SP6体外转录试剂盒

SP6体外转录试剂盒

产品及特点 本试剂盒是基于 SP6 RNA 聚合酶的 RNA 体外转录试剂盒，它利用含有 SP6启动子的模版 DNA，以 NTP 为底物，从 SP6 启动子下游开始合成与模版 DNA 中一条链互补的 RNA，简单快速获得大量的 RNA 分子。本产品具有下列特点：
1. 即开即用，用户只需提供含 SP6 启动子的 DNA 模板即可以进行体外转录实验。
2. 单溶液预配液，减少加样次数，避免了操作误差，增加了可重复性。
3. 模版 DNA 可以是线性化的质粒 DNA，也可以是 PCR 扩增产物。
4. 可以合成的 RNA 的最佳长度在 20nt 到 2000 nt 之间。
5. 产品配方经过精心优化，每 ug DNA 模版可以合成 2-6 ug RNA。
6. 得到的 RNA 可以用于 RNA 结构研究、核酶生物化学、体外翻译、RNA-蛋白质相互作用、反义技术、SELEX 技术和 RNA 干扰（RNAi）等实验。

7. 本产品足够 50 次 20uL 的体外转录实验。本产品只能用于科研。

规格及成分

运输及保存 低温运输，-20℃保存, 有效期一年。

自备试剂 如果需要去除转录产物中的 DNA 模板，则需要自备 RNase-free DNase、Tris 饱 和酚、氯仿、微量核酸沉淀剂、RNase-free 75%乙醇（均可从本公司另购）

使用方法 

一、制备 DNA 模板 

PCR 片段和质粒 DNA 都可以用作体外转录的模板，但是必须注意以下几点。一 是必须使用线性化的 DNA。如果是质粒 DNA，则必须先用适当的限制性内切酶 切成线状。二是需要转录的 DNA 序列的上游必须有 SP6 启动子。如果模板是 PCR 产物，则可以在设计引物时将 SP6 启动子序列（5’ATT TAG GTG ACA CTA TAG AGN G 3’）加上，转录其实是从 3 端 G AGN G 中的第一个 G 开 始。如果是将 DNA 片段克隆到载体上，则需要选择有 SP6 启动子的载体，并 且克隆位点必须位于 SP6 启动子下游。三是需要转录的 DNA 序列的下游端最 好不要是 3’突出。如果是 3’突出（如选择了 Pst I 来线性化质粒），则最好用 T4 DNA 聚合酶修平。四是必须保证 DNA 模板中没有 RNase。由于提取质粒 DNA 的过程中一般要使用大量的 RNase A，因此质粒 DNA 一般都有严重的 RNase A 污染，所以在用作模板前，最好采取胶回收得方法回收质粒 DNA。并 且加入少量总 RNA 一起保温，然后电泳检测 RNA 是否被降解，以此判断纯化 的 DNA 模板是否有残留 RNase A。

二、体外转录反应

1. 如果有 N 个样品，强烈建议做一个阴性对照，故共设置 N+1 个反应，这样一 起并排电泳时容易判断哪个条带是模板 DNA，哪个条带是扩增得到的 RNA。 在 N+1 个 RNase-free 的塑料离心管中，在室温下（不是在 4℃下）按次序加 入下列成分（T7 转录预配液容易产生结晶沉淀，一定要握在手中直到结晶彻底 溶解并摇匀后方可使用）：

注：此为 20 μL 反应体系的用量，对其他反应体系，各成分的用量可以按比例增减。如果需要标记 RNA 探针，则需要单独订购 NTP 分开的试剂盒。如果需要得到加帽 RNA，则需要另外加入自备的加帽修饰核苷酸（可以从 NEB 购买）。

2. 37℃保温 1-2 小时。注意：延长保温时间并不能提高产量。
3. 70℃加热 10 分钟灭活 SP6 RNA 聚合酶。
4. 取 1-3μL 电泳检测转录效果。此时除 DNA marker 外，最好再用 DNA 模板做电泳对照。电泳时比阴性对照多出的条带就是扩增得到的 RNA（由于合成的RNA 长度不均匀，即使长度均匀，但由于自生形成发夹结构，泳动速度也不一致，所以电泳所得 RNA 条带一般都不是清晰，而是比较弥散的电泳条带。但由于 RNA 是单链，分子量比同样长度的 DNA 小一倍，因此转录得到的 RNA一般比其双链的 DNA 模板电泳速度更快
5. 定量，可以用自备的单链 RNA 定量试剂盒检测浓度，也可以肉眼比较电泳胶上 RNA 和 DNA 的强度。由于 RNA 是单，核酸染料结合力低，因此同等亮度的 RNA 条带，其 RNA 分子数一般比 DNA 的分子数多一倍。使用本试剂盒时 1μg DNA 模板一般可以合成 2-6μg 的 RNA
6. 得到的 RNA 可以放-80℃保存或立即使用。
注：若需进一步去除 DNA 模板，可参考下列操作步骤，但所用试剂需另行购买。
1. 在体外转录体系中加入 3-5 U 自备的 RNase-free DNase。
2. 37℃保温 15-30 分钟降解 DNA。
3. 补水到 100 μL（体积太小不方便下步的酚氯仿抽提）。
4. 用等体积的 Tris 饱和酚-氯仿抽提一次去除残留的 DNase 和 RNA 聚合酶。
5. 在上清中加 200 μL 自备的微量核酸沉淀剂，振荡后 15000 rpm 离心 3-5 分钟，
6. 加入 1 mL 75%乙醇，震荡 10 秒后 15000 rpm 离心 3-5 分钟，弃上清。
7. 短暂离心数秒，用枪头吸弃上清。

8. 晾干半分钟，所得沉淀即去除 DNA 模板后的 RNA。可溶于 RNase-free 水中后立即使用或放-80℃长期保存。

特别提示：本公司的所有产品仅可用于科研实验，严禁用于临床医疗及其他非科研用途！