新技术促进了非细菌性植物微生物组的研究!
百欧博伟生物:与人类一样,植物也有微生物组。随着植物的生长,它们会从周围的土壤中吸收有益的微生物,使其在根部繁殖。大多数植物微生物组研究都集中在细菌和真菌上,尽管还有许多其他微生物可以影响植物健康,如线虫、螨虫、原生动物和真菌。人们对这些其他微生物的影响知之甚少,很大程度上是由于技术上的限制。其中一个限制是,来自植物根部或组织的样本中充满了植物DNA,它覆盖了科学家用来检测特定微生物的DNA信号。
为了更准确地对线虫、螨虫、原生动物和真菌的DNA进行测序和鉴定,来自康涅狄格农业实验站和康涅狄格大学的科学家们改造了一种被称为 "肽核酸(PNA)夹 "的技术,以阻断植物DNA。他们在《Phytobiomes Journal》上发表了他们的研究成果。
"这些夹子使我们能够以最小的污染从植物本身检查整个非细菌微生物组,"第一作者Stephen Taerum解释说。"通过添加夹子,我们能够从每个植物样本中获得三倍的序列信息,并检测到来自罕见微生物的数千个序列。"
他们设计的夹子阻断了玉米、小麦、高粱和大麦的DNA。只要稍加改变,这种方法就可以用来开发阻断其他植物物种DNA的夹子。
"这是一种技术,只在许多研究人员已经使用的方法类型上增加了微小的变化,并揭示了许多新的和不同的生物体的存在,希望更多的人们去尝试使用它。"项目负责人Lindsay Triplett补充道。Triplett、Taerum和同事们现在将研究重点放在原生动物在根系微生物组中的作用上。
论文标题为《Validation of a PNA Clamping Method for Reducing Host DNA Amplification and Increasing Eukaryotic Diversity in Rhizosphere Microbiome Studies》。
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