dependent acquisition (DDA)鉴定到的蛋白只能覆盖人蛋白质组的一半。高场非对称波形离子迁移谱(High-Field Asymmetric Waveform Ion Mobility Spectrometry，FAIMS)技术的引入可以将肽段在ESI电离后，进入质谱之前实现快速气相分离，提高了分离的峰容量，该技术可以大大提高单针DDA鉴定的蛋白的数目，与二维色谱技术相当。FAIMS pro是赛默飞世尔科技2018年发布的新产品，较之前的产品在性能上有很大的提高。本讲座将分享FAIMS pro和三合一超高分辨质谱联用在蛋白质组学中的应用包括单针DDA深度覆盖、TMT定量、血浆蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学和交联肽段鉴定等。