新冠病人肠道病毒组研究领域取得新进展

中科院微生物所王军研究员团队利用已建立的肠道病毒组的研究方法（Cao et al, Medicine in Microecology, 2020, 4:100012）结合Nanopore三代测序技术,与解放军总医院第五医学中心杨鹏辉主任合作，首次解析了新冠肺炎（COVID-19）患者的肠道病毒组（Virome）的动态变化，并以小鼠为模型对其中的机制进行解释。 　　

新型冠状病毒（SARS-CoV-2）引起的新冠肺炎疫情持续流行。根据世界卫生组织（WHO）统计，截止2021年3月，全球已有超过1亿COVID-19，死亡病例高达260多万。虽然COVID-19患者主要表现为呼吸系统的感染，引发呼吸系统的症状，甚至呼吸衰竭，但是该病毒也常常影响消化系统，尤其是肠道。值得注意的是，新冠病毒感染后COVID-19患者消化系统的症状先于呼吸系统，主要表现为腹泻。 　　

已有研究表明新冠肺炎患者中肠道菌群存在着不同程度的肠道生态失衡，并且这种变化可以作为COVID-19疾病的诊断和治疗的生物标记物。肠道病毒作为肠道微生物的重要组成部分，已有证据表明其与炎症性肠道疾病密切相关，但是，对于COVID-19患者的肠道病毒变化，以及它们与SARS-CoV-2感染之间的关系现在仍不清楚。 　　

至此，作者以北京地区新冠患者为研究对象，分别采集了患者的粪便及咽拭子。然后，以健康人作为参照，分析了COVID-19患者的肠道病毒组和细菌组的动态变化。结果发现，与健康人相比，COVID-19患者的肠道病毒和细菌存在较大差异，主要表现为患者的肠道菌群多样性显著降低。同时，不同疾病严重程度的患者之间细菌或病毒的组成不同。与轻症相比，重症患者中的条件致病菌显著增多，但产丁酸菌显著下降。此外，作者也在SARS-CoV-2感染的小鼠模型中复制了这一发现，证实了SARS-CoV-2感染导致的病毒组差异和细菌组失调，并观察到感染过程中免疫/感染相关基因在肠道上皮细胞中的表达不同，可能解释了病毒组和细菌组的动态。

----摘自 中国科学院微生物研究所---如有学术问题，请直接联系本单位删除，感谢支持！