你还在为复杂的粪便基因组DNA提取步骤烦恼么
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【Magbeads FastDNA Kit for Feces】
【轻松提取粪便基因组DNA】
1.近乎完美的电泳条带
2.无可比拟的提取浓度
3.出类拔萃的提取效果
MP Biomedicals贴心为大家准备了MagBeads FastDNA Kit for Feces的快速操作指南和常见问题解决方案,帮助初次使用者快速上手!
提取码:r1k7
常见问题解决方案:
1.DNA收率过低
严格按照说明书操作,实验前确保按要求加入相应体积的异*丙醇或乙醇。
样本的影响:对于微生物含量低的样本,增加样品处理量或者采用多个介质管处理样本后合并;对于难裂解的样本,在推荐的速度和时间基础上增加研磨次数,两次研磨之间将介质管置于冰上2mins降温。
磁珠的影响:收到磁珠后保存于2-8℃,不能冷冻;使用前需涡旋混匀;磁吸时确保磁珠被磁力架完全吸引,以防移液中磁珠损失;加入TE Buffer洗脱时,确保将磁珠完全重悬,并置于55℃加速洗脱。
2. 260/280比值过低
严格按照说明书操作,实验前确保按要求加入相应体积的异*丙醇或乙醇。
样本的影响:对于难裂解的样本,研磨后将介质管置于70℃孵育10mins再离心;对于蛋白含量多的样本,加入PPS后可置于4℃冰箱5mins后再离心。
磁珠的影响:加入Wash Buffer F1和Wash Buffer F2后若发现磁珠有结块,用枪头轻轻将结块分散开,确保磁珠彻底重悬,置于摇床上震荡漂洗。
3. 260/280比值过高
RNA残留:严格按照说明书操作,裂解时加入RNaseA Solution。
4. 260/230比值过低
蛋白质残留:对于蛋白含量多的样本,加入PPS后可置于4℃冰箱5mins后再离心。
加入Wash Buffer F1和Wash Buffer F2后若发现磁珠有结块,用枪头轻轻将结块分散开,确保磁珠彻底重悬,置于摇床上震荡漂洗。
乙醇残留:加入TE Buffer 前于55℃晾干磁珠,确保乙醇完全蒸发。
5. DNA片段化
优化裂解条件:对于大多数类型的粪便,FastPrep-5G设置为5.0m/s、40s即可满足裂解,但对个别样本,可选择降低研磨的速度或时间以获得高分子量的DNA。
6. DNA不扩增
稀释DNA模板,减少洗脱DNA中的抑制剂对PCR反应的抑制。MagBeads FastDNA® Kit for Feces已经对抑制剂进行了有效去除,所以稀释不是必需的,但仍然是一种选择。
优化PCR条件:可能需要更改反应条件或引物。
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